Publications of the team
2024
Journal articles
- titre
- NNEoS : Neural network-based thermodynamically consistent equation of state for fast and accurate flash calculations
- auteur
- Jingang Qu, Soleiman Yousef, Thibault Faney, Jean-Charles de Hemptinne, Patrick Gallinari
- article
- Applied Energy, 2024, 374, pp.124025. ⟨10.1016/j.apenergy.2024.124025⟩
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- titre
- Individual Brain Charting dataset extension, third release for movie watching and retinotopy data
- auteur
- Ana Luísa Pinho, Hugo Richard, Ana Fernanda Ponce, Michael Eickenberg, Alexis Amadon, Elvis Dohmatob, Isabelle Denghien, Juan Jesús Torre, Swetha Shankar, Himanshu Aggarwal, Alexis Thual, Thomas Chapalain, Chantal Ginisty, Séverine Becuwe-Desmidt, Séverine Roger, Yann Lecomte, Valérie Berland, Laurence Laurier, Véronique Joly-Testault, Gaëlle Médiouni-Cloarec, Christine Doublé, Bernadette Martins, Gaël Varoquaux, Stanislas Dehaene, Lucie Hertz-Pannier, Bertrand Thirion
- article
- Scientific Data , 2024, 11 (590)
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- titre
- Uncertainty-biased molecular dynamics for learning uniformly accurate interatomic potentials
- auteur
- Viktor Zaverkin, David Holzmüller, Henrik Christiansen, Federico Errica, Francesco Alesiani, Makoto Takamoto, Mathias Niepert, Johannes Kästner
- article
- npj Computational Materials, 2024, npj Computational Materials, 10 (1), pp.83. ⟨10.1038/s41524-024-01254-1⟩
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- titre
- Concomitant medication, comorbidity and survival in patients with breast cancer
- auteur
- Elise Dumas, Beatriz Grandal Rejo, Paul Gougis, Sophie Houzard, Judith Abécassis, Floriane Jochum, Benjamin Marande, Annabelle Ballesta, Elaine del Nery, Thierry Dubois, Samar Alsafadi, Bernard Asselain, Aurélien Latouche, Marc Espie, Enora Laas, Florence Coussy, Clémentine Bouchez, Jean-Yves Pierga, Christine Le Bihan-Benjamin, Philippe-Jean Bousquet, Judicaël Hotton, Chloé-Agathe Azencott, Fabien Reyal, Anne-Sophie Hamy
- article
- Nature Communications, 2024, 15 (1), pp.2966. ⟨10.1038/s41467-024-47002-3⟩
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- titre
- stanscofi and benchscofi: a new standard for drug repurposing by collaborative filtering
- auteur
- Clémence Réda, Jill-Jênn Vie, Olaf Wolkenhauer
- article
- Journal of Open Source Software, 2024, 9 (93), pp.5973. ⟨10.21105/joss.05973⟩
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- titre
- Mutual Domain Adaptation
- auteur
- Sunghong Park, Myung Jun Kim, Kanghee Park, Hyunjung Shin
- article
- Pattern Recognition, 2024, 145, pp.109919. ⟨10.1016/j.patcog.2023.109919⟩
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- titre
- Causal inference methods for combining randomized trials and observational studies: a review
- auteur
- Bénédicte Colnet, Imke Mayer, Guanhua Chen, Awa Dieng, Ruohong Li, Gaël Varoquaux, Jean-Philippe Vert, Julie Josse, Shu Yang
- article
- Statistical Science, In press
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- titre
- Understanding metric-related pitfalls in image analysis validation
- auteur
- Annika Reinke, Minu D. Tizabi, Michael Baumgartner, Matthias Eisenmann, Doreen Heckmann-Nötzel, A. Emre Kavur, Tim Rädsch, Carole H. Sudre, Laura Acion, Michela Antonelli, Tal Arbel, Spyridon Bakas, Arriel Benis, Matthew Blaschko, Florian Buettner, M. Jorge Cardoso, Veronika Cheplygina, Jianxu Chen, Evangelia Christodoulou, Beth A. Cimini, Gary S. Collins, Keyvan Farahani, Luciana Ferrer, Adrian Galdran, Bram van Ginneken, Ben Glocker, Patrick Godau, Robert Haase, Daniel A. Hashimoto, Michael M. Hoffman, Merel Huisman, Fabian Isensee, Pierre Jannin, Charles E. Kahn, Dagmar Kainmueller, Bernhard Kainz, Alexandros Karargyris, Alan Karthikesalingam, Hannes Kenngott, Jens Kleesiek, Florian Kofler, Thijs Kooi, Annette Kopp-Schneider, Michal Kozubek, Anna Kreshuk, Tahsin Kurc, Bennett A. Landman, Geert Litjens, Amin Madani, Klaus Maier-Hein, Anne L. Martel, Peter Mattson, Erik Meijering, Bjoern Menze, Karel G. M. Moons, Henning Müller, Brennan Nichyporuk, Felix Nickel, Jens Petersen, Susanne M. Rafelski, Nasir Rajpoot, Mauricio Reyes, Michael A. Riegler, Nicola Rieke, Julio Saez-Rodriguez, Clara I. Sánchez, Shravya Shetty, Ronald M. Summers, Abdel A. Taha, Aleksei Tiulpin, Sotirios A. Tsaftaris, Ben van Calster, Gaël Varoquaux, Ziv R. Yaniv, Paul F. Jäger, Lena Maier-Hein
- article
- Nature Methods, 2024, 21, pp.182-194. ⟨10.1038/s41592-023-02150-0⟩
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- titre
- The Past, Present, and Future of the Brain Imaging Data Structure (BIDS)
- auteur
- Russell Poldrack, Christopher Markiewicz, Stefan Appelhoff, Yoni Ashar, Tibor Auer, Sylvain Baillet, Shashank Bansal, Leandro Beltrachini, Christian Benar, Giacomo Bertazzoli, Suyash Bhogawar, Ross Blair, Marta Bortoletto, Mathieu Boudreau, Teon Brooks, Vince Calhoun, Filippo Maria Castelli, Patricia Clement, Alexander Cohen, Julien Cohen-Adad, Sasha d’Ambrosio, Gilles de Hollander, María de la Iglesia-Vayá, Alejandro de la Vega, Arnaud Delorme, Orrin Devinsky, Dejan Draschkow, Eugene Paul Duff, Elizabeth Dupre, Eric Earl, Oscar Esteban, Franklin Feingold, Guillaume Flandin, Anthony Galassi, Giuseppe Gallitto, Melanie Ganz, Rémi Gau, James Gholam, Satrajit Ghosh, Alessio Giacomel, Ashley Gillman, Padraig Gleeson, Alexandre Gramfort, Samuel Guay, Giacomo Guidali, Yaroslav Halchenko, Daniel Handwerker, Nell Hardcastle, Peer Herholz, Dora Hermes, Christopher Honey, Robert Innis, Horea-Ioan Ioanas, Andrew Jahn, Agah Karakuzu, David Keator, Gregory Kiar, Balint Kincses, Angela Laird, Jonathan Lau, Alberto Lazari, Jon Haitz Legarreta, Adam Li, Xiangrui Li, Bradley Love, Hanzhang Lu, Eleonora Marcantoni, Camille Maumet, Giacomo Mazzamuto, Steven Meisler, Mark Mikkelsen, Henk Mutsaerts, Thomas Nichols, Aki Nikolaidis, Gustav Nilsonne, Guiomar Niso, Martin Norgaard, Thomas Okell, Robert Oostenveld, Eduard Ort, Patrick Park, Mateusz Pawlik, Cyril Pernet, Franco Pestilli, Jan Petr, Christophe Phillips, Jean-Baptiste Poline, Luca Pollonini, Pradeep Reddy Raamana, Petra Ritter, Gaia Rizzo, Kay Robbins, Alexander Rockhill, Christine Rogers, Ariel Rokem, Chris Rorden, Alexandre M Routier, Jose Manuel Saborit-Torres, Taylor Salo, Michael Schirner, Robert Smith, Tamas Spisak, Julia Sprenger, Nicole Swann, Martin Szinte, Sylvain Takerkart, Bertrand Thirion, Adam Thomas, Sajjad Torabian, Gaël Varoquaux, Bradley Voytek, Julius Welzel, Martin Wilson, Tal Yarkoni, Krzysztof Gorgolewski
- article
- Imaging Neuroscience, 2024, 2, pp.1-19. ⟨10.1162/imag_a_00103⟩
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Conference papers
- titre
- CARTE: Pretraining and Transfer for Tabular Learning
- auteur
- Myung Jun Kim, Léo Grinsztajn, Gaël Varoquaux
- article
- Forty-first International Conference on Machine Learning, ICML 2024, Jul 2024, Vienna, Austria
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- titre
- Optimizing human learning using reinforcement learning
- auteur
- Samuel Girard, Jill-Jênn Vie, Françoise Tort, Amel Bouzeghoub
- article
- Educational Data Mining 2024, Jul 2024, Atlanta (USA), United States
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- titre
- Adaptation of the Multi-Concept Multivariate Elo Rating System to Medical Students’ Training Data
- auteur
- Erva Nihan Kandemir, Jill-Jênn Vie, Adam Hegel Sanchez Ayte, Olivier Palombi, Franck Ramus
- article
- LAK 2024 – The 14th Learning Analytics and Knowledge Conference, Mar 2024, Kyoto, Japan. pp.1-10, ⟨10.1145/3636555.3636858⟩
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- titre
- Optimizing Human Learning. 4th Workshop eliciting Adaptive Sequences for Learning and Educational RecSys (WASL 2024)
- auteur
- Jill-Jênn Vie, Yong Zheng, Fabrice Popineau, Yizhu Gao, Samuel Girard, Hisashi Kashima
- article
- Learning Analytics and Knowledge 2024, Mar 2024, Kyoto, Japan
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- titre
- Learning High-Quality and General-Purpose Phrase Representations
- auteur
- Lihu Chen, Gaël Varoquaux, Fabian M. Suchanek
- article
- EACL 2024 – The 18th Conference of the European Chapter of the Association for Computational Linguistics, Mar 2024, La Valette, Malta
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Preprints, Working Papers, …
- titre
- Active Learning for Neural PDE Solvers
- auteur
- Daniel Musekamp, Marimuthu Kalimuthu, David Holzmüller, Makoto Takamoto, Mathias Niepert
- article
- 2024
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- titre
- What is the Role of Small Models in the LLM Era: A Survey
- auteur
- Lihu Chen, Gaël Varoquaux
- article
- 2024
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Imputation for prediction: beware of diminishing returns
- auteur
- Marine Le Morvan, Gaël Varoquaux
- article
- 2024
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- titre
- Better by Default: Strong Pre-Tuned MLPs and Boosted Trees on Tabular Data
- auteur
- David Holzmüller, Léo Grinsztajn, Ingo Steinwart
- article
- 2024
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- titre
- Comprehensive evaluation of collaborative filtering in drug repurposing
- auteur
- Clémence Réda, Jill-Jênn Vie, Olaf Wolkenhauer
- article
- 2024
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Joint Embedding-Classifier Learning for Interpretable Collaborative Filtering
- auteur
- Clémence Réda, Jill-Jênn Vie, Olaf Wolkenhauer
- article
- 2024
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Teaching Models To Survive: Proper Scoring Rule and Stochastic Optimization with Competing Risks
- auteur
- Julie Alberge, Vincent Maladière, Olivier Grisel, Judith Abécassis, Gaël Varoquaux
- article
- 2024
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Retrieve, Merge, Predict: Augmenting Tables with Data Lakes (Experiment, Analysis & Benchmark Paper)
- auteur
- Riccardo Cappuzzo, Gaël Varoquaux, Aimee Coelho, Paolo Papotti
- article
- 2024
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Risk ratio, odds ratio, risk difference… Which causal measure is easier to generalize?
- auteur
- Bénédicte Colnet, Julie Josse, Gaël Varoquaux, Erwan Scornet
- article
- 2024
- Accès au bibtex
- titre
- Towards Efficient and Optimal Covariance-Adaptive Algorithms for Combinatorial Semi-Bandits
- auteur
- Julien Zhou, Pierre Gaillard, Thibaud Rahier, Houssam Zenati, Julyan Arbel
- article
- 2024
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2023
Journal articles
- titre
- Fast Prediction for Criminal Suspects through Neighbor Mutual Information-Based Latent Network
- auteur
- Jong Ho Jhee, Myung Jun Kim, Myeonggeon Park, Jeongheun Yeon, Hyunjung Shin
- article
- International Journal of Intelligent Systems, 2023, 2023, pp.1-12. ⟨10.1155/2023/9922162⟩
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- titre
- BOOM! Tephrochronological dataset and exploration tool of the Southern (33–46° S) and Austral (49–55° S) volcanic zones of the Andes
- auteur
- Consuelo Martínez Fontaine, Vanessa Peña-Araya, Chiara Marmo, Marine Le Morvan, Guillaume Delpech, Karen Fontijn, Giuseppe Siani, Lucile Cosyn-Wexsteen
- article
- Quaternary Science Reviews, 2023, 316, pp.108254. ⟨10.1016/j.quascirev.2023.108254⟩
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- titre
- Evolution of synchronous female bilateral breast cancers and response to treatment
- auteur
- Anne-Sophie Hamy, Judith Abécassis, Keltouma Driouch, Lauren Darrigues, Mathias Vandenbogaert, Cecile Laurent, Francois Zaccarini, Benjamin Sadacca, Myriam Delomenie, Enora Laas, Odette Mariani, Thanh Lam, Beatriz Grandal, Marick Laé, Ivan Bieche, Sophie Vacher, Jean-Yves Pierga, Etienne Brain, Celine Vallot, Judicael Hotton, Wilfrid Richer, Dario Rocha, Zakia Tariq, Veronique Becette, Didier Meseure, Laetitia Lesage, Anne Vincent-Salomon, Natalie Filmann, Jenny Furlanetto, Sibylle Loibl, Elise Dumas, Joshua Waterfall, Fabien Reyal
- article
- Nature Medicine, 2023, ⟨10.1038/s41591-023-02216-8⟩
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- titre
- Pore distances of particulate organic matter predict N 2 O emissions from intact soil at moist conditions
- auteur
- Patricia Ortega-Ramírez, Valérie Pot, Patricia Laville, Steffen Schlüter, David Arturo Amor-Quiroz, Dalila Hadjar, Arnaud Mazurier, Marine Lacoste, Chloé Caurel, Valérie Pouteau, Claire Chenu, Isabelle Basile-Doelsch, Catherine Henault, Patricia Garnier
- article
- Geoderma, 2023, 429, pp.art. 116224. ⟨10.1016/j.geoderma.2022.116224⟩
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- titre
- Energy-momentum tensor in the scalar diquark model
- auteur
- Arturo Amor-Quiroz, William Focillon, Cédric Lorcé, Simone Rodini
- article
- European Physical Journal C: Particles and Fields, 2023, 83 (11), pp.1012. ⟨10.1140/epjc/s10052-023-12190-7⟩
- Accès au bibtex
- titre
- Relational Data Embeddings for Feature Enrichment with Background Information
- auteur
- Alexis Cvetkov-Iliev, Alexandre Allauzen, Gaël Varoquaux
- article
- Machine Learning, 2023, 112 (2), pp.687-720. ⟨10.1007/s10994-022-06277-7⟩
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Conference papers
- titre
- The Locality and Symmetry of Positional Encodings
- auteur
- Lihu Chen, Gaël Varoquaux, Fabian M. Suchanek
- article
- EMNLP 2023 – Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing, Dec 2023, Singapore, Singapore
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Deep Knowledge Tracing is an implicit dynamic multidimensional item response theory model
- auteur
- Jill-Jênn Vie, Hisashi Kashima
- article
- ICCE 2023 – The 31st International Conference on Computers in Education, Asia-Pacific Society for Computers in Education, Dec 2023, Matsue, Shimane, Japan
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- False Discovery Proportion control for aggregated Knockoffs
- auteur
- Alexandre Blain, Bertrand Thirion, Olivier Grisel, Pierre Neuvial
- article
- NeurIPS 2023 – 37th Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2023, New Orleans, United States. ⟨10.48550/arXiv.2310.10373⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Towards Scalable Adaptive Learning with Graph Neural Networks and Reinforcement Learning
- auteur
- Jean Vassoyan, Jill-Jênn Vie, Pirmin Lemberger
- article
- EDM 2023 – 16th International Conference on Educational Data Mining, Jul 2023, Bangalore, India
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- GLADIS: A General and Large Acronym Disambiguation Benchmark
- auteur
- Lihu Chen, Gaël Varoquaux, Fabian M. Suchanek
- article
- EACL 2023 – The 17th Conference of the European Chapter of the Association for Computational Linguistics, May 2023, Dubrovnik, Croatia
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Beyond calibration: estimating the grouping loss of modern neural networks
- auteur
- Alexandre Perez-Lebel, Marine Le Morvan, Gaël Varoquaux
- article
- ICLR 2023 – The Eleventh International Conference on Learning Representations, May 2023, Kigali, Rwanda
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Book sections
- titre
- Evaluating machine learning models and their diagnostic value
- auteur
- Gaël Varoquaux, Olivier Colliot
- article
- Olivier Colliot. Machine Learning for Brain Disorders, Springer, 2023
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Reports
- titre
- Lessons from shortcomings in machine learning for medical imaging
- auteur
- Gaël Varoquaux, Veronika Cheplygina
- article
- OECD. 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
Theses
- titre
- Representations and inference from time-varying routine care data
- auteur
- Matthieu Doutreligne
- article
- Machine Learning [stat.ML]. Université Paris-Saclay, 2023. English. ⟨NNT : 2023UPASG073⟩
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- titre
- Embedding models for relational data analytics
- auteur
- Alexis Cvetkov-Iliev
- article
- Machine Learning [cs.LG]. Université Paris-Saclay, 2023. English. ⟨NNT : 2023UPASG004⟩
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Preprints, Working Papers, …
- titre
- Vectorizing string entries for data processing on tables: when are larger language models better?
- auteur
- Léo Grinsztajn, Myung Jun Kim, Edouard Oyallon, Gaël Varoquaux
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Understanding metric-related pitfalls in image analysis validation
- auteur
- Annika Reinke, Minu D. Tizabi, Michael Baumgartner, Matthias Eisenmann, Doreen Heckmann-Nötzel, A. Emre Kavur, Tim Rädsch, Carole H. Sudre, Laura Acion, Michela Antonelli, Tal Arbel, Spyridon Bakas, Arriel Benis, Matthew Blaschko, Florian Buettner, M. Jorge Cardoso, Veronika Cheplygina, Jianxu Chen, Evangelia Christodoulou, Beth A. Cimini, Gary S. Collins, Keyvan Farahani, Luciana Ferrer, Adrian Galdran, Bram van Ginneken, Ben Glocker, Patrick Godau, Robert Haase, Daniel A. Hashimoto, Michael M. Hoffman, Merel Huisman, Fabian Isensee, Pierre Jannin, Charles E. Kahn, Dagmar Kainmueller, Bernhard Kainz, Alexandros Karargyris, Alan Karthikesalingam, Hannes Kenngott, Jens Kleesiek, Florian Kofler, Thijs Kooi, Annette Kopp-Schneider, Michal Kozubek, Anna Kreshuk, Tahsin Kurc, Bennett A. Landman, Geert Litjens, Amin Madani, Klaus Maier-Hein, Anne L. Martel, Peter Mattson, Erik Meijering, Bjoern Menze, Karel G. M. Moons, Henning Müller, Brennan Nichyporuk, Felix Nickel, Jens Petersen, Susanne M. Rafelski, Nasir Rajpoot, Mauricio Reyes, Michael A. Riegler, Nicola Rieke, Julio Saez-Rodriguez, Clara I. Sánchez, Shravya Shetty, Ronald M. Summers, Abdel A. Taha, Aleksei Tiulpin, Sotirios A. Tsaftaris, Ben van Calster, Gaël Varoquaux, Ziv R. Yaniv, Paul F. Jäger, Lena Maier-Hein
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Causal thinking for decision making on Electronic Health Records: why and how
- auteur
- Matthieu Doutreligne, Tristan Struja, Judith Abecassis, Claire Morgand, Leo Anthony Celi, Gaël Varoquaux
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Confidence intervals for performance estimates in 3D medical image segmentation
- auteur
- Rosana El Jurdi, Gaël Varoquaux, Olivier Colliot
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- How to select predictive models for decision making or causal inference?
- auteur
- Matthieu Doutreligne, Gaël Varoquaux
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
2022
Journal articles
- titre
- Comprehensive decoding mental processes from Web repositories of functional brain images
- auteur
- Romuald Menuet, Raphael Meudec, Jérôme Dockès, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- Scientific Reports, 2022, 12 (7050), ⟨10.1038/s41598-022-10710-1⟩
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- titre
- Machine learning for medical imaging: methodological failures and recommendations for the future
- auteur
- Gaël Varoquaux, Veronika Cheplygina
- article
- npj Digital Medicine, 2022, 5 (1), pp.48. ⟨10.1038/s41746-022-00592-y⟩
- Accès au bibtex
- titre
- Body-weight variability and risk of cardiovascular outcomes in patients with type 1 diabetes: a retrospective observational analysis of data from the DCCT/EDIC population.
- auteur
- Iulia Petria, Samuel Albuquerque, Gaël Varoquaux, Jill-Jênn Vie, Nicolas Venteclef, Kamel Mohammedi, Ronan Roussel, Marion Camoin, Gianluca Perseghin, Gilberto Velho, Louis Potier
- article
- Cardiovascular Diabetology, 2022, 21 (1), pp.247. ⟨10.1186/s12933-022-01689-0⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Predicting future cognitive decline from non-brain and multimodal brain imaging data in healthy and pathological aging
- auteur
- Bruno Hebling Vieira, Franziskus Liem, Kamalaker Dadi, Denis Engemann, Alexandre Gramfort, Pierre Bellec, Richard Cameron Craddock, Jessica Damoiseaux, Christopher Steele, Tal Yarkoni, Nicolas Langer, Daniel Margulies, Gaël Varoquaux
- article
- Neurobiology of Aging, 2022, 118, pp.55-65. ⟨10.1016/j.neurobiolaging.2022.06.008⟩
- Accès au bibtex
- titre
- Causal effect on a target population: a sensitivity analysis to handle missing covariates
- auteur
- Bénédicte Colnet, Julie Josse, Gaël Varoquaux, Erwan Scornet
- article
- Journal of Causal Inference, 2022, 10 (1), pp.372-414. ⟨10.1515/jci-2021-0059⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- 424-P: Body-Weight Variability and Risk of Cardiovascular Outcomes in Type 1 Diabetes: Results from the DCCT/EDIC Studies
- auteur
- Iulia Petria, Samuel Albuquerque, Gaël Varoquaux, Jill-Jênn Vie, Gilberto Velho, Gianluca Perseghin, Ronan Roussel, Louis Potier
- article
- Diabetes, 2022, 71 (Supplement_1), ⟨10.2337/db22-424-P⟩
- Accès au bibtex
- titre
- Understanding Brain Network Dynamics in Autism Begs for Generalization
- auteur
- Yong Liu, Gaël Varoquaux
- article
- Biological Psychiatry, 2022, 91 (11), pp.916-917. ⟨10.1016/j.biopsych.2022.03.007⟩
- Accès au bibtex
- titre
- How to remove or control confounds in predictive models, with applications to brain biomarkers
- auteur
- Darya Chyzhyk, Gaël Varoquaux, Michael Milham, Bertrand Thirion
- article
- GigaScience, 2022, 11, ⟨10.1093/gigascience/giac014⟩
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- titre
- Multidimensional Item Response Theory in the Style of Collaborative Filtering
- auteur
- Yoav Bergner, Peter Halpin, Jill-Jênn Vie
- article
- Psychometrika, In press, 87 (1), pp.266-288. ⟨10.1007/s11336-021-09788-9⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Insights from an autism imaging biomarker challenge: promises and threats to biomarker discovery
- auteur
- Nicolas Traut, Katja Heuer, Guillaume Lemaître, Anita Beggiato, David Germanaud, Monique Elmaleh, Alban Bethegnies, Laurent Bonnasse-Gahot, Weidong Cai, Stanislas Chambon, Freddy Cliquet, Ayoub Ghriss, Nicolas Guigui, Amicie de Pierrefeu, Meng Wang, Valentina Zantedeschi, Alexandre Boucaud, Joris van Den Bossche, Balázs Kegl, Richard Delorme, Thomas Bourgeron, Roberto Toro, Gaël Varoquaux
- article
- NeuroImage, 2022, 255, pp.119171. ⟨10.1016/j.neuroimage.2022.119171⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Advancing brain network models to reconcile functional neuroimaging and clinical research
- auteur
- Xenia Kobeleva, Gaël Varoquaux, Alain Dagher, Mohit Adhikari, Christian Grefkes, Matthieu Gilson
- article
- Neuroimage-Clinical, 2022, 36, pp.103262. ⟨10.1016/j.nicl.2022.103262⟩
- Accès au bibtex
- titre
- Standardized Description of the Feature Extraction Process to Transform Raw Data Into Meaningful Information for Enhancing Data Reuse: Consensus Study
- auteur
- Antoine Lamer, Mathilde Fruchart, Nicolas Paris, Benjamin Popoff, Anaïs Payen, Thibaut Balcaen, William Gacquer, Guillaume Bouzillé, Marc Cuggia, Matthieu Doutreligne, Emmanuel Chazard
- article
- JMIR Medical Informatics, 2022, 10 (10), pp.e38936. ⟨10.2196/38936⟩
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- titre
- Analytics on Non-Normalized Data Sources: more Learning, rather than more Cleaning
- auteur
- Alexis Cvetkov-Iliev, Alexandre Allauzen, Gaël Varoquaux
- article
- IEEE Access, In press, 10, pp.42420-42431. ⟨10.1109/ACCESS.2022.3168013⟩
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Conference papers
- titre
- Variational Factorization Machines for Preference Elicitation in Large-Scale Recommender Systems
- auteur
- Jill-Jênn Vie, Tomas Rigaux, Hisashi Kashima
- article
- IEEE BigData 2022, Dec 2022, Osaka, Japan
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Why do tree-based models still outperform deep learning on typical tabular data?
- auteur
- Léo Grinsztajn, Edouard Oyallon, Gaël Varoquaux
- article
- 36th Conference on Neural Information Processing Systems (NeurIPS 2022) Track on Datasets and Benchmarks, Nov 2022, New Orleans, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Privacy-Preserving Synthetic Educational Data Generation
- auteur
- Jill-Jênn Vie, Tomas Rigaux, Sein Minn
- article
- EC-TEL 2022 – 17th European Conference on Technology Enhanced Learning, Sep 2022, Toulouse, France
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Imputing out-of-vocabulary embeddings with LOVE makes language models robust with little cost
- auteur
- Lihu Chen, Gaël Varoquaux, Fabian Suchanek
- article
- ACL 2022 – 60th Annual Meeting of the Association for Computational Linguistics, May 2022, Dublin, Ireland
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Interpretable Knowledge Tracing: Simple and Efficient Student Modeling with Causal Relations
- auteur
- Sein Minn, Jill-Jênn Vie, Koh Takeuchi, Hisashi Kashima, Feida Zhu
- article
- Proceedings of the AAAI Conference on Artificial Intelligence, Feb 2022, Vancouver, Canada. pp.12810-12818, ⟨10.1609/aaai.v36i11.21560⟩
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Preprints, Working Papers, …
- titre
- Reweighting the RCT for generalization: finite sample error and variable selection
- auteur
- Bénédicte Colnet, Julie Josse, Gaël Varoquaux, Erwan Scornet
- article
- 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
2021
Journal articles
- titre
- External validation of prognostic scores for COVID-19: a multicenter cohort study of patients hospitalized in Greater Paris University Hospitals
- auteur
- Yannis Lombardi, Loris Azoyan, Piotr Szychowiak, Ali Bellamine, Guillaume Lemaitre, Mélodie Bernaux, Christel Daniel, Judith Leblanc, Quentin Riller, Olivier Steichen, Pierre-Yves Ancel, Alain Bauchet, Nathanael Beeker, Vincent Benoit, Romain Bey, Aurélie Bourmaud, Stéphane Bréant, Anita Burgun, Fabrice Carrat, Charlotte Caucheteux, Julien Champ, Sylvie Cormont, Julien Dubiel, Catherine Duclos, Loic Esteve, Marie Frank, Nicolas Garcelon, Alexandre Gramfort, Nicolas Griffon, Olivier Grisel, Martin Guilbaud, Claire Hassen-Khodja, François Hemery, Martin Hilka, Anne Sophie Jannot, Jerome Lambert, Richard Layese, Léo Lebouter, Damien Leprovost, Ivan Lerner, Kankoe Levi Sallah, Aurélien Maire, Marie-France Mamzer, Patricia Martel, Arthur Mensch, Thomas Moreau, Antoine Neuraz, Nina Orlova, Nicolas Paris, Bastien Rance, Hélène Ravera, Antoine Rozes, Pierre Rufat, Elisa Salamanca, Arnaud Sandrin, Patricia Serre, Xavier Tannier, Jean-Marc Treluyer, Damien van Gysel, Gael Varoquaux, Jill-Jênn Vie, Maxime Wack, Perceval Wajsburt, Demian Wassermann, Eric Zapletal
- article
- Intensive Care Medicine, 2021, 47 (12), pp.1426-1439. ⟨10.1007/s00134-021-06524-w⟩
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Conference papers
- titre
- A lightweight neural model for biomedical entity linking
- auteur
- Lihu Chen, Gaël Varoquaux, Fabian Suchanek
- article
- AAAI 2021 – The Thirty-Fifth Conference on Artificial Intelligence, Association for the Advancement of Artificial Intelligence, Feb 2021, Palo Alto (virtual), United States. pp.12657-12665
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Proceedings
- titre
- Proceedings of the 14th International Conference on Educational Data Mining
- auteur
- I-Han Sharon Hsiao, Shaghayegh Sherry Sahebi, François Bouchet, Jill-Jênn Vie
- article
- 2021, 978-1-7336736-2-4
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2020
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Individual Brain Charting dataset extension, fourth release of high-resolution fMRI data for cognitive mapping
- auteur
- Juan Jesus Torre, Ana Luísa Pinho, Swetha Shankar, Alexis Amadon, Mani Saignavongs, Marcela Perrone-Bertolotti, Thomas Bazeille, Elvis Dohmatob, Isabelle Denghien, Chantal Ginisty, S Éverine Becuwe-Desmidt, Éverine Roger, Yann Lecomte, Valérie Berland, Laurence Laurier, Gaëlle Médiouni-Cloarec, Christine Doublé, Bernadette Martins, Jean- Philippe Lachaux, Patrick G Bissett, Ayse Zeynep Enkavi, Ian Eisenberg, Russell Poldrack, Roberta Santoro, Elia Formisano, Gaël Varoquaux, Stanislas Dehaene, Lucie Hertz-Pannier, Bertrand Thirion
- article
- 2020
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