Publications

Publications HAL du labo/EPI 172042

2024

Conference papers

titre
Bidomain Model Coupled To A Realistic Multi-Electrode Device In Cardiac Electrophysiology
auteur
Valentin Pannetier, Yves Coudière, Michael Leguèbe
article
CANUM 2024 – Congrès National d’Analyse Numérique, May 2024, Le Bois-Plage-en-Ré, Île de Ré, France
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https://inria.hal.science/hal-04610592/file/canum_2024.pdf BibTex

Poster communications

titre
The MICROCARD project
auteur
Mark Potse
article
EuroHPC Summit 2024 – The European High Performance Computing, Mar 2024, Antwerp, Belgium
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https://inria.hal.science/hal-04713117/file/depot.pdf BibTex

Documents associated with scientific events

titre
Modeling the heart cell by cell: the MICROCARD project
auteur
Mark Potse
article
Cardiac Physiome meeting 2024, Sep 2024, Freiburg, Germany
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https://inria.hal.science/hal-04713134/file/abstract_microcard.pdf BibTex

Theses

titre
Numerical methods for solving clinical problems in cardiac electrophysiology
auteur
Narimane Gassa
article
Mathematics [math]. Université de Bordeaux, 2024. English. ⟨NNT : 2024BORD0045⟩
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https://theses.hal.science/tel-04635665/file/GASSA_NARIMANE_2024.pdf BibTex

2023

Journal articles

titre
Comparison of two segmentation software tools for deep brain stimulation of the subthalamic and ventro-intermedius nuclei
auteur
Paul-Eugène Constanthin, Nejib Zemzemi, Emmanuel Cuny, Julien Engelhardt
article
Acta Neurochirurgica, 2023, ⟨10.1007/s00701-023-05819-9⟩
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titre
Differences in ventricular wall composition may explain inter-patient variability in the ECG response to variations in serum potassium and calcium
auteur
Hassaan A. Bukhari, Carlos Sánchez, Pablo Laguna, Mark Potse, Esther Pueyo
article
Frontiers in Physiology, 2023, 14, pp.1060919. ⟨10.3389/fphys.2023.1060919⟩
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https://inria.hal.science/hal-04407773/file/bukhari-transmural.pdf BibTex
titre
Immersed Boundary Method for the Complete Electrode Model in Electrical Impedance Tomography
auteur
Jérémi Dardé, Niami Nasr, Lisl Weynans
article
Journal of Computational Physics, 2023, 487, pp.112150. ⟨10.1016/j.jcp.2023.112150⟩
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https://hal.science/hal-03904013/file/main.pdf BibTex
titre
Artificial Intelligence for Detection of Ventricular Oversensing Machine Learning Approaches for Noise Detection Within Non-Sustained Ventricular Tachycardia Episodes Remotely Transmitted by Pacemakers and Implantable Cardioverter Defibrillators
auteur
Marc Strik, Benjamin Sacristan, Pierre Bordachar, Josselin Duchateau, Romain Eschalier, Pierre Mondoly, Julien Laborderie, Narimane Gassa, Nejib Zemzemi, Maxime Laborde, Juan Garrido, Clara Matencio Perabla, Guillermo Jimenez-Perez, Oscar Camara, Michel Haïssaguerre, Rémi Dubois, Sylvain Ploux
article
Heart Rhythm, In press, ⟨10.1016/j.hrthm.2023.06.019⟩
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titre
A continuous spatial and temporal mathematical model for assessing the distribution of dengue in Brazil with control
auteur
Fernando Luiz Pio dos Santos, Mostafa Bendahmane, Elmahdi Erraji, Fahd Karami
article
Journal of Biological Systems, 2023, 31 (02), pp.345-373. ⟨10.1142/S0218339023300026⟩
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https://hal.science/hal-04127091/file/ws-jbs-fernandolps.pdf BibTex
titre
Optimal control for a two-sidedly degenerate aggregation equation
auteur
Mostafa Bendahmane, Fahd Karami, Elmahdi Erraji, Abdelghafour Atlas, Abdelkbir Afraites
article
Nonlinear Analysis: Modelling and Control, 2023, ⟨10.15388/namc.2023.28.32395⟩
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https://hal.science/hal-04124303/file/Bendahmane_et_al.pdf BibTex
titre
A Patchwork Method to Improve the Performance of Current Methods for Solving the Inverse Problem of Electrocardiography
auteur
Oumayma Bouhamama, Mark Potse, Laura Bear, Lisl Weynans
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2023, 70 (1), pp.55-66. ⟨10.1109/TBME.2022.3184473⟩
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https://inria.hal.science/hal-03913730/file/A_Patchwork_Method_to_Improve_the_Performance_of_Current_Methods_for_Solving_the_Inverse_Problem_of_Electrocardiography.pdf BibTex

Conference papers

titre
Numerical simulation of cardiac pacing devices: modeling and validation issues
auteur
Yves Coudière, Gwladys Ravon, Valentin Pannetier, Michael Leguèbe
article
RICAM 2023 – Workshop on Cardiovascular Modeling and Simulation, Nov 2023, Linz, Austria
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https://hal.science/hal-04402791/file/expose.pdf BibTex
titre
The Two-Point Finite Volume Scheme for the Microscopic Bidomain Model of Electrocardiology
auteur
Zeina Chehade, Yves Coudière
article
FVCA 10 – Finite Volume for Complex applications 10, Oct 2023, Strasbourg, France
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https://inria.hal.science/hal-04403881/file/last_version_fvca10_zeina.pdf BibTex
titre
Continuity of Mircoscopic Cardiac Conduction in a Computational Cell-by-Cell Model
auteur
Joshua Steyer, Fatemeh Chegini, Mark Potse, Axel Loewe, Martin Weiser
article
CinC 2023 – 50th Computing in Cardiology Conference, Oct 2023, Atlanta (GA), United States. ⟨10.22489/CinC.2023.385⟩
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https://inria.hal.science/hal-04407818/file/CinC2023-385.pdf BibTex
titre
Comparison of Two Formulations for Computing Body Surface Potential Maps
auteur
Emma Lagracie, Lisl Weynans, Yves Coudière
article
CinC 2023 – 50th Computing in Cardiology Conference, Oct 2023, Atlanta, United States. ⟨10.22489/CinC.2023.106⟩
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https://inria.hal.science/hal-04405814/file/106_CinCFinalPDF.pdf BibTex
titre
Modeling Cardiac Stimulation by a Pacemaker, with Accurate Tissue-Electrode Interface
auteur
Valentin Pannetier, Michael Leguèbe, Yves Coudière, Richard D Walton, Philippe Dhiver, Delphine Feuerstein, Diego Amaro
article
FIMH 2023 – 12th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2023, Villeurbanne (Lyon), France. pp.194-203, ⟨10.1007/978-3-031-35302-4_20⟩
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https://inria.hal.science/hal-04379089/file/978-3-031-35302-4_20.pdf BibTex
titre
Efficient numerical methods for simulating cardiac electrophysiology with cellular resolution
auteur
Fatemeh Chegini, Algiane Froehly, Ngoc Mai Monica Huynh, Luca F. Pavarino, Mark Potse, Simone Scacchi, Martin Weiser
article
COUPLED 2023 – 10th International Conference on Computational Methods for Coupled Problems in Science and Engineering, Jun 2023, Chania, Greece
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https://inria.hal.science/hal-04407791/file/coupled2023.pdf BibTex

Poster communications

titre
Mathematical Modeling of Pulsed Electric Field Cardiac Ablation
auteur
Simon Bihoreau, Guido Caluori, Annabelle Collin, Pierre Jaïs, Michael Leguèbe, Clair Poignard
article
RICAM – Workshop 4 “Modeling and simulation of ablation treatments”, Nov 2023, Linz, Austria
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https://hal.science/hal-04389083/file/poster_RICAM_Final3.pdf BibTex
titre
From experimental data to 3D realistic simulations: a pacemaker example
auteur
Valentin Pannetier, Gwladys Ravon, Michael Leguèbe, Yves Coudière, Richard D Walton, Delphine Feuerstein, Guilhem Fauré, Diego Amaro, Philippe Dhiver
article
LIRYConnect 2023, Nov 2023, Pessac (Bordeaux), France. 2023
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https://inria.hal.science/hal-04384800/file/poster_liryc-9.pdf BibTex
titre
Modeling Cardiac Stimulation by a Pacemaker, with Accurate Tissue-Electrode Interface
auteur
Valentin Pannetier, Michael Leguèbe, Yves Coudière, Richard D Walton, Delphine Feuerstein, Diego Amaro, Philippe Dhiver
article
FIMH 2023 – 12th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2023, Villeurbanne (Lyon), France
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https://inria.hal.science/hal-04384661/file/fimh-3.pdf BibTex
titre
Inter-operator segmentation variability induces high premature ventricular contractions localization uncertainty at the heart base
auteur
Narimane Gassa, Jess Tate, Machteld Boonstra, Beata Ondrusova, Jana Svehlikova, Rob Macleod, Nejib Zemzemi
article
Heart Rhythm 2023 – The Society’s 44th annual meeting, May 2023, New Orleans (LA), United States. 2023
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https://hal.science/hal-04124313/file/HRS23Poster2submit%20%281%29.pdf BibTex
titre
Standardized numerical simulations of cardiac electrical stimulation devices
auteur
Valentin Pannetier, Yves Coudière, Michael Leguèbe
article
Journée annuelle de l’EDMI, Apr 2023, Bordeaux (France), France
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https://inria.hal.science/hal-04384583/file/poster_edmi.pdf BibTex

Theses

titre
Estimation of Serum Potassium and Calcium Concentrations from Electrocardiographic Depolarization and Repolarization Waveforms
auteur
Syed Hassaan Ahmed Bukhari
article
Other [cs.OH]. Université de Bordeaux; Universidad de Zaragoza (Espagne), 2023. English. ⟨NNT : 2023BORD0040⟩
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https://theses.hal.science/tel-04077621/file/BUKHARI_SYED_HASSAAN_AHMED_2023.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
A NUMERICAL METHOD FOR WAVE-STRUCTURE INTERACTIONS IN THE BOUSSINESQ REGIME
auteur
Geoffrey Beck, David Lannes, Lisl Weynans
article
2023
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https://hal.science/hal-04151128/file/beck_lannes_weynans.pdf BibTex
titre
Numerical Investigation of Methods Used In Commercial Clinical Devices for Solving the ECGI Inverse Problem
auteur
Narimane Gassa, Vitaly Kalinin, Nejib Zemzemi
article
2023
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https://hal.science/hal-04124322/file/fimh2023.pdf BibTex
titre
Data Assimilation with Machine Learning for Dynamical Systems: Modelling Indoor Ventilation
auteur
Claire E Heaney, Jieyi Tang, Jintao Yan, Donghu Guo, Jamesson Ipock, Sanjana Kaluvakollu, Yushen Lin, Danhui Shao, Boyang Chen, Laetitia Mottet, Prashant Kumar, Christopher C Pain
article
2023
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https://inria.hal.science/hal-03938455/file/26_Heaney_PhysicaA.pdf BibTex

2022

Journal articles

titre
À quoi servent les ordinateurs les plus puissants au monde ? Un exemple en cardiologie
auteur
Emmanuelle Saillard, Mark Potse
article
The Conversation France, 2022
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BibTex
titre
Global Lipschitz stability of multiple space dependent ionic parameters for the MEA/hiPSC-CM assays
auteur
Hamza Ammar, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
Inverse Problems, 2022, 39 (1), pp.015010. ⟨10.1088/1361-6420/aca70d⟩
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BibTex
titre
Microscopic tridomain model of electrical activity in the heart with dynamical gap junctions. Part 2 – Derivation of the macroscopic tridomain model by unfolding homogenization method
auteur
Fakhrielddine Bader, Mostafa Bendahmane, Mazen Saad, Raafat Talhouk
article
Asymptotic Analysis, 2022, pp.1-32. ⟨10.3233/ASY-221804⟩
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https://hal.science/hal-03776998/file/Article%20Trid%20Part%202.pdf BibTex
titre
Impact of intraventricular septal fiber orientation on cardiac electromechanical function
auteur
Jairo Rodríguez-Padilla, Argyrios Petras, Julie Magat, Jason Bayer, Yann Bihan-Poudec, Dounia El Hamrani, Girish Ramlugun, Aurel Neic, Christoph Augustin, Fanny Vaillant, Marion Constantin, David Benoist, Line Pourtau, Virginie Dubes, Julien Rogier, Louis Labrousse, Olivier Bernus, Bruno Quesson, Michel Haïssaguerre, Matthias Gsell, Gernot Plank, Valéry Ozenne, Edward Vigmond
article
AJP – Heart and Circulatory Physiology, 2022, 322 (6), pp.H936-H952. ⟨10.1152/ajpheart.00050.2022⟩
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BibTex
titre
MUSIC: Cardiac Imaging, Modelling and Visualisation Software for Diagnosis and Therapy
auteur
Mathilde Merle, Florent Collot, Julien Castelneau, Pauline Migerditichan, Mehdi Juhoor, Buntheng Ly, Valery Ozenne, Bruno Quesson, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Pierre Jaïs, Hubert Cochet, Maxime Sermesant
article
Applied Sciences, 2022, 12 (12), pp.6145. ⟨10.3390/app12126145⟩
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BibTex
titre
Microscopic Tridomain Model of Electrical Activity in the Heart with Dynamical Gap Junctions. Part 1 – Modeling and Well-Posedness
auteur
Fakhrielddine Bader, Mostafa Bendahmane, Mazen Saad, Raafat Talhouk
article
Acta Applicandae Mathematicae, 2022, 179 (11), ⟨10.1007/s10440-022-00498-7⟩
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https://hal.science/hal-03682214/file/Article%20Trid%20Part%201.pdf BibTex
titre
Monitoring of Serum Potassium and Calcium Levels in End-Stage Renal Disease Patients by ECG Depolarization Morphology Analysis
auteur
Hassaan A Bukhari, Carlos Sánchez, José Esteban Ruiz, Mark Potse, Pablo Laguna, Esther Pueyo
article
Sensors, 2022, 22 (8), pp.2951. ⟨10.3390/s22082951⟩
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https://inria.hal.science/hal-03937638/file/bukhari-depol.pdf BibTex
titre
Estimation of potassium levels in hemodialysis patients by T wave nonlinear dynamics and morphology markers
auteur
Hassaan A. Bukhari, Carlos Sánchez, Sabarathinam Srinivasan, Flavio Palmieri, Mark Potse, Pablo Laguna, Esther Pueyo
article
Computers in Biology and Medicine, 2022, 143, pp.105304. ⟨10.1016/j.compbiomed.2022.105304⟩
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https://inria.hal.science/hal-03579198/file/S0010482522000968.pdf BibTex

Conference papers

titre
Inferring characteristics of bacterial swimming in biofilm matrix from time-lapse confocal laser scanning microscopy
auteur
Guillaume Ravel, Michel Bergmann, Alain Trubuil, Julien Deschamps, Romain Briandet, Simon Labarthe
article
IbSB 2022 – 6th International Symposium “Image-based Systems Biology”, Sep 2022, Jena, Germany. ⟨10.7554/eLife.76513⟩
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BibTex
titre
A Patient-Specific Equivalent Dipole Model
auteur
Gabriel Cardoso, Geneviève Robin, Andony Arrieula, Mark Potse, Michel Haïssaguerre, Eric Moulines, Rémi Dubois
article
Computing in Cardiology 2022, Sep 2022, Tampere, Finland
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https://inria.hal.science/hal-03936912/file/paper.pdf BibTex
titre
Inter-individual differences in cell composition across the ventricular wall may explain variability in ECG response to serum potassium and calcium variations
auteur
Hassaan Bukhari, Carlos Sánchez, Pablo Laguna, Mark Potse, Esther Pueyo
article
Computing in Cardiology 2022, Sep 2022, Tampere, Finland
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https://inria.hal.science/hal-03936957/file/bukhari-cinc22a.pdf BibTex
titre
A comparison of multithreading, vectorization, and GPU computing for the acceleration of cardiac electrophysiology models
auteur
Chiheb Sakka, Amina Guermouche, Olivier Aumage, Emmanuelle Saillard, Mark Potse, Yves Coudière, Denis Barthou
article
Computing in Cardiology 2022, Sep 2022, Tampere, Finland
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https://inria.hal.science/hal-03936903/file/sakka-cinc22.pdf BibTex
titre
Accelerating stabilization of whole-heart models after changes in cycle length
auteur
Hassaan Bukhari, Carlos Sánchez, Esther Pueyo, Mark Potse
article
Computing in Cardiology 2022, Sep 2022, Tampere, Finland
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https://inria.hal.science/hal-03936920/file/bukhari-cinc22b.pdf BibTex
titre
The Effect of Segmentation Variability in Forward ECG Simulation
auteur
Beata Ondrusova, Machteld Boonstra, Jana Svehlikova, Dana Brooks, Peter van Dam, Ali Salman Rababah, Akil Narayan, Rob Macleod, Nejib Zemzemi, Jess Tate
article
Computing in Cardiology 2022, Sep 2022, Tampere, Finland
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https://inria.hal.science/hal-03936097/file/325_file_cinc_manuscript_pdf.pdf BibTex
titre
Effect of Segmentation Uncertainty on the ECGI Inverse Problem Solution and Source Localization
auteur
Narimane Gassa, Machteld Boonstra, Jana Svehlikova, Dana Brooks, Akil Narayan, Peter van Dam, Rob Macleod, Jess Tate, Nejib Zemzemi
article
Computing in Cardiology 2022, Sep 2022, Tampere, Finland
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https://inria.hal.science/hal-03936058/file/cinc_compressed.pdf BibTex
titre
Activation Sites Estimation using a Fast Algorithm Based on an Eikonal Equation
auteur
Jérôme Fehrenbach, Lisl Weynans
article
Computing in Cardiology 2022, Sep 2022, Tampere, Finland
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https://inria.hal.science/hal-03913733/file/cinc22_weynans.pdf BibTex
titre
Segmentation Uncertainty Quantification in Cardiac Propagation Models
auteur
Jess D Tate, Nejib Zemzemi, Shireen Elhabian, Beáta Ondrusová, Machteld Boonstra, Peter van Dam, Akil Narayan, Dana H Brooks, Rob S Macleod
article
CinC 2022 – 49th Computing in Cardiology Conference, Sep 2022, Tampere, Finland
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https://inria.hal.science/hal-03933769/file/cinc_2022_tate.pdf BibTex
titre
Deep Learning for Model Correction in Cardiac Electrophysiological Imaging
auteur
Victoriya Kashtanova, Ibrahim Ayed, Andony Arrieula, Mark Potse, Patrick Gallinari, Maxime Sermesant
article
MIDL 2022 – Medical Imaging with Deep Learning, Jul 2022, Zurich, Switzerland
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https://hal.science/hal-03687596/file/Kashtanova_MIDL22_Camera_Ready.pdf BibTex
titre
A practical algorithm to build geometric models of cardiac muscle structure
auteur
Mark Potse, Luca Cirrottola, Algiane Froehly
article
ECCOMAS 2022 – The 8th European Congress on Computational Methods in Applied Sciences and Engineering, Jun 2022, Oslo, Norway
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https://inria.hal.science/hal-03936963/file/potse-eccomas22.pdf BibTex

Theses

titre
Numerical learning methods to facilitate ventricular arrhythmias localisation during ablation procedures
auteur
Andony Arrieula
article
Modélisation et simulation. Université de Bordeaux, 2022. Français. ⟨NNT : 2022BORD0271⟩
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https://theses.hal.science/tel-03875870/file/ARRIEULA_ANDONY_2022.pdf BibTex
titre
Numerical methods for solving the electrocardiographic imaging inverse problem with structurally abnormal tissue
auteur
Oumayma Bouhamama
article
Modélisation et simulation. Université de Bordeaux, 2022. Français. ⟨NNT : 2022BORD0135⟩
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https://theses.hal.science/tel-03923165/file/BOUHAMAMA_OUMAYMA_2022.pdf BibTex
titre
Modélisation mathématiques de l’activité de la mitochondrie cardiaque
auteur
Bachar Tarraf
article
Numerical Analysis [math.NA]. Université de Bordeaux, 2022. English. ⟨NNT : 2022BORD0025⟩
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https://theses.hal.science/tel-03619984/file/TARRAF_BACHAR_2022.pdf BibTex

2021

Journal articles

titre
Three Scale Unfolding Homogenization Method Applied to Cardiac Bidomain Model
auteur
Fakhrielddine Bader, Mostafa Bendahmane, Mazen Saad, Raafat Talhouk
article
Acta Applicandae Mathematicae, 2021, 176 (1), pp.14. ⟨10.1007/s10440-021-00459-6⟩
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https://hal.science/hal-03517657/file/Article%20Three-Unf.pdf BibTex
titre
Derivation of a new macroscopic bidomain model including three scales for the electrical activity of cardiac tissue
auteur
Fakhrielddine Bader, Mostafa Bendahmane, Mazen Saad, Raafat Talhouk
article
Journal of Engineering Mathematics, 2021, 131 (1), pp.3. ⟨10.1007/s10665-021-10174-8⟩
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https://hal.science/hal-03517663/file/Article%20Three-Dev.pdf BibTex
titre
A Cartesian Method with Second-Order Pressure Resolution for Incompressible Flows with Large Density Ratios
auteur
Michel Bergmann, Lisl Weynans
article
Fluids, 2021, 6 (11), pp.402. ⟨10.3390/fluids6110402⟩
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https://inria.hal.science/hal-03506971/file/fluids-06-00402-v2.pdf BibTex
titre
Clinical VIM targeting for deep brain stimulation based on an augmented intelligence. The RebrAIn solution
auteur
Julien Engelhardt, Nejib Zemzemi, Dominique Guehl, Pierre Burbaud, Nathalie Damon-Perriere, Emmanuel Cuny
article
Brain Stimulation, 2021, 14 (6), pp.1634-1635. ⟨10.1016/j.brs.2021.10.150⟩
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BibTex
titre
Prediction of Clinical Deep Brain Stimulation Target for Essential Tremor From 1.5 Tesla MRI Anatomical Landmarks
auteur
Julien Engelhardt, Emmanuel Cuny, Dominique Guehl, Pierre Burbaud, Nathalie Damon-Perrière, Camille Dallies-Labourdette, Juliette Thomas, Olivier Branchard, Louise-Amélie Schmitt, Narimane Gassa, Nejib Zemzemi
article
Frontiers in Neurology, 2021, 12, ⟨10.3389/fneur.2021.620360⟩
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https://inria.hal.science/hal-03409356/file/fneur-12-620360.pdf BibTex
titre
Cardiac Activation Maps Reconstruction: A Comparative Study Between Data-Driven and Physics-Based Methods
auteur
Amel Karoui, Mostafa Bendahmane, Nejib Zemzemi
article
Frontiers in Physiology, 2021, 12, ⟨10.3389/fphys.2021.686136⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03382399/file/fphys-12-686136%281%29.pdf BibTex
titre
Left-axis deviation in patients with nonischemic heart failure and left bundle branch block is a purely electrical phenomenon
auteur
Saer Abu-Alrub, Marc Strik, Peter Huntjens, F. Daniel Ramirez, Mark Potse, Hubert Cochet, Hugo Marchand, Samuel Buliard, Romain Eschalier, Michel Haïssaguerre, Pierre Bordachar, Sylvain Ploux
article
Heart Rhythm, 2021, 18 (8), pp.1352-1360. ⟨10.1016/j.hrthm.2021.03.042⟩
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https://inria.hal.science/hal-03452310/file/alrub-lbbb-axis-manuscript.pdf BibTex
titre
Characterization of T Wave Amplitude, Duration and Morphology Changes During Hemodialysis: Relationship with Serum Electrolyte Levels and Heart Rate
auteur
Hassaan A. Bukhari, Flavio Palmieri, Julia Ramirez, Pablo Laguna, Jose Esteban Ruiz, Dina Ferreira, Mark Potse, Carlos Sánchez, Esther Pueyo
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, In press, 68, pp.2467-2478. ⟨10.1109/TBME.2020.3043844⟩
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https://inria.hal.science/hal-03076879/file/bukhari-hemo.pdf BibTex
titre
Analysis of the heart-torso conductivity parameters recovery inverse problem in cardiac electrophysiology ECG modelling
auteur
Abir Amri, Mourad Bellassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
Applicable Analysis, 2021, pp.1-30. ⟨10.1080/00036811.2021.1955861⟩
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https://inria.hal.science/hal-03301127/file/inverse_problem_d.pdf BibTex
titre
A simple model of cardiac mitochondrial respiration with experimental validation
auteur
Bachar Tarraf, Emmanuel Suraniti, Camille Colin, Stéphane Arbault, Philippe Diolez, Michael Leguèbe, Yves Coudière
article
Mathematical Biosciences and Engineering, 2021, 18 (5), pp.5758-5789. ⟨10.3934/mbe.2021291⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03272432/file/10.3934_mbe.2021291.pdf BibTex
titre
Optimal control for nonlocal reaction-diffusion system describing calcium dynamics in cardiac cell
auteur
Mostafa Bendahmane, Elmahdi Erraji, Fahd Karami
article
Mathematical Methods in the Applied Sciences, 2021, 44 (6), pp.4802-4834. ⟨10.1002/mma.7071⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03534731/file/Bendahmane_et_al.pdf BibTex
titre
Why Ablation of Sites With Purkinje Activation Is Antiarrhythmic: The Interplay Between Fast Activation and Arrhythmogenesis
auteur
Ruben Coronel, Mark Potse, Michel Haïssaguerre, Nicolas Derval, Mathilde Rivaud, Veronique Meijborg, Matthijs Cluitmans, Mélèze Hocini, Bastiaan Boukens
article
Frontiers in Physiology, 2021, 12, pp.648396. ⟨10.3389/fphys.2021.648396⟩
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https://inria.hal.science/hal-03452281/file/coronel-safe.pdf BibTex
titre
Fibrosis and Conduction Abnormalities as Basis for Overlap of Brugada Syndrome and Early Repolarization Syndrome
auteur
Bastiaan Boukens, Mark Potse, Ruben Coronel
article
International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (4), pp.1570. ⟨10.3390/ijms22041570⟩
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https://inria.hal.science/hal-03133273/file/boukens-overlap.pdf BibTex
titre
A positive cell vertex godunov scheme for a beeler-reuter based model of cardiac electrical activity
auteur
Mostafa Bendahmane, Fatima Mroué, Mazen Saad
article
Numerical Methods for Partial Differential Equations, 2021, 37 (1), pp.262-301. ⟨10.1002/num.22528⟩
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https://inria.hal.science/hal-03534773/file/CVFE-mondomain.pdf BibTex

Conference papers

titre
A Cardiac Shape Model for Segmentation Uncertainty Quantification
auteur
Jess Tate, Shireen Elhabian, Nejib Zemzemi, Wilson Good, Peter van Dam, Dana Brooks, Rob Macleod
article
2021 Computing in Cardiology (CinC), Sep 2021, Brno, Czech Republic. pp.1-4, ⟨10.22489/CinC.2021.146⟩
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https://inria.hal.science/hal-03805351/file/CinC2021-146.pdf BibTex
titre
In-Silico Data Based Machine Learning Technique Predicts Premature Ventricular Contraction Origin Coordinates
auteur
Andony Arrieula, Hubert Cochet, Pierre Jaïs, Michel Haïssaguerre, Nejib Zemzemi, Mark Potse
article
Computing in Cardiology 2021 – 48th Computing in Cardiology Conference, Sep 2021, Brno / Virtual, Czech Republic. pp.1-4, ⟨10.23919/CinC53138.2021.9662896⟩
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https://inria.hal.science/hal-03364532/file/finalpaper.pdf BibTex
titre
Evaluation of the ECGI Patchwork Method Using Experimental Data in Sinus Rhythm
auteur
Oumayma Bouhamama, Lisl Weynans, Laura Bear
article
CinC 2021 – Computing in Cardiology, Sep 2021, Brno, Czech Republic. pp.1-4, ⟨10.23919/CinC53138.2021.9662809⟩
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https://inria.hal.science/hal-03370881/file/CinC2021.pdf BibTex
titre
QRS Slopes for Potassium and Calcium Monitoring in End-Stage Renal Disease Patients
auteur
Hassaan A Bukhari, Pablo Laguna, Mark Potse, Carlos Sánchez, Esther Pueyo
article
Computing in Cardiology 2021 – 48th Computing in Cardiology Conference, Sep 2021, Brno / Virtual, Czech Republic. ⟨10.22489/CinC.2021.221⟩
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https://inria.hal.science/hal-03452385/file/221_Preprint.pdf BibTex
titre
Benchmark of deep learning algorithms for the automatic screening in electrocardiograms transmitted by implantable cardiac devices
auteur
Narimane Gassa, Benjamin Sacristan, Nejib Zemzemi, Maxime Laborde, Juan Garrido Oliver, Clara Matencio Perabla, Guillermo Jimenez-Perez, Oscar Camara, Sylvain Ploux, Marc Strik, Pierre Bordachar, Remi Dubois
article
CINC 2021 – Computing In Cardiology, Sep 2021, Brno, Czech Republic. pp.1-4, ⟨10.23919/CinC53138.2021.9662651⟩
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https://inria.hal.science/hal-03485146/file/CeaseCinc.pdf BibTex
titre
Uncertainty Quantification of the Effects of Segmentation Variability in ECGI
auteur
Jess D Tate, Wilson Good, Nejib Zemzemi, Machteld Boonstra, Peter van Dam, Dana H Brooks, Akil Narayan, Rob S Macleod
article
FIMH 2021 – 11th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2021, Stanford, United States. pp.515-522, ⟨10.1007/978-3-030-78710-3_49⟩
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https://inria.hal.science/hal-03805280/file/FIMH2021_072_v1.pdf BibTex
titre
A Volume Source Method for Solving ECGI Inverse Problem
auteur
Mohamadou Malal Diallo, Yves Coudière, Rémi Dubois
article
FIMH 2021 – 11th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2021, Stanford / Virtual, United States. pp.551-560, ⟨10.1007/978-3-030-78710-3_53⟩
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https://hal.science/hal-03507452/file/FIMH2021_049_final_v3.pdf BibTex

Book sections

titre
Spiral Waves Generation Using an Eikonal-Reaction Cardiac Electrophysiology Model
auteur
Narimane Gassa, Nejib Zemzemi, Cesare Corrado, Yves Coudière
article
Functional Imaging and Modeling of the Heart 2021: International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, pp.523-530, 2021, ⟨10.1007/978-3-030-78710-3_50⟩
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https://inria.hal.science/hal-03301186/file/fimh2021_ng_final0.pdf BibTex

Theses

titre
Numerical methods for solving inverse problems in electrocardiography
auteur
Amel Karoui
article
Modélisation et simulation. Université de Bordeaux, 2021. Français. ⟨NNT : 2021BORD0104⟩
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https://theses.hal.science/tel-03236544/file/KAROUI_AMEL_2021.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Source and metric estimation in the eikonal equation using optimization on a manifold
auteur
Jérôme Fehrenbach, Lisl Weynans
article
2021
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https://hal.science/hal-03475139/file/papier_IPI_soumis.pdf BibTex

2020

Journal articles

titre
The ‘Digital Twin’ to enable the vision of precision cardiology
auteur
Jorge Corral-Acero, Francesca Margara, Maciej Marciniak, Cristobal Rodero, Filip Loncaric, Yingjing Feng, Andrew Gilbert, Joao F Fernandes, Hassaan A Bukhari, Ali Wajdan, Manuel Villegas Martinez, Mariana Sousa Santos, Mehrdad Shamohammdi, Hongxing Luo, Philip Westphal, Paul Leeson, Paolo Diachille, Viatcheslav Gurev, Manuel Mayr, Liesbet Geris, Pras Pathmanathan, Tina Morrison, Richard Cornelussen, Frits Prinzen, Tammo Delhaas, Ada Doltra, Marta Sitges, Edward J Vigmond, Ernesto Zacur, Vicente Grau, Blanca Rodriguez, Espen W Remme, Steven Niederer, Peter Mortier, Kristin Mcleod, Mark Potse, Esther Pueyo, Alfonso Bueno-Orovio, Pablo Lamata
article
European Heart Journal, 2020, 41 (48), pp.4556-4564. ⟨10.1093/eurheartj/ehaa159⟩
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https://inria.hal.science/hal-02947289/file/lamata-twin.pdf BibTex
titre
Rush-Larsen time-stepping methods of high order for stiff problems in cardiac electrophysiology
auteur
Yves Coudière, Charlie Douanla Lontsi, Charles Pierre
article
Electronic Transactions on Numerical Analysis, 2020, 55, pp.342-357
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https://hal.science/hal-01557856/file/rlk.pdf BibTex
titre
A publicly available virtual cohort of four-chamber heart meshes for cardiac electro-mechanics simulations
auteur
Marina Strocchi, Christoph Augustin, Matthias Gsell, Elias Karabelas, Aurel Neic, Karli Gillette, Orod Razeghi, Anton J Prassl, Edward Vigmond, Jonathan Behar, Justin Gould, Baldeep Sidhu, Christopher A Rinaldi, Martin Bishop, Gernot N Plank, Steven Niederer
article
PLoS ONE, 2020, 15 (6), pp.e0235145. ⟨10.1371/journal.pone.0235145⟩
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BibTex
titre
Simulating ventricular systolic motion in a four-chamber heart model with spatially varying robin boundary conditions to model the effect of the pericardium
auteur
Marina Strocchi, Matthias Gsell, Christoph Augustin, Orod Razeghi, Caroline Roney, Anton J Prassl, Edward Vigmond, Jonathan Behar, Justin Gould, Christopher A Rinaldi, Martin Bishop, Gernot N Plank, Steven Niederer
article
Journal of Biomechanics, 2020, 101, pp.109645. ⟨10.1016/j.jbiomech.2020.109645⟩
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BibTex
titre
Epicardial Fibrosis Explains Increased Endo–Epicardial Dissociation and Epicardial Breakthroughs in Human Atrial Fibrillation
auteur
Ali Gharaviri, Elham Bidar, Mark Potse, Stef Zeemering, Sander Verheule, Simone Pezzuto, Rolf Krause, Jos Maessen, Angelo Auricchio, Ulrich Schotten
article
Frontiers in Physiology, 2020, 11, pp.68. ⟨10.3389/fphys.2020.00068⟩
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https://inria.hal.science/hal-02487118/file/fphys-11-00068.pdf BibTex
titre
Modelling the action potential propagation in a heart with structural heterogeneities: From high‐resolution MRI to numerical simulations
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Yves Bourgault
article
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, 2020, pp.e3322. ⟨10.1002/cnm.3322⟩
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BibTex
titre
Virtual FFR quantified with a generalized flow model using Windkessel boundary conditions ; Application to a patient-specific coronary tree.
auteur
Keltoum Chahour, Rajae Aboulaich, Abderrahmane Habbal, Nejib Zemzemi, Cherif Abdelkhirane
article
Computational and Mathematical Methods in Medicine, 2020, 2020, pp.14. ⟨10.1155/2020/3942152⟩
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https://inria.hal.science/hal-02427411/file/Manuscript_Chahour-4.pdf BibTex
titre
Left Atrial Appendage Electrical Isolation Reduces Atrial Fibrillation Recurrences
auteur
Ali Gharaviri, Simone Pezzuto, Mark Potse, Sander Verheule, Giulio Conte, Rolf Krause, Ulrich Schotten, Angelo Auricchio
article
Circulation. Arrhythmia and electrophysiology, 2020, ⟨10.1161/CIRCEP.120.009230⟩
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https://inria.hal.science/hal-03088377/file/389621_1_article_tracked_changes_5302610_qhp8bv.pdf BibTex
titre
Generating boundary conditions for a Boussinesq system
auteur
Lisl Weynans, David Lannes
article
Nonlinearity, 2020, 33
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https://inria.hal.science/hal-01982925/file/RR-9248%20%281%29.pdf BibTex
titre
Reconstruction of three-dimensional biventricular activation based on the 12-lead electrocardiogram via patient-specific modelling
auteur
Simone Pezzuto, Frits W Prinzen, Mark Potse, Francesco Maffessanti, François Regoli, Maria Luce Caputo, Giulio Conte, Rolf Krause, Angelo Auricchio
article
EP-Europace, 2020, ⟨10.1093/europace/euaa330⟩
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https://inria.hal.science/hal-03026944/file/pezzuto-eikoECGI.pdf BibTex

Conference papers

titre
Feasibility of Whole-Heart Electrophysiological Models With Near-Cellular Resolution
auteur
Mark Potse, Emmanuelle Saillard, Denis Barthou, Yves Coudière
article
CinC 2020 – Computing in Cardiology, Sep 2020, Rimini / Virtual, Italy. ⟨10.22489/CinC.2020.126⟩
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https://inria.hal.science/hal-02943513/file/CinC2020-126.pdf BibTex
titre
Shape Analysis of Segmentation Variability
auteur
Jess D Tate, Nejib Zemzemi, Wilson W Good, Peter van Dam, Dana H Brooks, Rob S Macleod
article
CinC 2020 – Computing in Cardiology Conference, Sep 2020, Rimini, Italy. ⟨10.22489/CinC.2020.466⟩
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https://inria.hal.science/hal-03805404/file/146_Preprint.pdf BibTex
titre
Solving the ECGI problem with known locations of scar regions
auteur
Mohamadou Malal Diallo, Mark Potse, Rémi Dubois, Yves Coudière
article
CinC 2020 – Computing in Cardiology, Sep 2020, Rimini / Virtual, Italy
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https://inria.hal.science/hal-02945886/file/Diallo_CincPaper.pdf BibTex
titre
A Patchwork Inverse Method in Combination with the Activation Time Gradient to Detect Regions of Slow Conduction in Sinus Rhythm
auteur
Oumayma Bouhamama, Mark Potse, Rémi Dubois, Lisl Weynans, Laura Bear
article
CinC 2020 – Computing in Cardiology, Sep 2020, Rimini / Virtual, Italy
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https://inria.hal.science/hal-02954702/file/Full_paper_CinC_108_Oumayma_Bouhamama.pdf BibTex
titre
An Improved Iterative Pace-Mapping Algorithm to Detect the Origin of Premature Ventricular Contractions
auteur
Andony Arrieula, Hubert Cochet, Pierre Jaïs, Michel Haïssaguerre, Mark Potse
article
CinC 2020 – Computing in Cardiology, Sep 2020, Rimini / Virtual, Italy. ⟨10.22489/CinC.2020.062⟩
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https://hal.science/hal-02944731/file/CinC2020-062.pdf BibTex
titre
Global Sensitivity Analysis for Uncertain Parameters Applied to a Cardiac Mitochondrial Model
auteur
Bachar Tarraf, Michael Leguèbe, Yves Coudière, Emmanuel Suraniti, Camille Colin, Stéphane Arbault, Philippe Diolez
article
CinC 2020 – Computing in cardiology, Sep 2020, Rimini / Virtual, Italy
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https://hal.science/hal-02944899/file/main.pdf BibTex
titre
A Patchwork Method to improve the performance of the current ECGI methods for sinus rythm
auteur
Oumayma Bouhamama, Mark Potse, Laura Bear, Lisl Weynans
article
VPH 2020 – International Conference on the Virtual Physiological Human, Aug 2020, Paris / Virtual, France
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https://inria.hal.science/hal-03130256/file/VPH2020_bouhamama_oumayma_abstract.pdf BibTex

Poster communications

titre
A Patchwork Inverse Method in Combination with the Activation Time Gradient to Detect Regions of Slow Conduction in Sinus Rhythm
auteur
Oumayma Bouhamama, Mark Potse, Rémi Dubois, Laura Bear, Lisl Weynans
article
CinC 2020 – Computing in Cardiology, Sep 2020, Rimini / Virtual, Italy
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https://hal.science/hal-02945604/file/ID108_poster.pdf BibTex
titre
Sensitivity analysis of a simple cardiac mitochondrial model
auteur
Bachar Tarraf, Michael Leguèbe, Yvès Coudière
article
VPH2020 – International Conference on the Virtual Physiological Human, Aug 2020, Paris / Virtual, France
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BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Prédiction de l’affluence journalière dans un réseau de transports urbains
auteur
Apolline Louvet, Andony Arrieula, Jean Prost, Paul Freulon
article
2020
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https://hal.science/hal-03043105/file/rapport_seme_hupi.pdf BibTex

2019

Journal articles

titre
Advantages and pitfalls of noninvasive electrocardiographic imaging
auteur
Laura R. Bear, Oumayma Bouhamama, Matthijs Cluitmans, Josselin Duchateau, Richard D. Walton, Emma Abell, Charly Belterman, Michel Haissaguerre, Olivier Bernus, Ruben Coronel, Rémi Dubois
article
Journal of Electrocardiology, 2019, 57, pp.S15 – S20. ⟨10.1016/j.jelectrocard.2019.08.007⟩
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https://hal.science/hal-03488455/file/S0022073619303723.pdf BibTex
titre
Wide-area low-energy surface stimulation of large mammalian ventricular tissue
auteur
Angel Moreno, Richard Walton, Marion Constantin, Olivier Bernus, Edward Vigmond, Jason Bayer
article
Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.15863. ⟨10.1038/s41598-019-51364-w⟩
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BibTex
titre
Unfolding homogenization method applied to physiological and phenomenological bidomain models in electrocardiology
auteur
Mostafa Bendahmane, Fatima Mroue, Mazen Saad, Raafat Talhouk
article
Nonlinear Analysis: Real World Applications, 2019, 50, pp.413-447. ⟨10.1016/j.nonrwa.2019.05.006⟩
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https://hal.science/hal-02142028/file/S1468121818312835.pdf BibTex
titre
On Simulating the Effect of Sodium Channel Block on Cardiac Electromechanics
auteur
Noha Shalaby, Nejib Zemzemi, Khalil Elkhodary
article
Proceedings of the Institution of Mechanical Engineers, Part H: Journal of Engineering in Medicine, 2019
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https://inria.hal.science/hal-02434201/file/On%20Simulating%20the%20Effect%20of%20Sodium%20Channel%20Block%20on%20Cardiac%20Electromechanics.pdf BibTex
titre
Modified bidomain model with passive periodic heterogeneities
auteur
Yves Coudière, Anđela Davidović, Clair Poignard
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series S, 2019, ⟨10.3934/dcdss.2020126⟩
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https://inria.hal.science/hal-02363470/file/201909DCDSS-CDP.pdf BibTex
titre
A domain decomposition strategy for a very high-order finite volumes scheme applied to cardiac electrophysiology
auteur
Yves Coudière, Rodolphe Turpault
article
Journal of computational science, 2019, 37, pp.101025. ⟨10.1016/j.jocs.2019.101025⟩
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https://hal.science/hal-02327953/file/article_jcs.pdf BibTex
titre
Acetylcholine Delays Atrial Activation to Facilitate Atrial Fibrillation
auteur
Jason Bayer, Bastiaan Boukens, Sébastien Krul, Caroline Roney, Antoine Driessen, Wouter Berger, Nicoline van den Berg, Arie Verkerk, Edward Vigmond, Ruben Coronel, Joris R de Groot
article
Frontiers in Physiology, 2019, 10, pp.1105. ⟨10.3389/fphys.2019.01105⟩
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BibTex
titre
Editorial: Recent Advances in Understanding the Basic Mechanisms of Atrial Fibrillation Using Novel Computational Approaches
auteur
Jichao Zhao, Oleg Aslanidi, Pawel Kuklik, Geoffrey Lee, Gary Tse, Steven Niederer, Edward Vigmond
article
Frontiers in Physiology, 2019, 10, pp.1065. ⟨10.3389/fphys.2019.01065⟩
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BibTex
titre
Universal atrial coordinates applied to visualisation, registration and construction of patient specific meshes
auteur
Caroline Roney, Ali Pashaei, Marianna Meo, Rémi Dubois, Patrick Boyle, Natalia Trayanova, Hubert Cochet, Steven Niederer, Edward Vigmond
article
Medical Image Analysis, 2019, 55, pp.65-75. ⟨10.1016/j.media.2019.04.004⟩
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BibTex
titre
Depolarization versus repolarization abnormality underlying inferolateral J wave syndromes – new concepts in sudden cardiac death with apparently normal hearts
auteur
Michel Haïssaguerre, Koonlawee Nademanee, Mélèze Hocini, Ghassen Cheniti, Josselin Duchateau, Antonio Frontera, Frédéric Sacher, Nicolas Derval, Arnaud Denis, Thomas Pambrun, Rémi Dubois, Pierre Jaïs, David Benoist, Richard D. Walton, Akihiko Nogami, Ruben Coronel, Mark Potse, Olivier Bernus
article
Heart Rhythm, 2019, 16 (5), pp.781-790. ⟨10.1016/j.hrthm.2018.10.040⟩
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https://inria.hal.science/hal-01933810/file/authormanuscript.pdf BibTex
titre
Considering New Regularization Parameter-Choice Techniques for the Tikhonov Method to Improve the Accuracy of Electrocardiographic Imaging
auteur
Judit Chamorro-Servent, Rémi Dubois, Yves Coudière
article
Frontiers in Physiology, 2019, 10, ⟨10.3389/fphys.2019.00273⟩
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BibTex
titre
New insights on the cardiac safety factor: Unraveling the relationship between conduction velocity and robustness of propagation
auteur
Patrick Boyle, William Franceschi, Marion Constantin, Claudia Hawks, Thomas Desplantez, Natalia Trayanova, Edward Vigmond
article
Journal of Molecular and Cellular Cardiology, 2019, 128, pp.117-128. ⟨10.1016/j.yjmcc.2019.01.010⟩
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BibTex
titre
Optical Imaging of Ventricular Action Potentials in a Torso Tank: A New Platform for Non-Invasive Electrocardiographic Imaging Validation
auteur
Laura Bear, Richard D. Walton, Emma Abell, Yves Coudière, Michel Haïssaguerre, Olivier Bernus, Rémi Dubois
article
Frontiers in Physiology, 2019, 10, ⟨10.3389/fphys.2019.00146⟩
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BibTex
titre
Propagation of two independent sources of uncertainty in the electrocardiography imaging inverse solution
auteur
Najib Fikal, Rajae Aboulaich, Emahdi El Guarmah, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2019, 14 (2), ⟨10.1051/mmnp/2018065⟩
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https://inria.hal.science/hal-01923847/file/template.pdf BibTex
titre
Ionic parameters identification of an inverse problem of strongly coupled PDE’s system in cardiac electrophysiology using Carleman estimates
auteur
Yassine Abidi, Mourad Bellassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2019, Mathematical Modelling in Cardiology, 14 (2), ⟨10.1051/mmnp/2018060⟩
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https://inria.hal.science/hal-01923862/file/Abidi-et-al-bidomain-MMNP.pdf BibTex
titre
The Left and Right Ventricles Respond Differently to Variation of Pacing Delays in Cardiac Resynchronization Therapy: A Combined Experimental- Computational Approach
auteur
Erik Willemen, Rick Schreurs, Peter Huntjens, Marc Strik, Gernot N Plank, Edward Vigmond, John Walmsley, Kevin Vernooy, Tammo Delhaas, Frits W Prinzen, Joost Lumens
article
Frontiers in Physiology, 2019, 10, pp.17. ⟨10.3389/fphys.2019.00017⟩
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BibTex
titre
Cardiac Propagation Pattern Mapping With Vector Field for Helping Tachyarrhythmias Diagnosis With Clinical Tridimensional Electro-Anatomical Mapping Tools
auteur
Corentin Dallet, Caroline Roney, Ruairidh Martin, Takeshi Kitamura, Stéphane Puyo, Josselin Duchateau, Carole Dumas-Pomier, Gwladys Ravon, Laura Bear, Nicolas Derval, Frederic Sacher, Edward Vigmond, Michel Haïssaguerre, Mélèze Hocini, Rémi Dubois
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2019, 66 (2), pp.373-382. ⟨10.1109/TBME.2018.2841340⟩
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BibTex
titre
Propagation Failure by TRPM4 Overexpression
auteur
Namit Gaur, Thomas Hof, Michel Haïssaguerre, Edward Vigmond
article
Biophysical Journal, 2019, 116 (3), pp.469-476. ⟨10.1016/j.bpj.2018.11.3137⟩
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https://hal.science/hal-02885623/file/S0006349518344606.pdf BibTex
titre
Information theory to tachycardia therapy: electrogram entropy predicts diastolic microstructure of reentrant ventricular tachycardia
auteur
Sachin Nayyar, Eugene Downar, Mohammadali Beheshti, Timothy Liang, Stéphane Massé, Karl Magtibay, Abhishek Bhaskaran, Yawer Saeed, Edward Vigmond, Kumaraswamy Nanthakumar
article
AJP – Heart and Circulatory Physiology, 2019, 316 (1), pp.H134-H144. ⟨10.1152/ajpheart.00581.2018⟩
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BibTex
titre
A technique for measuring anisotropy in atrial conduction to estimate conduction velocity and atrial fibre direction
auteur
Caroline Roney, John F. Whitaker, Iain Sim, Louisa O’Neill, Rahul Mukherjee, Orod Razeghi, Edward Vigmond, Matthew Wright, Mark O’Neill, Steven Williams, Steven Niederer
article
Computers in Biology and Medicine, 2019, 104, pp.278-290. ⟨10.1016/j.compbiomed.2018.10.019⟩
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BibTex
titre
Impact of the endocardium in a parameter optimization to solve the inverse problem of electrocardiography
auteur
Gwladys Ravon, Yves Coudière, Mark Potse, Rémi Dubois
article
Frontiers in Physiology, 2019, 9, pp.1946. ⟨10.3389/fphys.2018.01946⟩
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https://hal.science/hal-01966574/file/ravon-param.pdf BibTex
titre
Kinetic-fluid derivation and mathematical analysis of nonlocal cross-diffusion-fluid system
auteur
Mostafa Bendahmane, Fahd Karami, Mohammed Zagour, Driss Meskine
article
Applied Mathematical Modelling, In press, ⟨10.1016/j.apm.2019.11.036⟩
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BibTex
titre
A 3D Reaction-Diffusion System Describing Bidomain Calcium Dynamics in Cardiac Cell
auteur
Mostafa Bendahmane, Elmahdi Erraji, Fahd Karami
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2019, 14 (2), pp.27. ⟨10.1051/mmnp/2018064⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01680574/file/Bendahmane%20et%20al.pdf BibTex
titre
Kinetic-fluid derivation and mathematical analysis of cross-diffusion-Brinkman system
auteur
Mostafa Bendahmane, Fahd Karami, Mohammed Zagour
article
Mathematical Methods in the Applied Sciences, 2019, ⟨10.1002/mma.5139⟩
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https://inria.hal.science/hal-01680584/file/Brinkman-Cross-Diff.pdf BibTex
titre
Analysis of the ECGI inverse problem solution with respect to the measurement boundary size and the distribution of noise
auteur
Mohammed Addouche, Nadra Bouarroudj, Fadhel Jday, Jacques Henry, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2019, ⟨10.1051/mmnp/2018061⟩
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https://inria.hal.science/hal-01923800/file/Addouche-et-MMNP.pdf BibTex
titre
A Virtual Element Method for a Nonlocal FitzHugh-Nagumo Model of Cardiac Electrophysiology
auteur
Veronica Anaya, Mostafa Bendahmane, David Mora, Mauricio Sepulveda
article
IMA Journal of Numerical Analysis, In press, ⟨10.1093/imanum/drz001⟩
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BibTex
titre
A nash game algorithm for the solution of coupled conductivity identification and data completion in cardiac electrophysiology
auteur
Rabeb Chamekh, Abderrahmane Habbal, Moez Kallel, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2019, Mathematical modelling in cardiology, 14 (2), pp.15. ⟨10.1051/mmnp/2018059⟩
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https://hal.science/hal-01923819/file/mmnp180143.pdf BibTex
titre
Stochastically forced cardiac bidomain model
auteur
Mostafa Bendahmane, Kenneth Hvistendahl Karlsen
article
Stochastic Processes and their Applications, In press, 129 (12), pp.5312-5363. ⟨10.1016/j.spa.2019.03.001⟩
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https://arxiv.org/pdf/1803.08537 BibTex
titre
Mathematical analysis of cardiac electromechanics with physiological ionic model
auteur
Mostafa Bendahmane, Fatima Mroue, Mazen Saad, Raafat Talhouk
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, 2019, 24 (9), pp.34. ⟨10.3934/dcdsb.2019035⟩
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https://inria.hal.science/hal-01680593/file/Bid-Mech-revised.pdf BibTex
titre
Towards the modelling of the Purkinje/ myocardium coupled problem: A well-posedness analysis
auteur
Saloua Mani Aouadi, Wajih Mbarki, Nejib Zemzemi
article
Journal of Computational and Applied Mathematics, 2019, ⟨10.1016/j.cam.2018.10.024⟩
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https://inria.hal.science/hal-01923779/file/monodomainbidomain.pdf BibTex

Conference papers

titre
Transmural Ventricular Heterogeneities Play a Major Role in Determining T-Wave Morphology at Different Extracellular Potassium Levels
auteur
Hassaan A Bukhari, Flavio Palmieri, Dina Ferreira, Mark Potse, Julia Ramírez, Pablo Laguna, Carlos Sánchez, Esther Pueyo
article
CinC 2019 – Computing in Cardiology 2019, Sep 2019, Singapour, Singapore. ⟨10.22489/CinC.2019.404⟩
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https://hal.science/hal-02476011/file/bukhari-cinc19.pdf BibTex
titre
Direct Mapping from Body Surface Potentials to Cardiac Activation Maps Using Neural Networks
auteur
Amel Karoui, Mostafa Bendahamane, Nejib Zemzemi
article
CinC 2019 – Computing in Cardiology Conference, Sep 2019, Singapour, Singapore. ⟨10.22489/CinC.2019.253⟩
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BibTex
titre
Thermodynamical Fluxes for the Modeling of Cardiac Mitochondrial Calcium Handling
auteur
Bachar Tarraf, Michael Leguèbe, Yves Coudière, Philippe Diolez
article
CinC 2019 – Computing In Cardiology 2019, Sep 2019, Singapour, Singapore
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https://hal.science/hal-02299233/file/CinC_2019_Mitochondria_model.pdf BibTex
titre
In-Silico Evaluation of an Iterative Pace-Mapping Technique to Guide Catheter Ablation of Ventricular Ectopy
auteur
Andony Arrieula, Hubert Cochet, Pierre Jaïs, Michel Haïssaguerre, Mark Potse
article
CinC 2019 – Computing in Cardiology 2019, Sep 2019, Singapour, Singapore. ⟨10.22489/CinC.2019.351⟩
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https://hal.science/hal-02299186/file/cinc19_arrieula.pdf BibTex
titre
Space rescaling in the MFS method improves the ECGI reconstruction
auteur
Pauline Migerditichan, Mark Potse, Nejib Zemzemi
article
CinC 2019 – Computing in Cardiology 2019, Sep 2019, Singapour, Singapore
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https://hal.science/hal-02428142/file/miger-cinc19.pdf BibTex
titre
Inducibility of Atrial Fibrillation Depends Chaotically on Ionic Model Parameters
auteur
Mark Potse
article
CinC 2019 – Computing in Cardiology 2019, Sep 2019, Singapour, Singapore. ⟨10.22489/CinC.2019.410⟩
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https://hal.science/hal-02428139/file/potse-cinc19.pdf BibTex
titre
A Spatial Adaptation of the Time Delay Neural Network for Solving ECGI Inverse Problem
auteur
Amel Karoui, Mostafa Bendahmane, Nejib Zemzemi
article
FIMH 2019 – 10th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2019, Bordeaux, France. pp.94-102, ⟨10.1007/978-3-030-21949-9_11⟩
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https://inria.hal.science/hal-02154094/file/fimh2019_RevisedVersion.pdf BibTex
titre
Fibrillation Patterns Creep and Jump in a Detailed Three-Dimensional Model of the Human Atria
auteur
Mark Potse, Alain Vinet, Ali Gharaviri, Simone Pezzuto
article
FIMH 2019 – 10th International Conference Functionnal Imaging and Modeling of the Heart, Yves Coudière; Valéry Ozenne; Edward Vigmond; Nejib Zemzemi, Jun 2019, Bordeaux, France. pp.131-138, ⟨10.1007/978-3-030-21949-9_15⟩
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https://inria.hal.science/hal-02153733/file/potse-fimh19.pdf BibTex
titre
Model assessment through data assimilation of realistic data in cardiac electrophysiology
auteur
Antoine Gérard, Annabelle Collin, Gautier Bureau, Philippe Moireau, Yves Coudière
article
FIMH 2019 – 10th Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2019, Bordeaux, France
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https://inria.hal.science/hal-02172102/file/sequentialDA_FIMH2019.pdf BibTex
titre
Maximal conductances ionic parameters estimation in cardiac electrophysiology multiscale modelling
auteur
Yassine Abidi, Julien Bouyssier, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
FIMH 2019 – 10th International Conference Functionnal Imaging and Modeling of the Heart, Y. Coudière, V. Ozenne, E. Vigmond and N. Zemzemi, Jun 2019, Bordeaux, France. pp.131-138, ⟨10.1007/978-3-030-21949-9⟩
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https://inria.hal.science/hal-02154074/file/samplepaper_09_04_2019.pdf BibTex
titre
Fast And Accurate Reconstruction Of Transmural Activation Maps From Standard 12-lead ECG Using An Eikonal Model
auteur
Simone Pezzuto, Frits W Prinzen, Mark Potse, François Regoli, Maria Luce Caputo, Giulio Conte, Rolf Krause, Angelo Auricchio
article
Heart Rhythm Meeting, Heart Rhythm Society, May 2019, San Francisco, United States
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BibTex
titre
Effect Of Pulmonary Vein Isolations And Reconnections On P-wave Morphology in Atrial Fibrillation Patients. A Simulation Study
auteur
Ali Gharaviri, Simone Pezzuto, Mark Potse, Sander Verheule, Rolf Krause, Angelo Auricchio, Ulrich Schotten
article
Heart Rhythm 2019 – The Heart Rhythm Society’s 40th Annual Heart Rhythm Scientific Sessions, Heart Rhythm Society, May 2019, San Francisco, United States
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BibTex
titre
Fibrosis explains atrial fibrillation recurrences after pulmonary vein isolations. A simulation study
auteur
Ali Gharaviri, Simone Pezzuto, Mark Potse, Sander Verheule, Rolf Krause, Angelo Auricchio, Ulrich Schotten
article
EHRA 2019 – Annual Congress of the European Heart Rhythm Association, European Heart Rhythm Association, Mar 2019, Lisboa, Portugal
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Book sections

titre
The Spectrum of Idiopathic Ventricular Fibrillation and J-Wave Syndromes: Novel Mapping Insights
auteur
Michel Haïssaguerre, Wee Nademanee, Mélèze Hocini, Josselin Duchateau, Clémentine André, Thomas Lavergne, Masa Takigawa, Frédéric Sacher, Nicolas Derval, Thomas Pambrun, Pierre Jaïs, Rick Walton, Mark Potse, Ed Vigmond, Rémi Dubois, Olivier Bernus
article
Mohammad Shenasa; Amin AL-Ahmad; Ranjan K. Thakur; Andrea Natale. The Spectrum of Idiopathic Ventricular Fibrillation and J-Wave Syndromes Novel Mapping Insights, Elsevier Inc., pp.699-709, 2019, Advances in cardiac mapping and catheter ablation: part II, ⟨10.1016/j.ccep.2019.08.011⟩
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https://inria.hal.science/hal-02428164/file/mh-spectrum.pdf BibTex
titre
Remarks about spatially structured SI model systems with cross diffusion
auteur
Veronica Anaya, Mostafa Bendahmane, Michel Langlais, Mauricio Sepulveda
article
B. N. Chetverushki; W. Fitzgibbon; Y.A. Kuznetsov; P. Neittaanmäki; J. Periaux; O. Pironneau. Contributions to Partial Differential Equations and Applications, 47, Springer, pp.21, 2019, Computational Methods in Applied Sciences, ⟨10.1007/978-3-319-78325-3_5⟩
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Proceedings

titre
Functional Imaging and Modeling of the Heart
auteur
Yves Coudière, Nejib Zemzemi, Edward J. Vigmond, Valéry Ozenne
article
FIMH 2019 – 10th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2019, 11504, Springer, 2019, LNCS – Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-030-21949-9⟩
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Theses

titre
Numerical patient-specific model of atrial-fibrillation
auteur
Antoine Gérard
article
Modélisation et simulation. Université de Bordeaux, 2019. Français. ⟨NNT : 2019BORD0120⟩
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https://theses.hal.science/tel-02297510/file/GERARD_ANTOINE_2019.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Ionic Parameters Estimation in Multi-Scale Cardiac Electrophysiology Modelling
auteur
Yassine Abidi, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
2019
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https://inria.hal.science/hal-02338984/file/paper_optim_10-07-2019.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
Evaluation of fifteen algorithms for the resolution of the electrocardiography imaging inverse problem using ex-vivo and in-silico data
auteur
Amel Karoui, Laura Bear, Pauline Migerditichan, Nejib Zemzemi
article
Frontiers in Physiology, 2018, Electrocardiographic Imaging, 9, pp.1708
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https://inria.hal.science/hal-01923763/file/frontiers.pdf BibTex
titre
Determinants of new wavefront locations in cholinergic atrial fibrillation
auteur
Caroline Roney, Fu Siong Ng, Michael Debney, Christian Eichhorn, Arun Nachiappan, Rasheda Chowdhury, Norman Qureshi, Chris Cantwell, Jennifer Tweedy, Steven Niederer, Nicholas Peters, Edward Vigmond
article
EP-Europace, 2018, 20 (suppl_3), pp.iii3-iii15. ⟨10.1093/europace/euy235⟩
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BibTex
titre
A left bundle branch block activation sequence and ventricular pacing influence voltage amplitudes: an in vivo and in silico study
auteur
Uyên Châu Nguyên, Mark Potse, Kevin Vernooy, Masih Mafi-Rad, Jordi Heijman, Maria Luce Caputo, Giulio Conte, François Regoli, Rolf Krause, Tiziano Moccetti, Angelo Auricchio, Frits W Prinzen, Francesco Maffessanti
article
EP-Europace, 2018, 20 (suppl-3), pp.iii77 – iii86. ⟨10.1093/europace/euy233⟩
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https://inria.hal.science/hal-01933819/file/AuthorMS.pdf BibTex
titre
Effect of Na+-channel blockade on the three-dimensional substrate of atrial fibrillation in a model of endo-epicardial dissociation and transmural conduction
auteur
Ali Gharaviri, Sander Verheule, Jens Eckstein, Mark Potse, Rolf Krause, Angelo Auricchio, Nico H.L. Kuijpers, Ulrich Schotten
article
EP-Europace, 2018, 20 (suppl 3), pp.iii69 – iii76. ⟨10.1093/europace/euy236⟩
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https://inria.hal.science/hal-01933818/file/Gharaviri2018-Na-block-manuscript.pdf BibTex
titre
Patient-specific simulations predict efficacy of ablation of interatrial connections for treatment of persistent atrial fibrillation
auteur
Caroline Roney, Steven Williams, Hubert Cochet, Rahul Mukherjee, Louisa O’Neill, Iain Sim, John F. Whitaker, Orod Razeghi, George Klein, Edward Vigmond, Mark O’Neill, Steven Niederer
article
EP-Europace, 2018, 20 (suppl_3), pp.iii55-iii68. ⟨10.1093/europace/euy232⟩
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BibTex
titre
Determinants of atrial bipolar voltage: Inter electrode distance and wavefront angle
auteur
Mohammadali Beheshti, Karl Magtibay, Stéphane Massé, Andreu Porta-Sanchez, Shouvik Haldar, Abhishek Bhaskaran, Sachin Nayyar, Benedict Glover, D Curtis Deno, Edward Vigmond, Kumaraswamy Nanthakumar
article
Computers in Biology and Medicine, 2018, 102, pp.449-457. ⟨10.1016/j.compbiomed.2018.07.011⟩
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BibTex
titre
Beat-to-beat P-wave morphological variability in patients with paroxysmal atrial fibrillation: an in silico study
auteur
Simone Pezzuto, Ali Gharaviri, Ulrich Schotten, Mark Potse, Giulio Conte, Maria Luce Caputo, François Regoli, Rolf Krause, Angelo Auricchio
article
EP-Europace, 2018, 20 (suppl 3), pp.iii26-iii35. ⟨10.1093/europace/euy227⟩
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https://inria.hal.science/hal-01933828/file/ppvar_upload.pdf BibTex
titre
Quantifying the determinants of decremental response in critical ventricular tachycardia substrate
auteur
Mohammadali Beheshti, Sachin Nayyar, Karl Magtibay, Stéphane Massé, Andreu Porta-Sanchez, Shouvik Haldar, Abhishek Bhaskaran, Edward Vigmond, Kumaraswamy Nanthakumar
article
Computers in Biology and Medicine, 2018, 102, pp.260-266. ⟨10.1016/j.compbiomed.2018.05.025⟩
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BibTex
titre
Wavelength and Fibrosis Affect Phase Singularity Locations During Atrial Fibrillation
auteur
Mirabeau Saha, Caroline Roney, Jason Bayer, Marianna Meo, Hubert Cochet, Rémi Dubois, Edward Vigmond
article
Frontiers in Physiology, 2018, 9, pp.1207. ⟨10.3389/fphys.2018.01207⟩
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BibTex
titre
Compartmentalized Structure of the Moderator Band Provides a Unique Substrate for Macroreentrant Ventricular Tachycardia
auteur
Richard Walton, Ali Pashaei, Marine Martinez, Marion Constantin, Josselin Duchateau, Laura Bear, Caroline Cros, Caroline Pascarel-Auclerc, Yunbo Guo, David Benoist, Virginie Dubes, Ndeye Rokhaya Faye, Sebastien Chaigne, Sebastien Dupuis, Dominique Detaille, Line Pourtau, Philippe Pasdois, Fabien Brette, Julien Rogier, Louis Labrousse, Mélèze Hocini, Edward Vigmond, Michel Haïssaguerre, Olivier Bernus
article
Circulation. Arrhythmia and electrophysiology, 2018, 11 (8), pp.e005913. ⟨10.1161/CIRCEP.117.005913⟩
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BibTex
titre
Localized Structural Alterations Underlying a Subset of Unexplained Sudden Cardiac Death
auteur
Michel Haïssaguerre, Mélèze Hocini, Ghassen Cheniti, Josselin Duchateau, Fréderic Sacher, Stéphane Puyo, Hubert Cochet, Masateru Takigawa, Arnaud Denis, Ruairidh Martin, Nicolas Derval, Pierre Bordachar, Philippe Ritter, Sylvain Ploux, Thomas Pambrun, Nicolas Klotz, Grégoire Massoullié, Xavier Pillois, Corentin Dallet, Jean-Jacques Schott, Solena Le Scouarnec, Michael Ackerman, David Tester, Olivier Piot, Jean Luc Pasquié, Christophe Leclerc, Jean-Sylvain Hermida, Estelle Gandjbakhch, Philippe Maury, Louis Labrousse, Ruben Coronel, Pierre Jaïs, David Benoist, Edward J. Vigmond, Mark Potse, Richard D. Walton, Koonlawee Nademanee, Olivier Bernus, Rémi Dubois
article
Circulation. Arrhythmia and electrophysiology, 2018, 11 (7), pp.e006120. ⟨10.1161/CIRCEP.117.006120⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01839275/file/2018%20Ha%C3%AFssaguerre%20et%20al.%20Localized%20structural%20alterations.pdf BibTex
titre
Role of the Purkinje-Muscle Junction on the Ventricular Repolarization Heterogeneity in the Healthy and Ischemic Ovine Ventricular Myocardium
auteur
Marine Martinez, Richard Walton, Jason Bayer, Michel Haïssaguerre, Edward Vigmond, Mélèze Hocini, Olivier Bernus
article
Frontiers in Physiology, 2018, 9, pp.718. ⟨10.3389/fphys.2018.00718⟩
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BibTex
titre
Variability in pulmonary vein electrophysiology and fibrosis determines arrhythmia susceptibility and dynamics
auteur
Caroline Roney, Jason Bayer, Hubert Cochet, Marianna Meo, Rémi Dubois, Pierre Jaïs, Edward Vigmond
article
PLoS Computational Biology, 2018, 14 (5), pp.e1006166. ⟨10.1371/journal.pcbi.1006166⟩
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BibTex
titre
Complex interactions in a novel SCN5A compound mutation associated with long QT and Brugada syndrome: Implications for Na+ channel blocking pharmacotherapy for de novo conduction disease
auteur
Jie Liu, Jason Bayer, Roozbeh Aschar-Sobbi, Marianne Wauchop, Danna Spears, Michael Gollob, Edward Vigmond, Robert Tsushima, Peter Backx, Vijay Chauhan
article
PLoS ONE, 2018, 13 (5), pp.e0197273. ⟨10.1371/journal.pone.0197273⟩
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BibTex
titre
Mechano-electric finite element model of the left atrium
auteur
Alessandro Satriano, Edward Vigmond, David Schwartzman, Elena Di Martino
article
Computers in Biology and Medicine, 2018, 96, pp.24-31. ⟨10.1016/j.compbiomed.2018.02.010⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
Efficient high order schemes for stiff ODEs in cardiac electrophysiology
auteur
Charlie Douanla Lontsi, Yves Coudière, Charles Pierre
article
Revue Africaine de Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées, 2018, Mathématiques pour la Biologie et l’environement, Volume 28 – 2018 – 2019 – Mathematics for Biology and the Environment, ⟨10.46298/arima.2668⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01406683/file/ARIMA-Vol28-1-12.pdf BibTex
titre
Scalable and Accurate ECG Simulation for Reaction-Diffusion Models of the Human Heart
auteur
Mark Potse
article
Frontiers in Physiology, 2018, 9, pp.370. ⟨10.3389/fphys.2018.00370⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01910637/file/fphys-09-00370.pdf BibTex
titre
Comparing Reentrant Drivers Predicted by Image-Based Computational Modeling and Mapped by Electrocardiographic Imaging in Persistent Atrial Fibrillation
auteur
Patrick Boyle, Joe Hakim, Sohail Zahid, William Franceschi, Michael Murphy, Edward Vigmond, Rémi Dubois, Michel Haïssaguerre, Mélèze Hocini, Pierre Jaïs, Natalia Trayanova, Hubert Cochet
article
Frontiers in Physiology, 2018, 9, pp.414. ⟨10.3389/fphys.2018.00414⟩
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BibTex
titre
Sensitivity Analysis of Ventricular Activation and Electrocardiogram in Tailored Models of Heart-Failure Patients
auteur
Carlos Sánchez, Gabriele d’Ambrosio, Francesco Maffessanti, Enrico G Caiani, Frits W Prinzen, Rolf Krause, Angelo Auricchio, Mark Potse
article
Medical and Biological Engineering and Computing, 2018, 56, pp.491-504. ⟨10.1007/s11517-017-1696-9⟩
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https://inria.hal.science/hal-01567886/file/sanchez-sa.pdf BibTex
titre
A conduction velocity adapted eikonal model for electrophysiology problems with re-excitability evaluation
auteur
Cesare Corrado, Nejib Zemzemi
article
Medical Image Analysis, 2018, 43, pp.186-197. ⟨10.1016/j.media.2017.11.002⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01655410/file/MitchellSchaefferEikonal.pdf BibTex
titre
An optimal quasi solution for the cauchy problem for laplace equation in the framework of inverse ECG
auteur
Eduardo Hernández-Montero, Andrés Fraguela-Collar, Jacques Henry
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, In press, ⟨10.1051/mmnp/2018062⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01933948/file/template-9-3.pdf BibTex
titre
In silico assessment of the effects of various compounds in MEA/hiPSC-CM assays: Modelling and numerical simulations
auteur
Emanuela Abbate, Muriel Boulakia, Yves Coudière, Jean-Frédéric Gerbeau, Philippe Zitoun, Nejib Zemzemi
article
Journal of Pharmacological and Toxicological Methods, 2018, 89, pp.59-72
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01562673/file/compound_MEA_hiPSC.pdf BibTex
titre
Identification of ion currents components generating field potential recorded in MEA from hiPSC-CM
auteur
Fabien Raphel, Muriel Boulakia, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Jean-Michel Guillon, Philippe Zitoun, Jean-Frédéric Gerbeau
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2018, 65 (6), pp.1311-1319. ⟨10.1109/TBME.2017.2748798⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01570341/file/mea_HAL.pdf BibTex
titre
Numerical simulation of the fractional flow reserve (FFR)
auteur
Keltoum Chahour, Rajae Aboulaich, Abderrahmane Habbal, Cherif Abdelkhirane, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, In press, Special issue “Mathematical Modelling in Cardiology”
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01944566/file/mmnp180018_proof-1.pdf BibTex
titre
Exponential Adams Bashforth integrators for stiff ODEs, application to cardiac electrophysiology
auteur
Yves Coudière, Charlie Douanla Lontsi, Charles Pierre
article
Mathematics and Computers in Simulation, 2018, 153, pp.15-34. ⟨10.1016/j.matcom.2018.04.006⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01394036/file/eabk.pdf BibTex

Conference papers

titre
Anatomically-induced Fibrillation in a 3D model of the Human Atria
auteur
Mark Potse, Ali Gharaviri, Simone Pezzuto, Angelo Auricchio, Rolf Krause, Sander Verheule, Ulrich Schotten
article
Computing in Cardiology, Sep 2018, Maastricht, Netherlands
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01910674/file/finalpaper.pdf BibTex
titre
Acute Changes in P-Wave Morphology by Pulmonary Vein Isolation in Atrial Fibrillation Patients
auteur
Ali Gharaviri, Matthias Zink, Mark Potse, Simone Pezzuto, Stef Zeemering, Rolf Krause, Angelo Auricchio, Ulrich Schotten
article
Computing in Cardiology, Sep 2018, Maastricht, Netherlands
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01910663/file/34_CinCFinalPDF.pdf BibTex
titre
Microscopic Simulation of the Cardiac Electrophysiology: A Study of the Influence of Different Gap Junctions Models
auteur
Pierre-Elliott Bécue, Mark Potse, Yves Coudière
article
Computing in Cardiology, Sep 2018, Maastricht, Netherlands
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01910679/file/57_CinCFinalPDF.pdf BibTex
titre
The Heart Recording Conditions Impact the Assessment of the Electrocardiography Imaging Inverse Solution
auteur
Amel Karoui, Laura Bear, Pauline Migerditichan, Mostafa Bendahmane, Nejib Zemzemi
article
CinC 2018 – 45th Computing in Cardiology Conference, Sep 2018, Maastricht, Netherlands
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01923927/file/example1.pdf BibTex
titre
Validation of a sequential data assimilation method applied to cardiac electrophysiology
auteur
Antoine Gérard, Annabelle Collin, Yves Coudière
article
Virtual Physiological Human conference, Sep 2018, Saragosse, Spain
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01955627/file/VPHProceedingsAG.pdf BibTex
titre
Trigger and Substrate Share A Common Location In Human VF
auteur
Michel Haïssaguerre, Meleze Hocini, Stéphane Puyo, Ghassen Cheniti, Josselin Duchateau, Arnaud Denis, Hubert Cochet, Marianna Meo, Takeshi Kitamura, Masateru Takigawa, Antonio Frontera, Konstantinos George Vlachos, Grégoire Massoullié, Anna Lam, Felix Bourier, Thomas Pambrun, Nicolas Welte, Nicolas Derval, Sana Amraoui, Nicolas Klotz, Fréderic Sacher, Pierre Bordachar, Sylvain Ploux, Philippe Ritter, Pierre Jaïs, Edward J. Vigmond, Mark Potse, Richard D. Walton, Rémi Dubois, Olivier Bernus
article
Heart Rhythm Meeting – HRS 39th Annual Scientific Sessions, May 2018, Boston, United States
Accès au bibtex
BibTex
titre
Distinct Characteristics Of Human Ventricular Fibrillation In Its Initial Phase
auteur
Michel Haïssaguerre, Josselin Duchateau, Ghassen Cheniti, Stéphane Puyo, Arnaud Denis, Hubert Cochet, Marianna Meo, Takeshi Kitamura, Masateru Takigawa, Antonio Frontera, Konstantinos George Vlachos, Grégoire Massoullié, Anna Lam, Felix Bourier, Thomas Pambrun, Nicolas Welte, Nicolas Derval, Sana Amraoui, Nicolas Klotz, Fréderic Sacher, Pierre Bordachar, Sylvain Ploux, Philippe Ritter, Pierre Jaïs, Edward J. Vigmond, Mark Potse, Richard D. Walton, Rémi Dubois, Olivier Bernus, Meleze Hocini
article
Heart Rhythm Meeting – 39th Annual Scientific Sessions, May 2018, Boston, United States
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titre
A new ECG-based method to guide catheter ablation of ventricular tachycardia
auteur
Michał Kania, Yves Coudière, Hubert Cochet, Michel Haïssaguerre, Pierre Jaïs, Mark Potse
article
iMAging and eLectrical Technologies, Apr 2018, Uppsala, Sweden
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titre
Efficiency of high order schemes for the monodomain model
auteur
Charles Pierre, Charlie Douanla Lontsi
article
INdAM Workshop “Mathematical and Numerical Modeling of the Cardiovascular System”, Apr 2018, Roma, Italy
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titre
Validation of a Novel Computer Model of Endo-epicardial Electrical Dissociation and Transmural Conduction during Atrial Fibrillation
auteur
Ali Gharaviri, Mark Potse, Rolf Krause, Angelo Auricchio, Ulrich Schotten
article
EHRA Europace – Annual Congress of the European Heart Rhythm Association, Mar 2018, Barcelona, Spain
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https://inria.hal.science/hal-01910697/file/Human-Model.pdf BibTex
titre
Effect of sodium channel blockade on the 3-dimensional substrate of atrial fibrillation: a simulation study
auteur
Ali Gharaviri, Mark Potse, Rolf Krause, Angelo Auricchio, Ulrich Schotten
article
EHRA Europace – Annual congress of the European Heart Rhythm Association, Mar 2018, Barcelona, Spain. ⟨10.1093/europace/euy015.401⟩
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https://inria.hal.science/hal-01910691/file/Na-channelUS.pdf BibTex

Habilitation à diriger des recherches

titre
Prise en compte précise de géométries complexes pour l’approximation d’EDP sur grilles cartésiennes et leur simulation en calcul parallèle
auteur
Lisl Weynans
article
Analyse numérique [math.NA]. Université de Bordeaux, 2018
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https://inria.hal.science/tel-01971516/file/HDRv2.pdf BibTex

Theses

titre
Modelization and simulation of the cardiac electrophysiology at microscopic scale.
auteur
Pierre-Elliott Becue
article
Modélisation et simulation. Université de Bordeaux, 2018. Français. ⟨NNT : 2018BORD0352⟩
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https://theses.hal.science/tel-02019648/file/BECUE_PIERRE-ELIOTT_2018.pdf BibTex

2017

Journal articles

titre
Fractionated electrograms with ST-segment elevation recorded from the human right ventricular outflow tract
auteur
Edward Vigmond, Igor Efimov, Stacey Rentschler, Ruben Coronel, Bastiaan Boukens
article
HeartRhythm Case Reports, 2017, 3 (11), pp.546-550. ⟨10.1016/j.hrcr.2017.08.010⟩
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BibTex
titre
Stability analysis of decoupled time-stepping schemes for the specialized conduction system/myocardium coupled problem in cardiology
auteur
Salwa Aouadi, W Mbarki, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2017, Mathematical models in physiology, 12 (5), pp.208-239. ⟨10.1051/mmnp/201712513⟩
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https://inria.hal.science/hal-01655411/file/MMNP-Wajih.pdf BibTex
titre
Efficient computation of electrograms and ECGs in human whole heart simulations using a reaction-eikonal model
auteur
Aurel Neic, Fernando Campos, Anton J Prassl, Steven Niederer, Martin Bishop, Edward Vigmond, Gernot N Plank
article
Journal of Computational Physics, 2017, 346, pp.191-211. ⟨10.1016/j.jcp.2017.06.020⟩
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BibTex
titre
Computational assessment of the functional role of sinoatrial node exit pathways in the human heart
auteur
Sanjay Kharche, Edward Vigmond, Igor Efimov, Halina Dobrzynski
article
PLoS ONE, 2017, 12 (9), pp.e0183727. ⟨10.1371/journal.pone.0183727⟩
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BibTex
titre
Stochastic spontaneous calcium release events and sodium channelopathies promote ventricular arrhythmias
auteur
Fernando Campos, Yohannes Shiferaw, Edward Vigmond, Gernot N Plank
article
Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science, 2017, 27 (9), pp.093910. ⟨10.1063/1.4999612⟩
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BibTex
titre
An Analytical Model for the Effects of the Spatial Resolution of Electrode Systems on the Spectrum of Cardiac Signals
auteur
Ferney Beltrán-Molina, Jesús Requena-Carrión, Felipe Alonso-Atienza, Nejib Zemzemi
article
IEEE Access, 2017, 5, pp.18488-18497. ⟨10.1109/ACCESS.2017.2747632⟩
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https://inria.hal.science/hal-01655418/file/Main_BeltranMolina_IEEEAccess.pdf BibTex
titre
Numerical Analysis of a Finite Element Method for an Optimal Control of Bidomain-bath Model
auteur
Mostafa Bendahmane, Nagaiah Chamakuri
article
Journal of Differential Equations, 2017, 263 (5), pp.2419-2456. ⟨10.1016/j.jde.2017.04.001⟩
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https://inria.hal.science/hal-01259773/file/bidomain-opt-sicon.pdf BibTex
titre
Very high order finite volume methods for cardiac electrophysiology
auteur
Yves Coudière, Rodolphe Turpault
article
Computers & Mathematics with Applications, 2017, ⟨10.1016/j.camwa.2017.05.012⟩
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BibTex
titre
Evaluation of a Rapid Anisotropic Model for ECG Simulation
auteur
Simone Pezzuto, Peter Kalavsky, Mark Potse, Frits W Prinzen, Angelo Auricchio, Rolf Krause
article
Frontiers in Physiology, 2017, 8, pp.265. ⟨10.3389/fphys.2017.00265⟩
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https://inria.hal.science/hal-01567861/file/pezzuto-rapidecg.pdf BibTex
titre
Spatially Coherent Activation Maps for Electrocardiographic Imaging
auteur
Josselin Duchateau, Mark Potse, Remi Dubois
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2017, 64, pp.1149-1156. ⟨10.1109/TBME.2016.2593003⟩
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https://inria.hal.science/hal-01386890/file/duchateau-coherent.pdf BibTex
titre
Rate-Dependent Role of I Kur in Human Atrial Repolarization and Atrial Fibrillation Maintenance
auteur
Martin Aguilar, Jianlin Feng, Edward Vigmond, Philippe Comtois, Stanley Nattel
article
Biophysical Journal, 2017, 112 (9), pp.1997-2010. ⟨10.1016/j.bpj.2017.03.022⟩
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BibTex
titre
Spatial Resolution Requirements for Accurate Identification of Drivers of Atrial Fibrillation
auteur
Caroline Roney, Chris Cantwell, Jason Bayer, Norman Qureshi, Phang Boon Lim, Jennifer Tweedy, Prapa Kanagaratnam, Nicholas Peters, Edward Vigmond, Fu Siong Ng
article
Circulation. Arrhythmia and electrophysiology, 2017, 10 (5), pp.e004899. ⟨10.1161/CIRCEP.116.004899⟩
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BibTex
titre
Rotor Tracking Using Phase of Electrograms Recorded During Atrial Fibrillation
auteur
Caroline Roney, Chris Cantwell, Norman Qureshi, Rasheda Chowdhury, Emmanuel Dupont, Phang Boon Lim, Edward Vigmond, Jennifer Tweedy, Fu Siong Ng, Nicholas Peters
article
Annals of Biomedical Engineering, 2017, 45 (4), pp.910-923. ⟨10.1007/s10439-016-1766-4⟩
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BibTex
titre
Bidomain Predictions of Virtual Electrode-Induced Make and Break Excitations around Blood Vessels
auteur
Adam Connolly, Edward Vigmond, Martin Bishop
article
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2017, 5, pp.18. ⟨10.3389/fbioe.2017.00018⟩
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BibTex
titre
Virtual electrodes around anatomical structures and their roles in defibrillation
auteur
Adam Connolly, Edward Vigmond, Martin Bishop
article
PLoS ONE, 2017, 12 (3), pp.e0173324. ⟨10.1371/journal.pone.0173324⟩
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BibTex
titre
The relation between local repolarization and T-wave morphology in heart failure patients
auteur
Francesco Maffessanti, Joris Wanten, Mark Potse, Francois Regoli, Maria Luce Caputo, Giulio Conte, Daniel Sürder, Annekatrin Illner, Rolf Krause, Tiziano Moccetti, Angelo Auricchio, Frits W Prinzen
article
International Journal of Cardiology, 2017, 241, pp.270 – 276. ⟨10.1016/j.ijcard.2017.02.056⟩
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https://inria.hal.science/hal-01567816/file/Maffessanti-IJC2017-ARI.pdf BibTex
titre
Interplay among distinct Ca 2+ conductances drives Ca 2+ sparks/spontaneous transient outward currents in rat cerebral arteries
auteur
Ahmed Hashad, Neil Mazumdar, Monica Romero, Anders Nygren, Kamran Bigdely-Shamloo, Osama Harraz, Jose Puglisi, Edward Vigmond, Sean Wilson, Donald Welsh
article
The Journal of Physiology, 2017, 595 (4), pp.1111-1126. ⟨10.1113/JP273329⟩
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BibTex
titre
An asymptotic two-layer monodomain model of cardiac electrophysiology in the atria: derivation and convergence *
auteur
Yves Coudière, Jacques Henry, Simon Labarthe
article
SIAM Journal on Applied Mathematics, 2017, 77 (2), pp.409 – 429. ⟨10.1137/15M1016886⟩
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https://inria.hal.science/hal-00922717/file/M101688.pdf BibTex

Conference papers

titre
A Three-Dimensional Computational Model of Action Potential Propagation Through a Network of Individual Cells
auteur
Pierre-Elliott Bécue, Mark Potse, Yves Coudière
article
Computing in Cardiology 2017, Sep 2017, Rennes, France. pp.1-4
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https://inria.hal.science/hal-01592178/file/271_becue.pdf BibTex
titre
Non Invasive Assessment of Spatiotemporal Organization of Ventricular Fibrillation through Principal Component Analysis
auteur
Marianna Meo, Mark Potse, Stéphane Puyo, Laura Bear, Mélèze Hocini, Michel Haïssaguerre, Rémi Dubois
article
Computing in Cardiology, Sep 2017, Rennes, France
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BibTex
titre
Prediction of the Exit Site of Ventricular Tachycardia Based on Different ECG Lead Systems
auteur
Michał Kania, Yves Coudière, Hubert Cochet, Michel Haïssaguerre, Pierre Jaïs, Mark Potse
article
Computing in Cardiology, Sep 2017, Rennes, France. ⟨10.22489/CinC.2017.100-253⟩
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https://inria.hal.science/hal-01567961/file/CinC2017_MKania-v4.pdf BibTex
titre
A novel method for deriving the 12-lead ECG from body surface potential maps
auteur
Laura Bear, Peter Huntjens, Mark Potse, Josselin Duchateau, Sylvain Ploux, Rémi Dubois
article
Computing in Cardiology, Sep 2017, Rennes, France
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BibTex
titre
Inverse Problem of Electrocardiography: estimating the location of cardiac isquemia in a 3D geometry
auteur
C.E. Chavez, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Felipe Alonso-Atienza, Diegó Alvarez
article
Functional Imaging and modelling of the heart (FIMH2015), Jun 2017, Maastricht, Netherlands. ⟨10.1007/978-3-319-20309-6_45⟩
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https://hal.science/hal-01222385/file/Carlos_FIMH.pdf BibTex
titre
An in-silico analysis of the effect of changing activation wavefronts on voltage amplitudes in patients with heart failure
auteur
Uyên Châu Nguyên, Mark Potse, Kevin Vernooy, Rolf Krause, Angelo Auricchio, Frits W. Prinzen
article
EHRA Europace – Cardiostim 2017, Jun 2017, Vienna, Austria. ⟨10.1093/ehjci/eux135.003⟩
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BibTex
titre
Fast simulation of standard 12-lead ECG and 3D ventricular activation
auteur
Simone Pezzuto, Peter Kaľavský, Mark Potse, Frits W. Prinzen, Angelo Auricchio, Rolf Krause
article
EHRA Europace – Cardiostim 2017, Jun 2017, Vienna, Austria
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BibTex
titre
Improving the Spatial Solution of Electrocardiographic Imaging: A New Regularization Parameter Choice Technique for the Tikhonov Method
auteur
Judit Chamorro-Servent, Rémi Dubois, Mark Potse, Yves Coudière
article
9th International Conference on Functional Imaging and Modelling of the Heart – FIMH 2017, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.289-300, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_28⟩
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https://hal.science/hal-01564899/file/FIMHwithauthors_forHal.pdf BibTex
titre
Image-Based Modeling of the Heterogeneity of Propagation of the Cardiac Action Potential. Example of Rat Heart High Resolution MRI
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Yves Bourgault
article
9th international conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart (FIMH 2017), Jun 2017, Toronto, Canada. pp.260-270, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_25⟩
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https://hal.science/hal-01563770/file/ImageBasedModelling-AD-YC-YB-final.pdf BibTex
titre
A Parameter Optimization to Solve the Inverse Problem in Electrocardiography
auteur
Gwladys Ravon, Rémi Dubois, Yves Coudière, Mark Potse
article
FIMH 2017 – 9th International Conference on Functional Imaging and Modelling of the Heart, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.219-229, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_21⟩
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https://hal.science/hal-01572076/file/GwladysRavonFinal.pdf BibTex
titre
New approach for solving electrocardiography imaging inverse problem with missing data on the body surface
auteur
Mohammed Addouche, Nadra Bouarroudj, Jacques Henry, Fadhel Jday, Nejib Zemzemi
article
Tendances des Applications Mathématiques en Tunisie, Algérie, Maroc 10-13 mai 2017, May 2017, Hammamet, Tunisia
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https://inria.hal.science/hal-01567821/file/tamtam2017.pdf BibTex

Master thesis

titre
Méthodes numériques pour la résolution du problème inverse en électrocardiographie
auteur
Amel Karoui
article
Optimisation et contrôle [math.OC]. 2017
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https://inria.hal.science/hal-03086981/file/pfe.pdf BibTex

Other publications

titre
Exploring different approaches to improve the inverse problem solutions in electrocardiography
auteur
Judit Chamorro-Servent
article
2017
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https://hal.science/hal-01579087/file/AbstractPC.pdf BibTex

Reports

titre
On the identification of multiple space dependent ionic parameters in cardiac electrophysiology modelling
auteur
Yassine Abidi, Mourad Bellassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
[Research Report] INRIA. 2017
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https://inria.hal.science/hal-01567714/file/ABZM3_version_16-06-17.pdf BibTex
titre
A conduction velocity adapted eikonal model for electrophysiology problems with re-excitability evaluation
auteur
Cesare Corrado, Nejib Zemzemi
article
[Research Report] Inria Bordeaux Sud-Ouest; King’s College London. 2017
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01567868/file/MitchellSchaefferEikonal.pdf BibTex
titre
Convergence of a cartesian method for elliptic problems with immersed interfaces
auteur
Lisl Weynans
article
[Research Report] RR-8872, INRIA Bordeaux; Univ. Bordeaux. 2017, pp.24
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https://inria.hal.science/hal-01280283/file/RR8872.pdf BibTex

Theses

titre
High order schemes for realistic simulations in cardiac electrophysiology
auteur
Charlie Douanla Lontsi
article
Médecine humaine et pathologie. Université de Bordeaux, 2017. Français. ⟨NNT : 2017BORD0752⟩
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https://hal.science/tel-01647395/file/DOUANLA_LONTSI_CHARLIE_2017.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Sensitivity of the electrocardiographic problem to multiple independent sources of uncertainty
auteur
Rajae Aboulaich, Najib Fikal, Emahdi El Guarmah, Nejib Zemzemi
article
2017
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https://inria.hal.science/hal-01567700/file/elsarticle-template.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
Human ventricular activation sequence and the simulation of the electrocardiographic QRS complex and its variability in healthy and intraventricular block conditions
auteur
Louie Cardone-Noott, Alfonso Bueno-Orovio, Ana Mincholé, Nejib Zemzemi, Blanca Rodriguez
article
EP-Europace, 2016, ⟨10.1093/europace/euw346⟩
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https://inria.hal.science/hal-01567722/file/Activation-Paper-2016.pdf BibTex
titre
Modelling methodology of atrial fibrosis affects rotor dynamics and electrograms
auteur
Caroline Roney, Jason Bayer, Sohail Zahid, Marianna Meo, Patrick Boyle, Natalia Trayanova, Michel Haïssaguerre, Rémi Dubois, Hubert Cochet, Edward Vigmond
article
EP-Europace, 2016, 18 (suppl_4), pp.iv146-iv155. ⟨10.1093/europace/euw365⟩
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BibTex
titre
Abnormal Lymphatic Channels Detected by T2-Weighted MR Imaging as a Substrate for Ventricular Arrhythmia in HCM
auteur
Louis Kolman, Donald Welsh, Edward Vigmond, Sebastien Joncas, John Stirrat, David Scholl, Martin Rajchl, Edward Tweedie, Yoko Mikami, Carmen Lydell, Andrew Howarth, Raymond Yee, James White
article
JACC: Cardiovascular Imaging, 2016, 9 (11), pp.1354-1356. ⟨10.1016/j.jcmg.2015.10.016⟩
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BibTex
titre
Reduced Sodium Current in the Lateral Ventricular Wall Induces Inferolateral J-Waves
auteur
Veronique M F Meijborg, Mark Potse, Chantal E Conrath, Charly N W Belterman, Jacques M T de Bakker, Ruben Coronel
article
Frontiers in Physiology, 2016, 7 (365), ⟨10.3389/fphys.2016.00365⟩
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https://inria.hal.science/hal-01386905/file/meijborg-jwaves.pdf BibTex
titre
P-wave complexity in normal subjects and computer models
auteur
Mark Potse, Theo A.R. Lankveld, Stef Zeemering, Pieter C Dagnelie, Coen D.A. Stehouwer, Ronald M Henry, André C Linnenbank, Nico H.L. Kuijpers, Ulrich Schotten
article
Journal of Electrocardiology, 2016, 49 (4), pp.545 – 553. ⟨10.1016/j.jelectrocard.2016.05.005⟩
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https://inria.hal.science/hal-01386877/file/potse-pwave.pdf BibTex
titre
Percolation as a mechanism to explain atrial fractionated electrograms and reentry in a fibrosis model based on imaging data
auteur
Edward Vigmond, Ali Pashaei, Sana Amraoui, Hubert Cochet, Michel Hassaguerre
article
Heart Rhythm, 2016, 13 (7), pp.1536-1543. ⟨10.1016/j.hrthm.2016.03.019⟩
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BibTex
titre
Patient-derived models link re-entrant driver localization in atrial fibrillation to fibrosis spatial pattern
auteur
Sohail Zahid, Hubert Cochet, Patrick Boyle, Erica Schwarz, Kaitlyn Whyte, Edward Vigmond, Rémi Dubois, Mélèze Hocini, Michel Haïssaguerre, Pierre Jaïs, Natalia Trayanova
article
Cardiovascular Research, 2016, 110 (3), pp.443-454. ⟨10.1093/cvr/cvw073⟩
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BibTex
titre
Intermittent drivers anchoring to structural heterogeneities as a major pathophysiological mechanism of human persistent atrial fibrillation
auteur
Michel Haïssaguerre, Ashok J. Shah, Hubert Cochet, Mélèze Hocini, Rémi Dubois, Edward Vigmond, Olivier Bernus, Natalia Trayanova
article
The Journal of Physiology, 2016, 594 (9), pp.2387-2398. ⟨10.1113/JP270617⟩
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BibTex
titre
Segmentation of the left ventricular endocardium from magnetic resonance images by using different statistical shape models
auteur
Concetta Piazzese, M. Chiara Carminati, Andrea Colombo, Rolf Krause, Mark Potse, Angelo Auricchio, Lynn Weinert, Gloria Tamborini, Mauro Pepi, Roberto M Lang, Enrico G. Caiani
article
Journal of Electrocardiology, 2016, 49 (3), pp.383-391. ⟨10.1016/j.jelectrocard.2016.03.017⟩
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https://inria.hal.science/hal-01302237/file/SSMs-final-withfonts.pdf BibTex
titre
Novel Radiofrequency Ablation Strategies for Terminating Atrial Fibrillation in the Left Atrium: A Simulation Study
auteur
Jason Bayer, Caroline Roney, Ali Pashaei, Pierre Jaïs, Edward Vigmond
article
Frontiers in Physiology, 2016, 7, pp.108. ⟨10.3389/fphys.2016.00108⟩
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BibTex
titre
From Single Myocyte to Whole Heart
auteur
Sanda Despa, Edward Vigmond
article
Circulation Research, 2016, 118 (2), pp.184-186. ⟨10.1161/CIRCRESAHA.115.308067⟩
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BibTex
titre
Modeling our understanding of the His-Purkinje system
auteur
Edward Vigmond, Bruno Stuyvers
article
Progress in Biophysics and Molecular Biology, 2016, 120 (1-3), pp.179-188. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2015.12.013⟩
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BibTex
titre
Noisy threshold in neuronal models: connections with the noisy leaky integrate-and-fire model
auteur
Gregory Dumont, Jacques Henry, Carmen Oana Tarniceriu
article
Journal of Mathematical Biology, 2016, 73, pp.1413 – 1436. ⟨10.1007/s00285-016-1002-8⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1512.03785 BibTex
titre
Stochastic Finite Element Method for torso conductivity uncertainties quantification in electrocardiography inverse problem
auteur
Rajae Aboulaich, Najib Fikal, Emahdi El Guarmah, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2016, 11 (2), pp.1-19. ⟨10.1051/mmnp/201611201⟩
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https://inria.hal.science/hal-01289144/file/mmnp-format-fikal.pdf BibTex
titre
Theoretical connections between mathematical neuronal models corresponding to different expressions of noise
auteur
Grégory Dumont, Jacques Henry, Carmen Oana Tarniceriu
article
Journal of Theoretical Biology, 2016, 406, pp.31-41. ⟨10.1016/j.jtbi.2016.06.022⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01414929/file/JTBrev2.pdf BibTex
titre
Stability results for the parameter identification inverse problem in cardiac electrophysiology
auteur
Jamila Lassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
Inverse Problems, 2016, 32 (11), pp.1-31. ⟨10.1088/0266-5611/32/11/115002⟩
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https://inria.hal.science/hal-01399373/file/Paper-Mahjoub-Moncef-soumission-Inverse-Problems-corrige.pdf BibTex
titre
A 3D boundary optimal control for the bidomain-bath system modeling the thoracic shock therapy for cardiac defibrillation
auteur
Mostafa Bendahmane, Nagaiah Chamakuri, Eloïse Comte, Bedr’Eddine Ainseba
article
Journal of Mathematical Analysis and Applications, 2016, ⟨10.1016/j.jmaa.2016.01.018⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01261547/file/article_fhn_rev1%20%281%29.pdf BibTex
titre
Turing pattern dynamics and adaptive discretization for a superdiffusive Lotka-Volterra system
auteur
Mostafa Bendahmane, Ricardo Ruiz-Baier, Canrong Tian
article
Journal of Mathematical Biology, 2016, 6, pp.1441-1465
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01403081/file/JOMB-S-14-00403.pdf BibTex

Conference papers

titre
Sensitivity of the electrocardiographic forward problem to the heart potential measuement noise and conductivity uncertainties
auteur
Rajae Aboulaich, Najib Fikal, El Mahdi Guarmah, Nejib Zemzemi
article
Colloque africain sur la recherche en informatique et mathématiques appliquées, CARI 2016, Oct 2016, Hammamet, Tunisia
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01402938/file/squelette-CARI2016.pdf BibTex
titre
Identification of sources for the bidomain equation using topological gradient
auteur
Jamila Lassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
Colloque africain sur la recherche en informatique et mathématiques appliquées, CARI 2016, Oct 2016, Hammamet, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01402953/file/Papier_CAri.pdf BibTex
titre
Do we need to enforce the homogeneous Neuman condition on the Torso for solving the inverse electrocardiographic problem by using the method of fundamental solution ?
auteur
Judit Chamorro-Servent, Laura Bear, Josselin Duchateau, Mark Potse, Rémi Dubois, Yves Coudière
article
Computing in Cardiology 2016, Sep 2016, Vancouver, Canada. pp.425-428
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titre
Epicardial Fibrosis Explains Increased Transmural Conduction in a Computer Model of Atrial Fibrillation
auteur
Ali Gharaviri, Mark Potse, Sander Verheule, Rolf Krause, Angelo Auricchio, Ulrich Schotten
article
Computing in Cardiology, Sep 2016, Vancouver, Canada
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https://inria.hal.science/hal-01386916/file/gharaviri-cinc16.pdf BibTex
titre
Adaptive placement of the pseudo-boundaries improves the conditioning of the inverse problem
auteur
Judit Chamorro-Servent, Laura Bear, Josselin Duchateau, Corentin Dallet, Yves Coudière, Rémi Dubois
article
Computing in Cardiology, Sep 2016, Vancouver, Canada
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https://inria.hal.science/hal-01379271/file/294_file_cinc_manuscript.pdf BibTex
titre
Optimization of Organ Conductivity for the Forward Problem of Electrocardiography
auteur
Laura Bear, Rémi Dubois, Nejib Zemzemi
article
Computing In cardiology, Sep 2016, Vancouver, Canada
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https://inria.hal.science/hal-01402927/file/CINC%20paper%20final.pdf BibTex
titre
Decentralized Strategies for Ill Posed Inverse Problems
auteur
Abderrahmane Habbal, Moez Kallel, Rabeb Chamekh, Nejib Zemzemi
article
5th International Conference on Engineering Optimization, Jun 2016, Iguassu Falls, Brazil
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titre
Rapid estimation of 3D ventricular activation from electroanatomic mapping
auteur
Simone Pezzuto, Peter Kalavsky, Mark Potse, François Regoli, Maria Luce Caputo, Giulio Conte, Tiziano Moccetti, Frits W. Prinzen, Angelo Auricchio, Rolf Krause
article
Cardiostim EHRA Europace, Jun 2016, Nice, France
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https://inria.hal.science/hal-01386922/file/pezzuto16ep.pdf BibTex
titre
A Nash-game approach to solve the Coupled problem of conductivity identification and data completion
auteur
Rabeb Chamekh, Abderrahmane Habbal, Moez Kallel, Nejib Zemzemi
article
PICOF (Problèmes Inverses, Contrôle et Optimisation de Formes), Jun 2016, Autrans, France
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https://inria.hal.science/hal-01402976/file/abstract-picof-2016.pdf BibTex
titre
Stability results for the parameter identification inverse problem in cardiac electrophysiology
auteur
Lassoued Jamila, Mahjoub Moncef, Nejib Zemzemi
article
PICOF (Problèmes Inverses, Contrôle et Optimisation de Formes), Jun 2016, Autrans, France
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BibTex
titre
Étude d’un modèle microscopique de l’électrophysiologie cardiaque
auteur
Pierre-Elliott Bécue
article
CANUM 2016 – 43e Congrès National d’Analyse Numérique, May 2016, Obernai, France
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https://inria.hal.science/hal-01412883/file/presentation.pdf BibTex
titre
Efficient high order schemes for stiff ODEs in cardiac electrophysiology.
auteur
Yves Coudière, Charlie Douanla-Lontsi, Charles Pierre
article
African Conference on Research in Computer Sciences and Applied Mathematics. Tunis,, 2016, Tunis, Tunisia. pp.312–319
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Master thesis

titre
Probìeme inverse en électrocardiographie : Théorie de la factorisation
auteur
Ronald Reagan Moussitou
article
Analysis of PDEs [math.AP]. 2016
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https://inria.hal.science/hal-01418738/file/memoire-3-9.pdf BibTex

Poster communications

titre
The effects of the diffusive inclusions in the bidomain model: theoretical and numerical study. Application to the rat heart.
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Clair Poignard
article
2nd Scientific Workshop IHU-Liryc, Nov 2016, Bordeaux, France
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https://inria.hal.science/hal-01418706/file/main.pdf BibTex
titre
Possible improvements of the method of fundamental solution to solve the ECGI problem
auteur
Judit Chamorro-Servent, Laura Bear, Josselin Duchateau, Mark Potse, Rémi Dubois, Yves Coudière
article
Workshop Liryc, Oct 2016, Pessac, France
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https://inria.hal.science/hal-01410756/file/IHUPosterJCHS.pdf BibTex
titre
Integration of data and model in cardiac electrophysiology
auteur
Mehdi Juhoor, Marc Fuentes
article
Liryc Workshop, Sep 2016, Pessac, France. 2016
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https://inria.hal.science/hal-01400889/file/IDAM.pdf BibTex
titre
High order time-stepping methods for cardiac electrophysiology models
auteur
Charlie Douanla Lontsi, Yves Coudière, Charles Pierre
article
IHU Liryc-Workshop 2016, Sep 2016, Bordeaux, France
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https://inria.hal.science/hal-01406536/file/High_order_RLk.pdf BibTex
titre
Regional conduction slowing can explain inferolateral J waves and their attenuation by sodium channel blockers
auteur
Mark Potse, Veronique M F Meijborg, Charly N W Belterman, Jacques M T de Bakker, Chantal E Conrath, Ruben Coronel
article
Annual workshop of Liryc – Electrophysiology and heart modeling institute, Sep 2016, Pessac, France. , 2016
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https://inria.hal.science/hal-01393102/file/poster.pdf BibTex
titre
Front observer for data assimilation of electroanatomical mapping data for a numerical atrial model
auteur
A Gérard, Annabelle Collin, J Bayer, A Frontera, Philippe Moireau, Yves Coudière
article
Liryc Workshop, Sep 2016, Bordeaux, France
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https://inria.hal.science/hal-01400776/file/poster.pdf BibTex
titre
Parameters estimation approach for the MEA/hiPSC-CM assays
auteur
Julien Bouyssier, Mostafa Bendahmane, Yves Coudière, Jean-Frédéric Gerbeau, Julien Pedron, Philippe Zitoun, Nejib Zemzemi
article
Journées scientifiques du LIRYC, Sep 2016, Pessac, France
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https://inria.hal.science/hal-01409683/file/main.pdf BibTex
titre
Optimization of Organ Conductivity for the Forward Problem of Electrocardiography
auteur
Laura Bear, Rémi Dubois, Nejib Zemzemi
article
Journées scientifiques du LIRYC, Sep 2016, Pessac, France
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https://inria.hal.science/hal-01402983/file/Poster-v2.pdf BibTex
titre
Do we need to enforce the homogeneous Neumann condition on the torso for solving the inverse electrocardiographic problem?
auteur
Judit Chamorro-Servent, Laura Bear, Josselin Duchateau, Mark Potse, Rémi Dubois, Yves Coudière
article
Computing in Cardiology, Sep 2016, Vancouver, Canada. 2016
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https://inria.hal.science/hal-01378822/file/jchamorroCinCposter.pdf BibTex
titre
Theoretical and Numerical Study of Cardiac Electrophysiology Problems at the Microscopic Scale.
auteur
Pierre-Elliott Bécue, Florian Caro, Mark Potse, Yves Coudière
article
SIAM Conference on the Life Sciences (LS16), Jul 2016, Boston, United States
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https://inria.hal.science/hal-01405837/file/poster.pdf BibTex

Theses

titre
Multiscale mathematical modelling of structural heterogeneities in cardiac electrophysiology
auteur
Andjela Davidović
article
General Mathematics [math.GM]. Université de Bordeaux, 2016. English. ⟨NNT : 2016BORD0448⟩
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https://theses.hal.science/tel-01478145/file/DAVIDOVIC_ANDJELA_2016.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
The Modified Bidomain Model with Periodic Diffusive Inclusions
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Clair Poignard
article
2016
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2015

Journal articles

titre
Stability analysis of the POD reduced order method for solving the bidomain model in cardiac electrophysiology
auteur
Cesare Corrado, Jamila Lassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
Mathematical Biosciences, 2015, ⟨10.1016/j.mbs.2015.12.005⟩
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https://inria.hal.science/hal-01245685/file/Paper-MBS-D-15-00248-Accepted-Mahjoub-BioSciences.pdf BibTex
titre
Towards a large-scale scalable adaptive heart model using shallow tree meshes
auteur
Dorian Krause, Thomas Dickopf, Mark Potse, Rolf Krause
article
Journal of Computational Physics, 2015, 298, pp.79-94. ⟨10.1016/j.jcp.2015.05.005⟩
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titre
Transmural APD gradient synchronizes repolarization in the human left ventricular wall
auteur
Bastiaan Boukens, Matthew Sulkin, Chris Gloschat, Fu Siong Ng, Edward Vigmond, Igor Efimov
article
Cardiovascular Research, 2015, 108 (1), pp.188-196. ⟨10.1093/cvr/cvv202⟩
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titre
Controllability of a Degenerating Reaction-diffusion System in Electrocardiology
auteur
Mostafa Bendahmane, Felipe Wallison
article
SIAM Journal on Control and Optimization, 2015, 53 (6), pp.3483-3502
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https://hal.science/hal-01256761/file/BenChav-SIAM-revised.pdf BibTex
titre
Stochastic spontaneous calcium release events trigger premature ventricular complexes by overcoming electrotonic load
auteur
Fernando Campos, Yohannes Shiferaw, Anton J Prassl, Patrick Boyle, Edward Vigmond, Gernot N Plank
article
Cardiovascular Research, 2015, 107 (1), pp.175-183. ⟨10.1093/cvr/cvv149⟩
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titre
The Early Repolarization Pattern
auteur
Peter W. Macfarlane, Charles Antzelevitch, Michel Haïssaguerre, Heikki V. Huikuri, Mark Potse, Raphael Rosso, Frederic Sacher, Jani T. Tikkanen, Hein Wellens, Gan-Xin Yan
article
Journal of the American College of Cardiology, 2015, 66 (4), pp.470-477. ⟨10.1016/j.jacc.2015.05.033⟩
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BibTex
titre
Asymptotic wave propagation in excitable media
auteur
Olivier Bernus, Edward Vigmond
article
Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, 2015, 92 (1), pp.010901. ⟨10.1103/PhysRevE.92.010901⟩
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titre
Stability of Conductivities in an Inverse Problem in the Reaction-diffusion System in Electrocardiology
auteur
Bedr’Eddine Ainseba, Mostafa Mostafa Bendahmane, He Yuan
article
Networks and Heterogeneous Media, 2015, ⟨10.3934/nhm.2015.10.xx⟩
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https://hal.science/hal-01256802/file/Bendahmane-NHM_6.pdf BibTex
titre
Tracking Rotors With Minimal Electrodes
auteur
Krishnanand Balasundaram, Karthikeyan Umapathy, Joyce Jeyaratnam, Ahmed Niri, Stéphane Massé, Talha Farid, Krishnakumar Nair, John Asta, Robert Cusimano, Edward Vigmond, Kumaraswamy Nanthakumar
article
Circulation. Arrhythmia and electrophysiology, 2015, 8 (2), pp.447-455. ⟨10.1161/CIRCEP.114.002306⟩
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BibTex
titre
A two layers monodomain model of cardiac electrophysiology of the atria
auteur
Yves Coudière, Jacques Henry, Simon Labarthe
article
Journal of Mathematical Biology, 2015, 71 (6-7), pp.35. ⟨10.1007/s00285-015-0861-8⟩
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https://inria.hal.science/hal-01132889/file/article_version_hal.pdf BibTex
titre
Computation and Projection of Spiral Wave Trajectories During Atrial Fibrillation
auteur
Ali Pashaei, Jason Bayer, Valentin Meillet, Rémi Dubois, Edward Vigmond
article
Cardiac Electrophysiology Clinics, 2015, 7 (1), pp.37-47. ⟨10.1016/j.ccep.2014.11.001⟩
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BibTex
titre
Identification of weakly coupled multiphysics problems. Application to the inverse problem of electrocardiography
auteur
Cesare Corrado, Jean-Frédéric Gerbeau, Philippe Moireau
article
Journal of Computational Physics, 2015, 283, pp.271-298. ⟨10.1016/j.jcp.2014.11.041⟩
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https://inria.hal.science/hal-01091751/file/electromec_resubmission.pdf BibTex
titre
Solvability analysis and numerical approximation of linearized cardiac electromechanics
auteur
Boris Andreianov, Mostafa Bendahmane, Alfio Quarteroni, Ricardo Ruiz-Baier
article
Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2015, ⟨10.1142/S0218202515500244⟩
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https://hal.science/hal-01256811/file/ABQR_forM3AS_REVISED.pdf BibTex
titre
On 3D Numerical Inverse Problems for the Bidomain Model in Electrocardiology
auteur
Bedr’Eddine Ainseba, Mostafa Mostafa Bendahmane, Alejandro Lopez
article
Computers & Mathematics with Applications, 2015, 69 ( 4), pp.255-274
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https://hal.science/hal-01256825/file/AinBen-bidomain-full.pdf BibTex

Conference papers

titre
Accuracy of Lead Removal vs Linear Interpolation in Non-Invasive Electrocardiographic Imaging (ECGI)
auteur
Laura Bear, Mark Potse, Josselin Duchateau, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Rémi Dubois
article
Computing in cardiology, Sep 2015, Nice, France
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https://inria.hal.science/hal-01241752/file/Cinc2015-Laura.pdf BibTex
titre
Inverse Localization of Ischemia in a 3D Realistic Geometry: A Level Set Approach
auteur
Carlos E. Chavez, Felipe Alonso-Atienza, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Diegó Alvarez
article
Computing in cardiology, Sep 2015, Nice, France
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https://inria.hal.science/hal-01241754/file/Carlos-Cinc2015.pdf BibTex
titre
Microscopic Modelling of the Non-Linear Gap Junction Channels
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Thomas Desplantez, Clair Poignard
article
2015 Computing in Cardiology Conference (CinC), Sep 2015, Nice, France
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https://inria.hal.science/hal-01418702/file/paper.pdf BibTex
titre
Local Conduction Velocity Mapping for Electrocardiographic Imaging
auteur
Corentin Dallet, Laura Bear, Josselin Duchateau, Mark Potse, Nejib Zemzemi, Valentin Meillet, Yves Coudière, Rémi Dubois
article
Computing in cardiology, Sep 2015, Nice, France
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https://inria.hal.science/hal-01241751/file/CinC2015_Corentin.pdf BibTex
titre
Effect of the torso conductivity heterogeneities on the ECGI inverse problem solution
auteur
Nejib Zemzemi, Cecile Dobrzynski, Laura Bear, Mark Potse, Corentin Dallet, Yves Coudière, Remi Dubois, Josselin Duchateau
article
Computing in cardiology, Sep 2015, Nice, France
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https://inria.hal.science/hal-01241750/file/cinc2015.pdf BibTex
titre
Adaptive multistep time discretization and linearization based on a posteriori estimates for the Richards equation
auteur
Pierre Sochala, Vincent Baron, Yves Coudière
article
SIAM Conference on Mathematical and Computational Issues in the Geosciences, SIAM, Jun 2015, Stanford, United States
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BibTex
titre
Issues in Modeling Cardiac Optical Mapping Measurements
auteur
Gwladys Ravon, Yves Coudière, Angelo Iollo, Oliver Bernus, Richard D. Walton
article
Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2015, Maastricht, Netherlands. ⟨10.1007/978-3-319-20309-6_52⟩
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https://hal.science/hal-01214073/file/article_Gwladys_Ravon.pdf BibTex
titre
Inverse problem in electrocardography via the factorization method of boundary value problems
auteur
Julien Bouyssier, Nejib Zemzemi, Jacques Henry
article
IEEE 12th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2015, Apr 2015, New York, France. ⟨10.1109/ISBI.2015.7163979⟩
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https://hal.science/hal-01222401/file/ArticleISBI2015.pdf BibTex
titre
In silico assessment of drugs effects on human embryonic stem cells derived cardiomyocytes electrical activity
auteur
Emanuela Abbate, Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Jean-Frédéric Gerbeau
article
LACM 2015 (2nd International Workshop on Latest Advances in Cardiac Modeling), Mar 2015, German Heart Center, Munich, Germany
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BibTex

Book sections

titre
Sensitivity of the Electrocardiography Inverse Solution to the Torso Conductivity Uncertainties
auteur
Nejib Zemzemi, Rajae Aboulaich, Najib Fikal, Emahdi El Guarmah
article
Hans van Assen; Peter Bovendeerd ; Tammo Delhaas. Functional Imaging and Modeling of the Heart, Lecture Notes in Computer Science (9126), Springer, pp.475-483, 2015, 8th International Conference, FIMH 2015, Maastricht, The Netherlands, June 25-27, 2015. Proceedings, 978-3-319-20308-9. ⟨10.1007/978-3-319-20309-6_54⟩
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https://hal.science/hal-01222381/file/fimh.pdf https://hal.science/hal-01222381/file/fimh%20%281%29.pdf BibTex

Other publications

titre
Exponential multistep ODE solvers for stiff problems : convergence and stability analysis
auteur
Y. Coudière, C Douahla Lontsi, Charles Pierre
article
2015
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BibTex

Poster communications

titre
Microscopic Modelling of the Non-Linear Gap Junction Channels
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Thomas Desplantez, Clair Poignard
article
2015 Computing in Cardiology Conference, Sep 2015, Nice, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01418665/file/main.pdf BibTex
titre
Cardiac electrical simulations at the microscopic scale
auteur
Pierre-Elliott Bécue, Florian Caro, Mark Potse, Yves Coudière
article
PTIB presentation of CARMEN team work., Jul 2015, Bordeaux, France. 2015
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01255492/file/poster.pdf BibTex
titre
Effects of non-linear GJ channels on the AP propagation : a modelling insight
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Thomas Desplantez, Clair Poignard
article
33RD ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN SECTION OF THE ISHR , Jul 2015, Bordeaux, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01418687/file/ISHR2015-AD.pdf BibTex
titre
Overview on the Cardiac ElectroPhysiology Simulator (CEPS)
auteur
Nejib Zemzemi, Yves Coudière, Florian Caro, Marc Fuentes
article
Meeting at the Lyric, Jun 2015, Bordeaux, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01204600/file/2015-06-poster-ptib.pdf BibTex
titre
Sensitivity of the electrocardiography inverse solution to the torso conductivity uncertainties
auteur
Rajae Aboulaich, Najib Fikal, El Mahdi El Guarmah, Nejib Zemzemi
article
LIRYC scientific day, Jun 2015, Pessac, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01222404/file/poster.pdf BibTex
titre
New Mathematical approaches in Electrocardiography Imaging inverse problem
auteur
Nejib Zemzemi, Mark Potse, Laura Bear, Yves Coudière, Rémi Dubois, Jacques Henry, C Dallet, Josselin Duchateau, O Bernus, M Haïssaguerre
article
LIRYC scientific day, Jun 2015, Pessac, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01222406/file/LirycPoster.pdf BibTex
titre
Modelling cardiac electrophysiology with structural heterogeneities and dynamical gap junctions
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Clair Poignard, Thomas Desplantez
article
2015 SIAM Conference on Computational Science and Engineering, Mar 2015, Salt Lake City, United States
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https://inria.hal.science/hal-01418697/file/main.pdf BibTex

Theses

titre
Inverse problems for cardiac optical mapping
auteur
Gwladys Ravon
article
Analyse numérique [math.NA]. Université de Bordeaux, 2015. Français. ⟨NNT : 2015BORD0118⟩
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https://inria.hal.science/tel-01251706/file/RAVON_GWLADYS_2015.pdf BibTex

2014

Journal articles

titre
A bilayer model of human atria: mathematical background, construction, and assessment
auteur
Simon Labarthe, Jason Bayer, Yves Coudière, Jacques Henry, Hubert Cochet, Pierre Jais, Edward Vigmond
article
EP-Europace, 2014, 16 (suppl 4), pp.29. ⟨10.1093/europace/euu256⟩
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https://inria.hal.science/hal-01132905/file/article.pdf BibTex
titre
Patient-specific modelling of cardiac electrophysiology in heart-failure patients
auteur
Mark Potse, Dorian Krause, Wilco Kroon, Romina Murzilli, Stefano Muzzarelli, François Regoli, Enrico G. Caiani, Frits W. Prinzen, Rolf Krause, Angelo Auricchio
article
EP-Europace, 2014, 16, pp.iv56-iv61. ⟨10.1093/europace/euu257⟩
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https://inria.hal.science/hal-01080113/file/potse-trm13.pdf BibTex
titre
Effects of L-type calcium channel and human ether-a-go-go related gene blockers on the electrical activity of the human heart: a simulation study
auteur
Nejib Zemzemi, Rodriguez Blanca
article
EP-Europace, 2014, ⟨10.1093/europace/euu122⟩
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BibTex
titre
A Density Model for a Population of Theta Neurons
auteur
Gregory Dumont, Jacques Henry, Carmen Oana Tarniceriu
article
Journal of Mathematical Neuroscience, 2014, 4 (2), ⟨10.1186/2190-8567-4-2⟩
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BibTex
titre
Design and analysis of a lightweight parallel adaptive scheme for the solution of the monodomain equation
auteur
Thomas Dickopf, Dorian Krause, Rolf Krause, Mark Potse
article
SIAM Journal on Scientific Computing, 2014, 36 (2), pp.C163-C189. ⟨10.1137/130912505⟩
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BibTex
titre
Study of degenerate parabolic system modeling the hydrogen displacement in a nuclear waste repository
auteur
Mazen Saad, Bilal Saad, Florian Caro
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series S, 2014, 7 (2), pp.191 – 205. ⟨10.3934/dcdss.2014.7.191⟩
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https://arxiv.org/pdf/1202.3820 BibTex
titre
Optimal monodomain approximations of the bidomain equations used in cardiac electrophysiology
auteur
Yves Coudière, Yves Bourgault, Myriam Rioux
article
Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2014, 24 (6), pp.1115-1140. ⟨10.1142/S0218202513500784⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00644257/file/RR-7810.pdf BibTex

Conference papers

titre
An Iterative method for solving the inverse problem in Electrocardiography imaging: From body surface to heart potential.
auteur
Nejib Zemzemi, Hamed Bourenane, Hubert Cochet
article
IEEE Computers in Cardiology, MIT, Sep 2014, Cambridge, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01065107/file/cinc2014.pdf BibTex
titre
A Computational Investigation into the Effect of Infarction on Clinical Human Electrophysiology Biomarkers
auteur
Louie Cardone-Noott, Alfonso Bueno-Orovio, Ana Mincholé, Kevin Burrage, Mikael Wallman, Nejib Zemzemi, Erica Dall’Armellina, Rodriguez Blanca
article
IEEE Computers in Cardiology, Sep 2014, Cambridge, United States
Accès au bibtex
BibTex
titre
The Modified Bidomain Model with Periodic Diffusive Inclusions
auteur
Yves Coudière, Anđela Davidović, Clair Poignard
article
Computing in Cardiology — 41st Annual Conference, Sep 2014, Cambridge, Massachusetts, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01117248/file/paper.pdf BibTex
titre
Localization of Three-Dimensional Sources in Cardiac Tissue Using Optical Mapping
auteur
Gwladys Ravon, Yves Coudière, Angelo Iollo, Oliver Bernus, Richard D. Walton
article
CinC 2014 : Computing in Cardiology Conference, Sep 2014, Cambridge, United States. pp.829 – 832
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https://inria.hal.science/hal-01114916/file/0829.pdf BibTex
titre
Role and modelling of some heterogeneities for cardiac electrophysiology
auteur
Anđela Davidović
article
MATHEMATICAL MODELLING WORKSHOP: MATHMODS & EMA ALUMNI MEETING, MATHMODS & EMA ALUMNI, Jul 2014, L’Aquila, Italy
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BibTex
titre
Role and modelling of some heterogeneities for cardiac electrophysiology
auteur
Anđela Davidović
article
First Joint International Meeting RSME-SCM-SEMA-SIMAI-UMI, Jun 2014, Bilbao, Spain
Accès au bibtex
BibTex
titre
An iterative method for solving the inverse problem in electrocardiography in normal and fibrillation conditions: A simulation Study
auteur
Nejib Zemzemi
article
International Congress on Electrocardiology (ICE), Jun 2014, Bratislava, Slovakia. pp.53-56
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01064445/file/TheICE2014_paper.pdf BibTex
titre
Inverse ECG problem using the factorization method
auteur
Nejib Zemzemi, Julien Bouyssier
article
PICOF’2014, LAMSIN, May 2014, Hammamet, Tunisia
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titre
Inferolateral J-waves are inducible by regional conduction delay
auteur
Veronique M. F. Meijborg, Chantal E. Conrath, Mark Potse, Jacques M. T. de Bakker, Ruben Coronel
article
Heart Rhythm Meeting, May 2014, San Francisco, United States
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Books

titre
Adaptive time discretization and linearization based on a posteriori estimates for the Richards equation
auteur
Vincent Baron, Yves Coudière, Pierre Sochala
article
Fuhrmann, Jürgen; Ohlberger, Mario; Rohde, Christian. Springer, 8 p., 2014, Springer Proceedings in Mathematics & Statistics, Vol. 77, ⟨10.1007/978-3-319-05591-6_48⟩
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Poster communications

titre
The Modified Bidomain Model with Diffusive Inclusions
auteur
Yves Coudière, Anđela Davidović, Clair Poignard
article
Computing in Cardiology — 41st Annual Conference, Sep 2014, Cambridge, Massachusetts, United States. 2014
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https://inria.hal.science/hal-01117258/file/main.pdf BibTex
titre
Influence of periodic diffusive inclusions on the bidomain model
auteur
Yves Coudière, Anđela Davidović, Clair Poignard
article
From the Clinic to Partial Differential Equations and Back: Emerging challenges for Cardiovascular Mathematics, Jan 2014, Providence, Rhode Island, United States. 2014
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https://inria.hal.science/hal-01117272/file/main.pdf BibTex

Reports

titre
Numerical Investigation on the usefulness of Proper Orthogonal Decomposition method in cardiac electrophysiology
auteur
Jamila Lassoued, Moncef Mahjoub, Nejib Zemzemi
article
[Research Report] 2014, pp.20
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https://inria.hal.science/hal-01058655/file/rapport_2013.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Virtual electrode polarization and current activation with monodomain equations
auteur
Yves Coudière, Myriam Rioux
article
2014
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https://inria.hal.science/hal-00986337/file/MonoCourant-JMBS-merged.pdf BibTex

2013

Journal articles

titre
Critical appraisal of the mechanism underlying J waves
auteur
Mark G Hoogendijk, Mark Potse, Ruben Coronel
article
Journal of Electrocardiology, 2013, 46 (5), pp.390-394. ⟨10.1016/j.jelectrocard.2013.06.017⟩
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titre
Chaste: an open source C++ library for computational physiology and biology.
auteur
Mirams Gary, Christopher J. Arthurs, Miguel O. Bernabeu, Rafel Bordas, Jonathan Cooper, Alberto Corrias, Yohan Davit, Sara-Jane Dunn, Alexander G. Fletcher, Daniel G. Harvey, Megan E. Marsh, James M. Osborne, Pras Pathmanathan, Joe Pitt-Francis, James Southern, Nejib Zemzemi, David J. Gavaghan
article
PLoS Computational Biology, 2013, 9 (3)
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titre
Synchronization of an Excitatory Integrate-and-Fire Neural Network
auteur
Grégory Dumont, Jacques Henry
article
Bulletin of Mathematical Biology, 2013, 75 (4), pp.629-648. ⟨10.1007/s11538-013-9823-8⟩
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https://inria.hal.science/hal-00822472/file/explosion-revised.pdf BibTex

Conference papers

titre
A Steklov-Poincaré Variational Formulation of the Inverse Problem in Cardiac Electrophysiology
auteur
Nejib Zemzemi
article
CinC – Computing in Cardiology Conference, Sep 2013, Zaragoza, Spain. pp.193
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titre
Influence of Transmural Slow-Conduction Zones on the Long- Time Behaviour Of Atrial Arrhythmia. A Numerical Study with a Human Bilayer Atrial Model
auteur
Simon Labarthe, Edward Vigmond, Yves Coudière, Jacques Henry, Hubert Cochet, Pierre Jais
article
CINC – Computing in Cardiology 2013, Sep 2013, Zaragoza, Spain. pp.1187-1190
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https://inria.hal.science/hal-00921262/file/cinc2013.pdf BibTex
titre
A Machine Learning Technique Regularization of the Inverse Problem in Cardiac Electrophysiology
auteur
Nejib Zemzemi, Rémi Dubois, Yves Coudière, Olivier Bernus, M. Haïssaguerre
article
CinC – Computing in Cardiology Conference, Sep 2013, Zaragoza, Spain. pp.285-312
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titre
A Domain Decomposition Approch in the Electrocardiography Inverse Problem
auteur
Nejib Zemzemi
article
Domain Decomposition 22, Università della Svizzera italiana, Sep 2013, Lugano, Switzerland
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https://inria.hal.science/hal-01065692/file/dd22-proceeding.pdf BibTex
titre
Measured and Simulated P Waves in Normal Subjects Reflect Complex Atrial Anatomy
auteur
Mark Potse, Theo A.R. Lankveld, Stef Zeemering, Nico H.L. Kuijpers, Ulrich Schotten
article
ICE 2013 – 40th International Congress on Electrocardiology, Aug 2013, Glasgow, United Kingdom. pp.e18, ⟨10.1016/j.jelectrocard.2013.05.067⟩
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titre
A Bilayer Representation of the Human Atria
auteur
Edward Vigmond, Simon Labarthe, Hubert Cochet, Yves Coudière, Jacques Henry, Pierre Jais
article
EMBC – 35th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC), 2013, EMBS, Jul 2013, Osaka, Japan. pp.1530-1533, ⟨10.1109/EMBC.2013.6609804⟩
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https://inria.hal.science/hal-00837671/file/atria.pdf BibTex
titre
A Computational Bilayer Surface Model of Human Atria
auteur
Simon Labarthe, Edward Vigmond, Yves Coudière, Jacques Henry, Hubert Cochet, Pierre Jais
article
FIMH 2013 – 7th International Conference on Fonctional Imaging and Modeling of the Heart, S.Ourselin, D.Ruecker, N.Smith, Jun 2013, London, United Kingdom
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https://inria.hal.science/hal-00802104/file/article-2-HAL.pdf BibTex
titre
A computational bilayer surface model of human atria
auteur
Simon Labarthe, Edward Vigmond, Yves Coudière, Jacques Henry, Hubert Cochet, Pierre Jaïs
article
FIMH 2013 – 7th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2013, London, United Kingdom. pp.27-34, ⟨10.1007/978-3-642-38899-6_4⟩
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https://hal.science/hal-01606999/file/a%20computational_1.pdf BibTex
titre
Comparison of DDFV and DG Methods for Flow in Anisotropic Heterogeneous Porous Media
auteur
Vincent Baron, Yves Coudière, Pierre Sochala
article
SIAM Conference on Mathematical & Computational Issues in the Geosciences, Jun 2013, Padova, Italy
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Other publications

titre
Reduced Order Methods: Faster Solvers For Cardiac Electro-physiology problems
auteur
Cesare Corrado, Nejib Zemzemi, Yves Coudière
article
2013
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BibTex
titre
Inverse problem in electrocardiography via factorization method of boundary problems : how reconstruct epicardial potential maps from measurements of the torso ?
auteur
Julien Bouyssier, Nejib Zemzemi, Jacques Henry
article
2013
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https://inria.hal.science/hal-00926344/file/poster_liryc_bj.pdf BibTex

Poster communications

titre
Numerical modeling of the electrical activity of the atria and the pulmonary veins
auteur
Simon Labarthe, Yves Coudière, Jacques Henry
article
Workshop IHU Liryc, Oct 2013, Pessac, France
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https://inria.hal.science/hal-00926441/file/poster-ihu.pdf BibTex
titre
C.E.P.S. : an efficient tool for cardiac electrophysiology simulations
auteur
Mehdi Juhoor, Yves Coudière, Nejib Zemzemi
article
Workshop LIRYC, Oct 2013, Bordeaux, France
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https://inria.hal.science/hal-00925834/file/PosterWorkshop.pdf BibTex
titre
3D Source location in optical mapping
auteur
Gwladys Ravon, Yves Coudière, Angelo Iollo, Olivier Bernus
article
Workshop Liryc, Oct 2013, Pessac, France. 2013
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https://inria.hal.science/hal-00925812/file/posterV3.pdf BibTex
titre
Superposition de couches de fibres et propagations anormales : une étude numérique
auteur
Simon Labarthe, Yves Coudière, Jacques Henry
article
Printemps de la Cardiologie, Apr 2013, Marseille, France
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https://inria.hal.science/hal-00926480/file/poster_PC2013.pdf BibTex
titre
Influence of periodic diffusive inclusions on the bidomain model
auteur
Andjela Davidovic, Yves Coudière, Clair Poignard
article
Workshop Liryc, 2013, Bordeaux, France
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https://inria.hal.science/hal-00937884/file/poster-ad.pdf BibTex

Theses

titre
Numerical modelling of the electrical activity of the atria and the pulmonary veins.
auteur
Simon Labarthe
article
Modélisation et simulation. Université Victor Segalen – Bordeaux II, 2013. Français. ⟨NNT : ⟩
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https://theses.hal.science/tel-00925253/file/manuscrit_SL.pdf BibTex

2012

Journal articles

titre
Computational assessment of drug-induced effects on the electrocardiogram: from ion channel to body surface potentials
auteur
Nejib Zemzemi, Miguel Oscar Bernabeu, Javier Saiz Rodriguez, Jonathan Cooper, Pras Pathmanathan, Gary Mirams, Joe Pitt-Francis, Rodriguez Blanca
article
British Journal of Pharmacology, 2012, 168 (3), pp.718-733. ⟨10.1111/j.1476-5381.2012.02200.x⟩
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BibTex
titre
A parallel second order Cartesian method for elliptic interface problems
auteur
Marco Cisternino, Lisl Weynans
article
Communications in Computational Physics, 2012, 12, pp.1562-1587. ⟨10.4208/cicp.160311.090112a⟩
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https://inria.hal.science/inria-00577874/file/cisternino_weynans.pdf BibTex

Conference papers

titre
Role of L-type Calcium in Modulating Pro-Arrhythmic Effects of Dofetilide in Human
auteur
Nejib Zemzemi, Javier Saiz Rodriguez, Rodriguez Blanca
article
CinC 2012 – Computing in Cardiology, Sep 2012, Krakow, Poland. pp.861-864
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BibTex
titre
A Semi-Automatic Method To Construct Atrial Fibre Structures : a Tool for Atrial Simulations
auteur
Simon Labarthe, Yves Coudière, Jacques Henry, Hubert Cochet
article
CinC 2012 – Computing in Cardiology, Sep 2012, Krakow, Poland. pp.881-884
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https://inria.hal.science/hal-00759191/file/article-CINC-v4.pdf BibTex
titre
Virtual electrodes mechanisms predictions with a current-lifted monodomain model
auteur
Yves Coudière, Myriam Rioux
article
Computing in Cardiology, Sep 2012, Cracovie, Poland. pp.837-840
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https://inria.hal.science/hal-00767042/file/paper_179.pdf BibTex
titre
Global and Directional Activation Maps for Cardiac Mapping in Electrophysiology
auteur
Rémi Dubois, Simon Labarthe, Yves Coudière, Mélèze Hocini, Michel Haïssaguerre
article
CINC 2012 – Computing In Cardiology – 2012, Sep 2012, Krakow, Poland. pp.349-352
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https://inria.hal.science/hal-00760451/file/Manuscript_CinC_2012_DAA.pdf BibTex
titre
From Body Surface Potential to Activation Maps on the Atria: a Machine Learning Technique
auteur
Nejib Zemzemi, Simon Labarthe, Rémi Dubois, Yves Coudière
article
CINC – Computing in Cardiology 2012, Sep 2012, Krakow, Poland. pp.125-128
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https://inria.hal.science/hal-00759210/file/CinCInverseProblem.pdf BibTex

Book sections

titre
EP Challenge – STACOM’11: Forward Approaches to Computational Electrophysiology Using MRI-Based Models and In-Vivo CARTO Mapping in Swine Hearts
auteur
Mihaela Pop, Maxime Sermesant, Tommaso Mansi, Eugene Crystal, Sudip Ghate, Jatin Relan, Charles Pierre, Yves Coudière, Jennifer Barry, Ilan Lashevsky, Beiping Qiang, Elliot R. Mcveigh, Nicholas Ayache, Grahama. Wright
article
Camara, Oscar and Konukoglu, Ender and Pop, Mihaela and Rhode, Kawal and Sermesant, Maxime and Young, Alistair. LNCS, 7085, Springer Berlin Heidelberg, pp.1-13, 2012, STACOM 2011 : Statistical Atlases and Computational Models of the Heart. Imaging and Modelling Challenges, 978-3-642-28325-3. ⟨10.1007/978-3-642-28326-0_1⟩
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BibTex

Poster communications

titre
Modélisation bidimensionnelle d’un problème de réaction-diffusion anisotrope hétérogène en couche mince appliquée à la cardiologie
auteur
Simon Labarthe, Yves Coudière, Jacques Henry
article
CANUM – 2012, May 2012, Super-Besse, France
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https://inria.hal.science/hal-00785621/file/communication-SLABARTHE.pdf BibTex
titre
Simulation numérique de l’activité électrique dans l’oreillette gauche et les veines pulmonaires
auteur
Simon Labarthe, Yves Coudière, Jacques Henry
article
Printemps de la Cardiologie, Apr 2012, Bordeaux, France
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https://inria.hal.science/hal-00785607/file/poster-3-pas-de-couleur.pdf BibTex

Reports

titre
How to compute the extracellular potential in electrocardiology from an extended monodomain model
auteur
M. Chhay, Yves Coudière, Rodolphe Turpault
article
[Research Report] RR-7916, INRIA. 2012, pp.9
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00683386/file/RR-7916.pdf BibTex

2010

Preprints, Working Papers, …

titre
Comparing the bidomain and monodomain models in electro-cardiology through convergence analysis
auteur
Yves Bourgault, Charles Pierre
article
2010
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https://hal.science/hal-00545888/file/PRB1_janv2011.pdf BibTex

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