2024
Theses
- titre
- Optimisation algorithms in non-standard Banach spaces for inverse problems in imaging
- auteur
- Marta Lazzaretti
- article
- Image Processing [eess.IV]. Université Côte d’Azur; Università degli studi (Gênes, Italie), 2024. English. ⟨NNT : 2024COAZ4009⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Algorithmic unfolding for image reconstruction and localization problems in fluorescence microscopy
- auteur
- Silvia Bonettini, Luca Calatroni, Danilo Pezzi, Marco Prato
- article
- 2024
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-
- titre
- Off-the-grid regularisation for Poisson inverse problems
- auteur
- Marta Lazzaretti, Claudio Estatico, Alejandro Melero Carrillo, Luca Calatroni
- article
- 2024
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-
- titre
- Whiteness-based bilevel learning of regularization parameters in imaging
- auteur
- Carlo Santambrogio, Monica Pragliola, Alessandro Lanza, Marco Donatelli, Luca Calatroni
- article
- 2024
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-
- titre
- Exact continuous relaxations of l0-regularized criteria with non-quadratic data terms
- auteur
- M’Hamed Essafri, Luca Calatroni, Emmanuel Soubies
- article
- 2024
- Accès au bibtex
-
2023
Journal articles
- titre
- Improving CNNs classification with pathologist-based expertise: the renal cell carcinoma case study
- auteur
- Francesco Ponzio, Xavier Descombes, Damien Ambrosetti
- article
- Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.15887. ⟨10.1038/s41598-023-42847-y⟩
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-
- titre
- Beyond $\ells sparse coding in V1
- auteur
- Ilias Rentzeperis, Luca Calatroni, Laurent Perrinet, Dario Prandi
- article
- PLoS Computational Biology, 2023, 19 (9), pp.e1011459. ⟨10.1371/journal.pcbi.1011459⟩
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-
- titre
- A mobility-SAV approach for a Cahn-Hilliard equation with degenerate mobilities
- auteur
- Elie Bretin, Luca Calatroni, Simon Masnou
- article
- Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series S, 2023, ⟨10.3934/dcdss.2023177⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- On and beyond Total Variation regularisation in imaging: the role of space variance
- auteur
- Monica Pragliola, Luca Calatroni, Alessandro Lanza, Fiorella Sgallari
- article
- SIAM Review, 2023, pp.601-685. ⟨10.1137/21M1410683⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Off-the-grid curve reconstruction through divergence regularisation: an extreme point result
- auteur
- Bastien Laville, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- SIAM Journal on Imaging Sciences, 2023, 16 (2), pp.867-885. ⟨10.1137/22M1494373⟩
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-
- titre
- Coupled mechanical mapping and interference contrast microscopy reveal viscoelastic and adhesion hallmarks of monocyte differentiation into macrophages
- auteur
- Mar Eroles, Javier Lopez-Alonso, Alexandre Ortega, Thomas Boudier, Khaldoun Gharzeddine, Frank Lafont, Clemens Franz, Arnaud Millet, Claire Valotteau, Felix Rico
- article
- Nanoscale, 2023, 15 (29), pp.12255-12269. ⟨10.1039/D3NR00757J⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Age‐dependent changes in epidermal architecture explored using an automated image analysis algorithm on in vivo reflectance confocal microscopy images
- auteur
- Imane Lboukili, Georgios Stamatas, Xavier Descombes
- article
- Skin Research and Technology, 2023, 29 (5), ⟨10.1111/srt.13343⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Fluorescence image deconvolution microscopy via generative adversarial learning (FluoGAN)
- auteur
- Mayeul Cachia, Vasiliki Stergiopoulou, Luca Calatroni, Sébastien Schaub, Laure Blanc-Féraud
- article
- Inverse Problems, 2023, 39 (5), pp.054006. ⟨10.1088/1361-6420/acc889⟩
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-
- titre
- Space-Variant Image Reconstruction via Cauchy Regularisation: Application to Optical Coherence Tomography
- auteur
- Alin Achim, Luca Calatroni, Serena Morigi, Gabriele Scrivanti
- article
- Signal Processing, 2023, 205, ⟨10.1016/j.sigpro.2022.108866⟩
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-
- titre
- Automatic granular and spinous epidermal cell identification and analysis on in vivo reflectance confocal microscopy images using cell morphological features
- auteur
- Imane Lboukili, Georgios Stamatas, Xavier Descombes
- article
- Journal of Biomedical Optics, 2023, 28 (04), ⟨10.1117/1.JBO.28.4.046003⟩
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-
- titre
- Fast and stable schemes for non-linear osmosis filtering
- auteur
- Luca Calatroni, S. Morigi, S. Parisotto, G.A. Recupero
- article
- Computers & Mathematics with Applications, 2023, 133, pp.30-47. ⟨10.1016/j.camwa.2022.12.015⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- A spatial statistical framework for the parametric study of fiber networks: application to fibronectin deposition by normal and activated fibroblasts
- auteur
- Anca-Ioana Grapa, Georgios Efthymiou, Ellen van Obberghen-Schilling, Laure Blanc-Féraud, Xavier Descombes
- article
- Biological Imaging, In press, ⟨10.1017/S2633903X23000247⟩
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-
- titre
- A machine learning framework for the quantification of experimental uveitis in murine OCT
- auteur
- Youness Mellak, Alin Achim, Amy Ward, Lindsay Nicholson, Xavier Descombes
- article
- Biomedical optics express, 2023, 14 (7), pp.3413. ⟨10.1364/BOE.489271⟩
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-
Conference papers
- titre
- Reconstruction sans-grille de courbes : un algorithme pour la super-résolution
- auteur
- Bastien Laville, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- GRETSI’23 – XXIX ème Colloque Francophone de Traitement du Signal et des Images, Aug 2023, Grenoble, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Stochastic gradient descent for linear inverse problems in variable exponent Lebesgue spaces
- auteur
- Marta Lazzaretti, Zeljko Kereta, Claudio Estatico, Luca Calatroni
- article
- IX conference on Scale Space and Variational Methods in Computer Vision 2023, May 2023, Santa margherita di Pula, Italy. pp.457-470, ⟨10.1007/978-3-031-31975-4_35⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Off-the-Grid Charge Algorithm for Curve Reconstruction in Inverse Problems
- auteur
- Bastien Laville, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- SSVM 2023 -International Conference on Scale Space and Variational Methods in Computer Vision, May 2023, Santa Margherita di Pula, Italy. pp.393-405, ⟨10.1007/978-3-031-31975-4_30⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fluctuation-based deconvolution in fluorescence microscopy using plug-and-play denoisers
- auteur
- Vasiliki Stergiopoulou, Subhadip Mukherjee, Luca Calatroni, Laure Blanc-Féraud
- article
- Scale Space and Variational Methods in Computer Vision, May 2023, Sardinia, Italy. pp.498-510, ⟨10.1007/978-3-031-31975-4_38⟩
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-
Theses
- titre
- Analysis and characterization of the tissue structure of the epidermis from confocal imaging
- auteur
- Imane Lboukili
- article
- Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV]. Université Côte d’Azur, 2023. English. ⟨NNT : 2023COAZ4067⟩
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-
- titre
- Reconstruction sans-grille de courbes : théorie et applications en microscopie de fluorescence
- auteur
- Bastien Laville
- article
- Traitement du signal et de l’image [eess.SP]. Université Côte d’Azur, 2023. Français. ⟨NNT : 2023COAZ4062⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A nearest-neighbours kernel for classification : a case study of in situ two-dimensional plankton images with correction of total volume estimates for copepods
- auteur
- Cédric Dubois
- article
- Modeling and Simulation. Université Côte d’Azur, 2023. English. ⟨NNT : 2023COAZ4032⟩
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-
- titre
- Learning and optimization for 3D super-resolution in fluorescence microscopy
- auteur
- Vasiliki Stergiopoulou
- article
- Optimization and Control [math.OC]. Université Côte d’Azur, 2023. English. ⟨NNT : 2023COAZ4007⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Physics-inspired generative adversarial modelling for fluctuation-based super-resolution microscopy
- auteur
- Luca Calatroni, Hamza Mentagui, Sébastien Schaub, Laure Blanc-Féraud
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Parameter-Free FISTA by Adaptive Restart and Backtracking
- auteur
- Jean-François Aujol, Luca Calatroni, Charles Dossal, Hippolyte Labarrière, Aude Rondepierre
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Beyond $\ell_1$ sparse coding in V1
- auteur
- Ilias Rentzeperis, Luca Calatroni, Laurent Perrinet, Dario Prandi
- article
- 2023
- Accès au bibtex
-
2022
Journal articles
- titre
- Embryo-scale epithelial buckling forms a propagating furrow that initiates gastrulation
- auteur
- Julien Fierling, Alphy John, Barthélémy Delorme, Alexandre Torzynski, Guy B Blanchard, Claire M Lye, Anna Popkova, Grégoire Malandain, Bénédicte Sanson, Jocelyn Etienne, Philippe Marmottant, Catherine Quilliet, Matteo Rauzi
- article
- Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.3348. ⟨10.1038/s41467-022-30493-3⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modular-proximal gradient algorithms in variable exponent Lebesgue spaces
- auteur
- Marta Lazzaretti, Luca Calatroni, Claudio Estatico
- article
- SIAM Journal on Scientific Computing, 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Scaled, inexact and adaptive generalized FISTA for strongly convex optimization
- auteur
- Simone Rebegoldi, Luca Calatroni
- article
- SIAM Journal on Optimization, 2022
- Accès au bibtex
-
- titre
- ADMM-Based Residual Whiteness Principle for Automatic Parameter Selection in Single Image Super-Resolution Problems
- auteur
- Monica Pragliola, Luca Calatroni, Alessandro Lanza, Fiorella Sgallari
- article
- Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2022
- Accès au bibtex
-
- titre
- Automating reflectance confocal microscopy image analysis for dermatological research: a review
- auteur
- Imane Lboukili, Xavier Descombes, Georgios N Stamatas
- article
- Journal of Biomedical Optics, 2022, 27 (07), ⟨10.1117/1.JBO.27.7.070902⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- A unified surface geometric framework for feature-aware denoising, hole filling and context-aware completion
- auteur
- Luca Calatroni, Martin Huska, Serena Morigi, Giuseppe Recupero
- article
- Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Correcting estimations of copepod volume from 2-dimensional images
- auteur
- Cédric Dubois, Jean Olivier Irisson, Eric Debreuve
- article
- Limnology and Oceanography : methods, 2022, 20 (6), pp.361-371. ⟨10.1002/lom3.10492⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- COL0RME: Super-resolution microscopy based on sparse blinking/fluctuating fluorophore localization and intensity estimation
- auteur
- Vasiliki Stergiopoulou, Luca Calatroni, José Henrique de M Goulart, Sébastien Schaub, Laure Blanc-Féraud
- article
- Biological Imaging, 2022, 2, pp.e1. ⟨10.1017/S2633903X22000010⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Can AI predict epithelial lesion categories via automated analysis of cervical biopsies: The TissueNet challenge?
- auteur
- Nicolas Loménie, Capucine Bertrand, Rutger H.J. Fick, Saima Ben Hadj, Brice Tayart, Cyprien Tilmant, Isabelle Farré, Soufiane Azdad, Samy Dahmani, Gilles Dequen, Ming Feng, Kele Xu, Zimu Li, Sophie Prevot, Christine Bergeron, Guillaume Bataillon, Mojgan Devouassoux-Shisheboran, Claire Glaser, Agathe Delaune, Séverine Valmary-Degano, Philippe Bertheau
- article
- Journal of Pathology Informatics, 2022, 13, pp.100149. ⟨10.1016/j.jpi.2022.100149⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Constrained and Unconstrained Inverse Potts Modelling for Joint Image Super-Resolution and Segmentation
- auteur
- Dario Mylonopoulos, Pasquale Cascarano, Luca Calatroni, Elena Loli Piccolomini
- article
- Image Processing On Line, 2022, 12, pp.92-110. ⟨10.5201/ipol.2022.393⟩
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Dynamic analysis framework to detect cell division and cell death in live-cell imaging, using signal processing and machine learning
- auteur
- Asma Chalabi, Eric Debreuve, Jérémie Roux
- article
- ICSB 2022 – The 21st International Conference on Systems Biology, Oct 2022, Berlin (DE), Germany
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Multi-Task Semi-Supervised Learning for Vascular Network Segmentation and Renal Cell Carcinoma Classification
- auteur
- Rudan Xiao, Damien Ambrosetti, Xavier Descombes
- article
- REMIA 2022 – first MICCAI Workshop on Resource-Efficient Medical Image Analysis, Sep 2022, Singapour, Singapore. ⟨10.1007/978-3-031-16876-5_1⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Tomographic imaging: two examples of medical and archaeological applications
- auteur
- Vanna Lisa Coli, Didier Binder, Laure Blanc-Féraud, Juliette Leblond, Serge X. Cohen, Louise Gomart, Claire Migliaccio
- article
- MIA-MIVA – 1st French-Italian workshop on the Mathematics of Imaging, Vision and their Applications, Sep 2022, Sophia Antipolis, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Easily Interpretable, Non-parametric Sample Transformation for Classification
- auteur
- Cédric Dubois, Jean-Olivier Irisson, Eric Debreuve
- article
- Colloque GRETSI (Groupe de Recherche et d’Etudes de Traitement du Signal et des Images), Sep 2022, Nancy, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Super-résolution sans-grille pour l’imagerie de fluctuation
- auteur
- Bastien Laville, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- GRETSI’22 – XXVIIIème Colloque Francophone de Traitement du Signal et des Images, Sep 2022, Nancy, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Off-the-grid covariance-based super-resolution fluctuation microscopy
- auteur
- Bastien Laville, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- ICASSP 2022 – IEEE International Conference on Acoustics, Speech, and Signal Processing, IEEE, May 2022, Singapour, Singapore. ⟨10.1109/ICASSP43922.2022.9746845⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Automatic cell identification and analysis on in vivo reflectance confocal microscopy images of the human epidermis
- auteur
- Imane Lboukili, Georgios Stamatas, Xavier Descombes
- article
- SPIE Photonics Europe 2022, Apr 2022, Strasbourg, France. ⟨10.1117/12.2626777⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Robust Plant Cell Tracking in Fluorescence Microscopy 3D+T Series
- auteur
- Manuel Petit, Guillaume Cerutti, Christophe Godin, Grégoire Malandain
- article
- ISBI 2022 – IEEE 19th International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2022, Kolkata, India. pp.1-4, ⟨10.1109/ISBI52829.2022.9761521⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- 3D Image super-resolution by fluorophore fluctuations and MA-TIRF microscopy reconstruction (3D-COL0RME)
- auteur
- Vasiliki Stergiopoulou, Luca Calatroni, Sébastien Schaub, Laure Blanc-Féraud
- article
- IEEE ISBI 2022 – IEEE 19th International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2022, Kolkata, India
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Exploring Tomographic Images of Archaeological Pottery Sherds with Machine Learning Methods
- auteur
- Vanna Lisa Coli, Kassem Dia, Laure Blanc-Féraud, Juliette Leblond, Louise Gomart, Didier Binder
- article
- SIAM Conference on Imaging Science – IS22, Mar 2022, Virtual conference, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modeling isogenic cancer cell response upon TRAIL treatment in multi-omics studies
- auteur
- Marielle Péré, Asma Chalabi, Jérémie Roux
- article
- Multiple facets of RNA in development and disease conference, Signalife Labex community, Mar 2022, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- Detecting Stress Granules in Drosophila Neurons
- auteur
- Fabienne de Graeve, Nadia Formicola, Kavya Vinayan Pushpalatha, Akira Nakamura, Eric Debreuve, Xavier Descombes, Florence Besse
- article
- The Integrated Stress Response: Methods and Protocols, Springer, 2022, Methods in Molecular Biology, 978-1-0716-1975-9
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Books
- titre
- Le corps en images
- auteur
- Laure Blanc-Féraud, Emmanuel Caruyer, Christian Jutten, Herve Liebgott
- article
- CNRS, 2022, ISBN 9782271143280
- Accès au bibtex
-
Poster communications
- titre
- Integrating machine learning methods to single-cell experimental workflow increases throughput and accuracy for target identification in immuno-oncology
- auteur
- Marielle Péré, Diego Oyarzun, Asma Chalabi, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- Sophia Summit AI, Nov 2022, Sophia Antipolis, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Integrating machine learning methods to single cell signaling analyses increases throughput and accuracy for target identification in immuno-oncology
- auteur
- Marielle Péré, Asma Chalabi, Jérémie Roux, Diego Oyarzun, Madalena Chaves
- article
- 5th Signalife Labex Meeting, Nov 2022, Nice, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Automated keratinocyte identification on in vivo reflectance confocal microscopy images of the epidermis (Poster)
- auteur
- Imane Lboukili, Xavier Descombes, Georgios N Stamatas
- article
- YSN 2022 – 3rd Imabio Young Scientist Network Conference, Jul 2022, Lyon, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Automatic cell identification and analysis on in vivo reflectance confocal images of the human epidermis (Poster)
- auteur
- Imane Lboukili, Xavier Descombes, Georgios N Stamatas
- article
- SPIE Photonics Europe : Conférence Internationale et Exposition sur les Applications de la Technologie Photonique, Apr 2022, Strasbourg, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Theses
- titre
- Classification and segmentation of vascular network in histological images : application to renal cell carcinoma
- auteur
- Rudan Xiao
- article
- Image Processing [eess.IV]. Université Côte d’Azur, 2022. English. ⟨NNT : 2022COAZ4075⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Fast and stable schemes for non-linear osmosis filtering
- auteur
- Luca Calatroni, S. Morigi, S. Parisotto, G. A. Recupero
- article
- 2022
- Accès au bibtex
-
- titre
- A hybrid approach combining cnns and variational modelling for blind image denoising
- auteur
- Rim Rekik Dit Nekhili, Xavier Descombes, Luca Calatroni
- article
- 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2021
Journal articles
- titre
- Off-the-grid variational sparse spike recovery: methods and algorithms
- auteur
- Bastien Laville, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- Journal of Imaging, 2021, 7 (12), pp.266. ⟨10.3390/jimaging7120266⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Identifying regions of interest in whole slide images of renal cell carcinoma
- auteur
- Mohammed Lamine Benomar, Nesma Settouti, Eric Debreuve, Xavier Descombes, Damien Ambrosetti
- article
- Research on Biomedical Engineering, 2021, ⟨10.1007/s42600-021-00178-9⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A continuous relaxation of the constrained $L_2 − L_0$ problem
- auteur
- Arne Bechensteen, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2021, 63, pp.472-491. ⟨10.1007/s10851-020-01014-y⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Efficient $\ell^0$ gradient-based Super Resolution for simplified image segmentation
- auteur
- Pasquale Cascarano, Luca Calatroni, Elena Loli Piccolomini
- article
- IEEE Transactions on Computational Imaging, 2021, 7, pp.399-408. ⟨10.1109/TCI.2021.3070720⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Multi Features Based Approach for White Blood Cells Segmentation and Classification in Peripheral Blood and Bone Marrow Images
- auteur
- Mohammed Lamine Benomar, Amine M. Chikh, Xavier Descombes, Mourtada Benazzouz
- article
- International Journal of Biomedical Engineering and Technology (IJBET), 2021, ⟨10.1504/IJBET.2021.113729⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A cortical-inspired sub-Riemannian model for Poggendorff-type visual illusions
- auteur
- Emre Baspinar, Luca Calatroni, Valentina Franceschi, Dario Prandi
- article
- Journal of Imaging, 2021, ⟨10.3390/jimaging7030041⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fibronectin Extra Domains tune cellular responses and confer topographically distinct features to fibril networks
- auteur
- Georgios Efthymiou, Agata Radwanska, Anca-Ioana Grapa, Stéphanie Beghelli-de La Forest Divonne, Dominique Grall, Sébastien Schaub, Maurice Hattab, Sabrina Pisano, M. Poët, Didier F Pisani, Laurent Counillon, Xavier Descombes, Laure Blanc-Féraud, Ellen van Obberghen-Schilling
- article
- Journal of Cell Science, 2021, ⟨10.1242/jcs.252957⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A multiscale analysis of early flower development in Arabidopsis provides an integrated view of molecular regulation and growth control
- auteur
- Yassin Refahi, Argyris Zardilis, Gaël Michelin, Raymond Wightman, Bruno Leggio, Jonathan Legrand, Emmanuel Faure, Laetitia Vachez, Alessia Armezzani, Anne-Evodie Risson, Feng Zhao, Pradeep Das, Nathanaël Prunet, Elliot Meyerowitz, Christophe Godin, Grégoire Malandain, Henrik Jönsson, Jan Traas
- article
- Developmental Cell, 2021, 56 (4), pp.540-556.e8. ⟨10.1016/j.devcel.2021.01.019⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Accelerated Iterative Regularization via Dual Diagonal Descent
- auteur
- Luca Calatroni, Guillaume Garrigos, Lorenzo Rosasco, Silvia Villa
- article
- SIAM Journal on Optimization, 2021, 31 (1), pp.754-784. ⟨10.1137/19M1308888⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Micro-computed tomography for discriminating between different forming techniques in ancient pottery: new segmentation method and pore distribution recognition
- auteur
- Vanna Lisa Coli, Louise Gomart, Didier F Pisani, Serge X. Cohen, Laure Blanc-Féraud, Juliette Leblond, Didier Binder
- article
- Archaeometry, 2021, ⟨10.1111/arcm.12693⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Direction-of-Arrival Estimation through Exact Continuous l20-Norm Relaxation
- auteur
- Emmanuel Soubies, Adilson Chinatto, Pascal Larzabal, João M T Romano, Laure Blanc-Féraud
- article
- IEEE Signal Processing Letters, 2021, 28, pp.16-20. ⟨10.1109/LSP.2020.3042771⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Renal Cell Carcinoma Classification from Vascular Morphology
- auteur
- Rudan Xiao, Eric Debreuve, Damien Ambrosetti, Xavier Descombes
- article
- MICCAI 2021 – 24th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2021, Strasbourg, France. pp.611-621, ⟨10.1007/978-3-030-87231-1_59⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A scaled, inexact and adaptive Fast Iterative Soft-Thresholding Algorithm for convex image restoration
- auteur
- Luca Calatroni, Simone Rebegoldi
- article
- Computational Science and Its Applications – ICCSA 2021: 21st International Conference, Sep 2021, Cagliari, Italy. ⟨10.1109/ICCSA54496.2021.00017⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- A continuous, non-convex & sparse super-resolution approach for fluorescence microscopy data with Poisson noise
- auteur
- Marta Lazzaretti, Luca Calatroni, Claudio Estatico
- article
- ICCSA 2021 – 21st International Conference on Computational Science and Its Applications, Sep 2021, Cagliari, Italy. pp.80-86, ⟨10.1109/ICCSA54496.2021.00021⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Applications of Learning Methods to Imaging Issues in Archaeology, Regarding Ancient Ceramic Manufacturing
- auteur
- Kassem Dia, Vanna Lisa Coli, Juliette Leblond, Louise Gomart, Didier Binder, Laure Blanc-Féraud
- article
- DeLTA 2021 – 2nd International Conference on Deep Learning Theory and Applications, Jul 2021, Virtual conference, France. pp.109-116, ⟨10.5220/0010519101090116⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Correction of the estimation of the volume of copepods from 2-dimensional in situ images
- auteur
- Cédric Dubois, Jean-Olivier Irisson, Eric Debreuve
- article
- ASLO Aquatic Sciences Meeting, Jun 2021, Online, Spain
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-
- titre
- Adaptive parameter selection for weighted-TV image reconstruction problems
- auteur
- Luca Calatroni, Alessandro Lanza, Monica Pragliola, Fiorella Sgallari
- article
- NCMIP 2019 – 9th International Conference on New Computational Methods for Inverse Problems, May 2021, Cachan, France. pp.012003, ⟨10.1088/1742-6596/1476/1/012003⟩
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-
- titre
- Residual Whiteness Principle for Automatic Parameter Selection in ℓ2 – ℓ2 Image Super-Resolution Problems
- auteur
- Luca Calatroni, Monica Pragliola, Alessandro Lanza, Fiorella Sgallari
- article
- SSVM 2021 – 8th International Conference on Scale Space and Variational Methods in Computer Vision, May 2021, Virtual Event, France. pp.476-488, ⟨10.1007/978-3-030-75549-2_38⟩
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-
- titre
- A Scaled and Adaptive FISTA Algorithm for Signal-Dependent Sparse Image Super-Resolution Problems
- auteur
- Marta Lazzaretti, Simone Rebegoldi, Luca Calatroni, Claudio Estatico
- article
- SSVM 2021-8th International Conference on Scale Space and Variational Methods in Computer Vision, May 2021, Cabourg, France. pp.242-253, ⟨10.1007/978-3-030-75549-2_20⟩
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-
- titre
- Weighted-CEL0 sparse regularisation for molecule localisation in super-resolution microscopy with Poisson data
- auteur
- Marta Lazzaretti, Luca Calatroni, Claudio Estatico
- article
- 2021 IEEE 18th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2021, Nice, France. ⟨10.1109/ISBI48211.2021.9434014⟩
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-
- titre
- Non-convex Super-resolution of OCT images via sparse representation
- auteur
- Gabriele Scrivanti, Luca Calatroni, Serena Morigi, Lindsay Nicholson, Alin Achim
- article
- 2021 IEEE 18th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2021, Nice, France
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-
- titre
- COL0RME: COvariance-based $\ell_0$ super-Resolution Microscopy with intensity Estimation
- auteur
- Vasiliki Stergiopoulou, José Henrique de M Goulart, Sébastien Schaub, Luca Calatroni, Laure Blanc-Féraud
- article
- ISBI 2021 – 18th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2021, Nice (Virtual), France. pp.349-352, ⟨10.1109/ISBI48211.2021.9433976⟩
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-
- titre
- How to define a rejection class based on model learning?
- auteur
- Sarah Laroui, Xavier Descombes, Aurélia Vernay, Florent Villiers, François Villalba, Eric Debreuve
- article
- ICPR 2020 – 25th International Conference on Pattern Recognition, Jan 2021, Milan / Virtual, Italy. ⟨10.1109/ICPR48806.2021.9412381⟩
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-
Theses
- titre
- Classification et modélisation de la croissance du champignon Botrytis cinerea à partir d’imagerie microscopique : vers l’établissement de liens entre phénotypes et molécules antifongiques
- auteur
- Sarah Laroui
- article
- Traitement du signal et de l’image [eess.SP]. Université Côte d’Azur, 2021. Français. ⟨NNT : 2021COAZ4086⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Residual whiteness principle for automatic parameter selection in $\ell_2$-$\ell_2$ image super-resolution problems
- auteur
- Monica Pragliola, Luca Calatroni, Alessandro Lanza, Fiorella Sgallari
- article
- 2021
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-
2020
Journal articles
- titre
- New Insights on the Optimality Conditions of the l2-l0 Minimization Problem
- auteur
- Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2020, Special Issue on Memory of Mila Nikolova, 62, pp.808-824. ⟨10.1007/s10851-019-00917-9⟩
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-
- titre
- Contact area-dependent cell communication and the morphological invariance of ascidian embryogenesis
- auteur
- Léo Guignard, Ulla-Maj Fiuza, Bruno Leggio, Julien Laussu, Emmanuel Faure, Gaël Michelin, Kilian Biasuz, Lars Hufnagel, Grégoire Malandain, Christophe Godin, Patrick Lemaire
- article
- Science, 2020, 369 (6500), pp.158. ⟨10.1126/science.aar5663⟩
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-
- titre
- Cortical-inspired Wilson-Cowan-type equations for orientation-dependent contrast perception modelling
- auteur
- Marcelo Bertalmio, Luca Calatroni, Valentina Franceschi, Benedetta Franceschiello, Dario Prandi
- article
- Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2020, ⟨10.1007/s10851-020-00960-x⟩
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-
- titre
- New $L_2$−$L_0$ algorithm for single-molecule localization microscopy
- auteur
- Arne Bechensteen, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- Biomedical optics express, 2020, 11 (2), pp.1153. ⟨10.1364/BOE.381666⟩
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-
- titre
- Visual illusions via neural dynamics: Wilson-Cowan-type models and the efficient representation principle
- auteur
- Marcelo Bertalmio, Luca Calatroni, Valentina Franceschi, Benedetta Franceschiello, Alexander Gomez-Villa, Dario Prandi
- article
- Journal of Neurophysiology, 2020, 123 (5), pp.1606-1618. ⟨10.1152/jn.00488.2019⟩
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-
- titre
- Variational Osmosis for Non-linear Image Fusion
- auteur
- Simone Parisotto, Luca Calatroni, Aurélie Bugeau, Nicolas Papadakis, Carola-Bibiane Schönlieb
- article
- IEEE Transactions on Image Processing, 2020, 29, pp.5507-5516
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-
Conference papers
- titre
- Hough Transform and Image Processing: An Application to Neolithic Pottery
- auteur
- Vanna Lisa Coli, Didier Binder, Laure Blanc-Féraud, Serge X. Cohen, Louise Gomart, Juliette Leblond
- article
- IS 2020 – SIAM Conference on Imaging Science, Jul 2020, Virtual, Canada
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-
Theses
- titre
- Constrained L2-L0 optimization and its application to Single-Molecule
- auteur
- Arne Bechensteen
- article
- Signal and Image Processing. Université Côte d’Azur, 2020. English. ⟨NNT : 2020COAZ4068⟩
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-
- titre
- Characterization of fibronectin networks using graph-based representations of the fibers from 2D confocal images
- auteur
- Anca-Ioana Grapa
- article
- Signal and Image processing. Université Côte d’Azur, 2020. English. ⟨NNT : 2020COAZ4031⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- On the inverse Potts functional for single-image super-resolution problems
- auteur
- Pasquale Cascarano, Luca Calatroni, Elena Loli Piccolomini
- article
- 2020
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-
2019
Journal articles
- titre
- 3D analysis of the whole subcutaneous adipose tissue reveals a complex spatial network of interconnected lobules with heterogeneous browning ability
- auteur
- Jules Dichamp, Corinne Barreau, Christophe Guissard, Audrey Carrière, Yves Martinez, Xavier Descombes, Luc Penicaud, Jacques Rouquette, Louis Casteilla, Franck Plouraboué, Anne Lorsignol
- article
- Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-43130-9⟩
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-
- titre
- Nanometric axial resolution of fibronectin assembly units achieved with an efficient reconstruction approach for multi-angle-TIRF microscopy
- auteur
- Emmanuel Soubies, Agata Radwanska, Dominique Grall, Laure Blanc-Féraud, Ellen van Obberghen-Schilling, Sébastien Schaub
- article
- Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-018-36119-3⟩
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-
- titre
- Gelfond-Zhang aggregates as propositional formulas
- auteur
- Pedro Cabalar, Jorge Fandinno, Torsten Schaub, Sebastian Schellhorn
- article
- Artificial Intelligence, 2019, 274, pp.26-43. ⟨10.1016/j.artint.2018.10.007⟩
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-
- titre
- Detecting and quantifying stress granules in tissues of multicellular organisms with the Obj.MPP analysis tool
- auteur
- Fabienne de Graeve, Eric Debreuve, Somia Rahmoun, Szilvia Ecsedi, Alia Bahri, Arnaud Hubstenberger, Xavier Descombes, Florence Besse
- article
- Traffic, 2019, ⟨10.1111/tra.12678⟩
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-
- titre
- Detection of Simulated Brain Strokes Using Microwave Tomography
- auteur
- Vanna Lisa Coli, Pierre-Henri Tournier, Victorita Dolean-Maini, Ibtissam El Kanfoud, Christian Pichot, Claire Migliaccio, Laure Blanc-Féraud
- article
- IEEE Journal of Electromagnetics, RF and Microwaves in Medicine and Biology, 2019, 1, pp.1. ⟨10.1109/JERM.2019.2921076⟩
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-
Conference papers
- titre
- A study on tensor and matrix models for super-resolution fluorescence microscopy
- auteur
- José Henrique de Morais Goulart, Laure Blanc-Féraud, Eric Debreuve, Sébastien Schaub
- article
- CAMSAP 2019 – IEEE International Workshop on Computational Advances in Multi-Sensor Adaptive Processing, Dec 2019, Le Gosier, Guadeloupe
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-
- titre
- Détection et modélisation des réseaux poreux dans les céramiques néolithiques : perspectives pour l’identification des techniques et des usages
- auteur
- Vanna Lisa Coli, Didier Binder, Laure Blanc-Féraud, Serge X. Cohen, Drieu Léa, Louise Gomart, Juliette Leblond
- article
- 2ème Journée Matériaux Université Côte d’Azur, Sep 2019, Sophia Antipolis, France
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-
- titre
- Exact biconvex reformulation of the $L2 − L0$ minimization problem
- auteur
- Arne Bechensteen, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- GRETSI 2019 – 27ème Colloque Francophone de traitement du signal et des images., Aug 2019, Lille, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal Transport vs Many-to-many assignment for Graph Matching
- auteur
- Anca-Ioana Grapa, Laure Blanc-Féraud, Ellen van Obberghen-Schilling, Xavier Descombes
- article
- GRETSI 2019 – XXVIIème Colloque francophone de traitement du signal et des images, Aug 2019, Lille, France
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-
- titre
- On the Local Minimizers of the CEL0 Relaxation
- auteur
- Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- SPARS 2019 – Signal Processing with Adaptive Sparse Structured Representations – Workshop, Jul 2019, Toulouse, France
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-
- titre
- 3D Coronary Vessel Tree Tracking in X-Ray Projections
- auteur
- Emmanuelle Poulain, Grégoire Malandain, Régis Vaillant
- article
- FIMH 2019 – 10th Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2019, Bordeaux, France. pp.388-396, ⟨10.1007/978-3-030-21949-9_42⟩
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-
- titre
- Machine-learning assisted phenotyping: From fungal morphology to mode of action hypothesis
- auteur
- Sarah Laroui, Eric Debreuve, Xavier Descombes, François Villalba, Florent Villiers, Aurélia Vernay
- article
- IUPAC – 14th International Congress of Crop Protection Chemistry, May 2019, Ghent, Belgium
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-
- titre
- New methods for $\ell_2-\ell_0$ minimization and their applications to 2D Single-Molecule Localization Microscopy
- auteur
- Arne Bechensteen, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- ISBI 2019 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. ⟨10.1109/ISBI.2019.8759567⟩
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-
- titre
- An Adaptative Threshold Operator Taking Shape into Account: Application to Mitochondrial Network Segmentation
- auteur
- Kévin Giulietti, Lavisse Guillaume, Aurélie Charazac, Clavel Stéphan, Frédéric Bost, Xavier Descombes
- article
- ISBI 2019 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venise, Italy. ⟨10.1109/ISBI.2019.8759501⟩
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-
- titre
- Improving 3D MA-TIRF Reconstruction with Deconvolution and Background Estimation
- auteur
- Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Sébastien Schaub, Ellen van Obberghen-Schilling
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venise, Italy. ⟨10.1109/ISBI.2019.8759103⟩
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-
- titre
- Modélisation 3D des fabriques et identification des techniques : nouvelles méthodes de segmentation et de reconnaissance de formes
- auteur
- Vanna Lisa Coli, Didier Binder, Laure Blanc-Féraud, Serge X. Cohen, Louise Gomart, Juliette Leblond
- article
- Céramiques imprimées de Méditerranée occidentale. Matières premières, productions, usages, Didier Binder; Stéphane Azoulay; Alain Burr; Claire Manen; Martine Regert; Chrystèle Vérati, Mar 2019, Nice, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Des macro-traces au synchrotron : premiers résultats et enjeux relatifs aux méthodes de montage des céramiques
- auteur
- Louise Gomart, Didier Binder, Laure Blanc-Féraud, Serge X. Cohen, Vanna Lisa Coli, Léa Drieu, Marzia Gabriele, Juliette Leblond, Didier Pisani, Sabine Sorin
- article
- Céramiques imprimées de Méditerranée occidentale. Matières premières, productions, usages, Didier Binder; Stéphane Azoulay; Alain Burr; Claire Manen; Martine Regert; Chrystèle Vérati, Mar 2019, Nice, France
- Accès au bibtex
-
Theses
- titre
- Recalage déformable entre angioscanner cardiaque 3D statique et angiographie coronaire dynamique 2D+t
- auteur
- Emmanuelle Poulain
- article
- Traitement du signal et de l’image [eess.SP]. COMUE Université Côte d’Azur (2015 – 2019), 2019. Français. ⟨NNT : 2019AZUR4068⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Accelerated iterative regularization via dual diagonal descent
- auteur
- Luca Calatroni, Guillaume Garrigos, Lorenzo Rosasco, Silvia Villa
- article
- 2019
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2018
Journal articles
- titre
- A stochastic framework to model axon interactions within growing neuronal populations
- auteur
- Agustina Razetti, Caroline Medioni, Grégoire Malandain, Florence Besse, Xavier Descombes
- article
- PLoS Computational Biology, 2018, 14 (12), pp.e1006627
- Accès au bibtex
-
- titre
- In Toto Imaging and Reconstruction of Post-Implantation Mouse Development at the Single-Cell Level
- auteur
- Katie Mcdole, Léo Guignard, Fernando Amat, Andrew Berger, Grégoire Malandain, Loïc Royer, Srinivas Turaga, Kristin Branson, Philipp Keller
- article
- Cell, 2018, 175 (3), pp.859 – 876.e33. ⟨10.1016/j.cell.2018.09.031⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- New objective measurements of semen wave motion are associated with fertility in sheep
- auteur
- Ingrid David, Philippa L. Kohnke, Jérôme Fehrenbach, Ana Rita Lopes Simoes, Eric Debreuve, Xavier Descombes, Franck Plouraboué, Pierre Degond, Xavier Druart
- article
- Reproduction, Fertility and Development, 2018, 30 (6), pp.889-896. ⟨10.1071/RD17472⟩
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-
Conference papers
- titre
- Single molecule localization by $\ell_2-\ell_0$ constrained optimization
- auteur
- Arne Bechensteen, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- iTWIST’18, Nov 2018, Marseille, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Céramiques imprimées de Méditerranée occidentale: apports de la micro-tomographie à la restitution des traditions céramiques en contexte archéologique
- auteur
- Vanna Lisa Coli, Louise Gomart, Didier Binder, Laure Blanc-Féraud, Serge Cohen, Juliette Leblond
- article
- Journée d’échanges “Applications de la tomographie par rayons X”, Réseau Tomo3D, CNRS-INEE, Muséum National d’Histoire Naturelle, Nov 2018, Paris, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Detection of Brain Strokes Using Microwave Tomography
- auteur
- Vanna Lisa Coli, Pierre-Henri Tournier, Victorita Dolean, Ibtissam El Kanfoud, Christian Pichot, Claire Migliaccio, Laure Blanc-Féraud
- article
- IEEE 2018 – International Symposium on Antennas and Propagation and USNC-URSI Radio Science Meeting, Jul 2018, Boston, United States. pp.223-224, ⟨10.1109/APUSNCURSINRSM.2018.8609404⟩
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-
- titre
- SPADE: A Small Particle Detection Method Using A Dictionary Of Shapes Within The Marked Point Process Framework
- auteur
- Nicolas Cedilnik, Eric Debreuve, Fabienne de Graeve, Florence Besse, Xavier Descombes
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2018, Washington, DC, United States
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-
- titre
- Classification of the fibronectin variants with curvelets
- auteur
- Anca-Ioana Grapa, Raphael Meunier, Laure Blanc-Féraud, Georgios Efthymiou, Sébastien Schaub, Agata Radwanska, Ellen van Obberghen-Schilling, Xavier Descombes
- article
- ISBI 2018 – IEEE 15th International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington, DC, United States. pp. 930-933, ⟨10.1109/ISBI.2018.8363723⟩
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-
- titre
- Intensity-based matching and registration for 3D correlative microscopy with large discrepancies
- auteur
- Bertha Mayela Toledo Acosta, Xavier Heiligenstein, Grégoire Malandain, Patrick Bouthemy
- article
- ISBI 2018 – IEEE 15th International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington, United States. pp.493-496, ⟨10.1109/ISBI.2018.8363623⟩
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-
- titre
- Multiscale Tomography – Imaging and Modelling Ancient Materials
- auteur
- Vanna Lisa Coli, Didier Binder, Laure Blanc-Féraud, Serge Cohen, Louise Gomart, Juliette Leblond
- article
- Journées du Programme structurant UCA-JEDI “Matière, Lumière, Interactions”, 2018, Villa Clythia de Fréjus, France, France
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-
Poster communications
- titre
- An image based high throughput screen to identify regulators of Imp containing RNP granules
- auteur
- Fabienne de Graeve, Somia Rahmoun, Djampa Kozlowski, Nicolas Cedilnik, Eric Debreuve, Xavier Descombes, Florence Besse
- article
- 32nd French Drosophila Meeting, Oct 2018, Hyères, France
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-
- titre
- SPADE: A Small Particle Detection Method Using A Dictionary Of Shapes Within The Marked Point Process Framework
- auteur
- Nicolas Cedilnik, Eric Debreuve, Fabienne de Graeve, Florence Besse, Xavier Descombes
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2018, Washington, DC, United States
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-
Theses
- titre
- Modelling and characterizing axon growth from in vivo data
- auteur
- Agustina Razetti
- article
- Signal and Image processing. COMUE Université Côte d’Azur (2015 – 2019), 2018. English. ⟨NNT : 2018AZUR4016⟩
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-
2017
Journal articles
- titre
- Simple mechanical cues could explain adipose tissue morphology
- auteur
- Diane Peurichard, Fanny Delebecque, Anne Lorsignol, Corinne Barreau, Jacques Rouquette, Xavier Descombes, Louis Casteilla, Pierre Degond
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2017, 429, pp.61-81. ⟨10.1016/j.jtbi.2017.06.030⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- A comparison of edge-preserving approaches for differential interference contrast microscopy
- auteur
- Simone Rebegoldi, Lola Bautista, Laure Blanc-Féraud, Marco Prato, Luca Zanni, Arturo Plata
- article
- Inverse Problems, 2017, ⟨10.1088/1361-6420/aa790a⟩
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-
- titre
- Planar cell polarity genes frizzled4 and frizzled6 exert patterning influence on arterial vessel morphogenesis
- auteur
- Rene Markovič, Julien Peltan, Marko Gosak, Denis Horvat, Borut Žalik, Benjamin Séguy, Rémi Chauvel, Grégoire Malandain, Thierry Couffinhal, Cécile Duplàa, Marko Marhl, Etienne Roux
- article
- PLoS ONE, 2017, 12 (3), pp.e0171033. ⟨10.1371/journal.pone.0171033⟩
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-
- titre
- Photometric Stereo with Only Two Images: A Theoretical Study and Numerical Resolution
- auteur
- Yvain Quéau, Roberto Mecca, Jean-Denis Durou, Xavier Descombes
- article
- Image and Vision Computing, 2017, 57, pp.175–191. ⟨10.1016/j.imavis.2016.11.006⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Unified View of Exact Continuous Penalties for l2-l0 Minimization
- auteur
- Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- SIAM Journal on Optimization, 2017, 27 (3), ⟨10.1137/16M1059333⟩
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-
Conference papers
- titre
- Suivi temporel 3D de vaisseaux coronaires dans les projections rayons X
- auteur
- Emmanuelle Poulain, Grégoire Malandain, Régis Vaillant
- article
- GRETSI, Sep 2017, Juan-Les-Pins, France
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-
- titre
- Quelles relaxations continues pour le critère $l2-l0$ ?
- auteur
- Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- Colloque Gretsi, Sep 2017, Juan-Les-Pins, France. pp.4
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Quantitative image based analysis of endocrine disruptor effects on mitochondria morphology-function in prostate cancer cells
- auteur
- Aurélie Charazac, Célia Decondé Le Butor, Kévin Giulietti, Jean-Marc A. Lobaccaro, Silvère Baron, Jérôme Gilleron, Patrick Fenichel, Xavier Descombes, Frédéric Bost, Clavel Stéphan, Nicolas Chevalier
- article
- International Congress of Translational Research in Human Nutrition, Jun 2017, Clermont-Ferrand, France
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-
- titre
- 3D Coronary vessel tracking in x-ray projections
- auteur
- Emmanuelle Poulain, Grégoire Malandain, Régis Vaillant
- article
- International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart (FIMH), Jun 2017, Toronto, Canada. pp.204-215, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_20⟩
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-
- titre
- Modelling collective axon growth from in vivo data reveals the importance of physical axon-axon interactions
- auteur
- Agustina Razetti, Caroline Medioni, Grégoire Malandain, Florence Besse, Xavier Descombes
- article
- Rencontre C@UCA 2017, Jun 2017, Fréjus, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modeling collective axon growth from in vivo data reveals the importance of physical axon-axon interactions
- auteur
- Agustina Razetti, Caroline Medioni, Grégoire Malandain, Florence Besse, Xavier Descombes
- article
- Cell biology of the neuron: Polarity, plasticity and regeneration, EMBO, May 2017, Heraklion, Greece
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- High density molecule localization for super-resolution microscopy using CEL0 based sparse approximation
- auteur
- Simon Gazagnes, Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud
- article
- ISBI 2017 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2017, Melbourne, Australia. pp.4, ⟨10.1109/ISBI.2017.7950460⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Coherent temporal extrapolation of labeled images
- auteur
- Grégoire Malandain, Gaël Michelin
- article
- ISBI 2017 – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2017, Melbourne, Australia. pp.433 – 436, ⟨10.1109/ISBI.2017.7950554⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- A Stochastic Framework for Neuronal Morphological Comparison: Application to the Study of imp Knockdown Effects in Drosophila Gamma Neurons
- auteur
- Agustina Razetti, Xavier Descombes, Caroline Medioni, Florence Besse
- article
- Ana Fred; Hugo Gamboa. Biomedical Engineering Systems and Technologies, 690, Springer, pp.145-166, 2017, CCIS, ⟨10.1007/978-3-319-54717-6_9⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Other publications
- titre
- Contact-dependent cell communications drive morphological invariance during ascidian embryogenesis
- auteur
- Léo Guignard, Ulla-Maj Fiuza, Bruno Leggio, Emmanuel Faure, Julien Laussu, Lars Hufnagel, Grégoire Malandain, Christophe Godin, Patrick Lemaire
- article
- 2017, ⟨10.1101/238741⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Poster communications
- titre
- Quantitative image based analysis of endocrine disruptor effects on mitochondria morphology-function in prostate cancer cells.
- auteur
- Aurélie Charazac, Célia Decondé Le Butor, Mamadou Gueye, Jérôme Gilleron, Kévin Giuletti, Maeva Gesson, Patrick Fénichel, Xavier Descombes, Frédéric Bost, Stéphan Clavel, Nicolas Chevalier
- article
- ECE 2017 – European Congress of Endocrinology, May 2017, Lisbonne, Portugal. pp.1, 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Quantitative image based analysis of endocrine disruptor effects on mitochondria morphology‐function in prostate cancer cells.
- auteur
- Aurélie Charazac, Célia Decondé Le Butor, Mamadou Gueye, Jérôme Gilleron, Kévin Giuletti, Maeva Gesson, Patrick Fénichel, Xavier Descombes, Frédéric Bost, Stéphan Clavel, Nicolas Chevalier
- article
- Signalife, May 2017, Nice, France. pp.1
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-
Theses
- titre
- Phase estimation for Differential Interference Contrast microscopy
- auteur
- Lola Xiomara Bautista Rozo
- article
- Other. Université Côte d’Azur, 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4045⟩
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-
2016
Journal articles
- titre
- ERRATUM: A Continuous Exact l0 penalty (CEL0) for least squares regularized problem
- auteur
- Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- SIAM Journal on Imaging Sciences, 2016, 9 (1), pp.490-494. ⟨10.1137/15M1038384⟩
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-
- titre
- Multiple objects detection in biological images using a marked point process framework
- auteur
- Xavier Descombes
- article
- Methods, 2016, ⟨10.1016/j.ymeth.2016.09.009⟩
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-
Conference papers
- titre
- Accelerated gradient-based methods for phase estimation in differential-interference-contrast microscopy
- auteur
- Simone Rebegoldi, Lola Bautista, Laure Blanc-Féraud, Marco Prato, Luca Zanni, Arturo Plata
- article
- SIMAI 2016: Società Italiana di Matematica Aplicata e Industriale, Sep 2016, Milan, Italy
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-
- titre
- An efficient gradient-based method for differential-interference-contrast microscopy
- auteur
- Simone Rebegoldi, Lola Bautista, Marco Prato, Luca Zanni, Laure Blanc-Féraud, Arturo Plata
- article
- NUMTA 2016: Numerical Computations: Theory and Algorithms, Jun 2016, Calabria, Italy
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-
- titre
- Is the Vascular Network Discriminant Enough to Classify Renal Cell Carcinoma?
- auteur
- Alexis Zubiolo, Eric Debreuve, Damien Ambrosetti, Philippe Pognonec, Xavier Descombes
- article
- CBMI 2016 – International Workshop on Content-based Multimedia Indexing, Jun 2016, Bucarest, Romania. ⟨10.1109/CBMI.2016.7500255⟩
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-
- titre
- Some results on sparse L2-L0 reconstruction: Continuous Exact L0 penalties
- auteur
- Laure Blanc-Féraud, Emmanuel Soubies, Gilles Aubert
- article
- Workshop ATLAS on mathematical and algorithmimcal approaches for high dimensional problems in data sciences. , GdR MaDICS, May 2016, Grenoble, France
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-
- titre
- Some results on sparse L2-L0 reconstruction: Continuous Exact L0 penalties
- auteur
- Laure Blanc-Féraud, Emmanuel Soubies, Gilles Aubert
- article
- NCMIP 2016 – New Computational Methods for Inverse Problem , ENS Cachan, Apr 2016, Cachan, France
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-
- titre
- Phase Estimation in Differential-Interference-Contrast (DIC) Microscopy
- auteur
- Lola Bautista, Simone Rebegoldi, Laure Blanc-Féraud, Marco Prato, Luca Zanni, Arturo Plata
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2016, Prague, Czech Republic. pp.136-139
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-
- titre
- A Framework for Multi-angle Tirf Microscope Calibration
- auteur
- Emmanuel Soubies, Sébastien Schaub, Agata Radwanska, Ellen van Obberghen-Schilling, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2016, Prague, Czech Republic. pp.4, ⟨10.1109/ISBI.2016.7493355⟩
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-
- titre
- Spatio-temporal registration of 3D microscopy image sequences of Arabidopsis floral meristems
- auteur
- Gaël Michelin, Yassin Refahi, Raymond Wightman, Henrik Jönsson, Jan J. Traas, Christophe Godin, Grégoire Malandain
- article
- ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2016, Prague, Czech Republic. pp.4, ⟨10.1109/ISBI.2015.7163872⟩
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-
- titre
- Statistical Characterization, Modelling and Classification of Morphological Changes in imp Mutant Drosophila Gamma Neurons
- auteur
- Agustina Razetti, Xavier Descombes, Caroline Medioni, Florence Besse
- article
- BIOSTEC 2016 – The 9h International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, Feb 2016, Rome, Italy
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-
Poster communications
- titre
- Optimization methods for phase estimation in differential-interference-contrast (DIC) microscopy
- auteur
- Simone Rebegoldi, Lola Bautista, Laure Blanc-Féraud, Marco Prato, Luca Zanni, Arturo Plata
- article
- Workshop on Optimization Techniques for Inverse Problems III, Sep 2016, Modena, Italy
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-
Theses
- titre
- Outils d’analyse d’images et recalage d’individus pour l’étude de la morphogenèse animale et végétale
- auteur
- Gaël Michelin
- article
- Autre. Université Côte d’Azur, 2016. Français. ⟨NNT : 2016AZUR4088⟩
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-
- titre
- Sur quelques problèmes de reconstruction en imagerie MA-TIRF et en optimisation parcimonieuse par relaxation continue exacte de critères pénalisés en norme-l0
- auteur
- Emmanuel Soubies
- article
- Autre. Université Côte d’Azur, 2016. Français. ⟨NNT : 2016AZUR4082⟩
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-
2015
Journal articles
- titre
- Age-related changes in FDG brain uptake are more accurately assessed when applying an adaptive template to the SPM method of voxel-based quantitative analysis
- auteur
- Axel van Der Gucht, Antoine Verger, Eric Guedj, Grégoire Malandain, Gabriela Hossu, Yalcin Yagdigul, Véronique Roch, Sylvain Poussier, Louis Maillard, Gilles Karcher, Pierre-Yves Marie
- article
- Annals of Nuclear Medicine, 2015, 29 (10), pp.921-928. ⟨10.1007/s12149-015-1022-2⟩
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-
- titre
- A Continuous Exact l0 penalty (CEL0) for least squares regularized problem
- auteur
- Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- SIAM Journal on Imaging Sciences, 2015, 8 (3), pp. 1607-1639 (33 p.). ⟨10.1137/151003714⟩
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-
- titre
- From Curves to Trees: A Tree-like Shapes Distance Using the Elastic Shape Analysis Framework
- auteur
- Alejandro Mottini, Xavier Descombes, Florence Besse
- article
- Neuroinformatics, 2015, 13 (2), pp.175-191. ⟨10.1007/s12021-014-9255-0⟩
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-
- titre
- A tree-topology preserving pairing for 3D/2D registration
- auteur
- Thomas Benseghir, Grégoire Malandain, Régis Vaillant
- article
- International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, 2015, 10 (6), pp.913-923. ⟨10.1007/s11548-015-1207-0⟩
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-
Conference papers
- titre
- L0-Optimization for Channel and DOA Sparse Estimation
- auteur
- Adilson Chinatto, Emmanuel Soubies, Cynthia Junqueira, Joâo M. T. Romano, Pascal Larzabal, Jean-Pierre Barbot, Laure Blanc-Féraud
- article
- International Workshop on Computational Advances in Multi-Sensor Adaptive Processing (CAMSAP), Dec 2015, Cancun, Mexico. pp.305-308, ⟨10.1109/CAMSAP.2015.7383797⟩
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-
- titre
- Geometric Analysis of Axonal Tree Structures
- auteur
- Alan Duncan, Eric Klassen, Xavier Descombes, Srivastava Anuj
- article
- DIFF-CV 2015 – Proceedings of the 1st International Workshop on DIFFerential Geometry in Computer Vision for Analysis of Shapes, Images and Trajectories, Oct 2015, Swansea, United Kingdom
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-
- titre
- A framework for creating population specific multimodal brain atlas using clinical T1 and diffusion tensor images
- auteur
- Vikash Gupta, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
- article
- MICCAI 2015 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI’15), Oct 2015, Munich, Germany. pp.99-108, ⟨10.1007/978-3-319-28588-7_9⟩
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-
- titre
- Gradient-Based Phase Estimation in Differential Interference Contrast (DIC) Microscopy
- auteur
- Lola Bautista, Laure Blanc-Féraud, Simone Rebegoldi, Marco Prato, Luca Zanni, Arturo Plata
- article
- Assemblée générale ; interférences d’ondes, GdR Ondes, Sep 2015, lyon, France
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-
- titre
- Seuillage CEL0 pour la minimisation l2- l0 : comparaisons avec IHT
- auteur
- Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- Colloque Gretsi, Sep 2015, Lyon, France. pp.4
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-
- titre
- Comment retrouver une constellation dans la galaxie ?
- auteur
- Alexis Zubiolo, Kawssar Harb, Michèle Studer, Eric Debreuve, Xavier Descombes
- article
- Colloque Gretsi, Sep 2015, Lyon, France. pp.4
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-
- titre
- Morphological Analysis and Feature Extraction of Neurons from Mouse Cortices Multiscale 3D Microscopic Images
- auteur
- Alexis Zubiolo, Kawssar Harb, Michèle Studer, Eric Debreuve, Xavier Descombes
- article
- 37th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC 2015), IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBS), Aug 2015, Milan, Italy. ⟨10.1109/EMBC.2015.7320118⟩
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-
- titre
- CEL0: a continuous alternative to l0 penalty
- auteur
- Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- Signal Processing with Adaptive Sparse Structured Representations (SPARS), Jul 2015, Cambridge, United Kingdom
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-
- titre
- Que peut-on apprendre d’une scène vue par une webcam à partir d’images prises au cours d’une journée ensoleillée ?
- auteur
- Yvain Quéau, Jean-Denis Durou, Xavier Descombes
- article
- Journées francophones des jeunes chercheurs en vision par ordinateur, Jun 2015, Amiens, France. pp.8
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-
- titre
- Quantitative comparison of micro-vasculatures
- auteur
- Manon Linder, Cecile Duplaa, Thierry Couffinhal, Grégoire Malandain
- article
- ISBI 2015 – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2015, Brooklyn, United States
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-
- titre
- Motion compensation in two-photon microscopy temporal series
- auteur
- Caroline Medioni, Florence Besse, Xavier Descombes, Grégoire Malandain
- article
- International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, Brooklyn, United States. pp.4, ⟨10.1109/ISBI.2015.7164182⟩
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-
- titre
- Cells Detection Using Segmentation Competition
- auteur
- Emmanuelle Poulain, Sylvain Prigent, Emmanuel Soubies, Xavier Descombes
- article
- ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2015, Brooklyn, United States. ⟨10.1109/ISBI.2015.7164090⟩
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-
- titre
- Detection and Tracking of Golgi Outposts in Microscopy Data
- auteur
- Huei-Fang Yang, Chu-Song Chen, Xavier Descombes
- article
- ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2015, Brooklyn, New York, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Cell Pairings for Ascidian Embryo Registration
- auteur
- Gaël Michelin, Léo Guignard, Ulla-Maj Fiuza, Patrick Lemaire, Christophe Godin, Grégoire Malandain
- article
- ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE). USA., Apr 2015, New York, United States. ⟨10.1109/ISBI.2015.7163872⟩
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-
Book sections
- titre
- Graph Cut Based Segmentation of Predefined Shapes: Applications to Biological Imaging
- auteur
- Emmanuel Soubies, Pierre Weiss, Xavier Descombes
- article
- Pattern Recognition Applications and Methods., 318, Springer-Verlag, pp.153-170, 2015, Advances in Intelligent Systems and Computing, 978-3-319-12610-4. ⟨10.1007/978-3-319-12610-4_10⟩
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-
Reports
- titre
- From extraction of physiological features with dynamic µ-SPECT imaging to modelling of iodide biodistribution in stomach
- auteur
- Marine Breuilly, Kaouthar Chatti, Jacques Darcourt, Philippe Franken, Julien Guglielmi, Grégoire Malandain, Thierry Pourcher
- article
- [Research Report] Inria Sophia Antipolis. 2015
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Assessing skin lesion evolution from multispectral image sequences
- auteur
- Sylvain Prigent, Xavier Descombes, Didier Zugaj, Laurent Petit, Anne-Sophie Dugaret, Philippe Martel, Josiane Zerubia
- article
- [Research Report] RR-8745, Inria Sophia Antipolis; INRIA. 2015
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-
Theses
- titre
- Extraction de caractéristiques et apprentissage statistique pour l’imagerie biomédicale cellulaire et tissulaire
- auteur
- Alexis Zubiolo
- article
- Autre. Université Nice Sophia Antipolis, 2015. Français. ⟨NNT : 2015NICE4117⟩
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-
2014
Journal articles
- titre
- Assessing the ability of the 2D Fisher-KPP equation to model cell-sheet wound closure
- auteur
- Abderrahmane Habbal, Hélène Barelli, Grégoire Malandain
- article
- Mathematical Biosciences, 2014, 252, pp.45-59
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-
- titre
- Space Variant Blind Image Restoration
- auteur
- Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- SIAM Journal on Imaging Sciences, 2014, 7, pp.2196 – 2225. ⟨10.1137/130945776⟩
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-
Conference papers
- titre
- Sparse reconstruction from Multiple-Angle Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy
- auteur
- Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Sébastien Schaub, Gilles Aubert
- article
- ICIP – International Conference on Image Processing, Oct 2014, Paris, France. pp.2844 – 2848, ⟨10.1109/ICIP.2014.7025575⟩
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-
- titre
- Discrete Stochastic Model for the Generation of Axonal Trees
- auteur
- Alejandro Mottini, Xavier Descombes, Florence Besse, Eugene Pechersky
- article
- EMBC 2014, Aug 2014, Chicago, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Spatio-temporal registration of embryo images
- auteur
- Léo Guignard, Christophe Godin, Ulla-Maj Fiuza, Lars Hufnagel, Patrick Lemaire, Grégoire Malandain
- article
- ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Pekin, China
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Embryo Cell Membranes Reconstruction by Tensor Voting
- auteur
- Gaël Michelin, Léo Guignard, Ulla-Maj Fiuza, Grégoire Malandain
- article
- ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Beijing, China. ⟨10.1109/ISBI.2014.6868105⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Axonal Tree Classification Using an Elastic Shape Analysis Based Distance
- auteur
- Alejandro Mottini, Xavier Descombes, Florence Besse
- article
- ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Beijing, China. ⟨10.1109/ISBI.2014.6868004⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- A 3D model with shape prior information for biological structures reconstruction using Multiple-Angle Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy
- auteur
- Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Sébastien Schaub, Gilles Aubert
- article
- ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Beijing, China. pp.608 – 611, ⟨10.1109/ISBI.2014.6867944⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Head Tracking and Flagellum Tracing for Sperm Motility Analysis
- auteur
- Huei-Fang Yang, Xavier Descombes, Sylvain Prigent, Grégoire Malandain, Xavier Druart, Franck Plouraboué
- article
- ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Beijing, China. ⟨10.1109/ISBI.2014.6867871⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Recursive Approach For Multiclass Support Vector Machine: Application to Automatic Classification of Endomicroscopic Videos
- auteur
- Alexis Zubiolo, Barbara André, Eric Debreuve, Grégoire Malandain
- article
- VISAPP – International Conference on Computer Vision Theory and Applications, Jan 2014, Lisbon, Portugal
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- Markov Models and MCMC Algorithms in Image Processing
- auteur
- Xavier Descombes
- article
- Rama Chelappa. Academic Press Library in Signal Processing, 4, Elsevier Ltd, 2014, Image, Video Processing and Analysis, Hardware, Audio, Acoustic and Speech 978-0-12-396501-1
- Accès au bibtex
-
Theses
- titre
- Axonal morphology analysis : from image processing to modelling
- auteur
- Alejandro Ricardo Mottini d’Oliveira
- article
- Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2014. English. ⟨NNT : 2014NICE4066⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2013
Journal articles
- titre
- Amplitude-based data selection for optimal retrospective reconstruction in micro-SPECT
- auteur
- Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Julien Guglielmi, Robert Marsault, Thierry Pourcher, Philippe R. Franken, Jacques Darcourt
- article
- Physics in Medicine and Biology, 2013, 58 (8), pp.2657-2674. ⟨10.1088/0031-9155/58/8/2657⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Analysis of a new variational model to restore point-like and curve-like singularities in imaging
- auteur
- Gilles Aubert, Laure Blanc-Féraud, Daniele Graziani
- article
- Applied Mathematics and Optimization, 2013, 67, pp.73-96
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Mechanical properties of the plasma membrane of micropatterned cells incubated with mono or polyunsaturated fatty acids
- auteur
- Hélène Barelli, M. Pinot, Thierry Ferreira, Grégoire Malandain, Xavier Descombes, Bruno Goud, Bruno Antonny
- article
- American Society for Cell Biology (ASCB) Annual Meeting, Dec 2013, New Orleans, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Multi-scale analysis of skin hyper-pigmentation evolution
- auteur
- Sylvain Prigent, Xavier Descombes, Didier Zugaj, Laurent Petit, Josiane Zerubia
- article
- ICIP – International Conf. on Image Processing, Sep 2013, Melbourne, Australia
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Tree-like Shapes Distance Using the Elastic Shape Analysis Framework
- auteur
- Alejandro Mottini, Xavier Descombes, Florence Besse
- article
- BMVC – British Machine Vision Conference, Sep 2013, Bristol, United Kingdom
- Accès au bibtex
-
- titre
- Restauration aveugle d’image 3D de microscopie de fluorescence avec prise en compte des aberrations sphériques et contrainte de phase
- auteur
- Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud, Engler Gilbert
- article
- Colloque Gretsi, Sep 2013, Brest, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimisation jointe de la chaîne codage/débruitage pour les images satellite
- auteur
- Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud, Marc Antonini, Carole Thiebaut, Christophe Latry, Yves Bobichon
- article
- GRETSI, Sep 2013, Brest, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Iterative Closest Curve: a Framework for Curvilinear Structure Registration Application to 2D/3D Coronary Arteries Registration
- auteur
- Thomas Benseghir, Grégoire Malandain, Régis Vaillant
- article
- MICCAI – Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.179-186, ⟨10.1007/978-3-642-40811-3_23⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modeling cell sheet wound closure
- auteur
- Abderrahmane Habbal, Hélène Barelli, Grégoire Malandain
- article
- Applied Mathematics, Modeling and Computational Science (AMMCS), Wilfrid Laurier University with AIMS and SIAM, Aug 2013, Waterloo, Ontario, Canada
- Accès au bibtex
-
- titre
- Blind restoration of confocal microscopy images in presence of a depth-variant blur and Poisson noise
- auteur
- Laure Blanc-Féraud, Saima Ben Hadj, Gilles Aubert
- article
- Journées thématiques, GdR Microscopie foncitonnelle du vivant, Jul 2013, Paris, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Blind restoration of confocal microscopy images in presence of a depth-variant blur and Poisson noise
- auteur
- Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert, Engler Gilbert
- article
- ICASSP – International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing, May 2013, Vancouver, Canada
- Accès au bibtex
-
- titre
- ML estimation of wavelet regularization hyperparameters in inverse problems
- auteur
- Roberto Cavicchioli, Caroline Chaux, Laure Blanc-Féraud, Luca Zanni
- article
- ICASSP – International Conference on Acoustics, Speech, and Signal Processing, May 2013, Vancouver, Canada. pp.1553-1557
- Accès au bibtex
-
- titre
- Depth-variant blind restoration with pupil-phase constraints for 3D confocal microscopy
- auteur
- Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud, Engler Gilbert
- article
- 3rd International Workshop on New Computational Methods for Inverse Problems, May 2013, Paris, France. ⟨10.1088/1742-6596/464/1/012009⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Blind depth-variant blur removal in confocal microscopy
- auteur
- Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert, Gilbert Engler, Elie Maalouf, Bruno Colicchio, Alain Dieterlen
- article
- ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San Francisco, United States. ⟨10.1109/ISBI.2013.6556438⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Image-based motion detection in 4D images and application to respiratory motion suppression
- auteur
- Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Julien Guglielmi, Thierry Pourcher, Philippe R. Franken, Jacques Darcourt
- article
- ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.792-795, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556597⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Automatic dendrite spines detection from X-ray tomography volumes
- auteur
- Xavier Descombes, Grégoire Malandain, Caroline Fonta, Lazlo Negyessy, Rajmund Mosko
- article
- ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San fancisco, United States. ⟨10.1109/ISBI.2013.6556505⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A 3D segmentation algorithm for ellipsoidal shapes. Application to nuclei extraction.
- auteur
- Emmanuel Soubiès, Pierre Weiss, Xavier Descombes
- article
- ICPRAM – International Conference on Pattern Recognition Applications and Methods, Feb 2013, Barcelona, Spain. pp.97-105
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An efficient optimizer for simple point process models
- auteur
- Ahmed Gamal Eldin, Guillaume Charpiat, Xavier Descombes, Josiane Zerubia
- article
- SPIE, Computational Imaging XI, Feb 2013, Burlingame, California, United States. ⟨10.1117/12.2009238⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimisation joint pour le codage/débruitage d’images bruitées
- auteur
- Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud, Marc Antonini, Carole Thiébaut, Christophe Latry, Yves Bobichon
- article
- GRETSI, 2013, Brest, France
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- Deconvolution and denoising for computational microscopy
- auteur
- Praveen Pankajakshan, Gilbert Engler, Laure Blanc-Féraud, Josiane Zerubia
- article
- F. Cazals, P. kornprobst. Modeling in Computational Biology and Biomedecine. A Multidisciplinary Endeavor, XXVI, Springer, pp.117-164, 2013
- Accès au bibtex
-
Books
- titre
- 3rd international Workshop on New Computational Methods for Inverse Problems (NCMIP 2013)
- auteur
- Laure Blanc-Féraud, Pierre-Yves Joubert
- article
- Blanc-Féraud,Laure and Joubert,Pierre-Yves. IOP Publishing, 464, 2013, Journal of Physics: Conference Series
- Accès au bibtex
-
Reports
- titre
- Joint coding-denoising optimization of noisy images
- auteur
- Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud, Marc Antonini, Carole Thiebaut, Christophe Latry, Yves Bobichon
- article
- [Research Report] I3S. 2013
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- On the optimization of the satellite imaging chain
- auteur
- Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud, Marc Antonini, Carole Thiebaut, Christophe Latry, Yves Bobichon
- article
- [Research Report] I3S. 2013
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Theses
- titre
- Restauration d’images 3D de microscopie de fluorescence en présence d’aberrations optiques
- auteur
- Saïma Ben Hadj
- article
- Autre. Université Nice Sophia Antipolis, 2013. Français. ⟨NNT : 2013NICE4015⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2012
Journal articles
- titre
- Voxel-based quantitative analysis of brain images from F-18 Fluorodeoxyglucose Positron Emission Tomography with a Block-Matching algorithm for spatial normalization
- auteur
- Christophe Person, Valérie Louis-Dorr, Sylvain Poussier, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Louis Maillard, Didier Wolf, Nicolas Gilet, Véronique Roch, Gilles Karcher, Pierre-Yves Marie
- article
- Clinical Nuclear Medicine, 2012, 37 (3), pp.268-273. ⟨10.1097/RLU.0b013e3182443b2d⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Building Development Monitoring in Multitemporal Remotely Sensed Image Pairs with Stochastic Birth-Death Dynamics
- auteur
- Csaba Benedek, Xavier Descombes, Josiane Zerubia
- article
- IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, 2012, 34 (1), pp.33-50. ⟨10.1109/TPAMI.2011.94⟩
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-
- titre
- Sparse Poisson Noisy Image Deblurring
- auteur
- Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud
- article
- IEEE Transactions on Image Processing, 2012, 21 (4), pp.1834-1846
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-
- titre
- Double Annealing Regimes in the Multiple Birth-and-Death Stochastic Algorithms
- auteur
- Elena Zhizhina, Xavier Descombes
- article
- Markov Processes And Related Fields, 2012, 18, pp.441-456
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-
Conference papers
- titre
- Tracking Growing Axons by Particle Filtering in 3D+t Fluorescent Two-Photon Microscopy Images
- auteur
- Huei-Fang Yang, Xavier Descombes, Charles Kervrann, Caroline Medioni, Florence Besse
- article
- ACCV – Asian Conference on Computer Vision, Nov 2012, Daejeon, South Korea
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- titre
- Global rate-distortion optimization of satellite imaging chains
- auteur
- Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud, Marc Antonini, Carole Thiebaut, Christophe Latry, Yves Bobichon
- article
- On-Board Payload Data Compression Workshop, Oct 2012, Barcelone, Spain
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-
- titre
- A satellite imaging chain based on the Compressed Sensing technique
- auteur
- Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud, Marc Antonini, Carole Thiebaut, Christophe Latry, Yves Bobichon
- article
- On-Board Payload Data Compression Workshop, Oct 2012, Barcelone, Spain
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- titre
- ML estimation of hyperparameters in inverse problems with wavelet regularisation
- auteur
- Laure Blanc-Féraud
- article
- Workshop Optimization Techniques for Inverse Problems II, Sep 2012, Modena, France
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-
- titre
- Modeling Cell-Sheets Wound Closure
- auteur
- Abderrahmane Habbal, Hélène Barelli, Grégoire Malandain
- article
- 3rd International Conference of the Moroccan Society of Applied Mathematics (SM2A), Sep 2012, Marrakesh, Morocco
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- titre
- Depth variant image restoration in 3D fluorescence microscopy: two approaches under Gaussian and Poissonian noise conditions
- auteur
- Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud, Elie Maalouf, Bruno Colicchio, Alain Dieterlen
- article
- ISBI 2012 – 9th International Symposium on Biomedical Imaging, May 2012, Barcelona, Spain. pp.1671-1674, ⟨10.1109/ISBI.2012.6235899⟩
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-
- titre
- Vascular network segmentation: an unsupervised approach
- auteur
- Xavier Descombes, Franck Plouraboué, Abdelhakim El Boustani, Caroline Fonta, Géraldine Le Duc, Raphael Serduc, Timm Weitkamp
- article
- ISBI 2012 – 9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, May 2012, Barcelona, Spain. pp.1248-1251
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-
- titre
- Axon extraction from fluorescent confocal microscopy images
- auteur
- Alejandro Mottini, Xavier Descombes, Florence Besse
- article
- ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, IEEE Signal Processing Society (SPS) and IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBS), May 2012, Barcelona, Spain. ⟨10.1109/ISBI.2012.6235660⟩
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-
- titre
- Prise en compte du mouvement respiratoire du petit animal pour la reconstruction 3D TEMP synchronisée : application aux métastases péritonéales
- auteur
- Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Jacques Darcourt, Thierry Pourcher, Philippe R. Franken
- article
- 50ème Colloque de Médecine Nucléaire de Langue Française, Apr 2012, Montpellier, France. pp.188-189, ⟨10.1016/j.mednuc.2012.02.108⟩
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-
- titre
- Modeling and removing depth-variant blur from 3D fluorescence microscopy
- auteur
- Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud
- article
- ICASSP – International Conference on Acoustics, Speech, and Signal Processing, Mar 2012, Kyoto, Japan
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-
- titre
- Modeling and removing depth variant blur in 3D fluorescence microscopy
- auteur
- Laure Blanc-Féraud, Saima Ben Hadj
- article
- IEEE ICIP – International conference on Image Processing, Mar 2012, Kyoto, Japan
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-
- titre
- Simulated breath-hold reconstruction in micro-SPECT: application to peritoneal metastases expressing NIS as reporter gene
- auteur
- Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Jacques Darcourt, Thierry Pourcher, Philippe R. Franken
- article
- MIBO – second Molecular Imaging in Biology and Oncology workshop – 2012, Jan 2012, Nice, France
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Book sections
- titre
- Interacting Adaptive Filters for Multiple Objects Detection
- auteur
- Xavier Descombes
- article
- Luc Florack and Remco Duits and Geurt Jongbloed and Marie-Colette van Lieshout and Laurie Davies. Mathematical Methods for Signal and Image Analysis and Representation, 41, Springer, pp.221-239, 2012, Computational Imaging and Vision, 978-1-4471-2352-1. ⟨10.1007/978-1-4471-2353-8_13⟩
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-
Other publications
- titre
- A relaxation result for an inhomogeneous functional preserving point-like and curve-like singularities in image processing
- auteur
- Gilles Aubert, Daniele Graziani
- article
- 2012
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-
Books
- titre
- 2nd international Workshop on New Computational Methods for Inverse Problems
- auteur
- Laure Blanc-Féraud, Pierre-Yves Joubert
- article
- Blanc-Feraud, Laure and Joubert, Pierre-Yves. IOP Publishing, 386, pp.70, 2012, Journal of Physics: Conference Series
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-
Reports
- titre
- Skin lesion evaluation from multispectral images
- auteur
- Sylvain Prigent, Xavier Descombes, Didier Zugaj, Laurent Petit, Anne-Sophie Dugaret, Philippe Martel, Josiane Zerubia
- article
- [Research Report] RR-8136, INRIA. 2012, pp.23
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-
- titre
- Space Variant Blind Image Restoration
- auteur
- Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- [Research Report] RR-8073, INRIA. 2012, pp.49
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-
- titre
- Wavelet-based hyperparameter estimation for solving inverse problems
- auteur
- Caroline Chaux, Laure Blanc-Féraud
- article
- [Research Report] INRIA; I3S. 2012
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-
- titre
- Classification of skin hyper-pigmentation lesions with multi-spectral images
- auteur
- Sylvain Prigent, Xavier Descombes, Didier Zugaj, Laurent Petit, Anne-Sophie Dugaret, Philippe Martel, Josiane Zerubia
- article
- [Research Report] RR-8105, INRIA. 2012
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-
Theses
- titre
- Apport de l’imagerie multi et hyperspectrale pour l’évaluation de la pigmentation de la peau
- auteur
- Sylvain Prigent
- article
- Traitement du signal et de l’image [eess.SP]. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- ADMM algorithm for demosaicking deblurring denoising
- auteur
- Daniele Graziani, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
- article
- 2012
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-
2011
Journal articles
- titre
- Trends in Bio Imaging and Signal Processing
- auteur
- Jean-Christophe Olivo-Marin, Laure Blanc-Féraud, Michael Unser, Andrew Laine, Boudewijn Lelieveldt
- article
- IEEE Signal Processing Magazine, 2011, 28 (6), pp.200-191. ⟨10.1109/MSP.2011.942317⟩
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-
- titre
- A Marked Point Process Model Including Strong Prior Shape Information Applied to Multiple Object Extraction From Images.
- auteur
- Maria Kulikova, Ian Jermyn, Xavier Descombes, Elena Zhizhina, Josiane Zerubia
- article
- International Journal of Computer Vision and Image Processing, 2011, 1 (2), pp.1-12. ⟨10.4018/ijcvip.2011040101⟩
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-
- titre
- Regularized inversion of a distributed point source model for the reconstruction of defects in eddy current imagin
- auteur
- S. Bausson, Vincent Thomas, Pierre-Yves Joubert, Laure Blanc-Féraud, Jérôme Darbon, Gilles Aubert
- article
- COMPEL: The International Journal for Computation and Mathematics in Electrical and Electronic Engineering, 2011, 30 (6)
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-
Conference papers
- titre
- Analyse par micro-tomographie RX des réseaux vasculaires normaux et tumoraux
- auteur
- Franck Plouraboué, Laurent Risser, Xavier Descombes, A. El Boustani, Caroline Fonta, Géraldine Le Duc, Raphaël Serduc, Timm Weitkamp
- article
- 7èmes Journées du Cancéropôle Grand Sud-Ouest, Oct 2011, Bordeaux, France
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-
- titre
- Regularizing parameter estimation for Poisson noisy image restoration.
- auteur
- Laure Blanc-Féraud, Mikael Carlavan
- article
- Optimisation et traitement des images, GdR MOA et GdR MSPC, Jun 2011, La Londe les Maures, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Regularizing parameter estimation for Poisson noisy image restoration
- auteur
- Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud
- article
- International ICST Workshop on New Computational Methods for Inverse Problems, May 2011, Paris, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Two constrained formulations for deblurring poisson noisy images
- auteur
- Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud
- article
- IEEE International Conference on Image Processing, 2011, Brussels, Belgium
- Accès au texte intégral et bibtex
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Books
- titre
- Applications de la géometrie stochastique à l’analyse d’images
- auteur
- Florent Chatelain, Xavier Descombes, Florent Lafarge, Christian Lantuéjoul, Clement Mallet, Robert Minlos, Michel Schmitt, Marc Sigelle, Radu Stoica, Elena Zhizhina
- article
- Xavier Descombes. Hermes Science-Lavoisier, pp.250, 2011, 978-2-7462-2145-1
- Accès au bibtex
-
- titre
- Stochastic geometry for image analysis
- auteur
- Xavier Descombes
- article
- Xavier Descombes. Wiley-ISTE, pp.384, 2011, 978-1-84821-240-4
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