Biography
I’m a researcher at the French National Institute for Research in Computer Science and Control (INRIA), I obtained my master degree in 2006 and my PHD on 2009 in applied mathematics at the university of Paris-XI. In 2010 I moved to the department of computer science at Oxford university where I made my postdoctoral research about numerical assessment of drugs effect on the electrical activity of the heart. I have been working at Inria-Bordeaux since 2012 in the CARMEN team and my work is about modelling and numerical simulation of electrocardiograms with a special focus on the electrocardiographic imaging inverse problem.
Contact
Inria Bordeaux Sud-Ouest
200 rue de la vieille tour
33405 Talence Cedex, France
E-mail: nejib.zemzemi@inria.fr
Co-leader of the Epicard associate team
Projects
Inverse Problem in Electrocardiography
In scilico assessment of drugs action on the heart electrical activity
CardioXcomp
MedicActiV
Softwares
Supervision
PHD students
- Amel Karoui. New approches for solving inverse problems in cardiac electrophysiology. (co-advisor: Mostafa Bendahmane). Defence expected in October 2020.
- Yassine Abidi. Theoretical and numerical analysis of parameter estimation problem in cardiac electrophysiology. (co-advisor: Moncef Mahjoub and Mourad Bellassoued). Defence expected in October 2018.
- Wajih M’Barki. Analysis of numerical methods in myocardium/purkinje coupling models. (co-advisor: Saloua Mani-Aouadi). Defended in July 2017
- Jamila Lassoued. Parameter estimation problems in cardiac electrophysiology. (co-advisor: Moncef Mahjoub). Defended in July 2016.
Post-docs
- Cesare Corrado. Reduced order modelling in cardiac electrophysiology.
- Julien Bouyssier. Factorization of boundary problem method for the electrocardiography inverse problem. (co-advisor: Jacques Henry).
Engineers
- Mehdi Juhoor. Developpement Cardiac ElectroPhysiology Solver (CEPS).
(co-advisor: Yves Coudière). CEPS would be used by resherchers in th LIRYC institute.
- Cesare Corrado. Developpement of scalable reduced order methods in a massively parallel cardiac electrophysiology solver. Simulation of cases for MedicActiV project.
- Dragan Amenga M’bengue. Segmentation of CT-scan and MR-images for computer models. MedicActiV project
- Emanuela Abbate. Developpment of numerical tools for drug/stem-cells interaction. CardioXcomp project.
Publications
2023
Journal articles
- titre
- Comparison of two segmentation software tools for deep brain stimulation of the subthalamic and ventro-intermedius nuclei
- auteur
- Paul-Eugène Constanthin, Nejib Zemzemi, Emmanuel Cuny, Julien Engelhardt
- article
- Acta Neurochirurgica, 2023, ⟨10.1007/s00701-023-05819-9⟩
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-
- titre
- Artificial Intelligence for Detection of Ventricular Oversensing Machine Learning Approaches for Noise Detection Within Non-Sustained Ventricular Tachycardia Episodes Remotely Transmitted by Pacemakers and Implantable Cardioverter Defibrillators
- auteur
- Marc Strik, Benjamin Sacristan, Pierre Bordachar, Josselin Duchateau, Romain Eschalier, Pierre Mondoly, Julien Laborderie, Narimane Gassa, Nejib Zemzemi, Maxime Laborde, Juan Garrido, Clara Matencio Perabla, Guillermo Jimenez-Perez, Oscar Camara, Michel Haïssaguerre, Rémi Dubois, Sylvain Ploux
- article
- Heart Rhythm, In press, ⟨10.1016/j.hrthm.2023.06.019⟩
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-
Poster communications
- titre
- Inter-operator segmentation variability induces high premature ventricular contractions localization uncertainty at the heart base
- auteur
- Narimane Gassa, Jess Tate, Machteld Boonstra, Beata Ondrusova, Jana Svehlikova, Rob Macleod, Nejib Zemzemi
- article
- Heart Rhythm 2023 – The Society’s 44th annual meeting, May 2023, New Orleans (LA), United States. 2023
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Numerical Investigation of Methods Used In Commercial Clinical Devices for Solving the ECGI Inverse Problem
- auteur
- Narimane Gassa, Vitaly Kalinin, Nejib Zemzemi
- article
- 2023
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-
2022
Journal articles
- titre
- Global Lipschitz stability of multiple space dependent ionic parameters for the MEA/hiPSC-CM assays
- auteur
- Hamza Ammar, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
- article
- Inverse Problems, 2022, 39 (1), pp.015010. ⟨10.1088/1361-6420/aca70d⟩
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-
- titre
- MUSIC: Cardiac Imaging, Modelling and Visualisation Software for Diagnosis and Therapy
- auteur
- Mathilde Merle, Florent Collot, Julien Castelneau, Pauline Migerditichan, Mehdi Juhoor, Buntheng Ly, Valery Ozenne, Bruno Quesson, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Pierre Jaïs, Hubert Cochet, Maxime Sermesant
- article
- Applied Sciences, 2022, 12 (12), pp.6145. ⟨10.3390/app12126145⟩
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-
Conference papers
- titre
- RebrAIn A New Clinical Targeting of VIM and STN Based on Supervised Statistical Learning: Study on Localization of the Prediction
- auteur
- Nejib Zemzemi, Julien Engelhardt, Emmanuel Cuny, Dominique Guehl, Pierre Burbaud
- article
- INS 2022 Interim Meeting, Nov 2022, Mumbai (India), France. pp.S35, ⟨10.1016/j.neurom.2023.02.056⟩
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-
- titre
- The Effect of Segmentation Variability in Forward ECG Simulation
- auteur
- Beata Ondrusova, Machteld Boonstra, Jana Svehlikova, Dana Brooks, Peter van Dam, Ali Salman Rababah, Akil Narayan, Rob Macleod, Nejib Zemzemi, Jess Tate
- article
- Computing in Cardiology 2022, Sep 2022, Tampere, Finland
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-
- titre
- Effect of Segmentation Uncertainty on the ECGI Inverse Problem Solution and Source Localization
- auteur
- Narimane Gassa, Machteld Boonstra, Jana Svehlikova, Dana Brooks, Akil Narayan, Peter van Dam, Rob Macleod, Jess Tate, Nejib Zemzemi
- article
- Computing in Cardiology 2022, Sep 2022, Tampere, Finland
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-
- titre
- Segmentation Uncertainty Quantification in Cardiac Propagation Models
- auteur
- Jess D Tate, Nejib Zemzemi, Shireen Elhabian, Beáta Ondrusová, Machteld Boonstra, Peter van Dam, Akil Narayan, Dana H Brooks, Rob S Macleod
- article
- CinC 2022 – 49th Computing in Cardiology Conference, Sep 2022, Tampere, Finland
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Global Lipschitz stability of multiple space dependent ionic parameters in cardiac electrophysiology
- auteur
- Hamza Ammar, Moncef Mahjoub, Néjib Zemzemi
- article
- 2022
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-
2021
Journal articles
- titre
- Clinical VIM targeting for deep brain stimulation based on an augmented intelligence. The RebrAIn solution
- auteur
- Julien Engelhardt, Nejib Zemzemi, Dominique Guehl, Pierre Burbaud, Nathalie Damon-Perriere, Emmanuel Cuny
- article
- Brain Stimulation, 2021, 14 (6), pp.1634-1635. ⟨10.1016/j.brs.2021.10.150⟩
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-
- titre
- Prediction of Clinical Deep Brain Stimulation Target for Essential Tremor From 1.5 Tesla MRI Anatomical Landmarks
- auteur
- Julien Engelhardt, Emmanuel Cuny, Dominique Guehl, Pierre Burbaud, Nathalie Damon-Perrière, Camille Dallies-Labourdette, Juliette Thomas, Olivier Branchard, Louise-Amélie Schmitt, Narimane Gassa, Nejib Zemzemi
- article
- Frontiers in Neurology, 2021, 12, ⟨10.3389/fneur.2021.620360⟩
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-
- titre
- Cardiac Activation Maps Reconstruction: A Comparative Study Between Data-Driven and Physics-Based Methods
- auteur
- Amel Karoui, Mostafa Bendahmane, Nejib Zemzemi
- article
- Frontiers in Physiology, 2021, 12, ⟨10.3389/fphys.2021.686136⟩
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-
- titre
- Analysis of the heart-torso conductivity parameters recovery inverse problem in cardiac electrophysiology ECG modelling
- auteur
- Abir Amri, Mourad Bellassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
- article
- Applicable Analysis, 2021, pp.1-30. ⟨10.1080/00036811.2021.1955861⟩
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-
Conference papers
- titre
- A Cardiac Shape Model for Segmentation Uncertainty Quantification
- auteur
- Jess Tate, Shireen Elhabian, Nejib Zemzemi, Wilson Good, Peter van Dam, Dana Brooks, Rob Macleod
- article
- 2021 Computing in Cardiology (CinC), Sep 2021, Brno, Czech Republic. pp.1-4, ⟨10.22489/CinC.2021.146⟩
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-
- titre
- In-Silico Data Based Machine Learning Technique Predicts Premature Ventricular Contraction Origin Coordinates
- auteur
- Andony Arrieula, Hubert Cochet, Pierre Jaïs, Michel Haïssaguerre, Nejib Zemzemi, Mark Potse
- article
- Computing in Cardiology 2021 – 48th Computing in Cardiology Conference, Sep 2021, Brno / Virtual, Czech Republic
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-
- titre
- Benchmark of deep learning algorithms for the automatic screening in electrocardiograms transmitted by implantable cardiac devices
- auteur
- Narimane Gassa, Benjamin Sacristan, Nejib Zemzemi, Maxime Laborde, Juan Garrido Oliver, Clara Matencio Perabla, Guillermo Jimenez-Perez, Oscar Camara, Sylvain Ploux, Marc Strik, Pierre Bordachar, Remi Dubois
- article
- CINC 2021 – Computing In Cardiology, Sep 2021, Brno, Czech Republic
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-
- titre
- Uncertainty Quantification of the Effects of Segmentation Variability in ECGI
- auteur
- Jess D Tate, Wilson Good, Nejib Zemzemi, Machteld Boonstra, Peter van Dam, Dana H Brooks, Akil Narayan, Rob S Macleod
- article
- FIMH 2021 – 11th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2021, Stanford, United States. pp.515-522, ⟨10.1007/978-3-030-78710-3_49⟩
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-
Book sections
- titre
- Spiral Waves Generation Using an Eikonal-Reaction Cardiac Electrophysiology Model
- auteur
- Narimane Gassa, Nejib Zemzemi, Cesare Corrado, Yves Coudière
- article
- Functional Imaging and Modeling of the Heart 2021: International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, pp.523-530, 2021, ⟨10.1007/978-3-030-78710-3_50⟩
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-
2020
Journal articles
- titre
- Virtual FFR quantified with a generalized flow model using Windkessel boundary conditions ; Application to a patient-specific coronary tree.
- auteur
- Keltoum Chahour, Rajae Aboulaich, Abderrahmane Habbal, Nejib Zemzemi, Cherif Abdelkhirane
- article
- Computational and Mathematical Methods in Medicine, 2020, 2020, pp.14. ⟨10.1155/2020/3942152⟩
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-
Conference papers
- titre
- Shape Analysis of Segmentation Variability
- auteur
- Jess D Tate, Nejib Zemzemi, Wilson W Good, Peter van Dam, Dana H Brooks, Rob S Macleod
- article
- CinC 2020 – Computing in Cardiology Conference, Sep 2020, Rimini, Italy. ⟨10.22489/CinC.2020.466⟩
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-
2019
Journal articles
- titre
- On Simulating the Effect of Sodium Channel Block on Cardiac Electromechanics
- auteur
- Noha Shalaby, Nejib Zemzemi, Khalil Elkhodary
- article
- Proceedings of the Institution of Mechanical Engineers, Part H: Journal of Engineering in Medicine, 2019
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-
- titre
- Propagation of two independent sources of uncertainty in the electrocardiography imaging inverse solution
- auteur
- Najib Fikal, Rajae Aboulaich, Emahdi El Guarmah, Nejib Zemzemi
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2019, 14 (2), ⟨10.1051/mmnp/2018065⟩
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-
- titre
- Ionic parameters identification of an inverse problem of strongly coupled PDE’s system in cardiac electrophysiology using Carleman estimates
- auteur
- Yassine Abidi, Mourad Bellassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2019, Mathematical Modelling in Cardiology, 14 (2), ⟨10.1051/mmnp/2018060⟩
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-
- titre
- Analysis of the ECGI inverse problem solution with respect to the measurement boundary size and the distribution of noise
- auteur
- Mohammed Addouche, Nadra Bouarroudj, Fadhel Jday, Jacques Henry, Nejib Zemzemi
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2019, ⟨10.1051/mmnp/2018061⟩
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-
- titre
- A nash game algorithm for the solution of coupled conductivity identification and data completion in cardiac electrophysiology
- auteur
- Rabeb Chamekh, Abderrahmane Habbal, Moez Kallel, Nejib Zemzemi
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2019, Mathematical modelling in cardiology, 14 (2), pp.15. ⟨10.1051/mmnp/2018059⟩
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-
- titre
- Towards the modelling of the Purkinje/ myocardium coupled problem: A well-posedness analysis
- auteur
- Saloua Mani Aouadi, Wajih Mbarki, Nejib Zemzemi
- article
- Journal of Computational and Applied Mathematics, 2019, ⟨10.1016/j.cam.2018.10.024⟩
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-
Conference papers
- titre
- Direct Mapping from Body Surface Potentials to Cardiac Activation Maps Using Neural Networks
- auteur
- Amel Karoui, Mostafa Bendahamane, Nejib Zemzemi
- article
- CinC 2019 – Computing in Cardiology Conference, Sep 2019, Singapour, Singapore. ⟨10.22489/CinC.2019.253⟩
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-
- titre
- Space rescaling in the MFS method improves the ECGI reconstruction
- auteur
- Pauline Migerditichan, Mark Potse, Nejib Zemzemi
- article
- CinC 2019 – Computing in Cardiology 2019, Sep 2019, Singapour, Singapore
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Spatial Adaptation of the Time Delay Neural Network for Solving ECGI Inverse Problem
- auteur
- Amel Karoui, Mostafa Bendahmane, Nejib Zemzemi
- article
- FIMH 2019 – 10th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2019, Bordeaux, France. pp.94-102, ⟨10.1007/978-3-030-21949-9_11⟩
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-
- titre
- Maximal conductances ionic parameters estimation in cardiac electrophysiology multiscale modelling
- auteur
- Yassine Abidi, Julien Bouyssier, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
- article
- FIMH 2019 – 10th International Conference Functionnal Imaging and Modeling of the Heart, Y. Coudière, V. Ozenne, E. Vigmond and N. Zemzemi, Jun 2019, Bordeaux, France. pp.131-138, ⟨10.1007/978-3-030-21949-9⟩
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-
Proceedings
- titre
- Functional Imaging and Modeling of the Heart
- auteur
- Yves Coudière, Nejib Zemzemi, Edward J. Vigmond, Valéry Ozenne
- article
- FIMH 2019 – 10th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2019, 11504, Springer, 2019, LNCS – Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-030-21949-9⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Ionic Parameters Estimation in Multi-Scale Cardiac Electrophysiology Modelling
- auteur
- Yassine Abidi, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
- article
- 2019
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-
2018
Journal articles
- titre
- Evaluation of fifteen algorithms for the resolution of the electrocardiography imaging inverse problem using ex-vivo and in-silico data
- auteur
- Amel Karoui, Laura Bear, Pauline Migerditichan, Nejib Zemzemi
- article
- Frontiers in Physiology, 2018, Electrocardiographic Imaging, 9, pp.1708
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-
- titre
- A conduction velocity adapted eikonal model for electrophysiology problems with re-excitability evaluation
- auteur
- Cesare Corrado, Nejib Zemzemi
- article
- Medical Image Analysis, 2018, 43, pp.186-197. ⟨10.1016/j.media.2017.11.002⟩
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-
- titre
- Identification of ion currents components generating field potential recorded in MEA from hiPSC-CM
- auteur
- Fabien Raphel, Muriel Boulakia, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Jean-Michel Guillon, Philippe Zitoun, Jean-Frédéric Gerbeau
- article
- IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2018, 65 (6), pp.1311-1319. ⟨10.1109/TBME.2017.2748798⟩
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-
- titre
- In silico assessment of the effects of various compounds in MEA/hiPSC-CM assays: Modelling and numerical simulations
- auteur
- Emanuela Abbate, Muriel Boulakia, Yves Coudière, Jean-Frédéric Gerbeau, Philippe Zitoun, Nejib Zemzemi
- article
- Journal of Pharmacological and Toxicological Methods, 2018, 89, pp.59-72
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-
- titre
- Numerical simulation of the fractional flow reserve (FFR)
- auteur
- Keltoum Chahour, Rajae Aboulaich, Abderrahmane Habbal, Cherif Abdelkhirane, Nejib Zemzemi
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, In press, Special issue “Mathematical Modelling in Cardiology”
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-
Conference papers
- titre
- The Heart Recording Conditions Impact the Assessment of the Electrocardiography Imaging Inverse Solution
- auteur
- Amel Karoui, Laura Bear, Pauline Migerditichan, Mostafa Bendahmane, Nejib Zemzemi
- article
- CinC 2018 – 45th Computing in Cardiology Conference, Sep 2018, Maastricht, Netherlands
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2017
Journal articles
- titre
- Stability analysis of decoupled time-stepping schemes for the specialized conduction system/myocardium coupled problem in cardiology
- auteur
- Salwa Aouadi, W Mbarki, Nejib Zemzemi
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2017, Mathematical models in physiology, 12 (5), pp.208-239. ⟨10.1051/mmnp/201712513⟩
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-
- titre
- An Analytical Model for the Effects of the Spatial Resolution of Electrode Systems on the Spectrum of Cardiac Signals
- auteur
- Ferney Beltrán-Molina, Jesús Requena-Carrión, Felipe Alonso-Atienza, Nejib Zemzemi
- article
- IEEE Access, 2017, 5, pp.18488-18497. ⟨10.1109/ACCESS.2017.2747632⟩
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-
Conference papers
- titre
- Inverse Problem of Electrocardiography: estimating the location of cardiac isquemia in a 3D geometry
- auteur
- C.E. Chavez, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Felipe Alonso-Atienza, Diegó Alvarez
- article
- Functional Imaging and modelling of the heart (FIMH2015), Jun 2017, Maastricht, Netherlands. ⟨10.1007/978-3-319-20309-6_45⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- New approach for solving electrocardiography imaging inverse problem with missing data on the body surface
- auteur
- Mohammed Addouche, Nadra Bouarroudj, Jacques Henry, Fadhel Jday, Nejib Zemzemi
- article
- Tendances des Applications Mathématiques en Tunisie, Algérie, Maroc 10-13 mai 2017, May 2017, Hammamet, Tunisia
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Reports
- titre
- A conduction velocity adapted eikonal model for electrophysiology problems with re-excitability evaluation
- auteur
- Cesare Corrado, Nejib Zemzemi
- article
- [Research Report] Inria Bordeaux Sud-Ouest; King’s College London. 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- On the identification of multiple space dependent ionic parameters in cardiac electrophysiology modelling
- auteur
- Yassine Abidi, Mourad Bellassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
- article
- [Research Report] INRIA. 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Sensitivity of the electrocardiographic problem to multiple independent sources of uncertainty
- auteur
- Rajae Aboulaich, Najib Fikal, Emahdi El Guarmah, Nejib Zemzemi
- article
- 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2016
Journal articles
- titre
- Human ventricular activation sequence and the simulation of the electrocardiographic QRS complex and its variability in healthy and intraventricular block conditions
- auteur
- Louie Cardone-Noott, Alfonso Bueno-Orovio, Ana Mincholé, Nejib Zemzemi, Blanca Rodriguez
- article
- EP-Europace, 2016, ⟨10.1093/europace/euw346⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Stochastic Finite Element Method for torso conductivity uncertainties quantification in electrocardiography inverse problem
- auteur
- Rajae Aboulaich, Najib Fikal, Emahdi El Guarmah, Nejib Zemzemi
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2016, 11 (2), pp.1-19. ⟨10.1051/mmnp/201611201⟩
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-
- titre
- Stability results for the parameter identification inverse problem in cardiac electrophysiology
- auteur
- Jamila Lassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
- article
- Inverse Problems, 2016, 32 (11), pp.1-31. ⟨10.1088/0266-5611/32/11/115002⟩
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-
Conference papers
- titre
- Sensitivity of the electrocardiographic forward problem to the heart potential measuement noise and conductivity uncertainties
- auteur
- Rajae Aboulaich, Najib Fikal, El Mahdi Guarmah, Nejib Zemzemi
- article
- Colloque africain sur la recherche en informatique et mathématiques appliquées, CARI 2016, Oct 2016, Hammamet, Tunisia
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Identification of sources for the bidomain equation using topological gradient
- auteur
- Jamila Lassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
- article
- Colloque africain sur la recherche en informatique et mathématiques appliquées, CARI 2016, Oct 2016, Hammamet, France
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-
- titre
- Optimization of Organ Conductivity for the Forward Problem of Electrocardiography
- auteur
- Laura Bear, Rémi Dubois, Nejib Zemzemi
- article
- Computing In cardiology, Sep 2016, Vancouver, Canada
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Decentralized Strategies for Ill Posed Inverse Problems
- auteur
- Abderrahmane Habbal, Moez Kallel, Rabeb Chamekh, Nejib Zemzemi
- article
- 5th International Conference on Engineering Optimization, Jun 2016, Iguassu Falls, Brazil
- Accès au bibtex
-
- titre
- A Nash-game approach to solve the Coupled problem of conductivity identification and data completion
- auteur
- Rabeb Chamekh, Abderrahmane Habbal, Moez Kallel, Nejib Zemzemi
- article
- PICOF (Problèmes Inverses, Contrôle et Optimisation de Formes), Jun 2016, Autrans, France
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-
- titre
- Stability results for the parameter identification inverse problem in cardiac electrophysiology
- auteur
- Lassoued Jamila, Mahjoub Moncef, Nejib Zemzemi
- article
- PICOF (Problèmes Inverses, Contrôle et Optimisation de Formes), Jun 2016, Autrans, France
- Accès au bibtex
-
Poster communications
- titre
- Parameters estimation approach for the MEA/hiPSC-CM assays
- auteur
- Julien Bouyssier, Mostafa Bendahmane, Yves Coudière, Jean-Frédéric Gerbeau, Julien Pedron, Philippe Zitoun, Nejib Zemzemi
- article
- Journées scientifiques du LIRYC, Sep 2016, Pessac, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimization of Organ Conductivity for the Forward Problem of Electrocardiography
- auteur
- Laura Bear, Rémi Dubois, Nejib Zemzemi
- article
- Journées scientifiques du LIRYC, Sep 2016, Pessac, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2015
Journal articles
- titre
- Stability analysis of the POD reduced order method for solving the bidomain model in cardiac electrophysiology
- auteur
- Cesare Corrado, Jamila Lassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
- article
- Mathematical Biosciences, 2015, ⟨10.1016/j.mbs.2015.12.005⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Accuracy of Lead Removal vs Linear Interpolation in Non-Invasive Electrocardiographic Imaging (ECGI)
- auteur
- Laura Bear, Mark Potse, Josselin Duchateau, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Rémi Dubois
- article
- Computing in cardiology, Sep 2015, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Inverse Localization of Ischemia in a 3D Realistic Geometry: A Level Set Approach
- auteur
- Carlos E. Chavez, Felipe Alonso-Atienza, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Diegó Alvarez
- article
- Computing in cardiology, Sep 2015, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Local Conduction Velocity Mapping for Electrocardiographic Imaging
- auteur
- Corentin Dallet, Laura Bear, Josselin Duchateau, Mark Potse, Nejib Zemzemi, Valentin Meillet, Yves Coudière, Rémi Dubois
- article
- Computing in cardiology, Sep 2015, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Effect of the torso conductivity heterogeneities on the ECGI inverse problem solution
- auteur
- Nejib Zemzemi, Cecile Dobrzynski, Laura Bear, Mark Potse, Corentin Dallet, Yves Coudière, Remi Dubois, Josselin Duchateau
- article
- Computing in cardiology, Sep 2015, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Inverse problem in electrocardography via the factorization method of boundary value problems
- auteur
- Julien Bouyssier, Nejib Zemzemi, Jacques Henry
- article
- IEEE 12th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2015, Apr 2015, New York, France. ⟨10.1109/ISBI.2015.7163979⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- In silico assessment of drugs effects on human embryonic stem cells derived cardiomyocytes electrical activity
- auteur
- Emanuela Abbate, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Jean-Frédéric Gerbeau
- article
- LACM 2015 (2nd International Workshop on Latest Advances in Cardiac Modeling), Mar 2015, German Heart Center, Munich, Germany
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- Sensitivity of the Electrocardiography Inverse Solution to the Torso Conductivity Uncertainties
- auteur
- Nejib Zemzemi, Rajae Aboulaich, Najib Fikal, Emahdi El Guarmah
- article
- Hans van Assen; Peter Bovendeerd ; Tammo Delhaas. Functional Imaging and Modeling of the Heart, Lecture Notes in Computer Science (9126), Springer, pp.475-483, 2015, 8th International Conference, FIMH 2015, Maastricht, The Netherlands, June 25-27, 2015. Proceedings, 978-3-319-20308-9. ⟨10.1007/978-3-319-20309-6_54⟩
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-
Poster communications
- titre
- Overview on the Cardiac ElectroPhysiology Simulator (CEPS)
- auteur
- Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Florian Caro, Marc Fuentes
- article
- Meeting at the Lyric, Jun 2015, Bordeaux, France
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-
- titre
- Sensitivity of the electrocardiography inverse solution to the torso conductivity uncertainties
- auteur
- Rajae Aboulaich, Najib Fikal, El Mahdi El Guarmah, Nejib Zemzemi
- article
- LIRYC scientific day, Jun 2015, Pessac, France
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-
- titre
- New Mathematical approaches in Electrocardiography Imaging inverse problem
- auteur
- Nejib Zemzemi, Mark Potse, Laura Bear, Yves Coudière, Rémi Dubois, Jacques Henry, C Dallet, Josselin Duchateau, O Bernus, M Haïssaguerre
- article
- LIRYC scientific day, Jun 2015, Pessac, France
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-
2014
Journal articles
- titre
- Effects of L-type calcium channel and human ether-a-go-go related gene blockers on the electrical activity of the human heart: a simulation study
- auteur
- Nejib Zemzemi, Rodriguez Blanca
- article
- EP-Europace, 2014, ⟨10.1093/europace/euu122⟩
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-
Conference papers
- titre
- An Iterative method for solving the inverse problem in Electrocardiography imaging: From body surface to heart potential.
- auteur
- Nejib Zemzemi, Hamed Bourenane, Hubert Cochet
- article
- IEEE Computers in Cardiology, MIT, Sep 2014, Cambridge, United States
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-
- titre
- A Computational Investigation into the Effect of Infarction on Clinical Human Electrophysiology Biomarkers
- auteur
- Louie Cardone-Noott, Alfonso Bueno-Orovio, Ana Mincholé, Kevin Burrage, Mikael Wallman, Nejib Zemzemi, Erica Dall’Armellina, Rodriguez Blanca
- article
- IEEE Computers in Cardiology, Sep 2014, Cambridge, United States
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-
- titre
- An iterative method for solving the inverse problem in electrocardiography in normal and fibrillation conditions: A simulation Study
- auteur
- Nejib Zemzemi
- article
- International Congress on Electrocardiology (ICE), Jun 2014, Bratislava, Slovakia. pp.53-56
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-
- titre
- Inverse ECG problem using the factorization method
- auteur
- Nejib Zemzemi, Julien Bouyssier
- article
- PICOF’2014, LAMSIN, May 2014, Hammamet, Tunisia
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-
Reports
- titre
- Numerical Investigation on the usefulness of Proper Orthogonal Decomposition method in cardiac electrophysiology
- auteur
- Jamila Lassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
- article
- [Research Report] 2014, pp.20
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-
2013
Journal articles
- titre
- Chaste: an open source C++ library for computational physiology and biology.
- auteur
- Mirams Gary, Christopher J. Arthurs, Miguel O. Bernabeu, Rafel Bordas, Jonathan Cooper, Alberto Corrias, Yohan Davit, Sara-Jane Dunn, Alexander G. Fletcher, Daniel G. Harvey, Megan E. Marsh, James M. Osborne, Pras Pathmanathan, Joe Pitt-Francis, James Southern, Nejib Zemzemi, David J. Gavaghan
- article
- PLoS Computational Biology, 2013, 9 (3)
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-
Conference papers
- titre
- A Steklov-Poincaré Variational Formulation of the Inverse Problem in Cardiac Electrophysiology
- auteur
- Nejib Zemzemi
- article
- CinC – Computing in Cardiology Conference, Sep 2013, Zaragoza, Spain. pp.193
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-
- titre
- A Machine Learning Technique Regularization of the Inverse Problem in Cardiac Electrophysiology
- auteur
- Nejib Zemzemi, Rémi Dubois, Yves Coudière, Olivier Bernus, M. Haïssaguerre
- article
- CinC – Computing in Cardiology Conference, Sep 2013, Zaragoza, Spain. pp.285-312
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-
- titre
- A Domain Decomposition Approch in the Electrocardiography Inverse Problem
- auteur
- Nejib Zemzemi
- article
- Domain Decomposition 22, Università della Svizzera italiana, Sep 2013, Lugano, Switzerland
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-
Other publications
- titre
- Reduced Order Methods: Faster Solvers For Cardiac Electro-physiology problems
- auteur
- Cesare Corrado, Nejib Zemzemi, Yves Coudière
- article
- 2013
- Accès au bibtex
-
- titre
- Inverse problem in electrocardiography via factorization method of boundary problems : how reconstruct epicardial potential maps from measurements of the torso ?
- auteur
- Julien Bouyssier, Nejib Zemzemi, Jacques Henry
- article
- 2013
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-
Poster communications
- titre
- C.E.P.S. : an efficient tool for cardiac electrophysiology simulations
- auteur
- Mehdi Juhoor, Yves Coudière, Nejib Zemzemi
- article
- Workshop LIRYC, Oct 2013, Bordeaux, France
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-
2012
Journal articles
- titre
- Computational assessment of drug-induced effects on the electrocardiogram: from ion channel to body surface potentials
- auteur
- Nejib Zemzemi, Miguel Oscar Bernabeu, Javier Saiz Rodriguez, Jonathan Cooper, Pras Pathmanathan, Gary Mirams, Joe Pitt-Francis, Rodriguez Blanca
- article
- British Journal of Pharmacology, 2012, 168 (3), pp.718-733. ⟨10.1111/j.1476-5381.2012.02200.x⟩
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Role of L-type Calcium in Modulating Pro-Arrhythmic Effects of Dofetilide in Human
- auteur
- Nejib Zemzemi, Javier Saiz Rodriguez, Rodriguez Blanca
- article
- CinC 2012 – Computing in Cardiology, Sep 2012, Krakow, Poland. pp.861-864
- Accès au bibtex
-
- titre
- From Body Surface Potential to Activation Maps on the Atria: a Machine Learning Technique
- auteur
- Nejib Zemzemi, Simon Labarthe, Rémi Dubois, Yves Coudière
- article
- CINC – Computing in Cardiology 2012, Sep 2012, Krakow, Poland. pp.125-128
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-
2011
Book sections
- titre
- Numerical simulations of electrocardiograms
- auteur
- Muriel Boulakia, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau, Nejib Zemzemi
- article
- Ambrosi, D. and Quarteroni, A. and Rozza, G. Modeling of Physiological Flows, Springer, pp.77-106, 2011, 978-88-470-1934-8
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-
2010
Journal articles
- titre
- Decoupled time-marching schemes in computational cardiac electrophysiology and ECG numerical simulation
- auteur
- Miguel Angel Fernández, Nejib Zemzemi
- article
- Mathematical Biosciences, 2010, 226 (1), pp.58-75. ⟨10.1016/j.mbs.2010.04.003⟩
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-
- titre
- Mathematical Modeling of Electrocardiograms: A Numerical Study
- auteur
- Muriel Boulakia, Serge Cazeau, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau, Nejib Zemzemi
- article
- Annals of Biomedical Engineering, 2010, 38 (3), pp.1071-1097. ⟨10.1007/s10439-009-9873-0⟩
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-
2009
Conference papers
- titre
- From intracardiac electrograms to electrocardiograms. Models and metamodels
- auteur
- Géraldine Ebrard, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau, Fabrice Rossi, Nejib Zemzemi
- article
- Functional Imaging and Modeling of the Heart, 2009, Nice, France. pp.524-533
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-
- titre
- Numerical simulation of the electromechanical activity of the heart
- auteur
- Dominique Chapelle, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau, Philippe Moireau, Jacques Sainte-Marie, Nejib Zemzemi
- article
- Functional Imaging and Modeling of the Heart, 2009, Nice, France. pp.357-365
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-
Theses
- titre
- Theoretical and Numerical study of the electric activity of the heart. Modeling and Numerical simulation of electrocardiograms.
- auteur
- Nejib Zemzemi
- article
- Mathematics [math]. Université Paris Sud – Paris XI, 2009. English. ⟨NNT : ⟩
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-
2008
Journal articles
- titre
- A coupled system of PDEs and ODEs arising in electrocardiograms modelling
- auteur
- Muriel Boulakia, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau, Nejib Zemzemi
- article
- Applied Mathematics Research eXpress, 2008, 2008, pp.abn002. ⟨10.1093/amrx/abn002⟩
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-
2007
Reports
- titre
- A coupled system of PDEs and ODEs arising in electrocardiograms modelling
- auteur
- Muriel Boulakia, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau, Nejib Zemzemi
- article
- [Research Report] RR-6352, INRIA. 2007, pp.24
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-
Conferences
- Computing in Cardiology conference 2014. September 7-10, 2014, Cambridge, MA. USA.
- 41st International Congress on Electrocardiology. 4 to 7 June, 2014. Bratislava, Slovakia.
- Inverse Problems, Control and Shape Optimization. May 7-8-9, 2014. Hammamet, Tunisia.
- Rencontre Sanofi “Pharmacométrie et Bio-informatique”. Chilly Mazarin, December 10th 2013.
- JANO’10: 10 ème Edition des Journées d’Analyse Numérique et d’Optimisatio. October 30 – November 2nd 2013., Essaouira, Morocco.
- Computing in Cardiology conference 2013. September 22-25, 2013. Zaragoza, Spain.
- 22nd International Conference on Domain Decomposition Methods. September 16-20, 2013 – Lugano, Switzerland.
- Computing in Cardiology conference 2012. September 9-12, 2012. Krakow, Poland.
- Invited speaker in “Workshop on Efficient Solvers in Biomedical Applications” . July 2-5, 2012 Graz, Austria.
- 21st International Conference on Domain Decomposition Methods. June 25-29 2012, Inria Rennes-Bretagne-Atlantique, France.
- Invited speaker: leading the VPH Network of Excellence cardiovascular study group. Presentation of cardiovas-cular modeling challenges. May 7-11, 2012. Barcelona, Spain.
- GdT au Laboratoire TrEFlE-ENSCPB. May 16, 2012. Talence, France.
- Cardiac Modelling Seminar. November 22nd 2011. Department of computer science, Oxford University, Oxford, UK.
- Computational Biology Seminar. October 2010. Oxford University Computing Laboratory, Oxford, UK.
- 9th World Congress on Computational Mechanics and 4th Asian Pacific Congress on Computational Mechanics (WCCM/APCOM 2010), July 19-23, 2010. Sydney Australia.
- International Workshop on Biomathematics and Biomechanics, November 20-23, 2009. Tozeur, Tunisia.
- International Conference on Functional Imaging and Modelling of the Heart (FIMH09). Jun, 03-05 2009, Nice. France.
- Groupe de Travail des Thesards du LJLL. December 02 2008, Paris, France.
- Open Bang Seminar. November 04 2008, INRIA-Rocquencourt Paris, France
- International Conference of Numerical Analysis and Applied Mathematics 2008 (ICNAAM 2008). September 14- 20 2008, Kos, Greece.
- Premiere rencontre CRM-INRIA-MITACS. May 02-09 2008, Montreal, CANADA.
- International Conference of Partial Differential Equations and Applications. Mars 25-29 2008, Hammamet, Tunisia.
- GDR Mathématiques pour la Biologie et la Médecine (MABEM). December 05-07 2007 à l’Institut de Mathématiques de Bordeaux, France.
- 10th Young Researchers and Life Sciences Meeting. April 25-27 2007. Institut Curie Paris, France.
