Software

  • Simuscale



    • Ode, Simulation, Multi-échelles, Multi-agent


    • Simuscale est un logiciel de simulation de dynamique de populations cellulaires multi-échelles 3D performant, développé dans l’EPI Dracula, qui simule l’évolution d’une population de cellules hétérogène évoluant et interagissant dans un environnement 3D. L’interaction cellule-cellule est régie par un protocole formalisme-indépendent qui permet de construire un modèle à partir de plug-ins existants.


    • Simuscale is a C++ simulation framework that models both intra- and extra-cellular processes at different time scales. Its decoupled architecture allows for an easy and parsimonious extension of the model with e.g. a new kind of intra-cellular formalism.





    • Carole Knibbe (carole.knibbe@inria.fr), David Parsons (david.parsons@inria.fr), Fabien Crauste (fabien.crauste@inria.fr), Olivier Gandrillon (olivier.gandrillon@inria.fr), Raphael Bournhonesque (raphael.bournhonesque@inria.fr), Samuel Bernard (samuel.bernard@inria.fr)


    • CNRS, UCBL Lyon 1


    • Samuel Bernard (samuel.bernard@inria.fr)



  • CelDyn



    • Bio-informatique, Modélisation, Biologie



    • Le logiciel "Celdyn" est développé afin de modéliser la dynamique des populations cellulaires pour des applications biologiques. Les cellules sont représentées soit comme des sphères molles, soit par des structures plus complexes. Les cellules peuvent se diviser, se déplacer, interagir entre elles ou avec le milieu environnant. Différents types de cellules peuvent être introduits. Lorsque les cellules se divisent, les types de cellules filles sont spécifiés. Une interface utilisateur est développée.





    • Alen Tosenberger, Laurent Pujo-Menjouet (laurent.pujo-menjouet@inria.fr), Nikolai Bessonov, Vitaly Volpert (vitaly.volpert@inria.fr)



    • Vitaly Volpert (vitaly.volpert@inria.fr)



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