Publications

Publications HAL du labo/EPI parietal

2017

Journal articles

titre
A Bayesian Non-Parametric Hidden Markov Random Model for Hemodynamic Brain Parcellation
auteur
Mohanad Albughdadi, Lotfi Chaari, Jean-Yves Tourneret, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
article
Signal Processing, Elsevier, 2017, 135, pp.132-146. <10.1016/j.sigpro.2017.01.005>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01426385/file/albugdhadi_paper.pdf BibTex
titre
A Projection Method on Measures Sets
auteur
Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Jonas Kahn, Pierre Weiss
article
Constructive Approximation, Springer Verlag, 2017, 45 (1), pp.83 – 111. <10.1007/s00365-016-9346-2>
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https://hal.inria.fr/hal-01432720/file/Measure_Projection.pdf BibTex

Conference papers

titre
Hierarchical Region-Network Sparsity for High-Dimensional Inference in Brain Imaging
auteur
Danilo Bzdok, Michael Eickenberg, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
article
International conference on Information Processing in Medical Imaging (IPMI) 2017, Jun 2017, Boone, North Carolina, USA, France. 2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01480885/file/IPMI_2017_bzdok_camera.pdf BibTex
titre
Drum extraction in single channel audio signals using multi-layer non negative matrix factor deconvolution
auteur
Clément Laroche, Hélène Papadopoulos, Matthieu Kowalski, Gaël Richard
article
ICASSP, Mar 2017, Nouvelle Orleans, United States
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01438851/file/Template.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Stochastic Subsampling for Factorizing Huge Matrices
auteur
Arthur Mensch, Julien Mairal, Bertrand Thirion, Gael Varoquaux
article
2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01431618/file/neutral.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
On the generation of sampling schemes for Magnetic Resonance Imaging
auteur
Claire Boyer, Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Jonas Kahn, Pierre Weiss
article
SIAM Journal on Imaging Sciences, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2016, 9 (4), pp.2039-20972
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01373758/file/SIAM_JIS_sep2016_accepted_version.pdf BibTex
titre
Deriving reproducible biomarkers from multi-site resting-state data: An Autism-based example
auteur
Alexandre Abraham, Michael Milham, Adriana Di Martino, R. Cameron Craddock, Dimitris Samaras, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
article
NeuroImage, Elsevier, 2016, <10.1016/j.neuroimage.2016.10.045>
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https://hal.inria.fr/hal-01398867/file/neuroimage.pdf BibTex
titre
Exploring the anatomical encoding of voice with a mathematical model of the vocal system.
auteur
M Florencia Assaneo, Jacobo Sitt, Gaël Varoquaux, Mariano Sigman, Laurent Cohen, Marcos A Trevisan
article
NeuroImage, Elsevier, 2016, 141, pp.31-9. <10.1016/j.neuroimage.2016.07.033>
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BibTex
titre
Predicting brain-age from multimodal imaging data captures cognitive impairment
auteur
Franziskus Liem, Gaël Varoquaux, Jana Kynast, Frauke Beyer, Shahrzad Kharabian Masouleh, Julia M. Huntenburg, Leonie Lampe, Mehdi Rahim, Alexandre Abraham, R. Cameron Craddock, Steffi Riedel-Heller, Tobias Luck, Markus Loeffler, Matthias L. Schroeter, Anja Veronica Witte, Daniel S. Margulies
article
NeuroImage, Elsevier, 2016, <10.1016/j.neuroimage.2016.11.005>
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BibTex
titre
Transmodal Learning of Functional Networks for Alzheimer’s Disease Prediction
auteur
Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Claude Comtat, Gaël Varoquaux
article
IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing, IEEE, 2016, 10 (7), pp.1204 – 1213. <10.1109/JSTSP.2016.2600400>
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https://hal.inria.fr/hal-01353728/file/article.pdf BibTex
titre
Word meaning in the ventral visual path: a perceptual to conceptual gradient of semantic coding
auteur
Valentina Borghesani, Fabian Pedregosa, Marco Buiatti, Alexis Amadon, Evelyn Eger, Manuela Piazza
article
NeuroImage, Elsevier, 2016, <10.1016/j.neuroimage.2016.08.068>
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http://hal.upmc.fr/hal-01372551/file/Borghesani_Word_meaning_in_the.pdf BibTex
titre
Recursive nearest agglomeration (ReNA): fast clustering for approximation of structured signals
auteur
Andrés Hoyos-Idrobo, Gaël Varoquaux, Jonas Kahn, Bertrand Thirion
article
IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016
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https://hal.inria.fr/hal-01366651/file/paper.pdf BibTex
titre
Neuroimaging Research: From Null-Hypothesis Falsification to Out-of-sample Generalization
auteur
Danilo Bzdok, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
article
Educational and Psychological Measurement, SAGE Publications, 2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01338313/file/bzdok_NHST_versus_GI_accepted.pdf BibTex
titre
The brain imaging data structure, a format for organizing and describing outputs of neuroimaging experiments
auteur
Krzysztof Gorgolewski, Tibor Auer, Vince Calhoun, Cameron Craddock, Samir Das, Eugene Duff, Guillaume Flandin, Satrajit Ghosh, Tristan Glatard, Yaroslav Halchenko, Daniel Handwerker, Michael Hanke, David Keator, Xiangrui Li, Zachary Michael, Camille Maumet, Nolan Nichols, Thomas Nichols, John Pellman, Jean-Baptiste Poline, Ariel Rokem, Gunnar Schaefer, Vanessa Sochat, William Triplett, Jessica Turner, Gaël Varoquaux, Russell Poldrack
article
Scientific Data , Nature Publishing Group, 2016, 3, pp.160044. <10.1038/sdata.2016.44>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-01345616/file/sdata201644.pdf BibTex
titre
Formal Models of the Network Co-occurrence Underlying Mental Operations
auteur
Danilo Bzdok, Gaël Varoquaux, Olivier Grisel, Michael Eickenberg, Cyril Poupon, Bertrand Thirion
article
PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2016, <10.1371/journal.pcbi.1004994>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01338307/file/bzdok_pcompbiol_2016.PDF BibTex
titre
Left inferior parietal lobe engagement in social cognition and language
auteur
Danilo Bzdok, Gesa Hartwigsen, Andrew Reid, Angela R. Laird, Peter T. Fox, Simon Eickhoff
article
Neuroscience and Biobehavioral Reviews, Elsevier, 2016, <10.1016/j.neubiorev.2016.02.024>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01350512/file/bzdok_hartwigsen_2016_LTPJ.pdf BibTex
titre
Connectivity-Based Parcellation: Critique and Implications
auteur
Simon Eickhoff, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux, Danilo Bzdok
article
Human Brain Mapping, Wiley, 2016, pp.22. <10.1002/hbm.22933>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01184563/file/cbp_critique_subm.pdf BibTex
titre
A projection algorithm for gradient waveforms design in Magnetic Resonance Imaging
auteur
Nicolas Chauffert, Pierre Weiss, Jonas Kahn, Philippe Ciuciu
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, <10.1109/TMI.2016.2544251>
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https://hal.inria.fr/hal-01317939/file/paper_draft.pdf BibTex
titre
Seeing it all: Convolutional network layers map the function of the human visual system
auteur
Michael Eickenberg, Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
article
NeuroImage, Elsevier, 2016, <10.1016/j.neuroimage.2016.10.001>
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https://hal.inria.fr/hal-01389809/file/neuroimage.pdf BibTex
titre
Assessing and tuning brain decoders: cross-validation, caveats, and guidelines
auteur
Gaël Varoquaux, Pradeep Reddy Raamana, Denis Engemann, Andrés Hoyos-Idrobo, Yannick Schwartz, Bertrand Thirion
article
NeuroImage, Elsevier, 2016, <10.1016/j.neuroimage.2016.10.038>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01332785/file/paper.pdf BibTex

Conference papers

titre
Subsampled online matrix factorization with convergence guarantees
auteur
Arthur Mensch, Julien Mairal, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
article
NIPS Workshop on Optimization for Machine Learning, Dec 2016, Barcelone, Spain. 2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01405058/file/modl_opt.pdf BibTex
titre
Testing for Differences in Gaussian Graphical Models: Applications to Brain Connectivity
auteur
Eugene Belilovsky, Gaël Varoquaux, Matthew B. Blaschko
article
Neural Information Processing Systems (NIPS) 2016, Dec 2016, Barcelona, Spain. NIPS Proceedings
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https://hal.inria.fr/hal-01248844/file/main.pdf BibTex
titre
A simple algorithm for computing Nash-equilibria in incomplete information games
auteur
Elvis Dohmatob
article
OPT2016 — NIPS workshop on optimization for machine learning, Dec 2016, Barcelona, Spain. 2016, <http://opt-ml.org/>
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https://hal.inria.fr/hal-01384460/file/paper.pdf BibTex
titre
Learning brain regions via large-scale online structured sparse dictionary-learning
auteur
Elvis Dohmatob, Arthur Mensch, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
article
Neural Information Processing Systems (NIPS), Dec 2016, Barcelona, Spain. 2016
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https://hal.inria.fr/hal-01369134/file/nips%20%281%29.pdf BibTex
titre
Impact of perceptual learning on resting-state fMRI connectivity: A supervised classification study
auteur
Mehdi Rahim, Philippe Ciuciu, Salma Bougacha
article
Eusipco 2016, Aug 2016, Budapest, Hungary
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https://hal.inria.fr/hal-01355478/file/paper_ss.pdf BibTex
titre
Genre specific dictionaries for harmonic/percussive source separation
auteur
Clément Laroche, Hélène Papadopoulos, Matthieu Kowalski, Gaël Richard
article
ISMIR The 17th International Society for Music Information Retrieval Conference, Aug 2016, New York, United States
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01353252/file/ISMIR2016SPNMFGenreSpec.pdf BibTex
titre
Fast brain decoding with random sampling and random projections
auteur
Andrés Hoyos-Idrobo, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
article
PRNI 2016: the 6th International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging, Jun 2016, Trento, Italy
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https://hal.inria.fr/hal-01313814/file/paper.pdf BibTex
titre
Social-sparsity brain decoders: faster spatial sparsity
auteur
Gaël Varoquaux, Matthieu Kowalski, Bertrand Thirion
article
Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2016, Trento, Italy. 2016, <http://prni2016.wix.com/prni2016>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01334551/file/paper.pdf BibTex
titre
M/EEG source localization with multi-scale time-frequency dictionaries
auteur
Yousra Bekhti, Daniel Strohmeier, Mainak Jas, Roland Badeau, Alexandre Gramfort
article
6th International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging (PRNI), Jun 2016, Trento, Italy. 2016, <http://prni2016.wix.com/prni2016>. <10.1109/PRNI.2016.7552337>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01313567/file/PRNI16_multiscale.pdf BibTex
titre
Comparing functional connectivity based predictive models across datasets
auteur
Kamalaker Dadi, Alexandre Abraham, Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
article
PRNI 2016: 6th International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging, Jun 2016, Trento, Italy
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https://hal.inria.fr/hal-01319131/file/paper.pdf BibTex
titre
Dictionary Learning for Massive Matrix Factorization
auteur
Arthur Mensch, Julien Mairal, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
article
International Conference on Machine Learning, Jun 2016, New York, United States. JMLR Workshop and Conference Proceedings, 48, pp.1737-1746, 2016, Proceedings of the 33rd Internation Conference on Machine Learning. <http://jmlr.org/proceedings/papers/v48/mensch16.html>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01308934/file/icml.pdf BibTex
titre
Multi-subject joint parcellation detection estimation in functional MRI
auteur
Mohanad Albughdadi, Lotfi Chaari, Florence Forbes, Jean-Yves Tourneret, Philippe Ciuciu
article
13th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2016, Prague, Czech Republic. IEEE, 13th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, pp.74-77, 2016, <10.1109/ISBI.2016.7493214>
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https://hal.inria.fr/hal-01261982/file/ISBI_Mohanad_Albughdadi.pdf BibTex
titre
Multivariate Hurst Exponent Estimation in FMRI. Application to Brain Decoding of Perceptual Learning
auteur
Hubert Pellé, Philippe Ciuciu, Mehdi Rahim, Elvis Dohmatob, Patrice Abry, Virginie Van Wassenhove
article
13th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2016, Prague, Czech Republic. 2016
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https://hal.inria.fr/hal-01261976/file/ISBI_corr.pdf BibTex
titre
Compressed Online Dictionary Learning for Fast Resting-State fMRI Decomposition
auteur
Arthur Mensch, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
article
International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2016) “From Nano to Macro”, Apr 2016, Prague, Czech Republic. IEEE, pp.1282-1285, 2016, 13th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI). <http://ieeexplore.ieee.org/document/7493501/>. <10.1109/ISBI.2016.7493501>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01271033/file/article.pdf BibTex
titre
Local Q-Linear Convergence and Finite-time Active Set Identification of ADMM on a Class of Penalized Regression Problems
auteur
Elvis Dohmatob, Michael Eickenberg, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
article
ICASSP, International Conference on Acoustics, Speach, and Signal Processing, Mar 2016, http://icassp2016.org/default.asp, China. ICASSP, International Conference on Acoustics, Speach, and Signal Processing, ICASSP, International Conference on Acoustics, Speach, and Signal Processing
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01265372/file/paper.pdf BibTex

Book sections

titre
Functional Neuroimaging Group Studies
auteur
Bertrand Thirion
article
Hernando Ombao; Martin Lindquist; Wesley Thompson; John Aston. Handbook of Neuroimaging Data Analysis, Chapman & Hall / CRC, 2016, Handbook of Modern Statistical methods, 9781482220971
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https://hal.inria.fr/hal-01419347/file/paper.pdf BibTex

Poster communications

titre
Physically plausible K-space trajectories for Compressed Sensing in MRI: From simulations to real acquisitions
auteur
C Lazarus, N Chauffert, J Kahn, Pierre Weiss, A Vignaud, P Ciuciu
article
CEA Visiting committee on High Performance Computing, Mar 2016, Saclay, France. 2016
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https://hal.inria.fr/hal-01296496/file/Poster_VisitingCommittee_PhilippeCiuciu_CaroleLazarus.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
The Future of Data Analysis in the Neurosciences
auteur
Danilo Bzdok, B.T. Thomas Yeo
article
2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01356923/file/1608.03465v1.pdf BibTex
titre
Supplementary materials: Iterative Smoothing Proximal Gradient for Regression with Structured Sparsity
auteur
Fouad Hadj-Selem, Tommy Löfstedt, Elvis Dohmatob, Vincent Frouin, Mathieu Dubois, Vincent Guillemot, Edouard Duchesnay
article
2016
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-01324021/file/hal_ols_nestv_supp.pdf https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-01324021/file/figure_weights_map_cvcount.pdf https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-01324021/file/figure_algos-convergence_mri.pdf BibTex
titre
Learning to Discover Graphical Model Structures
auteur
Eugene Belilovsky, Kyle Kastner, Gaël Varoquaux, Matthew Blaschko
article
2016
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https://hal.inria.fr/hal-01306491/file/DataDrivenGraphDiscovery_NIPS.pdf BibTex
titre
A Unified Approach for Over and Under-Determined Blind Source Separation Based on Both Sparsity and Decorrelation
auteur
Fangchen Feng, Matthieu Kowalski
article
2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01297471/file/FK_unified.pdf BibTex
titre
Convex Optimization approach to signals with fast varying instantaneous frequency
auteur
Matthieu Kowalski, Adrien Meynard, Hau-Tieng Wu
article
2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01199615/file/TycoonACHARev1%20%281%29.pdf BibTex
titre
Functional connectivity outperforms scale-free brain dynamics as fMRI predictive feature of perceptual learning underwent in MEG
auteur
Mehdi Rahim, Philippe Ciuciu, Salma Bougacha
article
2016
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01297845/file/paper_ss.pdf BibTex
titre
Hemodynamic Brain Parcellation Using A Non-Parametric Bayesian Approach
auteur
Mohanad Albughdadi, Lotfi Chaari, Jean-Yves Tourneret, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
article
2016
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01275622/file/albugdhadi_paper.pdf BibTex
titre
Subject-level Joint Parcellation-Detection-Estimation in fMRI
auteur
Lotfi Chaari, Solveig Badillo, Thomas Vincent, Ghislaine Dehaene-Lambertz, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
article
2016
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01255465/file/JPDE_CHAARI_submitted06012016.pdf BibTex

2015

Journal articles

titre
Semi-Supervised Factored Logistic Regression for High-Dimensional Neuroimaging Data
auteur
Danilo Bzdok, Michael Eickenberg, Olivier Grisel, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
article
Neural Information Processing Systems, 2015
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01211248/file/paper.pdf BibTex
titre
Medial Prefrontal Aberrations in Major Depressive Disorder Revealed by Cytoarchitectonically Informed Voxel-Based Morphometry
auteur
Sebastian Bludau, Danilo Bzdok, Oliver Gruber, Nils Kohn, Valentin Riedl, Christian Sorg, Nicola Palomero-Gallagher, Mueller Veronika, Felix Hoffstaedter, Katrin Amunts, B Simon
article
American Journal of Psychiatry, American Psychiatric Publishing, 2015, <10.1176/appi.ajp.2015.15030349>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01236100/file/bludau_bzdok_AJP2015.pdf BibTex
titre
The Brainomics/Localizer database
auteur
Dimitri Papadopoulos Orfanos, Vincent Michel, Yannick Schwartz, Philippe Pinel, Antonio Moreno, Denis Le Bihan, Vincent Frouin
article
NeuroImage, Elsevier, 2015, Data Sharing, <10.1016/j.neuroimage.2015.09.052>
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-01213448/file/brainomics-localizer.pdf BibTex
titre
Convex relaxations of penalties for sparse correlated variables with bounded total variation
auteur
Eugene Belilovsky, Andreas Argyriou, Gaël Varoquaux, Matthew Blaschko
article
Machine Learning, Springer Verlag, 2015, pp.1-21. <10.1007/s10994-015-5511-2>
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https://hal.inria.fr/hal-01167861/file/ConvexECML2015.pdf BibTex
titre
NeuroVault.org: A repository for sharing unthresholded statistical maps, parcellations, and atlases of the human brain
auteur
Krzysztof Gorgolewski, Gael Varoquaux, Gabriel Rivera, Yannick Schwartz, Vanessa Sochat, Satrajit Ghosh, Camille Maumet, Thomas Nichols, Jean-Baptiste Poline, Tal Yarkoni, Daniel Margulies, Russell Poldrack
article
NeuroImage, Elsevier, 2015, 124 (Pt B), pp.1242-1244. <10.1016/j.neuroimage.2015.04.016>
Accès au texte intégral et bibtex
http://www.hal.inserm.fr/inserm-01148969/file/nihms769186.pdf BibTex
titre
NeuroVault.org: a web-based repository for collecting and sharing unthresholded statistical maps of the human brain
auteur
Krzysztof Gorgolewski, Gael Varoquaux, Gabriel Rivera, Yannick Schwarz, Satrajit Ghosh, Camille Maumet, Vanessa Sochat, Thomas Nichols, Russell Poldrack, Jean-Baptiste Poline, Tal Yarkoni, Daniel Margulies
article
Frontiers in Neuroinformatics, Frontiers, 2015, 9 (8), <10.3389/fninf.2015.00008>
Accès au texte intégral et bibtex
http://www.hal.inserm.fr/inserm-01134573/file/fninf-09-00008.pdf BibTex
titre
Data-driven HRF estimation for encoding and decoding models
auteur
Fabian Pedregosa, Michael Eickenberg, Philippe Ciuciu, Bertrand Thirion, Alexandre Gramfort
article
NeuroImage, Elsevier, 2015, pp.209–220
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00952554/file/paper.pdf BibTex
titre
Transport on Riemannian Manifold for Connectivity-based Brain Decoding
auteur
Bernard Ng, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Michael D Greicius, Bertrand Thirion
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2015, PP (99), pp.9. <http://ieeexplore.ieee.org/Xplore/home.jsp>. <10.1109/TMI.2015.2463723>
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https://hal.inria.fr/hal-01185200/file/final.pdf BibTex

Conference papers

titre
Integrating Multimodal Priors in Predictive Models for the Functional Characterization of Alzheimer’s Disease
auteur
Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Alexandre Abraham, Michael Eickenberg, Elvis Dohmatob, Claude Comtat, Gael Varoquaux
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2015, Munich, Germany
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01174636/file/paper983.pdf BibTex
titre
Total Variation meets Sparsity: statistical learning with segmenting penalties
auteur
Michael Eickenberg, Elvis Dohmatob, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
article
Medical Image Computing and Computer Aided Intervention (MICCAI), Oct 2015, München, Germany. 2015, Proceedings of MICCAI 2015. <www.miccai.org>
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01170619/file/paper.pdf BibTex
titre
Comparison of Stochastic and Variational Solutions to ASL fMRI Data Analysis
auteur
Aina Frau-Pascual, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
article
Nassir Navab; Joachim Hornegger; William M. Wells III; Alejandro F. Frangi. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2015, Oct 2015, Munich, Germany. Springer, Lecture Notes in Computer Science, 9349, pp.85-92, 2015, Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2015 – 18th International Conference Munich, Germany, October 5-9, 2015, Proceedings, Part I. <10.1007/978-3-319-24553-9_11>
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01249018/file/miccai15_af_ff_pc.pdf BibTex
titre
Vers une approche unifiée pour la séparation aveugle de sources en sur et sous-déterminé, basée sur la parcimonie et la décorrélation
auteur
Fangchen Feng, Matthieu Kowalski
article
Gretsi 2015, Sep 2015, Lyon, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01199645/file/FK_gretsi.pdf BibTex
titre
Problèmes inverses avec dictionnaires temps-fréquences en présence de bruit Gaussien non blanc
auteur
Matthieu Kowalski, Alexandre Gramfort
article
Gretsi 2015, Sep 2015, Lyon, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01199641/file/KG_gretsi.pdf BibTex
titre
Méthode Structurée de décomposition en matrices non- négatives appliquéè a la séparation de sources audio
auteur
Clément Laroche, Matthieu Kowalski, Helene Papadopoulos, Gaël Richard
article
Gretsi 2015, Sep 2015, Lyon, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01199648/file/Laroche_gretsi.pdf BibTex
titre
Méthode d’approximation variationnelle pour l’analyse de données d’IRM fonctionnelle acquise par Arterial Spin Labelling
auteur
Florence Forbes, Aina Frau-Pascual, Philippe Ciuciu
article
GRETSI, Sep 2015, Lyon, France. 2015
Accès au bibtex
BibTex
titre
FAASTA: A fast solver for total-variation regularization of ill-conditioned problems with application to brain imaging
auteur
Gaël Varoquaux, Michael Eickenberg, Elvis Dohmatob, Bertand Thirion
article
Colloque GRETSI, Sep 2015, Lyon, France. Gretsi, 2015, <http://www.gretsi.fr/colloque2015/myGretsi/programme.php>
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https://hal.inria.fr/hal-01247388/file/paper.pdf BibTex
titre
Sur la génération de schémas d’échantillonnage compressé en IRM
auteur
Pierre Weiss, Nicolas Chauffert, Claire Boyer, Jonas Kahn, Philippe Ciuciu
article
GRETSI, Sep 2015, Lyon, France. pp.4, 2015, 25 ème actes du colloque GRETSI
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https://hal.inria.fr/hal-01255325/file/GRETSI_weiss_2015.pdf BibTex
titre
Comment représenter une image avec un spaghetti ?
auteur
Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Jonas Kahn, Pierre Weiss
article
GRETSI, Sep 2015, Lyon, France. 2015, 25 ème actes du colloque GRETSI
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https://hal.inria.fr/hal-01255315/file/GRETSI_chauffert_2015.pdf BibTex
titre
La convergence de l’activité neurale vers des attracteurs multifractals localisés prédit la capacité d’apprentissage
auteur
Philippe Ciuciu, Nicolas Zilber, Patrice Abry, Virginie Van Wassenhove
article
GRETSI, Sep 2015, Lyon, France. 2015, 25 ème actes du colloque GRETSI
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https://hal.inria.fr/hal-01255289/file/ciuciu147_update.pdf BibTex
titre
An Unified Approach for Blind Source Separation Using Sparsity and Decorrelation
auteur
Fangchen Feng, Matthieu Kowalski
article
Eusipco 2015, Aug 2015, Nice, France. 2015
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01199620/file/FK_paper.pdf BibTex
titre
Inverse Problems with Time-frequency Dictionaries and non-white Gaussian Noise
auteur
Matthieu Kowalski, Alexandre Gramfort
article
Eusipco 2015, Aug 2015, Nice, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01199635/file/KG_eusipco.pdf BibTex
titre
Hybrid sparse and low-rank time-frequency signal decomposition
auteur
Cédric Févotte, Matthieu Kowalski
article
Eusipco 2015, Aug 2015, Nice, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01199622/file/eusipco2015.pdf BibTex
titre
A structured nonnegative matrix factorization for source separation
auteur
Clément Laroche, Matthieu Kowalski, Helene Papadopoulos, Gaël Richard
article
Eusipco 2015 – European Signal Processing Conference, Aug 2015, Nice, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01199631/file/EUSIPCO.pdf BibTex
titre
Fast clustering for scalable statistical analysis on structured images
auteur
Bertrand Thirion, Andrés Hoyos-Idrobo, Jonas Kahn, Gael Varoquaux
article
ICML Workshop on Statistics, Machine Learning and Neuroscience (Stamlins 2015), Jul 2015, Lille, France
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https://hal.inria.fr/hal-01229023/file/paper.pdf BibTex
titre
Correlations of correlations are not reliable statistics: implications for multivariate pattern analysis.
auteur
Bertrand Thirion, Fabian Pedregosa, Michael Eickenberg, Gaël Varoquaux
article
ICML Workshop on Statistics, Machine Learning and Neuroscience (Stamlins 2015), Jul 2015, Lille, France. 2015
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https://hal.inria.fr/hal-01187297/file/paper_stamlins.pdf BibTex
titre
Big data in practice: the example of nilearn for mining brain imaging data
auteur
Loïc Estève
article
Scipy 2015, Jul 2015, Austin, Texas, United States. Talk presented at Scipy 2015
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BibTex
titre
Bootstrapped Permutation Test for Multiresponse Inference on Brain Behavior Associations
auteur
Bernard Ng, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion, Michael Greicius
article
Sebastien Ourselin; Daniel C. Alexander; Carl-Fredrik Westin; M. Jorge Cardoso. Information Processing in Medical Imaging 2015, Jun 2015, Sabhal Mor Ostaig, Isle of Skye, United Kingdom. Springer, 9123, pp.12, 2015, Lecture Notes in Computer Science
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https://hal.inria.fr/hal-01185206/file/camReady.pdf BibTex
titre
Improving sparse recovery on structured images with bagged clustering
auteur
Andrés Hoyos-Idrobo, Yannick Schwartz, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
article
International Workshop On Pattern Recognition In Neuroimaging (PRNI), 2015, Jun 2015, Palo alto, United States
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01174335/file/paper.pdf BibTex
titre
Variational Physiologically Informed Solution to Hemodynamic and Perfusion Response Estimation from ASL fMRI Data
auteur
Aina Frau-Pascual, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
article
2015 International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2015, Stanford, CA, United States. IEEE, pp.57-60, 2015, 2015 International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Stanford, CA, USA, June 10-12, 2015. <10.1109/PRNI.2015.12>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01249015/file/prni15_af_ff_pc.pdf BibTex
titre
Speeding-up model-selection in GraphNet via early-stopping and univariate feature-screening
auteur
Elvis Dohmatob, Michael Eickenberg, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
article
PRNI, Jun 2015, Stanford, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01147731/file/paper.pdf BibTex
titre
Variable density sampling based on physically plausible gradient waveform. Application to 3D MRI angiography
auteur
Nicolas Chauffert, Pierre Weiss, Marianne Boucher, Sébastien Mériaux, Philippe Ciuciu
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, New-York, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01119578/file/Gradient_waveform_design_for%20VDS.pdf BibTex
titre
Physiological models comparison for the analysis of ASL FMRI data
auteur
Aina Frau-Pascual, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
article
12th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, ISBI 2015, Apr 2015, New York, United States. IEEE, pp.1348-1351, 2015, 12th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, ISBI 2015, Brooklyn, NY, USA, April 16-19, 2015. <10.1109/ISBI.2015.7164125>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01249014/file/14isbi_af_ff_pc.pdf BibTex

Book sections

titre
Joint Detection-Estimation in Functional MRI
auteur
Philippe Ciuciu, Florence Forbes, Thomas Vincent, Lotfi Chaari
article
Jean-François Giovannelli and Jérôme Idier. Regularization and Bayesian Methods for Inverse Problems in Signal and Image Processing, John Wiley and Sons, pp.169-200, 2015, 978-1-84821-637-2
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BibTex
titre
Statistical Computing on Non-Linear Spaces for Computational Anatomy
auteur
Xavier Pennec, Pierre Fillard
article
Paragios, Nikos and Duncan, Jim and Ayache, Nicholas. Handbook of Biomedical Imaging: Methodologies and Clinical Research, Springer, pp.147-168, 2015, 978-0-387-09748-0. <10.1007/978-0-387-09749-7_8>
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https://hal.inria.fr/inria-00616201/file/ComputationalAnatomy.pdf BibTex

Books

titre
Scipy Lecture Notes
auteur
Gaël Varoquaux, Emmanuelle Gouillart, Olav Vahtras, Valentin Haenel, Nicolas P. Rougier, Ralf Gommers, Fabian Pedregosa, Zbigniew Jędrzejewski-Szmek, Pauli Virtanen, Christophe Combelles, Didrik Pinte, Robert Cimrman, André Espaze, Adrien Chauve, Christopher Burns
article
Zenodo, 2015, <10.5281/zenodo.31736>. <http://www.scipy-lectures.org/>
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https://hal.inria.fr/hal-01206546/file/ScipyLectures-simple.pdf BibTex

Poster communications

titre
SpaceNet: Multivariate brain decoding and segmentation
auteur
Elvis Dohmatob, Michael Eickenberg, Bertrand Thirion, Gael Varoquaux
article
OHBM, Jun 2015, Honolulu, Hawaii, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01187230/file/ohbm_poster.pdf BibTex

Theses

titre
Learning functional brain atlases modeling inter-subject variability
auteur
Alexandre Abraham
article
Machine Learning [cs.LG]. Université Paris-Saclay, 2015. English. <NNT : 2015SACLS159>
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01331308/file/73089_ABRAHAM_2015_archivage.pdf BibTex
titre
Echantillonnage compressé le long de trajectoires physiquement plausibles en IRM
auteur
Nicolas Chauffert
article
Traitement du signal et de l’image. Université Paris Sud – Paris XI, 2015. Français. <NNT : 2015PA112234>
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01265504/file/VD2_CHAUFFERT_NICOLAS_28092015.pdf BibTex
titre
Échantillonnage compressé le long de trajectoires physiquement plausibles en IRM
auteur
Nicolas Chauffert
article
Traitement du signal et de l’image. université paris XI, 2015. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01235202/file/Manuscrit_Chauffert.pdf BibTex
titre
Evaluating Computational Models of Vision with Functional Magnetic Resonance Imaging
auteur
Michael Eickenberg
article
Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV]. Université Paris Sud – Paris XI, 2015. English. <NNT : 2015PA112206>
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01292787/file/VD2_EICKENBERG_MICHAEL_21092015.pdf BibTex
titre
Large-scale functional MRI analysis to accumulate knowledge on brain functions
auteur
Yannick Schwartz
article
Medical Imaging. Université Paris Sud – Paris XI, 2015. English. <NNT : 2015PA112056>
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01160550/file/VD2_SCHWARTZ_YANNICK_21042015.pdf BibTex
titre
Feature extraction and supervised learning on fMRI : from practice to theory
auteur
Fabian Pedregosa-Izquierdo
article
Medical Imaging. Université Pierre et Marie Curie – Paris VI, 2015. English. <NNT : 2015PA066015>
Accès au texte intégral et bibtex
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01100921/file/2015PA066015.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Hemodynamic-Informed Parcellation of fMRI Data in a Joint Detection Estimation Framework
auteur
Lotfi Chaari, Solveig Badillo, Thomas Vincent, Ghislaine Dehaene-Lambertz, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
article
Submitted to IEEE Transactions on Medical Imaging. 2015
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01228007/file/JPDE_CHAARI.pdf BibTex
titre
On the Consistency of Ordinal Regression Methods
auteur
Fabian Pedregosa, Francis Bach, Alexandre Gramfort
article
2015
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01054942/file/index.pdf BibTex
titre
In theory, You crack under pressure!
auteur
Elvis Dohmatob
article
2015
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01179903/file/1507.05194v2.pdf BibTex
titre
A projection method on measures sets
auteur
Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Jonas Kahn, Pierre Weiss
article
2015
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01133398/file/papier_projection.pdf BibTex
titre
A projection algorithm on measures sets
auteur
Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Jonas Kahn, Pierre Weiss
article
2015
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01188069/file/papier_projection.pdf BibTex

2014

Journal articles

titre
Identification of Mood-Relevant Brain Connections Using a Continuous, Subject-Driven Rumination Paradigm.
auteur
Anna-Clare Milazzo, Bernard Ng, Heidi Jiang, William Shirer, Gael Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion, Michael D Greicius
article
Cerebral Cortex, Oxford University Press (OUP), 2014, pp.12
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BibTex
titre
Interplay between functional connectivity and scale-free dynamics in intrinsic fMRI networks
auteur
Philippe Ciuciu, Patrice Abry, Biyu Jade He
article
NeuroImage, Elsevier, 2014, 95, pp.248 – 263. <10.1016/j.neuroimage.2014.03.047>
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https://hal.inria.fr/hal-01084242/file/manuscript%20%281%29.pdf BibTex
titre
Graph-based inter-subject pattern analysis of fMRI data
auteur
Sylvain Takerkart, Guillaume Auzias, Bertrand Thirion, Liva Ralaivola
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2014, 10.1371/journal.pone.0104586. <10.1371/journal.pone.0104586>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01027769/file/takerkart_plosone2014_gsvc_halversion.pdf BibTex
titre
Touchless User Interface for Intraoperative Image Control: Almost There
auteur
Antoine Iannessi, Pierre Yves Marcy, Olivier Clatz, Nicholas Ayache, Pierre Fillard
article
Radiographics, Radiological Society of North America (RSNA), 2014, 34 (4), <10.1148/rg.344135158>
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BibTex
titre
Interoperable atlases of the human brain
auteur
K Amunts, M.J. Hawrylycz, David C. Van Essen, Jd Van Horn., N Harel, Jean-Baptiste Poline, F De Martino, J. G. Bjaalie, Ghislaine Dehaene-Lambertz, S Dehaene, P Valdes-Sosa, Bertrand Thirion, K Zilles, S.L. Hill, M.B. Abrams, P.A. Tass, W Vanduffel, Alan Evans, S.B. Eickhoff
article
NeuroImage, Elsevier, 2014, 99 (1), pp.8. <10.1016/j.neuroimage.2014.06.010>
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https://hal.inria.fr/hal-01094749/file/Amunts14.pdf BibTex
titre
Supramodal processing optimizes visual perceptual learning and plasticity
auteur
Nicolas Zilber, Philippe Ciuciu, Alexandre Gramfort, Leila Azizi, Virginie Van Wassenhove
article
NeuroImage, Elsevier, 2014, 93, pp.32 – 46. <10.1016/j.neuroimage.2014.02.017>
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https://hal.inria.fr/hal-01084251/file/Zilber_etal_NIMG_final.pdf BibTex
titre
Which fMRI clustering gives good brain parcellations?
auteur
Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux, Elvis Dohmatob, Jean-Baptiste Poline
article
Frontiers in Neuroscience, Frontiers, 2014, 8 (167), pp.13. <http://journal.frontiersin.org/Journal/10.3389/fnins.2014.00167/pdf>. <10.3389/fnins.2014.00167>
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https://hal.inria.fr/hal-01015172/file/frontiers_paper.pdf BibTex
titre
Frontiers in Neuroinformatics Flexible multivariate hemodynamics fMRI data analyses and simulations with PyHRF
auteur
Thomas Vincent, Solveig Badillo, Laurent Risser, Lotfi Chaari, Christine Bakhous, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
article
Frontiers in Neuroscience, Frontiers, 2014, Brain Imaging methods (eCollection 2014), 8 (Article 67), pp.23. <10.3389/fnins.2014.00067>
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https://hal.inria.fr/hal-01084249/file/frontiersRevised.pdf BibTex
titre
Machine Learning Patterns for Neuroimaging-Genetic Studies in the Cloud
auteur
Benoit Da Mota, Radu Tudoran, Alexandru Costan, Gaël Varoquaux, Goetz Brasche, Patricia J. Conrod, Hervé Lemaitre, Tomáš Paus, Marcella Rietschel, Vincent Frouin, Jean-Baptiste Poline, Gabriel Antoniu, Bertrand Thirion
article
Frontiers in Neuroinformatics, Frontiers, 2014, Recent advances and the future generation of neuroinformatics infrastructure, 8, <10.3389/fninf.2014.00031>
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https://hal.inria.fr/hal-01057325/file/frontiers.pdf BibTex
titre
Probabilistic Atlas and Geometric Variability Estimation to Drive Tissue Segmentation
auteur
Hao Xu, Bertrand Thirion, Stéphanie Allassonnière
article
Statistics in Medicine, Wiley-Blackwell, 2014, 33 (20), pp.24. <http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/sim.6156/abstract>. <10.1002/sim.6156>
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01094739/file/simdoc.pdf BibTex
titre
Spatio-temporal wavelet regularization for parallel MRI reconstruction: application to functional MRI
auteur
Lotfi Chaari, Philippe Ciuciu, Sébastien Mériaux, Jean-Christophe Pesquet
article
Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology and Medicine, Springer Verlag, 2014, 27 (6), pp.41. <10.1007/s10334-014-0436-5>
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https://hal.inria.fr/hal-01084324/file/MAGMA_Chaari_v3.pdf BibTex
titre
Two Distinct Dynamic Modes Subtend the Detection of Unexpected Sounds
auteur
Jean-Rémi King, Alexandre Gramfort, Aaron Schurger, Lionel Naccache, Stanislas Dehaene
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2014, 9 (1), pp.e85791. <10.1371/journal.pone.0085791>
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http://hal.upmc.fr/hal-01365820/file/journal.pone.0085791.PDF BibTex
titre
Variable density sampling with continuous trajectories. Application to MRI.
auteur
Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Jonas Kahn, Pierre Weiss
article
SIAM Journal of Imaging Sciences, 2014, 7 (4), pp.1962-1992
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00908486/file/VDS_continuous_traj.pdf BibTex
titre
How machine learning is shaping cognitive neuroimaging
auteur
Gael Varoquaux, Bertrand Thirion
article
GigaScience, BioMed Central, 2014, 3, pp.28. <10.1186/2047-217X-3-28>
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01094737/file/paper.pdf BibTex

Conference papers

titre
Extracting Brain PET-MRI Joint Structures for Statistical Analysis
auteur
Mehdi Rahim
article
Séminaire imagerie TEP/IRM, Dec 2014, Lyon, France
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BibTex
titre
Physiologically Informed Bayesian Analysis of ASL fMRI Data
auteur
Aina Frau-Pascual, Thomas Vincent, Jennifer Sloboda, Philippe Ciuciu, Florence Forbes
article
M. Jorge Cardoso; Ivor Simpson; Tal Arbel; Doina Precup; Annemie Ribbens. BAMBI 2014 – First International Workshop on Bayesian and grAphical Models for Biomedical Imaging, Sep 2014, Boston, United States. Springer International Publishing, 8677, pp.37 – 48, 2014, Lecture Notes in Computer Science. <10.1007/978-3-319-12289-2_4>
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https://hal.inria.fr/hal-01100266/file/14bambi_af_tv_js_pc_ff.pdf BibTex
titre
Deriving a multi-subject functional-connectivity atlas to inform connectome estimation
auteur
Ronald Phlypo, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
article
Golland, Polina; Hata, Nobuhiko; Barillot, Christian; Hornegger, Joachim; Howe, Robert. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2014, Boston, United States. Springer International Publishing, 8675, pp.185-192, 2014, <10.1007/978-3-319-10443-0_24>
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https://hal.inria.fr/hal-00991124/file/paper1144.pdf BibTex
titre
Transport on Riemannian Manifold for Functional Connectivity-based Classification
auteur
Bernard Ng, Martin Dressler, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Michael Greicius, Bertrand Thirion
article
MICCAI – 17th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2014, Boston, United States. Springer, 2014
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01058521/file/camReady.pdf BibTex
titre
Principal Component Regression predicts functional responses across individuals
auteur
Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux, Olivier Grisel, Cyril Poupon, Philippe Pinel
article
MICCAI, Sep 2014, Boston, United States. Springer, 2014
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01015173/file/paper_869.pdf BibTex
titre
Physiologically informed Bayesian analysis of ASL fMRI data
auteur
Florence Forbes, Aina Frau-Pascual, Thomas Vincent, Jennifer Sloboda, Philippe Ciuciu
article
Statistical Challenges in Neuroscience workshop, Sep 2014, Warwick, United Kingdom
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BibTex
titre
Model Selection for Hemodynamic Brain Parcellation in fMRI
auteur
Mohanad Albughdadi, Lotfi Chaari, Florence Forbes, Jean-Yves Tourneret, Philippe Ciuciu
article
EUSIPCO – 22nd European Signal Processing Conference, Sep 2014, Lisbon, Portugal. IEEE, pp.31 – 35, 2014, <http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs_all.jsp?arnumber=6951965>
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BibTex
titre
Developing and using the Neuroimaging and Data Sharing Data Model: the NIDASH Working Group
auteur
David Keator, Satrajit Ghosh, Camille Maumet, Guillaume Flandin, B. Nolan Nichols, Thomas E. Nichols, Gully Burns, Ruediger Bruehl, Cameron Craddock, Blaise Frederick, Krysztof Gorgolewski, Daniel Marcus, Michael Hanke, Christian Haselgrove, Karl Helmer, Arno Klein, Michael Milham, Russel Poldrack, Franck Michel, Jason Steffener, Yannick Schwartz, Rich Stoner, Jessica Turner, David N. Kennedy, Jean-Baptiste Poline
article
20th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2014, Hamburg, Germany. 2014
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BibTex
titre
NeuroVault: a web repository for sharing statistical parametric maps
auteur
Krzysztof Gorgolewski, Tal Yarkoni, Satrajit Ghosh, Russel Poldrack, Jean-Baptiste Poline, Yannick Schwartz, Thomas Nichols, Camille Maumet, Daniel Margulies
article
20th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2014, Hamburg, Germany. 2014
Accès au texte intégral et bibtex
http://www.hal.inserm.fr/inserm-01134575/file/Gorgolewski%20et%20al.%20Poster.pdf BibTex
titre
A perceptual-to-conceptual gradient of word coding along the ventral path
auteur
Valentina Borghesani, Fabian Pedregosa, Evelyn Eger, Marco Buiatti, Manuela Piazza
article
Pattern Recognition in Neuroimaging, Jun 2014, Tubingen, Germany. IEEE, 2014
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00986606/file/PRNI2014_1_.pdf BibTex
titre
Decoding perceptual thresholds from MEG/EEG
auteur
Yousra Bekhti, Nicolas Zilber, Fabian Pedregosa, Philippe Ciuciu, Virginie Van Wassenhove, Alexandre Gramfort
article
Pattern Recoginition in Neuroimaging (PRNI) (2014), Jun 2014, Tubingen, Germany. p00, 2014
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032909/file/PID3197363.pdf BibTex
titre
Benchmarking solvers for TV-l1 least-squares and logistic regression in brain imaging
auteur
Elvis Dohmatob, Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
article
Pattern Recoginition in Neuroimaging (PRNI), Jun 2014, Tübingen, Germany. IEEE, 2014, <IEEE>
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00991743/file/PRNI2014_TVl1.pdf BibTex
titre
Hemodynamically informed parcellation of cerebral FMRI data
auteur
Aina Frau-Pascual, Thomas Vincent, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
article
ICASSP 2014 – 2014 IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing, May 2014, Florence, Italy. IEEE, pp.2079-2083, 2014, <10.1109/ICASSP.2014.6853965>
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01100186/file/icassp14_af_tv_ff_pc.pdf BibTex
titre
Automatic pathology classification using a single feature machine learning – support vector machines
auteur
Fernando Yepes, Fabian Pedregosa, Bertrand Thirion, Yalin Wang, Natasha Lepore
article
SPIE Medical Imaging 2014, Feb 2014, San Diego, United States. 9035 (1), pp.24, 2014, <10.1117/12.2043943>
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00975872/file/Spie2014_Extension.pdf BibTex

Book sections

titre
Shape Analysis for Brain Structures: A Review
auteur
Bernard Ng, Matthew Toews, Stanley Durrleman, Yonggang Shi
article
Li, Shuo and Tavares, João Manuel R. S. Shape Analysis in Medical Image Analysis, 14, Springer, 2014, Lecture Notes in Computational Vision and Biomechanics, 978-3-319-03813-1
Accès au bibtex
BibTex

Master thesis

titre
Unsupervised Clustering of Neural Pathways
auteur
Sergio Medina
article
Machine Learning [cs.LG]. 2014
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00908433/file/Master%20Thesis%20-%20Sergio%20MEDINA.pdf BibTex

Documents associated with scientific events

titre
Region segmentation for sparse decompositions: better brain parcellations from rest fMRI
auteur
Alexandre Abraham, Elvis Dohmatob, Bertrand Thirion, Dimitris Samaras, Gael Varoquaux
article
Sparsity Techniques in Medical Imaging, Sep 2014, Boston, United States. pp.8
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https://hal.inria.fr/hal-01093944/file/paper16.pdf BibTex

Theses

titre
Multi-modal registration of T1 brain image and geometric descriptors of white matter tracts
auteur
Viviana Siless
article
Medical Imaging. Université Paris Sud – Paris XI, 2014. English. <NNT : 2014PA112147>
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01144171/file/VD2_SILESS_VIVIANA_08072014.pdf BibTex
titre
ERF and scale-free analyses of source-reconstructed MEG brain signals during a multisensory learning paradigm
auteur
Nicolas Zilber
article
Other [cond-mat.other]. Université Paris Sud – Paris XI, 2014. English. <NNT : 2014PA112040>
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00984990/file/VA_ZILBER_NICOLAS_10032014.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Gradient waveform design for variable density sampling in Magnetic Resonance Imaging
auteur
Nicolas Chauffert, Pierre Weiss, Jonas Kahn, Philippe Ciuciu
article
2014
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https://hal.inria.fr/hal-01095320/file/curve_projectionv5.pdf BibTex

2013

Journal articles

titre
Machine Learning for Neuroimaging with Scikit-Learn
auteur
Alexandre Abraham, Fabian Pedregosa, Michael Eickenberg, Philippe Gervais, Andreas Muller, Jean Kossaifi, Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
article
Frontiers in Neuroscience, Frontiers, 2013, pp.15. <10.3389/fninf.2014.00014>
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https://hal.inria.fr/hal-01093971/file/frontiers.pdf BibTex
titre
Randomized parcellation based inference.
auteur
Benoit Da Mota, Virgile Fritsch, Gaël Varoquaux, Tobias Banaschewski, Gareth J. Barker, Arun L. W. Bokde, Uli Bromberg, Patricia J. Conrod, Jürgen Gallinat, Hugh Garavan, Jean-Luc Martinot, Frauke Nees, Tomáš Paus, Zdenka Pausova, Marcella Rietschel, Michael N. Smolka, Andreas Ströhle, Vincent Frouin, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
NeuroImage, Elsevier, 2013, epub ahead of print. <10.1016/j.neuroimage.2013.11.012>
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https://hal.inria.fr/hal-00915243/file/persistence.pdf https://hal.inria.fr/hal-00915243/file/supplementary_material1.pdf BibTex
titre
Toward global tractography.
auteur
Jean-François Mangin, Pierre Fillard, Yann Cointepas, Denis Le Bihan, Vincent Frouin, Cyril Poupon
article
NeuroImage, Elsevier, 2013, 80, pp.290-6. <10.1016/j.neuroimage.2013.04.009>
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titre
Oxytocin Receptor Genotype Modulates Ventral Striatal Activity to Social Cues and Response to Stressful Life Events.
auteur
Eva Loth, Jean-Baptiste Poline, Benjamin Thyreau, Tianye Jia, Chenyang Tao, Anbarasu Lourdusamy, David Stacey, Anna Cattrell, Sylvane Desrivières, Barbara Ruggeri, Virgile Fritsch, Tobias Banaschewski, Gareth J. Barker, Arun L. W. Bokde, Christian Büchel, Fabiana M. Carvalho, Patricia J. Conrod, Mira Fauth-Buehler, Herta Flor, Jürgen Gallinat, Hugh Garavan, Andreas Heinz, Ruediger Bruehl, Claire Lawrence, Karl Mann, Jean-Luc Martinot, Frauke Nees, Tomáš Paus, Zdenka Pausova, Luise Poustka, Marcella Rietschel, Michael N. Smolka, Maren Struve, Jianfeng Feng, Gunter Schumann
article
Biological Psychiatry, Elsevier, 2013, epub ahead of print. <10.1016/j.biopsych.2013.07.043>
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titre
Learning and comparing functional connectomes across subjects
auteur
Gaël Varoquaux, R. Cameron Craddock
article
NeuroImage, Elsevier, 2013, 80, pp.405-415. <10.1016/j.neuroimage.2013.04.007>
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https://hal.inria.fr/hal-00812911/file/paper.pdf BibTex
titre
Denoising and fast diffusion imaging with physically constrained sparse dictionary learning
auteur
Alexandre Gramfort, Cyril Poupon, Maxime Descoteaux
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2013, 18 (1), pp.36-49. <http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1361841513001205>. <10.1016/j.media.2013.08.006>
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https://hal.inria.fr/hal-00867372/file/mia_paper.pdf BibTex
titre
A framework for inter-subject prediction of functional connectivity from structural networks
auteur
Fani Deligianni, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, David Sharp, Christian Ledig, Robert Leech, Daniel Rueckert
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2013, epub ahead of print, <http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs_all.jsp?arnumber=6575192&tag=1>. <10.1109/TMI.2013.2276916>
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https://hal.inria.fr/hal-00852072/file/paper.pdf BibTex
titre
Spatial vs. Temporal Features in ICA of Resting-State fMRI – A Quantitative and Qualitative Investigation in the Context of Response Inhibition
auteur
Lixia Tian, Yazhuo Kong, Juejing Ren, Gaël Varoquaux, Yufeng Zang, Stephen Smith
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, <10.1371/journal.pone.0066572>
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BibTex
titre
Group-level impacts of within- and between-subject hemodynamic variability in fMRI
auteur
Solveig Badillo, Thomas Vincent, Philippe Ciuciu
article
NeuroImage, Elsevier, 2013, 82C, pp.433-448. <10.1016/j.neuroimage.2013.05.100>
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https://hal.inria.fr/hal-00854481/file/Article_JDEvsSPM_2013_REVISED_last.pdf BibTex
titre
A neural marker of perceptual consciousness in infants.
auteur
Sid Kouider, Carsten Stahlhut, Sofie V Gelskov, Leonardo S Barbosa, Michel Dutat, Vincent De Gardelle, Anne Christophe, Stanislas Dehaene, Ghislaine Dehaene-Lambertz
article
Science, American Association for the Advancement of Science, 2013, 340 (6130), pp.376-80
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BibTex
titre
Time-Frequency Mixed-Norm Estimates: Sparse M/EEG imaging with non-stationary source activations
auteur
Alexandre Gramfort, Daniel Strohmeier, Jens Haueisen, Matti Hämäläinen, Matthieu Kowalski
article
NeuroImage, Elsevier, 2013, 70, pp.410-422. <http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23291276>. <10.1016/j.neuroimage.2012.12.051>
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https://hal.inria.fr/hal-00773276/file/paper.pdf BibTex
titre
Publishing scientific software matters
auteur
Christophe Pradal, Gaël Varoquaux, Hans Peter Langtangen
article
Journal of Computational Science, Elsevier, 2013, 4 (5), pp.311 – 312. <10.1016/j.jocs.2013.08.001>
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https://hal.inria.fr/hal-00858663/file/paper.pdf BibTex
titre
Mapping Cortico-Striatal Connectivity onto the Cortical Surface: A New Tractography-Based Approach to Study Huntington Disease.
auteur
Linda Marrakchi-Kacem, Christine Delmaire, Pamela Guevara, Fabrice Poupon, Sophie Lecomte, Alan Tucholka, Pauline Roca, Jérôme Yelnik, Alexandra Durr, Jean-François Mangin, Cyril Poupon
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (2), pp.e53135. <10.1371/journal.pone.0053135>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00804579/file/journal.pone.0053135.pdf BibTex

Conference papers

titre
Mapping cognitive ontologies to and from the brain
auteur
Yannick Schwartz, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
article
NIPS (Neural Information Processing Systems), Dec 2013, United States. 2013
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00904763/file/paper.pdf BibTex
titre
API design for machine learning software: experiences from the scikit-learn project
auteur
Lars Buitinck, Gilles Louppe, Mathieu Blondel, Fabian Pedregosa, Andreas Mueller, Olivier Grisel, Vlad Niculae, Peter Prettenhofer, Alexandre Gramfort, Jaques Grobler, Robert Layton, Jake Vanderplas, Arnaud Joly, Brian Holt, Gaël Varoquaux
article
European Conference on Machine Learning and Principles and Practices of Knowledge Discovery in Databases, Sep 2013, Prague, Czech Republic. 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00856511/file/paper.pdf BibTex
titre
Bayesian Estimation of Probabilistic Atlas for Anatomically-Informed Functional MRI Group Analyses
auteur
Hao Xu, Bertrand Thirion, Stéphanie Allassonnière
article
Yoshinobu Sato and Christian Barillot and Nassir Navab. MICCAI – 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – 2013, Sep 2013, Nagoya, Japan. Springer, 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00853097/file/paper226.pdf BibTex
titre
Implications of Inconsistencies between fMRI and dMRI on Multimodal Connectivity Estimation
auteur
Bernard Ng, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
Yoshinobu Sato and Christian Barillot and Nassir Navab. MICCAI – 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – 2013, Sep 2013, Nagoya, Japan. Springer, 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00853108/file/camReady.pdf BibTex
titre
Unsupervised Fiber Bundles Registration using Weighted Measures Geometric Demons
auteur
Viviana Siless, Sergio Medina, Pierre Fillard, Bertrand Thirion
article
Workshop on Multi Modal Brain Image Analysis, Sep 2013, Nagoya, Japan. Springer Lecture Notes in Computer Science, 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00853582/file/GeometricMeassuresLogDemons.pdf BibTex
titre
Bayesian Joint Detection-Estimation of cerebral vasoreactivity from ASL fMRI data
auteur
Thomas Vincent, Jan Warnking, Marjorie Villien, Alexandre Krainik, Philippe Ciuciu, Florence Forbes
article
Mori, Kensaku and Sakuma, Ichiro and Sato, Yoshinobu and Barillot, Christian and Navab, Nassir. MICCAI 2013 – 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2013, Nagoya, Japan. Springer, 8150, pp.616-623, 2013, 16th International Conference, Nagoya, Japan, September 22-26, 2013, Proceedings, Part II; Lecture Notes in Computer Science. <10.1007/978-3-642-40763-5_76>
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https://hal.inria.fr/hal-00854437/file/paper826.pdf BibTex
titre
Extracting brain regions from rest fMRI with Total-Variation constrained dictionary learning
auteur
Alexandre Abraham, Elvis Dohmatob, Bertrand Thirion, Dimitris Samaras, Gaël Varoquaux
article
MICCAI – 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – 2013, Sep 2013, Nagoya, Japan. Springer, 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00853242/file/paper598.pdf BibTex
titre
Enhancing the Reproducibility of Group Analysis with Randomized Brain Parcellations
auteur
Benoit Da Mota, Virgile Fritsch, Gaël Varoquaux, Vincent Frouin, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
MICCAI – 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – 2013, Sep 2013, Nagoya, Japan. 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00832616/file/paper397.pdf BibTex
titre
A complex-valued majorize-minimize memory gradient method with application to parallel MRI
auteur
Anisia Florescu, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet, Philippe Ciuciu, Silviu Ciochina
article
21st European Signal Processing Conference (EUSIPCO 2013), Sep 2013, Marrakech, Morocco. pp.14283743.1-14283743.5, 2013
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BibTex
titre
From variable density sampling to continuous sampling using Markov chains
auteur
Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Pierre Weiss, Fabrice Gamboa
article
SampTA – 10th Conference International Conference on Sampling Theory and Applications, Jul 2013, Bremen, Germany. pp.200-203, 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00848286/file/markov_sampling_Sampta.pdf BibTex
titre
Travelling salesman-based variable density sampling
auteur
Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Jonas Kahn, Pierre Weiss
article
SampTA – 10th Conference International Conference on Sampling Theory and Applications, Jul 2013, Bremen, Germany. pp.509-512, 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00848290/file/TravellingSalesmanCompressiveSensing_Final.pdf BibTex
titre
Cohort-level brain mapping: learning cognitive atoms to single out specialized regions
auteur
Gaël Varoquaux, Yannick Schwartz, Philippe Pinel, Bertrand Thirion
article
William M. Wells and Sarang Joshi and Kilian M. Pohl. IPMI – Information Processing in Medical Imaging – 2013, Jun 2013, Asilomar, United States. Springer, 7917, pp.438-449, 2013, LNCS. <http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-642-38868-2_37>. <10.1007/978-3-642-38868-2_37>
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https://hal.inria.fr/hal-00841502/file/paper.pdf BibTex
titre
A Novel Sparse Group Gaussian Graphical Model for Functional Connectivity Estimation
auteur
Bernard Ng, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
Information Processing in Medical Imaging, Jun 2013, Asilomar, United States. 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00842607/file/camReadyA4.pdf BibTex
titre
Identifying predictive regions from fMRI with TV-L1 prior
auteur
Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
article
Pattern Recognition in Neuroimaging (PRNI), Jun 2013, Philadelphia, United States. IEEE, 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00839984/file/paper.pdf BibTex
titre
Hemodynamic estimation based on Consensus Clustering
auteur
Solveig Badillo, Gaël Varoquaux, Philippe Ciuciu
article
PRNI 2013 — 3rd International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2013, Philadelphia, United States. 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00854621/file/PRNI_badillo_varoquaux_ciuciu2013.pdf BibTex
titre
A Comparison of Metrics and Algorithms for Fiber Clustering
auteur
Viviana Siless, Sergio Medina, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
article
Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2013, Philadelphia, United States. 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00858115/file/FiberClusteringPRNI.pdf BibTex
titre
HRF estimation improves sensitivity of fMRI encoding and decoding models
auteur
Fabian Pedregosa, Michael Eickenberg, Bertrand Thirion, Alexandre Gramfort
article
3nd International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2013, Philadelphia, United States. 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00821946/file/paper.pdf BibTex
titre
Robust Group-Level Inference in Neuroimaging Genetic Studies
auteur
Virgile Fritsch, Benoit Da Mota, Gaël Varoquaux, Vincent Frouin, Eva Loth, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
Pattern Recognition in Neuroimaging, Jun 2013, Philadelphie, United States. 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00833953/file/rlm.pdf BibTex
titre
Second order scattering descriptors predict fMRI activity due to visual textures
auteur
Michael Eickenberg, Fabian Pedregosa, Senoussi Mehdi, Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion
article
PRNI 2013 – 3nd International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2013, Philadelphia, United States. Conference Publishing Services, 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00834928/file/prni_2013.pdf BibTex
titre
Asymmetry of the Superior Temporal Sulcus: a Robust Human Landmark
auteur
Francois Leroy, Stéphanie Bogart, William Hopkins, Olivier Coulon, Qing Cai, Roberto Toro, Jean-François Mangin, Ghislaine Dehaene-Lambertz
article
OHBM 2013 – International Conference on Human Brain Mapping, Jun 2013, Seattle, WA, USA, États-Unis. 2013
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BibTex
titre
Brainomics: A management system for exploring and merging heterogeneous brain mapping data
auteur
Vincent Michel, Yannick Schwartz, Philippe Pinel, Olivier Cayrol, Antonio Moreno, Jean-Baptiste Poline, Vincent Frouin, Dimitri Papadopoulos Orfanos
article
OHBM 2013 19th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2013, Seattle, United States
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-00904768/file/hbm2013_ter.pdf BibTex
titre
Analyse parcimonieuse des données d’IRM fonctionnelle dans un cadre bayésien variationnel
auteur
Christine Bakhous, Florence Forbes, Farida Enikeeva, Thomas Vincent, Michel Dojat, Philippe Ciuciu
article
45èmes Journées de Statistique, May 2013, Toulouse, France. 2013
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BibTex
titre
Bayesian BOLD and perfusion source separation and deconvolution from functional ASL imaging
auteur
Thomas Vincent, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
article
ICASSP 2013 – IEEE International Conference on Acoustics, Speech, and Signal Processing, May 2013, Vancouver, Canada. IEEE, pp.1003-1007, 2013, <10.1109/ICASSP.2013.6637800>
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https://hal.inria.fr/hal-00859373/file/vincent.pdf BibTex
titre
Variational Variable Selection To Assess Experimental Condition Relevance In Event-Related fMRI
auteur
Christine Bakhous, Florence Forbes, Thomas Vincent, Michel Dojat, Philippe Ciuciu
article
ISBI 2013 – 10th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San Francisco, United States. IEEE, pp.1508-1511, 2013, <10.1109/ISBI.2013.6556821>
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https://hal.inria.fr/hal-00859391/file/bakhous.pdf BibTex
titre
Multi-session extension of the joint-detection framework in fMRI
auteur
Solveig Badillo, Thomas Vincent, Philippe Ciuciu
article
ISBI 2013 – International Symposium on BIomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2013, San Fransisco, United States. IEEE, pp.1512-1515, 2013, <10.1109/ISBI.2013.6556822>
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https://hal.inria.fr/hal-00854624/file/isbi_final.pdf BibTex
titre
Learning-induced modulation of scale-free properties of brain activity measured with MEG
auteur
Nicolas Zilber, Philippe Ciuciu, Patrice Abry, Virginie Van Wassenhove
article
10th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.998-1001, 2013, <10.1109/ISBI.2013.6556645>
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https://hal.inria.fr/hal-00859389/file/isbi13_zilber.pdf BibTex
titre
Variable Density Compressed Sensing In MRI. Theoretical vs Heuristic Sampling Strategies
auteur
Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Pierre Weiss
article
ISBI – 10th International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San Francisco, United States. 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00848271/file/isbi.pdf BibTex
titre
L’évaluation automatique des déplacements et des déformations des organes pelviens est faisable et reproductible.
auteur
Silvia Cresti, E. Di Crocco, Mehdi Rahim, Diane Mege, Marc-Emmanuel Bellemare, Nicolas Pirro
article
36eme Congrès de la SIFUD-PP, 2013, Nice, France. 2013
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BibTex

Theses

titre
Etude de la variabilité hémodynamique chez l’enfant et l’adulte sains en IRMf
auteur
Solveig Badillo
article
Autre [cond-mat.other]. Université Paris Sud – Paris XI, 2013. Français. <NNT : 2013PA112279>
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01208140/file/VD2_BADILLO_SOLVEIG_18112013.pdf BibTex

2012

Journal articles

titre
An empirical comparison of surface-based and volume-based group studies in neuroimaging
auteur
Alan Tucholka, Virgile Fritsch, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
NeuroImage, Elsevier, 2012, 63 (3), pp.1443-53. <10.1016/j.neuroimage.2012.06.019>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00723437/file/surface_volume.pdf BibTex
titre
Hyperfrontality and hypoconnectivity during refreshing in schizophrenia.
auteur
Marie-Laure Grillon, Catherine Oppenheim, Gaël Varoquaux, Frédérique Charbonneau, Anne-Dominique Devauchelle, Marie-Odile Krebs, Franck Bayle, Bertrand Thirion, Caroline Huron
article
Psychiatry Research: Neuroimaging, Elsevier, 2012, 211 (3), pp.226-233. <10.1016/j.pscychresns.2012.09.001>
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https://hal.inria.fr/hal-00753225/file/Grillon_2012_preprint.pdf BibTex
titre
Significant correlation between a set of genetic polymorphisms and a functional brain network revealed by feature selection and sparse Partial Least Squares
auteur
Edith Le Floch, Vincent Guillemot, Vincent Frouin, Philippe Pinel, Christophe Lalanne, Laura Trinchera, Arthur Tenenhaus, Antonio Moreno, Monica Zilbovicius, Thomas Bourgeron, Stanislas Dehaene, Bertrand Thirion, Jean-Baptiste Poline, Edouard Duchesnay
article
NeuroImage, Elsevier, 2012, 63 (1), pp.11-24. <10.1016/j.neuroimage.2012.06.061>
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BibTex
titre
Multi-scale Mining of fMRI data with Hierarchical Structured Sparsity
auteur
Rodolphe Jenatton, Alexandre Gramfort, Vincent Michel, Guillaume Obozinski, Evelyn Eger, Francis Bach, Bertrand Thirion
article
SIAM Journal on Imaging Sciences, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2012, 5 (3), pp.835-856. <10.1137/110832380>
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https://hal.inria.fr/inria-00589785/file/sparse_hierarchical_fmri_mining_hal.pdf BibTex
titre
PyXNAT: XNAT in Python
auteur
Yannick Schwartz, Alexis Barbot, Benjamin Thyreau, Vincent Frouin, Gaël Varoquaux, Aditya Siram, Daniel Marcus, Jean-Baptiste Poline
article
Frontiers in Neuroinformatics, Frontiers, 2012, 6 (12), pp.1-14. <10.3389/fninf.2012.00012>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00782339/file/paper.pdf BibTex
titre
Detecting Outliers in High-Dimensional Neuroimaging Datasets with Robust Covariance Estimators
auteur
Virgile Fritsch, Gaël Varoquaux, Benjamin Thyreau, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2012, 16, pp.1359-1370. <10.1016/j.media.2012.05.002>
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https://hal.inria.fr/hal-00701225/file/media_outliers.pdf BibTex
titre
A-Brain: Using the Cloud to Understand the Impact of Genetic Variability on the Brain
auteur
Gabriel Antoniu, Alexandru Costan, Benoit Da Mota, Bertrand Thirion, Radu Tudoran
article
ERCIM News, ERCIM, 2012, pp.21-22
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BibTex
titre
Mixed-norm estimates for the M/EEG inverse problem using accelerated gradient methods
auteur
Alexandre Gramfort, Matthieu Kowalski, Matti Hämäläinen
article
Physics in Medicine and Biology, IOP Publishing, 2012, 57 (7), pp.1937-1961. <10.1088/0031-9155/57/7/1937>
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https://hal.inria.fr/hal-00690774/file/GKH_PMB.pdf BibTex
titre
Automatic fiber bundle segmentation in massive tractography datasets using a multi-subject bundle atlas.
auteur
P. Guevara, D. Duclap, C. Poupon, L. Marrakchi-Kacem, P. Fillard, D. Lebihan, M. Leboyer, J. Houenou, J.-F. Mangin
article
NeuroImage, Elsevier, 2012, epub ahead of print. <10.1016/j.neuroimage.2012.02.071>
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BibTex
titre
Markov models for fMRI correlation structure: is brain functional connectivity small world, or decomposable into networks?
auteur
Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
Journal of Physiology – Paris, Elsevier, 2012, 106, pp.212-221. <10.1016/j.jphysparis.2012.01.001>
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https://hal.inria.fr/hal-00665340/file/paper.pdf BibTex
titre
Changing computational research. The challenges ahead.
auteur
Cameron Neylon, Jan Aerts, C Titus Brown, Simon J Coles, Les Hatton, Daniel Lemire, K Jarrod Millman, Peter Murray-Rust, Fernando Perez, Neil Saunders, Nigam Shah, Arfon Smith, Gaël Varoquaux, Egon Willighagen
article
Source Code for Biology and Medicine, BioMed Central, 2012, 7 (2), pp.2. <10.1186/1751-0473-7-2>
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titre
In Situ Synchrotron Microtomography Reveals Multiple Reaction Pathways During Soda-Lime Glass Synthesis
auteur
Emmanuelle Gouillart, Michael-J. Toplis, Julien Grynberg, Marie-Hélène Chopinet, Elin Sondergard, Luc Salvo, Michel Suéry, Marco Di Michiel, Gaël Varoquaux
article
Journal of the American Ceramic Society, Wiley, 2012, 95 (5), pp.1504-1507. <10.1111/j.1551-2916.2012.05151.x>
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Conference papers

titre
Hemodynamic-informed parcellation of fMRI data in a Joint Detection Estimation framework
auteur
Lotfi Chaari, Florence Forbes, Thomas Vincent, Philippe Ciuciu
article
Nicholas Ayache and Hervé Delingette and Polina Golland and Kensaku Mori. MICCAI 2012 – 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. Springer, 7512, pp.180-188, 2012, Lecture Notes in Computer Science; Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2012. <10.1007/978-3-642-33454-2_23>
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https://hal.inria.fr/hal-00859388/file/MICCAI_CHAARI_final.pdf BibTex
titre
Joint T1 and Brain Fiber Log-Demons Registration Using Currents to Model Geometry
auteur
Viviana Siless, Joan Glaunès, Pamela Guevara, Jean-François Mangin, Cyril Poupon, Denis Le Bihan, Bertrand Thirion, Pierre Fillard
article
MICCAI, Oct 2012, Nice, France, France. 2012
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https://hal.inria.fr/hal-00723367/file/75110057.pdf BibTex
titre
Sparse DSI: Learning DSI structure for denoising and fast imaging
auteur
Alexandre Gramfort, Poupon Cyril, Maxime Descoteaux
article
MICCAI, Oct 2012, Nice, France. Springer, 2012
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titre
A Novel Sparse Graphical Approach for Multimodal Brain Connectivity Inference
auteur
Bernard Ng, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. 2012
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https://hal.inria.fr/hal-00741631/file/camReady.pdf BibTex
titre
Non-parametric Density Modeling and Outlier Detection in Medical Imaging Datasets
auteur
Virgile Fritsch, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
Fei Wang and Dinggang Shen and Pingkun Yan and Kenji Suzuki. Machine Learning in Medical Imaging – Miccai 2012 workshop, Oct 2012, Nice, France. pp.207-214, 2012
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https://hal.inria.fr/hal-00738438/file/camera_ready.pdf BibTex
titre
Learning to rank from medical imaging data
auteur
Fabian Pedregosa, Elodie Cauvet, Gaël Varoquaux, Christophe Pallier, Bertrand Thirion, Alexandre Gramfort
article
Third International Workshop on Machine Learning in Medical Imaging – MLMI 2012, Oct 2012, Nice, France. 2012
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https://hal.inria.fr/hal-00717990/file/paper.pdf BibTex
titre
Improving accuracy and power with transfer learning using a meta-analytic database
auteur
Yannick Schwartz, Gaël Varoquaux, Christophe Pallier, Philippe Pinel, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
MICCAI, Oct 2012, Nice, France. pp.1-8, 2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00734911/file/paper.pdf BibTex
titre
Graph-based inter-subject classification of local fMRI patterns
auteur
Sylvain Takerkart, Guillaume Auzias, Bertrand Thirion, Daniele Schön, Liva Ralaivola
article
Third International Workshop Machine Learning in Medical Imaging – MLMI 2012 (Held in Conjunction with MICCAI 2012), Oct 2012, Nice, France. Springer Berlin Heidelberg, 7588 (0302-9743), pp 184-192, 2012, Lecture Notes in Computer Science. <10.1007/978-3-642-35428-1_23>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00818815/file/mlmi2012_takerkart_camera_ready.pdf BibTex
titre
A MapReduce Approach for Ridge Regression in Neuroimaging-Genetic Studies
auteur
Benoit Da Mota, Michael Eickenberg, Soizic Laguitton, Vincent Frouin, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
DCICTIA-MICCAI – Data- and Compute-Intensive Clinical and Translational Imaging Applications in conjonction with the 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – 2012, Oct 2012, Nice, France. 2012
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https://hal.inria.fr/hal-00730385/file/article.pdf BibTex
titre
Robust voxel-wise Joint Detection Estimation of Brain Activity in fMRI
auteur
Lotfi Chaari, Florence Forbes, Thomas Vincent, Philippe Ciuciu
article
ICIP 2012 – 19th IEEE International Conference on Image Processing, Sep 2012, Orlando, United States. IEEE, pp.1273-1276, 2012, <10.1109/ICIP.2012.6467099>
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https://hal.inria.fr/hal-00859386/file/ICIP12_revised.pdf BibTex
titre
A fast computational framework for genome-wide association studies with neuroimaging data
auteur
Benoit Da Mota, Vincent Frouin, Edouard Duchesnay, Soizic Laguitton, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
20th International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT 2012), Aug 2012, Limassol, Cyprus. 2012
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https://hal.inria.fr/hal-00720265/file/article.pdf BibTex
titre
Connectivity-informed Sparse Classifiers for fMRI Brain Decoding
auteur
Bernard Ng, Viviana Siless, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion, Rafeef Abugharbieh
article
Pattern Recognition in Neuroimaging, Jul 2012, London, United Kingdom. 2012
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https://hal.inria.fr/hal-00726656/file/connClassifierPRNI2012.pdf BibTex
titre
Multilayer Scattering Image Analysis Fits fMRI Activity in Visual Areas
auteur
Michael Eickenberg, Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion
article
International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jul 2012, London, United Kingdom. 2012
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https://hal.inria.fr/hal-00704528/file/example_paper.pdf BibTex
titre
Improved brain pattern recovery through ranking approaches
auteur
Fabian Pedregosa, Elodie Cauvet, Gaël Varoquaux, Christophe Pallier, Bertrand Thirion, Alexandre Gramfort
article
PRNI 2012 : 2nd International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jul 2012, London, United Kingdom. 2012
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https://hal.inria.fr/hal-00717954/file/paper.pdf BibTex
titre
On spatial selectivity and prediction across conditions with fMRI
auteur
Yannick Schwartz, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
article
PRNI 2012 : 2nd International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jul 2012, London, United Kingdom. pp.53-56, 2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00728765/file/paper.pdf BibTex
titre
Decoding Visual Percepts Induced by Word Reading with fMRI
auteur
Alexandre Gramfort, Christophe Pallier, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
article
Pattern Recognition in NeuroImaging (PRNI), 2012 International Workshop on, Jul 2012, Londres, United Kingdom. pp.13-16, 2012, <http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs_all.jsp?arnumber=6295916&tag=1>. <10.1109/PRNI.2012.20>
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https://hal.inria.fr/hal-00730768/file/paper.pdf BibTex
titre
Small-sample brain mapping: sparse recovery on spatially correlated designs with randomization and clustering
auteur
Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion
article
John, Langford and Joelle, Pineau. International Conference on Machine Learning, Jun 2012, Edimbourg, United Kingdom. 2012
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https://hal.inria.fr/hal-00705192/file/paper.pdf BibTex
titre
Template-Based Tractography for Clinical Neonatal Diffusion Imaging Data
auteur
Natasha Lepore, Fernando Yepes, Yi Lao, Ashok Panigraphy, Rafael Cheschin, Subhashree Ravichandran, Marvin D. Nelson, Pierre Fillard
article
Template-Based Tractography for Clinical Neonatal Diffusion Imaging Data, Feb 2012, San Francisco CA, United States. 2012
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https://hal.inria.fr/hal-00675337/file/spieProceedings.pdf BibTex

Poster communications

titre
Joint T1 and brain fiber diffeomorphic registration using the demons
auteur
Viviana Siless, Pamela Guevara, Xavier Pennec, Bertrand Thirion, Pierre Fillard
article
Organization for the Human Brain Mapping, Jun 2012, Beijing, China
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https://hal.inria.fr/hal-00828387/file/ohbm2012.pdf BibTex

Documents associated with scientific events

titre
The adjoint method of OpenMEEG for EEG and MEG with large source space
auteur
Emmanuel Olivi, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc
article
Proceedings of Biomag, 2012, Paris, France. 2012
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2011

Journal articles

titre
Scikit-learn: Machine Learning in Python
auteur
Fabian Pedregosa, Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Vincent Michel, Bertrand Thirion, Olivier Grisel, Mathieu Blondel, Peter Prettenhofer, Ron Weiss, Vincent Dubourg, Jake Vanderplas, Alexandre Passos, David Cournapeau, Matthieu Brucher, Matthieu Perrot, Édouard Duchesnay
article
Journal of Machine Learning Research, Journal of Machine Learning Research, 2011
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https://hal.inria.fr/hal-00650905/file/pedregosa11a.pdf BibTex
titre
Quantitative evaluation of 10 tractography algorithms on a realistic diffusion MR phantom.
auteur
Pierre Fillard, Maxime Descoteaux, Alvina Goh, Sylvain Gouttard, Ben Jeurissen, James Malcolm, Alonso Ramirez-Manzanares, Marco Reisert, Ken Sakaie, Fatima Tensaouti, Ting Yo, Jean-François Mangin, Cyril Poupon
article
NeuroImage, Elsevier, 2011, 56 (1), pp.220-34. <10.1016/j.neuroimage.2011.01.032>
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https://hal.inria.fr/inria-00559191/file/nifibercup_final.pdf BibTex
titre
A supervised clustering approach for fMRI-based inference of brain states
auteur
Vincent Michel, Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Evelyn Eger, Christine Keribin, Bertrand Thirion
article
Pattern Recognition, Elsevier, 2011, epub ahead of print. <10.1016/j.patcog.2011.04.006>
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https://hal.inria.fr/inria-00589201/file/supervised_clustering_vm_review.pdf BibTex
titre
Multiclass Sparse Bayesian Regression for fMRI-Based Prediction
auteur
Vincent Michel, Evelyn Eger, Christine Keribin, Bertrand Thirion
article
International Journal of Biomedical Imaging, Hindawi Publishing Corporation, 2011, 2011, <10.1155/2011/350838>
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https://hal.inria.fr/inria-00609365/file/vm_mlmi_mcbr.pdf BibTex
titre
Registration, atlas estimation and variability analysis of white matter fiber bundles modeled as currents.
auteur
Stanley Durrleman, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
article
NeuroImage, Elsevier, 2011, 55 (3), pp.1073-90. <10.1016/j.neuroimage.2010.11.056>
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titre
The NumPy array: a structure for efficient numerical computation
auteur
Stefan Van Der Walt, S. Chris Colbert, Gaël Varoquaux
article
Computing in Science and Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 13 (2), pp.22-30. <10.1109/MCSE.2011.37>
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https://hal.inria.fr/inria-00564007/file/numpy_final.pdf BibTex
titre
Total variation regularization for fMRI-based prediction of behaviour.
auteur
Vincent Michel, Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Evelyn Eger, Bertrand Thirion
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 30 (7), pp.1328 – 1340. <10.1109/TMI.2011.2113378>
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https://hal.inria.fr/inria-00563468/file/arxiv_version.pdf BibTex
titre
Mayavi: 3D visualization of scientific data
auteur
Prabhu Ramachandran, Gaël Varoquaux
article
COMPUTING IN SCIENCE & ENGINEERING, IEEE, 2011, 13 (2), pp.40-51. <10.1109/MCSE.2011.35>
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https://hal.inria.fr/inria-00528985/file/article_submitted.pdf BibTex
titre
DTI registration in atlas based fiber analysis of infantile Krabbe disease.
auteur
Yi Wang, Aditya Gupta, Zhexing Liu, Hui Zhang, Maria L Escolar, John H Gilmore, Sylvain Gouttard, Pierre Fillard, Eric Maltbie, Guido Gerig, Martin Styner
article
NeuroImage, Elsevier, 2011, epub ahead of print. <10.1016/j.neuroimage.2011.01.038>
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titre
Voxelwise multivariate statistics and brain-wide machine learning using the full diffusion tensor.
auteur
Anne-Laure Fouque, Pierre Fillard, Anne Bargiacchi, Arnaud Cachia, Monica Zilbovicius, Benjamin Thyreau, Edith Le Floch, Philippe Ciuciu, Edouard Duchesnay
article
Med Image Comput Comput Assist Interv, Springer, 2011, 14 (Pt 2), pp.9-16
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titre
Forward Field Computation with OpenMEEG.
auteur
Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc
article
Computational Intelligence and Neuroscience, Hindawi Publishing Corporation, 2011, 2011, pp.923703. <10.1155/2011/923703>
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Conference papers

titre
A Comparative Study of Algorithms for Intra- and Inter-subjects fMRI Decoding
auteur
Vincent Michel, Alexandre Gramfort, Evelyn Eger, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
article
Georg Langs, Irina Rish, Moritz Grosse-Wentrup, Brain Murphy. MLINI – Machine Learning and Interpretation in Neuroimaging – 2011, Dec 2011, Sierra Nevada, Spain. Springer, pp.1-8, 2012, Lecture Notes in Computer Science. <10.1007/978-3-642-34713-9_1>
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https://hal.inria.fr/hal-00753142/file/michel_mlini_2011.pdf BibTex
titre
Statistical Learning for Resting-State fMRI: Successes and Challenges
auteur
Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
article
Gearg Langs, Irina Rish, Moritz Grosse-Wentrup, Brain Murphy. Machine Learning and Interpretation in Neuroimaging, NIPS workshop, Dec 2011, Sierra Nevada, Spain. Springer, pp.172-177, 2012, <10.1007/978-3-642-34713-9_22>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00753132/file/paper.pdf BibTex
titre
Beyond brain reading: randomized sparsity and clustering to simultaneously predict and identify
auteur
Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
article
Springer. NIPS 2011 MLINI Workshop, Dec 2011, Granada, Spain. pp.9-16, 2011, Machine Learning and Interpretation in Neuroimaging. <10.1007/978-3-642-34713-9_2>
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https://hal.inria.fr/hal-00704875/file/paper.pdf BibTex
titre
Detecting Outlying Subjects in High-Dimensional Neuroimaging Datasets with Regularized Minimum Covariance Determinant
auteur
Virgile Fritsch, Gaël Varoquaux, Thyreau Benjamin, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2011, Toronto, Canada. Springer-Verlag, Part III (LNCS 6893), pp. 264-271, 2011, 14th International Conference, Toronto, Canada, September 18-22, 2011. <http://www.springerlink.com/content/y1w41n8238341866/>. <10.1007/978-3-642-23626-6_33>
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https://hal.inria.fr/inria-00626857/file/outliers.pdf BibTex
titre
Connectivity-informed fMRI Activation Detection
auteur
Bernard Ng, Abugharbieh Rafeef, Gaël Varoquaux, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
Gabor Fichtinger and Anne Martel and Terry Peters. Medical Image Computing and Computed Aided Intervention, Sep 2011, Toronto, Canada. Springer-Verlag, 6892, pp.285-292, 2011, 2011; 14th International Conference, Toronto, Canada, September 18-22, 2011. <http://www.springerlink.com/content/n02708l5206857wh/>. <10.1007/978-3-642-23629-7_35>
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https://hal.inria.fr/inria-00627523/file/camera_ready.pdf BibTex
titre
Joint T1 and Brain Fiber Diffeomorphic Registration Using the Demons
auteur
Viviana Siless, Pamela Guevara, Xavier Pennec, Pierre Fillard
article
Liu, Tianming and Shen, Dinggang and Ibanez, Luis and Tao, Xiaodong. Multimodal Brain Image Analysis First International Workshop, MBIA 2011, Held in Conjunction with MICCAI 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. Springer Berlin / Heidelberg, 7012, pp.10-18, 2011, Lecture Notes in Computer Science; Multimodal Brain Image Analysis. <10.1007/978-3-642-24446-9_2>
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https://hal.inria.fr/inria-00627971/file/Joint_T1_and_Brain_Fiber_Diffeomorphic_Registration_Using_the_Demons_.pdf BibTex
titre
Apport des dictionnaires temps-fréquence, de la parcimonie et des structures pour l’imagerie cérébrale fonctionnelle M/EEG
auteur
Alexandre Gramfort, Daniel Strohmeier, Jens Haueisen, Matti Hämäläinen, Matthieu Kowalski
article
GRETSI 2011, Sep 2011, Bordeaux, France. pp.ID45, 2011
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00621040/file/GSK_gretsi.pdf BibTex
titre
Multi-subject dictionary learning to segment an atlas of brain spontaneous activity
auteur
Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Fabian Pedregosa, Vincent Michel, Bertrand Thirion
article
Information Processing in Medical Imaging, Jul 2011, Kaufbeuren, Germany. Springer, 6801, pp.562-573, 2011, Lecture Notes in Computer Science; Information Processing in Medical Imaging. <10.1007/978-3-642-22092-0_46>
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https://hal.inria.fr/inria-00588898/file/paper.pdf BibTex
titre
Functional brain imaging with M/EEG using structured sparsity in time-frequency dictionaries
auteur
Alexandre Gramfort, Daniel Strohmeier, Jens Haueisen, Matti Hamalainen, Matthieu Kowalski
article
International Conference on Information Processing in Medical Imaging (IPMI ’11), Jul 2011, Irsee, Germany. Springer, 6801, pp.600-611, 2011, Information Processing in Medical Imaging. <http://www.springerlink.com/content/mp7701m142193w83/>. <10.1007/978-3-642-22092-0_49>
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https://hal.inria.fr/inria-00605502/file/paper.pdf BibTex
titre
A probabilistic framework to infer brain functional connectivity from anatomical connections
auteur
Fani Deligianni, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, Emma Robinson, David Sharp, David Edwards, Daniel Rueckert
article
Information Processing in Medical Imaging, Jul 2011, Kaufbeuren, Germany. Springer, 6801, pp.296-307, 2011, Information Processing in Medical Imaging. <10.1007/978-3-642-22092-0_25>
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https://hal.inria.fr/inria-00627914/file/paper.pdf BibTex
titre
Multi-scale Mining of fMRI Data with Hierarchical Structured Sparsity
auteur
Rodolphe Jenatton, Alexandre Gramfort, Vincent Michel, Guillaume Obozinski, Francis Bach, Bertrand Thirion
article
PRNI 2011 – IEEE International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, May 2011, Seoul, South Korea. IEEE, 2011, <http://www.computer.org/portal/web/csdl/doi/10.1109/PRNI.2011.15>. <10.1109/PRNI.2011.15>
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titre
M/EEG source reconstruction based on Gabor thresholding in the source space
auteur
Daniel Strohmeier, Alexandre Gramfort, Jens Haueisen, Matti Hämäläinen, Matthieu Kowalski
article
NFSI 2011, May 2011, Banff, Canada. 2011
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00621044/file/nfsi2011.pdf BibTex
titre
Impact of the joint detection-estimation approach on random effects group studies in fMRI
auteur
Solveig Badillo, Thomas Vincent, Philippe Ciuciu
article
Pan X, Liebling M,. ISBI 2011 – IEEE Computer Society International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Mar 2011, Chicago, United States. IEEE, pp.376-380, 2011, <10.1109/ISBI.2011.5872427>
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https://hal.inria.fr/hal-00854626/file/isbi.pdf BibTex
titre
MULTIFRACTAL ANALYSIS OF RESTING STATE NETWORKS IN FUNCTIONAL MRI
auteur
Philippe Ciuciu, Gaël Varoquaux, Patrice Abry, Moty Almog
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2011, Chicago, United States. paper ID 1544, 2011
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-00558870/file/MF_ISBI_PA_GV.pdf BibTex
titre
OpenMEEG for calibrating the conductivity of nested compartment models
auteur
Maureen Clerc, Jean-Michel Badier, Emmanuel Olivi, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo
article
EIT conference, 2011, Bath, United Kingdom. 2011
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Poster communications

titre
Adjoint method for lead-fields computation in MEEG.
auteur
Emmanuel Olivi, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc
article
HBM’2011, Jun 2011, Québec City, Canada
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https://hal.inria.fr/inria-00603769/file/HBM2011-poster-OLIVI.pdf BibTex

2010

Journal articles

titre
Phase delays within visual cortex shape the response to steady-state visual stimulation.
auteur
Benoit Cottereau, Jean Lorenceau, Alexandre Gramfort, Maureen Clerc, Bertrand Thirion, Sylvain Baillet
article
NeuroImage, Elsevier, 2010, 54 (3), pp.1919-1929. <10.1016/j.neuroimage.2010.10.004>
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BibTex
titre
Tracking cortical activity from M/EEG using graph-cuts with spatiotemporal constraints.
auteur
Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Sylvain Baillet, Maureen Clerc
article
NeuroImage, Elsevier, 2010, epub ahead of print. <10.1016/j.neuroimage.2010.09.087>
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BibTex
titre
OpenMEEG: opensource software for quasistatic bioelectromagnetics
auteur
Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc
article
BioMedical Engineering OnLine, BioMed Central, 2010, 9 (1), pp.45. <http://www.biomedical-engineering-online.com/content/9/1/45>. <10.1186/1475-925X-9-45>
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https://hal.inria.fr/inria-00467061/file/OpenMEEGjournal.pdf BibTex
titre
A priori par normes mixtes pour les problèmes inverses: Application à la localisation de sources en M/EEG
auteur
Matthieu Kowalski, Alexandre Gramfort
article
Traitement du Signal, Lavoisier, 2010, 27 (1), pp.51-76. <10.3166/Traitement du Signal.vol(27)51-76>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00473970/file/KG_TS.pdf BibTex
titre
A group model for stable multi-subject ICA on fMRI datasets.
auteur
Gaël Varoquaux, Sepideh Sadaghiani, Philippe Pinel, Andreas Kleinschmidt, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
NeuroImage, Elsevier, 2010, 51 (1), pp.288-99. <10.1016/j.neuroimage.2010.02.010>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00489507/file/paper.pdf BibTex
titre
Graph-Based Variability Estimation in Single-Trial Event-Related Neural Responses.
auteur
Alexandre Gramfort, Renaud Keriven, Maureen Clerc
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2010, epub ahead of print. <10.1109/TBME.2009.2037139>
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BibTex
titre
Inference of a HARDI fiber bundle atlas using a two-level clustering strategy.
auteur
Pamela Guevara, Cyril Poupon, Denis Rivière, Yann Cointepas, Linda Marrakchi, Maxime Descoteaux, Pierre Fillard, Bertrand Thirion, Jean-François Mangin
article
Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI .. International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Springer, 2010, 13 (Pt 1), pp.550-7
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Conference papers

titre
Brain covariance selection: better individual functional connectivity models using population prior
auteur
Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
Richard Zemel and John Shawe-Taylor. Advances in Neural Information Processing Systems, Dec 2010, Vancouver, Canada. 2010, Advances in Neural Information Processing Systems
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https://hal.inria.fr/inria-00512451/file/paper.pdf BibTex
titre
Multi-Class Sparse Bayesian Regression for Neuroimaging data analysis
auteur
Vincent Michel, Evelyn Eger, Christine Keribin, Bertrand Thirion
article
International Workshop on Machine Learning in Medical Imaging (MLMI) In conjunction with MICCAI 2010, Sep 2010, Beijing, China. 6357, pp.50-58, 2010, LNCS. <10.1007/978-3-642-15948-0>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00505057/file/vm_mlmi.pdf BibTex
titre
Detection of brain functional-connectivity difference in post-stroke patients using group-level covariance modeling
auteur
Gaël Varoquaux, Flore Baronnet, Andreas Kleinschmidt, Pierre Fillard, Bertrand Thirion
article
Dinggang Shen and Alejandro Frangi and Gabor Szekely. Medical Image Computing and Computer Added Intervention, Sep 2010, Beijing, China. Springer, 2010, Lecture Notes in Computer Science. <10.1007/978-3-642-15705-9_25>
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https://hal.inria.fr/inria-00512417/file/paper.pdf BibTex
titre
Accurate Definition of Brain Regions Position Through the Functional Landmark Approach
auteur
Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline
article
13th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2010, Beijing, China. 2010
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https://hal.inria.fr/inria-00521909/file/bsa_miccai.pdf BibTex
titre
Imaging genetics: bio-informatics and bio-statistics challenges
auteur
Jean-Baptiste Poline, Christophe Lalanne, Arthur Tenenhaus, Edouard Duchesnay, Bertrand Thirion, Vincent Frouin
article
Lechevallier, Yves and Saporta, Gilbert. 19th International Conference on Computational Statistics, Aug 2010, Paris, France. 2010, Proceedings of COMPSTAT’2010
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https://hal.inria.fr/inria-00523236/file/229_paper.pdf BibTex
titre
Parcellation Schemes and Statistical Tests to Detect Active Regions on the Cortical Surface
auteur
Bertrand Thirion, Alan Tucholka, Jean-Baptiste Poline
article
Lechevallier, Yves and Saporta, Gilbert. 19th International Conference on Computational Statistics, Aug 2010, Paris, France. Spinger Verlag, pp.565–572, 2010, Proceedings of COMPSTAT’2010
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https://hal.inria.fr/inria-00521908/file/PAPER285.pdf BibTex
titre
Total Variation regularization enhances regression-based brain activity prediction
auteur
Vincent Michel, Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
article
1st ICPR Workshop on Brain Decoding – Pattern recognition challenges in neuroimaging – 20th International Conference on Pattern Recognition, Aug 2010, Istanbul, Turkey. IEEE Computer Society, 0, pp.9-12, 2010, <10.1109/WBD.2010.13>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00504095/file/icpr_2010_tv.pdf BibTex
titre
A supervised clustering approach for extracting predictive information from brain activation images
auteur
Vincent Michel, Evelyn Eger, Christine Keribin, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
Workshop on Mathematical Methods in Biomedical Image Analysis – IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2010, San Francisco, United States. pp.08, 2010
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00504094/file/mmbia.pdf BibTex
titre
The symmetric BEM: bringing in more variables for better accuracy
auteur
Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Emmanuel Olivi, Théodore Papadopoulo
article
Supek, Selma and Susac, Ana. Biomag 2010, May 2010, Dubrovnik, Croatia. Springer, 28, pp.109-112, 2010, Advances in Biomagnetism; IFMBE Proceedings. <http://www.springerlink.com/content/tq30518q02762u52/fulltext.pdf>. <10.1007/978-3-642-12197-5_21>
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https://hal.inria.fr/inria-00497081/file/ConfBiomag-122.pdf BibTex
titre
ICA-based sparse feature recovery from fMRI datasets
auteur
Gaël Varoquaux, Merlin Keller, Jean Baptiste Poline, Philippe Ciuciu, Bertrand Thirion
article
Biomedical Imaging, IEEE International Symposium on, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. IEEE, pp.1177, 2010
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00489506/file/paper.pdf BibTex
titre
Multi-condition M/EEG inverse modeling with sparsity assumptions: how to estimate what is common and what is specific in multiple experimental conditions
auteur
Alexandre Gramfort
article
Biomag: International Conference on Biomagnetism, Mar 2010, Dubrovnik, Croatia. 2010
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https://hal.inria.fr/inria-00468592/file/GramfortBiomag2010.pdf BibTex
titre
A hierarchical Bayesian model for frame representation
auteur
Lotfi Chaâri, Jean-Christophe Pesquet, Jean-Yves Tourneret, Philippe Ciuciu, Amel Benazza-Benyahia
article
IEEE International Conference Acoustics, Speech, and Signal (ICASSP), Mar 2010, Dallas, USA, France. pp.4086-4089, 2010
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BibTex
titre
Random Forests based feature selection for decoding fMRI data
auteur
Robin Genuer, Vincent Michel, Evelyn Eger, Bertrand Thirion
article
Proceedings of the 19th COMPSTAT, 2010, Unknown, pp.1071-1078, 2010
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Other publications

titre
Horizontal Data Fusion for Integrative Modelling: the MedINRIA Fusion Toolbox
auteur
Benoît Bleuzé, Olivier Clatz, Pierre Fillard, Maxime Sermesant, Nicolas Toussaint, Julien Wintz
article
Abstract. 2010
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https://hal.inria.fr/hal-00813764/file/noe-abstract.pdf BibTex

Poster communications

titre
OpenMEEG for M/EEG forward modeling: a comparison study
auteur
Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc
article
Human Brain Mapping, Jun 2010, Barcelone, Spain
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https://hal.inria.fr/inria-00502745/file/poster_hbm2010_gramfort.pdf BibTex
titre
An empirical evaluation of free BEM solvers for M/EEG forward modeling
auteur
Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc
article
Biomag, May 2010, Dubrovnik, Croatia. 2010
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https://hal.inria.fr/hal-00776674/file/poster_openmeeg_biomag_2010.pdf BibTex

Theses

titre
Understanding the visual cortex by using classification techniques
auteur
Vincent Michel
article
Human-Computer Interaction [cs.HC]. Université Paris Sud – Paris XI, 2010. English
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00550047/file/Thesis_VincentMICHEL_final.pdf BibTex

2009

Journal articles

titre
An automatic valuation system in the human brain: evidence from functional neuroimaging.
auteur
Maël Lebreton, Soledad Jorge, Vincent Michel, Bertrand Thirion, Mathias Pessiglione
article
Neuron, Elsevier, 2009, 64 (3), pp.431-9. <10.1016/j.neuron.2009.09.040>
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titre
Deciphering cortical number coding from human brain activity patterns.
auteur
Evelyn Eger, Vincent Michel, Bertrand Thirion, Alexis Amadon, Stanislas Dehaene, Andreas Kleinschmidt
article
Current Biology – CB, Elsevier, 2009, 19 (19), pp.1608-15. <10.1016/j.cub.2009.08.047>
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titre
Recruitment of an area involved in eye movements during mental arithmetic.
auteur
André Knops, Bertrand Thirion, Edward M Hubbard, Vincent Michel, Stanislas Dehaene
article
Science, American Association for the Advancement of Science, 2009, 324 (5934), pp.1583-5. <10.1126/science.1171599>
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titre
Python comme langage scientifique
auteur
Gaël Varoquaux
article
Linux Magazine, Editions Diamond, 2009, Explorer les richesses du langage Python, 40, <http://www.unixgarden.com/index.php/gnu-linux-magazine-hs/python-comme-langage-scientifique>
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titre
Brain classification reveals the right cerebellum as the best biomarker of dyslexia.
auteur
Cyril R Pernet, Jean Baptiste Poline, Jean François Demonet, Guillaume A Rousselet
article
BMC Neuroscience, BioMed Central, 2009, 10, pp.67. <10.1186/1471-2202-10-67>
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titre
Constructing a dictionary of human brain folding patterns.
auteur
Zhong Yi Sun, Matthieu Perrot, Alan Tucholka, Denis Rivière, Jean-François Mangin
article
Med Image Comput Comput Assist Interv, Springer, 2009, 12 (Pt 2), pp.117-24
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titre
Joint Bayesian cortical sulci recognition and spatial normalization.
auteur
Matthieu Perrot, Denis Rivière, Alan Tucholka, Jean-François Mangin
article
Information processing in medical imaging : proceedings of the .. conference., Springer-Verlag, 2009, 21, pp.176-87
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Conference papers

titre
Discriminative Network Models of Schizophrenia
auteur
Guillermo Cecchi, Irina Rish, Benjamin Thyreau, Bertrand Thirion, Marion Plaze, Jean-Luc Martinot, Marie-Laure Pallière-Martinot, Jean-Baptiste Poline
article
Neural Information processing Systems, Dec 2009, Vancouver, Canada. 2009
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BibTex
titre
Surface-based versus volume-based fMRI group analysis: a case study
auteur
Alan Tucholka, Merlin Keller, Jean-Baptiste Poline, Alexis Roche, Bertrand Thirion
article
MICCAI 2009 Functional NeuroImaging Workshop, Sep 2009, Londres, United Kingdom. 2009
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https://hal.inria.fr/hal-00776637/file/tucholkaMICCAI09.pdf BibTex
titre
CanICA: Model-based extraction of reproducible group-level ICA patterns from fMRI time series
auteur
Gaël Varoquaux, Sepideh Sadaghiani, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion
article
Medical Image Computing and Computer Aided Intervention, Sep 2009, London, United Kingdom. pp.1, 2009
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00435262/file/paper.pdf BibTex
titre
Adaptive multi-class Bayesian sparse regression – An application to brain activity classification
auteur
Vincent Michel, Evelyn Eger, Christine Keribin, Bertrand Thirion
article
MICCAI 2009: fMRI data analysis workshop – Medical Image Computing and Computer Aided Intervention, Sep 2009, London, United Kingdom. pp.1, 2009
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00504093/file/WM_Final.pdf BibTex
titre
Proceedings of the 8th Python in Science conference
auteur
Gaël Varoquaux, Stefan Van Der Walt, Jarrod Millman
article
Gaël Varoquaux; Stefan van der Walt ; Jarrod Millman. SciPy 2009: 8th Python in Science Conference, Aug 2009, Pasadena, United States. 1 (1), pp.1-78, 2009
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00502607/file/SciPy2009_proceedings.pdf BibTex

Habilitation à diriger des recherches

titre
Structural and probabilistic methods for group analysis in functional neuroimaging
auteur
Bertrand Thirion
article
Life Sciences [q-bio]. École normale supérieure de Cachan – ENS Cachan, 2009
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00438202/file/HDR.pdf BibTex

2008

Journal articles

titre
A fully Bayesian approach to the parcel-based detection-estimation of brain activity in fMRI.
auteur
Salima Makni, Jérôme Idier, Thomas Vincent, Bertrand Thirion, Ghislaine Dehaene-Lambertz, Philippe Ciuciu
article
NeuroImage, Elsevier, 2008, 41 (3), pp.941-69. <10.1016/j.neuroimage.2008.02.017>
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-00333624/file/finalSMakni.pdf BibTex
titre
Agile Computer Control of a Complex Experiment
auteur
Gaël Varoquaux
article
Computing in Science and Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2008, 10 (2), pp.55-59. <10.1109/MCSE.2008.47>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00502504/file/varoquaux_agile_computing.pdf BibTex
titre
Probabilistic anatomo-functional parcellation of the cortex: how many regions?
auteur
Alan Tucholka, Bertrand Thirion, Matthieu Perrot, Philippe Pinel, Jean-François Mangin, Jean-Baptiste Poline
article
Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI .. International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Springer, 2008, 11 (Pt 2), pp.399-406
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BibTex
titre
Connectivity-Based Parcellation of the Cortical Mantle Using q-Ball Diffusion Imaging
auteur
Muriel Perrin, Yann Cointepas, Arnaud Cachia, Cyril Poupon, Bertrand Thirion, Denis Rivière, Pascal Cathier, Vincent El Kouby, André Constantinesco, Denis Le Bihan, Jean-François Mangin
article
International Journal of Biomedical Imaging, Hindawi Publishing Corporation, 2008, 2008, pp.368406. <10.1155/2008/368406>
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Conference papers

titre
Proceedings of the 7th Python in Science conference
auteur
Gaël Varoquaux, Travis Vaught, Jarrod Millman
article
Gaël Varoquaux; Travis Vaught ; Jarrod Millman. SciPy 2008: 7th Python in Science Conference, Aug 2008, Pasadena, United States. 1 (1), pp.1-78, 2008
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00502586/file/SciPy2008_proceedings.pdf BibTex
titre
Mayavi: Making 3D Data Visualization Reusable
auteur
Gaël Varoquaux, Prabhu Ramachandran
article
Gaël Varoquaux; Travis Vaught ; Jarrod Millman. SciPy 2008: 7th Python in Science Conference, Aug 2008, Pasadena, United States. 1 (1), pp.51, 2008
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00502548/file/full_text.pdf BibTex
titre
Mutual information-based feature selection enhances fMRI brain activity classification
auteur
Vincent Michel, Cécilia Damon, Bertrand Thirion
article
2008 5th IEEE international symposium on biomedical imaging: From nano to macro, May 2008, Paris, France. pp.592 – 595, 2008, <10.1109/ISBI.2008.4541065>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00504092/file/Mutual_Information-based_feature_selection_enhances_fMRI_brain_activity_classification_-_2008.pdf BibTex

2007

Journal articles

titre
Analysis of a large fMRI cohort: Statistical and methodological issues for group analyses.
auteur
Bertrand Thirion, Philippe Pinel, Sébastien Mériaux, Alexis Roche, Stanislas Dehaene, Jean-Baptiste Poline
article
NeuroImage, Elsevier, 2007, 35 (1), pp.105-20. <10.1016/j.neuroimage.2006.11.054>
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-00371089/file/Localizer.pdf BibTex
titre
Fast reproducible identification and large-scale databasing of individual functional cognitive networks
auteur
Philippe Pinel, Bertrand Thirion, Sébastien Meriaux, Antoinette Jobert, Julien Serres, Denis Le Bihan, Jean-Baptiste Poline, Stanislas Dehaene
article
BMC Neuroscience, BioMed Central, 2007, 8 (1), pp.91. <10.1186/1471-2202-8-91>
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https://hal.inria.fr/hal-00784462/file/1471-2202-8-91.pdf BibTex
titre
Geometric Means in a Novel Vector Space Structure on Symmetric Positive-Definite Matrices
auteur
Vincent Arsigny, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
article
SIAM Journal on Matrix Analysis and Applications, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2007, 29 (1), pp.328–347. <10.1137/050637996>
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BibTex
titre
Challenging the estimation of cortical activity from MEG with simulated fMRI-constrained retinotopic maps.
auteur
Alexandre Gramfort, Benoit Cottereau, Maureen Clerc, Bertrand Thirion, Sylvain Baillet
article
Conference proceedings : .. Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual Conference, Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2007, 2007, pp.4945-8. <10.1109/IEMBS.2007.4353450>
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Conference papers

titre
Evaluating Brain Anatomical Correlations via Canonical Correlation Analysis of Sulcal Lines
auteur
Pierre Fillard, Xavier Pennec, Paul Thompson, Nicholas Ayache
article
Proc. of MICCAI’07 Workshop on Statistical Registration: Pair-wise and Group-wise Alignment and Atlas Formation, 2007, Brisbane, Australia, Australia. 2007
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titre
MedINRIA: Medical Image Navigation and Research Tool by INRIA
auteur
Nicolas Toussaint, Jean-Christophe Souplet, Pierre Fillard
article
Proc. of MICCAI’07 Workshop on Interaction in medical image analysis and visualization, 2007, Brisbane, Australia, Australia. 2007
Accès au bibtex
BibTex
titre
vtkINRIA3D: A VTK Extension for Spatiotemporal Data Synchronization, Visualization and Management
auteur
Nicolas Toussaint, Maxime Sermesant, Pierre Fillard
article
Proc. of Workshop on Open Source and Open Data for MICCAI, 2007, Brisbane, Australia, Australia. 2007
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BibTex

2006

Journal articles

titre
Inverse retinotopy: inferring the visual content of images from brain activation patterns.
auteur
Bertrand Thirion, Edouard Duchesnay, Edward Hubbard, Jessica Dubois, Jean-Baptiste Poline, Denis Le Bihan, Stanislas Dehaene
article
NeuroImage, Elsevier, 2006, 33 (4), pp.1104-16. <10.1016/j.neuroimage.2006.06.062>
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BibTex
titre
A Riemannian Framework for Tensor Computing
auteur
Xavier Pennec, Pierre Fillard, Nicholas Ayache
article
International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2006, 66 (1), pp.41–66. <10.1007/s11263-005-3222-z>
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00614990/file/Pennec.IJCV05.pdf BibTex

Conference papers

titre
Clinical DT-MRI estimation, smoothing and fiber tracking with log-Euclidean metrics
auteur
Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
article
Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.786-789, 2006, <10.1109/ISBI.2006.1625034>
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