2024
Journal articles
- titre
- An inverse problem: recovering the fragmentation kernel from the short-time behaviour of the fragmentation equation
- auteur
- Marie Doumic, Miguel Escobedo, Magali Tournus
- article
- Annales Henri Lebesgue, 2024, 7, pp.621-671. ⟨10.5802/ahl.207⟩
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-
- titre
- A Stochastic Analysis of Particle Systems with Pairing
- auteur
- Vincent Fromion, Philippe Robert, Jana Zaherddine
- article
- Stochastic Processes and their Applications, 2024, 178, pp.104480. ⟨10.1016/j.spa.2024.104480⟩
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-
- titre
- Nonlocal Cahn-Hilliard equation with degenerate mobility: Incompressible limit and convergence to stationary states
- auteur
- Charles Elbar, Benoît Perthame, Andrea Poiatti, Jakub Skrzeczkowski
- article
- Archive for Rational Mechanics and Analysis, 2024, 248 (3), pp.41. ⟨10.1007/s00205-024-01990-0⟩
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-
- titre
- Optimal Control Approach for Implementation of Sterile Insect Techniques
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Daiver Cardona-Salgado, Yves Dumont, Olga Vasilieva
- article
- Journal of Mathematical Sciences, 2024, 279 (5), pp.607-622
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-
- titre
- A particle method for non-local advection-selection-mutation equations
- auteur
- Frank Ernesto Alvarez, Jules Guilberteau
- article
- Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2024, pp.1-62. ⟨10.1142/S0218202524500106⟩
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-
- titre
- Structured Model Conserving Biomass for the Size-spectrum Evolution in Aquatic Ecosystems
- auteur
- Laura Kanzler, Benoît Perthame, Benoît Sarels
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2024, 88 (3), pp.26. ⟨10.1007/s00285-023-02043-y⟩
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-
- titre
- Effective interface conditions for a porous medium type problem
- auteur
- Giorgia Ciavolella, Noemi David, Alexandre Poulain
- article
- Interfaces and Free Boundaries : Mathematical Analysis, Computation and Applications, 2024, ⟨10.4171/ifb/505⟩
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-
- titre
- Fiber crosslinking drives the emergence of order in a 3D dynamical network model
- auteur
- Pauline Chassonnery, Jenny Paupert, Anne Lorsignol, Childérick Séverac, Marielle Ousset, Pierre Degond, Louis Casteilla, Diane Peurichard
- article
- Royal Society Open Science, 2024, 11, pp.231456
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-
- titre
- A Palm Space Approach to Non-Linear Hawkes Processes
- auteur
- Philippe Robert, Gaëtan Vignoud
- article
- Electronic Journal of Probability, 2024, 29 (none), pp.1-37. ⟨10.1214/23-EJP1063⟩
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-
- titre
- Fibre crosslinking drives the emergence of order in a three-dimensional dynamical network model
- auteur
- Pauline Chassonnery, Jenny Paupert, Anne Lorsignol, Childérick Séverac, Marielle Ousset, Pierre Degond, Louis Casteilla, Diane Peurichard
- article
- Royal Society Open Science, 2024, 11 (1), pp.231456. ⟨10.1098/rsos.231456⟩
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-
Conference papers
- titre
- Modeling population dynamics and control strategies for a unique species evolving in heterogenous landscape
- auteur
- Manon de la Tousche, Pierre-Alexandre Bliman, Yves Dumont
- article
- 15 th Conference on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences (DSABNS 2024), Feb 2024, Lisbonne, Portugal. pp.194
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-
- titre
- A two-stage seirs reinfection model with multiple endemic equilibria
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Marcel Fang
- article
- 15th Conference on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences, DSABNS 2024, Feb 2024, Lisbonne, Portugal
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Vector-borne disease outbreak control via instant releases
- auteur
- Luis Almeida, Jesús Bellver Arnau, Yannick Privat, Carlota Rebelo
- article
- 2024
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-
- titre
- Mean-field limit of non-exchangeable multi-agent systems over hypergraphs with unbounded rank
- auteur
- Nathalie Ayi, Nastassia Pouradier Duteil, David Poyato
- article
- 2024
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Analysis and numerical simulation of a generalized compressible Cahn-Hilliard-Navier-Stokes model with friction effects
- auteur
- Charles Elbar, Alexandre Poulain
- article
- 2024
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- How a reaction-diffusion signal can control spinal cord regeneration in axolotls: A modelling study
- auteur
- Valeria Caliaro, Diane Peurichard, Osvaldo Chara
- article
- 2024
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-
- titre
- Large-population limits of non-exchangeable particle systems
- auteur
- Nathalie Ayi, Nastassia Pouradier Duteil
- article
- 2024
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2023
Journal articles
- titre
- Steady-state solutions for a reaction-diffusion equation with Robin boundary conditions: Application to the control of dengue vectors
- auteur
- Luís Almeida, Pierre-Alexandre Bliman, Nga Nguyen, Nicolas Vauchelet
- article
- European Journal of Applied Mathematics, 2023, 35 (3), pp.382-408. ⟨10.1017/S0956792523000256⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Degenerate Cahn-Hilliard equation: From nonlocal to local
- auteur
- Charles Elbar, Jakub Skrzeczkowski
- article
- Journal of Differential Equations, 2023, 364, pp.576-611. ⟨10.1016/j.jde.2023.03.057⟩
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-
- titre
- Wasserstein contraction for the stochastic Morris-Lecar neuron model
- auteur
- Maxime Herda, Pierre Monmarché, Benoît Perthame
- article
- Kinetic and Related Models , 2023, ⟨10.3934/krm.2024009⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Final Size for Epidemic Models with Asymptomatic Transmission
- auteur
- Carles Barril, Pierre-Alexandre Bliman, Sílvia Cuadrado
- article
- Bulletin of Mathematical Biology, 2023, 85 (6), pp.52. ⟨10.1007/s11538-023-01159-y⟩
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-
- titre
- A sex-structured model of Wolbachia invasion to design sex-biased release strategies in Aedes spp mosquitoes populations
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Yves Dumont, Oscar Eduardo Escobar-Lasso, Hector Martinez-Romero, Olga Vasilieva
- article
- Applied Mathematical Modelling, 2023, 119, pp.391-412. ⟨10.1016/j.apm.2023.02.023⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Analysis of the “Rolling carpet” strategy to eradicate an invasive species
- auteur
- Luis Almeida, Alexis Léculier, Nicolas Vauchelet
- article
- SIAM Journal on Mathematical Analysis, 2023, 55 (1), pp.275-309. ⟨10.1137/21M1427243⟩
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-
- titre
- From Vlasov equation to degenerate nonlocal Cahn-Hilliard equation
- auteur
- Charles Elbar, Marco Mason, Benoît Perthame, Jakub Skrzeczkowski
- article
- Communications in Mathematical Physics, 2023, 401 (1), pp.1033-1057. ⟨10.1007/s00220-023-04663-3⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Tiered social distancing policies and epidemic control
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Alessio Carrozzo-Magli, Alberto D’onofrio, Piero Manfredi
- article
- Proceedings of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, 2023, 478 (2268), ⟨10.1098/rspa.2022.0175⟩
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-
- titre
- Discrete and continuum models for the coevolutionary dynamics between CD8+ cytotoxic T lymphocytes and tumour cells
- auteur
- Luís Almeida, Chloe Audebert, Emma Leschiera, Tommaso Lorenzi
- article
- Mathematical Medicine and Biology, 2023, ⟨10.1093/imammb/dqac017⟩
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-
- titre
- Pressure jump and radial stationary solutions of the degenerate Cahn-Hilliard equation (Extended version)
- auteur
- Charles Elbar, Benoît Perthame, Jakub Skrzeczkowski
- article
- Comptes Rendus. Mécanique, In press, ⟨10.5802/crmeca.173⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- In-vitro to in-vivo acetaminophen hepatotoxicity extrapolation using classical schemes, pharmaco-dynamic models and a multiscale spatial-temporal liver twin
- auteur
- Jules Dichamp, Geraldine Cellière, Ahmed Ghallab, Reham Hassan, Noemie Boissier, Ute Hofmann, Joerg Reinders, Selahaddin Sezgin, Sebastian Zühlke, Jan Hengstler, Dirk Drasdo
- article
- Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, In press, 11, ⟨10.3389/fbioe.2023.1049564⟩
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-
- titre
- A phenotype-structured model for the tumour-immune response
- auteur
- Zineb Kaid, Camille Pouchol, Jean Clairambault
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2023, 18, pp.22. ⟨10.1051/mmnp/2023025⟩
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-
- titre
- Stochastic Models of Regulation of Transcription in Biological Cells
- auteur
- Vincent Fromion, Philippe Robert, Jana Zaherddine
- article
- Journal of Mathematical Biology, In press, 87 (5), pp.65. ⟨10.1007/s00285-023-01998-2⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bounds and long term convergence for the voltage-conductance kinetic system arising in neuroscience
- auteur
- Xu’An Dou, Benoît Perthame, Delphine Salort, Zhennan Zhou
- article
- Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series A, 2023, 43 (3&4), pp.1366-1382. ⟨10.3934/dcds.2022136⟩
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-
Conference papers
- titre
- Nonlinear Adaptive Observers for an SIS System Counting Primo-infections
- auteur
- Marcel Fang, Pierre-Alexandre Bliman, Denis Efimov, Rosane Ushirobira
- article
- 22nd World Congress of the International Federation of Automatic Control, Jul 2023, Yokohama, Japan
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- On the problem of minimizing the epidemic final size for SIR model by social distancing
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Alain Rapaport
- article
- IFAC World Congress 2023 – 22nd World Congress of the International Federation of Automatic Control, IFAC – International Federation of Automatic Control, Jul 2023, Yokohama, Japan. ⟨10.1016/j.ifacol.2023.10.1726⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Mathematical modelling of cancer growth and drug treatments: taking into account cell population heterogeneity and plasticity
- auteur
- Jean Clairambault
- article
- ECC 23 – European Control Conference, Silviu-Iulian Niculescu, Jun 2023, Bucarest, Romania
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-
Book sections
- titre
- Individual and population approaches for calibrating division rates in population dynamics: Application to the bacterial cell cycle
- auteur
- Marie Doumic, Marc Hoffmann
- article
- Modeling and Simulation for Collective Dynamics, 40, WORLD SCIENTIFIC, pp.1-81, 2023, Lecture Notes Series, Institute for Mathematical Sciences, National University of Singapore, ⟨10.1142/9789811266140_0001⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Special issue
- titre
- Control theory perspectives on mathematical epidemiology
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Alain Rapaport
- article
- 2023, 22nd World Congress of the International Federation of Automatic Control
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Theses
- titre
- Mathematical 3D modelling of connective tissues architecture emergence
- auteur
- Pauline Chassonnery
- article
- Human health and pathology. Université Paul Sabatier – Toulouse III, 2023. English. ⟨NNT : 2023TOU30354⟩
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-
- titre
- Stochastic models of protein production in bacterial cells : analysis of regulation mechanisms for transcription and translation phases
- auteur
- Jana Zaherddine
- article
- Probability [math.PR]. Sorbonne Université, 2023. English. ⟨NNT : 2023SORUS576⟩
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-
- titre
- Asymptotic and numerical analysis of models for heterogeneous cell populations
- auteur
- Jules Guilberteau
- article
- Dynamical Systems [math.DS]. Sorbonne Université, 2023. English. ⟨NNT : 2023SORUS316⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Individual cell fate and population dynamics revealed by a mathematical model linking telomere length and replicative senescence
- auteur
- Anaïs Rat, Marie Doumic, Maria Teresa Teixeira, Zhou Xu
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Incompressible limit of porous media equation with chemotaxis and growth
- auteur
- Qingyou He, Hai-Liang Li, Benoît Perthame
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Scaling Approach to Stochastic Chemical Reaction Networks
- auteur
- Lucie Laurence, Philippe Robert
- article
- 2023
- Accès au bibtex
-
- titre
- An integrative phenotype-structured partial differential equation model for the population dynamics of epithelial-mesenchymal transition
- auteur
- Jules Guilberteau, Paras Jain, Mohit Kumar Jolly, Camille Pouchol, Nastassia Pouradier Duteil
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Graph Limit for Interacting Particle Systems on Weighted Random Graphs
- auteur
- Nathalie Ayi, Nastassia Pouradier Duteil
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- On the limit problem arising in the kinetic derivation of the Cahn-Hilliard equation
- auteur
- Charles Elbar, Benoît Perthame, Jakub Skrzeczkowski
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- On the inviscid limit connecting Brinkman’s and Darcy’s models of tissue growth with nonlinear pressure
- auteur
- Charles Elbar, Jakub Skrzeczkowski
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- From nonlocal Euler-Korteweg to local Cahn-Hilliard via the high-friction limit
- auteur
- Charles Elbar, Piotr Gwiazda, Jakub Skrzeczkowski, Agnieszká Swierczewska-Gwiazda
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Bistability and oscillatory behaviours of cyclic feedback loops
- auteur
- Jules Guilberteau
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A control strategy for Sterile Insect Techniques using exponentially decreasing releases to avoid the hair-trigger effect
- auteur
- Alexis Léculier, Nga Nguyen
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Mathematical modelling of cancer growth and drug treatments: taking into account cell population heterogeneity and plasticity
- auteur
- Jean Clairambault
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An infinite-times renewal equation
- auteur
- Xu’An Dou, Benoît Perthame, Chenjiayue Qi, Delphine Salort, Zhennan Zhou
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Asymptotic preserving schemes for nonlinear kinetic equations leading to volume-exclusion chemotaxis in the diffusive limit
- auteur
- Gissell Estrada-Rodriguez, Diane Peurichard, Xinran Ruan
- article
- 2023
- Accès au bibtex
-
- titre
- Long-time behaviour of an advection-selection equation
- auteur
- Jules Guilberteau, Camille Pouchol, Nastassia Pouradier Duteil
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2022
Journal articles
- titre
- Evolution of a structured cell population endowed with plasticity of traits under constraints on and between the traits
- auteur
- Frank Ernesto Alvarez, José Antonio Carrillo, Jean Clairambault
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A multiple time renewal equation for neural assemblies with elapsed time model
- auteur
- Nicolás Torres, Benoît Perthame, Delphine Salort
- article
- Nonlinearity, 2022, ⟨10.1088/1361-6544/ac8714⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Wave blocking in a bistable system by local introduction of a population: application to sterile insect techniques on mosquito populations
- auteur
- Luís Almeida, Jorge Estrada, Nicolas Vauchelet
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2022, ⟨10.1051/mmnp/2022026⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Aronson-Bénilan Estimate in Lebesgue Spaces
- auteur
- Giulia Bevilacqua, Benoît Perthame, Markus Schmidtchen
- article
- Annales de l’Institut Henri Poincaré C, Analyse non linéaire, 2022, 40 (2), pp.259-286. ⟨10.4171/AIHPC/43⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Robust control strategy by the Sterile Insect Technique for reducing epidemiological risk in presence of vector migration
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Yves Dumont
- article
- Mathematical Biosciences, 2022, pp.108856. ⟨10.1016/j.mbs.2022.108856⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- On the Spontaneous Dynamics of Synaptic Weights in Stochastic Models with Pair-Based STDP
- auteur
- Gaëtan Vignoud, Philippe Robert
- article
- Physical Review E , 2022, 105 (5), pp.054405. ⟨10.48550/arXiv.2111.07919⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Perspectives in cancer treatment. Reply to comments on “Improving cancer treatments via dynamical biophysical models
- auteur
- Maxim Kuznetsov, Jean Clairambault, Vitali Volpert
- article
- Physics of Life Reviews, In press, ⟨10.1016/j.plrev.2022.05.003⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Invasion fronts and adaptive dynamics in a model for the growth of cell populations with heterogeneous mobility
- auteur
- Tommaso Lorenzi, Benoît Perthame, Xinran Ruan
- article
- European Journal of Applied Mathematics, 2022, pp.1-18. ⟨10.1017/S0956792521000218⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A mathematical model of p62-ubiquitin aggregates in autophagy
- auteur
- Julia Delacour, Marie Doumic, Sascha Martens, Christian Schmeiser, Gabriele Zaffagnini
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2022, 84 (3), ⟨10.1007/s00285-021-01659-2⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal control strategies for the sterile mosquitoes technique
- auteur
- Luís Almeida, Michel Duprez, Yannick Privat, Nicolas Vauchelet
- article
- Journal of Differential Equations, 2022, 311, pp.229-266. ⟨10.1016/j.jde.2021.12.002⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Effect of a membrane on diffusion-driven Turing instability
- auteur
- Giorgia Ciavolella
- article
- Acta Applicandae Mathematicae, 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A mathematical model to study the impact of intra-tumour heterogeneity on anti-tumour CD8 + T cell immune response
- auteur
- Emma Leschiera, Tommaso Lorenzi, Shensi Shen, Luis Almeida, Chloe Audebert
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Mean-field limit of collective dynamics with time-varying weights
- auteur
- Nastassia Pouradier Duteil
- article
- Networks and Heterogeneous Media, 2022, 17 (2), pp.129-161
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Hamilton-Jacobi Approach to Evolution of Dispersal
- auteur
- King-Yeung Lam, Yuan Lou, Benoît Perthame
- article
- Communications in Partial Differential Equations, In press
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Collective motion driven by nutrient consumption
- auteur
- Pierre-Emmanuel Jabin, Benoît Perthame
- article
- Asymptotic Analysis, In press
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An Asymptotic Preserving Scheme for Capturing Concentrations in Age-structured Models Arising in Adaptive Dynamics
- auteur
- Luís Almeida, Benoît Perthame, Xinran Ruan
- article
- Journal of Computational Physics, 2022, 464, pp.111335. ⟨10.1016/j.jcp.2022.111335⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Degenerate Cahn-Hilliard and incompressible limit of a Keller-Segel model
- auteur
- Charles Elbar, Benoît Perthame, Alexandre Poulain
- article
- Communications in Mathematical Sciences, 2022, 20 (7), pp.1901-1926. ⟨10.4310/CMS.2022.v20.n7.a5⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Consensus Formation in First-Order Graphon Models with Time-Varying Topologies
- auteur
- Benoît Bonnet, Nastassia Pouradier Duteil, Mario Sigalotti
- article
- Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2022, 32 (11), pp.2121-2188
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Guided interactive image segmentation using machine learning and color-based image set clustering
- auteur
- Adrian Friebel, Tim Johann, Dirk Drasdo, Stefan Hoehme
- article
- Bioinformatics, 2022, 38 (19), pp.4622-4628. ⟨10.1093/bioinformatics/btac547⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A hybrid discrete-continuum modelling approach to explore the impact of T-cell infiltration on anti-tumour immune response
- auteur
- Luís Almeida, Chloe Audebert, Emma Leschiera, Tommaso Lorenzi
- article
- Bulletin of Mathematical Biology, In press
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- How environment affects active particle swarms: a case study
- auteur
- Pierre Degond, Angelika Manhart, Sara Merino-Aceituno, Diane Peurichard, Lorenzo Sala
- article
- Royal Society Open Science, 2022, 9, pp.220791
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Periodic asymptotic dynamics of the measure solutions to an equal mitosis equation
- auteur
- Pierre Gabriel, Hugo Martin
- article
- Annales Henri Lebesgue, 2022, 5, pp.275-301. ⟨10.5802/ahl.123⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Motility switching and front-back synchronisation in polarised cells
- auteur
- Gissell Estrada-Rodriguez, Benoît Perthame
- article
- Journal of Nonlinear Science, 2022, 32 (3), pp.40. ⟨10.1007/s00332-022-09791-z⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal control strategies for bistable ODE equations: Application to mosquito population replacement
- auteur
- Luis Almeida, Jesús Bellver Arnau, Yannick Privat
- article
- Applied Mathematics and Optimization, 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- A class of nonlinear state observers for an SIS system counting primo-infections
- auteur
- Marcel Fang, Pierre-Alexandre Bliman, Denis Efimov, Rosane Ushirobira
- article
- IEEE CDC 2022 – 61st IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2022, Cancún, Mexico
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- How the shortest telomere in the cell signals senescence
- auteur
- Prisca Berardi, Stefano Mattarocci, Rachel Langston, Pascale Jolivet, Gilles Charvin, Marie Doumic, Zhou Xu, Maria Teresa Teixeira
- article
- EMBO Workshop on Telomere function and evolution in health and disease, EMBO, Sep 2022, Troia, Portugal
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modelling, Analysis, Observability and Identifiability of Epidemic Dynamics with Reinfections
- auteur
- Marcel Fang, Pierre-Alexandre Bliman
- article
- ECC 2022 – European Control Conference, Jul 2022, London, United Kingdom
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Epidemiological assessment of Wolbachia-based biocontrol for reduction of dengue morbidity
- auteur
- Olga Vasilieva, Oscar Escobar, Hector Martinez, Pierre-Alexandre Bliman, Yves Dumont
- article
- Biology and Medicine Through Mathematics Conference, May 2022, Richmond, United States
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- Minimal cost-time strategies for mosquito population replacement
- auteur
- Luis Almeida, Jesús Bellver Arnau, Michel Duprez, Yannick Privat
- article
- Roland Herzog, Matthias Heinkenschloss, Dante Kalise, Georg Stadler and Emmanuel Trélat. Optimization and Control for Partial Differential Equations, 29, De Gruyter, 2022, Radon Series on Computational and Applied Mathematics, 9783110695984
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The sterile insect technique used as a barrier control against reinfestation
- auteur
- Luís Almeida, Jorge Estrada, Nicolas Vauchelet
- article
- Roland Herzog, Matthias Heinkenschloss, Dante Kalise, Georg Stadler and Emmanuel Trélat. Optimization and Control for Partial Differential Equations, 29, De Gruyter, pp.91-112, 2022, Radon Series on Computational and Applied Mathematics, 9783110695984. ⟨10.1515/9783110695984-005⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Theses
- titre
- Optimal mosquito release strategies for vector-borne disease control
- auteur
- Jesús Bellver Arnau
- article
- Optimization and Control [math.OC]. Sorbonne Université, 2022. English. ⟨NNT : 2022SORUS406⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Mathematical models of tumour-immune interactions: discrete and continuum approaches
- auteur
- Emma Leschiera
- article
- Mathematics [math]. Sorbonne Universites, UPMC University of Paris 6, 2022. English. ⟨NNT : ⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Reaction-diffusion equations with membrane conditions describing tumor invasion
- auteur
- Giorgia Ciavolella
- article
- Analysis of PDEs [math.AP]. Sorbonne Université; Università degli studi di Roma “Tor Vergata” (1972-..), 2022. English. ⟨NNT : 2022SORUS344⟩
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-
- titre
- Incompressible limit and well-posedness of PDE models of tissue growth
- auteur
- Noemi David
- article
- Analysis of PDEs [math.AP]. Sorbonne Université; Università degli studi (Bologne, Italie), 2022. English. ⟨NNT : 2022SORUS235⟩
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-
- titre
- Synaptic plasticity in stochastic neuronal networks
- auteur
- Gaëtan Vignoud
- article
- Probability [math.PR]. Sorbonne Université, 2022. English. ⟨NNT : 2022SORUS068⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Optimal control of bistable travelling waves: looking for the spatial distribution of a killing action to block a pest invasion
- auteur
- Luis Almeida, Alexis Léculier, Grégoire Nadin, Yannick Privat
- article
- 2022
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-
- titre
- Diffusion-weighted MRI -guided needle biopsies permit quantitative tumor heterogeneity assessment and cell load estimation
- auteur
- Yi Yin, Kai Breuhahn, Hans-Ulrich Kauczor, Oliver Sedlaczek, Irene Vignon-Clementel, Dirk Drasdo
- article
- 2022
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-
- titre
- Growth-fragmentation model for a population presenting heterogeneity in growth rate: Malthus parameter and long-time behavior
- auteur
- Anaïs Rat, Magali Tournus
- article
- 2022
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-
- titre
- Modelling the orchestration of different types of cells and factors during liver regeneration in a virtual liver twin
- auteur
- Jieling Zhao, Hassan Reham, Ahmed Ghallab, Jan G. Hengstler, Dirk Drasdo
- article
- 2022
- Accès au bibtex
-
2021
Journal articles
- titre
- BiPSim: a flexible and generic stochastic simulator for polymerization processes
- auteur
- Stephan Fischer, Marc Dinh, Vincent Henry, Philippe Robert, Anne Goelzer, Vincent Fromion
- article
- Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-92833-5⟩
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-
- titre
- On the Mechanisms of Biliary Flux
- auteur
- Nachiket Vartak, Dirk Drasdo, Fabian Geisler, Tohru Itoh, Ronald P.J.Oude Elferink, Stan F.J. Graaf, John Chiang, Verena Keitel, Michael Trauner, Peter Jansen, Jan Hengstler
- article
- Hepatology, 2021, 74 (6), pp.3497-3512. ⟨10.1002/hep.32027⟩
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-
- titre
- Monostability and bistability of biological switches
- auteur
- Jules Guilberteau, Camille Pouchol, Nastassia Pouradier Duteil
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2021, 83 (6-7), pp.65. ⟨10.1007/s00285-021-01687-y⟩
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-
- titre
- Convergence, error analysis and longtime behavior of the Scalar Auxiliary Variable method for the nonlinear Schrödinger equation
- auteur
- Alexandre Poulain, Katharina Schratz
- article
- IMA Journal of Numerical Analysis, 2021, ⟨10.1093/imanum/drab082⟩
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-
- titre
- Stochastic Models of Neural Plasticity: A Scaling Approach
- auteur
- Philippe Robert, Gaëtan Vignoud
- article
- SIAM Journal on Applied Mathematics, 2021, 81 (6), pp.2362–2386. ⟨10.1137/20M1382891⟩
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-
- titre
- Mean-field and graph limits for collective dynamics models with time-varying weights
- auteur
- Nathalie Ayi, Nastassia Pouradier Duteil
- article
- Journal of Differential Equations, 2021, ⟨10.1016/j.jde.2021.07.010⟩
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-
- titre
- Improving cancer treatments via dynamical biophysical models
- auteur
- Maxim Kuznetsov, Jean Clairambault, Vitaly Volpert
- article
- Physics of Life Reviews, 2021, pp.1-84. ⟨10.1016/j.plrev.2021.10.001⟩
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-
- titre
- Modeling and Control of Epidemics through Testing Policies
- auteur
- Muhammad Umar B. Niazi, Alain Kibangou, Carlos Canudas de Wit, Denis Nikitin, Liudmila Tumash, Pierre-Alexandre Bliman
- article
- Annual Reviews in Control, 2021, 52, pp.554-572. ⟨10.1016/j.arcontrol.2021.09.004⟩
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-
- titre
- Telomere shortening causes distinct cell division regimes during replicative senescence in Saccharomyces cerevisiae
- auteur
- Hugo Martin, Marie Doumic, Maria Teresa Teixeira, Zhou Xu
- article
- Cell & Bioscience, 2021, 11 (1), ⟨10.1186/s13578-021-00693-3⟩
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-
- titre
- Stochastic Models of Neural Plasticity
- auteur
- Philippe Robert, Gaëtan Vignoud
- article
- SIAM Journal on Applied Mathematics, 2021, 81 (5), pp.1821-1846. ⟨10.48550/arXiv.2010.08195⟩
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-
- titre
- Insights into the dynamic trajectories of protein filament division revealed by numerical investigation into the mathematical model of pure fragmentation
- auteur
- Magali Tournus, Miguel Escobedo, Wei-Feng Xue, Marie Doumic
- article
- PLoS Computational Biology, 2021, 17 (9), pp.e1008964. ⟨10.1371/journal.pcbi.1008964⟩
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-
- titre
- Gut microbiota depletion exacerbates cholestatic liver injury via loss of FXR signalling
- auteur
- Kai Markus Schneider, Lena Susanna Candels, Johannes Hov, Maiju Myllys, Reham Hassan, Carolin Victoria Schneider, Annika Wahlström, Antje Mohs, Sebastian Zühlke, Lijun Liao, Carsten Elfers, Konrad Kilic, Marcus Henricsson, Antonio Molinaro, Maximilian Hatting, Ayham Zaza, Dirk Drasdo, Mick Frissen, A. Sloan Devlin, Eric Gálvez, Till Strowig, Tom Karlsen, Jan Hengstler, Hanns-Ulrich Marschall, Ahmed Ghallab, Christian Trautwein
- article
- Nature Metabolism, 2021, 3 (9), pp.1228-1241. ⟨10.1038/s42255-021-00452-1⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Fokker–Plank System for Movement of Micro-organism Population in Confined Environment
- auteur
- Jingyi Fu, Benoît Perthame, Min Tang
- article
- Journal of Statistical Physics, 2021, 184 (1), ⟨10.1007/s10955-021-02760-y⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Kinetic models for epidemic dynamics with social heterogeneity
- auteur
- Giacomo Dimarco, Benoît Perthame, Giuseppe Toscani, Mattia Zanella
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2021, 83 (1), pp.4. ⟨10.1007/s00285-021-01630-1⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Packing simulation of thin flexible particles using a novel discrete element model
- auteur
- Leman Mathias, Saeys Wouter, Leblicq Tom, Pešek Jiří, Smeets Bart
- article
- Computational Particle Mechanics, 2021, ⟨10.1007/s40571-021-00419-9⟩
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-
- titre
- An elapsed time model for strongly coupled inhibitory and excitatory neural networks
- auteur
- Maria J. Caceres, Benoît Perthame, Delphine Salort, Nicolas Torres
- article
- Physica D: Nonlinear Phenomena, 2021, ⟨10.1016/j.physd.2021.132977⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Averaging Principles for Markovian Models of Plasticity
- auteur
- Philippe Robert, Gaëtan Vignoud
- article
- Journal of Statistical Physics, 2021, 183 (3), pp.47–90. ⟨10.1007/s10955-021-02785-3⟩
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-
- titre
- Consensus and Flocking under Communication Failures for a Class of Cucker-Smale Systems
- auteur
- Benoît Bonnet, Emilien Flayac
- article
- Systems and Control Letters, 2021, 152, pp.104930. ⟨10.1016/j.sysconle.2021.104930⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Intravital dynamic and correlative imaging reveals diffusion‐dominated canalicular and flow‐augmented ductular bile flux
- auteur
- Nachiket Vartak, Georgia Guenther, Florian Joly, Amruta Damle-Vartak, Gudrun Wibbelt, Jörns Fickel, Simone Jörs, Brigitte Begher-Tibbe, Adrian Friebel, Kasimir Wansing, Ahmed Ghallab, Marie Rosselin, Noemie Boissier, Irene Vignon-Clementel, Christian Hedberg, Fabian Geisler, Heribert Hofer, Peter Jansen, Stefan Hoehme, Dirk Drasdo, Jan Hengstler
- article
- Hepatology, 2021, 73 (4), pp.1531-1550. ⟨10.1002/hep.31422⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- How Best Can Finite-Time Social Distancing Reduce Epidemic Final Size?
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Michel Duprez
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2021, 511, pp.110557. ⟨10.1016/j.jtbi.2020.110557⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Kinetic approach to the collective dynamics of the rock-paper-scissors binary game
- auteur
- Nastassia Pouradier Duteil, Francesco Salvarani
- article
- Applied Mathematics and Computation, 2021, 388, ⟨10.1016/j.amc.2020.125496⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal Immunity Control and Final Size Minimization by Social Distancing for the SIR Epidemic Model
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Michel Duprez, Yannick Privat, Nicolas Vauchelet
- article
- Journal of Optimization Theory and Applications, 2021, 189 (2), pp.408–436. ⟨10.1007/s10957-021-01830-1⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Incompressible limit for a two-species model with coupling through Brinkman’s law in any dimension
- auteur
- Tomasz Dębiec, Benoît Perthame, Markus Schmidtchen, Nicolas Vauchelet
- article
- Journal de Mathématiques Pures et Appliquées, 2021, 145, pp.204-239. ⟨10.1016/j.matpur.2020.11.002⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Free boundary limit of tumor growth model with nutrient
- auteur
- Noemi David, Benoît Perthame
- article
- Journal de Mathématiques Pures et Appliquées, 2021, 155, pp.62-82. ⟨10.1016/j.matpur.2021.01.007⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dynamics of concentration in a population structured by age and a phenotypic trait with mutations. Convergence of the corrector
- auteur
- Samuel Nordmann, Benoît Perthame
- article
- Journal of Differential Equations, 2021, ⟨10.1016/j.jde.2021.04.029⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Treatment-induced shrinking of tumour aggregates: A nonlinear volume-filling chemotactic approach
- auteur
- Luis Almeida, Gissell Estrada-Rodriguez, Lisa Oliver, Diane Peurichard, Alexandre Poulain, François M. Vallette
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2021, 83 (3), pp.29. ⟨10.1007/s00285-021-01642-x⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Final size and convergence rate for an epidemic in heterogeneous population
- auteur
- Luís Almeida, Pierre-Alexandre Bliman, Grégoire Nadin, Benoît Perthame, Nicolas Vauchelet
- article
- Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2021, 31 (05), pp.1021-1051. ⟨10.1142/S0218202521500251⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Simulation of a detoxifying organ function: Focus on hemodynamics modeling and convection‐reaction numerical simulation in microcirculatory networks
- auteur
- Noemie Boissier, Dirk Drasdo, Irene Vignon-Clementel
- article
- International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, 2021, 37 (2), ⟨10.1002/cnm.3422⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Social contacts and the spread of infectious diseases
- auteur
- Giacomo Dimarco, Benoît Perthame, Giuseppe Toscani, Mattia Zanella
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2021, 83 (1), pp.4. ⟨10.1007/s00285-021-01630-1⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A non-expanding transport distance for some structured equations
- auteur
- Nicolas Fournier, Benoît Perthame
- article
- SIAM Journal on Mathematical Analysis, 2021, 53 (6), pp.6847-6872. ⟨10.1137/21M1397313⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A new model for the emergence of blood capillary networks
- auteur
- Pedro Aceves-Sanchez, Benjamin Aymard, Diane Peurichard, Pol Kennel, Anne Lorsignol, Franck Plouraboue, Louis Casteilla, Pierre Degond
- article
- Networks and Heterogeneous Media, 2021, 16 (1), pp.91 – 138. ⟨10.3934/nhm.2021001⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- The effect of the shortest telomere on cell proliferation
- auteur
- Stefano Mattarocci, Prisca Berardi, Rachel Langston, Stéphane Marcand, Marie Doumic, Zhou Xu, Maria Teresa Teixeira
- article
- Telomeres & Telomerase, Cold Spring Habor Laboratory, Dec 2021, Cold Spring Harbor, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Optimal Control of Urban Human Mobility for Epidemic Mitigation
- auteur
- Muhammad Umar B. Niazi, Carlos Canudas de Wit, Alain Kibangou, Pierre-Alexandre Bliman
- article
- CDC 2021 – 60th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2021, Austin, United States. ⟨10.1109/CDC45484.2021.9683343⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Effective Testing Policies for Controlling an Epidemic Outbreak
- auteur
- Muhammad Umar B. Niazi, Alain Kibangou, Carlos Canudas de Wit, Denis Nikitin, Liudmila Tumash, Pierre-Alexandre Bliman
- article
- CDC 2021 – 60th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2021, Austin, United States. ⟨10.1109/CDC45484.2021.9683300⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The shortest telomere in the cell signals senescence through a probabilistic rather than deterministic mechanism
- auteur
- Stefano Mattarocci, Prisca Berardi, Rachel Langston, Pascale Jolivet, Alexandre Maes, Stéphane Marcand, Marie Doumic, Zhou Xu, Maria Teresa Teixeira
- article
- 14th International Conference Levures, modèles et outils, Oct 2021, Strasboug, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modelling and control of Mendelian and maternal inheritance for biological control of dengue vectors
- auteur
- Pastor E. Pérez Estigarribia, Pierre-Alexandre Bliman, Christian E. Schaerer
- article
- ECC 2021 – European Control Conference, Jun 2021, Rotterdam / Virtual, Netherlands. pp.333-340, ⟨10.23919/ECC54610.2021.9655215⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- Control of collective dynamics with time-varying weights
- auteur
- Nastassia Pouradier Duteil, Benedetto Piccoli
- article
- Francesco Salvarani. Recent Advances in Kinetic Equations and Applications, Springer, pp 289-308, 2021, Springer INdAM Series (SINDAMS, volume 48), 978-3-030-82945-2. ⟨10.1007/978-3-030-82946-9_12⟩
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-
Poster communications
- titre
- How the shortest telomere in the cell signals senescence
- auteur
- Stefano Mattarocci, Prisca Berardi, Rachel Langston, Stéphane Marcand, Marie Doumic, Zhou Xu, Maria Teresa Teixeira
- article
- Telomeres & Telomerase, Dec 2021, Cold Spring Harbor (New York), United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Behavioral effect of selective deletion of beta2* nicotinic acetylcholine receptors in neuropeptide Y expressing interneurons
- auteur
- Alice Abbondanza, Alexandra Tyshkevich, Jigar Dhabalia Trisha, Jan Elias, Radislav Sedláček, Stéphanie Daumas, Véronique Bernard, Helena Janickova
- article
- NeuroFrance 2021, May 2021, Online, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Theses
- titre
- Asymptotic behavior of solutions of the elapsed time model for neural assemblies
- auteur
- Nicolas Torres
- article
- Analysis of PDEs [math.AP]. Sorbonne Université, 2021. English. ⟨NNT : 2021SORUS445⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Models of living tissues, numerical simulations and immunotherapy of cancers
- auteur
- Alexandre Poulain
- article
- Numerical Analysis [math.NA]. Sorbonne Université, 2021. English. ⟨NNT : 2021SORUS200⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Long-time behaviour of a model for p62-ubiquitin aggregation in cellular autophagy
- auteur
- Julia Delacour, Christian Schmeiser, Peter Szmolyan
- article
- 2021
- Accès au bibtex
-
- titre
- A predictive computational model shows that biomechanical cell cycle progression control can explain liver regeneration after partial hepatectomy
- auteur
- Stefan Hoehme, Jan Boettger, Seddik Hammad, Brigitte Begher-Tibbe, Petru Bucur, Eric Vibert, Rolf Gebhardt, Jan G Hengstler, Dirk Drasdo
- article
- 2021
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Influence of cell mechanics in embryonic bile duct lumen formation: insight from quantitative modeling
- auteur
- Paul van Liedekerke, Lila Gannoun, Axelle Loriot, Frédéric P Lemaigre, Dirk Drasdo
- article
- 2021
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2020
Journal articles
- titre
- A class of fast-slow models for adaptive resistance evolution
- auteur
- Pastor E. Pérez-Estigarribia, Pierre-Alexandre Bliman, Christian E Schaerer
- article
- Theoretical Population Biology, 2020, 135, pp.32-48. ⟨10.1016/j.tpb.2020.07.003⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Stepping From Modeling Cancer Plasticity to the Philosophy of Cancer
- auteur
- Jean Clairambault
- article
- Frontiers in Genetics, 2020, Non-Genetic Heterogeneity in Development and Disease, 11 (579738), pp.11. ⟨10.3389/fgene.2020.579738⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Estimating the division rate from indirect measurements of single cells
- auteur
- Marie Doumic, Adélaïde Olivier, Lydia Robert
- article
- Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, 2020, 25 (10), pp.3931–3961. ⟨10.3934/dcdsb.2020078⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Existence of a global weak solution for a reaction-diffusion problem with membrane conditions
- auteur
- Giorgia Ciavolella, Benoît Perthame
- article
- Journal of Evolution Equations, 2020, 21, pp.1513-1540. ⟨10.1007/s00028-020-00633-7⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A purely mechanical model with asymmetric features for early morphogenesis of rod-shaped bacteria micro-colony
- auteur
- Marie Doumic, Sophie Hecht, Diane Peurichard
- article
- Mathematical Biosciences and Engineering, 2020, 17 (6), http://aimspress.com/article/doi/10.3934/mbe.2020356. ⟨10.3934/mbe.2020356⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dynamics of neural networks with elapsed time model and learning processes
- auteur
- Delphine Salort, Nicolas Torres
- article
- Acta Applicandae Mathematicae, 2020, ⟨10.1007/s10440-020-00367-1⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Large-Scale Dynamics of Self-propelled Particles Moving Through Obstacles: Model Derivation and Pattern Formation
- auteur
- Pedro Aceves-Sanchez, Pierre Degond, Eric E Keaveny, Angelika Manhart, Sara Merino-Aceituno, Diane Peurichard
- article
- Bulletin of Mathematical Biology, 2020, 82 (10), pp.129. ⟨10.1007/s11538-020-00805-z⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A feedback control perspective on biological control of dengue vectors by Wolbachia infection
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman
- article
- European Journal of Control, 2020, ⟨10.1016/j.ejcon.2020.09.006⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Division of Amyloid Fibrils: Systematic Comparison of Fibril Fragmentation Stability by Linking Theory with Experiments
- auteur
- David Béal, Magali Tournus, Ricardo Marchante, Tracey Purton, David Smith, Mick F Tuite, Marie Doumic, Wei-Feng Xue
- article
- iScience, 2020, 23 (9), ⟨10.1016/j.isci.2020.101512⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- SBML Level 3: an extensible format for the exchange and reuse of biological models
- auteur
- Sarah Keating, Frank Bergmann, Tomáš Helikar, Rahuman Malik‐sheriff, Ion Moraru, Martin Meier‐schellersheim, Richard Adams, Nicholas Allen, Bastian Angermann, Marco Antoniotti, Gary D. Bader, Jan Červený, Mélanie Courtot, Chris Cox, Piero Dalle Pezze, Emek Demir, William Denney, Harish Dharuri, Julien Dorier, Dirk Drasdo, Ali Ebrahim, Johannes Eichner, Johan Elf, Lukas Endler, Chris Evelo, Christoph Flamm, Ronan Mt Fleming, Martina Fröhlich, Mihai Glont, Emanuel Gonçalves, Martin Golebiewski, Hovakim Grabski, Alex Gutteridge, Damon Hachmeister, Leonard Harris, Benjamin Heavner, Ron Henkel, William Hlavacek, Bin Hu, Daniel Hyduke, Hidde De Jong, Nick Juty, Peter Karp, Jonathan Karr, Douglas Kell, Roland Keller, Ilya Kiselev, Steffen Klamt, Edda Klipp, Christian Knüpfer, Fedor Kolpakov, Falko Krause, Martina Kutmon, Camille Laibe, Conor Lawless, Lu Li, Leslie Loew, Rainer Machne, Yukiko Matsuoka, Pedro S. F. Mendes, Huaiyu Mi, Florian Mittag, Pedro Monteiro, Kedar Nath Natarajan, Poul Mf Nielsen, Tramy Nguyen, Alida Palmisano, Jean‐baptiste Pettit, Thomas Pfau, Robert Phair, Tomas Radivoyevitch, Johann Rohwer, Oliver Ruebenacker, Julio Saez‐rodriguez, Martin Scharm, Henning Schmidt, Falk Schreiber, Michael Schubert, Roman Schulte, Stuart Sealfon, Kieran Smallbone, Sylvain Soliman, Melanie I. Stefan, Devin Sullivan, Koichi Takahashi, Bas Teusink, David Tolnay, Ibrahim Vazirabad, Axel Kamp, Ulrike Wittig, Clemens Wrzodek, Dagmar Waltemath, Finja Wrzodek, Ioannis Xenarios, Anna Zhukova, Jeremy Zucker, Matthias König, Fengkai Zhang, Andreas Dräger, Claudine Chaouiya, Frank T Bergmann, Andrew Finney, Colin S. Gillespie, Stefan Hoops, Rahuman S Malik-Sheriff, Stuart L Moodie, Chris Myers, Aurélien Naldi, Brett G Olivier, Sven Sahle, James C Schaff, Lucian P Smith, Maciej J Swat, Denis Thieffry, Leandro Watanabe, Darren Wilkinson, Michael L Blinov, Kimberly Begley, James R Faeder, Harold F Gómez, Thomas M Hamm, Yuichiro Inagaki, Wolfram Liebermeister, Allyson L Lister, Daniel Lucio, Eric Mjolsness, Carole Proctor, Karthik Raman, Nicolas Rodriguez, Clifford A Shaffer, Bruce Shapiro, Joerg Stelling, Neil Swainston, Naoki Tanimura, John Wagner, Martin Meier-Schellersheim, Herbert M Sauro, Bernhard O Palsson, Hamid Bolouri, Hiroaki Kitano, Akira Funahashi, Henning Hermjakob, John C Doyle, Michael Hucka
- article
- Molecular Systems Biology, 2020, 16 (8), pp.1-21. ⟨10.15252/msb.20199110⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Cell plasticity in cancer cell populations
- auteur
- Shensi Shen, Jean Clairambault
- article
- F1000Research, 2020, 9:635, pp.16. ⟨10.12688/f1000research.24803.1⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Relaxation of the Cahn-Hilliard equation with singular single-well potential and degenerate mobility
- auteur
- Benoît Perthame, Alexandre Poulain
- article
- European Journal of Applied Mathematics, 2020, ⟨10.1017/S0956792520000054⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Models of protein production along the cell cycle: An investigation of possible sources of noise
- auteur
- Renaud Dessalles, Vincent Fromion, Philippe Robert
- article
- PLoS ONE, 2020, 15 (1), pp.25. ⟨10.1371/journal.pone.0226016⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- The role of actin protrusion dynamics in cell migration through a degradable viscoelastic extracellular matrix: Insights from a computational model
- auteur
- Tommy Heck, Diego A Vargas, Smeets Bart, Herman Ramon, Paul van Liedekerke, Hans van Oosterwijck
- article
- PLoS Computational Biology, 2020, 16, pp.e1007250. ⟨10.1371/journal.pcbi.1007250⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Identification of a transient state during the acquisition of temozolomide resistance in glioblastoma
- auteur
- Marion Rabé, Solenne Dumont, Arturo Álvarez-Arenas, Hicham Janati, Juan Belmonte-Beitia, Gabriel F Calvo, Christelle Thibault-Carpentier, Quentin Séry, Cynthia Chauvin, Noémie Joalland, Floriane Briand, Stéphanie Blandin, Emmanuel Scotet, Claire Pecqueur, Jean Clairambault, Lisa Oliver, Victor Pérez-García, Arulraj M Nadaradjane, Pierre-Francois Cartron, Catherine Gratas, François Vallette
- article
- Cell Death and Disease, 2020, 11 (1), ⟨10.1038/s41419-019-2200-2⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Equilibrium States of Large Networks of Erlang Queues
- auteur
- Davit Martirosyan, Philippe Robert
- article
- Advances in Applied Probability, In press, 52 (2), ⟨10.1017/apr.2020⟩
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-
- titre
- Phase transitions in a two-species model for cell segregation and logistic growth
- auteur
- Luis Almeida, Kevin Atsou, Marta Marulli, Diane Peurichard, Rémi Tesson
- article
- ESAIM: Proceedings and Surveys, 2020, CEMRACS 2018 – Numerical and mathematical modeling for biological and medical applications: deterministic, probabilistic and statistical descriptions, 67, pp.1-15. ⟨10.1051/proc/202067001⟩
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-
- titre
- Multiple asymptotics of kinetic equations with internal states
- auteur
- Benoît Perthame, Weiran Sun, Min Tang, Shugo Yasuda
- article
- Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2020, 30 (06), ⟨10.1142/S0218202520400060⟩
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-
- titre
- Transport costs for PDEs: the coupling method
- auteur
- Nicolas Fournier, Benoît Perthame
- article
- EMS Surveys in Mathematical Sciences, 2020, 7 (1), pp.1-31. ⟨10.4171/EMSS/35⟩
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-
- titre
- Hele-Shaw limit for a system of two reaction-(cross-)diffusion equations for living tissues
- auteur
- Federica Bubba, Benoît Perthame, Camille Pouchol, Markus Schmidtchen
- article
- Archive for Rational Mechanics and Analysis, 2020, 236, pp.735–766. ⟨10.1007/s00205-019-01479-1⟩
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-
- titre
- Modelling adhesion-independent cell migration
- auteur
- Gaspard Jankowiak, Diane Peurichard, Anne Reversat, Christian Schmeiser, Michael Sixt
- article
- Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, In press, ⟨10.1142/S021820252050013X⟩
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-
- titre
- Multiplicative ergodic theorem for a non-irreducible random dynamical system
- auteur
- Davit Martirosyan, Vahagn Nersesyan
- article
- Journal of Differential Equations, 2020, 268 (7), pp.3564-3598. ⟨10.1016/j.jde.2019.10.002⟩
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-
- titre
- Modelling pattern formation through differential repulsion
- auteur
- Julien Barre, Pierre Degond, Diane Peurichard, Ewelina Zatorska
- article
- Networks and Heterogeneous Media, 2020, 15 (3), pp.307-352. ⟨10.3934/nhm.2020021⟩
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-
- titre
- Reaction-diffusion systems with initial data of low regularity
- auteur
- El-Haj Laamri, Benoît Perthame
- article
- Journal of Differential Equations, 2020, 269 (11), ⟨10.1016/j.jde.2020.06.042⟩
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-
Book sections
- titre
- Plasticity in Cancer Cell Populations: Biology, Mathematics and Philosophy of Cancer
- auteur
- Jean Clairambault
- article
- George Bebis; Max Alekseyev; Heyrim Cho; Jana Gevertz; Maria Rodriguez Martinez. “Mathematical and Computational Oncology”, Proceedings of the Second International Symposium, ISMCO 2020, San Diego, CA, USA, October 8-10, 2020, G. Bebis, M. Alekseyev, H. Cho, J. Gevertz, M. Rodriguez Martinez (Eds.), Springer LNBI 12508, pp. 3-9, October 2020., 12508, Springer, pp.3-9, 2020, LNBI – Lecture Notes in Bioinformatics, ⟨10.1007/978-3-030-64511-3_1⟩
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-
- titre
- Méthodes in silico et modélisation des mécanismes de toxicité (AOP)
- auteur
- Enrico Mombelli, Irene Vignon-Clementel, Dirk Drasdo
- article
- Francelyne Marano; Philippe Hubert; Laure Geoffroy; Hervé Juin. Quelles alternatives en expérimentation animale ?, Éditions Quae, pp.186, 2020, Savoir Faire, 978-2-7592-3187-4
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-
Master thesis
- titre
- Analysis and stability of ODE systems for cell differentiation
- auteur
- Jules Guilberteau
- article
- Dynamical Systems [math.DS]. 2020
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-
Reports
- titre
- Rapport de conjoncture 2019 : CID 51 Modélisation mathématique, informatique et physique pour les sciences du vivant
- auteur
- Franck Picard, Myriam Ferro, Alice Cleynen, Marie Doumic, Xavier Duchemin, Guillaume Fertin, Jonathan Filee, Philippe Juin, Romain Koszul, Rafael Laboissiere, Dominique Lavenier, Thérèse Malliavin, Antonio Monari, Isabelle Nondier, Françoise Peyrin, Pierre Pouget, David Vallenet, Rufin Vanrullen, Stéphane Vezian, Aleksandra Walczak
- article
- Comité national de la recherche scientifique. 2020
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-
Theses
- titre
- Mathematical Modelling of p62-Ubiquitin aggregates involved in cellular autophagy
- auteur
- Julia Delacour
- article
- Mathematics [math]. Sorbonne Université; Universität Wien, 2020. English. ⟨NNT : 2020SORUS295⟩
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-
- titre
- Mathematical model and control of arbovirus vectors by Wolbachia infection
- auteur
- Pastor Enmanuel Pastor Pérez-Estigarribia
- article
- Dynamical Systems [math.DS]. Facultad Politécnica, Universidad Nacional de Asunción, Paraguay, 2020. English. ⟨NNT : ⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Scalar auxiliary variable finite element scheme for the parabolic-parabolic Keller-Segel model
- auteur
- Alexandre Poulain
- article
- 2020
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-
2019
Journal articles
- titre
- Early stage prion assembly involves two subpopulations with different quaternary structures and a secondary templating pathway
- auteur
- Angélique Igel-Egalon, Florent Laferrière, Mohammed Moudjou, Jan Bohl, Mathieu Mezache, Tina Knäpple, Laetitia Herzog, Fabienne Reine, Christelle Jas-Duval, Marie Doumic, Human Rezaei, Vincent Béringue
- article
- Communications Biology, 2019, 2 (1), pp.1-13. ⟨10.1038/s42003-019-0608-y⟩
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-
- titre
- Influence of Liver Fibrosis on Lobular Zonation
- auteur
- Ahmed Ghallab, Maiju Myllys, Christian H. Holland, Ayham Zaza, Walaa Murad, Reham Hassan, Yasser A. Ahmed, Tahany Abbas, Eman Abdelrahim, Kai Markus Schneider, Madlen Matz-Soja, Jörg Reinders, Rolf Gebhardt, Marie-Luise Berres, Maximilian Hatting, Dirk Drasdo, Julio Saez-Rodriguez, Christian Trautwein, Jan G. Hengstler
- article
- Cells, 2019, 8 (12), pp.1556. ⟨10.3390/cells8121556⟩
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-
- titre
- A quantitative high-resolution computational mechanics cell model for growing and regenerating tissues
- auteur
- Paul Van Liedekerke, Johannes Neitsch, Tim Johann, Enrico Warmt, Ismael Gonzàlez-Valverde, Stefan Hoehme, Steffen Grosser, Josef Kaes, Dirk Drasdo
- article
- Biomechanics and Modeling in Mechanobiology, 2019, ⟨10.1007/s10237-019-01204-7⟩
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-
- titre
- A bi-monomeric, nonlinear Becker-Döring-type system to capture oscillatory aggregation kinetics in prion dynamics
- auteur
- Marie Doumic, Klemens Fellner, Mathieu Mezache, Human Rezaei
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2019, 480, pp.241–261. ⟨10.1016/j.jtbi.2019.08.007⟩
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-
- titre
- Mathematical Models of Gene Expression
- auteur
- Philippe Robert
- article
- Probability Surveys, 2019, 16, pp.56
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-
- titre
- On the Asymptotic Distribution of Nucleation Times of Polymerization Processes
- auteur
- Philippe Robert, Wen Sun
- article
- SIAM Journal on Applied Mathematics, 2019, 79 (5), pp.27. ⟨10.1137/19M1237508⟩
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-
- titre
- A cohort longitudinal study identifies morphology and hemodynamics predictors of abdominal aortic aneurysm growth
- auteur
- Florian Joly, Gilles Soulez, Simon Lessard, Claude Kauffmann, Irene Vignon-Clementel
- article
- Annals of Biomedical Engineering, In press, ⟨10.1007/s10439-019-02375-1⟩
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-
- titre
- A Stochastic Analysis of a Network with Two Levels of Service
- auteur
- Vianney Boeuf, Philippe Robert
- article
- Queueing Systems, In press, 92 (3-4), pp.30. ⟨10.1007/s11134-019-09617-y⟩
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-
- titre
- Implementation of Control Strategies for Sterile Insect Techniques
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Daiver Cardona-Salgado, Yves Dumont, Olga Vasilieva
- article
- Mathematical Biosciences, 2019, 314, pp.43-60. ⟨10.1016/j.mbs.2019.06.002⟩
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-
- titre
- Evolution of cancer cell populations under cytotoxic therapy and treatment optimisation: insight from a phenotype-structured model
- auteur
- Luís Almeida, Patrizia Bagnerini, Giulia Fabrini, Barry D Hughes, Tommaso Lorenzi
- article
- ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, 2019, 53 (4), pp.1157-1190. ⟨10.1051/m2an/2019010⟩
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-
- titre
- Cyclic asymptotic behaviour of a population reproducing by fission into two equal parts
- auteur
- Etienne Bernard, Marie Doumic, Pierre Gabriel
- article
- Kinetic and Related Models , 2019, 12 (3), pp.551-571. ⟨10.3934/krm.2019022⟩
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-
- titre
- Adaptive dynamics of hematopoietic stem cells and their supporting stroma: A model and mathematical analysis
- auteur
- Thanh Nam Nguyen, Jean Clairambault, Thierry Jaffredo, Benoît Perthame, Delphine Salort
- article
- Mathematical Biosciences and Engineering, 2019, 16 (05), pp.4818-4845. ⟨10.3934/mbe.2019243⟩
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-
- titre
- Extra-cellular matrix rigidity may dictate the fate of injury outcome
- auteur
- Diane Peurichard, Marielle Ousset, Jenny Paupert, Benjamin Aymard, Anne Lorsignol, Louis Casteilla, Pierre Degond
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2019, 469, pp.127-136. ⟨10.1016/j.jtbi.2019.02.017⟩
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-
- titre
- A survey of adaptive cell population dynamics models of emergence of drug resistance in cancer, and open questions about evolution and cancer
- auteur
- Jean Clairambault, Camille Pouchol
- article
- BIOMATH, 2019, BIOMATH 2019, 8 (1), pp.23. ⟨10.11145/j.biomath.2019.05.147⟩
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-
- titre
- Bidirectional sliding of two parallel microtubules generated by multiple identical motors
- auteur
- Jun Allard, Marie Doumic, Alex Mogilner, Dietmar Oelz
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2019, ⟨10.1007/s00285-019-01369-w⟩
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-
- titre
- Analysis of Large Urn Models with Local Mean-Field Interactions
- auteur
- Wen Sun, Philippe Robert
- article
- Electronic Journal of Probability, In press, 24 (45), pp.33
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-
- titre
- Quantitative cell-based model predicts mechanical stress response of growing tumor spheroids over various growth conditions and cell lines
- auteur
- Paul van Liedekerke, Johannes Neitsch, Tim Johann, Kévin Alessandri, Pierre Nassoy, Dirk Drasdo
- article
- PLoS Computational Biology, 2019, 15 (3), pp.e1006273. ⟨10.1371/journal.pcbi.1006273⟩
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-
- titre
- Energy and implicit discretization of the Fokker-Planck and Keller-Segel type equations
- auteur
- Luís Almeida, Federica Bubba, Benoît Perthame, Camille Pouchol
- article
- Networks and Heterogeneous Media, 2019, 14 (1), ⟨10.3934/nhm.2019002⟩
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-
- titre
- Steady distribution of the incremental model for bacteria proliferation
- auteur
- Pierre Gabriel, Hugo Martin
- article
- Networks and Heterogeneous Media, 2019, Special issue on mathematical methods in systems biology, 14 (1), pp.149-171. ⟨10.3934/nhm.2019008⟩
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-
- titre
- Optimal releases for population replacement strategies, application to Wolbachia
- auteur
- Luís Almeida, Yannick Privat, Martin Strugarek, Nicolas Vauchelet
- article
- SIAM Journal on Mathematical Analysis, 2019, 51 (4), pp.3170–3194. ⟨10.1137/18M1189841⟩
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-
- titre
- Bile Microinfarcts in Cholestasis Are Initiated by Rupture of the Apical Hepatocyte Membrane and Cause Shunting of Bile to Sinusoidal Blood
- auteur
- Ahmed Ghallab, Ute Hofmann, Selahaddin Sezgin, Nachiket Vartak, Reham Hassan, Ayham Zaza, Patricio Godoy, Kai Markus Schneider, Georgia Guenther, Yasser A. Ahmed, Aya Abbas, Verena Keitel, Lars Kuepfer, Steven Dooley, Frank Lammert, Christian Trautwein, Michael Spiteller, Dirk Drasdo, Alan Hofmann, Peter L.M. Jansen, Jan Hengstler, Raymond Reif
- article
- Hepatology, 2019, 69 (2), pp.666-683. ⟨10.1002/hep.30213⟩
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-
- titre
- Phase portrait control for 1D monostable and bistable reaction-diffusion equations
- auteur
- Camille Pouchol, Emmanuel Trélat, Enrique Zuazua
- article
- Nonlinearity, 2019, 32 (3), pp.884–909. ⟨10.1088/1361-6544/aaf07e⟩
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-
- titre
- Oscillatory regimes in a mosquito population model with larval feedback on egg hatching
- auteur
- Martin Strugarek, Laetitia Dufour, Nicolas Vauchelet, Luís Almeida, Benoît Perthame, Daniel Antunes Maciel Villela
- article
- Journal of Biological Dynamics, 2019, 13 (1), pp.269-300. ⟨10.1080/17513758.2019.1593524⟩
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-
- titre
- Combination of direct methods and homotopy in numerical optimal control: application to the optimization of chemotherapy in cancer
- auteur
- Antoine Olivier, Camille Pouchol
- article
- Journal of Optimization Theory and Applications, 2019, 181 (2), pp.479-503
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-
- titre
- The Flux Limited Keller-Segel System; Properties and Derivation from Kinetic Equations
- auteur
- Benoît Perthame, Nicolas Vauchelet, Zhian Wang
- article
- Revista Matemática Iberoamericana, In press, 36 (2), ⟨10.4171/rmi/1132⟩
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-
- titre
- Mosquito population control strategies for fighting against arboviruses
- auteur
- Luís Almeida, Michel Duprez, Yannick Privat, Nicolas Vauchelet
- article
- Mathematical Biosciences and Engineering, 2019, 16 (6), pp.6274-6297. ⟨10.3934/mbe.2019313⟩
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-
- titre
- Sparse control of Hegselmann-Krause models: Black hole and declustering
- auteur
- Benedetto Piccoli, Nastassia Pouradier Duteil, Emmanuel Trélat
- article
- SIAM Journal on Control and Optimization, 2019, 57 (4), pp.2628–2659. ⟨10.1137/18M1168911⟩
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-
- titre
- A Scaling Analysis of a Star Network with Logarithmic Weights
- auteur
- Philippe Robert, Amandine Véber
- article
- Stochastic Processes and their Applications, 2019, ⟨10.1016/j.spa.2018.06.002⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An evolutionary perspective on cancer, with applications to anticancer drug resistance modelling and perspectives in therapeutic control
- auteur
- Jean Clairambault
- article
- Journal of Mathematical Study, In press, pp.1 – 21
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-
- titre
- Social Dynamics Models with Time-Varying Influence
- auteur
- Sean T Mcquade, Benedetto Piccoli, Nastassia Pouradier Duteil
- article
- Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2019, 29 (04)
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Pressure Reveals Unique Conformational Features in Prion Protein Fibril Diversity
- auteur
- Joan Torrent, Davy Martin, Sylvie Noinville, Yi Yin, Marie Doumic, Mohammed Moudjou, Vincent Béringue, Human Rezaei
- article
- Scientific Reports, 2019, 9, pp.2802. ⟨10.1038/s41598-019-39261-8⟩
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-
- titre
- A chemotaxis-based explanation of spheroid formation in 3D cultures of breast cancer cells
- auteur
- Federica Bubba, Camille Pouchol, Nathalie Ferrand, Guillaume Vidal, Luís Almeida, Benoît Perthame, Michèle Sabbah
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2019, 479, pp.73-80. ⟨10.1016/j.jtbi.2019.07.002⟩
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-
- titre
- Derivation of a voltage density equation from a voltage-conductance kinetic model for networks of integrate-and-fire neurons.
- auteur
- Benoît Perthame, Delphine Salort
- article
- Communications in Mathematical Sciences, 2019, 17 (5), ⟨10.4310/CMS.2019.v17.n5.a2⟩
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-
- titre
- Implicit and Semi-implicit Numerical Schemes for the Gradient Flow of the Formation of Biological Transport Networks
- auteur
- Di Fang, Shi Jin, Peter Markowich, Benoît Perthame
- article
- SMAI Journal of Computational Mathematics, 2019, 5, pp.229-249. ⟨10.5802/smai-jcm.59⟩
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-
Conference papers
- titre
- Estimating the infection rate of a SIR epidemic model via differential elimination
- auteur
- Rosane Ushirobira, Denis Efimov, Pierre-Alexandre Bliman
- article
- ECC 2019 – 18th European Control Conference, Jun 2019, Naples, Italy
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-
- titre
- Feedback Control Principles for Biological Control of Dengue Vectors
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman
- article
- European Control Conference ECC19, Jun 2019, Naples, Italy. pp.6
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-
- titre
- Automated Quantification of Amyloid Fibrils Morphological Features by Image Processing Techniques
- auteur
- Yi Yin, Stephanie Prigent, Joan Torrent, Human Rezaei, Dirk Drasdo, Marie Doumic
- article
- 2019 IEEE 16th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2019, Venice, France. pp.534-537, ⟨10.1109/ISBI.2019.8759597⟩
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-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Quantitative modeling of cell and tissue mechanics with agent-based models
- auteur
- Paul van Liedekerke
- article
- Biological Physics [physics.bio-ph]. Inria Paris, Sobonne Université, 2019
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-
Theses
- titre
- Oscillatory processes during the aggregation and the fragmentation of amyloid fibrils
- auteur
- Mathieu Mezache
- article
- Analysis of PDEs [math.AP]. Sorbonne Université, 2019. English. ⟨NNT : 2019SORUS533⟩
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-
- titre
- Data analysis and integro-differential models in cellular biology
- auteur
- Hugo Martin
- article
- Equations aux dérivées partielles [math.AP]. Sorbonne Université – Laboratoire Jacques-Louis Lions, 2019. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Testing for high frequency features in a noisy signal
- auteur
- Mathieu Mezache, Marc Hoffmann, Human Rezaei, Marie Doumic
- article
- 2019
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-
- titre
- A survey of adaptive cell population dynamics models of emergence of drug resistance in cancer, and open questions about evolution and cancer
- auteur
- Jean Clairambault, Camille Pouchol
- article
- 2019
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Quantitative agent-based modeling reveals mechanical stress response of growing tumor spheroids is predictable over various growth conditions and cell lines
- auteur
- Paul Van Liedekerke, Johannes Neitsch, Tim Johann, Kévin Alessandri, Pierre Nassoy, Dirk Drasdo
- article
- 2019
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-
2018
Journal articles
- titre
- Relative Entropy Method for Measure Solutions of the Growth-Fragmentation Equation
- auteur
- Tomasz Dębiec, Marie Doumic, Piotr Gwiazda, Emil Wiedemann
- article
- SIAM Journal on Applied Mathematics, 2018, 50 (6), pp.5811-5824
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Estimating the division rate and kernel in the fragmentation equation
- auteur
- Marie Doumic, Miguel Escobedo, Magali Tournus
- article
- Annales de l’Institut Henri Poincaré C, Analyse non linéaire, 2018, 35 (7), pp.1847-1884. ⟨10.1016/j.anihpc.2018.03.004⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Long-time asymptotics for polymerization models
- auteur
- Juan Calvo, Marie Doumic, Benoît Perthame
- article
- Communications in Mathematical Physics, 2018, 363 (1), pp.111-137. ⟨10.1007/s00220-018-3218-5⟩
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-
- titre
- Stabilization of periodic orbits of discrete-time dynamical systems using the Prediction-Based Control: New control law and practical aspects
- auteur
- Thiago P Chagas, Pierre-Alexandre Bliman, Karl H. Kienitz
- article
- Journal of The Franklin Institute, 2018, 355 (12), pp.4771-4793. ⟨10.1016/j.jfranklin.2018.04.040⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Control in dormancy or eradication of cancer stem cells: Mathematical modeling and stability issues
- auteur
- Walid Djema, Catherine Bonnet, Frédéric Mazenc, Jean Clairambault, Emilia Fridman, Pierre Hirsch, François Delhommeau
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2018, 449, pp.103 – 123. ⟨10.1016/j.jtbi.2018.03.038⟩
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-
- titre
- Dynamics of concentration in a population model structured by age and a phenotypical trait
- auteur
- Samuel Nordmann, Benoît Perthame, Cécile Taing
- article
- Acta Applicandae Mathematicae, 2018, 155 (1), pp.197-225. ⟨10.1007/s10440-017-0151-0⟩
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-
- titre
- On the stability of the state 1 in the non-local Fisher-KPP equation in bounded domains
- auteur
- Camille Pouchol
- article
- Comptes Rendus. Mathématique, 2018, ⟨10.1016/j.crma.2018.04.016⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The fractional diffusion limit of a kinetic model with biochemical pathway
- auteur
- Benoît Perthame, Weiran Sun, Min Tang
- article
- Zeitschrift für Angewandte Mathematik und Physik = Journal of Applied mathematics and physics = Journal de mathématiques et de physique appliquées, 2018, 69:67, ⟨10.1007/s00033-018-0964-3⟩
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-
- titre
- Career plans and wage structures: a mean field game approach
- auteur
- Benoît Perthame, Edouard Ribes, Delphine Salort
- article
- Mathematics in Engineering, 2018, 1 (1), pp.47-63. ⟨10.3934/Mine.2018.1.47⟩
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-
- titre
- Model Prediction and Validation of an Order Mechanism Controlling the Spatiotemporal Phenotype of Early Hepatocellular Carcinoma
- auteur
- Stefan Hoehme, François Bertaux, William Weens, Bettina Grasl-Kraupp, Jan Hengstler, Dirk Drasdo
- article
- Bulletin of Mathematical Biology, 2018, 80 (5), pp.1134-1171
- Accès au bibtex
-
- titre
- A Large Scale Analysis of Unreliable Stochastic Networks
- auteur
- Reza Aghajani, Philippe Robert, Wen Sun
- article
- The Annals of Applied Probability, In press, 28 (2), pp.36. ⟨10.1214/17-AAP1318⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Approximate Prediction-Based Control Method for Nonlinear Oscillatory Systems with Applications to Chaotic Systems
- auteur
- Thiago P Chagas, Pierre-Alexandre Bliman, Karl H Kienitz
- article
- Journal of Control Science and Engineering, 2018, 2018, pp.1-29. ⟨10.1155/2018/3298286⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- From short-range repulsion to Hele-Shaw problem in a model of tumor growth
- auteur
- Diane Peurichard, Sebastien Motsch
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2018, 76 (1-2), pp.205-234. ⟨10.1007/s00285-017-1143-4⟩
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-
- titre
- Traveling Wave and Aggregation in a Flux-Limited Keller-Segel Model
- auteur
- Vincent Calvez, Benoît Perthame, Shugo Yasuda
- article
- Kinetic and Related Models , 2018, 11 (4), pp.891-909. ⟨10.3934/krm.2018035⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Asymptotic analysis and optimal control of an integro-differential system modelling healthy and cancer cells exposed to chemotherapy
- auteur
- Camille Pouchol, Jean Clairambault, Alexander Lorz, Emmanuel Trélat
- article
- Journal de Mathématiques Pures et Appliquées, 2018, 116 (9), pp.268-308. ⟨10.1016/j.matpur.2017.10.007⟩
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-
- titre
- Quantitative analysis of hepatic macro- and microvascular alterations during cirrhogenesis in the rat
- auteur
- Geert Peeters, Charlotte Debbaut, Adrian Friebel, Pieter Cornillie, Winnok de Vos, Kasper Favere, Ingrid Vander Elst, Tim Vandecasteele, Tim Johann, Luc van Hoorebeke, Diethard Monbaliu, Dirk Drasdo, Stefan Hoehme, Wim Laleman, Patrick Segers
- article
- Journal of Anatomy, In press, ⟨10.1111/joa.12760⟩
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-
- titre
- Analysis of a system describing proliferative-quiescent cell dynamics
- auteur
- Jean Clairambault, Benoît Perthame, Andrada Quillas Maran
- article
- Chinese Annals of Mathematics – Series B, 2018, pp.1-13
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-
- titre
- Super-linear propagation for a general, local cane toads model
- auteur
- Christopher Henderson, Benoît Perthame, Panagiotis E Souganidis
- article
- Interfaces and Free Boundaries : Mathematical Analysis, Computation and Applications, 2018, 20 (4), pp.483-509. ⟨10.4171/IFB/409⟩
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-
- titre
- A Functional Central Limit Theorem for the Becker-Döring model
- auteur
- Wen Sun
- article
- Journal of Statistical Physics, 2018, 171 (1), pp.145-165. ⟨10.1007/s10955-018-1993-1⟩
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-
- titre
- Global stability with selection in integro-differential Lotka-Volterra systems modelling trait-structured populations
- auteur
- Camille Pouchol, Emmanuel Trélat
- article
- Journal of Biological Dynamics, 2018, 12 (1), pp.872–893
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-
- titre
- Stiff-response-induced instability for chemotactic bacteria and flux-limited Keller-Segel equation
- auteur
- Benoît Perthame, Shugo Yasuda
- article
- Nonlinearity, 2018, 31 (9), ⟨10.1088/1361-6544/aac760⟩
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-
Conference papers
- titre
- Discrete element method models of deformable cells in 2D and 3D environments to explore traction generation mechanisms
- auteur
- Diego Vargas, Tommy Heck, Bart Smeets, Paul van Liedekerke, Herman Ramon, Hans van Oosterwijck
- article
- 8th World Congress of Biomechanics, Jul 2018, Dublin, Ireland
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-
- titre
- Stability Analysis of a Nonlinear System with Infinite Distributed Delays Describing Cell Dynamics
- auteur
- Walid Djema, Frédéric Mazenc, Catherine Bonnet, Jean Clairambault, Emilia Fridman
- article
- ACC 2018 – American Control Conference, Jun 2018, Milwaukee, United States. ⟨10.23919/acc.2018.8430869⟩
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-
- titre
- Introducing Cell-Plasticity Mechanisms into a Class of Cell Population Dynamical Systems
- auteur
- Walid Djema, Catherine Bonnet, Frédéric Mazenc, Jean Clairambault
- article
- IEEE American Control Conference (ACC 2018), Jun 2018, Milwaukee, United States. ⟨10.23919/acc.2018.8430758⟩
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-
- titre
- A class of nonlinear adaptive observers for SIR epidemic model
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Denis Efimov, Rosane Ushirobira
- article
- ECC 2018 – European Control Conference, Jun 2018, Limassol, Cyprus. pp.6
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-
- titre
- Interval observer for uncertain time-varying SIR-SI epidemiological model of vector-borne disease
- auteur
- Maria Soledad Aronna, Pierre-Alexandre Bliman
- article
- ECC 2018 – European Control Conference, Jun 2018, Limassol, Cyprus. pp.1-6
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-
- titre
- Dynamics of prion replication and structural diversification
- auteur
- Vincent Béringue, Angélique Igel-Egalon, Florent Laferrière, Mathieu Merzach, Tina Knäpple, Laetitia Herzog, Fabienne Reine, Hubert Laude, Marie Doumic, Human Rezaei
- article
- Prion 2018, May 2018, Santiago de Compostela,, Spain
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-
Book sections
- titre
- Why Is Evolution Important in Cancer and What Mathematics Should Be Used to Treat Cancer? Focus on Drug Resistance
- auteur
- Luís Almeida, Rebecca H Chisholm, Jean Clairambault, Tommaso Lorenzi, Alexander Lorz, Camille Pouchol, Emmanuel Trélat
- article
- Trends in Biomathematics: Modeling, Optimization and Computational Problems: Selected works from the BIOMAT Consortium Lectures, Moscow 2017, Springer International Publishing, pp.107-120, 2018
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-
- titre
- Agent-Based Lattice Models of Multicellular Systems
- auteur
- Dirk Drasdo, Andreas Buttenschön, Paul van Liedekerke
- article
- Numerical Methods and Advanced Simulation in Biomechanics and Biological Processes, Elsevier, pp.223-238, 2018, ⟨10.1016/B978-0-12-811718-7.00012-5⟩
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-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Étude mathématique de modèles cinétiques, fluides et paraboliques issus de la biologie
- auteur
- Ayman Moussa
- article
- Mathématiques [math]. Sorbonne Université – Laboratoire Jacques-Louis Lions, 2018
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-
Special issue
- titre
- Explicit Solution and Fine Asymptotics for a Critical Growth-Fragmentation Equation
- auteur
- Marie Doumic, Bruce van Brunt
- article
- ESAIM: Proceedings and Surveys, 62, pp.30-42, 2018, ⟨10.1051/proc/201862030⟩
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-
Master thesis
- titre
- Modélisation du métabolisme énergétique tumoral glycolytique vs. respiratoire oxydatif
- auteur
- Loïs Naudin
- article
- Mathématiques [math]. 2018
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-
Theses
- titre
- New control of networks / IT : Performance analysis of virtualized network functions for a programmable infrastructure
- auteur
- Verónica Karina Quintuna Rodriguez
- article
- Networking and Internet Architecture [cs.NI]. Sorbonne Université, 2018. English. ⟨NNT : 2018SORUS099⟩
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-
- titre
- Mathematical modeling of population dynamics, applications to vector control of Aedes spp. (Diptera:Culicidae)
- auteur
- Martin Strugarek
- article
- Analysis of PDEs [math.AP]. Sorbonne Université UPMC, 2018. English. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- Analysis, control and optimization of PDEs, application to the biology and therapy of cancer
- auteur
- Camille Pouchol
- article
- General Mathematics [math.GM]. Sorbonne Université, 2018. English. ⟨NNT : 2018SORUS176⟩
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-
- titre
- A study of interacting stochastic networks : large scale, long time behavior and fluctuations, with applications in communication networks and protein polymerization
- auteur
- Wen Sun
- article
- Dynamical Systems [math.DS]. Sorbonne Université, 2018. English. ⟨NNT : 2018SORUS075⟩
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-
- titre
- Dynamique de concentration dans des équations aux dérivées partielles non locales issues de la biologie
- auteur
- Cécile Taing
- article
- Analysis of PDEs [math.AP]. Sorbonne Université; Inria Paris, 2018. English. ⟨NNT : 2018SORUS077⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- On the use of the sterile insect technique or the incompatible insect technique to reduce or eliminate mosquito populations
- auteur
- Martin Strugarek, Herve Bossin, Yves Dumont
- article
- 2018
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-
- titre
- Sharp seasonal threshold property for cooperative population dynamics with concave nonlinearities
- auteur
- Martin Strugarek, Hongjun Ji
- article
- 2018
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-
2017
Journal articles
- titre
- Hybrid coupling of a one-dimensional Energy-Transport Schrödinger system
- auteur
- Clément Jourdana, Paola Pietra, Nicolas Vauchelet
- article
- Monatshefte für Mathematik, 2017, 184 (4), pp.563-596. ⟨10.1007/s00605-016-1008-8⟩
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-
- titre
- Corrigendum
- auteur
- Geert Peeters, Charlotte Debbaut, Wim Laleman, Adrian Friebel, Diethard Monbaliu, Ingrid Vander Elst, Detrez Jan R., Tim Vandecasteele, Tim Johann, Thomas de Schryver, Luc van Hoorebeke, Kasper Favere, Verbeke Jonas, Dirk Drasdo, Stefan Hoehme, Patrick Segers, Pieter Cornillie, Vos Winnok H. De
- article
- Journal of Anatomy, 2017, 231 (5), pp.786-786. ⟨10.1111/joa.12723⟩
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-
- titre
- Adverse outcome pathways: opportunities, limitations and open questions
- auteur
- Marcel Leist, Ahmed Ghallab, Rabea Graepel, Rosemarie Marchan, Reham Hassan, Susanne Hougaard Bennekou, Alice Limonciel, Mathieu Vinken, Stefan Schildknecht, Tanja Waldmann, Erik Danen, Ben van Ravenzwaay, Hennicke Kamp, Iain Gardner, Patricio Godoy, Frédéric Bois, Albert Braeuning, Raymond Reif, Franz Oesch, Dirk Drasdo, Stefan Höhme, Michael Schwarz, Thomas Hartung, Thomas Braunbeck, Joost Beltman, Harry Vrieling, Ferran Sanz, Anna Forsby, Domenico Gadaleta, Ciarán Fisher, Jens Kelm, David Fluri, Gerhard Ecker, Barbara Zdrazil, Andrea Terron, Paul Jennings, Bart van Der Burg, Steven Dooley, Annemarie Meijer, Egon Willighagen, Marvin Martens, Chris Evelo, Enrico Mombelli, Olivier Taboureau, Albert Mantovani, Barry Hardy, Bjorn Koch, Sylvia Escher, Chris van Thriel, Cristina Cadenas, Dinant Kroese, Bob van de Water, Jan Hengstler
- article
- Archives of Toxicology, 2017, 91 (11), pp.3477-3505. ⟨10.1007/s00204-017-2045-3⟩
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-
- titre
- Ensuring successful introduction of Wolbachia in natural populations of Aedes aegypti by means of feedback control
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, M. Soledad Aronna, Flávio C. Coelho, Moacyr A. H. B. da Silva
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2017, ⟨10.1007/s00285-017-1174-x⟩
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-
- titre
- Synchronising and non-synchronising dynamics for a two-species aggregation model
- auteur
- Casimir Emako, Jie Liao, Nicolas Vauchelet
- article
- Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, 2017, 22 (6), pp.2121 – 2146. ⟨10.3934/dcdsb.2017088⟩
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-
- titre
- Integrating Biological and Mathematical Models to Explain and Overcome Drug Resistance in Cancer, Part 1: Biological Facts and Studies in Drug Resistance
- auteur
- Aaron Goldman, Mohammad Kohandel, Jean Clairambault
- article
- Current Stem Cell Reports, 2017, ⟨10.1007/s40778-017-0097-1⟩
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-
- titre
- Integrating Biological and Mathematical Models to Explain and Overcome Drug Resistance in Cancer, Part 2: From Theoretical Biology to Mathematical Models
- auteur
- Aaron Goldman, Mohammad Kohandel, Jean Clairambault
- article
- Current Stem Cell Reports, 2017, ⟨10.1007/s40778-017-0098-0⟩
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-
- titre
- The mechanism of monomer transfer between two structurally distinct PrP oligomers
- auteur
- Aurora Armiento, Philippe Moireau, Davy Martin, Nad’a Lepejova, Marie Doumic, Human Rezaei
- article
- PLoS ONE, 2017, 12 (7), ⟨10.1371/journal.pone.0180538⟩
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-
- titre
- Analysis of a Stochastic Model of Replication in Large Distributed Storage Systems
- auteur
- Wen Sun, Véronique Simon, Sébastien Monnet, Philippe Robert, Pierre Sens
- article
- Proceedings of the ACM on Measurement and Analysis of Computing Systems , 2017, 1 (1), pp.1 – 21. ⟨10.1145/3084462⟩
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-
- titre
- How does variability in cells aging and growth rates influence the malthus parameter?
- auteur
- Adélaïde Olivier
- article
- Kinetic and Related Models , 2017, 10 (2), pp.481-512. ⟨10.3934/krm.2017019⟩
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-
- titre
- Analytical examples of diffusive waves generated by a traveling wave
- auteur
- Harold Moundoyi, Ayman Moussa, Benoît Perthame, Benoît Sarels
- article
- Applicable Analysis, 2017, 96 (9), pp.1596-1615. ⟨10.1080/00036811.2017.1314463⟩
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-
- titre
- Toward an integrated workforce planning framework using structured equations
- auteur
- Marie Doumic, Benoît Perthame, Edouard Ribes, Delphine Salort, Nathan Toubiana
- article
- European Journal of Operational Research, 2017, 262, ⟨10.1016/j.ejor.2017.03.076⟩
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-
- titre
- Positive effect of Mdm2 on p53 expression explains excitability of p53 in response to DNA damage
- auteur
- Jan Elias
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2017, 418, pp.94-104. ⟨10.1016/j.jtbi.2017.01.038⟩
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-
- titre
- On interfaces between cell populations with different mobilities
- auteur
- Tommaso Lorenzi, Alexander Lorz, Benoît Perthame
- article
- Kinetic and Related Models , 2017, 10 (1), pp.299-311. ⟨10.3934/krm.2017012⟩
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-
- titre
- Dirac concentrations in a chemostat model of adaptive evolution
- auteur
- Alexander Lorz, Benoît Perthame, Cécile Taing
- article
- Chinese Annals of Mathematics – Series B, 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Balanced Growth Path Solutions of a Boltzmann Mean Field Game Model for Knowledge Growth
- auteur
- Martin Burger, Alexander Lorz, Marie-Therese Wolfram
- article
- Kinetic and Related Models , 2017, ⟨10.3934/krm.2017005⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modulating Portal Hemodynamics With Vascular Ring Allows Efficient Regeneration After Partial Hepatectomy in a Porcine Model.
- auteur
- Petru O. Bucur, Mohamed Bekheit, Chloe Audebert, Amnah Othman, Seddik Hammad, Mylène Sebagh, Marc Antoine Allard, Benoît Decante, Adrian Friebel, Dirk Drasdo, Elodie Miquelestorena-Standley, Jan G. Hengstler, Irene Vignon-Clementel, Eric Vibert
- article
- Annals of Surgery, 2017, ⟨10.1097/SLA.0000000000002146⟩
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-
- titre
- Effects of initial telomere length distribution on senescence onset and heterogeneity
- auteur
- Sarah Eugene, Thibault Bourgeron, Zhou Xu
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2017, 413, pp.8
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modeling extracellular matrix viscoelasticity using smoothed particle hydrodynamics with improved boundary treatment
- auteur
- Tommy Heck, Bart Smeets, Simon Vanmaercke, Pinaki Bhattachara, Tim Odenthal, Herman Ramon, Hans van Oosterwijck, Paul van Liedekerke
- article
- Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering, 2017, ⟨10.1016/j.cma.2017.04.031⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A numerical scheme for the early steps of nucleation-aggregation Models
- auteur
- Harvey Thomas Banks, Marie Doumic, Carola Kruse
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2017, 74 (1-2), pp.259-287. ⟨10.1007/s00285-016-1026-0⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Distributed synaptic weights in a LIF neural network and learning rules
- auteur
- Benoît Perthame, Delphine Salort, Gilles Wainrib
- article
- Physica D: Nonlinear Phenomena, 2017, 353-354, pp.20-30. ⟨10.1016/j.physd.2017.05.005⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Tumor cell load and heterogeneity estimation from diffusion-weighted MRI calibrated with histological data: an example from lung cancer
- auteur
- Yi Yin, Oliver Sedlaczek, Benedikt Müller, Arne Warth, Margarita González-Vallinas, Bernd Lahrmann, Niels Grabe, Hans-Ulrich Kauczor, Kai Breuhahn, Irene Vignon-Clementel, Dirk Drasdo
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2017, ⟨10.1109/TMI.2017.2698525⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A cooperative conjugate gradient method for linear systems permitting efficient multi-thread implementation
- auteur
- Amit A Bhaya, Pierre-Alexandre A Bliman, Guilherme Niedu, Fernando A Pazos
- article
- Computational & Applied Mathematics, 2017, pp.1-28. ⟨10.1007/s40314-016-0416-7⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Hele-Shaw Problem for Tumor Growth
- auteur
- Antoine Mellet, Benoît Perthame, Fernando Quirós
- article
- Journal of Functional Analysis, 2017, 273, pp.3061-3093
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- From Kinetic Theory of Multicellular Systems to Hyperbolic Tissue Equations: Asymptotic Limits and Computing
- auteur
- Nisrine Outada, Nicolas Vauchelet, Thami Akrid, Mohamed Khaladi
- article
- Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Establishing Traveling Wave in Bistable Reaction-Diffusion System by Feedback
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Nicolas Vauchelet
- article
- IEEE Control Systems Letters, 2017, 1 (1), pp.62-67. ⟨10.1109/LCSYS.2017.2703303⟩
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-
Conference papers
- titre
- Analysis of Blood Cell Production under Growth Factors Switching
- auteur
- Walid Djema, Hitay Ozbay, C. Bonnet, E Fridman, Frédéric Mazenc, J Clairambault
- article
- IFAC 2017 – 20th World Congress of the International Federation of Automatic Control, Jul 2017, Toulouse, France. pp.13312-13317, ⟨10.1016/j.ifacol.2017.08.1331⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Analysis of a Model of Dormancy in Cancer as a State of Coexistence Between Tumor and Healthy Stem Cells
- auteur
- Walid Djema, Jean Clairambault, Frédéric Mazenc, Pierre Hirsch, Francois Delhommeau
- article
- ACC 2017 – American Control Conference, May 2017, Seattle, United States. pp.5135-5140, ⟨10.23919/ACC.2017.7963751⟩
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-
- titre
- Telomere Replication in the Absence of Telomerase: Failure, Repair and Adaptation
- auteur
- Xu Zhou, Henninger Erin, Jolivet Pascale, Coutelier Héloïse, Fallet Emilie, Doumic Marie, Charvin Gilles, Maria Teresa Teixeira
- article
- Genomic Instability and DNA Repair, Keystone Symposia, Apr 2017, Santa Fe (NM), United States
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-
Book sections
- titre
- Off-Lattice Agent-Based Models for Cell and Tumor Growth: Numerical Methods, Implementation, and Applications
- auteur
- Paul van Liedekerke, Andreas Buttenschön, Dirk Drasdo
- article
- Miguel Cerrolaza; Sandra J. Shefelbine; Diego Garzón-Alvarado. Numerical Methods and Advanced Simulation in Biomechanics and Biological Processes, Academic Press, pp.245-267, 2017, 978-0-12-811718-7
- Accès au bibtex
-
- titre
- Creation of Three-dimensional Liver Tissue Models from Experimental Images for Systems Medicine
- auteur
- Stefan Hoehme, Adrian Friebel, Seddik Hammad, Dirk Drasdo, Jan G. Hengstler
- article
- Peggy Stock, Bruno Christ. Hepatocyte Transplantation, 1506, Springer, pp.319-362, 2017, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-6504-5 (Print) 978-1-4939-6506-9. ⟨10.1007/978-1-4939-6506-9_22⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- System modeling of receptor-induced apoptosis
- auteur
- François Bertaux, Dirk Drasdo, Gregory Batt
- article
- Olivier Micheau. TRAIL, Fas Ligand, TNF and TLR3 in Cancer, 12, 2017, Resistance to Targeted Anti-Cancer Therapeutics, 978-3-319-56804-1
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Interval Observers for SIR Epidemic Models Subject to Uncertain Seasonality
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Bettina D ‘Avila Barros
- article
- Lecture Notes in Control and Information Sciences, 471, pp.9, 2017, ⟨10.1007/978-3-319-54211-9_3⟩
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-
Master thesis
- titre
- Design and identification on biological data of a dedicated model of the interactions between haematopoietic stem/progenitor cells and supporting stroma
- auteur
- Julie Favre
- article
- Cancer. 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Theses
- titre
- Inverse problems and data assimilation methods applied to protein polymerisation
- auteur
- Aurora Armiento
- article
- Optimization and Control [math.OC]. Université Paris 7 – Diderot, 2017. English. ⟨NNT : ⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- A model for cost efficient Workforce Organizational Dynamics and its optimization
- auteur
- Benoît Perthame, Edouard Ribes, Karim Touahri, Delphine Salort
- article
- 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Strategic Workforce Planning and sales force : a demographic approach to productivity
- auteur
- Marie Doumic, Mathieu Mezache, Benoît Perthame, Edouard Ribes, Delphine Salort
- article
- 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Trend to equilibrium for a reaction-diffusion system modelling reversible enzyme reaction
- auteur
- Jan Elias
- article
- 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Hindrances to bistable front propagation: application to Wolbachia invasion
- auteur
- Grégoire Nadin, Martin Strugarek, Nicolas Vauchelet
- article
- 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Videos
- titre
- Simulation of the critical fragmentation equation with binary fission
- auteur
- Marie Doumic
- article
- 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2016
Journal articles
- titre
- Tracking the evolution of cancer cell populations through the mathematical lens of phenotype-structured equations
- auteur
- Tommaso Lorenzi, Rebecca H. Chisholm, Jean Clairambault
- article
- Biology Direct, 2016, 11 (1), pp.43. ⟨10.1186/s13062-016-0143-4⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Asymptotics of Stochastic Protein Assembly Models
- auteur
- Marie Doumic, Sarah Eugene, Philippe Robert
- article
- SIAM Journal on Applied Mathematics, 2016, 76 (6), pp.20. ⟨10.1137/16M1066920⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Behavioral modulation of the coexistence between Apis melifera and Varroa destructor : A defense against colony colapse disorder?
- auteur
- Joyce de Figueiró Santos, Flávio Codeço Coelho, Pierre-Alexandre Bliman
- article
- PLoS ONE, 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Time Asymptotics for a Critical Case in Fragmentation and Growth-Fragmentation Equations
- auteur
- Marie Doumic, Miguel Escobedo
- article
- Kinetic and Related Models , 2016, 9 (2), pp.47. ⟨10.3934/krm.2016.9.251⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Notes on a PDE System for Biological Network Formation
- auteur
- Jan Haskovec, Peter Markowich, Benoît Perthame, Matthias Schlottbom
- article
- Nonlinear Analysis: Real World Applications, 2016, Nonlinear Partial Differential Equations, in honor of Juan Luis Vázquez for his 70th birthday, 138, pp.127-155. ⟨10.1016/j.na.2015.12.018⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Insights into the variability of nucleated amyloid polymerization by a minimalistic model of stochastic protein assembly
- auteur
- Sarah Eugene, Wei-Feng Xue, Philippe Robert, Marie Doumic
- article
- The Journal of Chemical Physics, 2016, 144 (17), pp.12. ⟨10.1063/1.4947472⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Traveling Pulses for a Two-Species Chemotaxis Model
- auteur
- Casimir Emako, Charlène Gayrard, Axel Buguin, Luís Neves de Almeida, Nicolas Vauchelet
- article
- PLoS Computational Biology, 2016, 12 (4), pp.e1004843. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004843⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Estimation from Moments Measurements for Amyloid Depolymerisation
- auteur
- Aurora Armiento, Marie Doumic, Philippe Moireau, Human Rezaei
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2016, 397, pp.68 – 88. ⟨10.1016/j.jtbi.2016.02.037⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Macroscopic Model for Cross-Linked Fibers with Alignment Interactions: Existence Theory and Numerical Simulations
- auteur
- Diane Peurichard
- article
- Multiscale Modeling and Simulation: A SIAM Interdisciplinary Journal, 2016, 14 (4), pp.1175-1210. ⟨10.1137/15M1026729⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Interactions between immune challenges and cancer cells proliferation: timing does matter!
- auteur
- Camille Jacqueline, Youssef Bourfia, Hassan Hbid, Gabriele Sorci, Frédéric Thomas, Benjamin Roche
- article
- Evolution, Medicine, and Public Health, 2016, 2016 (1), pp.299-311. ⟨10.1093/emph/eow025⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Equivalence between duality and gradient flow solutions for one-dimensional aggregation equations
- auteur
- Francois James, Nicolas Vauchelet
- article
- Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series A, 2016, 36 (3), pp.1355-1382. ⟨10.3934/dcds.2016.36.1355⟩
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-
- titre
- Physiologically structured cell population dynamic models with applications to combined drug delivery optimisation in oncology
- auteur
- Jean Clairambault, Olivier Fercoq
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2016, pp.22. ⟨10.1051/mmnp/201611604⟩
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-
- titre
- Inferring Growth Control Mechanisms in Growing Multi-cellular Spheroids of NSCLC Cells from Spatial-Temporal Image Data
- auteur
- Nick Jagiella, Benedikt Müller, Margareta Müller, Irene E. Vignon-Clementel, Dirk Drasdo
- article
- PLoS Computational Biology, 2016, 12 (2), pp.e1004412. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004412⟩
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-
- titre
- Cooperative concurrent asynchronous computation of the solution of symmetric linear systems
- auteur
- Amit Bhaya, Pierre-Alexandre Bliman, Fernando Pazos
- article
- Numerical Algorithms, 2016, ⟨10.1007/s11075-016-0213-9⟩
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-
- titre
- The Filippov characteristic flow for the aggregation equation with mildly singular potentials
- auteur
- José Antonio Carrillo, Francois James, Frédéric Lagoutière, Nicolas Vauchelet
- article
- Journal of Differential Equations, 2016, 260 (1), pp.304-338. ⟨10.1016/j.jde.2015.08.048⟩
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-
- titre
- Free boundary problems for tumor growth: a viscosity solutions approach
- auteur
- Inwon C. Kim, Benoît Perthame, Panagiotis E. Souganidis
- article
- Nonlinear Analysis: Theory, Methods and Applications, 2016, 138, pp.207-228. ⟨10.1016/j.na.2016.01.019⟩
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-
- titre
- Hydrodynamic singular regimes in 1+1 kinetic models and spectral numerical methods
- auteur
- Laurent Gosse, Nicolas Vauchelet
- article
- Journal of Mathematical Analysis and Applications, 2016, ⟨10.1016/j.jmaa.2016.07.059⟩
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-
- titre
- Rare mutations limit of a steady state dispersal evolution model
- auteur
- Benoît Perthame, Panagiotis E. Souganidis
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2016, 11 (4), ⟨10.1051/mmnp/201611411⟩
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-
- titre
- Reduction to a single closed equation for 2 by 2 reaction-diffusion systems of Lotka-Volterra type
- auteur
- Martin Strugarek, Nicolas Vauchelet
- article
- SIAM Journal on Applied Mathematics, 2016, 76 (5), pp.2060-2080
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-
- titre
- Semi-discretization for Stochastic Scalar Conservation Laws with Multiple Rough Fluxes
- auteur
- Benjamin Gess, Benoît Perthame, Panagiotis E. Souganidis
- article
- SIAM Journal on Numerical Analysis, 2016, 54 (4), pp.2187-2209. ⟨10.1137/15M1053670⟩
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-
- titre
- Uncertainty propagation; intrusive kinetic formulations of scalar conservation laws
- auteur
- Bruno Després, Benoît Perthame
- article
- SIAM/ASA Journal on Uncertainty Quantification, 2016, 4 (1), pp.980-1013
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-
- titre
- On a Boltzmann mean field model for knowledge growth
- auteur
- Martin Burger, Alexander Lorz, Marie-Therese Wolfram
- article
- SIAM Journal on Applied Mathematics, 2016, ⟨10.1137/15M1018599⟩
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-
- titre
- Mathematics of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics: Diversity of Topics, Models and Methods
- auteur
- Gennady Bocharov, Anas Bouchnita, Jean Clairambault, Vitaly Volpert
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2016
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-
- titre
- Epidemiological data accessibility in Brazil: Current challenges for an adequate response to emergencies
- auteur
- Flávio Codeço Coelho, Cláudia Torres Codeço, Oswaldo Gonçalves Cruz, Sabrina Camargo, Pierre-Alexandre Bliman
- article
- The Lancet Infectious Diseases, 2016, 16, pp.524 – 525. ⟨10.1016/S1473-3099(16)30007-X⟩
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-
- titre
- Derivation of the bacterial run-and-tumble kinetic equation from a model with biochemical pathway
- auteur
- Benoît Perthame, Min Tang, Nicolas Vauchelet
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2016
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-
Conference papers
- titre
- Stability of a Delay System Coupled to a Differential-Difference System Describing the Coexistence of Ordinary and Mutated Hematopoietic Stem Cells
- auteur
- Walid Djema, Frédéric Mazenc, Catherine Bonnet, Jean Clairambault, P Hirsch, François Delhommeau
- article
- 55th IEEE Conference on Decision and Control (CDC 2016), Dec 2016, Las Vegas, United States. ⟨10.1109/cdc.2016.7798328⟩
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-
- titre
- Quantitative Estimation of Tumor Cellularity Based on Histology Data
- auteur
- Yi Yin, Oliver Sedlaczek, Arne Warth, Margarita González-Vallinas, Kai Breuhahn, Irene Vignon-Clementel, Dirk Drasdo
- article
- IEEE Nuclear Science Symposuim & Medical Imaging Conference, Oct 2016, Oct 2016, Strasbourg, France
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-
- titre
- Tumor Microvasculature in Lung Cancer and Diffusion-Weighted MRI: Preliminary Results
- auteur
- Yi Yin, Oliver Sedlaczek, Johannes Lotz, Janine Olesch, Kai Breuhahn, Dirk Drasdo, Irene Vignon-Clementel
- article
- IEEE Nuclear Science Symposuim & Medical Imaging Conference, Oct 2016, Strasbourg, France
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-
- titre
- Interval observer for SIR epidemic model subject to uncertain seasonality
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Bettina D ‘Avila Barros
- article
- Positive Systems – POSTA 2016, Sep 2016, Roma, Italy
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-
Master thesis
- titre
- Investigating cancer resistance in a Glioblastoma cell line with gene expression data
- auteur
- Hicham Janati
- article
- Statistics [stat]. 2016
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-
Poster communications
- titre
- Tumour growth and drug resistance: an evolutionary view with perspectives in therapeutics
- auteur
- Jean Clairambault, Luís Almeida, Rebecca Chisholm, Tommaso Lorenzi, Alexander Lorz, Benoît Perthame, Camille Pouchol, Emmanuel Trélat
- article
- ECMTB 2016 – European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jul 2016, Nottingham, United Kingdom. 2016
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-
Theses
- titre
- Mathematical Modeling in Cellular Dynamics: Applications to Cancer Research
- auteur
- Youssef Bourfia
- article
- Mathematics [math]. Université Paris 6 – Pierre et Marie Curie; Université Cadi Ayyad, 2016. English. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- Cell-based multi-scale modeling for systems and synthetic biology : from stochastic gene expression in single cells to spatially organized cell populations
- auteur
- François Bertaux
- article
- Modeling and Simulation. Université Pierre et Marie Curie – Paris VI, 2016. English. ⟨NNT : 2016PA066101⟩
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-
- titre
- Study of two-species chemotaxis models
- auteur
- Casimir Emako Kazianou
- article
- General Mathematics [math.GM]. Université Pierre et Marie Curie – Paris VI, 2016. English. ⟨NNT : 2016PA066045⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Quantitative modeling identifies robust predictable stress response of growing CT26 tumor spheroids under variable conditions
- auteur
- P van Liedekerke, J Neitsch, T Johann, K Alessandri, P Nassoy, Dirk Drasdo
- article
- 2016
- Accès au bibtex
-
- titre
- Model prediction and validation of an order mechanism controlling the spatio-temporal phenotype of early hepatocellular carcinoma
- auteur
- François Bertaux, Stefan Hoehme, William Weens, Bettina Grasl-Kraupp, Jan G. Hengstler, Dirk Drasdo
- article
- 2016
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-
- titre
- Analysis and simulation of nonlinear and nonlocal transport equations
- auteur
- Frédéric Lagoutière, Nicolas Vauchelet
- article
- 2016
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-
- titre
- Quantifying the Survival Uncertainty of Wolbachia-infected Mosquitoes in a Spatial Model *
- auteur
- Martin Strugarek, Nicolas Vauchelet, Jorge Zubelli
- article
- 2016
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-
- titre
- Physiologically structured cell population dynamic models with applications to combined drug delivery optimisation in oncology
- auteur
- Jean Clairambault, Olivier Fercoq
- article
- 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Well-balanced and asymptotic preserving schemes for kinetic models
- auteur
- Casimir Emako, Min Tang
- article
- 2016
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-
Videos
- titre
- Simulation of the growth-fragmentation equation in a periodic case – Non-dissipative numerical scheme
- auteur
- Marie Doumic
- article
- 2016
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-
2015
Journal articles
- titre
- Microscopic approach of a time elapsed neural model
- auteur
- Julien Chevallier, Maria J. Caceres, Marie Doumic, Patricia Reynaud-Bouret
- article
- Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2015, http://www.worldscientific.com/doi/10.1142/S021820251550058X. ⟨10.1142/S021820251550058X⟩
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-
- titre
- Nonparametric estimation of the division rate of an age dependent branching process
- auteur
- Marc Hoffmann, Adélaïde Olivier
- article
- Stochastic Processes and their Applications, 2015, ⟨10.1016/j.spa.2015.11.009⟩
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-
- titre
- Mathematical model reveals how regulating the three phases of T-cell response could counteract immune evasion
- auteur
- Tommaso Lorenzi, Rebecca H. Chisholm, Matteo Melensi, Alexander Lorz, Marcello Delitala
- article
- Immunology, 2015, 146 (2), pp.271-280. ⟨10.1111/imm.12500⟩
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-
- titre
- Model-guided identification of a therapeutic strategy to reduce hyperammonemia in liver diseases
- auteur
- Ahmed Ghallab, Geraldine Celliere, Sebastian Henkel, Dominik Driesch, Stefan Hoehme, Ute Hofmann, Sebastian Zellmer, Patricio Godoy, Agapios Sachinidis, Meinolf Blaszkewicz, Raymond Reif, Rosemarie Marchan, Lars Kuepfer, Dieter Häussinger, Dirk Drasdo, G Gebhardt, Jan G. Hengstler
- article
- Journal of Hepatology, 2015, 64 (4), pp.860-871. ⟨10.1016/j.jhep.2015.11.018⟩
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-
- titre
- Simulating tissue mechanics with Agent Based Models: concepts and perspectives
- auteur
- Paul van Liedekerke, Margriet Palm, N Jagiella, Dirk Drasdo
- article
- Computational Particle Mechanics, 2015, 2 (4), pp.401-444. ⟨10.1007/s40571-015-0082-3⟩
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-
- titre
- The asymmetry of telomere replication contributes to replicative senescence heterogeneity
- auteur
- Thibault Bourgeron, Zhou Xu, Marie Doumic, Maria Teresa Teixeira
- article
- Scientific Reports, 2015, 5, pp.15326. ⟨10.1038/srep15326⟩
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-
- titre
- Dynamics of time elapsed inhomogeneous neuron network model
- auteur
- Moon-Jin Kang, Benoît Perthame, Delphine Salort
- article
- Comptes Rendus. Mathématique, 2015, 353, pp.1111-1115. ⟨10.1016/j.crma.2015.09.029⟩
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-
- titre
- Modelling and numerics for respiratory aerosols
- auteur
- Laurent Boudin, Céline Grandmont, Alexander Lorz, Ayman Moussa
- article
- Communications in Computational Physics, 2015, 18 (3), pp.723-756. ⟨10.4208/cicp.180714.200415a⟩
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-
- titre
- Dissecting the dynamics of epigenetic changes in phenotype-structured populations exposed to fluctuating environments
- auteur
- Tommaso Lorenzi, Rebecca H. Chisholm, Laurent Desvillettes, Barry D. Hughes
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2015, 386, pp.166-176. ⟨10.1016/j.jtbi.2015.08.031⟩
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-
- titre
- Concomitant expression of far upstream element (FUSE) binding protein (FBP) interacting repressor (FIR) and its splice variants induce migration and invasion of non-small cell lung cancer (NSCLC) cells
- auteur
- Benedikt Müller, Michael Bovet, Yi Yin, Damian Stiche, Mona Malz, Margarita González-Vallinas, Alistair Middleton, Volker Ehemann, Jennifer Schmitt, Thomas Muley, Michael Meister, Esther Herpel, Stephan Singer, Arne Warth, Peter Schirmacher, Dirk Drasdo, Franziska Matthäus, Kai Breuhahn
- article
- Journal of Pathology, 2015, 237 (3), pp.390-401. ⟨10.1002/path.4588⟩
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-
- titre
- Qualitative Properties of Solutions for the Noisy Integrate & Fire model in Computational Neuroscience
- auteur
- José Carrillo, Benoît Perthame, Delphine Salort, Didier Smets
- article
- Nonlinearity, 2015, 28 (9), pp.3365 ⟨10.1088/0951-7715/28/9/3365⟩
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-
- titre
- Gap geometry dictates epithelial closure efficiency
- auteur
- Andrea Ravasio, Ibrahim Cheddadi, Tianchi Chen, Telmo Pereira, Hui Ting Ong, Cristina Bertocchi, Agusti Brugues, Antonio Jacinto, Alexandre J. Kabla, Yusuke Toyama, Xavier Trepat, Nir Gov, Luís Almeida, Benoit Ladoux
- article
- Nature Communications, 2015, 6, pp.NATURE COMMUNICATIONS | 6:7683 | DOI: 10.1038/ncomms8683 ⟨10.1038/ncomms8683⟩
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-
- titre
- Information Content in Data Sets for a Nucleated-Polymerization Model
- auteur
- H. T. Banks, Marie Doumic, Carola Kruse, Stephanie Prigent, H Rezaei
- article
- Journal of Biological Dynamics, 2015, 9 (1), pp.26. ⟨10.1080/17513758.2015.1050465⟩
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-
- titre
- Existence and diffusive limit of a two-species kinetic model of chemotaxis
- auteur
- Luís Almeida, Casimir Emako, Nicolas Vauchelet
- article
- Kinetic and Related Models , 2015, ⟨10.3934/krm.2015.8.359⟩
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-
- titre
- TiQuant: software for tissue analysis, quantification and surface reconstruction
- auteur
- Adrian Friebel, Johannes Neitsch, Tim Johann, Seddik Hammad, Dirk Drasdo, Stefan Hoehme
- article
- Bioinformatics, 2015, 31 (19), pp.3234-3236. ⟨10.1093/bioinformatics/btv346⟩
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-
- titre
- Mathematical Analysis of a System for Biological Network Formation
- auteur
- Jan Haskovec, Peter Markowich, Benoît Perthame
- article
- Communications in Partial Differential Equations, 2015, 40 (5), pp.918-956. ⟨10.1080/03605302.2014.968792⟩
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-
- titre
- Emergence of Drug Tolerance in Cancer Cell Populations: An Evolutionary Outcome of Selection, Nongenetic Instability, and Stress-Induced Adaptation
- auteur
- Rebecca H. Chisholm, Tommaso Lorenzi, Alexander Lorz, Annette K. Larsen, Luís Almeida, Alexandre Escargueil, Jean Clairambault
- article
- Cancer Research, 2015, 75 (6), pp.930-939. ⟨10.1158/0008-5472.CAN-14-2103⟩
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-
- titre
- Data Assimilation for hyperbolic conservation laws. A Luenberger observer approach based on a kinetic description
- auteur
- Anne-Céline Boulanger, Philippe Moireau, Benoît Perthame, Jacques Sainte-Marie
- article
- Communications in Mathematical Sciences, 2015, 13 (3), pp.587 – 622. ⟨10.4310/CMS.2015.v13.n3.a1⟩
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-
- titre
- Social information use and the evolution of unresponsiveness in collective systems
- auteur
- Colin J Torney, Tommaso Lorenzi, Iain D Couzin, Simon A Levin
- article
- Journal of the Royal Society Interface, 2015, ⟨10.1098/rsif.2014.0893⟩
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- titre
- Modeling the effects of space structure and combination therapies on phenotypic heterogeneity and drug resistance in solid tumors
- auteur
- Alexander Lorz, Tommaso Lorenzi, Jean Clairambault, Alexandre Escargueil, Benoît Perthame
- article
- Bulletin of Mathematical Biology, 2015, 77 (1), pp.1-22. ⟨10.1007/s11538-014-0046-4⟩
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-
- titre
- Unraveling liver complexity from molecular to organ level: Challenges and perspectives
- auteur
- Lorenza Alice d’Alessandro, Stefan Hoehme, Adriano Henney, Dirk Drasdo, Ursula Klingmüller
- article
- Progress in Biophysics and Molecular Biology, 2015, 117 (1), pp.78-86. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2014.11.005⟩
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-
- titre
- My Personal Journey In Mathematical Biology & Medicine
- auteur
- Jean Clairambault
- article
- Society for Mathematical Biology Newsletter, 2015, SMB Newsletter, 28 (1), pp.2
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-
- titre
- Numerical methods for one-dimensional aggregation equations
- auteur
- Francois James, Nicolas Vauchelet
- article
- SIAM Journal on Numerical Analysis, 2015, 53 (2), pp.895-916. ⟨10.1137/140959997⟩
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-
- titre
- Transversal instability for the thermodiffusive reaction-diffusion system
- auteur
- Michal Kolwalczyk, Benoît Perthame, Nicolas Vauchelet
- article
- Chinese Annals of Mathematics – Series B, 2015, 36 (5), pp.871-882. ⟨10.1007/s11401-015-0981-x⟩
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-
- titre
- Competition and boundary formation in heterogeneous media: Application to neuronal differentiation
- auteur
- Benoît Perthame, Cristóbal Quiñinao, Jonathan Touboul
- article
- Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2015, 25 (13), pp.2477-2502. ⟨10.1142/S0218202515400151⟩
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-
- titre
- Mechanics of epithelial closure over non-adherent environments
- auteur
- Sri Ram Krishna Vedula, Grégoire Peyret, Ibrahim Cheddadi, Tianchi Chen, Agustí Brugués, Hiroaki Hirata, Horacio Lopez-Menendez, Yusuke Toyama, Luís Neves de Almeida, Xavier Trepat, Chwee Teck Lim, Benoit Ladoux
- article
- Nature Communications, 2015, 6, pp.Article number: 6111. ⟨10.1038/ncomms7111⟩
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-
- titre
- Statistical estimation of a growth-fragmentation model observed on a genealogical tree
- auteur
- Marie Doumic, Marc Hoffmann, Nathalie Krell, Lydia Robert
- article
- Bernoulli, 2015, 21 (3), pp.1760-1799. ⟨10.3150/14-BEJ623⟩
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-
- titre
- Asymptotic analysis of a selection model with space
- auteur
- Sepideh Mirrahimi, Benoît Perthame
- article
- Journal de Mathématiques Pures et Appliquées, 2015, 104, pp.1108-1118
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-
- titre
- Incompressible limit of mechanical model of tumor growth with viscosity
- auteur
- Benoît Perthame, Nicolas Vauchelet
- article
- Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series A, Mathematical and Physical Sciences (1934–1990), 2015, 373, pp.20140283. ⟨10.1098/rsta.2014.0283⟩
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-
Conference papers
- titre
- Global stabilizing feedback law for a problem of biological control of mosquito-borne diseases
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Maria Soledad Aronna, Flávio C. Coelho, Moacyr da Silva
- article
- 54th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2015, Osaka, Japan
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Phenotype heterogeneity in cancer cell populations
- auteur
- Luis Almeida, Rebecca H. Chisholm, Jean Clairambault, Alexandre Escargueil, Tommaso Lorenzi, Alexander Lorz, Emmanuel Trélat
- article
- ICNAAM 2015 Session 70: “Mathematical models and methods to investigate heterogeneity in cell and cell population biology”, Jean Clairambault, Sep 2015, Rhodes, Greece
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Emergence of cytotoxic resistance in cancer cell populations: single-cell mechanisms and population-level consequences
- auteur
- Tommaso Lorenzi, Rebecca H. Chisholm, Alexander Lorz, Annette K Larsen, Luís Almeida, Alexandre Escargueil, Jean Clairambault
- article
- ICNAAM 2015 Session 70: “Mathematical models and methods to investigate heterogeneity in cell and cell population biology”, Jean Clairambault, Sep 2015, Rhodes, Greece
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-
- titre
- Diverse spatio-temporal dynamical patterns of p53 and cell fate decisions
- auteur
- Jean Clairambault, Jan Elias
- article
- ICNAAM 2015 Session 70: “Mathematical models and methods to investigate heterogeneity in cell and cell population biology”, Jean Clairambault, Sep 2015, Rhodes, Greece. pp.4
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Preface to Session 70 ” Mathematical models and methods to investigate heterogeneity in cell and cell population biology
- auteur
- Loic Barbarroux, Jean Clairambault, Nick Cogan, Jan Elias, Shalla Hanson, Marek Kimmel, Tommaso Lorenzi
- article
- ICNAAM 2015 Session 70: “Mathematical models and methods to investigate heterogeneity in cell and cell population biology”, Organiser Session 70: Jean Clairambault, Sep 2015, Rhodes, Greece
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Emergence of cytotoxic resistance in cancer cell populations
- auteur
- Tommaso Lorenzi, Rebecca H. Chisholm, Alexander Lorz, Annette K Larsen, Luís Almeida, Alexandre Escargueil, Jean Clairambault
- article
- Workshop on Multiscale and Hybrid Modelling in Cell and Cell Population Biology, V. Volpert and J. Clairambault, Mar 2015, Paris, France. ⟨10.1051/itmconf/20150500009⟩
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-
Master thesis
- titre
- Modelling interactions between tumour cells and supporting adipocytes in breast cancer
- auteur
- Camille Pouchol
- article
- Mathematics [math]. 2015
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Books
- titre
- Parabolic equations in biology
- auteur
- Benoît Perthame
- article
- Springer. Springer, 2015, Lecture Notes on Mathematical Modelling in the Life Sciences, 978-3-319-19499-8; 978-3-319-19500-1
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-
Poster communications
- titre
- Approximating the dynamics of the Hybrid Stochastic-Deterministic Apoptosis pathway
- auteur
- Sucheendra K. Palaniappan, François Bertaux, Matthieu Pichene, Eric Fabre, Gregory Batt, Blaise Genest
- article
- CMSB 2015, 2015, Nantes, France. CMSB 2015, 2015, CMSB 2015
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-
Theses
- titre
- Mathematical model of the role and temporal dynamics of protein p53 after drug-induced DNA damage
- auteur
- Jan Elias
- article
- Number Theory [math.NT]. Université Pierre et Marie Curie – Paris VI, 2015. English. ⟨NNT : 2015PA066253⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Effects of an advection term in nonlocal Lotka-Volterra equations
- auteur
- Tommaso Lorenzi, Rebecca H. Chisholm, Alexander Lorz
- article
- 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Ensuring successful introduction of Wolbachia in natural populations of Aedes aegypti by means of feedback control
- auteur
- Pierre-Alexandre Bliman, Maria Soledad Aronna, Flávio U. Coelho, Moacyr da Silva
- article
- 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Determining the distribution of calcium channels in the olfactory system
- auteur
- Thibault Bourgeron, Carlos Conca, Rodrigo Lecaros
- article
- 2015
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Behavioral modulation of the coexistence between Apis melifera and Varroa destructor : A defense against colony colapse disorder?
- auteur
- Joyce de Figueiró Santos, Flávio C. Coelho, Pierre-Alexandre Bliman
- article
- 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Emergence of drug tolerance in cancer cell populations: an evolutionary outcome of selection, non-genetic instability and stress-induced adaptation
- auteur
- Rebecca H. Chisholm, Tommaso Lorenzi, Alexander Lorz, Annette K. Larsen, Luís Almeida, Alexandre Escargueil, Jean Clairambault
- article
- 2015
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2014
Journal articles
- titre
- Integrated metabolic spatial-temporal model for the prediction of ammonia detoxification during liver damage and regeneration
- auteur
- Freimut Schliess, Stefan Hoehme, Sebastian Henkel, Ahmed Ghallab, Dominik Driesch, Jan Böttger, Reinhard Guthke, Michael Pfaff, Jan Hengstler, Rolf Gebhardt, Dieter Häussinger, Dirk Drasdo, Sebastian Zellmer
- article
- Hepatology, 2014, 60 (6), pp.2040-2051. ⟨10.1002/hep.27136⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The virtual liver: state of the art and future perspectives
- auteur
- Dirk Drasdo, Johannes Bode, Uta Dahmen, Olaf Dirsch, Steven Dooley, Rolf Gebhardt, Ahmed Ghallab, Patricio Godoy, Dieter Häussinger, Seddik Hammad, Stefan Hoehme, Hermann-Georg Holzhütter, Ursula Klingmüller, Lars Kuepfer, Jens Timmer, Marino Zerial, Jan G. Hengstler
- article
- Archives of Toxicology, 2014, pp.2071-2075. ⟨10.1007/s00204-014-1384-6⟩
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-
- titre
- Scalar conservation laws with rough (stochastic) fluxes; the spatially dependent case
- auteur
- Pierre Louis Lions, Benoît Perthame, Panagiotis E. Souganidis
- article
- Stochastics and Partial Differential Equations: Analysis and Computations, 2014, 2 (4), pp.517-538. ⟨10.1007/s40072-014-0038-2⟩
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-
- titre
- Derivation of a Hele-Shaw type system from a cell model with active motion
- auteur
- Benoît Perthame, Fernando Quirós, Min Tang, Nicolas Vauchelet
- article
- Interfaces and Free Boundaries : Mathematical Analysis, Computation and Applications, 2014, 14 (4), pp.489-508. ⟨10.4171/IFB/327⟩
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-
- titre
- How predictive quantitative modeling of tissue organization can inform liver disease pathogenesis.
- auteur
- Dirk Drasdo, Stefan Hoehme, Jan G. Hengstler
- article
- Journal of Hepatology, 2014, 61 (4), pp.951-956. ⟨10.1016/j.jhep.2014.06.013⟩
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-
- titre
- Dynamics of p53 in single cells: physiologically based ODE and reaction-diffusion PDE models
- auteur
- Jan Elias, Luna Dimitrio, Jean Clairambault, Roberto Natalini
- article
- Physical Biology, 2014, pp.22. ⟨10.1088/1478-3975/11/4/045001⟩
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-
- titre
- Reaction-diffusion systems for spatio-temporal intracellular protein networks: a beginner’s guide with two examples
- auteur
- Jan Elias, Jean Clairambault
- article
- Computational and Structural Biotechnology Journal, 2014, pp.11. ⟨10.1016/j.csbj.2014.05.007⟩
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-
- titre
- Size distribution of amyloid brils. Mathematical models and experimental data.
- auteur
- Stephanie Prigent, Hadjer Wafaa Haffaf, H. T. Banks, M. Hoffmann, Human Rezaei, Marie Doumic
- article
- International Journal of Pure and Applied Mathematics, 2014, 93 (6), pp.845-878. ⟨10.12732/ijpam.v93i6.10⟩
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-
- titre
- Modeling contact interactions between triangulated rounded bodies for the discrete element method
- auteur
- Bart Smeets, Tim Odenthal, Janos Keresztes, Simon Vanmaercke, Paul van Liedekerke, Engelbert Tijskens, Wouter Saeys, Hans van Oosterwyck, Herman Ramon
- article
- Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering, 2014, 277, pp.219-238. ⟨10.1016/j.cma.2014.04.017⟩
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-
- titre
- Enabling multiscale modeling in systems medicine: From reactions in cells to organ physiology
- auteur
- Olaf Wolkenhauer, Charles Auffray, Olivier Brass, Jean Clairambault, Andreas Deutsch, Dirk Drasdo, Francesco Gervasio, Luigi Preziosi, Philip Maini, Anna Marciniak-Czochra, Christina Kossow, Lars Kuepfer, Katja Rateitschak, Ignacio Ramis-Conde, Benjamin Ribba, Andreas Schuppert, Rod Smallwood, Georgios Stamatakos, Felix Winter, Helen Byrne
- article
- Genome Medicine, 2014, Genome Medicine, 6 (21), pp.3
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-
- titre
- Perspective on “New and Less New Opportunities For Mathematical Biology as Applied To Biological and Clinical Medicine
- auteur
- Jean Clairambault
- article
- Society for Mathematical Biology Newsletter, 2014, SMB Newsletter, 27 (2), pp.2
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-
- titre
- Protocols for staining of bile canalicular and sinusoidal networks of human, mouse and pig livers, three-dimensional reconstruction and quantification of tissue microarchitecture by image processing and analysis.
- auteur
- Seddik Hammad, Stefan Hoehme, Adrian Friebel, Iris von Recklinghausen, Amnah Othman, Brigitte Begher-Tibbe, Raymond Reif, Patricio Godoy, Tim Johann, Amruta Vartak, Klaus Golka, Petru O. Bucur, Eric Vibert, Rosemarie Marchan, Bruno Christ, Steven Dooley, Christoph Meyer, Iryna Ilkavets, Uta Dahmen, Olaf Dirsch, Jan Böttger, Rolf Gebhardt, Dirk Drasdo, Jan G. Hengstler
- article
- Archives of Toxicology, 2014, 88 (5), pp.1161-1183. ⟨10.1007/s00204-014-1243-5⟩
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-
- titre
- Long-term analysis of phenotypically structured models
- auteur
- Alexander Lorz, Benoît Perthame
- article
- Proceedings of the Royal Society of London. Series A, Mathematical and physical sciences, 2014, 470 (2167), pp.1-10. ⟨10.1098/rspa.2014.0089⟩
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-
- titre
- Estimating Dose Painting Effects in Radiotherapy: A Mathematical Model
- auteur
- Juan Carlos Lopez Alfonso, Nick Jagiella, Luis Núñez, Miguel Herrero, Dirk Drasdo
- article
- PLoS ONE, 2014, 9 (2), pp.22. ⟨10.1371/journal.pone.0089380⟩
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-
- titre
- Synchronisation and control of proliferation in cycling cell population models with age structure
- auteur
- Frédérique Billy, Jean Clairambault, Olivier Fercoq, Stéphane Gaubert, Thomas Lepoutre, Thomas Ouillon, Shoko Saito
- article
- Mathematics and Computers in Simulation, 2014, 96, pp.66-94. ⟨10.1016/j.matcom.2012.03.005⟩
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-
- titre
- Estimating the Division Rate of the Self-Similar Growth-Fragmentation Equation
- auteur
- Thibault Bourgeron, Marie Doumic, Miguel Escobedo
- article
- Inverse Problems, 2014, 30 (2), pp.025007, 28
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-
- titre
- Traveling wave solution of the Hele-Shaw model of tumor growth with nutrient
- auteur
- Benoît Perthame, Min Tang, Nicolas Vauchelet
- article
- Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2014, 24 (13), pp.2601-2626
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-
- titre
- A simple derivation of BV bounds for inhomogeneous relaxation systems
- auteur
- Benoît Perthame, Nicolas Seguin, Magali Tournus
- article
- Communications in Mathematical Sciences, 2014, 13 (2), pp.577-586
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-
- titre
- Beyond blow-up in excitatory integrate and fire neuronal networks: refractory period and spontaneous activity
- auteur
- Maria J. Caceres, Benoît Perthame
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2014, 350, pp.81-89. ⟨10.1016/j.jtbi.2014.02.005⟩
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-
- titre
- The Hele-Shaw asymptotics for mechanical models of tumor growth
- auteur
- Benoît Perthame, Fernando Quirós, Juan-Luis Vázquez
- article
- Archive for Rational Mechanics and Analysis, 2014, 212, pp.93-127. ⟨10.1007/s00205-013-0704-y⟩
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-
- titre
- Bernoulli variational problem and beyond
- auteur
- Alexander Lorz, Peter Markowich, Benoît Perthame
- article
- Archive for Rational Mechanics and Analysis, 2014, 212, pp.415-443. ⟨10.1007/s00205-013-0707-8⟩
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-
- titre
- Division in Escherichia coli is triggered by a size-sensing rather than a timing mechanism
- auteur
- Lydia Robert, Marc Hoffmann, Nathalie Krell, Stéphane Aymerich, Jérôme Robert, Marie Doumic
- article
- BMC Biology, 2014, 12 (1), pp.17. ⟨10.1186/1741-7007-12-17⟩
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-
- titre
- Adaptation and Fatigue Model for Neuron Networks and Large Time Asymptotics in a Nonlinear Fragmentation Equation
- auteur
- Khashayar Pakdaman, Benoît Perthame, Delphine Salort
- article
- Journal of Mathematical Neuroscience, 2014, 4 (1), pp.14. ⟨10.1186/2190-8567-4-14⟩
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-
- titre
- Modeling Dynamics of Cell-to-Cell Variability in TRAIL-Induced Apoptosis Explains Fractional Killing and Predicts Reversible Resistance
- auteur
- François Bertaux, Szymon Stoma, Dirk Drasdo, Gregory Batt
- article
- PLoS Computational Biology, 2014, 10 (10), pp.14. ⟨10.1371/journal.pcbi.1003893.s016⟩
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-
Conference papers
- titre
- Stability analysis of PDE’s modelling cell dynamics in Acute Myeloid Leukemia
- auteur
- Jose Luis Avila Alonso, Catherine Bonnet, Emilia Fridman, Frédéric Mazenc, Jean Clairambault
- article
- 53rd IEEE Annual Conference on Decision and Control (CDC 2014), Dec 2014, Los Angeles, United States. ⟨10.1109/cdc.2014.7039860⟩
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-
- titre
- A coupled model for healthy and cancer cells dynamics in Acute Myeloid Leukemia
- auteur
- José Luis Avila Alonso, Catherine Bonnet, Hitay Ozbay, Jean Clairambault, Silviu-Iulian Niculescu
- article
- 19th IFAC World Congress on International Federation of Automatic Control (IFAC 2014), Aug 2014, Groningen, South Africa. ⟨10.3182/20140824-6-za-1003.02574⟩
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-
- titre
- Some mathematical aspects of tumor growth and therapy
- auteur
- Benoît Perthame
- article
- ICM 2014 – International Congress of Mathematicians, Aug 2014, Seoul, South Korea
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Discrete-Maturity Interconnected Model of Healthy and Cancer Cell Dynamics in Acute Myeloid Leukemia
- auteur
- Catherine Bonnet, Jose Luis Avila Alonso, Hitay Ozbay, Jean Clairambault, Silviu-Iulian Niculescu, Pierre Hirsch
- article
- The 10th AIMS Conference on Dynamical Systems,Differential Equations and Applications, Jul 2014, Madrid, Spain
- Accès au bibtex
-
- titre
- A discrete-maturity Interconnected Model of Healthy and Cancer Cell Dynamics in Acute Myeloid Leukemia
- auteur
- José Luis Avila Alonso, Catherine Bonnet, Hitay Ozbay, Jean Clairambault, Silviu-Iulian Niculescu
- article
- Mathematical Theory of Networks and Systems, Jul 2014, Groningen, Netherlands
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-
Book sections
- titre
- Analysis of a New Model of Cell Population Dynamics in Acute Myeloid Leukemia
- auteur
- José Luis Avila Alonso, Catherine Bonnet, Jean Clairambault, Hitay Ozbay, Silviu-Iulian Niculescu, Faten Merhi, Annabelle Ballesta, Ruoping Tang, Jean-Pierre Marie
- article
- Tomáš Vyhlídal and Jean-François Lafay and Rifat Sipahi. Delay Systems : From Theory to Numerics and Applications, 1, Springer, pp.315-328, 2014, Advances in Delays and Dynamics, 978-3-319-01695-5. ⟨10.1007/978-3-319-01695-5_23⟩
- Accès au bibtex
-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Contributions mathématiques à l’étude de modèles décrivant le mouvement de particules confinées et de micro-organismes
- auteur
- Nicolas Vauchelet
- article
- Equations aux dérivées partielles [math.AP]. Université Pierre et Marie Curie, 2014
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Other publications
- titre
- Modelling and analysis of protein aggregation – completing pathways in prion (PrP) polymerisation
- auteur
- Stephanie Prigent, Hadjer Wafaa Haffaf
- article
- 2014
- Accès au bibtex
-
2013
Journal articles
- titre
- Wave-like solutions for nonlocal reaction-diffusion equations: a toy model
- auteur
- Grégoire Nadin, Luca Rossi, Leonid Ryzhik, Benoît Perthame
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2013, 8 (3), pp.33-41. ⟨10.1051/mmnp/20127102⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The p53 protein and its molecular network: modelling a missing link between DNA damage and cell fate
- auteur
- Jan Elias, Luna Dimitrio, Jean Clairambault, Roberto Natalini
- article
- Biochimica et Biophysica Acta Proteins and Proteomics, 2013, ⟨10.1016/j.bbapap.2013.09.019⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Modelling and analysis of protein aggregation – Competing pathways in prion (PrP) polymerisation
- auteur
- Hadjer Wafaa Haffaf, Stephanie Prigent
- article
- Congrès SMAI 2013, May 2013, Seignosse le Penon, France. ⟨10.1051/proc/201445019⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2012
Journal articles
- titre
- Regularization in Keller-Segel type systems and the De Giorgi method
- auteur
- Benoît Perthame, Alexis F. Vasseur
- article
- Communications in Mathematical Sciences, 2012, 10 (2), pp.463 – 476. ⟨10.4310/CMS.2012.v10.n2.a2⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2009
Journal articles
- titre
- Scaling limit of a discrete prion dynamics model
- auteur
- Marie Doumic, Thierry Goudon, Thomas Lepoutre
- article
- Communications in Mathematical Sciences, 2009, 7 (4), ⟨10.4310/CMS.2009.v7.n4.a3⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
