Publications – Equipe Inria Dracula

Publications HAL du labo/EPI 108959;1096064

2024

Article dans une revue

ref_biblio: Alexey Koshkin, Ulysse Herbach, María Rodríguez Martínez, Olivier Gandrillon, Fabien Crauste. Stochastic modeling of a gene regulatory network driving B cell development in germinal centers. PLoS ONE, 2024, 19 (3), pp.e0301022. ⟨10.1371/journal.pone.0301022⟩. ⟨hal-04490302v3⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Avelin Aghokeng, Nicole Ngo-Giang-Huong, Thu Huynh, Anoumou Dagnra, Thomas D’aquin Toni, et al.. Prevalence of pretreatment HIV resistance to integrase inhibitors in West African and Southeast Asian countries. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 2024, online first (dkae087), ⟨10.1093/jac/dkae087⟩. ⟨hal-04533843⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vincent Calvez, Thomas Lepoutre, David Poyato. Ergodicity of the Fisher infinitesimal model with quadratic selection. Nonlinear Analysis: Theory, Methods and Applications, 2024, 238, pp.113392. ⟨10.1016/j.na.2023.113392⟩. ⟨hal-03274734v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Gervillien Arnold Malonga, Almoustapha Issiaka Maiga, Dimitry Moudiongui Mboungou Malanda, Mahamadou Saliou, Juthèce Private Malanda-Kiminou, et al.. Seroprevalence of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus among people living with HIV in Brazzaville, Congo and among blood donors in Bamako, Mali. Ticks and Tick-borne Diseases, 2024, 15 (1), pp.102276. ⟨10.1016/j.ttbdis.2023.102276⟩. ⟨hal-04458727⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Rapport

ref_biblio: Samuel Bernard, Fabien Crauste, Olivier Gandrillon, Carole Knibbe, David Parsons. Simuscale: A Modular Framework for Multiscale Single-Cell Modelling. RT-0520, Inria Lyon. 2024, pp.18. ⟨hal-04400510⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Pré-publication, Document de travail

ref_biblio: Vincent Calvez, Adil El Abdouni, Maxime Estavoyer, Ignacio Madrid, Julien Olivier, et al.. Regime switching on the propagation speed of travelling waves of some size-structured Myxobacteria population models. 2024. ⟨hal-04532644⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Maxime Estavoyer, Thomas Lepoutre. Travelling waves for a fast reaction limit of a discrete coagulation-fragmentation model with diffusion and proliferation. 2024. ⟨hal-04516285⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Thi Nhu Thao Nguyen, Madge Martin, C Arpin, Samuel Bernard, Olivier Gandrillon, et al.. In silico modelling of CD8 T cell immune response links genetic regulation to population dynamics. 2024. ⟨hal-04489553⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Hugo da Cunha, Clément Erignoux, Marielle Simon. Hydrodynamic limit for a boundary-driven facilitated exclusion process. 2024. ⟨hal-04449478⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Clément Erignoux, Linjie Zhao. Stationary fluctuations for the facilitated exclusion process. 2024. ⟨hal-04379637⟩
Accès au texte intégral et bibtex

2023

Article dans une revue

ref_biblio: Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Charlotte Dugourd-Camus, Hanene Meghelli. Global Asymptotic Stability of a Hybrid Differential–Difference System Describing SIR and SIS Epidemic Models with a Protection Phase and a Nonlinear Force of Infection. Qualitative Theory of Dynamical Systems, 2023, 23 (34), pp.32. ⟨10.1007/s12346-023-00891-z⟩. ⟨hal-04271594⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: James Mason, Clément Erignoux, Robert Jack, Maria Bruna. Exact hydrodynamics and onset of phase separation for an active exclusion process. Proceedings of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, 2023, 479 (2279), ⟨10.1098/rspa.2023.0524⟩. ⟨hal-04379583⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Kyriaki Dariva, Thomas Lepoutre. Influence of the age structure on the stability in a tumor-immune model for chronic myeloid leukemia. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2023, 54 (2), pp.619-648. ⟨10.1051/mmnp/2023034⟩. ⟨hal-03128770⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Toshikazu Kuniya. Global asymptotic stability for a distributed delay differential-difference system of a Kermack-McKendrick SIR model. Applicable Analysis, 2023, 102 (Issue 12), pp.1-13. ⟨10.1080/00036811.2022.2075352⟩. ⟨hal-03683861⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Elise Berthel, Laurent Pujo-Menjouet, Eymeric Le Reun, Laurène Sonzogni, Joëlle Al-Choboq, et al.. Toward an Early Diagnosis for Alzheimer’s Disease Based on the Perinuclear Localization of the ATM Protein. Cells, 2023, 12 (13), pp.1747. ⟨10.3390/cells12131747⟩. ⟨hal-04157903⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Toshikazu Kuniya, Hanene Meghelli. Global stability of a SEIR discrete delay differential‐difference system with protection phase. Mathematical Methods in the Applied Sciences, 2023, 2023, pp.21. ⟨10.1002/mma.9533⟩. ⟨hal-04273580⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Jimmy Garnier, Olivier Cotto, Emeric Bouin, Thibault Bourgeron, Thomas Lepoutre, et al.. Adaptation of a quantitative trait to a changing environment: new analytical insights on the asexual and infinitesimal sexual models.. Theoretical Population Biology, 2023, 152, pp.1-22. ⟨10.1016/j.tpb.2023.04.002⟩. ⟨hal-03702032v4⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Clément Erignoux, Marielle Simon, Linjie Zhao. Asymmetric attractive zero-range processes with particle destruction at the origin. Stochastic Processes and their Applications, 2023, 159, pp.1-33. ⟨10.1016/j.spa.2023.01.015⟩. ⟨hal-03431141⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nan Papili Gao, Olivier Gandrillon, András Páldi, Ulysse Herbach, Rudiyanto Gunawan. Single-cell transcriptional uncertainty landscape of cell differentiation. F1000Research, 2023, 12, pp.426. ⟨10.12688/f1000research.131861.2⟩. ⟨hal-04082461⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Elias Ventre, Ulysse Herbach, Thibault Espinasse, Gérard Benoit, Olivier Gandrillon. One model fits all: Combining inference and simulation of gene regulatory networks. PLoS Computational Biology, 2023, 19 (3), pp.e1010962. ⟨10.1371/journal.pcbi.1010962⟩. ⟨hal-04071033⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Samuel Bernard, Kirsty L Spalding. Implication of lipid turnover for the control of energy balance. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 2023, 378 (1888), pp.20220202. ⟨10.1098/rstb.2022.0202⟩. ⟨hal-04195827⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Laurent Pujo-Menjouet, Mattia Sensi. A multigroup approach to delayed prion production. Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, 2023, ⟨10.3934/dcdsb.2023209⟩. ⟨hal-04162164⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Marie Paule Gustin, Laurent Pujo-Menjouet, Philippe Vanhems. Influenza transmissibility among patients and health-care professionals in a geriatric short-stay unit using individual contact data. Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.10547. ⟨10.1038/s41598-023-36908-5⟩. ⟨hal-04157830⟩
Accès au texte intégral et bibtex

2022

Article dans une revue

ref_biblio: Mostafa Adimy, Louis Babin, Laurent Pujo-Menjouet. Neuron Scale Modeling of Prion Production with the Unfolded Protein Response. SIAM Journal on Applied Dynamical Systems, 2022, 21 (4), pp.2487-2517. ⟨10.1137/21M1443157⟩. ⟨hal-03962123⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: L Dekens, S P Otto, V Calvez. The best of both worlds: Combining population genetic and quantitative genetic models. Theoretical Population Biology, 2022, 148, pp.49-75. ⟨10.1016/j.tpb.2022.10.002⟩. ⟨hal-03440065v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Julien Molina, Laurent Pujo-Menjouet, Grégoire Ranson, Jianhong Wu. Forecasting the Effect of Pre-Exposure Prophylaxis (PrEP) on HIV Propagation with a System of Differential–Difference Equations with Delay. Mathematics , 2022, 10 (21), pp.4093. ⟨10.3390/math10214093⟩. ⟨hal-03845950⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Abderrahim El Abdllaoui, Arsène Marzorati. Discrete maturity and delay differential-difference model of hematopoietic cell dynamics with applications to acute myelogenous leukemia. Journal of Biological Systems, 2022, 30 (03), pp.497-527. ⟨10.1142/S0218339022500176⟩. ⟨hal-03918042⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Samiran Ghosh, Vitaly Volpert, Malay Banerjee. An Epidemic Model with Time Delay Determined by the Disease Duration. Mathematics , 2022, 10, ⟨10.3390/math10152561⟩. ⟨hal-03840322⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vincent Calvez, Benoît Henry, Sylvie Méléard, Viet Chi Tran. Dynamics of lineages in adaptation to a gradual environmental change. Annales Henri Lebesgue, 2022, 5, pp.729-777. ⟨10.5802/ahl.135⟩. ⟨hal-03205023⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Samiran Ghosh, Vitaly Volpert, Malay Banerjee. An Epidemic Model with Time-Distributed Recovery and Death Rates. Bulletin of Mathematical Biology, 2022, 84, ⟨10.1007/s11538-022-01028-0⟩. ⟨hal-03840307⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Cristina Leon, Alexey A Tokarev, Vitaly A Volpert. Modelling of cytokine storm in respiratory viral infections. Computer Research and Modeling, 2022, 14, pp.619 – 645. ⟨10.20537/2076-7633-2022-14-3-619-645⟩. ⟨hal-03840309⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: L Ait Mahiout, Anastasia Mozokhina, A Tokarev, V Volpert. Virus replication and competition in a cell culture: Application to the SARS-CoV-2 variants. Applied Mathematics Letters, 2022, 133, ⟨10.1016/j.aml.2022.108217⟩. ⟨hal-03840306⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Maxim Kuznetsov, Jean Clairambault, Vitali Volpert. Perspectives in cancer treatment. Reply to comments on « Improving cancer treatments via dynamical biophysical models ». Physics of Life Reviews, In press, ⟨10.1016/j.plrev.2022.05.003⟩. ⟨hal-03661846⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Latifa Ait Mahiout, Nikolai Bessonov, Bogdan Kazmierczak, Georges Sadaka, Vitaly Volpert. Infection spreading in cell culture as a reaction-diffusion wave. ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, 2022, 56 (3), pp.791-814. ⟨10.1051/m2an/2022019⟩. ⟨hal-03651662⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Charles Dussiau, Agathe Boussaroque, Mathilde Gaillard, Clotilde Bravetti, Laila Zaroili, et al.. Hematopoietic differentiation is characterized by a transient peak of entropy at a single-cell level. BMC Biology, 2022, 20 (1), pp.60. ⟨10.1186/s12915-022-01264-9⟩. ⟨inserm-03693012⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Cristina Leon, Irina Kutsenko, Vitaly Volpert. Existence of solutions for a nonlocal reaction-diffusion equation in biomedical applications. Israel Journal of Mathematics, 2022, 248, pp.67 – 93. ⟨10.1007/s11856-022-2294-6⟩. ⟨hal-03840319⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Jairo Gomes Da Silva, Izabel Cristina Rodrigues Da Silva, Mostafa Adimy, Paulo Fernando de Arruda Mancera. The effect of lenvatinib and pembrolizumab on thyroid cancer refractory to iodine 131I simulated by mathematical modeling. Journal of Biological Systems, 2022, 30 (01), pp.93-112. ⟨10.1142/S0218339022500036⟩. ⟨hal-03683414⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Abdennasser Chekroun, Laurent Pujo-Menjouet, Steve Falcoz, Kamyine Tsuen, Kevin Tsueng, et al.. Theoretical evidence of osteoblast self-inhibition after activation of the genetic regulatory network controlling mineralization. Journal of Theoretical Biology, 2022, 537, pp.111005. ⟨10.1016/j.jtbi.2022.111005⟩. ⟨hal-03924769⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Léonard Dekens. Evolutionary dynamics of complex traits in sexual populations in a heterogeneous environment: how normal?. Journal of Mathematical Biology, 2022, ⟨10.1007/s00285-021-01712-0⟩. ⟨hal-03073813v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Latifa Ait Mahiout, Bogdan Kazmierczak, Vitaly Volpert. Viral Infection Spreading and Mutation in Cell Culture. Mathematics , 2022, 10, ⟨10.3390/math10020256⟩. ⟨hal-03840321⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Jaafar El Karkri, Fatima Boudchich, Vitaly Volpert, Rajae Aboulaich. Stability Analysis of a Delayed Immune Response Model to Viral Infection. Differential Equations and Dynamical Systems, 2022, ⟨10.1007/s12591-022-00594-y⟩. ⟨hal-03840311⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Elias Ventre. Reverse engineering of a mechanistic model of gene expression using metastability and temporal dynamics. In Silico Biology, 2022, 14 (3-4), pp.89-113. ⟨10.3233/ISB-210226⟩. ⟨hal-03531749⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Toshikazu Kuniya. Traveling waves of a differential-difference diffusive Kermack-McKendrick epidemic model with age-structured protection phase. Journal of Mathematical Analysis and Applications, 2022, 505 (1), pp.125464. ⟨10.1016/j.jmaa.2021.125464⟩. ⟨hal-03518604⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Louis Babin, Laurent Pujo-Menjouet. Why Are Periodic Erythrocytic Diseases so Rare in Humans?. Bulletin of Mathematical Biology, 2022, 84 (19), pp.1-19. ⟨10.1007/s11538-021-00973-6⟩. ⟨hal-03516975⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Helena Todorov, Margaux Prieux, Daphne Laubreton, Matteo Bouvier, Shaoying Wang, et al.. CD8 memory precursor cell generation is a continuous process. iScience, 2022, 25 (9), pp.104927. ⟨10.1016/j.isci.2022.104927⟩. ⟨hal-03842898⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Anastasia A. Masalceva, Valeriia N. Kaneva, Mikhail A. Panteleev, Fazoil Ataullakhanov, Vitaly Volpert, et al.. Analysis of microvascular thrombus mechanobiology with a novel particle-based model. Journal of Biomechanics, 2022, 130, pp.110801. ⟨10.1016/j.jbiomech.2021.110801⟩. ⟨hal-04134234⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Bogdan Kazmierczak. Traveling waves for reaction-diffusion PDE coupled to difference equation with nonlocal dispersal term and time delay. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2022, 17, pp.17. ⟨10.1051/mmnp/2022021⟩. ⟨hal-03697707⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vincent Calvez, Christopher Henderson, Sepideh Mirrahimi, Olga Turanova, Thierry Dumont. Non-local competition slows down front acceleration during dispersal evolution. Annales Henri Lebesgue, 2022, 5, pp.1-71. ⟨10.5802/ahl.117⟩. ⟨hal-01963994⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Thomas Lepoutre, Nicolas Meunier. Analysis of a model of cell crawling migration. Communications in Mathematical Sciences, 2022, 20 (6), pp.1589-1611. ⟨10.4310/CMS.2022.v20.n6.a6⟩. ⟨hal-03779089⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Souad Zreika, Camille Fourneaux, Elodie Vallin, Laurent Modolo, Remi Seraphin, et al.. Evidence for close molecular proximity between reverting and undifferentiated cells. BMC Biology, 2022, 20 (1), pp.155. ⟨10.1186/s12915-022-01363-7⟩. ⟨hal-04134084⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Samiran Ghosh, Malay Banerjee, Vitaly Volpert. Immuno-Epidemiological Model-Based Prediction of Further Covid-19 Epidemic Outbreaks Due to Immunity Waning. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2022, 17, ⟨10.1051/mmnp/2022017⟩. ⟨hal-03840324⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nicholas Bessonov, Gennady Bocharov, Vitaly Volpert. Space and Genotype-Dependent Virus Distribution during Infection Progression. Mathematics , 2022, 10 (1), pp.96. ⟨10.3390/math10010096⟩. ⟨hal-04134233⟩
Accès au bibtex

Communication dans un congrès

ref_biblio: Fabien Crauste, Olivier Gandrillon, Madge Martin, Thi Nhu Thao Nguyen, Samuel Bernard. A multi-scale model for CD8+ T cell immune response. Journées Math Bio Santé 2022, GDR MathSAV; GT Mabiome, Oct 2022, Besançon, France. ⟨hal-04193666⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Thèse

ref_biblio: Elias Ventre. Analysis, calibration and evaluation of stochastic models of gene expression. Probability [math.PR]. Ecole normale supérieure de lyon – ENS LYON, 2022. English. ⟨NNT : 2022ENSL0018⟩. ⟨tel-03848137⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mete Demircigil. Collective Movement in Dictyostelium discoideum and Other Species. Modeling, Analysis and Simulations. Analysis of PDEs [math.AP]. Université Claude Bernard – Lyon 1; Institut Camille Jordan, 2022. English. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-03880366⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Léonard Dekens. Quantifying the influence of sexual reproduction on the spatial eco-evo dynamics of species characterized by complex traits: asymptotic methods.. Analysis of PDEs [math.AP]. Université Claude Bernard Lyon I, 2022. English. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-03877911⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Kyriaki Dariva. Contributions à l’étude de la stabilité dans des modèles de populations de cellules. Mathématiques générales [math.GM]. Université de Lyon, 2022. Français. ⟨NNT : 2022LYSE1097⟩. ⟨tel-03956608v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Pré-publication, Document de travail

ref_biblio: Ionel Ciuperca, Laurent Pujo-Menjouet, Leon Matar-Tine, Nicolas Torres, Vitaly Volpert. A qualitative analysis of an Aβ-monomer model with inflammation processes for Alzheimer’s disease. 2022. ⟨hal-03877951v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vincent Calvez, Hélène Hivert, Havva Yoldaş. Concentration in Lotka-Volterra parabolic equations: an asymptotic-preserving scheme. 2022. ⟨hal-03635830⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mete Demircigil. When Self-Generated Gradients interact with Expansion by Cell Division and Diffusion. Analysis of a Minimal Model. 2022. ⟨hal-03601815⟩
Accès au texte intégral et bibtex

2021

Article dans une revue

ref_biblio: Elias Ventre, Thibault Espinasse, Charles-Edouard Bréhier, Vincent Calvez, Thomas Lepoutre, et al.. Reduction of a stochastic model of gene expression: Lagrangian dynamics gives access to basins of attraction as cell types and metastabilty. Journal of Mathematical Biology, 2021, 83 (59), ⟨10.1007/s00285-021-01684-1⟩. ⟨hal-03243421⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Maxim Kuznetsov, Jean Clairambault, Vitaly Volpert. Improving cancer treatments via dynamical biophysical models. Physics of Life Reviews, 2021, pp.1-84. ⟨10.1016/j.plrev.2021.10.001⟩. ⟨hal-03390854⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Ronan Duchesne, Anissa Guillemin, Olivier Gandrillon, Fabien Crauste. Practical identifiability in the frame of nonlinear mixed effects models: the example of the in vitro erythropoiesis. BMC Bioinformatics, 2021, pp.1-21. ⟨10.1186/s12859-021-04373-4⟩. ⟨hal-03364480⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Pablo Amster, Julián Epstein. Periodic solutions for a nonautonomous mathematical model of hematopoietic stem cell dynamics. Nonlinear Analysis: Theory, Methods and Applications, 2021, 211, pp.112397. ⟨10.1016/j.na.2021.112397⟩. ⟨hal-03518591⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Anastasia Mozokhina, Anass Bouchnita, Vitaly Volpert. Blood Clotting Decreases Pulmonary Circulation during the Coronavirus Disease. Mathematics , 2021, 9 (19), pp.1-18. ⟨10.3390/math9192401⟩. ⟨hal-03404818⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Olivier Gandrillon, Mathilde Gaillard, Thibault Espinasse, Nicolas B Garnier, Charles Dussiau, et al.. Entropy as a measure of variability and stemness in single-cell transcriptomics. Current Opinion in Systems Biology, 2021, 27, pp.1-14. ⟨10.1016/j.coisb.2021.05.009⟩. ⟨hal-03378505⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Felipe de A Camargo, Mostafa Adimy, Lourdes Esteva, Clémence Métayer, Cláudia P Ferreira. Modeling the Relationship Between Antibody-Dependent Enhancement and Disease Severity in Secondary Dengue Infection. Bulletin of Mathematical Biology, 2021, 83 (8), pp.1-28. ⟨10.1007/s11538-021-00919-y⟩. ⟨hal-03400267⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitali Vougalter, Vitaly Volpert. Solvability of some integro-differential equations with anomalous diffusion and transport. Analysis and Mathematical Physics, 2021, 11, pp.1-26. ⟨10.1007/s13324-021-00571-8⟩. ⟨hal-03379108⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Chloe Audebert, Daphné Laubreton, Christophe Arpin, Olivier Gandrillon, Jacqueline Marvel, et al.. Modeling and characterization of inter-individual variability in CD8 T cell responses in mice. In Silico Biology, 2021, 14 (1-2), pp.13-39. ⟨10.3233/ISB-200205⟩. ⟨hal-03136073⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Martin Andrade-Restrepo, Ionel Sorin Ciuperca, Paul Lemarre, Laurent Pujo-Menjouet, Leon Tine. A reaction-diffusion model of spatial propagation of Aβ oligomers in early stage Alzheimer’s disease. Journal of Mathematical Biology, 2021, 82 (5), pp.1-25. ⟨10.1007/s00285-021-01593-3⟩. ⟨hal-03533359⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Anna Zincenko, Sergei Petrovskii, Vitaly Volpert, Malay Banerjee. Turing instability in an economic–demographic dynamical system may lead to pattern formation on a geographical scale. Journal of the Royal Society Interface, 2021, 18, pp.1-17. ⟨10.1098/rsif.2021.0034⟩. ⟨hal-03398977⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Kalyan Manna, Vitaly Volpert, Malay Banerjee. Pattern Formation in a Three-Species Cyclic Competition Model. Bulletin of Mathematical Biology, 2021, 83, pp.1-37. ⟨10.1007/s11538-021-00886-4⟩. ⟨hal-03381821⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nicolas Ratto, Anass Bouchnita, P Chelle, Martine Marion, Mikhail A. Panteleev, et al.. Patient-Specific Modelling of Blood Coagulation. Bulletin of Mathematical Biology, 2021, 83, pp.1-31. ⟨10.1007/s11538-021-00890-8⟩. ⟨hal-03386476⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Sebastian Aniţa, Malay Banerjee, Samiran Ghosh, Vitaly Volpert. Vaccination in a two-group epidemic model. Applied Mathematics Letters, 2021, 119, pp.1-7. ⟨10.1016/j.aml.2021.107197⟩. ⟨hal-03379104⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Vitali Vougalter. Method of Monotone Solutions for Reaction-Diffusion Equations. Journal of Mathematical Sciences, 2021, 253, pp.660 – 675. ⟨10.1007/s10958-021-05260-2⟩. ⟨hal-03398980⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Malay Banerjee, Sergei V Petrovskii, Vitaly Volpert. Nonlocal Reaction–Diffusion Models of Heterogeneous Wealth Distribution. Mathematics , 2021, 9 (4), pp.1-18. ⟨10.3390/math9040351⟩. ⟨hal-03404817⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Elena Merino Tejero, Danial Lashgari, Rodrigo García-Valiente, Xuefeng Gao, Fabien Crauste, et al.. Multiscale Modeling of Germinal Center Recapitulates the Temporal Transition From Memory B Cells to Plasma Cells Differentiation as Regulated by Antigen Affinity-Based Tfh Cell Help. Frontiers in Immunology, 2021, 11, ⟨10.3389/fimmu.2020.620716⟩. ⟨hal-03153711⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Gennady Bocharov, Andreas Meyerhans, Vladimir Popov, Vitaly Volpert. Existence and Dynamics of Strains in a Nonlocal Reaction-Diffusion Model of Viral Evolution. SIAM Journal on Applied Mathematics, 2021, 81, pp.107-128. ⟨10.1137/19m1282234⟩. ⟨hal-03409170⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Chang Yang, Léon Matar Tine. Analysis and Numerical Simulations of a Reaction-Diffusion Model with Fixed Active Bodies. SIAM Journal on Applied Mathematics, 2021, 81 (4), pp.1339-1360. ⟨10.1137/20M1343385⟩. ⟨hal-03534435⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Malay Banerjee, Swarnali Sharma. Epidemic progression and vaccination in a heterogeneous population. Application to the Covid-19 epidemic. Ecological Complexity, 2021, 47, pp.1-28. ⟨10.1016/j.ecocom.2021.100940⟩. ⟨hal-03391028⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Valeriia N. Kaneva, Joanne L. Dunster, Vitaly A Volpert, Fazoil Ataullahanov, Mikhail A. Panteleev, et al.. Modeling Thrombus Shell: Linking Adhesion Receptor Properties and Macroscopic Dynamics. Biophysical Journal, 2021, 120 (2), pp.334-351. ⟨10.1016/j.bpj.2020.10.049⟩. ⟨hal-04134271⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mouhamadou Samsidy Goudiaby, Ababacar Diagne, Léon Matar Tine. Longtime behavior of a second order finite element scheme simulating the kinematic effects in liquid crystal dynamics. Communications on Pure and Applied Analysis, 2021, 20 (10), pp.1-16. ⟨10.3934/cpaa.2021116⟩. ⟨hal-03534380⟩
Accès au bibtex

Chapitre d’ouvrage

ref_biblio: Vincent Calvez, Mete Demircigil, Roxana Sublet. Mathematical modeling of cell collective motion triggered by self-generated gradients. Active Particles, Volume 3, 2021, 978-3-030-93302-9. ⟨10.1007/978-3-030-93302-9_3⟩. ⟨hal-03342200⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Khalil Ezzinbi, Catherine Marquet. Global Attractor in Alpha-Norm for Some Partial Functional Differential Equations of Neutral and Retarded Type. Studies in Evolution Equations and Related Topics, Springer International Publishing, pp.33-49, 2021, STEAM-H: Science, Technology, Engineering, Agriculture, Mathematics & Health, ⟨10.1007/978-3-030-77704-3_3⟩. ⟨hal-03518620⟩
Accès au bibtex

Rapport

ref_biblio: Kyriaki Dariva, Pedro Jaramillo. Reconstruction of trajectories-Challenge AMIES. [Research Report] Univ Lyon, Université Claude-Bernard Lyon 1; Université de bordeaux. 2021, pp.1-15. ⟨hal-03364121⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Romain Gauchon, Nicolas Ponthus, Catherine Pothier, Christophe Rigotti, Vitaly Volpert, et al.. Lessons learnt from the use of compartmental models over the COVID-19 induced lockdown in France. [Research Report] Université Lyon 1; Ecole Centrale de Lyon; INSA Lyon. 2021, p. 39. ⟨hal-03341704⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Thèse

ref_biblio: Alexey Koshkin. Studying a stochastic gene regulatory network driving the germinal center B cell differentiation. Bioinformatics [q-bio.QM]. Université de Lyon, 2021. English. ⟨NNT : 2021LYSEN083⟩. ⟨tel-03552186v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Paul Lemarre. Prions come in all shapes and sizes – Mathematical modeling of protein self-aggregation and conversion. Analysis of PDEs [math.AP]. Institut Camille Jordan, Université Claude Bernard Lyon 1, France, 2021. English. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-03537876⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Pré-publication, Document de travail

ref_biblio: Aquilina Al Khoury, Samuel Bernard, Jonathan Rouzaud-Cornabas. Accuracy of Mixed Precision Computation in Large Coupled Biological Systems. 2021. ⟨hal-03249828⟩
Accès au texte intégral et bibtex

2020

Article dans une revue

ref_biblio: Nayana Mukherjee, Vitaly Volpert. Bifurcation scenario of Turing patterns in prey-predator model with nonlocal consumption in the prey dynamics. Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation, 2020, 96, pp.1-11. ⟨10.1016/j.cnsns.2020.105677⟩. ⟨hal-03386477⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitali Vougalter, Vitaly Volpert. Existence of solutions for some non‐Fredholm integro‐differential equations with the bi‐Laplacian. Mathematical Methods in the Applied Sciences, 2020, ⟨10.1002/mma.6721⟩. ⟨hal-03029315⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Anne Beuter, Anne Balossier, François Vassal, Simone Hemm, Vitaly Volpert. Cortical stimulation in aphasia following ischemic stroke: toward model-guided electrical neuromodulation. Biological Cybernetics (Modeling), 2020, ⟨10.1007/s00422-020-00818-w⟩. ⟨hal-03019110⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: S Budzinskiy, A Beuter, Vitaly Volpert. Nonlinear analysis of periodic waves in a neural field model. Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science, 2020, ⟨10.1063/5.0012010⟩. ⟨hal-03019102⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Jairo Gomes da Silva, Rafael Martins de Morais, Izabel Cristina Rodrigues da Silva, Mostafa Adimy, Paulo Fernando de Arruda Mancera. A Mathematical model for treatment of papillary thyroid cancer using the allee effect. Journal of Biological Systems, 2020, 28 (03), pp.701-718. ⟨10.1142/S0218339020500138⟩. ⟨hal-03167508⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Charles Rocabert, Guillaume Beslon, Carole Knibbe, Samuel Bernard. Phenotypic noise and the cost of complexity. Evolution – International Journal of Organic Evolution, 2020, ⟨10.1111/evo.14083⟩. ⟨hal-02920356⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Tim Squire, A. Ryan, Samuel Bernard. Radioprotective effects of induced astronaut torpor and advanced propulsion systems during deep space travel. Life Sciences in Space Research, 2020, 26, pp.105-113. ⟨10.1016/j.lssr.2020.05.005⟩. ⟨hal-02868066⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: M Banerjee, Vitaly Volpert. Stochastic intracellular regulation can remove oscillations in a model of tissue growth. Mathematical Medicine and Biology, 2020, ⟨10.1093/imammb/dqaa009⟩. ⟨hal-03029320⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Anass Bouchnita, Kirill Terekhov, Patrice Nony, Yuri Vassilevski, Vitaly Volpert. A mathematical model to quantify the effects of platelet count, shear rate, and injury size on the initiation of blood coagulation under venous flow conditions. PLoS ONE, 2020, 15 (7), pp.e0235392. ⟨10.1371/journal.pone.0235392⟩. ⟨hal-03027325⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Anne Beuter, Sergei Trofimchuk, Vitaly Volpert. Dynamics of Periodic Waves in a Neural Field Model. Mathematics , 2020, 8 (7), pp.1-17. ⟨10.3390/math8071076⟩. ⟨hal-03027337⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Paul Lemarre, Laurent Pujo-Menjouet, Suzanne S Sindi. A unifying model for the propagation of prion proteins in yeast brings insight into the [PSI+] prion. PLoS Computational Biology, 2020, 16 (5), pp.e1007647. ⟨10.1371/journal.pcbi.1007647⟩. ⟨hal-02732998⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Karam Allali, Youssef Joundy, Ahmed Taik, Vitaly Volpert. Dynamics of Convective Thermal Explosion in Porous Media. International journal of bifurcation and chaos in applied sciences and engineering , 2020, 30 (06), pp.2050081. ⟨10.1142/S0218127420500819⟩. ⟨hal-03029317⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert. Existence of Reaction–Diffusion Waves in a Model of Immune Response. Mediterranean Journal of Mathematics, 2020, 17 (47), ⟨10.1007/s00009-020-1490-z⟩. ⟨hal-03027289⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Paulo Mancera, Diego S Rodrigues, Fernando L P Santos, Cláudia P Ferreira. Maternal Passive Immunity and Dengue Hemorrhagic Fever in Infants. Bulletin of Mathematical Biology, 2020, 82 (2), ⟨10.1007/s11538-020-00699-x⟩. ⟨hal-03167544⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Jaouad Danane, Karam Allali, Leon Tine, Vitaly Volpert. Nonlinear Spatiotemporal Viral Infection Model with CTL Immunity: Mathematical Analysis. Mathematics , 2020, 8 (1), pp.1-13. ⟨10.3390/math8010052⟩. ⟨hal-03029312⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Kalyan Manna, Vitaly Volpert, Malay Banerjee. Dynamics of a Diffusive Two-Prey-One-Predator Model with Nonlocal Intra-Specific Competition for Both the Prey Species. Mathematics , 2020, 8 (1), pp.1-28. ⟨10.3390/math8010101⟩. ⟨hal-03027297⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Gennady Bocharov, Andreas Meyerhans, Vladimir Popov, Vitaly Volpert. Nonlocal Reaction–Diffusion Model of Viral Evolution: Emergence of Virus Strains. Mathematics , 2020, 8 (1), pp.1-20. ⟨10.3390/math8010117⟩. ⟨hal-03029316⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Anass Bouchnita, Vitaly Volpert, Mark Koury, Andreas Hellander. A multiscale model to design therapeutic strategies that overcome drug resistance to tyrosine kinase inhibitors in multiple myeloma. Mathematical Biosciences, 2020, 319, pp.1-12. ⟨10.1016/j.mbs.2019.108293⟩. ⟨hal-03027293⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Loïs Boullu, Laurent Pujo-Menjouet, Jacques Bélair. Stability analysis of an equation with two delays and application to the production of platelets. Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series S, 2020, 13 (11), pp.3005-3027. ⟨10.3934/dcdss.2020131⟩. ⟨hal-02109546⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Malay Banerjee, Alberto D’onofrio, Tomasz Lipniacki, Sergei Petrovskii, et al.. Coronavirus – Scientific insights and societal aspects. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2020, 15, pp.E2. ⟨10.1051/mmnp/2020010⟩. ⟨hal-02904004⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nicolas Ratto, Alexei Tokarev, P. Chelle, Brigitte Poncet Tardy-Poncet, Vitaly A Volpert. Clustering of Thrombin Generation Test Data Using a Reduced Mathematical Model of Blood Coagulation. Acta Biotheoretica, 2020, 68 (1), pp.21-43. ⟨10.1007/s10441-019-09372-w⟩. ⟨hal-04135115⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Latifa Ait Mahiout, Grigory Panasenko, Vitaly A Volpert. Partial homogenization of the diffusion equation with a dirac-like potential. International Journal for Multiscale Computational Engineering, 2020, 18 (5), pp.507-518. ⟨10.1615/IntJMultCompEng.2020035521⟩. ⟨hal-04135125⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Tarik Mohammed Touaoula, Mohammed Nor Frioui, Nikolay Bessonov, Vitaly Volpert. Dynamics of solutions of a reaction-diffusion equation with delayed inhibition. Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series S, 2020, 13 (9), pp.2425-2442. ⟨10.3934/dcdss.2020193⟩. ⟨hal-03027194⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vincent Calvez, Thomas Lepoutre, Nicolas Meunier, Nicolas Muller. Non-linear analysis of a model for yeast cell communication. ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, 2020, 54 (2), pp.619 – 648. ⟨10.1051/m2an/2019065⟩. ⟨hal-02372511⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Malay Banerjee, Nayana Mukherjee, Vitaly Volpert. Prey-predator model with nonlocal and global consumption in the prey dynamics. Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series S, 2020, 13 (8), pp.2109-2120. ⟨10.3934/dcdss.2020180⟩. ⟨hal-03027313⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Swadesh Pal, Malay Banerjee, Vitaly Volpert. Spatio-temporal Bazykin’s model with space-time nonlocality. Mathematical Biosciences and Engineering, 2020, 17 (5), pp.4801-4824. ⟨10.3934/mbe.2020262⟩. ⟨hal-03029319⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Sergei Trofimchuk, Vitaly A Volpert. Existence of bistable waves for a nonlocal and nonmonotone reaction-diffusion equation. Proceedings of the Royal Society of Edinburgh: Section A, Mathematics, 2020, 150 (2), pp.721-739. ⟨10.1017/prm.2018.164⟩. ⟨hal-04135113⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Swarnali Sharma, Vitaly A Volpert, Malay Banerjee. Extended SEIQR type model for COVID-19 epidemic and data analysis. Mathematical Biosciences and Engineering, 2020, 17 (6), pp.7562-7604. ⟨10.3934/mbe.2020386⟩. ⟨hal-04135095⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Antonella Lupica, Piero Manfredi, Vitaly A Volpert, Annunziata Palumbo, Alberto d’Onofrio. Spatio-temporal games of voluntary vaccination in the absence of the infection: The interplay of local versus non-local information about vaccine adverse events. Mathematical Biosciences and Engineering, 2020, 17 (2), pp.1090-1131. ⟨10.3934/mbe.2020058⟩. ⟨hal-04135131⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Claudia Pio Ferreira. Global dynamics of a differential-difference system: a case of Kermack-McKendrick SIR model with age-structured protection phase. Mathematical Biosciences and Engineering, 2020, 17 (2), pp.1329-1354. ⟨10.3934/mbe.2020067⟩. ⟨hal-02431660⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: A.S. S Benedito, C.P. P Ferreira, Mostafa Adimy. Modeling the dynamics of Wolbachia -infected and uninfected A edes aegypti populations by delay differential equations. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2020, 15, pp.1-26. ⟨10.1051/mmnp/2020041⟩. ⟨hal-03167481⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Malay Banerjee, Alexey Tokarev, Vitaly A Volpert. Immuno-epidemiological model of two-stage epidemic growth. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2020, 15, pp.2020012. ⟨10.1051/mmnp/2020012⟩. ⟨hal-04135128⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Manaf Ahmed, Véronique Maume-Deschamps, Pierre Ribereau, Céline Vial. Spatial Risk Measure for Max-Stable and Max-Mixture Processes. Stochastics: An International Journal of Probability and Stochastic Processes, 2020, 92 (7), pp.1005-1020. ⟨10.1080/17442508.2019.1687703⟩. ⟨hal-01546570v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert. Mathematical Modelling in the era of coronavirus (Six month in a new reality). Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2020, 15, pp.E3. ⟨10.1051/mmnp/2020027⟩. ⟨hal-02898842⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Malay Banerjee, Sergei Petrovskii. On a quarantine model of coronavirus infection and data analysis. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2020, 15, pp.24. ⟨10.1051/mmnp/2020006⟩. ⟨hal-02904003⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Gennady Bocharov, Cristina Leon, Vladimir Popov, Vitaly Volpert. Genotype-dependent virus distribution and competition of virus strains. Mathematics and Mechanics of Complex Systems, 2020, 8 (2), pp.101-126. ⟨10.2140/memocs.2020.8.101⟩. ⟨hal-03027307⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly V Ganusov, Vitaly Volpert, Burkhard Ludewig, Andreas Meyerhans. Editorial: Mathematical Modeling of the Immune System in Homeostasis, Infection and Disease. Frontiers in Immunology, 2020, pp.1-3. ⟨10.3389/fimmu.2019.02944⟩. ⟨hal-03019262⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Sergei Trofimchuk, Vitaly A Volpert. Traveling waves in delayed reaction-diffusion equations in biology. Mathematical Biosciences and Engineering, 2020, 17 (6), pp.6487-6514. ⟨10.3934/mbe.2020339⟩. ⟨hal-04135098⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Latifa Ait Mahiout, Grigory Panasenko, Vitaly A Volpert. Homogenization of the diffusion equation with a singular potential for a model of a biological cell network. Zeitschrift für Angewandte Mathematik und Physik, 2020, 71 (6), pp.181. ⟨10.1007/s00033-020-01401-w⟩. ⟨hal-04135090⟩
Accès au bibtex

Rapport

ref_biblio: Stéphane Derrode, Romain Gauchon, Nicolas Ponthus, Christophe Rigotti, Catherine Pothier, et al.. Piecewise estimation of R0 by a simple SEIR model. Application to COVID-19 in French regions and departments until June 30, 2020. [Research Report] LIRIS UMR CNRS 5205; Ecole centrale de lyon; INSA LYON; Université Lyon 1 – Claude Bernard. 2020. ⟨hal-02910202v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Pré-publication, Document de travail

ref_biblio: Paul Lemarre, Suzanne S Sindi, Laurent Pujo-Menjouet. A unifying model for the propagation of prion proteins in yeast brings insight into the [PSI+] prion. 2020. ⟨hal-02501966⟩
Accès au texte intégral et bibtex

2019

Article dans une revue

ref_biblio: Anissa Guillemin, Ronan Duchesne, Fabien Crauste, Sandrine Gonin-Giraud, Olivier Gandrillon. Drugs modulating stochastic gene expression affect the erythroid differentiation process. PLoS ONE, 2019, 14 (11), pp.1-19. ⟨10.1371/journal.pone.0225166⟩. ⟨hal-02375801⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Toshikazu Kuniya. Coupled reaction-diffusion and difference system of cell-cycle dynamics for hematopoiesis process with Dirichlet boundary conditions. Australian Journal of Mathematical Analysis and Applications, 2019, 479 (1), pp.1030-1068. ⟨10.1016/j.jmaa.2019.06.066⟩. ⟨hal-02448738⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Laurent Pujo-Menjouet. Est-ce par hasard s’il a le cœur qui s’égare. Pour la science, 2019. ⟨hal-02414752⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Jeff E. Mold, Pedro Réu, Axel Olin, Samuel Bernard, Jakob Michaelsson, et al.. Cell generation dynamics underlying naïve T cell homeostasis in adult humans. PLoS Biology, 2019, 17 (10), pp.e3000383. ⟨10.1371/journal.pbio.3000383⟩. ⟨hal-02160888v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Ionel Sorin Ciuperca, Matthieu Dumont, Abdelkader Lakmeche, Pauline Mazzocco, Laurent Pujo-Menjouet, et al.. Alzheimer’s disease and prion: An in vitro mathematical model. Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, 2019, 24 (10), pp.5225-5260. ⟨10.3934/dcdsb.2019057⟩. ⟨hal-02414635⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Angélique Richard, Elodie Vallin, Caroline Romestaing, Damien Roussel, Olivier Gandrillon, et al.. Erythroid differentiation displays a peak of energy consumption concomitant with glycolytic metabolism rearrangements. PLoS ONE, 2019, 14 (9), pp.e0221472. ⟨10.1371/journal.pone.0221472⟩. ⟨hal-02318812⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: P. Arner, Samuel Bernard, Lena Appelsved, Keng-Yeh Fu, Mehran Salehpour, et al.. Adipose lipid turnover and long-term changes in body weight. Nature Medicine, 2019, 25 (9), pp.1385-1389. ⟨10.1038/s41591-019-0565-5⟩. ⟨hal-02317491⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Loïs Boullu, Laurent Pujo-Menjouet, Jianhong Wu. A model for megakaryopoiesis with state-dependent delay. SIAM Journal on Applied Mathematics, 2019, 79 (4), pp.1218-1243. ⟨10.1137/18M1201020⟩. ⟨hal-02123621⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Sergei Trofimchuk, Vitaly Volpert. Global continuation of monotone waves for bistable delayed equations with unimodal nonlinearities. Nonlinearity, 2019, 32 (7), pp.2593-2632. ⟨10.1088/1361-6544/ab0e23⟩. ⟨hal-02363393⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Anne Beuter, Sergei Trofimchuk, Vitaly Volpert. Cortical waves and post‐stroke brain stimulation. Mathematical Methods in the Applied Sciences, 2019, 42 (11), pp.3912-3928. ⟨10.1002/mma.5620⟩. ⟨hal-02363412⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Ulysse Herbach. Stochastic Gene Expression with a Multistate Promoter: Breaking Down Exact Distributions. SIAM Journal on Applied Mathematics, 2019, 79 (3), pp.1007-1029. ⟨10.1137/18M1181006⟩. ⟨hal-02159699⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Dmitry Grebennikov, Anass Bouchnita, Vitaly Volpert, Nikolay Bessonov, Andreas Meyerhans, et al.. Spatial Lymphocyte Dynamics in Lymph Nodes Predicts the Cytotoxic T Cell Frequency Needed for HIV Infection Control. Frontiers in Immunology, 2019, 10, pp.1-15. ⟨10.3389/fimmu.2019.01213⟩. ⟨hal-02363399⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Ronan Duchesne, Anissa Guillemin, Fabien Crauste, Olivier Gandrillon. Calibration, Selection and Identifiability Analysis of a Mathematical Model of the in vitro Erythropoiesis in Normal and Perturbed Contexts. In Silico Biology, 2019, 13 (1-2), pp.55-69. ⟨10.3233/ISB-190471⟩. ⟨hal-02309925⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mohamed Amine Benchaib, Anass Bouchnita, Vitaly Volpert, Abdelkader Makhoute. Mathematical Modeling Reveals That the Administration of EGF Can Promote the Elimination of Lymph Node Metastases by PD-1/PD-L1 Blockade. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2019, 7, pp.1-18. ⟨10.3389/fbioe.2019.00104⟩. ⟨hal-02363404⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Arnaud Bonnaffoux, Ulysse Herbach, Angélique Richard, Anissa Guillemin, Sandrine Gonin-Giraud, et al.. WASABI: a dynamic iterative framework for gene regulatory network inference. BMC Bioinformatics, 2019, 20 (1), pp.1-19. ⟨10.1186/s12859-019-2798-1⟩. ⟨hal-02159694⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Anass Bouchnita, Vitaly Volpert. A multiscale model of platelet-fibrin thrombus growth in the flow. Computers and Fluids, 2019, 184, pp.10-20. ⟨10.1016/j.compfluid.2019.03.021⟩. ⟨hal-02363406⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Moitri Sen, Vitaly Volpert, Vitali Vougalter. Existence of waves for a reaction–diffusion–dispersion system. Nonlinear Analysis: Theory, Methods and Applications, 2019, 180, pp.52-66. ⟨10.1016/j.na.2018.09.011⟩. ⟨hal-01941461⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Nikolay Bessonov, Anne Beuter, Sergei Trofimchuk, Vitaly Volpert. Estimate of the travelling wave speed for an integro-differential equation. Applied Mathematics Letters, 2019, 88, pp.103-110. ⟨10.1016/j.aml.2018.07.037⟩. ⟨hal-01941455⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Simon Girel, Christophe Arpin, Jacqueline Marvel, Olivier Gandrillon, Fabien Crauste. Model-based assessment of the Role of Uneven Partitioning of Molecular Content on Heterogeneity and Regulation of Differentiation in CD8 T-cell Immune Responses. Frontiers in Immunology, In press, pp.1-41. ⟨10.3389/fimmu.2019.00230⟩. ⟨hal-02008705⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Paul Lemarre, Laurent Pujo-Menjouet, Suzanne S Sindi. Generalizing a mathematical model of prion aggregation allows strain coexistence and co-stability by including a novel misfolded species. Journal of Mathematical Biology, 2019, 78, pp.465-495. ⟨10.1007/s00285-018-1280-4⟩. ⟨hal-01858724⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Thomas Lepoutre, Isabel Victoria Fernandez, Fanny Chevalier, Marie Lenormand, Nicolas Guérin. Les frontières psychanalytiques du moi : Freud, Klein, Winnicott, Lacan. L’Évolution Psychiatrique, 2019, 84 (1), pp.69-101. ⟨10.1016/j.evopsy.2018.10.008⟩. ⟨hal-02468443⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nicolas Ratto, Martine Marion, Vitaly Volpert. Existence of pulses for a reaction-diffusion system of blood coagulation in flow. Mathematical Biosciences and Engineering, 2019, 16 (5), pp.4196-4212. ⟨10.3934/mbe.2019209⟩. ⟨hal-02084120⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Manaf Ahmed, Véronique Maume-Deschamps, Pierre Ribereau, Céline Vial. Spatial risk measure for Gaussian processes. Annales de l’ISUP, 2019, 63 (1), pp.3-21. ⟨hal-01421078v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Martine Marion, Vitaly Volpert. Existence of Pulses for the System of Competition of Species. Journal of Dynamics and Differential Equations, 2019, 31, pp.1653-1670. ⟨10.1007/s10884-017-9582-6⟩. ⟨hal-01573773⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Maggie Yeung, Mehdi Djelloul, Embla Steiner, Samuel Bernard, Mehran Salehpour, et al.. Dynamics of oligodendrocyte generation in multiple sclerosis. Nature, 2019, 566, pp.538-542. ⟨10.1038/s41586-018-0842-3⟩. ⟨hal-02002274⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mohammed Helal, Angélique Igel-Egalon, Abdelkader Lakmeche, Pauline Mazzocco, Angélique Perrillat-Mercerot, et al.. Stability analysis of a steady state of a model describing Alzheimer’s disease and interactions with prion proteins. Journal of Mathematical Biology, 2019, 78 (1-2), pp.57-81. ⟨10.1007/s00285-018-1267-1⟩. ⟨hal-01946610⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Loïs Boullu, Mostafa Adimy, Fabien Crauste, Laurent Pujo-Menjouet. Oscillations and asymptotic convergence for a delay differential equation modeling platelet production. Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, 2019, 24 (6), pp.2417-2442. ⟨10.3934/dcdsb.2018259⟩. ⟨hal-01835435v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: A.V. Panfilov, H. Dierckx, Vitaly A Volpert. (INVITED) Reaction–diffusion waves in cardiovascular diseases. Physica D: Nonlinear Phenomena, 2019, 399, pp.1-34. ⟨10.1016/j.physd.2019.04.001⟩. ⟨hal-04135137⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Thomas Lepoutre. Improved duality estimates: time discrete case and applications to a class of cross-diffusion systems. Communications in Mathematical Sciences, 2019, 17 (2), pp.339 – 351. ⟨10.4310/CMS.2019.v17.n2.a2⟩. ⟨hal-01943576⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nicolas Ratto, Martine Marion, Vitaly Volpert. Existence of Waves for a Bistable Reaction–Diffusion System with Delay. Journal of Dynamics and Differential Equations, 2019, 16 (5), pp.4196-4212. ⟨10.1007/s10884-019-09751-4⟩. ⟨hal-02363403⟩
Accès au bibtex

Communication dans un congrès

ref_biblio: Cristina Leon, Vladimir Popov, Vitaly A Volpert. Viruses competition in the genotype space. International Conference “Mathematical Modelling in Biomedicine” 2019, Sep 2019, Moscow, Russia. pp.02002, ⟨10.1051/itmconf/20203102002⟩. ⟨hal-04139592⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Nicolas Ratto, Martine Marion, Vitaly A Volpert. Wave propagation for a reduced model of blood coagulation. International Conference “Mathematical Modelling in Biomedicine” 2019, Sep 2019, Moscow, Russia. pp.01005, ⟨10.1051/itmconf/20203101005⟩. ⟨hal-04139584⟩
Accès au bibtex

Chapitre d’ouvrage

ref_biblio: Laurent Pujo-Menjouet. Passer notre amour à la machine. Futures of Love, 2019, 2956302833. ⟨hal-02414758⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Katherine Grzesik, Kevin Eng, Fabien Crauste, Sebastiano Battaglia. In Silico Methods for Studying T Cell Biology. Int. Rev. Cell. Mol. Biol. 342, Elsevier, pp.265-304, 2019, ⟨10.1016/bs.ircmb.2018.07.005⟩. ⟨hal-02237891⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mathieu Caléro, Ionel Sorin Ciuperca, Laurent Pujo-Menjouet, Léon Matar Tine. Alzheimer Disease: Convergence Result from a Discrete Model Towards a Continuous One. Trends in Biomathematics: Mathematical Modeling for Health, Harvesting, and Population Dynamics, Springer, pp.397-431, 2019, 978-3-030-23432-4. ⟨10.1007/978-3-030-23433-1_25⟩. ⟨hal-02414726⟩
Accès au bibtex

Ouvrages

ref_biblio: Laurent Pujo-Menjouet. Le jeu de l’amour sans le hasard Mathématiques du couple. Des Equateurs, pp.1-248, 2019, 9782849905685. ⟨hal-02414777⟩
Accès au bibtex

Poster de conférence

ref_biblio: Charles Rocabert, Guillaume Beslon, Carole Knibbe, Samuel Bernard. Phenotypic Noise and the Cost of Complexity. EvoLyon 2019, Nov 2019, Lyon, France. ⟨hal-02402443⟩
Accès au texte intégral et bibtex

2018

Article dans une revue

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Natalia Reinberg, Malay Banerjee, Vitaly Volpert. The origin of species by means of mathematical modelling. Acta Biotheoretica, 2018, 66 (4), pp.333-344. ⟨10.1007/s10441-018-9328-9⟩. ⟨hal-01941452⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitali Vougalter, Vitaly Volpert. Solvability of Some Integro-Differential Equations with Anomalous Diffusion in Two Dimensions. Journal of Mathematical Sciences, 2018, 235 (3), pp.243-255. ⟨10.1007/978-3-319-47512-7_9⟩. ⟨hal-01941457⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Loic Barbarroux, Philippe Michel, Mostafa Adimy, Fabien Crauste. A multiscale model of the CD8 T cell immune response structured by intracellular content. Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, 2018, 23 (9), pp.3969-4002. ⟨10.3934/dcdsb.2018120⟩. ⟨hal-01969237⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Gennady Bocharov, Andreas Meyerhans, Nikolay Bessonov, Sergei Trofimchuk, Vitaly Volpert. Interplay between reaction and diffusion processes in governing the dynamics of virus infections. Journal of Theoretical Biology, 2018, 457, pp.221-236. ⟨10.1016/j.jtbi.2018.08.036⟩. ⟨hal-01941458⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Anne Beuter, Anne Balossier, Sergei Trofimchuk, Vitaly Volpert. Modeling of post-stroke stimulation of cortical tissue. Mathematical Biosciences, 2018, 305, pp.146-159. ⟨10.1016/j.mbs.2018.08.014⟩. ⟨hal-01941460⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vladimir A. Belyaev, Joanne L. Dunster, Jon M. Gibbins, Mikhail A. Panteleev, Vitaly Volpert. Modeling thrombosis in silico: Frontiers, challenges, unresolved problems and milestones. Physics of Life Reviews, 2018, 26-27, pp.57-95. ⟨10.1016/j.plrev.2018.02.005⟩. ⟨hal-01941469⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Léon Matar Tine, Babacar Lèye. Analysis and numerical simulation of a polymerization model with aggregation and Ostwald ripening for the growth phenomenon. Acta Applicandae Mathematicae, 2018, pp.1-28. ⟨10.1007/s10440-018-0222-x⟩. ⟨hal-01933553⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitali Vougalter, Vitaly Volpert. On the Existence in the Sense of Sequences of Stationary Solutions for Some Systems of Non-Fredholm Integro-differential Equations. Mediterranean Journal of Mathematics, 2018, 15 (205), ⟨10.1007/s00009-018-1248-z⟩. ⟨hal-01941463⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Tatiana Galochkina, Martine Marion, Vitaly Volpert. Initiation of reaction–diffusion waves of blood coagulation. Physica D: Nonlinear Phenomena, 2018, 376-377, pp.160-170. ⟨10.1016/j.physd.2017.11.006⟩. ⟨hal-01941465⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Guillaume Vogin, Thierry Bastogne, Larry Bodgi, Julien Gillet-Daubin, Aurélien Canet, et al.. The pATM Immunofluorescence assay: a high-performance radiosensitivity assay to predict post radiotherapy overreactions.. International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics, 2018, 101 (3), pp.690-693. ⟨10.1016/j.ijrobp.2018.03.047⟩. ⟨hal-01757771⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Simon Girel, Fabien Crauste. Existence and stability of periodic solutions of an impulsive differential equation and application to CD8 T-cell differentiation. Journal of Mathematical Biology, 2018, 76 (7), pp.1765-1795. ⟨10.1007/s00285-018-1220-3⟩. ⟨hal-01721728⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Oscar Angulo, Fabien Crauste, Juan Carlos López-Marcos. Numerical integration of an erythropoiesis model with explicit growth factor dynamics. Journal of Computational and Applied Mathematics, 2018, 330, pp.770 – 782. ⟨10.1016/j.cam.2017.01.033⟩. ⟨hal-01646786⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Hagen B Huttner, Olaf Bergmann, Mehran Salehpour, Raouf El Cheikh, Makoto Nakamura, et al.. Meningioma growth dynamics assessed by radiocarbon retrospective birth dating. EBioMedicine, 2018, 27, pp.176-181. ⟨10.1016/j.ebiom.2017.12.020⟩. ⟨hal-01671339⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Sergei Trofimchuk, Vitaly Volpert. Traveling Waves for a Bistable Reaction-Diffusion Equation with Delay. SIAM Journal on Mathematical Analysis, 2018, 50 (1), pp.1175-1199. ⟨10.1137/17M1115587⟩. ⟨hal-01941474⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Oscar Angulo, Olivier Gandrillon, Fabien Crauste. Investigating the role of the experimental protocol in phenylhydrazine-induced anemia on mice recovery. Journal of Theoretical Biology, 2018, 437, pp.286 – 298. ⟨10.1016/j.jtbi.2017.10.031⟩. ⟨hal-01646792⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Abdennasser Chekroun, Laurent Pujo-Menjouet, Jean-Philippe Berteau. A Novel Multiscale Mathematical Model for Building Bone Substitute Materials for Children. Materials, 2018, 11 (6), pp.1-16. ⟨10.3390/ma11061045⟩. ⟨hal-02159058⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Communication dans un congrès

ref_biblio: Martín Andrade-Restrepo, Paul Lemarre, Laurent Pujo-Menjouet, Leon Tine, Sorin Ionel Ciuperca. Modeling the spatial propagation of Aβ oligomers in alzheimer’s disease. CEMRACS 2018 – Numerical and mathematical modeling for biological and medical applications: deterministic, probabilistic and statistical descriptions, Jul 2018, Marseille, France. pp.1 – 10. ⟨hal-02414660⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Ouvrages

ref_biblio: Gennady Bocharov, Vitaly Volpert, Burkhard Ludewig, Andreas Meyerhans. Mathematical Immunology of Virus Infections. Springer International Publishing, pp.XV, 245, 2018, 978-3-319-72316-7. ⟨10.1007/978-3-319-72317-4⟩. ⟨hal-01941475⟩
Accès au bibtex

Thèse

ref_biblio: Simon Girel. Modélisation de la Réponse Immunitaire T-CD8 : Analyse Mathématique et Modèles Multiéchelles. Systèmes dynamiques [math.DS]. Université de Lyon, 2018. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-01941850⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Arnaud Bonnaffoux. Inférence de réseaux de régulation de gènes à partir de données dynamiques multi-échelles. Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]. Université de Lyon, 2018. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-01920262⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Ulysse Herbach. Modélisation stochastique de l’expression des gènes et inférence de réseaux de régulation. Mathématiques [math]. Université de Lyon, 2018. Français. ⟨NNT : 2018LYSE1155⟩. ⟨tel-01930398⟩
Accès au texte intégral et bibtex

2017

Article dans une revue

ref_biblio: Ulysse Herbach, Arnaud Bonnaffoux, Thibault Espinasse, Olivier Gandrillon. Inferring gene regulatory networks from single-cell data: a mechanistic approach. BMC Systems Biology, 2017, 11 (1), pp.105. ⟨10.1186/s12918-017-0487-0⟩. ⟨hal-01646910⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Sandrine Pereira, Larry Bodgi, Mirlande Duclos, Aurélien Canet, Mélanie L. Ferlazzo, et al.. Fast and binary assay for predicting radiosensitivity based on the nucleoshuttling of ATM protein: development, validation and performances. International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics, 2017, ⟨10.1016/j.ijrobp.2017.10.029⟩. ⟨hal-01647135⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: G Bocharov, A Meyerhans, N Bessonov, S Trofimchuk, Vitaly Volpert. Modelling the dynamics of virus infection and immune response in space and time. International Journal of Parallel, Emergent and Distributed Systems, 2017, ⟨10.1080/17445760.2017.1363203⟩. ⟨hal-01578907⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Thomas Lepoutre, Ayman Moussa. Entropic structure and duality for multiple species cross-diffusion systems. Nonlinear Analysis: Theory, Methods and Applications, 2017, 159, ⟨10.1016/j.na.2017.02.008⟩. ⟨hal-01373172⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Pedro Réu, Azadeh Khosravi, Samuel Bernard, Jeff E. Mold, Mehran Salehpour, et al.. The Lifespan and Turnover of Microglia in the Human Brain. Cell Reports, 2017, 20 (4), pp.779 – 784. ⟨10.1016/j.celrep.2017.07.004⟩. ⟨hal-01572438⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Pauline Mazzocco, Samuel Bernard, Laurent Pujo-Menjouet. Estimates and impact of lymphocyte division parameters from CFSE data using mathematical modelling.. PLoS ONE, 2017, 12 (6), pp.e0179768. ⟨hal-01561667⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Edouard Ollier, Pauline Mazzocco, Damien Ricard, Gentian Kaloshi, Ahmed Idbaih, et al.. Analysis of temozolomide resistance in low-grade gliomas using a mechanistic mathematical model. Fundamental & Clinical Pharmacology, 2017, 31 (3), pp.347-358. ⟨10.1111/fcp.12259⟩. ⟨hal-01623733⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Kirsty L Spalding, Samuel Bernard, Erik Näslund, Mehran Salehpour, Göran Possnert, et al.. Impact of fat mass and distribution on lipid turnover in human adipose tissue. Nature Communications, 2017, 8, pp.15253. ⟨10.1038/ncomms15253⟩. ⟨hal-01561605⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Fabien Crauste, Julien Mafille, Lilia Boucinha, Sophia Djebali, Olivier Gandrillon, et al.. Identification of Nascent Memory CD8 T Cells and Modeling of Their Ontogeny. Cell Systems, 2017, 4 (3), pp.306-317. ⟨10.1016/j.cels.2017.01.014⟩. ⟨hal-01409637⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Chang Yang, Léon Matar Tine. A Hybrid Finite Volume Method for Advection Equations and Its Applications in Population Dynamics. Numerical Methods for Partial Differential Equations, 2017, 33 (4), pp.1114 – 1142. ⟨10.1002/num.22134⟩. ⟨hal-01646859⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitali Vougalter, Vitaly Volpert. Existence of stationary solutions for some systems of integro-differential equations with superdiffusion. Rocky Mountain Journal of Mathematics, 2017, 47 (3), pp.955-970. ⟨10.1216/RMJ-2017-47-3-955⟩. ⟨hal-01564763⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Apollos Besse, Geoffrey D. Clapp, Samuel Bernard, Franck-Emmanuel Nicolini, Doron Levy, et al.. Stability Analysis of a Model of Interaction Between the Immune System and Cancer Cells in Chronic Myelogenous Leukemia. Bulletin of Mathematical Biology, 2017, pp.1-27. ⟨10.1007/s11538-017-0272-7⟩. ⟨hal-01539364⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Apollos Besse, Thomas Lepoutre, Samuel Bernard. Long-term treatment effects in chronic myeloid leukemia. Journal of Mathematical Biology, 2017, pp.1-26. ⟨10.1007/s00285-017-1098-5⟩. ⟨hal-01447781⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Anass Bouchnita, T Galochkina, P Kurbatova, Patrice Nony, Vitaly Volpert. Conditions of microvessel occlusion for blood coagulation in flow. International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, 2017, CMBE15: SELECTED PAPERS FROM THE 4TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON COMPUTATIONAL & MATHEMATICAL BIOMEDICAL ENGINEERING 2015, ⟨10.1002/cnm.2850⟩. ⟨hal-01573775⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Tatiana Galochkina, Anass Bouchnita, Polina Kurbatova, Vitaly Volpert. Reaction-diffusion waves of blood coagulation. Mathematical Biosciences, 2017, 288, pp.130 – 139. ⟨10.1016/j.mbs.2017.03.008⟩. ⟨hal-01567320⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nathalie Eymard, Vitaly Volpert, Polina Kurbatova, Nikolai Bessonov, Kayode Ogungbenro, et al.. Mathematical model of T-cell lymphoblastic lymphoma: disease, treatment, cure or relapse of a virtual cohort of patients. Mathematical Medicine and Biology, 2017, ⟨10.1093/imammb/dqw019⟩. ⟨hal-01568372⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Bogdan Kazmierczak. Traveling waves in a coupled reaction-diffusion and difference model of hematopoiesis. Journal of Differential Equations, 2017, 262, pp.4085 – 4128. ⟨10.1016/j.jde.2016.12.009⟩. ⟨hal-01573613⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Toshikazu Kuniya. Delayed nonlocal reaction–diffusion model for hematopoietic stem cell dynamics with Dirichlet boundary conditions. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2017, 12 (6), pp.1 – 22. ⟨10.1051/mmnp/2017078⟩. ⟨hal-01683636⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitali Vougalter, Vitaly Volpert. Solvability in the sense of sequences for some non Fredholm operators related to the superdiffusion. Journal of Pseudo-Differential Operators and Applications, 2017, 160, pp.1-22. ⟨10.1007/s11868-017-0204-1⟩. ⟨hal-01573772⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Anass Bouchnita, Fatima Ezzahra Belmaati, Rajae Aboulaich, M J K Koury, Vitaly A Volpert. A Hybrid Computation Model to Describe the Progression of Multiple Myeloma and Its Intra-Clonal Heterogeneity. Computation, 2017, 5 (1), pp.16. ⟨10.3390/computation5010016⟩. ⟨hal-01565940⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Raouf El Cheikh, Samuel Bernard, Nader El Khatib. A multiscale modelling approach for the regulation of the cell cycle by the circadian clock. Journal of Theoretical Biology, 2017, 426, pp.117-125. ⟨10.1016/j.jtbi.2017.05.021⟩. ⟨hal-01561617⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Anass Bouchnita, Gennady Bocharov, Andreas Meyerhans, Vitaly Volpert. Towards a Multiscale Model of Acute HIV Infection. Computation, 2017, 5 (1), pp.6. ⟨10.3390/computation5010006⟩. ⟨hal-01570577⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, S Petrovskii, A Zincenko. Interaction of human migration and wealth distribution. Nonlinear Analysis: Hybrid Systems, 2017, 159, pp.408 – 423. ⟨10.1016/j.na.2017.02.024⟩. ⟨hal-01565519⟩
Accès au texte intégral et bibtex

HDR

ref_biblio: Samuel Bernard. Structured differential equations and multiscale approaches for human cell population dynamics. Dynamical Systems [math.DS]. Université Claude Bernard Lyon 1, 2017. ⟨tel-01572434v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Thomas Lepoutre. Contributions en dynamique de populations. Equations aux dérivées partielles [math.AP]. Université Claude Bernard (Lyon 1), 2017. ⟨tel-01524261⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Thèse

ref_biblio: Tatiana Galochkina. Spatial structure of lipopolysaccharides and its role in blood coagulation. Mathematics [math]. Université Claude Bernard Lyon 1 – Institut Camille Jordan; Lomonosov Moscow State University, 2017. Russian. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-01674579⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Apollos Besse. Modélisation mathématique de la leucémie myéloide chronique. Modélisation et simulation. Université de Lyon, 2017. Français. ⟨NNT : 2017LYSE1105⟩. ⟨tel-01561249v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Loïc Barbarroux. Contributions à la modélisation multi-échelles de la réponse immunitaire T-CD8 : construction, analyse, simulation et calibration de modèles. Autre. Université de Lyon, 2017. Français. ⟨NNT : 2017LYSEC026⟩. ⟨tel-01569442v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Pré-publication, Document de travail

ref_biblio: Thibault Bourgeron, Vincent Calvez, Jimmy Garnier, Thomas Lepoutre. Existence of recombination-selection equilibria for sexual populations. 2017. ⟨hal-01489695v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

2016

Article dans une revue

ref_biblio: Angélique Richard, Loïs Boullu, Ulysse Herbach, Arnaud Arnaud, Valérie Morin, et al.. Single-Cell-Based Analysis Highlights a Surge in Cell-to-Cell Molecular Variability Preceding Irreversible Commitment in a Differentiation Process. PLoS Biology, 2016, 14 (12), ⟨10.1371/journal.pbio.1002585⟩. ⟨hal-01934489⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Anass Bouchnita, Alexandre Rocca, Eric Fanchon, Mark J. Koury, Jean-Marc Moulis, et al.. Multi-scale Modelling of Erythropoiesis and Hemoglobin Production. Journal of Inorganic and Organometallic Polymers and Materials, 2016, 26 (6), pp.1362 – 1379. ⟨10.1007/s10904-016-0437-0⟩. ⟨hal-01929703⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Samuel Bernard. Moving the Boundaries of Granulopoiesis Modelling. Bulletin of Mathematical Biology, 2016, 78 (12), pp.2358 – 2363. ⟨10.1007/s11538-016-0215-8⟩. ⟨hal-01391393⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Youssef Bourfia, My Lhassan Hbid, Catherine Marquet. Age-structured model of hematopoiesis dynamics with growth factor-dependent coefficients. Electronic Journal of Differential Equations, 2016, pp.140. ⟨hal-01344118⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Tarik-Mohamed Touaoula. Global asymptotic stability for an age-structured model of hematopoietic stem cell dynamics. Applicable Analysis, 2016, pp.1 – 12. ⟨10.1080/00036811.2016.1139698⟩. ⟨hal-01396691⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Grigory Panasenko, Vitaly Volpert. Homogenization of a one-dimensional diffusion – discrete absorption equation with feedback. Applicable Analysis, 2016, 95, pp.1507 – 1516. ⟨10.1080/00036811.2016.1179288⟩. ⟨hal-01397565⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitali Vougalter, Vitaly Volpert. Existence of stationary solutions for some non-Fredholm integro-differential equations with superdiffusion. Journal of Pseudo-Differential Operators and Applications, 2016, ⟨10.1007/s11868-016-0173-9⟩. ⟨hal-01397555⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Xuefeng Gao, Christophe Arpin, Jacqueline Marvel, Sotiris A. Prokopiou, Olivier Gandrillon, et al.. IL-2 sensitivity and exogenous IL-2 concentration gradient tune the productive contact duration of CD8+ T cell-APC: a multiscale modeling study. BMC Systems Biology, 2016, 10 (1), pp.77. ⟨10.1186/s12918-016-0323-y⟩. ⟨inserm-01354185⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: A Stéphanou, Vitaly Volpert. Hybrid Modelling in Biology: a Classification Review. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2016, 11, pp.37 – 48. ⟨10.1051/mmnp/201611103⟩. ⟨hal-01397430⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Laurent Pujo-Menjouet. Blood Cell Dynamics: Half of a Century of Modelling. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2016, 11, pp.92 – 115. ⟨10.1051/mmnp/201611106⟩. ⟨hal-01382783⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Martine Marion, Vitaly Volpert. Existence of pulses for a monotone reaction-diffusion system. Pure and Applied Functional Analysis, 2016. ⟨hal-01396839⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Hugues Berry, Thomas Lepoutre, Álvaro Mateos González. Quantitative convergence towards a self similar profile in an age-structured renewal equation for subdiffusion. Acta Applicandae Mathematicae, 2016, 145, pp.15-45. ⟨hal-01136667⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Anass Bouchnita, Nathalie Eymard, Tamara K Moyo, Mark J Koury, Vitaly Volpert. Bone marrow infiltration by multiple myeloma causes anemia by reversible disruption of erythropoiesis. American Journal of Hematology, 2016, 91 (4), pp.371 – 378. ⟨10.1002/ajh.24291⟩. ⟨hal-01395624⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Nikolay Bessonov, Adélia Sequeira, Sergey Simakov, Yuri Vassilevski, Vitaly Volpert. Methods of Blood Flow Modelling. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2016, 11, pp.1 – 25. ⟨10.1051/mmnp/201611101⟩. ⟨hal-01397437⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Larry Bodgi, Aurélien Canet, Laurent Pujo-Menjouet, Annick Lesne, Jean-Marc Victor, et al.. Mathematical models of radiation action on living cells: From the target theory to the modern approaches. A historical and critical review. Journal of Theoretical Biology, 2016, 394, pp.93 – 101. ⟨10.1016/j.jtbi.2016.01.018⟩. ⟨hal-01382777⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Romain Yvinec, Samuel Bernard, Erwan Hingant, Laurent Pujo-Menjouet. First passage times in homogeneous nucleation: Dependence on the total number of particles. Journal of Chemical Physics, 2016, 144 (3), pp.1-17. ⟨10.1063/1.4940033⟩. ⟨hal-01353266⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Flavien Caraguel, Nikolai Bessonov, Jacques Demongeot, Danielle Dhouailly, Vitaly Volpert. Wound Healing and Scale Modelling in Zebrafish. Acta Biotheoretica, 2016, ⟨10.1007/s10441-016-9298-8⟩. ⟨hal-01395845⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Gennady Bocharov, Anas Bouchnita, Jean Clairambault, Vitaly Volpert. Mathematics of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics: Diversity of Topics, Models and Methods. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2016. ⟨hal-01413795⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Communication dans un congrès

ref_biblio: Romain Yvinec, Samuel Bernard, Tom Chou, Julien Deschamps, Maria R. d’Orsogna, et al.. Nucleation time in stochastic Becker-Doring model. 11. AIMS Conference on Dynamical Systems, Differential Equations and Applications, American Institute of Mathematical Science (AIMS). USA., Jul 2016, Orlando, United States. 45 diapositives. ⟨hal-02797058⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Romain Yvinec, Samuel Bernard, Tom Chou, Julien Deschamps, Maria R. d’Orsogna, et al.. Stochastic coagulation-fragmentation models for the study of protein aggregation phenomena. Stochastic Dynamical Systems in Biology: Numerical Methods and Applications, Isaac Newton Institute. GBR., Jan 2016, Cambridge, United Kingdom. 31 diapositives. ⟨hal-02795563⟩
Accès au texte intégral et bibtex

HDR

ref_biblio: Laurent Pujo-Menjouet. Étude de modèles mathématiques issus de la biologie du cycle cellulaire et de la dynamique des protéines. Systèmes dynamiques [math.DS]. Université Claude Bernard Lyon 1 – Institut Camille Jordan, 2016. ⟨tel-01411371⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Thèse

ref_biblio: Abdennasser Chekroun. Contribution à l’analyse mathématique d’équations aux dérivées partielles structurées en âge et en espace modélisant une dynamique de population cellulaire. Equations aux dérivées partielles [math.AP]. Université de Lyon, 2016. Français. ⟨NNT : 2016LYSE1040⟩. ⟨tel-01313670v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Marine Jacquier. Mathematical modeling of the hormonal regulation of food intake and body weight : applications to caloric restriction and leptin resistance. Statistics [math.ST]. Université de Lyon, 2016. English. ⟨NNT : 2016LYSE1027⟩. ⟨tel-01273347v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

2015

Article dans une revue

ref_biblio: Stéphane Gaubert, Thomas Lepoutre. Discrete limit and monotonicity properties of the Floquet eigenvalue in an age structured cell division cycle model. Journal of Mathematical Biology, 2015, 71 (6), ⟨10.1007/s00285-015-0874-3⟩. ⟨hal-00773211⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Ophélie Arnaud, Sam Meyer, Elodie Vallin, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon. Temperature-induced variation in gene expression burst size in metazoan cells. BMC Molecular Biology, 2015, 16 (20), ⟨10.1186/s12867-015-0048-2⟩. ⟨hal-01248384⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Tarik-Mohamed Touaoula. Age-structured and delay differential-difference model of hematopoietic stem cell dynamics. Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, 2015, 20 (9), pp.27. ⟨10.3934/dcdsb.2015.20.2765⟩. ⟨hal-01249892⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Geoffrey D Clapp, Thomas Lepoutre, Raouf El Cheikh, Samuel Bernard, Jérémy Ruby, et al.. Implication of the Autologous Immune System in BCR-ABL Transcript Variations in Chronic Myelogenous Leukemia Patients Treated with Imatinib.. Cancer Research, 2015, 75 (19), pp.4053-62. ⟨10.1158/0008-5472.CAN-15-0611⟩. ⟨hal-01251396⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mikael Rydén, Mehmet Uzunel, Joanna l. Hård, Erik Borgström, Jeff e. Mold, et al.. Transplanted Bone Marrow-Derived Cells Contribute to Human Adipogenesis. Cell Metabolism, 2015, 22 (3), pp.408-417. ⟨10.1016/j.cmet.2015.06.011⟩. ⟨hal-01225085⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: B. Zilg, Samuel Bernard, K. Alkass, S. Berg, H. Druid. A new model for the estimation of time of death from vitreous potassium levels corrected for age and temperature. Forensic Science International, 2015, 254, pp.158-166. ⟨10.1016/j.forsciint.2015.07.020⟩. ⟨hal-01225089⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Marine Jacquier, Hédi A. Soula, Fabien Crauste. A mathematical model of leptin resistance. Mathematical Biosciences, 2015, 267, ⟨10.1016/j.mbs.2015.06.008⟩. ⟨hal-01233483⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Samuel Bernard, Fabien Crauste. Optimal linear stability condition for scalar differential equations with distributed delay. Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, 2015, 20 (7), ⟨10.3934/dcdsb.2015.20.1855⟩. ⟨hal-00997528⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Fabien Crauste, Emmanuelle Terry, I Le Mercier, Julien Mafille, Sophie Djebali, et al.. Predicting pathogen-specific CD8 T cell immune responses from a modeling approach.. Journal of Theoretical Biology, 2015, 374, pp.66-82. ⟨10.1016/j.jtbi.2015.03.033⟩. ⟨hal-00717406v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Olaf Bergmann, Sofia Zdunek, Anastasia Felker, Mehran Salehpour, Kanar Alkass, et al.. Dynamics of Cell Generation and Turnover in the Human Heart. Cell, 2015, 161 (7), pp.1566-1575. ⟨10.1016/j.cell.2015.05.026⟩. ⟨hal-01225091⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Tarik-Mohamed Touaoula. A delay differential-difference system of hematopoietic stem cell dynamics. Comptes Rendus. Mathématique, 2015, 353 (4), ⟨10.1016/j.crma.2015.01.018⟩. ⟨hal-01249894⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Alen Tosenberger, Nikolai Bessonov, Vitaly Volpert. Influence of Fibrinogen Deficiency on Clot Formation in Flow by Hybrid Model. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2015, ⟨10.1051/mmnp/201510102⟩. ⟨hal-01237500⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mohammed Benmir, Nikolai Bessonov, Soumaya Boujena, Vitaly Volpert. Travelling Waves of Cell Dierentiation. Acta Biotheoretica, 2015. ⟨hal-01238175⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nathalie Eymard, Vitaly Volpert, Vitali Vougalter. Existence of Pulses for Local and Nonlocal Reaction-Diffusion Equations. Journal of Dynamics and Differential Equations, 2015, ⟨10.1007/s10884-015-9487-1⟩. ⟨hal-01237744⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Vitali Vougalter. On the existence of stationary solutions for some nonlinear heat equations. Annales Academiae Scientiarum Fennicae. Mathematica, 2015, ⟨10.5186/aasfm.2015.4013⟩. ⟨hal-01238488⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Alen Tosenberger, Fazly Ataullakhanov, Nikolai Bessonov, Mikhail Panteleev, Alexei Tokarev, et al.. Modelling of platelet–fibrin clot formation in flow with a DPD–PDE method. Journal of Mathematical Biology, 2015, ⟨10.1007/s00285-015-0891-2⟩. ⟨hal-01237498⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Michael Levin, Nadya Morozova, Natalia Reinberg, Alen Tosenberger, et al.. Target morphology and cell memory: a model of regenerative pattern formation Cell Memory Can Regulate Morphogenesis and Regeneration. Neural Regeneration Research, 2015. ⟨hal-01238420⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Karam Allali, Fouad Bikany, Ahmed Taik, Vitaly Volpert. Numerical simulations of heat explosion with convection in porous media. Combustion Science and Technology, 2015, ⟨10.1080/00102202.2014.948619⟩. ⟨hal-01238489⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Jacques Demongeot, Vitaly Volpert. Dynamical system model of decision making and propagation. Journal of Biological Systems, 2015, ⟨10.1142/S0218339015500187⟩. ⟨hal-01237695⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Natalia Reinberg, Vitaly Volpert. How morphology of artificial organisms influences their evolution. Ecological Complexity, 2015, ⟨10.1016/j.ecocom.2015.09.005⟩. ⟨hal-01237505⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Karam Allali, Vitaly Volpert, Vitali Vougalter. A Model of Miscible Liquids in Porous Media. Electronic Journal of Differential Equations, 2015. ⟨hal-01237171⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: L Desvillettes, Th Lepoutre, Ayman Moussa, A Trescases. On the entropic structure of reaction-cross diffusion systems. Communications in Partial Differential Equations, 2015, ⟨10.1080/03605302.2014.998837⟩. ⟨hal-01078175⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Angélique Stéphanou, Vitaly Volpert. Hybrid Modelling in Cell Biology. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2015, 10 (1), pp.1-3. ⟨10.1051/mmnp/201510100⟩. ⟨hal-01975989⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Alen Tosenberger, Nikolai Bessonov, M Levin, Natalia Reinberg, Vitaly Volpert, et al.. Acta Biotheoretica Mathematical and philosophical foundations of biological and biomedical science A Conceptual Model of Morphogenesis and Regeneration. Acta Biotheoretica, 2015, ⟨10.1007/s10441-015-9249-9⟩. ⟨hal-01237264⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert. Pulses and waves for a bistable nonlocal reaction–diffusion equation. Applied Mathematics Letters, 2015, ⟨10.1016/j.aml.2014.12.011⟩. ⟨hal-01237160⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Michael Levin, Nadya Morozova, Natalia Reinberg, Alen Tosenberger, et al.. On a Model of Pattern Regeneration Based on Cell Memory. PLoS ONE, 2015, ⟨10.1371/journal.pone.0118091⟩. ⟨hal-01237935⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitali Vougalter, Vitaly Volpert. Existence of stationary solutions for some nonlocal reaction-diffusion equations. Dynamics of Partial Differential Equations, 2015, ⟨10.4310/DPDE.2015.v12.n1.a3⟩. ⟨hal-01237921⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Natalia Reinberg, Mohammed Benmir, Soumaya Boujena. On pulse solutions of a reaction–diffusion system in population dynamics. Nonlinear Analysis: Theory, Methods and Applications, 2015, ⟨10.1016/j.na.2015.02.017⟩. ⟨hal-01237675⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: P Mazzocco, Célia Barthélémy, G Kaloshi, Marc Lavielle, D Ricard, et al.. Prediction of Response to Temozolomide in Low-Grade Glioma Patients Based on Tumor Size Dynamics and Genetic Characteristics. CPT: Pharmacometrics and Systems Pharmacology, 2015, 4 (12), pp.728-737. ⟨10.1002/psp4.54⟩. ⟨hal-01252076⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Peggy Cellier, Thierry Charnois, Marc Plantevit, Christophe Rigotti, Bruno Crémilleux, et al.. Sequential pattern mining for discovering gene interactions and their contextual information from biomedical texts. Journal of Biomedical Semantics, 2015, 6, pp.1-27. ⟨10.1186/s13326-015-0023-3⟩. ⟨hal-01192959⟩
Accès au bibtex

Communication dans un congrès

ref_biblio: Loic Barbarroux, Jean Clairambault, Nick Cogan, Jan Elias, Shalla Hanson, et al.. Preface to Session 70 » Mathematical models and methods to investigate heterogeneity in cell and cell population biology « : Presentation of Session 70 in ICNAAM 2015, Rhodes. ICNAAM 2015 Session 70: « Mathematical models and methods to investigate heterogeneity in cell and cell population biology », Organiser Session 70: Jean Clairambault, Sep 2015, Rhodes, Greece. ⟨hal-01249244⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Loic Barbarroux, Philippe Michel, Mostafa Adimy, Fabien Crauste. Multi-scale modeling of the CD8 immune response. INTERNATIONAL CONFERENCE OF NUMERICAL ANALYSIS AND APPLIED MATHEMATICS 2015 (ICNAAM 2015), Sep 2015, Rhodes, Greece. pp.320002, ⟨10.1063/1.4952106⟩. ⟨hal-02237894⟩
Accès au bibtex

Thèse

ref_biblio: Raouf El Cheikh. Multiscale modeling for the regulation of cell cycle by the circadian clock : applications to chronotherapy. Dynamical Systems [math.DS]. Université Claude Bernard – Lyon I, 2015. English. ⟨NNT : 2015LYO10082⟩. ⟨tel-01254464v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

2014

Article dans une revue

ref_biblio: Maggie S y Yeung, Sofia Zdunek, Olaf Bergmann, Samuel Bernard, Mehran Salehpour, et al.. Dynamics of oligodendrocyte generation and myelination in the human brain.. Cell, 2014, 159, pp.766-774. ⟨hal-01092151⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Sotiris Prokopiou, Loic Barbarroux, Samuel Bernard, Julien Mafille, Yann Leverrier, et al.. Multiscale Modeling of the Early CD8 T-Cell Immune Response in Lymph Nodes: An Integrative Study. Computation, 2014, 2 (4), pp.159-181. ⟨10.3390/computation2040159⟩. ⟨hal-01074736⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Raouf El Cheikh, Samuel Bernard, Nader El Khatib. Modeling circadian clock-cell cycle interaction effects on cell population growth rates. Journal of Theoretical Biology, 2014, 363, pp.318-331. ⟨10.1016/j.jtbi.2014.08.008⟩. ⟨hal-01055081⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Erwan Hingant, Pascaline Fontes, Maria-Teresa Alvarez-Martinez, Jacques-Damien Arnaud, Jean-Pierre Liautard, et al.. A Micellar On-Pathway Intermediate Step Explains the Kinetics of Prion Amyloid Formation. PLoS Computational Biology, 2014, 10 (8), pp.e1003735. ⟨10.1371/journal.pcbi.1003735⟩. ⟨hal-01104265⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Pierre-Nicolas Mougel, Christophe Rigotti, Marc Plantevit, Olivier Gandrillon. Finding maximal homogeneous clique sets. Knowledge and Information Systems (KAIS), 2014, 39 (3), pp.579-608. ⟨10.1007/s10115-013-0625-y⟩. ⟨hal-00827164⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Hagen B Huttner, Olaf Bergmann, Mehran Salehpour, Attila Rácz, Jemal Tatarishvili, et al.. The age and genomic integrity of neurons after cortical stroke in humans.. Nature Neuroscience, 2014, pp.801-3. ⟨hal-01092159⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Aurélie Ernst, Kanar Alkass, Samuel Bernard, Mehran Salehpour, Shira Perl, et al.. Neurogenesis in the Striatum of the Adult Human Brain.. Cell, 2014, 156 (5), pp.1072-1083. ⟨10.1016/j.cell.2014.01.044⟩. ⟨hal-00952021⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Thomas Lepoutre, Nicolas Meunier, Nicolas Muller. Cell polarisation model : the 1D case. Journal de Mathématiques Pures et Appliquées, 2014, 101 (2), pp.152–171. ⟨10.1016/j.matpur.2013.05.006⟩. ⟨hal-00776613⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Frédérique Billy, Jean Clairambault, Olivier Fercoq, Stéphane Gaubert, Thomas Lepoutre, et al.. Synchronisation and control of proliferation in cycling cell population models with age structure. Mathematics and Computers in Simulation, 2014, 96, pp.66-94. ⟨10.1016/j.matcom.2012.03.005⟩. ⟨hal-00662885⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Reinberg Natalia, Vitaly Volpert. Mathematics of Darwin’s Diagram. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2014, 9 (3), pp.5-25. ⟨10.1051/mmnp/20149302⟩. ⟨hal-01097152⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitali Vougalter, Vitaly Volpert. On the solvability in the sense of sequences for some non-Fredholm operators. Dynamics of Partial Differential Equations, 2014, 11 (2), pp.109-124. ⟨10.4310/DPDE.2014.v11.n2.a1⟩. ⟨hal-01096776⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Stephan Fischer, Samuel Bernard, Guillaume Beslon, Carole Knibbe. A Model for Genome Size Evolution. Bulletin of Mathematical Biology, 2014, 76 (9), pp.2249 – 2291. ⟨10.1007/s11538-014-9997-8⟩. ⟨hal-01090984⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mohamed Helal, Erwan Hingant, Laurent Pujo-Menjouet, Glenn F. Webb. Alzheimer’s disease: analysis of a mathematical model incorporating the role of prions. Journal of Mathematical Biology, 2014, 69 (5), pp.1207-1235. ⟨10.1007/s00285-013-0732-0⟩. ⟨hal-00846137⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Oscar Angulo, Juan Carlos López-Marcos, Miguel Angel López-Marcos. Asymptotic behaviour of a mathematical model of hematopoietic stem cell dynamics. International Journal of Computer Mathematics, 2014, 91 (2), pp.11. ⟨10.1080/00207160.2013.778400⟩. ⟨hal-00767161⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitali Vougalter, Vitaly Volpert. Solvability Relations For Some Diffusion Equations With Convection Terms. Discontinuity, Nonlinearity, and Complexity, 2014, 3 (4), pp.457-465. ⟨hal-01097219⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert. Branching and aggregation in self-reproducing systems. ESAIM: Proceedings, 2014, 47, pp.116-129. ⟨10.1051/proc/201447007⟩. ⟨hal-01098162⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Narcisa Apreutesei, Vitaly Volpert. Properness and topological degree for nonlocal integro-differential systems. Topological Methods in Nonlinear Analysis, 2014, 43 (1), pp.215-229. ⟨hal-01096780⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Patrice Nony, Polina Kurbatova, Agathe Bajard, Salma Malik, Charlotte Castellan, et al.. A methodological framework for drug development in rare diseases. Orphanet Journal of Rare Diseases, 2014, 9 (164), pp.1-10. ⟨10.1186/s13023-014-0164-y⟩. ⟨hal-01097224⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Marine Jacquier, Fabien Crauste, Christophe Soulage, Hédi A Soula. A predictive model of the dynamics of body weight and food intake in rats submitted to caloric restrictions.. PLoS ONE, 2014, 9 (6), pp.e100073. ⟨10.1371/journal.pone.0100073⟩. ⟨hal-01017357⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Mohamed Alia, Khalil Ezzinbi. Functional differential equations with unbounded delay in extrapolation spaces. Electronic Journal of Differential Equations, 2014, 2014, pp.1 – 16. ⟨hal-01096950⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Vitali Vougalter. Solvability conditions for some non Fredholm operators in a layer in four dimensions. Discontinuity, Nonlinearity, and Complexity, 2014, 3 (1), pp.59-71. ⟨hal-01096774⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Nathalie Eymard, Nikolai Bessonov, Olivier Gandrillon, Koury Mark, Vitaly Volpert. The role of spatial organization of cells in erythropoiesis. Journal of Mathematical Biology, 2014, pp.1-29. ⟨10.1007/s00285-014-0758-y⟩. ⟨hal-01096794⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Laurent Desvillettes, Thomas Lepoutre, Ayman Moussa. Entropy, Duality and Cross Diffusion. SIAM Journal on Mathematical Analysis, 2014, 46 (1), pp.820-853. ⟨10.1137/130908701⟩. ⟨hal-00785379⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Vitali Vougalter. Existence of stationary pulses for nonlocal reaction-diffusion equations. Documenta Mathematica, 2014, 19, pp.1141-1153. ⟨hal-01097153⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Oscar Angulo, Catherine Marquet, Leila Sebaa. A mathematical model of multistage hematopoietic cell lineages. Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, 2014, 19 (1), pp.26. ⟨10.3934/dcdsb.2014.19.1⟩. ⟨hal-00993751⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Khalil Ezzinbi, Catherine Marquet. Ergodic and weighted pseudo-almost periodic solutions for partial functional differential equations in fading memory spaces. Journal of Applied Mathematics and Computing, 2014, 44 (1-2), pp.19. ⟨10.1007/s12190-013-0686-9⟩. ⟨hal-00846883⟩
Accès au bibtex

Communication dans un congrès

ref_biblio: Mansour Dia Ben, Ababacar Diagne, Leon Matar Tine. A generalized finite difference method for the 2-D nonlinear shallow water equations. CARI’14 Colloque Africain sur la Recherche en Informatique et en Mathématiques Appliquées., Oct 2014, Saint-Louis, Senegal. ⟨hal-01104586⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Anass Bouchnita, Nathalie Eymard, Mark Koury, Vitaly Volpert. Initiation of erythropoiesis by BFU-E cells. Mathematical biology in life sciences, Sep 2014, Sidi bel Abbes, Algeria. ⟨10.1051/itmconf/20150401002⟩. ⟨hal-01238490⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Léon Matar Tine. Inverse problem for cell division rate in population dynamics. Workshop on Mathematics for Life Sciences (WMLS 2014), Sep 2014, Sidi Bel-Abbes, Algeria. pp.10, ⟨10.1051/itmconf/20150401003⟩. ⟨hal-01253536⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Chapitre d’ouvrage

ref_biblio: Laurent Pujo-Menjouet. Théorie sur l’apparition de structures de Turing pour les biologistes ou éclaircissements sur deux intuitions ingénieuses. Modéliser & simuler – Epistémologies et pratiques de la modélisation et de la simulation – Tome 2, 2, Éditions Matériologiques, pp.525, 2014, Modélisations, simulations, systèmes complexes, 978-2-919694-72-3. ⟨hal-01102076⟩
Accès au bibtex

HDR

ref_biblio: Fabien Crauste. Equations à Retard et Modèles de Dynamiques de Populations Cellulaires. Mathématiques générales [math.GM]. Université Claude Bernard Lyon 1, 2014. ⟨tel-01092352⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Ouvrages

ref_biblio: Vitaly Volpert. Elliptic Partial Differential Equations Volume 2: Reaction-Diffusion Equations. Birkhauser, 2014, ISBN: 978-3-0348-0812-5. ⟨hal-01097226⟩
Accès au bibtex

Thèse

ref_biblio: Alen Tosenberger. Blood flow modelling and applications to blood coagulation and atherosclerosis. Mathematics [math]. Université Claude Bernard – Lyon 1 Institut Camille Jordan – CNRS UMR 5208, 2014. English. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-01101607⟩
Accès au texte intégral et bibtex

2013

Article dans une revue

ref_biblio: Mikael Rydén, Daniel P Andersson, Samuel Bernard, Kirsty Spalding, Peter Arner. Adipocyte triglyceride turnover and lipolysis in lean and overweight subjects.. Journal of Lipid Research, 2013, 54 (10), pp.2909-2913. ⟨10.1194/jlr.M040345⟩. ⟨hal-00867570⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Samuel Bernard. From Single-Scale to Multiscale Modelling in Biology. Acta Biotheoretica, 2013, 61 (3), pp.291-303. ⟨10.1007/s10441-013-9199-z⟩. ⟨hal-00867564⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Thomas Lepoutre, Salome Martinez. Steady state analysis for a relaxed cross diffusion model. Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series A, 2013, 34 (2), pp.613-633. ⟨10.3934/dcds.2014.34.613⟩. ⟨hal-00857467⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Vitali Vougalter. Solvability in the sense of sequence for some non-Fredholm elliptic problems. Discontinuity, Nonlinearity, and Complexity, 2013, in press. ⟨hal-00846862⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Narcisa Apreutesei, Alen Tosenberger. Existence of Reaction-Diffusion Waves with Nonlinear Boundary Conditions. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2013, 8 (4), pp.2-17. ⟨10.1051/mmnp/20138302⟩. ⟨hal-00846820⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Nikolai Bessonov, Victoria Mironova. Deformable cell model and its application to growth of plant meristem. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2013, 8 (3), pp.62-79. ⟨10.1051/mmnp/20138405⟩. ⟨hal-00846821⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Vitali Vougalter. Solvability in the sense of sequences to some non-Fredholm operators. Electronic Journal of Differential Equations, 2013, 2013 (160), pp.1-16. ⟨hal-00846784⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Narcisa Apreutesei, Vitaly Volpert. Reaction-diffusion waves with nonlinear boundary conditions. Networks and Heterogeneous Media, 2013, 8 (1), pp.23-35. ⟨10.3934/nhm.2013.8.23⟩. ⟨hal-00846563⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, A.G. Ramm. Convergence of time dependent Turing structure to a stationary solution. Acta Applicandae Mathematicae, 2013, 123 (1), pp.31-42. ⟨10.1007/s10440-012-9711-5⟩. ⟨hal-00846571⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Kirsty L Spalding, Olaf Bergmann, Kanar Alkass, Samuel Bernard, Mehran Salehpour, et al.. Dynamics of hippocampal neurogenesis in adult humans.. Cell, 2013, 153 (6), pp.1219-1227. ⟨10.1016/j.cell.2013.05.002⟩. ⟨hal-00839513⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Frédéric Thomas, Daniel Fisher, Philippe Fort, Jean-Pierre Marie, Simon Daoust, et al.. Applying ecological and evolutionary theory to cancer: a long and winding road. Evolutionary Applications, 2013, 6 (1), pp.1-10. ⟨10.1111/eva.12021⟩. ⟨halsde-00790602⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Kanar Alkass, Hisako Saitoh, Bruce A Buchholz, Samuel Bernard, Gunilla Holmlund, et al.. Analysis of radiocarbon, stable isotopes and DNA in teeth to facilitate identification of unknown decedents.. PLoS ONE, 2013, 8 (7), ⟨10.1371/journal.pone.0069597⟩. ⟨hal-00867568⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Chapitre d’ouvrage

ref_biblio: Vitaly Volpert, Nikolai Bessonov, Alen Tosenberger, Nathalie Eymard. Modele multi-echelle de la dynamique cellulaire. Le vivant discret et continu, Editions Materiologiques, in press, 2013. ⟨hal-00846865⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, N. Bessonov, Polina Kurbatova. Pattern Formation in Hybrid Models of Cell Population. Pattern Formation in Morphogenesis, Springer-Verlag, pp.107-119, 2013, Springer Proceedings in Mathematics, 978-3-642-20164-6. ⟨10.1007/978-3-642-20164-6_10⟩. ⟨hal-00846783⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Vitali Vougalter. Emergence and Propagation of Patterns in Nonlocal Reaction-Diffusion Equations Arising in the Theory of Speciation.. Dispersal, Individual Movement and Spatial Ecology, Springer-Verlag, pp.331-353, 2013, Lecture Notes in Mathematics, 978-3-642-35497-7. ⟨10.1007/978-3-642-35497-7_12⟩. ⟨hal-00846559⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Grigory Bordyugov, Pål O Westermark, Ana Korencic, Samuel Bernard, Hanspeter Herzel. Mathematical modeling in chronobiology. Achim Kramer and Martha Merrow. Circadian clocks, Springer, pp.335–357, 2013, ⟨10.1007/978-3-642-25950-0_14⟩. ⟨hal-00839517⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Samuel Bernard. Modélisation multi-échelles en biologie. Nicolas Glade and Angélique Stéphanou. Le vivant discret et continu, Éditions Matériologiques, pp.65-89, 2013, Science & Philosophie, 978-2-919694-23-5. ⟨hal-00920523⟩
Accès au bibtex

Pré-publication, Document de travail

ref_biblio: Karam Allali, Fouad Bikany, Ahmed Taik, Vitaly Volpert. Numerical Simulations of Heat ExplosionWith Convection In Porous Media. 2013. ⟨hal-00859414⟩
Accès au texte intégral et bibtex

2012

Article dans une revue

ref_biblio: Keith Frayn, Samuel Bernard, Kirsty Spalding, Peter Arner. Adipocyte triglyceride turnover is independently associated with atherogenic dyslipidemia.. Journal of the American Heart Association, 2012, 1 (6), pp.e003467. ⟨10.1161/JAHA.112.003467⟩. ⟨hal-00839514⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Alen Tosenberger, Fazly Ataullakhanov, N. Bessonov, Mikhail A. Panteleev, Alexey Tokarev, et al.. Modelling of thrombus growth and growth stop in flow by the method of dissipative particle dynamics.. Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling, 2012, 27 (5), pp.507-522. ⟨10.1515/rnam-2012-0029⟩. ⟨hal-00753089⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Nathalie Eymard, Polina Kurbatova, Vitaly Volpert. Mathematical modelling of erythropoiesis in vivo with multiple erythroblastic islands.. Applied Mathematics Letters, 2012, 25 (9), pp.1217-1221. ⟨10.1016/j.aml.2012.02.053⟩. ⟨hal-00753093⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Vitali Vougalter. Solvability Conditions for a Linearized Cahn-Hilliard Equation of Sixth Order.. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2012, 7 (2), pp.146–154. ⟨10.1051/mmnp/20127212⟩. ⟨hal-00753092⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: N. El Khatib, Stéphane Génieys, Bogdan Kazmierczak, Vitaly Volpert. Reaction-Diffusion Model of Atherosclerosis Development.. Journal of Mathematical Biology, 2012, 65 (2), pp.349-374. ⟨10.1007/s00285-011-0461-1⟩. ⟨hal-00753096⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Vitali Vougalter. Solvability conditions for some linear and nonlinear non-Fredholm elliptic problems.. Analysis and Mathematical Physics, 2012, 2, pp.473-496. ⟨10.1007/s13324-012-0046-1⟩. ⟨hal-00753099⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Vitali Vougalter. On the existence of stationary solutions for some systems of non-Fredholm integro-differential equations.. Discontinuity, Nonlinearity, and Complexity, 2012, 1 (2), pp.197-209. ⟨hal-00753090⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Narcisa Apreutesei. Existence of travelling waves for a class of integro-differential equations from population dynamics. International Electronic Journal of Pure and Applied Mathematics, 2012, 5 (2), pp.53-67. ⟨hal-00753095⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Vitali Vougalter. On the solvability conditions for the diffusion equation with convection terms.. Communications on Pure and Applied Mathematics, 2012, 11 (1), pp.365–373. ⟨hal-00753098⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: R. K. Upadhyay, Vitaly Volpert, N. K. Thakur. Propagation of Turing patterns in a plankton model.. Journal of Biological Dynamics, 2012, 6 (2), pp.524-538. ⟨10.1080/17513758.2012.655327⟩. ⟨hal-00753094⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Samuel Bernard. Né pour sentir [Born to smell].. Médecine/Sciences, 2012, 28 (11), pp.937-9. ⟨10.1051/medsci/20122811012⟩. ⟨hal-00767595⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Emmanuelle Terry, Jacqueline Marvel, Christophe Arpin, Olivier Gandrillon, Fabien Crauste. Mathematical model of the primary CD8 T cell immune response: stability analysis of a nonlinear age-structured system.. Journal of Mathematical Biology, 2012, 65, pp.263-291. ⟨10.1007/s00285-011-0459-8⟩. ⟨hal-00649219⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Philippe Michel, Tarik Touaoula. Asymptotic behavior for a class of the renewal nonlinear equation with diffusion. Mathematical Methods in the Applied Sciences, 2012, 36 (3), pp.323-335. ⟨10.1002/mma.2591⟩. ⟨hal-00785171⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Olaf Bergmann, Jakob Liebl, Samuel Bernard, Kanar Alkass, Maggie S y Yeung, et al.. The age of olfactory bulb neurons in humans.. Neuron, 2012, 74 (4), pp.634-639. ⟨10.1016/j.neuron.2012.03.030⟩. ⟨hal-00755464⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Ionel Sorin Ciuperca, Erwan Hingant, Liviu Iulian Palade, Laurent Pujo-Menjouet. Fragmentation and monomer lengthening of rod-like polymers, a relevant model for prion proliferation. Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, 2012, 17 (3), pp.775-799. ⟨10.3934/dcdsb.2012.17.775⟩. ⟨hal-00653362⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: S. Fischer, P. Kurbatova, N. Bessonov, Olivier Gandrillon, Vitaly Volpert, et al.. Modeling erythroblastic islands: using a hybrid model to assess the function of central macrophage.. Journal of Theoretical Biology, 2012, 298, pp.92-106. ⟨10.1016/j.jtbi.2012.01.002⟩. ⟨hal-00596682v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Polina Kurbatova, Grigory Panasenko, Vitaly Volpert. Asymptotic-numerical analysis of the diffusion- discrete absorption equation. Mathematical Methods in the Applied Sciences, 2012, 35 (4), pp.438-444. ⟨10.1002/mma.1572⟩. ⟨hal-00869285⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Alexey Tokarev, G. Sirakov, G. Panasenko, Vitaly Volpert, E. Schnol, et al.. Continuous Mathematical Model of Platelet Thrombus Formation in Blood Flow.. Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling, 2012, 27 (2), pp.192-212. ⟨10.1515/rnam-2012-0011⟩. ⟨hal-00753091⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Catherine Marquet. On the stability of hematopoietic model with feedback control. Comptes Rendus. Mathématique, 2012, 350 (3-4), pp.173-176. ⟨10.1016/j.crma.2012.01.014⟩. ⟨hal-00763154⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Olaf Bergmann, Sofia Zdunek, Jonas Frisén, Samuel Bernard, Henrik Druid, et al.. Cardiomyocyte renewal in humans.. Circulation Research, 2012, 110 (1), e17-8; author reply e19-21. ⟨10.1161/CIRCRESAHA.111.259598⟩. ⟨hal-00755465⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Raouf El Cheikh, Thomas Lepoutre, Samuel Bernard. Modeling Biological Rhythms in Cell Populations. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2012, 7 (6), pp.107–125. ⟨10.1051/mmnp/20127606⟩. ⟨hal-00847008⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Thomas Lepoutre, Michel Pierre, Guillaume Rolland. Global well-posedness of a conservative relaxed cross diffusion system.. SIAM Journal on Mathematical Analysis, 2012, 44 (3), pp.1674-1693. ⟨10.1137/110848839⟩. ⟨hal-00683006⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Khalil Ezzinbi, Catherine Marquet. Center manifolds for some partial functional differential equations with infinite delay in fading memory spaces. Journal of Concrete and Applicable Mathematics, 2012, 10 (3-4), pp.168-185. ⟨hal-00763166⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Fabien Crauste. Delay Differential Equations and Autonomous Oscillations in Hematopoietic Stem Cell Dynamics Modeling. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2012, 7 (6), pp.1-22. ⟨10.1051/mmnp/20127601⟩. ⟨hal-00766339⟩
Accès au bibtex

Communication dans un congrès

ref_biblio: Pierre-Nicolas Mougel, Christophe Rigotti, Olivier Gandrillon. Finding Collections of Protein Modules in Protein-Protein Interaction Networks. Bioinformatics and Computational Biology (BICoB), 2012, Las Vegas, United States. pp.216-222. ⟨hal-00758858⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Pierre-Nicolas Mougel, Christophe Rigotti, Olivier Gandrillon. Finding Collections of k-Clique Percolated Components in Attributed Graphs. Pacific-Asia Conference on Knowledge Discovery and Data Mining (PAKDD), 2012, Kuala Lumpur, Malaysia. pp.181–192. ⟨hal-00758843⟩
Accès au bibtex

Thèse

ref_biblio: Erwan Hingant. Contributions à la modélisation mathématique et numérique de problèmes issus de la biologie – Applications aux Prions et à la maladie d’Alzheimer. Equations aux dérivées partielles [math.AP]. Université Claude Bernard – Lyon I, 2012. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00763444⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mohammed Belkasmi. Contributions à la théorie des modèles positive.. Logique [math.LO]. Université Claude Bernard – Lyon I, 2012. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00733592⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Pré-publication, Document de travail

ref_biblio: Alen Tosenberger, Fazly Ataullakhanov, Nikolai Bessonov, Mikhail A. Panteleev, Alexey Tokarev, et al.. The role of platelets in blood coagulation during thrombus formation in flow. 2012. ⟨hal-00729046v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

2011

Article dans une revue

ref_biblio: Alen Tosenberger, Vsevolod Salnikov, Nikolai Bessonov, Evgeniya Babushkina, Vitaly Volpert. Particle Dynamics Methods of Blood Flow Simulations,. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2011, 6 (5), pp.320-332. ⟨10.1051/mmnp/20116512⟩. ⟨hal-00653688⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitali Vougalter, Vitaly Volpert. Solvability conditions for some non-Fredholm operators. Proceedings of the Edinburgh Mathematical Society, 2011, 54 (1), pp.249-271. ⟨10.1017/S0013091509000236⟩. ⟨hal-00653658⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitali Vougalter, Vitaly Volpert. On the existence of stationary solutions for some non-Fredholm integro-differential equations. Documenta Mathematica, 2011, 16, pp.561-580. ⟨hal-00653648⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Narcisa Apreutesei, Vitaly Volpert. Properness and Topological Degree for Nonlocal Reaction-Diffusion Operators. Abstract and Applied Analysis, 2011, pp.ID 629692. ⟨hal-00653656⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Arnaud Ducrot, Martine Marion, Vitaly Volpert. Spectrum of some integro-differential operators and stability of travelling waves. Nonlinear Analysis: Theory, Methods and Applications, 2011, 74 (13), pp.4455-4473. ⟨10.1016/j.na.2011.04.009⟩. ⟨hal-00653653⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Vitaly Volpert. Computational Algorithm for Some Problems with Variable Geometrical Structure. Lecture Notes in Computer Science, 2011, 6260/2011, pp.87-102. ⟨10.1007/978-3-642-16236-7_6⟩. ⟨hal-00653652⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Peter Arner, Samuel Bernard, Mehran Salehpour, Göran Possnert, Jakob Liebl, et al.. Dynamics of human adipose lipid turnover in health and metabolic disease.. Nature, 2011, 478 (7367), pp.110-3. ⟨10.1038/nature10426⟩. ⟨hal-00649210⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Maria-Teresa Alvarez-Martinez, Pascaline Fontes, Viviana Zomosa-Signoret, Jacques-Damien Arnaud, Erwan Hingant, et al.. Dynamics of polymerization shed light on the mechanisms that lead to multiple amyloid structures of the prion protein.. BBA – Biochimica et Biophysica Acta, 2011, 1814 (10), pp.1305-17. ⟨10.1016/j.bbapap.2011.05.016⟩. ⟨hal-00653368⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: C. Mejia-Pous, F. Damiola, Olivier Gandrillon. Cholesterol synthesis-related enzyme oxidosqualene cyclase is required to maintain self-renewal in primary erythroid progenitors.. Cell Proliferation, 2011, 44 (5), pp.441-52. ⟨10.1111/j.1365-2184.2011.00771.x⟩. ⟨hal-00652350⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Anuradha Chauhan, Stephan Lorenzen, Hanspeter Herzel, Samuel Bernard. Regulation of mammalian cell cycle progression in the regenerating liver.. Journal of Theoretical Biology, 2011, 283 (1), pp.103-12. ⟨10.1016/j.jtbi.2011.05.026⟩. ⟨hal-00649211⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Fabien Crauste. A review on local asymptotic stability analysis for mathematical models of hematopoiesis with delay and delay-dependent coefficients. Annals of the Tiberiu Popoviciu Seminar of functional equations, approximation and convexity, 2011, 9, pp.121-143. ⟨hal-00750271⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Eric Bertin, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon, Sebastian Grauwin, Pablo Jensen, et al.. Les complexités : point de vue d’un institut des systèmes complexes. Hermès, La Revue – Cognition, communication, politique, 2011, 2 (60), pp.145-150. ⟨10.4267/2042/45459⟩. ⟨hal-00744520⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Olaf Bergmann, Sofia Zdunek, Kanar Alkass, Henrik Druid, Samuel Bernard, et al.. Identification of cardiomyocyte nuclei and assessment of ploidy for the analysis of cell turnover.. Experimental Cell Research, 2011, 317 (2), pp.188-94. ⟨10.1016/j.yexcr.2010.08.017⟩. ⟨hal-00542527⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Khalil Ezzinbi, Mohamed Alia. Extrapolation Spaces and Partial Neutral Functional Differential Equations with infinite delay. Differential and integral equations, 2011. ⟨inria-00554435⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Michael C. Mackey, Marta Tyran-Kamińska, Romain Yvinec. Molecular distributions in gene regulatory dynamics. Journal of Theoretical Biology, 2011, 274 (1), pp.84–96. ⟨10.1016/j.jtbi.2011.01.020⟩. ⟨hal-00651585⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Fabien Crauste, Vitaly Volpert. Modelling of Plant Growth with Apical or Basal Meristem. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2011, 6 (2), pp.107-132. ⟨10.1051/mmnp/20116204⟩. ⟨hal-00649218⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Polina Kurbatova, Samuel Bernard, Nikolai Bessonov, Fabien Crauste, Ivan Demin, et al.. HYBRID MODEL OF ERYTHROPOIESIS AND LEUKEMIA TREATMENT WITH CYTOSINE ARABINOSIDE. SIAM Journal on Applied Mathematics, 2011, 71 (6), pp.2246-2268. ⟨10.1137/100815517⟩. ⟨hal-00538496v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Fabien Crauste, Stephan Fisher, Polina Kurbatova, Vitaly Volpert. Application of Hybrid Models to Blood Cell Production in the Bone Marrow. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2011, 6 (7), pp.2-12. ⟨10.1051/mmnp/20116701⟩. ⟨hal-00649217⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Communication dans un congrès

ref_biblio: Pierre-Nicolas Mougel, Marc Plantevit, Christophe Rigotti, Olivier Gandrillon, Jean-François Boulicaut. Extraction sous Contraintes d’Ensembles de Cliques Homogènes. 11eme Conference Francophone sur l’Extraction et la Gestion des Connaissances (EGC’11), 2011, Brest, France. pp.1-12. ⟨hal-00744808⟩
Accès au bibtex

Chapitre d’ouvrage

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Ivan Demin, Polina Kurbatova, Laurent Pujo-Menjouet, Vitaly Volpert. Multi-Agent Systems and Blood Cell Formation. InTech. Multi-Agent Systems – Modeling, Interactions, Simulations and Case Studies, InTech, pp.502, 2011, Robotics, 978-953-307-176-3. ⟨10.5772/1936⟩. ⟨hal-00858507⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Autre publication scientifique

ref_biblio: Romain Yvinec, Alexandre F. Ramos. On the bursting of gene products. 2011. ⟨hal-00651588⟩
Accès au texte intégral et bibtex

Ouvrages

ref_biblio: Vitaly Volpert. Elliptic Partial Differential Equations. Volume I. Fredholm theory of elliptic problems in unbounded domains. birkhauser, pp.655, 2011. ⟨hal-00653777⟩
Accès au bibtex

Pré-publication, Document de travail

ref_biblio: Mohammed Belkasmi. Positive model theory and amalgamations. 2011. ⟨hal-00746275⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Erwan Hingant. A numerical scheme for rod-like polymers with fragmentation and monomers lengthening. 2011. ⟨hal-00653394⟩
Accès au texte intégral et bibtex

2010

Article dans une revue

ref_biblio: Corinne Royer, Jérôme Briolay, Annie Garel, Patrick Brouilly, Shun-Ichi Sasanuma, et al.. Novel genes differentially expressed between posterior and median silk gland identified by SAGE-aided transcriptome analysis.. Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2010, 41 (2), epub ahead of print. ⟨10.1016/j.ibmb.2010.11.003⟩. ⟨hal-00542448⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Anh Thu Nguyen-Lefebvre, Sandrine Gonin-Giraud, Alexander Scherl, Patrizia Arboit, Laure Granger, et al.. Identification of human, rat and chicken ribosomal proteins by a combination of two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis and mass spectrometry.. Journal of Proteomics, 2010, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.jprot.2010.10.007⟩. ⟨hal-00542454⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Vitaly Volpert, Narcisa Apreutesei, Nikolai Bessonov, Vitali Vougalter. Spatial structures and generalized travelling waves for an integro-differential equation. Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, 2010, 13 (3), pp.537-557. ⟨10.3934/dcdsb.2010.13.537⟩. ⟨hal-00547574⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Ivan Demin, Vitaly Volpert. Existence of Waves for a Nonlocal Reaction-Diffusion Equation. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2010, 5 (5), pp.80-101. ⟨10.1051/mmnp/20105506⟩. ⟨hal-00547724⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Vitali Vougalter, Vitaly Volpert. On the solvability conditions for some non-Fredholm operators. International Journal of Pure and Applied Mathematics, 2010, 60 (2), pp.169-191. ⟨hal-00547729⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: K. Allali, F. Bikany, A. Taik, Vitaly Volpert. Linear stability analysis of reaction fronts propagation in liquids with vibrations. International Electronic Journal of Pure and Applied Mathematics, 2010, 1 (2), pp.196-215. ⟨hal-00547725⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Fabien Crauste, Ivan Demin, Olivier Gandrillon, Vitaly Volpert. Mathematical study of feedback control roles and relevance in stress erythropoiesis.. Journal of Theoretical Biology, 2010, 263 (3), pp.303-16. ⟨10.1016/j.jtbi.2009.12.026⟩. ⟨hal-00542457⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Erik Arner, Pål O Westermark, Kirsty L Spalding, Tom Britton, Mikael Rydén, et al.. Adipocyte turnover: relevance to human adipose tissue morphology.. Diabetes, 2010, 59 (1), pp.105-9. ⟨10.2337/db09-0942⟩. ⟨hal-00542528⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Fabien Crauste, Catherine Marquet. Asymptotic behavior and stability switch for a mature-immature model of cell differentiation. Nonlinear Analysis: Real World Applications, 2010, 11 (4), pp.2913-2929. ⟨10.1016/j.nonrwa.2009.11.001⟩. ⟨hal-00542644⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Fabien Crauste, Hassan Hbid, Redouane Qesmi. Stability and Hopf bifurcation for a cell population model with state-dependent delay. SIAM Journal on Applied Mathematics, 2010, 70 (5), pp.1611-1633. ⟨10.1137/080742713⟩. ⟨hal-00542655⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Samuel Bernard, Branka Cajavec Bernard, Francis Lévi, Hanspeter Herzel. Tumor growth rate determines the timing of optimal chronomodulated treatment schedules. PLoS Computational Biology, 2010, 6 (3), pp.e1000712. ⟨10.1371/journal.pcbi.1000712⟩. ⟨hal-00470302⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Ivan Demin, Fabien Crauste, Olivier Gandrillon, Vitaly Volpert. A multi-scale model of erythropoiesis. Journal of Biological Dynamics, 2010, 4 (1), pp.59-70. ⟨10.1080/17513750902777642⟩. ⟨hal-00542669⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Samuel Bernard, Jonas Frisén, Kirsty L. Spalding. A mathematical model for the interpretation of nuclear bomb test derived 14C incorporation in biological systems. Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section B: Beam Interactions with Materials and Atoms, 2010, 268 (7-8), pp.1295-1298. ⟨10.1016/j.nimb.2009.10.156⟩. ⟨hal-00544517v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Fabien Crauste, Abderrahim El Abdllaoui. Boundedness and Lyapunov Function for a Nonlinear System of Hematopoietic Stem Cell Dynamics. Comptes Rendus. Mathématique, 2010, 348 (7-8), pp.373-377. ⟨10.1016/j.crma.2010.02.018⟩. ⟨hal-00542477⟩
Accès au bibtex

Chapitre d’ouvrage

ref_biblio: Fabien Crauste. Stability and Hopf bifurcation for a first-order linear delay differential equation with distributed delay. Complex Time Delay Systems (Ed. F. Atay), Springer, pp.320, 2010, ⟨10.1007/978-3-642-02329-3_8⟩. ⟨hal-00542651⟩
Accès au bibtex

2009

Article dans une revue

ref_biblio: Marie Doumic, Thierry Goudon, Thomas Lepoutre. Scaling limit of a discrete prion dynamics model. Communications in Mathematical Sciences, 2009, 7 (4), ⟨10.4310/CMS.2009.v7.n4.a3⟩. ⟨inria-00403914⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nader El Khatib, Stéphane Génieys, Abdelmalek Zine, Vitaly Volpert. Non-Newtonian effects in a fluid-structure interaction model for atherosclerosis. Journal of Applied Mechanics and Technical Physics, 2009, 50 (1), pp.55-64. ⟨hal-00937323⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Nikolai Bessonov, Fabien Crauste, Ivan Demin, Vitaly Volpert. Dynamics of erythroid progenitors and erythroleukemia. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2009, Cancer modelling (Part 2), 4 (3), pp.210-232. ⟨10.1051/mmnp/20094309⟩. ⟨hal-00542660⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Fabien Crauste, Mostafa Adimy. Mathematical model of hematopoiesis dynamics with growth factor-dependent apoptosis and proliferation regulation. Mathematical and Computer Modelling, 2009, 49, pp.2128-2137. ⟨10.1016/j.mcm.2008.07.014⟩. ⟨hal-00542665⟩
Accès au bibtex

2008

Article dans une revue

ref_biblio: Mostafa Adimy, Fabien Crauste, Abderrahim El Abdllaoui. Discrete maturity-structured model of cell differentiation with applications to acute myelogenous leukemia. Journal of Biological Systems, 2008, 16 (3), pp.395-424. ⟨10.1142/S0218339008002599⟩. ⟨hal-00750276⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Samuel Bernard, Jean Clairambault, Fabien Crauste, Stéphane Génieys, et al.. Modélisation de la dynamique de l’hématopoïèse normale et pathologique. Hématologie, 2008, 14 (5), pp.339-350. ⟨10.1684/hma.2008.0282⟩. ⟨hal-00750278⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Mostafa Adimy, Oscar Angulo, Fabien Crauste, Juan Carlos Lopez-Marcos. Numerical integration of a mathematical model of hematopoietic stem cell dynamics. Computers & Mathematics with Applications, 2008, 56, pp.594-606. ⟨10.1016/j.camwa.2008.01.003⟩. ⟨hal-00750283⟩
Accès au bibtex

2006

Article dans une revue

ref_biblio: Mostafa Adimy, Fabien Crauste, Abderrahim El Abdllaoui. Asymptotic Behavior of a Discrete Maturity Structured System of Hematopoietic Stem Cells Dynamics with Several Delays. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2006, 1 (2), pp.1-22. ⟨10.1051/mmnp:2008001⟩. ⟨hal-00750285⟩
Accès au bibtex