Talks & Posters

Contents

Here are our posters and slides:

Neuro OpenScience Workshop 2023

Publications HAL de la structure visages;empenn

titre
Presentation of the project ‘Narps Open Pipeline
auteur
Jeremy Lefort-Besnard, Camille Maumet, Boris Clenet, Elodie Germani
article
2023 – Neuro Openscience Workshop, Paris Brain Institute, Nov 2023, Paris, France
identifiant
hal-04286609
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04286609/file/openneuro_22Nov23.pdf BibTex

MRI Together 2023

Publications HAL de la structure visages;empenn

titre
Towards reusable derived data in neuroimaging
auteur
Camille Maumet
article
MRI Together 2023 – Global workshop on open, reproducible, and inclusive MR research, Dec 2023, Online, Germany. pp.1-53, 2023
identifiant
hal-04328352
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04328352/file/Maumet_MRItogether2023_derived_data.pdf BibTex

Biogenouest days 2023

Publications HAL de la structure visages;empenn

titre
Deep Learning in Medical Imaging: What’s Needed for Training Data?
auteur
Francesca Galassi
article
Biogenouest days 2023, Oct 2023, Rennes (Campus Villejean), France
identifiant
hal-04247143
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04247143/file/BIOGEN_23_FG%2811%29.pdf BibTex

ECTRIMS 2023

Publications HAL de la structure visages;empenn

titre
Myelin dynamics in the spinal cord predict cord atrophy and disability progression at 5-years in early relapsing-remitting MS
auteur
Malo Gaubert, Benoit Combès, Elise Bannier, Arthur Masson, Vivien Caron, Gaëlle Baudron, Jean-Christophe Ferré, Emmanuelle Le Page, Laure Michel, Bruno Stankoff, Gilles Edan, Benedetta Bodini, Anne Kerbrat
article
ECTRIMS 2023 – 39th Congress of the European Committee for Treatment and Research in Multiple Sclerosis, Oct 2023, Milano, Italy. pp.1-2
identifiant
hal-04245831
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BibTex

CogBases 2023

Publications HAL de la structure visages;empenn

titre
Systematic review and evaluation of meta-analysis methods for same data meta-analyses
auteur
Jeremy Lefort-Besnard, Thomas E Nichols​, Camille Maumet
article
Cogbases-2023 – Workshop on open science methods for analyzing brain imaging data, Institut Pasteur, Paris; Parietal team, Inria, Paris Saclay, Oct 2023, Paris, France. pp.1-1
identifiant
inserm-04222730
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-04222730/file/cogbases23_abstract.pdf BibTex
titre
Towards reproducible neuroimaging across different analysis pipelines
auteur
Camille Maumet
article
CogBases 2023, Oct 2023, Paris, France. 2023
identifiant
hal-04236791
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04236791/file/Maumet_Cogbases_repro_neuroimaging.pdf BibTex

ESMRMB 2023

Publications HAL de la structure visages;empenn

titre
Open science practices for keeping inventions alive after project ends
auteur
Camille Maumet
article
ESMRMB 2023 – 39th Annual Scientific Meeting on European Society for Magnetic Resonance in Medicine and Biology, Oct 2023, Basel (CH), Switzerland. 2023
identifiant
hal-04236827
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04236827/file/Maumet_ESMRMB_keeping%20inventions%20alive%20after%20project%20ends.pdf BibTex

SFRMBM 2023

Publications HAL de la structure visages;empenn

titre
Étude de l’effet du bruit sur l’estimation de l’anisotropie microscopique en IRM de diffusion
auteur
Constance Bocquillon, Marc Lapert, Elise Bannier, Isabelle Corouge, Emmanuel Caruyer
article
SFRMBM 2023 – Sixième congrès de la Société Française de Résonance Magnétique en Biologie et Médecine, Mar 2023, Paris, France
identifiant
hal-04072656
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04072656/file/sfrmbm-2023.pdf https://inria.hal.science/hal-04072656/file/Bocquillon-Constance-Empenn.pdf BibTex
titre
Reproductibilité d’une tâche motrice en NIRS et comparaison à l’IRMf BOLD sur des sujets adultes sains
auteur
Nolwenn Jégou, Elise Bannier, Nora Erhart, Hector H Garcia, Emmanuel Caruyer, Isabelle Corouge
article
SFRMBM 2023 – 6ème Congrès Scientifique de la Société Française de Résonance Magnétique en Biologie et Médecine, Mar 2023, Paris, France. pp.1-1
identifiant
hal-04032802
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-04032802/file/NolwennJEGOU_sfrmbm2023.pdf BibTex
titre
Transfert d’aimantation (MTR) de l’ensemble de la moelle épinière chez des patients atteints de sclérose en plaques
auteur
Malo Gaubert, Elise Bannier, Raphaël Chouteau, Virginie Callot, Jean-Christophe Ferré, Guillaume Hamon, Anne Kerbrat, Benoit Combès
article
SFRMBM 2023 – 6ème Congrès de la Société Française de Résonance Magnétique en Biologie et Médecine, Mar 2023, Paris, France
identifiant
hal-04245913
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-04245913/file/gaubert_malo_empenn.pdf BibTex

OHBM 2023

Publications HAL de la structure visages;empenn

titre
Improving portability of bimodal neurofeedback: predicting NF-fMRI scores from EEG signals
auteur
Caroline Pinte, Claire Cury, Pierre Maurel
article
OHBM 2023 – Organization for Human Brain Mapping, Jul 2023, Montréal, Canada. pp.1-1
identifiant
hal-04168694
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04168694/file/pinte-caroline-empenn.pdf BibTex
titre
Exploring variability patterns in the task-fMRI analytical space
auteur
Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet
article
OHBM 2023 – 29th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jul 2023, Montreal, Canada
identifiant
hal-03991042
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03991042/file/abstract_OHBM.pdf BibTex

CBMS 2023

CBMS 2023 was held in L’Aquila, Italy, from 22-24 June 2023.

Publications HAL de la structure visages;empenn

titre
Expert Variability and Deep Learning Performance in Spinal Cord Lesion Segmentation for Multiple Sclerosis Patients
auteur
Ricky Walsh, Cédric Meurée, Anne Kerbrat, Arthur Masson, Burhan Rashid Hussein, Malo Gaubert, Francesca Galassi, Benoit Combés
article
CBMS 2023 – 36th IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS), Jun 2023, L’Aquila, Italy. pp.1-8, ⟨10.1109/CBMS58004.2023.00263⟩
identifiant
hal-04090598
DOI
DOI : 10.1109/CBMS58004.2023.00263
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04090598/file/IEEE_CBMS_Rater_Variability_Study_hal_2.pdf BibTex

IABM 2023

The first edition of the French conference on AI in biomedical imaging (“Colloque Français d’Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale”) was held in Paris, France in March 2023.

Publications HAL de la structure visages;empenn

titre
Representation learning for more reproducible fMRI data analyses
auteur
Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet
article
IABM 2023 – Colloque Français d’Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédical, Mar 2023, Paris, France. pp.1
identifiant
hal-04068797
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04068797/file/poster_elodiegermani.pdf BibTex
titre
Améliorer la portabilité du neurofeedback bimodal : prédire par apprentissage automatique les scores NF-IRMf à partir des signaux EEG
auteur
Caroline Pinte, Claire Cury, Pierre Maurel
article
IABM 2023 – Colloque Français d’Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale, Mar 2023, Paris, France. 2023
identifiant
hal-04040883
Accès au bibtex
BibTex
titre
A study on loss functions and decision thresholds for the segmentation of multiple sclerosis lesions on spinal cord MRI
auteur
Burhan Rashid Hussein, Cédric Meurée, Malo Gaubert, Arthur Masson, Anne Kerbrat, Benoît Combès, Francesca Galassi
article
IABM 2023 – Colloque Français d’Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale, Mar 2023, Paris, France
identifiant
hal-04092786
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04092786/file/Team-Empenn.pdf BibTex

ISBI 2023

ISBI 2023 was held in Cartagena de Indias, Colombia, April 18-21, 2023.

Publications HAL de la structure visages;empenn

titre
A study on loss functions and decision thresholds for the segmentation of multiple sclerosis lesions on spinal cord MRI
auteur
Burhan Rashid Hussein, Cédric Meurée, Malo Gaubert, Arthur Masson, Anne Kerbrat, Benoît Combès, Francesca Galassi
article
20th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2023), Apr 2023, Cartagena (Colombia), Colombia
identifiant
hal-03865212
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03865212/file/ISBI_Primus_10052023.pdf BibTex
titre
Different analysis pipelines, different results… How to deal with analytical variability?
auteur
Camille Maumet
article
20th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2023), Apr 2023, Cartagena (Colombia), Colombia
identifiant
hal-04073419
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04073419/file/ISBI%202023%20--%20analytical%20variability.pdf BibTex
titre
10 years of reproducibility in biomedical research: how can we achieve generalizability and fairness?
auteur
Adina Svenja Wagner, Camille Maumet, Melanie Ganz, Cassandra Gould van Praag
article
ISBI 2023 – 20th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2023, Cartagena de Indias, Colombia. , pp.3
identifiant
hal-04017085
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04017085/file/ISBI2023_special_session_reproducibility.pdf BibTex
titre
Introduction to the special session “10 years of reproducibility in biomedical research: how can we achieve generalizability and fairness?
auteur
Camille Maumet
article
ISBI 2023 – 20th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2023, Cartagenas de Indias, Colombia. pp.1-12
identifiant
hal-04073425
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04073425/file/ISBI%202023%20--%20intro.pdf BibTex
titre
Incomplete Hippocampal Inversion and hippocampal subfield volumes: Implementation and inter-reliability of automatic segmentation
auteur
Agustina Fragueiro, Giorgia Committeri, Claire Cury
article
ISBI 2023 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2023, Carthagène des Indes, Colombia. IEEE, pp.1, 2023
identifiant
inserm-04085099
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-04085099/file/poster_643_ISBI.pdf BibTex
titre
Pilot Study: eye-tracking and skin conductance to monitor task engagement during bimodal neurofeedback
auteur
Agustina Fragueiro, Renè-Paul Debroize, Antoine Coutrot, Elise Bannier, Claire Cury
article
ISBI 2023, Apr 2023, Carthagène des Indes, Colombia
identifiant
inserm-04107747
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-04107747/file/poster_953_isbi2023.pdf BibTex
titre
Incomplete Hippocampal Inversion and Hippocampal Subfield Volumes: Implementation and inter-reliability of automatic segmentation
auteur
Agustina Fragueiro, Giorgia Committeri, Claire Cury
article
ISBI 2023 – 20th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, IEEE Signal Processing Society and the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, Apr 2023, Carthagène des Indes, Colombia. pp.1-5, ⟨10.1109/ISBI53787.2023.10230555⟩
identifiant
inserm-04132185
DOI
DOI : 10.1109/ISBI53787.2023.10230555
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-04132185/file/ISBI_FRAGUEIROetal.pdf BibTex

IBIA 2023

Publications HAL de la structure visages;empenn

titre
Pre-post change in mental health and brain structure in pediatric mild traumatic brain injury
auteur
Fanny Dégeilh, Tilmann von Soest, Claire Cury, Lia Ferschmann, Christian K Tamnes
article
IBIA 2023 – 14th Biennial World Congress on Brain Injury, Mar 2023, Dublin, Ireland. pp.758-1040, ⟨10.1080/02699052.2023.2247822⟩
identifiant
hal-04174821
DOI
DOI : 10.1080/02699052.2023.2247822
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https://hal.science/hal-04174821/file/BainInjury2023.pdf BibTex

More talks and posters from previous years: 2022, 2021, 2020, 2019, 2018.

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