Stephane Redon

2019

Journal articles

titre

Controlled‐advancement rigid‐body optimization of nanosystems

auteur

Petr Popov, Sergei Grudinin, Andrii Kurdiuk, Pavel Buslaev, Stephane Redon

article

Journal of Computational Chemistry, 2019, 40 (27), pp.2391-2399. ⟨10.1002/jcc.26016⟩

DOI

DOI : 10.1002/jcc.26016

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titre

Incremental solver for Orbital-Free Density Functional Theory

auteur

François Rousse, Stephane Redon

article

Journal of Computational Chemistry, 2019, 40 (23), pp.2013-2027. ⟨10.1002/jcc.25854⟩

DOI

DOI : 10.1002/jcc.25854

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titre

Atomistic modelling of diamond-type Si x Ge y C z Sn1− x − y − z crystals for realistic transmission electron microscopy image simulations

auteur

Leonard Jaillet, Cyril Guedj, Stephane Redon

article

Journal of Applied Physics, 2019, 126 (3), ⟨10.1063/1.5099222⟩

DOI

DOI : 10.1063/1.5099222

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2018

Journal articles

titre

Generating conformational transition paths with low potential-energy barriers for proteins

auteur

Minh Khoa Nguyen, Léonard Jaillet, Stephane Redon

article

Journal of Computer-Aided Molecular Design, 2018, 32 (8), pp.853-867. ⟨10.1007/s10822-018-0137-7⟩

DOI

DOI : 10.1007/s10822-018-0137-7

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titre

Incremental update of electrostatic interactions in adaptively restrained particle simulations

auteur

Semeho Prince A. Edorh, Stephane Redon

article

Journal of Computational Chemistry, 2018, 39 (20), pp.1455-1469. ⟨10.1002/jcc.25215⟩

DOI

DOI : 10.1002/jcc.25215

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titre

ART-RRT: As-Rigid-As-Possible exploration of ligand unbinding pathways

auteur

Minh Khoa Nguyen, Léonard Jaillet, Stephane Redon

article

Journal of Computational Chemistry, 2018, 39 (11), pp.665-678. ⟨10.1002/jcc.25132⟩

DOI

DOI : 10.1002/jcc.25132

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titre

Single-pass Incremental Force Updates for Adaptively Restrained Molecular Dynamics

auteur

Krishna Kant Singh, Stephane Redon

article

Journal of Computational Chemistry, 2018, 39 (8), pp.412-423. ⟨10.1002/jcc.25126⟩

DOI

DOI : 10.1002/jcc.25126

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Conference papers

titre

Impact of Hydrogen on Graphene-based Materials: Atomistic Modeling and Simulation of HRSTEM Images

auteur

Cyril Guedj, Léonard Jaillet, François Rousse, Stephane Redon

article

AVS 65th International Symposium & Exhibition, Oct 2018, Long Beach, United States

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titre

Atomistic Modelling and Simulation of Transmission Electron Microscopy Images: Application to Intrinsic Defects of Graphene

auteur

Cyril Guedj, Léonard Jaillet, François Rousse, Stephane Redon

article

SIMULTECH 2018 – 8th International Conference on Simulation and Modeling Methodologies, Technologies and Applications, Jul 2018, Porto, Portugal. ⟨10.5220/0006829200150024⟩

DOI

DOI : 10.5220/0006829200150024

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2017

Journal articles

titre

IM-UFF: extending the Universal Force Field for interactive molecular modeling

auteur

Léonard Jaillet, Svetlana Artemova, Stephane Redon

article

Journal of Molecular Graphics and Modelling, 2017, 77, pp.350 – 362. ⟨10.1016/j.jmgm.2017.08.023⟩

DOI

DOI : 10.1016/j.jmgm.2017.08.023

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titre

Adaptive Physically Based Models in Computer Graphics

auteur

Pierre-Luc Manteaux, Chris Wojtan, Rahul Narain, Stéphane Redon, François Faure, Marie-Paule Cani

article

Computer Graphics Forum, 2017, 36 (6), pp.312-337 ⟨10.1111/cgf.12941⟩

DOI

DOI : 10.1111/cgf.12941

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titre

Adaptively Restrained Molecular Dynamics in LAMMPS

auteur

Krishna Kant Singh, Stephane Redon

article

Modelling and Simulation in Materials Science and Engineering, 2017, 25 (5), pp.055013. ⟨10.1088/1361-651X/aa7345⟩

DOI

DOI : 10.1088/1361-651X/aa7345

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titre

As-Rigid-As-Possible molecular interpolation paths

auteur

Minh Khoa Nguyen, Léonard Jaillet, Stephane Redon

article

Journal of Computer-Aided Molecular Design, 2017, 31 (4), pp.403 – 417. ⟨10.1007/s10822-017-0012-y⟩

DOI

DOI : 10.1007/s10822-017-0012-y

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Conference papers

titre

Parallel Adaptively Restrained Molecular Dynamics

auteur

Krishna Kant Singh, Dmitriy F. Marin, Stephane Redon

article

2017 International Conference on High Performance Computing & Simulation (HPCS), Jul 2017, Genova, Italy. pp.308 – 314, ⟨10.1109/HPCS.2017.55⟩

DOI

DOI : 10.1109/HPCS.2017.55

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2016

Journal articles

titre

Error Analysis of Modified Langevin Dynamics

auteur

Stephane Redon, Gabriel Stoltz, Zofia Trstanova

article

Journal of Statistical Physics, 2016, 164 (4), pp.735-771. ⟨10.1007/s10955-016-1544-6⟩

DOI

DOI : 10.1007/s10955-016-1544-6

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titre

Automatic molecular structure perception for the universal force field

auteur

Svetlana Artemova, Léonard Jaillet, Stephane Redon

article

Journal of Computational Chemistry, 2016, 37 (13), pp.1191-1205. ⟨10.1002/jcc.24309⟩

DOI

DOI : 10.1002/jcc.24309

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2014

Journal articles

titre

Interactive Chemical Reactivity Exploration

auteur

Moritz P. Haag, Alain C. Vaucher, Maël Bosson, Stephane Redon, Markus Reiher

article

ChemPhysChem, 2014, 15 (15), pp.3301-3319. ⟨10.1002/cphc.201402342⟩

DOI

DOI : 10.1002/cphc.201402342

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Conference papers

titre

Editing molecular structures with smoothed articulated-body acceleration

auteur

Stephane Redon

article

Workshop on Robotics Methods for Structural and Dynamic Modeling of Molecular Systems, Robotics Science and Systems, Jul 2014, Berkeley, CA, United States

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Book sections

titre

Modélisation et simulation adaptatives pour les nanosciences

auteur

Stephane Redon

article

Franck Varenne; Marc Silberstein. Modéliser & simuler. Epistémologies et pratiques de la modélisation et de la simulation, 2, Éditions Matériologiques, 2014

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2013

Journal articles

titre

Block-Adaptive Quantum Mechanics: An Adaptive Divide-and-Conquer Approach to Interactive Quantum Chemistry

auteur

Maël Bosson, Sergei Grudinin, Stephane Redon

article

Journal of Computational Chemistry, 2013, 34 (6), pp.492-504. ⟨10.1002/jcc.23157⟩

DOI

DOI : 10.1002/jcc.23157

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Conference papers

titre

Exploring the Use of Adaptively Restrained Particles for Graphics Simulations

auteur

Pierre-Luc Manteaux, François Faure, Stephane Redon, Marie-Paule Cani

article

VRIPHYS 2013 – 10th Workshop on Virtual Reality Interaction and Physical Simulation, Nov 2013, Lille, France. pp.17-24, ⟨10.2312/PE.vriphys.vriphys13.017-024⟩

DOI

DOI : 10.2312/PE.vriphys.vriphys13.017-024

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2012

Journal articles

titre

Adaptively Restrained Particle Simulations

auteur

Svetlana Artemova, Stephane Redon

article

Physical Review Letters, 2012, 109 (19), pp.190201:1-5. ⟨10.1103/PhysRevLett.109.190201⟩

DOI

DOI : 10.1103/PhysRevLett.109.190201

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titre

Interactive physically-based structural modeling of hydrocarbon systems

auteur

Maël Bosson, Sergei Grudinin, Xavier Bouju, Stephane Redon

article

Journal of Computational Physics, 2012, 231 (6), pp.2581-2598. ⟨10.1016/j.jcp.2011.12.006⟩

DOI

DOI : 10.1016/j.jcp.2011.12.006

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titre

Interactive quantum chemistry: A divide-and-conquer ASED-MO method

auteur

Maël Bosson, Antoine Plet, Sergei Grudinin, Stephane Redon, Caroline Richard

article

Journal of Computational Chemistry, 2012, 33 (7), pp.779-790. ⟨10.1002/jcc.22905⟩

DOI

DOI : 10.1002/jcc.22905

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2011

Journal articles

titre

A comparison of neighbor search algorithms for large rigid molecules

auteur

Svetlana Artemova, Sergei Grudinin, Stephane Redon

article

Journal of Computational Chemistry, 2011, 32 (13), pp.2865-2877. ⟨10.1002/jcc.21868⟩

DOI

DOI : 10.1002/jcc.21868

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titre

Fast construction of assembly trees for molecular graphs

auteur

Svetlana Artemova, Sergei Grudinin, Stephane Redon

article

Journal of Computational Chemistry, 2011, 32 (8), pp.1589-1598. ⟨10.1002/jcc.21738⟩

DOI

DOI : 10.1002/jcc.21738

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Conference papers

titre

Variable gain haptic coupling for molecular simulation

auteur

Aude Bolopion, Barthelemy Cagneau, Stephane Redon, Stéphane Régnier

article

WHC 2011 – IEEE World Haptics Conference, Jun 2011, Istanbul, Turkey. pp.469-474, ⟨10.1109/WHC.2011.5945531⟩

DOI

DOI : 10.1109/WHC.2011.5945531

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2010

Journal articles

titre

Comparing position and force control for interactive molecular simulators with haptic feedback

auteur

Aude Bolopion, Barthelemy Cagneau, Stephane Redon, Stéphane Régnier

article

Journal of Molecular Graphics and Modelling, 2010, 29 (2), pp.280-289. ⟨10.1016/j.jmgm.2010.06.003⟩

DOI

DOI : 10.1016/j.jmgm.2010.06.003

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titre

Practical modeling of molecular systems with symmetries

auteur

Sergei Grudinin, Stephane Redon

article

Journal of Computational Chemistry, 2010, 31 (9), pp.1799-1814. ⟨10.1002/jcc.21434⟩

DOI

DOI : 10.1002/jcc.21434

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Conference papers

titre

Haptic molecular simulation based on force control

auteur

Aude Bolopion, Barthelemy Cagneau, Stephane Redon, Stéphane Régnier

article

AIM – 2010 IEEE/ASME International Conference on Advanced Intelligent Mechatronics, Jul 2010, Montréal, Canada. pp.329-334, ⟨10.1109/AIM.2010.5695764⟩

DOI

DOI : 10.1109/AIM.2010.5695764

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2009

Journal articles

titre

Nanotechnologie : conception à l’échelle atomique par Stéphane Redon. Dynamique moléculaire interactive, entretien avec Serge Crouzy, propos recueillis par Dominique Chouchan.

auteur

Stéphane Redon, Serge Crouzy

article

Les Cahiers de l’INRIA – La Recherche, 2009, Les 10 découvertes de l’année, 426 janvier 2009

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Conference papers

titre

Haptic feedback for molecular simulation

auteur

Aude Bolopion, Barthelemy Cagneau, Stephane Redon, Stéphane Régnier

article

IROS 2009 – IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems, Oct 2009, St. Louis, MO, United States. pp.237-242, ⟨10.1109/IROS.2009.5354256⟩

DOI

DOI : 10.1109/IROS.2009.5354256

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2008

Journal articles

titre

Continuous Collision Detection for Adaptive Simulation of Articulated Bodies

auteur

Sujeong Kim, Stephane Redon, Young J. Kim

article

The Visual Computer, 2008, 24 (4), pp.261-269. ⟨10.1007/s00371-007-0196-6⟩

DOI

DOI : 10.1007/s00371-007-0196-6

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titre

View-dependent dynamics of articulated bodies

auteur

Sujeong Kim, Stephane Redon, Young J. Kim

article

Computer Animation and Virtual Worlds, 2008, 19 (3-4), pp.223-233. ⟨10.1002/cav.245⟩

DOI

DOI : 10.1002/cav.245

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Book sections

titre

Continuous Collision Detection

auteur

Stephane Redon

article

Ming C. Lin and Miguel A. Otaduy. Haptic Rendering: Foundations, Algorithms and Applications, A. K. Peters, Ltd., pp.253-276, 2008, 978-1568813325

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titre

Six Degree-of-Freedom Rendering of Rigid Environments

auteur

Michael Ortega, Stephane Redon, Sabine Coquillart

article

Ming C. Lin and Miguel A. Otaduy. Haptic Rendering: Foundations, Algorithms and Applications, A. K. Peters, Ltd., pp.333-354, 2008, 978-1568813325. ⟨10.1201/b10636-19⟩

DOI

DOI : 10.1201/b10636-19

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2007

Journal articles

titre

Adaptive torsion-angle quasi-statics: a general simulation method with applications to protein structure analysis and design.

auteur

Romain Rossi, Mathieu Isorce, Sandy Morin, Julien Flocard, Karthik Arumugam, Serge Crouzy, Michel Vivaudou, Stephane Redon

article

Bioinformatics, 2007, 23 (13), pp.i408-17. ⟨10.1093/bioinformatics/btm191⟩

DOI

DOI : 10.1093/bioinformatics/btm191

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titre

Interactive Continuous Collision Detection using Swept Volume for Avatars

auteur

Young J. Kim, Stephane Redon, Ming C. Lin, Dinesh Manocha, Jim Templeman

article

Presence: Teleoperators and Virtual Environments, 2007, 16 (2), pp.206–223. ⟨10.1162/pres.16.2.206⟩

DOI

DOI : 10.1162/pres.16.2.206

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titre

Le prototypage virtuel à l’échelle atomique

auteur

Stephane Redon

article

Interstices, 2007

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titre

A Six Degree-of-Freedom God-Object Method for Haptic Display of Rigid Bodies with Surface Properties

auteur

Michael Ortega, Stephane Redon, Sabine Coquillart

article

IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, 2007, 13, pp.458–469. ⟨10.1109/TVCG.2007.1028⟩

DOI

DOI : 10.1109/TVCG.2007.1028

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titre

Continuous Collision Detection for Articulated Models using Taylor Models and Temporal Culling

auteur

Xinyu Zhang, Stephane Redon, Minkyoung Lee, Young J. Kim

article

ACM Transactions on Graphics, 2007, 26 (3), pp.Article 15. ⟨10.1145/1276377.1276396⟩

DOI

DOI : 10.1145/1276377.1276396

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Conference papers

titre

Adaptive deformations with fast tight bounds

auteur

Miguel A Otaduy, Daniel Germann, Stephane Redon, Markus Gross

article

Proceedings of the 2007 ACM SIGGRAPH/Eurographics symposium on Computer animation, Aug 2007, San Diego, CA, United States. pp.181–190

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titre

A force-feedback algorithm for adaptive articulated-body dynamics simulation

auteur

Sandy Morin, Stephane Redon

article

Robotics and Automation, 2007 IEEE International Conference on, Apr 2007, Roma, Italy. pp.3245–3250, ⟨10.1109/ROBOT.2007.363973⟩

DOI

DOI : 10.1109/ROBOT.2007.363973

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titre

Efficient motion planning of highly articulated chains using physics-based sampling

auteur

Russell Gayle, Stephane Redon, Avneesh Sud, Ming C Lin, Dinesh Manocha

article

Robotics and Automation, 2007 IEEE International Conference on, Apr 2007, Roma, Italy. pp.3319–3326

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2006

Journal articles

titre

An Efficient, Error-Bounded Approximation Algorithm for Simulating Quasi-Statics of Complex Linkages

auteur

Stephane Redon, Ming C. Lin

article

Computer-Aided Design, 2006, 38 (4), pp.300-314. ⟨10.1016/j.cad.2006.01.009⟩

DOI

DOI : 10.1016/j.cad.2006.01.009

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titre

A Fast Method for Local Penetration Depth Computation

auteur

Stephane Redon, Ming C. Lin

article

Journal of graphics tools, 2006, 11 (2), pp.37-50. ⟨10.1080/2151237X.2006.10129216⟩

DOI

DOI : 10.1080/2151237X.2006.10129216

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Conference papers

titre

A six degree-of-freedom god-object method for haptic display of rigid bodies

auteur

Michael Ortega, Stephane Redon, Sabine Coquillart

article

Virtual Reality Conference, 2006, 2006, Alexandria, Virginia, United States. pp.191–198

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2005

Journal articles

titre

Fast Continuous Collision Detection for Articulated Models

auteur

Stephane Redon, Young J. Kim, Ming C. Lin, Dinesh Manocha

article

Journal of Computing and Information Science in Engineering, 2005, 5 (2), pp.126-137. ⟨10.1115/1.1884133⟩

DOI

DOI : 10.1115/1.1884133

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titre

Adaptive Dynamics of Articulated Bodies

auteur

Stephane Redon, Nico Galoppo, Ming C. Lin

article

ACM Transactions on Graphics, 2005, 24 (3), pp.936-945. ⟨10.1145/1073204.1073294⟩

DOI

DOI : 10.1145/1073204.1073294

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Conference papers

titre

An Efficient, Error-Bounded Approximation Algorithm for Simulating Quasi-Statics of Complex Linkages

auteur

Stephane Redon, Ming C. Lin

article

In Proceedings of ACM Symposium on Solid and Physical Modeling, Jun 2005, Boston, MA, United States. pp.175–186, ⟨10.1145/1060244.1060264⟩

DOI

DOI : 10.1145/1060244.1060264

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titre

Practical local planning in the contact space

auteur

Stephane Redon, Ming C Lin

article

Robotics and Automation, 2005. ICRA 2005. Proceedings of the 2005 IEEE International Conference on, Apr 2005, Barcelona, Spain. pp.4200–4205, ⟨10.1109/ROBOT.2005.1570765⟩

DOI

DOI : 10.1109/ROBOT.2005.1570765

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2004

Journal articles

titre

Fast Continuous Collision Detection and Handling for Desktop Virtual Prototyping

auteur

Stephane Redon

article

Virtual Reality, 2004, 8 (1), pp.63-70. ⟨10.1007/s10055-004-0138-9⟩

DOI

DOI : 10.1007/s10055-004-0138-9

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Conference papers

titre

Fast continuous collision detection for articulated models

auteur

Stephane Redon, Young J Kim, Ming C Lin, Dinesh Manocha

article

Proceedings of ACM symposium on Solid modeling and applications (SM 2004), Jun 2004, Genova, Italy. ⟨10.1115/1.1884133⟩

DOI

DOI : 10.1115/1.1884133

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titre

Interactive and continuous collision detection for avatars in virtual environments

auteur

Stephane Redon, Young J Kim, Ming C Lin, Dinesh Manocha, Jim Templeman

article

Virtual Reality, 2004. Proceedings. IEEE, 2004, Chicago, IL, United States. pp.117–283, ⟨10.1109/VR.2004.1310064⟩

DOI

DOI : 10.1109/VR.2004.1310064

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2003

Conference papers

titre

CULLIDE: Interactive collision detection between complex models in large environments using graphics hardware

auteur

Naga K Govindaraju, Stéphane Redon, Ming C Lin, Dinesh Manocha

article

Proceedings of the ACM SIGGRAPH/EUROGRAPHICS conference on Graphics hardware, 2003, San Diego, CA, United States. pp.25–32

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2002

Journal articles

titre

Fast Continuous Collision Detection between Rigid Bodies

auteur

Stephane Redon, Abderrahmane Kheddar, Sabine Coquillart

article

Computer Graphics Forum, 2002, 21 (3), pp.279-287. ⟨10.1111/1467-8659.t01-1-00587⟩

DOI

DOI : 10.1111/1467-8659.t01-1-00587

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Conference papers

titre

Hierarchical back-face culling for collision detection

auteur

Stéphane Redon, Abderrahmane Kheddar, Sabine Coquillart

article

Intelligent Robots and Systems, 2002. IEEE/RSJ International Conference on, 2002, Lausanne, Switzerland. pp.3036–3041, ⟨10.1109/IRDS.2002.1041734⟩

DOI

DOI : 10.1109/IRDS.2002.1041734

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titre

Gauss’ least constraints principle and rigid body simulations

auteur

Stéphane Redon, Abderrahmane Kheddar, Sabine Coquillart

article

Robotics and Automation, 2002. Proceedings. ICRA’02. IEEE International Conference on, 2002, Washington, DC, United States. pp.517–522, ⟨10.1109/ROBOT.2002.1013411⟩

DOI

DOI : 10.1109/ROBOT.2002.1013411

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Theses

titre

Algorithmes de simulation dynamique interactive d’objets rigides

auteur

Stéphane Redon

article

Modélisation et simulation. Université d’Evry-Val d’Essonne, 2002. Français. ⟨NNT : ⟩

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2001

Conference papers

titre

CONTACT: Arbitrary in-between motions for collision detection

auteur

Stéphane Redon, Abderrahmane Kheddar, Sabine Coquillart

article

Robot and Human Interactive Communication, 2001. Proceedings. 10th IEEE International Workshop on, 2001, Bordeaux and Paris, France. pp.106–111

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2000

Conference papers

titre

An algebraic solution to the problem of collision detection for rigid polyhedral objects

auteur

Stéphane Redon, Abderrahmane Kheddar, Sabine Coquillart

article

Proc. of IEEE Conference on Robotics and Automation, Apr 2000, San Fransisco, CA, United States. pp. 3733 – 3738, ⟨10.1109/ROBOT.2000.845313⟩

DOI

DOI : 10.1109/ROBOT.2000.845313

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