Nejib Zemzemi

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Biography

I’m a researcher at the French National Institute for Research in Computer Science and Control (INRIA),  I obtained my master degree in 2006 and my PHD on 2009  in applied mathematics at the university of Paris-XI. In 2010 I moved to the department of computer science at Oxford university where I made my postdoctoral research about numerical assessment of drugs effect on the electrical activity of the heart. I have been working at Inria-Bordeaux since 2012 in the CARMEN team and my work is about modelling and numerical simulation of electrocardiograms with a special focus on the electrocardiographic imaging inverse problem.

Contact

Inria Bordeaux Sud-Ouest
200 rue de la vieille tour
33405 Talence Cedex, France
E-mail: nejib.zemzemi@inria.fr
Co-leader of the Epicard associate team

Projects

Inverse Problem in Electrocardiography  
In scilico assessment of drugs action on the heart electrical activity
CardioXcomp
MedicActiV

Softwares

Supervision

PHD students

  • Amel Karoui. New approches for solving inverse problems in cardiac electrophysiology. (co-advisor: Mostafa Bendahmane). Defence expected in October 2020.
  • Yassine Abidi. Theoretical and numerical analysis of parameter estimation problem in cardiac electrophysiology. (co-advisor: Moncef Mahjoub and Mourad Bellassoued). Defence expected in October 2018.
  • Wajih M’Barki. Analysis of numerical methods in myocardium/purkinje coupling models. (co-advisor: Saloua Mani-Aouadi). Defended in July 2017
  • Jamila Lassoued. Parameter estimation problems in cardiac electrophysiology. (co-advisor: Moncef Mahjoub). Defended in July 2016.

Post-docs

  • Cesare Corrado. Reduced order modelling in cardiac electrophysiology.
  • Julien Bouyssier. Factorization of boundary problem method for the electrocardiography inverse problem. (co-advisor: Jacques Henry).

Engineers

    • Mehdi Juhoor. Developpement Cardiac ElectroPhysiology Solver (CEPS).

(co-advisor: Yves Coudière). CEPS would be used by resherchers in th LIRYC institute.

  • Cesare Corrado. Developpement of scalable reduced order methods in a massively parallel cardiac electrophysiology solver. Simulation of cases for MedicActiV project.
  • Dragan Amenga M’bengue. Segmentation of CT-scan and MR-images for computer models. MedicActiV project
  • Emanuela Abbate. Developpment of numerical tools for drug/stem-cells interaction. CardioXcomp project.

Publications

Publications HAL de Nejib,Zemzemi

2020

Journal articles

titre
Virtual FFR quantified with a generalized flow model using Windkessel boundary conditions ; Application to a patient-specific coronary tree.
auteur
Keltoum Chahour, Rajae Aboulaich, Abderrahmane Habbal, Nejib Zemzemi, Cherif Abdelkhirane
article
Computational and Mathematical Methods in Medicine, Hindawi Publishing Corporation, In press, ⟨10.1155/2020/3942152⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-02427411/file/Manuscript_Chahour-4.pdf BibTex

2019

Journal articles

titre
On Simulating the Effect of Sodium Channel Block on Cardiac Electromechanics
auteur
Noha Shalaby, Nejib Zemzemi, Khalil Elkhodary
article
Proceedings of the Institution of Mechanical Engineers, Part H: Journal of Engineering in Medicine, SAGE Publications, 2019
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-02434201/file/On%20Simulating%20the%20Effect%20of%20Sodium%20Channel%20Block%20on%20Cardiac%20Electromechanics.pdf BibTex
titre
A nash game algorithm for the solution of coupled conductivity identification and data completion in cardiac electrophysiology
auteur
Rabeb Chamekh, Abderrahmane Habbal, Moez Kallel, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, In press, Mathematical modelling in cardiology, 14 (2), pp.15. ⟨10.1051/mmnp/2018059⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01923819/file/mmnp180143.pdf BibTex
titre
Propagation of two independent sources of uncertainty in the electrocardiography imaging inverse solution
auteur
Najib Fikal, Rajae Aboulaich, Emahdi Guarmah, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2019, 14 (2), ⟨10.1051/mmnp/2018065⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01923847/file/template.pdf BibTex
titre
Ionic parameters identification of an inverse problem of strongly coupled PDE’s system in cardiac electrophysiology using Carleman estimates
auteur
Yassine Abidi, Mourad Bellassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2019, Mathematical Modelling in Cardiology, 14 (2), ⟨10.1051/mmnp/2018060⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01923862/file/Abidi-et-al-bidomain-MMNP.pdf BibTex
titre
Towards the modelling of the Purkinje/ myocardium coupled problem: A well-posedness analysis
auteur
Saloua Aouadi, Wajih Mbarki, Nejib Zemzemi
article
Journal of Computational and Applied Mathematics, Elsevier, 2019
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https://hal.inria.fr/hal-01923779/file/monodomainbidomain.pdf BibTex
titre
Analysis of the ECGI inverse problem solution with respect to the measurement boundary size and the distribution of noise
auteur
Mohammed Addouche, Nadra Bouarroudj, Fadhel Jday, Jacques Henry, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2019
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https://hal.inria.fr/hal-01923800/file/Addouche-et-MMNP.pdf BibTex

Conference papers

titre
Space rescaling in the MFS method improves the ECGI reconstruction
auteur
Pauline Migerditichan, Mark Potse, Nejib Zemzemi
article
CinC 2019 – Computing in Cardiology 2019, Sep 2019, Singapour, Singapore
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02428142/file/miger-cinc19.pdf BibTex
titre
Direct Mapping from Body Surface Potentials to Cardiac Activation Maps Using Neural Networks
auteur
Amel Karoui, Mostafa Bendahamane, Nejib Zemzemi
article
CinC 2019 – Computing in Cardiology Conference, Sep 2019, Singapour, Singapore. ⟨10.22489/CinC.2019.253⟩
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BibTex
titre
Maximal conductances ionic parameters estimation in cardiac electrophysiology multiscale modelling
auteur
Yassine Abidi, Julien Bouyssier, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
FIMH 2019 – 10th International Conference Functionnal Imaging and Modeling of the Heart, Y. Coudière, V. Ozenne, E. Vigmond and N. Zemzemi, Jun 2019, Bordeaux, France. pp.131-138, ⟨10.1007/978-3-030-21949-9⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02154074/file/samplepaper_09_04_2019.pdf BibTex

Book sections

titre
A Spatial Adaptation of the Time Delay Neural Network for Solving ECGI Inverse Problem
auteur
Amel Karoui, Mostafa Bendahmane, Nejib Zemzemi
article
Yves Coudière; Valéry Ozenne; Edward Vigmond; Nejib Zemzemi. 10th International Symposium Functional Imaging and Modeling of the Heart, 11504, Springer, pp.94-102, 2019, Lecture Notes in Computer Science, 978-3-030-21949-9. ⟨10.1007/978-3-030-21949-9_11⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-02154094/file/fimh2019_RevisedVersion.pdf BibTex

Directions of work or proceedings

titre
Functional Imaging and Modeling of the Heart
auteur
Yves Coudière, Nejib Zemzemi, Edward J. Vigmond, Valéry Ozenne
article
FIMH 2019 – 10th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2019, 11504, Springer, 2019, LNCS – Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-030-21949-9⟩
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BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Ionic Parameters Estimation in Multi-Scale Cardiac Electrophysiology Modelling
auteur
Yassine Abidi, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
2019
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https://hal.inria.fr/hal-02338984/file/paper_optim_10-07-2019.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
Evaluation of fifteen algorithms for the resolution of the electrocardiography imaging inverse problem using ex-vivo and in-silico data
auteur
Amel Karoui, Laura Bear, Pauline Migerditichan, Nejib Zemzemi
article
Frontiers in Physiology, Frontiers, 2018, Electrocardiographic Imaging, 9, pp.1708
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https://hal.inria.fr/hal-01923763/file/frontiers.pdf BibTex
titre
A conduction velocity adapted eikonal model for electrophysiology problems with re-excitability evaluation
auteur
Cesare Corrado, Nejib Zemzemi
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2018, 43, pp.186-197. ⟨10.1016/j.media.2017.11.002⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01655410/file/MitchellSchaefferEikonal.pdf BibTex
titre
Identification of ion currents components generating field potential recorded in MEA from hiPSC-CM
auteur
Fabien Raphel, Muriel Boulakia, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Jean-Michel Guillon, Philippe Zitoun, Jean-Frédéric Gerbeau
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 65 (6), pp.1311-1319. ⟨10.1109/TBME.2017.2748798⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01570341/file/mea_HAL.pdf BibTex
titre
In silico assessment of the effects of various compounds in MEA/hiPSC-CM assays: Modelling and numerical simulations
auteur
Emanuela Abbate, Muriel Boulakia, Yves Coudière, Jean-Frédéric Gerbeau, Philippe Zitoun, Nejib Zemzemi
article
Journal of Pharmacological and Toxicological Methods, Elsevier, 2018, 89, pp.59-72
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01562673/file/compound_MEA_hiPSC.pdf BibTex
titre
Numerical simulation of the fractional flow reserve (FFR)
auteur
Keltoum Chahour, Rajae Aboulaich, Abderrahmane Habbal, Cherif Abdelkhirane, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, In press, Special issue “Mathematical Modelling in Cardiology”
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01944566/file/mmnp180018_proof-1.pdf BibTex

Conference papers

titre
The Heart Recording Conditions Impact the Assessment of the Electrocardiography Imaging Inverse Solution
auteur
Amel Karoui, Laura Bear, Pauline Migerditichan, Mostafa Bendahmane, Nejib Zemzemi
article
CinC 2018 – 45th Computing in Cardiology Conference, Sep 2018, Maastricht, Netherlands
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01923927/file/example1.pdf BibTex

2017

Journal articles

titre
Stability analysis of decoupled time-stepping schemes for the specialized conduction system/myocardium coupled problem in cardiology
auteur
Salwa Aouadi, W Mbarki, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2017, Mathematical models in physiology, 12 (5), pp.208-239. ⟨10.1051/mmnp/201712513⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01655411/file/MMNP-Wajih.pdf BibTex
titre
An Analytical Model for the Effects of the Spatial Resolution of Electrode Systems on the Spectrum of Cardiac Signals
auteur
Ferney Beltrán-Molina, Jesús Requena-Carrión, Felipe Alonso-Atienza, Nejib Zemzemi
article
IEEE Access, IEEE, 2017, 5, pp.18488-18497. ⟨10.1109/ACCESS.2017.2747632⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01655418/file/Main_BeltranMolina_IEEEAccess.pdf BibTex

Conference papers

titre
Inverse Problem of Electrocardiography: estimating the location of cardiac isquemia in a 3D geometry
auteur
C.E. Chavez, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Felipe Alonso-Atienza, Diegó Alvarez
article
Functional Imaging and modelling of the heart (FIMH2015), Jun 2017, Maastricht, Netherlands. ⟨10.1007/978-3-319-20309-6_45⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01222385/file/Carlos_FIMH.pdf BibTex
titre
New approach for solving electrocardiography imaging inverse problem with missing data on the body surface
auteur
Mohammed Addouche, Nadra Bouarroudj, Jacques Henry, Fadhel Jday, Nejib Zemzemi
article
Tendances des Applications Mathématiques en Tunisie, Algérie, Maroc 10-13 mai 2017, May 2017, Hammamet, Tunisia
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01567821/file/tamtam2017.pdf BibTex

Reports

titre
A conduction velocity adapted eikonal model for electrophysiology problems with re-excitability evaluation
auteur
Cesare Corrado, Nejib Zemzemi
article
[Research Report] Inria Bordeaux Sud-Ouest; King’s College London. 2017
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01567868/file/MitchellSchaefferEikonal.pdf BibTex
titre
On the identification of multiple space dependent ionic parameters in cardiac electrophysiology modelling
auteur
Yassine Abidi, Mourad Bellassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
[Research Report] INRIA. 2017
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01567714/file/ABZM3_version_16-06-17.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Sensitivity of the electrocardiographic problem to multiple independent sources of uncertainty
auteur
Rajae Aboulaich, Najib Fikal, Emahdi El Guarmah, Nejib Zemzemi
article
2017
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01567700/file/elsarticle-template.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
Human ventricular activation sequence and the simulation of the electrocardiographic QRS complex and its variability in healthy and intraventricular block conditions
auteur
Louie Cardone-Noott, Alfonso Bueno-Orovio, Ana Mincholé, Nejib Zemzemi, Blanca Rodriguez
article
EP-Europace, Oxford University Press (OUP): Policy B, 2016, ⟨10.1093/europace/euw346⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01567722/file/Activation-Paper-2016.pdf BibTex
titre
Stability results for the parameter identification inverse problem in cardiac electrophysiology
auteur
Jamila Lassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
Inverse Problems, IOP Publishing, 2016, 32, pp.1-31. ⟨10.1088/0266-5611/32/11/115002⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01399373/file/Paper-Mahjoub-Moncef-soumission-Inverse-Problems-corrige.pdf BibTex
titre
Stochastic Finite Element Method for torso conductivity uncertainties quantification in electrocardiography inverse problem
auteur
Rajae Aboulaich, Najib Fikal, Emahdi El Guarmah, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2016, 11 (2), pp.1-19. ⟨10.1051/mmnp/201611201⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01289144/file/mmnp-format-fikal.pdf BibTex

Conference papers

titre
Sensitivity of the electrocardiographic forward problem to the heart potential measuement noise and conductivity uncertainties
auteur
Rajae Aboulaich, Najib Fikal, El Mahdi Guarmah, Nejib Zemzemi
article
Colloque africain sur la recherche en informatique et mathématiques appliquées, CARI 2016, Oct 2016, Hammamet, Tunisia
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https://hal.inria.fr/hal-01402938/file/squelette-CARI2016.pdf BibTex
titre
Identification of sources for the bidomain equation using topological gradient
auteur
Jamila Lassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
Colloque africain sur la recherche en informatique et mathématiques appliquées, CARI 2016, Oct 2016, Hammamet, France
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https://hal.inria.fr/hal-01402953/file/Papier_CAri.pdf BibTex
titre
Optimization of Organ Conductivity for the Forward Problem of Electrocardiography
auteur
Laura Bear, Rémi Dubois, Nejib Zemzemi
article
Computing In cardiology, Sep 2016, Vancouver, Canada
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https://hal.inria.fr/hal-01402927/file/CINC%20paper%20final.pdf BibTex
titre
Decentralized Strategies for Ill Posed Inverse Problems
auteur
Abderrahmane Habbal, Moez Kallel, Rabeb Chamekh, Nejib Zemzemi
article
5th International Conference on Engineering Optimization, Jun 2016, Iguassu Falls, Brazil
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BibTex
titre
Stability results for the parameter identification inverse problem in cardiac electrophysiology
auteur
Lassoued Jamila, Mahjoub Moncef, Nejib Zemzemi
article
PICOF (Problèmes Inverses, Contrôle et Optimisation de Formes), Jun 2016, Autrans, France
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BibTex
titre
A Nash-game approach to solve the Coupled problem of conductivity identification and data completion
auteur
Rabeb Chamekh, Abderrahmane Habbal, Moez Kallel, Nejib Zemzemi
article
PICOF (Problèmes Inverses, Contrôle et Optimisation de Formes), Jun 2016, Autrans, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01402976/file/abstract-picof-2016.pdf BibTex

Poster communications

titre
Optimization of Organ Conductivity for the Forward Problem of Electrocardiography
auteur
Laura Bear, Rémi Dubois, Nejib Zemzemi
article
Journées scientifiques du LIRYC, Sep 2016, Pessac, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01402983/file/Poster-v2.pdf BibTex
titre
Parameters estimation approach for the MEA/hiPSC-CM assays
auteur
Julien Bouyssier, Mostafa Bendahmane, Yves Coudière, Jean-Frédéric Gerbeau, Julien Pedron, Philippe Zitoun, Nejib Zemzemi
article
Journées scientifiques du LIRYC, Sep 2016, Pessac, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01409683/file/main.pdf BibTex

2015

Journal articles

titre
Stability analysis of the POD reduced order method for solving the bidomain model in cardiac electrophysiology
auteur
Cesare Corrado, Jamila Lassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Biosciences, Elsevier, 2015, ⟨10.1016/j.mbs.2015.12.005⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01245685/file/Paper-MBS-D-15-00248-Accepted-Mahjoub-BioSciences.pdf BibTex

Conference papers

titre
Effect of the torso conductivity heterogeneities on the ECGI inverse problem solution
auteur
Nejib Zemzemi, Cecile Dobrzynski, Laura Bear, Mark Potse, Corentin Dallet, Yves Coudière, Remi Dubois, Josselin Duchateau
article
Computing in cardiology, Sep 2015, Nice, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01241750/file/cinc2015.pdf BibTex
titre
Local Conduction Velocity Mapping for Electrocardiographic Imaging
auteur
Corentin Dallet, Laura Bear, Josselin Duchateau, Mark Potse, Nejib Zemzemi, Valentin Meillet, Yves Coudière, Rémi Dubois
article
Computing in cardiology, Sep 2015, Nice, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01241751/file/CinC2015_Corentin.pdf BibTex
titre
Accuracy of Lead Removal vs Linear Interpolation in Non-Invasive Electrocardiographic Imaging (ECGI)
auteur
Laura Bear, Mark Potse, Josselin Duchateau, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Rémi Dubois
article
Computing in cardiology, Sep 2015, Nice, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01241752/file/Cinc2015-Laura.pdf BibTex
titre
Inverse Localization of Ischemia in a 3D Realistic Geometry: A Level Set Approach
auteur
Carlos E. Chavez, Felipe Alonso-Atienza, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Diegó Alvarez
article
Computing in cardiology, Sep 2015, Nice, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01241754/file/Carlos-Cinc2015.pdf BibTex
titre
Inverse problem in electrocardography via the factorization method of boundary value problems
auteur
Julien Bouyssier, Nejib Zemzemi, Jacques Henry
article
IEEE 12th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2015, Apr 2015, New York, France. ⟨10.1109/ISBI.2015.7163979⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01222401/file/ArticleISBI2015.pdf BibTex
titre
In silico assessment of drugs effects on human embryonic stem cells derived cardiomyocytes electrical activity
auteur
Emanuela Abbate, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Jean-Frédéric Gerbeau
article
LACM 2015 (2nd International Workshop on Latest Advances in Cardiac Modeling), Mar 2015, German Heart Center, Munich, Germany
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BibTex

Book sections

titre
Sensitivity of the Electrocardiography Inverse Solution to the Torso Conductivity Uncertainties
auteur
Nejib Zemzemi, Rajae Aboulaich, Najib Fikal, Emahdi El Guarmah
article
Hans van Assen; Peter Bovendeerd ; Tammo Delhaas. Functional Imaging and Modeling of the Heart, Lecture Notes in Computer Science (9126), Springer, pp.475-483, 2015, 8th International Conference, FIMH 2015, Maastricht, The Netherlands, June 25-27, 2015. Proceedings, 978-3-319-20308-9. ⟨10.1007/978-3-319-20309-6_54⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01222381/file/fimh.pdf https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01222381/file/fimh%20%281%29.pdf BibTex

Poster communications

titre
Overview on the Cardiac ElectroPhysiology Simulator (CEPS)
auteur
Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Florian Caro, Marc Fuentes
article
Meeting at the Lyric, Jun 2015, Bordeaux, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01204600/file/2015-06-poster-ptib.pdf BibTex
titre
New Mathematical approaches in Electrocardiography Imaging inverse problem
auteur
Nejib Zemzemi, Mark Potse, Laura Bear, Yves Coudière, Rémi Dubois, Jacques Henry, C Dallet, Josselin Duchateau, O Bernus, M Haïssaguerre
article
LIRYC scientific day, Jun 2015, Pessac, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01222406/file/LirycPoster.pdf BibTex
titre
Sensitivity of the electrocardiography inverse solution to the torso conductivity uncertainties
auteur
Rajae Aboulaich, Najib Fikal, El Mahdi El Guarmah, Nejib Zemzemi
article
LIRYC scientific day, Jun 2015, Pessac, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01222404/file/poster.pdf BibTex

2014

Journal articles

titre
Effects of L-type calcium channel and human ether-a-go-go related gene blockers on the electrical activity of the human heart: a simulation study
auteur
Nejib Zemzemi, Rodriguez Blanca
article
EP-Europace, Oxford University Press (OUP): Policy B, 2014, ⟨10.1093/europace/euu122⟩
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BibTex

Conference papers

titre
An Iterative method for solving the inverse problem in Electrocardiography imaging: From body surface to heart potential.
auteur
Nejib Zemzemi, Hamed Bourenane, Hubert Cochet
article
IEEE Computers in Cardiology, MIT, Sep 2014, Cambridge, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01065107/file/cinc2014.pdf BibTex
titre
A Computational Investigation into the Effect of Infarction on Clinical Human Electrophysiology Biomarkers
auteur
Louie Cardone-Noott, Alfonso Bueno-Orovio, Ana Mincholé, Kevin Burrage, Mikael Wallman, Nejib Zemzemi, Erica Dall’Armellina, Rodriguez Blanca
article
IEEE Computers in Cardiology, Sep 2014, Cambridge, United States
Accès au bibtex
BibTex
titre
An iterative method for solving the inverse problem in electrocardiography in normal and fibrillation conditions: A simulation Study
auteur
Nejib Zemzemi
article
International Congress on Electrocardiology (ICE), Jun 2014, Bratislava, Slovakia. pp.53-56
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01064445/file/TheICE2014_paper.pdf BibTex
titre
Inverse ECG problem using the factorization method
auteur
Nejib Zemzemi, Julien Bouyssier
article
PICOF’2014, LAMSIN, May 2014, Hammamet, Tunisia
Accès au bibtex
BibTex

Reports

titre
Numerical Investigation on the usefulness of Proper Orthogonal Decomposition method in cardiac electrophysiology
auteur
Jamila Lassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
[Research Report] 2014, pp.20
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01058655/file/rapport_2013.pdf BibTex

2013

Journal articles

titre
Chaste: an open source C++ library for computational physiology and biology.
auteur
Mirams Gary, Christopher J. Arthurs, Miguel O. Bernabeu, Rafel Bordas, Jonathan Cooper, Alberto Corrias, Yohan Davit, Sara-Jane Dunn, Alexander G. Fletcher, Daniel G. Harvey, Megan E. Marsh, James M. Osborne, Pras Pathmanathan, Joe Pitt-Francis, James Southern, Nejib Zemzemi, David J. Gavaghan
article
PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2013, 9 (3)
Accès au bibtex
BibTex

Conference papers

titre
A Machine Learning Technique Regularization of the Inverse Problem in Cardiac Electrophysiology
auteur
Nejib Zemzemi, Rémi Dubois, Yves Coudière, Olivier Bernus, M. Haïssaguerre
article
CinC – Computing in Cardiology Conference, Sep 2013, Zaragoza, Spain. pp.285-312
Accès au bibtex
BibTex
titre
A Steklov-Poincaré Variational Formulation of the Inverse Problem in Cardiac Electrophysiology
auteur
Nejib Zemzemi
article
CinC – Computing in Cardiology Conference, Sep 2013, Zaragoza, Spain. pp.193
Accès au bibtex
BibTex
titre
A Domain Decomposition Approch in the Electrocardiography Inverse Problem
auteur
Nejib Zemzemi
article
Domain Decomposition 22, Università della Svizzera italiana, Sep 2013, Lugano, Switzerland
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https://hal.inria.fr/hal-01065692/file/dd22-proceeding.pdf BibTex

Other publications

titre
Reduced Order Methods: Faster Solvers For Cardiac Electro-physiology problems
auteur
Cesare Corrado, Nejib Zemzemi, Yves Coudière
article
2013
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BibTex
titre
Inverse problem in electrocardiography via factorization method of boundary problems : how reconstruct epicardial potential maps from measurements of the torso ?
auteur
Julien Bouyssier, Nejib Zemzemi, Jacques Henry
article
2013
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https://hal.inria.fr/hal-00926344/file/poster_liryc_bj.pdf BibTex

Poster communications

titre
C.E.P.S. : an efficient tool for cardiac electrophysiology simulations
auteur
Mehdi Juhoor, Yves Coudière, Nejib Zemzemi
article
Workshop LIRYC, Oct 2013, Bordeaux, France
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https://hal.inria.fr/hal-00925834/file/PosterWorkshop.pdf BibTex

2012

Journal articles

titre
Computational assessment of drug-induced effects on the electrocardiogram: from ion channel to body surface potentials
auteur
Nejib Zemzemi, Miguel Oscar Bernabeu, Javier Saiz Rodriguez, Jonathan Cooper, Pras Pathmanathan, Gary Mirams, Joe Pitt-Francis, Rodriguez Blanca
article
British Journal of Pharmacology, Wiley, 2012, 168 (3), pp.718-733. ⟨10.1111/j.1476-5381.2012.02200.x⟩
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Conference papers

titre
Role of L-type Calcium in Modulating Pro-Arrhythmic Effects of Dofetilide in Human
auteur
Nejib Zemzemi, Javier Saiz Rodriguez, Rodriguez Blanca
article
CinC 2012 – Computing in Cardiology, Sep 2012, Krakow, Poland. pp.861-864
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BibTex
titre
From Body Surface Potential to Activation Maps on the Atria: a Machine Learning Technique
auteur
Nejib Zemzemi, Simon Labarthe, Rémi Dubois, Yves Coudière
article
CINC – Computing in Cardiology 2012, Sep 2012, Krakow, Poland. pp.125-128
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https://hal.inria.fr/hal-00759210/file/CinCInverseProblem.pdf BibTex

2011

Book sections

titre
Numerical simulations of electrocardiograms
auteur
Muriel Boulakia, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau, Nejib Zemzemi
article
Ambrosi, D. and Quarteroni, A. and Rozza, G. Modeling of Physiological Flows, Springer, pp.77-106, 2011, 978-88-470-1934-8
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2010

Journal articles

titre
Decoupled time-marching schemes in computational cardiac electrophysiology and ECG numerical simulation
auteur
Miguel Angel Fernández, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Biosciences, Elsevier, 2010, 226 (1), pp.58-75. ⟨10.1016/j.mbs.2010.04.003⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00411510/file/RR-7022.pdf BibTex
titre
Mathematical Modeling of Electrocardiograms: A Numerical Study
auteur
Muriel Boulakia, Serge Cazeau, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau, Nejib Zemzemi
article
Annals of Biomedical Engineering, Springer Verlag, 2010, 38 (3), pp.1071-1097. ⟨10.1007/s10439-009-9873-0⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00400490/file/RR-6977.pdf BibTex

2009

Conference papers

titre
Numerical simulation of the electromechanical activity of the heart
auteur
Dominique Chapelle, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau, Philippe Moireau, Jacques Sainte-Marie, Nejib Zemzemi
article
Functional Imaging and Modeling of the Heart, 2009, Nice, France. pp.357-365
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BibTex
titre
From intracardiac electrograms to electrocardiograms. Models and metamodels
auteur
Géraldine Ebrard, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau, Fabrice Rossi, Nejib Zemzemi
article
Functional Imaging and Modeling of the Heart, 2009, Nice, France. pp.524-533
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Theses

titre
Theoretical and Numerical study of the electric activity of the heart. Modeling and Numerical simulation of electrocardiograms.
auteur
Nejib Zemzemi
article
Mathematics [math]. Université Paris Sud – Paris XI, 2009. English
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00470375/file/these.pdf BibTex

2008

Journal articles

titre
A coupled system of PDEs and ODEs arising in electrocardiograms modelling
auteur
Muriel Boulakia, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau, Nejib Zemzemi
article
Applied Mathematics Research eXpress, Oxford University Press (OUP): Policy H – Oxford Open Option A, 2008, 2008, pp.abn002. ⟨10.1093/amrx/abn002⟩
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2007

Reports

titre
A coupled system of PDEs and ODEs arising in electrocardiograms modelling
auteur
Muriel Boulakia, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau, Nejib Zemzemi
article
[Research Report] RR-6352, INRIA. 2007, pp.24
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https://hal.inria.fr/inria-00186852/file/RR-6352.pdf BibTex

Conferences

  1. Computing in Cardiology conference 2014. September 7-10, 2014, Cambridge, MA. USA.
  2. 41st International Congress on Electrocardiology. 4 to 7 June, 2014. Bratislava, Slovakia.
  3. Inverse Problems, Control and Shape Optimization. May 7-8-9, 2014. Hammamet, Tunisia.
  4. Rencontre Sanofi “Pharmacométrie et Bio-informatique”. Chilly Mazarin, December 10th 2013.
  5. JANO’10: 10 ème Edition des Journées d’Analyse Numérique et d’Optimisatio. October 30 – November 2nd 2013., Essaouira, Morocco.
  6. Computing in Cardiology conference 2013. September 22-25, 2013. Zaragoza, Spain.
  7. 22nd International Conference on Domain Decomposition Methods. September 16-20, 2013 – Lugano, Switzerland.
  8. Computing in Cardiology conference 2012. September 9-12, 2012. Krakow, Poland.
  9. Invited speaker in “Workshop on Efficient Solvers in Biomedical Applications” . July 2-5, 2012 Graz, Austria.
  10. 21st International Conference on Domain Decomposition Methods. June 25-29 2012, Inria Rennes-Bretagne-Atlantique, France.
  11. Invited speaker: leading the VPH Network of Excellence cardiovascular study group. Presentation of cardiovas-cular modeling challenges. May 7-11, 2012. Barcelona, Spain.
  12. GdT au Laboratoire TrEFlE-ENSCPB. May 16, 2012. Talence, France.
  13. Cardiac Modelling Seminar. November 22nd 2011. Department of computer science, Oxford University, Oxford, UK.
  14. Computational Biology Seminar. October 2010. Oxford University Computing Laboratory, Oxford, UK.
  15. 9th World Congress on Computational Mechanics and 4th Asian Pacific Congress on Computational Mechanics (WCCM/APCOM 2010), July 19-23, 2010. Sydney Australia.
  16. International Workshop on Biomathematics and Biomechanics, November 20-23, 2009. Tozeur, Tunisia.
  17. International Conference on Functional Imaging and Modelling of the Heart (FIMH09). Jun, 03-05 2009, Nice. France.
  18. Groupe de Travail des Thesards du LJLL. December 02 2008, Paris, France.
  19. Open Bang Seminar. November 04 2008, INRIA-Rocquencourt Paris, France
  20. International Conference of Numerical Analysis and Applied Mathematics 2008 (ICNAAM 2008). September 14- 20 2008, Kos, Greece.
  21. Premiere rencontre CRM-INRIA-MITACS. May 02-09 2008, Montreal, CANADA.
  22. International Conference of Partial Differential Equations and Applications. Mars 25-29 2008, Hammamet, Tunisia.
  23. GDR Mathématiques pour la Biologie et la Médecine (MABEM). December 05-07 2007 à l’Institut de Mathématiques de Bordeaux, France.
  24. 10th Young Researchers and Life Sciences Meeting. April 25-27 2007. Institut Curie Paris, France.

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