Publications

Publications HAL du labo/EPI 106416

2017

Article dans une revue

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Uran Ferizi, Benoit Scherrer, Torben Schneider, Mohammad Alipoor, Odin Eufracio, et al.. Diffusion MRI microstructure models with in vivo human brain Connectom data: results from a multi-group comparison. NMR in Biomedicine, Wiley, 2017, 30 (9), 〈http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/nbm.v30.9/issuetoc;jsessionid=66696BDF53179EFAF4B32F4EDAF57A5C.f02t03〉. 〈10.1002/nbm.3734〉. 〈hal-01500472〉
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Sebastian Hitziger, Maureen Clerc, Sandrine Saillet, Christian Bénar, Théodore Papadopoulo. Adaptive Waveform Learning: A Framework for Modeling Variability in Neurophysiological Signals. IEEE Transactions on Signal Processing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, 65, pp.4324 – 4338. 〈10.1109/TSP.2017.2698415〉. 〈hal-01548428〉
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Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Marsel Mano, Elise Bannier, Fabien Lotte, et al.. Unimodal Versus Bimodal EEG-fMRI Neurofeedback of a Motor Imagery Task. Frontiers in Human Neuroscience, Frontiers, 2017, 11, 〈10.3389/fnhum.2017.00193〉. 〈hal-01519755〉
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Guillermo Gallardo, William Wells Iii, Rachid Deriche, Demian Wassermann. Groupwise structural parcellation of the whole cortex: A logistic random effects model based approach. NeuroImage, Elsevier, 2017, 〈10.1016/j.neuroimage.2017.01.070〉. 〈hal-01426625〉
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Violaine Guy, M. H. Soriani, Mariane Bruno, Théodore Papadopoulo, Claude Desnuelle, et al.. Brain computer interface with P300-Speller: usability for disabled patients with Amyotrophic Lateral Sclerosis.. Annals of Physical and Rehabilitation Medicine, Elsevier Masson, 2017. 〈hal-01562276〉
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Isaiah Norton, Ibn Essayed, Fan Zhang, Sonia Pujol, Alex Yarmarkovich, et al.. SlicerDMRI: Open Source Diffusion MRI Software for Brain Cancer Research. Cancer Research, American Association for Cancer Research, 2017. 〈hal-01564088〉
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Gabriel Girard, Alessandro Daducci, Laurent Petit, Jean-Philippe Thiran, Kevin Whittingstall, et al.. AxTract: Toward Microstructure Informed Tractography. Human Brain Mapping, Wiley, 2017, 〈10.1002/hbm.23741〉. 〈hal-01564041〉
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Rutger Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stephane Lehericy, et al.. Non-Parametric GraphNet-Regularized Representation of dMRI in Space and Time. Medical Image Analysis, Elsevier, 2017, 〈10.1016/j.media.2017.09.002〉. 〈hal-01578296〉
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Marco Pizzolato, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Perfusion deconvolution in DSC-MRI with dispersion-compliant bases. Medical Image Analysis, Elsevier, 2017, 36, pp.197 – 215. 〈10.1016/j.media.2016.12.001〉. 〈hal-01536292〉
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Communication dans un congrès

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Nathalie T. H. Gayraud, Alain Rakotomamonjy, Maureen Clerc. Optimal Transport Applied to Transfer Learning For P300 Detection. BCI 2017 – 7th Graz Brain-Computer Interface Conference, Sep 2017, Graz, Austria. pp.6. 〈hal-01556603〉
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Samuel Deslauriers-Gauthier, Jean-Marc Lina, Russell Butler, Pierre-Michel Bernier, Kevin Whittingstall, et al.. Inference and Visualization of Information Flow in the Visual Pathway using dMRI and EEG. MICCAI 2017 Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2017, Québec, Canada. 〈http://www.miccai2017.org/〉. 〈hal-01556352〉
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Patryk Filipiak, Rutger Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, et al.. Spatio-Temporal dMRI Acquisition Design: Reducing the Number of $q\tau$ Samples Through a Relaxed Probabilistic Model. MICCAI 2017 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI 2017), Sep 2017, Québec City, Canada. 〈hal-01562617v3〉
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Christos Papageorgakis, Sebastian Hitziger, Théodore Papadopoulo. Dictionary Learning for Multidimensional Data. Proceedings of GRETSI 2017, Sep 2017, Juan-les-Pins, France. 〈http://gretsi.fr/colloque2017/2016/10/bienvenue-au-gretsi-2017/〉. 〈hal-01575263〉
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Kostiantyn Maksymenko, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc. A fast EEG forward problem approximation method and its application to tissue conductivity estimation. International Conference on Basic and Clinical Multimodal Imaging, Aug 2017, Bern, Switzerland. 〈hal-01563293〉
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Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Emmanuel Olivi, Théodore Papadopoulo. OpenMEEG software for forward problems handling non-nested geometries. BaCI Conference 2017: International Conference on Basic and Clinical Multimodal Imaging, Aug 2017, Bern, Switzerland. 2017. 〈hal-01581710〉
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Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo. Spatial regularization based on dMRI to solve EEG/MEG inverse problem. EMBC 2017 – 39th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society , Jul 2017, Jeju, South Korea. 〈hal-01533396〉
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Lang Chen, Demian Wassermann, John Kochalka, Vinod Menon. Concordance between white-matter pathways and functional circuits linking the VWFA and IPS. Organisation for the Human Brain Mapping, Jul 2017, Vancouver, Canada. Organisation for Human Brain Mapping, 2017. 〈hal-01558273〉
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Guillermo Gallardo, Demian Wassermann, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux, Samuel Deslauriers-Gauthier. Information Flow in the White Matter During a Motor Task: A Structural Connectivity Driven Approach. OHBM 2017 Organization for Human Brain Mapping Annual Meeting, Jun 2017, Vancouver, Canada. 〈hal-01534978〉
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Guillermo Gallardo, Rachid Deriche, Demian Wassermann. A Novel Parcellation of Human Cerebral Cortex based on Extrinsic Connectivity. Organization for Human Brain Mapping 2017 Annual Meeting, Jun 2017, Vancouver, Canada. 2017. 〈hal-01533516〉
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Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo. Large brain effective network from EEG/MEG data and dMR information. PRNI 2017 – 7th International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2017, Toronto, Canada. 〈hal-01533445〉
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Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Christos Papageorgakis. Inverse conductivity recovery problem in a spherical geometry from EEG data: uniqueness, reconstruction and stability results. TAMTAM 2017 – 8ème colloque, Tendances dans les Applications Mathématiques en Tunisie Algérie Maroc, May 2017, Hammamet, Tunisia. pp.1, 〈http://tamtam2017.enit-lr.tn/registration.html〉. 〈hal-01526931〉
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Rutger Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stephane Lehericy, et al.. Multi-Spherical Diffusion MRI: An in-vivo Test- Retest Study of Time-Dependent q-space Indices. ISMRM: 25th Annual Meeting & Exhibition, Apr 2017, Honolulu, United States. 〈hal-01468214〉
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Abib O. Y. Alimi, Marco Pizzolato, Rutger Fick, Rachid Deriche. Solving the Inclination Sign Ambiguity in Three Dimensional Polarized Light Imaging with a PDE-Based Method. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI2017), Apr 2017, Melbourne, Australia. 〈hal-01533363〉
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Rutger Fick, Neda Sepasian, Marco Pizzolato, Andrada Ianus, Rachid Deriche. Assessing the Feasibility of Estimating Axon Diameter using Diffusion Models and Machine Learning. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2017, Melbourne, Australia. 〈hal-01451664〉
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Nahuel Lascano, Guillermo Gallardo, Rachid Deriche, Dorian Mazauric, Demian Wassermann. Extracting the Groupwise Core Structural Connectivity Network: Bridging Statistical and Graph-Theoretical Approaches. Information Processing in Medical Imaging, 2017, Boone, United States. 〈hal-01426870v3〉
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Poster

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Anne-Charlotte Philippe, Sophie Lavault, Rutger Fick, Demian Wassermann, Romain Valabregue, et al.. Brain correlates of apathy in Kleine Levin syndrome: a mean apparent propagator study. International Symposium for Magnetic Resonance in Medicine, May 2017, Honolulu, United States. 〈hal-01558278〉
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Thèse

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Kai Dang. Electrical conduction models for cochlear implant stimulation. Other. Université Côte d’Azur, 2017. English. 〈NNT : 2017AZUR4043〉. 〈tel-01562277v2〉
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Brahim Belaoucha. Using diffusion MR information to reconstruct networks of brain activations from MEG and EEG measurements. Other. Université Côte d’Azur, 2017. English. 〈NNT : 2017AZUR4027〉. 〈tel-01534876v2〉
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Marco Pizzolato. Computational Diffusion & Perfusion MRI in Brain Imaging. Signal and Image Processing. Inria Sophia Antipolis; Universite Nice Cote d’Azur, 2017. English. 〈tel-01536335〉
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Rutger Fick. Advanced dMRI signal modeling for tissue microstructure characterization. Other. Université Côte d’Azur, 2017. English. 〈NNT : 2017AZUR4006〉. 〈tel-01534104v2〉
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Pré-publication, Document de travail

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Paul Görlach, Evelyne Hubert, Théo Papadopoulo. Rational invariants of ternary forms under the orthogonal group. 2017. 〈hal-01570853v2〉
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Rutger Fick, Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Rachid Deriche. Diffusion MRI Anisotropy: Modeling, Analysis and Interpretation. 2017. 〈hal-01468675〉
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2016

Article dans une revue

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Rutger Fick, Demian Wassermann, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche. MAPL: Tissue Microstructure Estimation Using Laplacian-Regularized MAP-MRI and its Application to HCP Data. NeuroImage, Elsevier, 2016, 134, pp.365-385. 〈10.1016/j.neuroimage.2016.03.046〉. 〈hal-01291929〉
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Rachid Deriche. Computational Brain Connectivity Mapping: A Core Health and Scientific Challenge. Medical Image Analysis, Elsevier, 2016, 〈http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1361841516300792〉. 〈10.1016/j.media.2016.06.003〉. 〈hal-01335669〉
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Saugat Bhattacharyya, Maureen Clerc, Mitsuhiro Hayashibe. A study on the effect of electrical stimulation as a user stimuli for motor imagery classification in Brain-Machine Interface. European Journal of Translational Myology, PAGEPress®, 2016, 26 (2), pp.165-168. 〈10.4081/ejtm.2016.6041〉. 〈lirmm-01402537〉
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Sandrine Saillet, Pascale P. Quilichini, Antoine Ghestem, Bernard Giusiano, Anton I. Ivanov, et al.. Interneurons contribute to the hemodynamic/metabolic response to epileptiform discharges. Journal of Neurophysiology, American Physiological Society, 2016, 115 (3), pp.1157-1169. 〈10.1152/jn.00994.2014〉. 〈hal-01431280〉
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A. Pascarella, C. Todaro, Maureen Clerc, T. Serre, M. Piana. Source modeling of ElectroCorticoGraphy (ECoG) data: Stability analysis and spatial filtering. Journal of Neuroscience Methods, Elsevier, 2016, 〈10.1016/j.jneumeth.2016.02.012〉. 〈hal-01278377〉
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Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. A survey of current trends in diffusion MRI for structural brain connectivity. Journal of Neural Engineering, IOP Publishing, 2016, 13 (1), pp.011001. 〈10.1088/1741-2560/13/1/011001〉. 〈hal-01293828〉
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Demian Wassermann, Nikos Makris, Yogesh Rathi, Martha Shenton, Ron Kikinis, et al.. The white matter query language: a novel approach for describing human white matter anatomy. Brain Structure and Function, Springer Verlag, 2016, 〈10.1007/s00429-015-1179-4〉. 〈hal-01247061〉
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Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Christos Papageorgakis. Uniqueness result for an inverse conductivity recovery problem with application to EEG. Rendiconti dell’Istituto di Matematica dell’Università di Trieste. An International Journal of Mathematics, 2016, 48. 〈hal-01303640v2〉
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Communication dans un congrès

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Rutger Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stephane Lehericy, et al.. Multi-Spherical Diffusion MRI: Exploring Diffusion Time Using Signal Sparsity. MICCAI 2016 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI’16), Oct 2016, Athènes, Greece. 〈http://cmic.cs.ucl.ac.uk/cdmri/〉. 〈hal-01354985〉
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Rutger Fick, Madelaine Daianu, Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Russel E. Jacobs, et al.. Comparison of Biomarkers in Transgenic Alzheimer Rats Using Multi-shell Diffusion MRI. MICCAI 2016 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI’16), Oct 2016, Athènes, Greece. 〈http://cmic.cs.ucl.ac.uk/cdmri/〉. 〈hal-01354981〉
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Guillermo Gallardo, Rutger Fick, William Wells Iii, Rachid Deriche, Demian Wassermann. Groupwise Structural Parcellation of the Cortex: A Sound Approach Based on Logistic Models. CDMRI 2016, Oct 2016, Athens, Greece. Computational Diffusion MRI: MICCAI Workshop, Athens, Greece, October 2016, 〈10.1007/978-3-319-54130-3_8〉. 〈hal-01358436〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01358436/file/Gallardo.pdf BibTex
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Marco Pizzolato, Rutger Fick, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Noise Floor Removal via Phase Correction of Complex Diffusion-Weighted Images: Influence on DTI and q-space Metrics. Computational Diffusion MRI, Oct 2016, Athens, Greece. Computational Diffusion MRI 2016. 〈hal-01358770〉
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Saugat Bhattacharyya, Maureen Clerc, Mitsuhiro Hayashibe. A Study on the Effect of Electrical Stimulation During Motor Imagery Learning in Brain-Computer Interfacing. SMC: Systems, Man, and Cybernetics, Oct 2016, Budapest, Hungary. IEEE International Conference on Systems, Man, and Cybernetics, 2016. 〈hal-01402794〉
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Nathalie Gayraud, Nathanael Foy, Maureen Clerc. A Separability Marker Based on High-Dimensional Statistics for Classification Confidence Assessment. IEEE International Conference on Systems, Man, and Cybernetics , Oct 2016, Budapest, Hungary. 〈http://smc2016.org/〉. 〈hal-01407759〉
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https://hal.inria.fr/hal-01407759/file/SMC_gayraud_foy_clerc.pdf BibTex
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Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo. Iterative two-stage approach to estimate sources and their interactions . 20th International Conference on Biomagnetism (BIOMAG2016), Oct 2016, Seoul, South Korea. 〈hal-01377967〉
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Théo Papadopoulo. Modelling thin tissue compartiments using the immersed FEM (continuous Galerkin). Biomag 2016 – 20th International Conference on Biomagnetism, Oct 2016, Seoul, South Korea. 2016, 〈http://www.biomag2016.org/welcome.php〉. 〈hal-01412820〉
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Gabriel Girard, Alessandro Daducci, Laurent Petit, Jean-Philippe Thiran, Kevin Whittingstall, et al.. Reducing Invalid Connections with Microstructure-Driven Tractography. ISMRM workshops: Breaking the Barriers of Diffusion MRI , Sep 2016, Lisbonne, Portugal. 〈hal-01408737〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01408737/file/girard-etal-ismrm-diffusion-workshop16.pdf BibTex
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Demian Wassermann, Dorian Mazauric, Guillermo Gallardo-Diez, Rachid Deriche. Extracting the Core Structural Connectivity Network: Guaranteeing Network Connectedness Through a Graph-Theoretical Approach. MICCAI 2016, Sep 2016, Athens, Greece. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention — MICCAI, 2016. 〈hal-01333301v2〉
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Brahim Belaoucha, Mouloud Kachouane, Théodore Papadopoulo. Multivariate Autoregressive Model Constrained by Anatomical Connectivity to Reconstruct Focal Sources. 2016 38th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC), Aug 2016, Orlando, United States. 2016. 〈hal-01357167〉
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Thinhinane Megherbi, Gabriel Girard, Maxime Descoteaux, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. Evaluation des méthodes d’extraction des orientations locales des faisceaux de fibres par analyse quantitative de la connectivité. Reconnaissance des Formes et l’Intelligence Artificielle (RFIA’16) , Jun 2016, Clermont-Ferrand, France. 〈hal-01354106〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01354106/file/IBM02.pdf BibTex
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Gabriel Girard, Alessandro Daducci, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Demian Wassermann, et al.. Microstructure ­driven tractography in the human brain . Organization for Human Brain Mapping (OHBM)., Jun 2016, Geneva, Switzerland. 2016, Proceedings of: Human Brain Mapping (HBM). 〈hal-01408727〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01408727/file/girard-etal-hbm16.pdf BibTex
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Guillermo Gallardo, William Wells Ill, Rachid Deriche, Demian Wassermann. Efficient Population-Representative Whole-Cortex Parcellation Based on Tractography. Organization for Human Brain Mapping 2016 Annual Meeting, Jun 2016, Genève, Switzerland. 〈http://www.humanbrainmapping.org/i4a/pages/index.cfm?pageID=3662〉. 〈hal-01408881v2〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01408881/file/journal.pdf BibTex
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Kai Dang, Pierre Stahl, Clair Vandersteen, Nicolas Guevara, Dan Gnansia, et al.. Evaluation of the current distribution of the hybrid common ground stimulation in cochlear implants. 9th International Symposium on Objective Measures in Auditory Implants (OMAI), Jun 2016, Szeged, Hungary. 〈hal-01377653〉
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https://hal.inria.fr/hal-01377653/file/OMAI_2016_KD.pdf BibTex
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Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Christos Papageorgakis. On some inverse conductivity recovery problem in a sphere: Uniqueness and reconstruction results with applications to EEG. Problèmes Inverses, Contrôle et Optimisation de Formes (PICOF), Jun 2016, Autrans, France. 〈hal-01410030〉
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Cecilia Lindig-León, Nathalie Gayraud, Laurent Bougrain, Maureen Clerc. Comparison of Hierarchical and Non-Hierarchical Classification for Motor Imagery Based BCI Systems. The Sixth International Brain-Computer Interfaces Meeting, May 2016, Pacific Groove, United States. 〈http://bcisociety.org/meetings/bci-meeting-2016-welcome/〉. 〈hal-01287636〉
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https://hal.inria.fr/hal-01287636/file/Lindig_Gayraud-BCI16-HierarchicalClassification.pdf BibTex
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Marco Pizzolato, Rutger Fick, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Improved Vascular Transport Function Characterization in DSC-MRI via Deconvolution with Dispersion-Compliant Bases. ISMRM 2016, May 2016, Singapore, Singapore. Proc. Int. Soc. Mag. Reson. Med. 24 (2016). 〈hal-01358775〉
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https://hal.inria.fr/hal-01358775/file/Poster_Pizzolato_ISMRM_2016.pdf BibTex
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Marco Pizzolato, Rutger Fick, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Unveiling the Dispersion Kernel in DSC-MRI by Means of Dispersion-Compliant Bases and Control Point Interpolation Techniques. ISMRM 24th Annual Meeting, May 2016, Singapore, Singapore. 2016, Proc. Int. Soc. Mag. Reson. Med. 24 (2016). 〈http://www.ismrm.org/2016-annual-meeting-exhibition/〉. 〈hal-01408170〉
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https://hal.inria.fr/hal-01408170/file/Pizzolato_et_al_ISMRM_abstract_0649_2016.pdf BibTex
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Marco Pizzolato, Timothé Boutelier, Rutger Fick, Rachid Deriche. Elucidating Dispersion Effects in Perfusion MRI by Means of Dispersion-Compliant Bases. International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2016, Prague, Czech Republic. IEEE 13th International Symposium on Biomedical Imaging. 〈10.1109/I978-1-4799-2349-6/16〉. 〈hal-01309243〉
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https://hal.inria.fr/hal-01309243/file/root2.pdf BibTex
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Brahim Belaoucha, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Cortical Surface Parcellation via dMRI Using Mutual Nearest Neighbor Condition. 2016 IEEE 13th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2016, Prague, Czech Republic. pp.903–906, 2016. 〈hal-01306239〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01306239/file/root_isbi2016.pdf BibTex
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Rutger Fick, Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Mauro Zucchelli, Gloria Menegaz, et al.. A sensitivity analysis of q-space indices with respect to changes in axonal diameter, dispersion and tissue composition. 2016 International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2016, Prague, Czech Republic. 〈hal-01292013〉
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https://hal.inria.fr/hal-01292013/file/root2.pdf https://hal.inria.fr/hal-01292013/file/fig1.pdf https://hal.inria.fr/hal-01292013/file/fig2.pdf https://hal.inria.fr/hal-01292013/file/fig3.pdf BibTex
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M. H. Soriani, Violaine Guy, Mariane Bruno, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc, et al.. Interface cerveau-ordinateur (BCI) : un moyen de communication alternative dans la SLA. Jnlf Nantes 2016 – Journées de Neurologie de langue française 2016, Apr 2016, Nantes, France. Elsevier, 172 (S1), Revue neurologique. 〈hal-01413326〉
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Demian Wassermann, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Rutger Fick, Anne-Charlotte Philippe, et al.. Quantifying White Matter Microstructure with aUnified Spatio-Temporal Diffusion Weighted MRIContinuous Representation. International Symposium of Magnetic Resonance in Medicine, 2016, Singapore, Singapore. 〈hal-01406348〉
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Chapitre d’ouvrage

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Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Fabien Lotte, Maureen Clerc, Christian Barillot. Entraîner son cerveau avec le neurofeedback. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 1, ISTE editions, pp.277-292, 2016, 978-1-78406-147-0. 〈hal-01413408〉
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Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Fabien Lotte, Maureen Clerc, Christian Barillot. Brain training with neurofeedback. Brain-Computer Interfaces 1, Wiley-ISTE, 2016. 〈hal-01413424〉
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Maureen Clerc. Prétraitements de données d’électro-encéphalographie. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 1, 2016, 978-1-78405-148-8. 〈hal-01402595〉
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Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte. Introduction. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 1, ISTE, 2016, Fondements et méthodes, 978-1-78405-148-8. 〈hal-01402594〉
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Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte. Introduction. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Brain-Computer Interfaces 1, Wiley-ISTE, 2016, 978-1-84821-826-0. 〈hal-01409001〉
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Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte. Conclusion et perspectives. Les interfaces cerveau-ordinateur 2, ISTE, 2016, 978-1-78405-148-8. 〈hal-01408972〉
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Nathanael Foy, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc. Illustration OpenViBE d’un clavier virtuel P300. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 2, ISTE, 2016, 978-1-78405-148-8. 〈hal-01408947〉
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Maureen Clerc. Electroencephalography Data Preprocessing. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Brain-Computer Interfaces 1, Wiley-ISTE, 2016, 978-1-84821-826-0. 〈10.1002/9781119144977.ch6〉. 〈hal-01409009〉
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Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte. Conclusion and Perspectives. Brain-Computer Interfaces 2, Wiley-ISTE, 2016, 978-1-84821-963-2. 〈hal-01409032〉
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Nathanael Foy, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc. OpenViBE Illustration of a P300 Virtual Keyboard. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Brain-Computer Interfaces 2, Wiley-ISTE, 2016, 978-1-84821-963-2. 〈10.1002/9781119332428.ch13〉. 〈hal-01409029〉
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Maureen Clerc, Emmanuel Daucé, Jeremie Mattout. Méthodes adaptatives en apprentissage machine. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 1, ISTE, 2016, 978-1-78405-147-1. 〈hal-01408906〉
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Maureen Clerc, Emmanuel Daucé, Jeremie Mattout. Adaptive Methods in Machine Learning. Brain-Computer Interfaces 1, Wiley-ISTE, 2016, 978-1-84821-826-0. 〈hal-01409016〉
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Direction d’ouvrage, Proceedings, Dossier

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Marco Pizzolato, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Effect of Phase Correction on DTI and q-space Metrics. Sep 2016, Lisbon, Portugal. International Society for Magnetic Resonance in Medicine, 2016, 〈http://www.ismrm.org/workshops/Diffusion16/〉. 〈hal-01408421〉
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https://hal.inria.fr/hal-01408421/file/Pizzolato_ISMRM_Workshop_Lisbon_2016.pdf BibTex

Ouvrage (y compris édition critique et traduction)

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Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte. Brain-Computer Interfaces 2: Technology and Applications. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Wiley-ISTE, 2016, Maureen Clerc. 〈hal-01408998〉
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Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte. Brain-Computer Interfaces 1: Foundations and Methods. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Wiley-ISTE, 2016, Maureen Clerc, 978-1-84821-826-0. 〈hal-01408991〉
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Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 2 : Technologie et applications. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. ISTE, 2016, 978-1-78405-148-8. 〈hal-01402544〉
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Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte. Les interfaces Cerveau-Ordinateur 1 : Fondements et méthodes. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. ISTE, 2016, Maureen Clerc, 978-1-78405-147-1. 〈hal-01402539〉
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https://hal.inria.fr/hal-01402539/file/147_Les_interfaces_cerveau-ordinateur_1_Preface.pdf BibTex

Poster

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Rutger Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stephane Lehericy, et al.. Multi-Spherical MRI: Breaking the Boundaries of Diffusion Time. ISMRM Workshop on: Breaking the Barriers of Diffusion MRI, Sep 2016, Lisbonne, Portugal. 〈http://www.ismrm.org/workshops/Diffusion16/〉. 〈hal-01360440〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01360440/file/poster_ismrm_workshop_2016.pdf BibTex
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Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Marsel Mano, Elise Bannier, Fabien Lotte, et al.. EEG-fMRI neurofeedback of a motor imagery task. Organization for Human Brain Mapping, Jun 2016, Genève, Switzerland. 〈hal-01426182〉
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https://hal.inria.fr/hal-01426182/file/OHBM_poster_4133_lp.pdf BibTex

Thèse

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Gabriel Girard. White matter tractography guided by anatomical and microstructural priors. Human health and pathology. Université Nice Sophia Antipolis, 2016. English. 〈NNT : 2016NICE4014〉. 〈tel-01369022〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01369022/file/2016NICE4014.pdf BibTex

2015

Article dans une revue

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Lipeng Ning, Frederik Laun, Yaniv Gur, Edward V.R. Dibella, Samuel Deslauriers-Gauthier, et al.. Sparse Reconstruction Challenge for diffusion MRI: Validation on a physical phantom to determine which acquisition scheme and analysis method to use?. Medical Image Analysis, 2015, 26, pp.316-331. 〈https://www.elsevier.com/〉. 〈10.1016/j.media.2015.10.012〉. 〈hal-01240197〉
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Matthew Dyson, Eoin Thomas, Laurence Casini, Boris Burle. Online Extraction and Single Trial Analysis of Regions Contributing to Erroneous Feedback Detection. NeuroImage, Elsevier, 2015, 121, pp.146-158. 〈10.1016/j.neuroimage.2015.06.041〉. 〈hal-01199206〉
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https://hal.inria.fr/hal-01199206/file/Dyson_et_al_NEUROIMAGE_15_Postprint.pdf BibTex
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Jorg M. Portegies, Rutger Fick, Gonzalo R. Sanguinetti, Stephan Meesters, Gabriel Girard, et al.. Improving Fiber Alignment in HARDI by Combining Contextual PDE Flow with Constrained Spherical Deconvolution. PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, 10 (10), 〈10.1371/journal.pone.0138122〉. 〈hal-01242740〉
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Joy T Matsui, Jatin G Vaidya, Demian Wassermann, Regina Eunyoung Kim, Vincent A Magnotta, et al.. Prefrontal cortex white matter tracts in prodromal Huntington disease.. Human Brain Mapping, Wiley, 2015, 36 (10), pp.3717-32. 〈10.1002/hbm.22835〉. 〈hal-01152276〉
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BibTex
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Romain E. Trachel, Maureen Clerc, Thomas G. Brochier. Decoding covert shifts of attention induced by ambiguous visuospatial cues. Frontiers in Human Neuroscience, Frontiers, 2015, pp.9. 〈10.3389/fnhum.2015.00358〉. 〈hal-01202766〉
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01202766/file/ptpmcrender.pdf BibTex
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Tarik Zakaraia Benmerar, Mouloud Kachouane, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. A Hybrid SaaS/Grid Architecture for Diffusion MRI in Brain Imaging Field: SaaS as a New Access Model for Computation Grids. International Journal of Organizational and Collective Intelligence (IJOCI), Dr. Victor Chang, 2015, 4 (4), pp.35. 〈http://www.igi-global.com/article/a-hybrid-saasgrid-architecture-for-diffusion-mri-in-brain-imaging-field/124105〉. 〈10.4018/ijoci.2014100102〉. 〈hal-01239760〉
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Eleftherios Garyfallidis, Omar Cepeda, Demian Wassermann, Maxime Descoteaux. Robust and efficient linear registration of white-matter fascicles in the space of streamlines. NeuroImage, Elsevier, 2015, In press. 〈10.1016/j.neuroimage.2015.05.016〉. 〈hal-01153043〉
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Dietsje Jolles, Demian Wassermann, Ritika Chokhani, Jennifer Richardson, Caitlin Tenison, et al.. Plasticity of left perisylvian white-matter tracts is associated with individual differences in math learningBrain Structure and Function. Brain Structure and Function, Springer Verlag, 2015, pp.15. 〈10.1007/s00429-014-0975-6〉. 〈hal-01099660〉
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Communication dans un congrès

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Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Tanguy Duval, Jennifer S. W. Campbell, Timothé Boutelier, et al.. A Temperature Phantom to Probe the Ensemble Average Propagator Asymmetry: an In-Silico Study. Computational Diffusion Magnetic Resonance Imaging, Oct 2015, Munich, Germany. Computational Diffusion MRI 2015. 〈10.1007/978-3-319-28588-7_16〉. 〈hal-01218143〉
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https://hal.inria.fr/hal-01218143/file/submission_107.pdf BibTex
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Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo. MEG/EEG reconstruction in the reduced source space. International Conference on Basic and Clinical Multimodal Imaging, Sep 2015, Utrecht, Netherlands. 2015. 〈hal-01207169〉
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BibTex
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Christos Papageorgakis, Sebastian Hitziger, Théodore Papadopoulo. Dictionary learning for M/EEG multidimensional data. International conference on basic and clinical multimodal imaging (BACI), Sep 2015, Utrecht, Netherlands. 〈hal-01243284〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01243284/file/Dictionary%20learning%20for%20MEEG%20multidimensional%20data_HAL.pdf BibTex
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Brahim Belaoucha, Jean-Marc Lina, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. MEM-diffusion MRI framework to solve MEEG inverse problem. 2015 23rd European Signal Processing Conference (EUSIPCO), Aug 2015, Nice, France. 2015. 〈hal-01207165〉
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https://hal.inria.fr/hal-01207165/file/root.pdf BibTex
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Rutger Fick, Demian Wassermann, Marco Pizzolato, Rachid Deriche. A Unifying Framework for Spatial and Temporal Diffusion in Diffusion MRI. Information Processing in Medical Imaging (IPMI), Jun 2015, Sabhal Mor Ostaig, Isle of Skye, United Kingdom. 24th International Conference, Information Processing in Medical Imaging. 〈hal-01140070〉
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https://hal.inria.fr/hal-01140070/file/IPMI2015_130.pdf BibTex
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Gabriel Girard, Rutger Fick, Maxime Descoteaux, Rachid Deriche, Demian Wassermann. AxTract: microstructure-driven tractography based on the ensemble average propagator. Information Processing in Medical Imaging, Jun 2015, Isle of Skye, United Kingdom. Springer, Information Processing in Medical Imaging, 2015, 〈10.1007/978-3-319-19992-4_53〉. 〈hal-01152267〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01152267/file/188.pdf BibTex
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Gabriel Girard, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Structural connectivity reproducibility through multiple acquisitions. Organization for Human Brain Mapping, Jun 2015, Honolulu, United States. 〈hal-01174327〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01174327/file/submitted.pdf BibTex
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Rutger Fick, Mauro Zucchelli, Gabriel Girard, Gloria Menegaz, Maxime Descoteaux, et al.. How to get more out of a clinically feasible 64 Gradient dMRI Acquisition: Multi-Shell versus Single-Shell. International Society for Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM), May 2015, Toronto, Ontario, Canada. 〈hal-01140076〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01140076/file/submitted_ISMRM2015.pdf BibTex
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Gabriel Girard, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Studying white matter tractography reproducibility through connectivity matrices. International Symposium on Magnetic Resonance in Medicine, May 2015, Toronto, Canada. 〈hal-01174328〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01174328/file/submitted.pdf BibTex
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Kai Dang, Maureen Clerc, Clair Vandersteen, Nicolas Guevara, Dan Gnansia. In situ validation of a parametric model of electrical field distribution in an implanted cochlea. 7th International IEEE EMBS Conference on Neural Engineering, Apr 2015, Montpellier, France, France. 2015, 〈10.1109/NER.2015.7146711〉. 〈hal-01242020〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01242020/file/ner_2015.pdf BibTex
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Rutger Fick, Demian Wassermann, Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche. Laplacian-Regularized MAP-MRI: Improving Axonal Caliber Estimation. International Symposium on BIOMEDICAL IMAGING: From Nano to Macro, Apr 2015, Brooklyn, New York City, United States. 〈hal-01140021〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01140021/file/ISBI2015a.pdf BibTex
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Rutger Fick, Mauro Zucchelli, Gabriel Girard, Maxime Descoteaux, Gloria Menegaz, et al.. Using 3D-SHORE and MAP-MRI to Obtain Both Tractography and Microstructural Constrast from a Clinical DMRI Acquisition. International Symposium on BIOMEDICAL IMAGING: From Nano to Macro, Apr 2015, Brooklyn, New York City, United States. 〈hal-01140011〉
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https://hal.inria.fr/hal-01140011/file/ISBI2015b.pdf BibTex
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Marco Pizzolato, Aurobrata Ghosh, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Perfusion MRI Deconvolution with Delay Estimation and Non-Negativity Constraints. International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2015, Brooklyn, New York, United States. 2015, IEEE 12th International Symposium on Biomedical Imaging. 〈http://biomedicalimaging.org/2015/〉. 〈10.1109/ISBI.2015.7164057〉. 〈hal-01143213〉
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https://hal.inria.fr/hal-01143213/file/root.pdf BibTex
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Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Exploiting the Phase in Diffusion MRI for Microstructure Recovery: Towards Axonal Tortuosity via Asymmetric Diffusion Processes. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, 2015, Munich, Germany. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2015. 〈10.1007/978-3-319-24553-9_14〉. 〈hal-01152672〉
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https://hal.inria.fr/hal-01152672/file/Pizzolato%20et%20al%20-%20Exploiting%20the%20Phase%20in%20Diffusion%20MRI%20for%20Microstructure%20Recovery%3A%20Towards%20Axonal%20Tortuosity%20via%20Asymmetric%20Diffusion%20Processes.pdf BibTex
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Tobias Scheer, Fabien Mathy, Demian Wassermann. Sahin et al. (2009) en modalité non-invasive : expérience pilote et perspectives. Journée de l’axe MTC-NSC, 2015, Université Nice Sophia antipolis, Nice, France. 2015. 〈hal-01359317〉
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Chapitre d’ouvrage

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Fabien Lotte, Laurent Bougrain, Maureen Clerc. Electroencephalography (EEG)-based Brain-Computer Interfaces. Wiley Encyclopedia of Electrical and Electronics Engineering, Wiley, pp.44, 2015, 〈10.1002/047134608X.W8278〉. 〈hal-01167515〉
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https://hal.inria.fr/hal-01167515/file/EEGBasedBCIArt.pdf BibTex

Poster

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Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Exploiting the Phase in Diffusion MRI for Microstructure Recovery: Towards Axonal Tortuosity via Asymmetric Diffusion Processes. MICCAI 2015, Oct 2015, Munich, Germany. 〈hal-01358805〉
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https://hal.inria.fr/hal-01358805/file/Poster%20MICCAI-660.pdf BibTex
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Christos Papageorgakis, Benjamin Lanfer, Maureen Clerc. Influence of skull modelling on conductivity estimation for EEG source analysis. International conference on basic and clinical multimodal imaging (BACI), Sep 2015, Utrecht, Netherlands. 〈http://www.baci-conference.com/〉. 〈hal-01244392〉
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https://hal.inria.fr/hal-01244392/file/Influence%20of%20skull%20modelling%20on%20conductivity%20estimation%20for%20EEG%20source%20analysis_HAL.pdf BibTex
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Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Christos Papageorgakis. Inverse skull conductivity estimation problems from EEG data. 1st International Conference on Mathematical Neuroscience (ICMNS), Jun 2015, Juan-les-Pins, France. 〈http://icmns2015.inria.fr/〉. 〈hal-01243059〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01243059/file/Inverse%20skull%20conductivity%20estimation%20problems%20from%20EEG%20data_HAL.pdf BibTex
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Kai Dang, Clair Vandersteen, Nicolas Guevara, Maureen Clerc, Dan Gnansia. Realistic Simulation of Electric Potential Distributions of Different Stimulation Modes in an Implanted Cochlea. Association of Research in Otolaryngology 38th MidWinter Meeting, Feb 2015, Baltimore, United States. 〈hal-01128098〉
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https://hal.inria.fr/hal-01128098/file/poster.pdf BibTex

Thèse

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Sebastian Hitziger. Modeling the variability of electrical activity in the brain. Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2015. English. 〈NNT : 2015NICE4015〉. 〈tel-01175851〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01175851/file/2015NICE4015.pdf BibTex

Vidéo

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Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Exploiting the Phase in Diffusion MRI for Microstructure Recovery: Towards Axonal Tortuosity via Asymmetric Diffusion Processes. 2015. 〈medihal-01358880〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/medihal-01358880/file/0660-file1.mp4 BibTex

2014

Article dans une revue

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Jian Cheng, Rachid Deriche, Jiang Tianzi, Dinggang Shen, Pew-Thian Yap. Non-Negative Spherical Deconvolution (NNSD) for estimation of fiber Orientation Distribution Function in single-/multi-shell diffusion MRI. NeuroImage, Elsevier, 2014, 11 (1), pp.750-764. 〈http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1053811914006454〉. 〈10.1016〉. 〈hal-01078338〉
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Thinhinane Megherbi, Mouloud Kachouane, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. Crossing Fibers Detection with an Analytical High Order Tensor Decomposition. Computational and Mathematical Methods in Medicine, Hindawi Publishing Corporation, 2014, 2014, pp.1-18. 〈http://dx.doi.org/10.1155/2014/476837〉. 〈10.1155〉. 〈hal-01078352〉
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Gabriel Girard, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Towards quantitative connectivity analysis: reducing tractography biases. NeuroImage, Elsevier, 2014, pp.266-278. 〈10.1016/j.neuroimage.2014.04.074〉. 〈hal-00991846〉
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Alessandro Daducci, Erick Canales Rodgriguez, Maxime Descoteaux, Eleftherios Garyfallidis, Yaniv Gur, et al.. Quantitative comparison of reconstruction methods for intra-voxel fiber recovery from diffusion MRI. IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2014, pp.384-399. 〈http://ieeexplore.ieee.org/xpl/articleDetails.jsp?arnumber=6630106〉. 〈10.1109/TMI.2013.2285500〉. 〈hal-00908289〉
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Michael Paquette, Sylvain Merlet, Guillaume Gilbert, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Comparison of sampling strategies and sparsifying transforms to improve compressed sensing diffusion spectrum imaging. Magnetic Resonance in Medicine, Wiley, 2014, Article first published online: 29 JAN 2014. 〈10.1002/mrm.25093〉. 〈hal-00945734〉
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Communication dans un congrès

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Mouloud Kachouane, Thinhinane Megherbi, Sihem Zeggout, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. ODF’s maxima extraction using Particle Swarm Optimization. Biomedical. Biomedical Engineering International Conference, Oct 2014, Tlemcen, Algeria. 〈https://www2.univ-tlemcen.dz/biomeic14/index.php?id=0〉. 〈hal-01239791〉
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Kai Dang, Maureen Clerc, Jonathan Laudanski. A 3D Model-based Simulation of the Electric Field During Cochlear Stimulation. 8th International Symposium on Objective Measures in Auditory Implants, Oct 2014, Toronto, Canada. 2014. 〈hal-01103374〉
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Marco Pizzolato, Aurobrata Ghosh, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Magnitude and complex based diffusion signal reconstruction. CDMRI’14, Sep 2014, Boston, United States. Computational Diffusion MRI 2016. 〈http://cmic.cs.ucl.ac.uk/cdmri14/program.html〉. 〈10.1007/978-3-319-〉. 〈hal-01095127〉
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https://hal.inria.fr/hal-01095127/file/Pizzolato%20et%20al%20-%20Magnitude%20and%20complex%20based%20diffusion%20signal%20reconstruction.pdf BibTex
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Rutger Fick, Demian Wassermann, Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche. An Analytical 3D Laplacian Regularized SHORE Basis and Its Impact on EAP Reconstruction and Microstructure Recovery. CD-MRI, Sep 2014, Boston, United States. 〈hal-01095271〉
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https://hal.inria.fr/hal-01095271/file/MICCAworkshop_CameraReady_2014.pdf BibTex
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Eoin Thomas, Emmanuel Daucé, Dieter Devlaminck, Loïc Mahé, Alexandra Carpentier, et al.. CoAdapt P300 speller: optimized flashing sequences and online learning. 6th International Brain Computer Interface Conference, Sep 2014, Graz, Austria. 〈hal-01103441〉
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https://hal.inria.fr/hal-01103441/file/CoadaptP300.pdf BibTex
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Théodore Papadopoulo, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. Complete Set of Invariants of a 4th Order Tensor: The 12 Tasks of HARDI from Ternary Quartics. Golland, Polina; Hata, Nobuhiko; Barillot, Christian; Hornegger, Joachim; Howe, Robert. Sep 2014, Boston, United States. 8675, pp.233 – 240, 2014, 〈10.1007/978-3-319-10443-0_30〉. 〈hal-01092492〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01092492/file/proof_Final.pdf BibTex
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Thinhinane Megherbi, Aurobrata Ghosh, F Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. Fiber Orientation Distribution from Non-Negative Sparse Recovery. MICCAI 2014 Workshop on Computational Diffusion MRI, Sep 2014, Boston, United States. 2014, MICCAI 2014 Workshop on Computational Diffusion MRI. 〈hal-01104163〉
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Brahim Belaoucha, Anne-Charlotte Philippe, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Diffusion Magnetic Resonance information as a regularization term for MEG/EEG inverse problem. The 19th International Conference on Biomagnetism, Aug 2014, Halifax, Canada. 2014. 〈hal-01095449〉
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Brahim Belaoucha, Jean-Marc Lina, Maureen Clerc, Anne-Charlotte Philippe, Christophe Grova, et al.. Using diffusion MRI information in the Maximum Entropy on Mean framework to solve MEG/EEG inverse problem. The 19th International Conference on Biomagnetism, Aug 2014, Halifax, Canada. 2014. 〈hal-01095785〉
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Rutger Fick, Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche. Extracting a biomarker for the mean cross-sectional area from the ODF. Human Brain Mapping, Jul 2014, Hamburg, Germany. 〈hal-01095197〉
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Thinhinane Megherbi, Mouloud Kachouane, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. Détection des croisements de fibre en IRM de diffusion par décomposition de tenseur : Approche analytique. Reconnaissance de Formes et Intelligence Artificielle (RFIA) 2014, Jun 2014, France. 2014. 〈hal-00989135〉
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Gabriel Girard, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Connectivity directionally-encoded color map: a streamline-based color mapping. The Organization for Human Brain Mapping (OHBM), Jun 2014, Hambourg, Germany. The Organization for Human Brain Mapping (OHBM), 2014, The Organization for Human Brain Mapping (OHBM). 〈hal-01103640〉
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Mouloud Kachouane, Thinhinane Megherbi, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. Use of Particle Swarm Optimization for ODF Maxima Extraction. IEEE EMBS International Student Conference, ISC 2014, Jun 2014, kuala lumpur, Malaysia. 〈http://www.myembs.org/conferences.php〉. 〈hal-01239824〉
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Demian Wassermann, James Ross, George Washko, William M Wells, Raul San Jose-Estepar. Deformable Registration of Feature-Endowed Point Sets Based on Tensor Fields. Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2014, Columbus, Ohio, United States. 2014, pp.2729-2735, 2014, 〈10.1109/CVPR.2014.355.〉. 〈hal-01153110〉
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Girard Gabriel, Whittingstall Kevin, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Choosing Tractography Parameters to Improve Connectivity Mapping. International Symposium on Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM’14), May 2014, Milan, Italy. 2014. 〈hal-00945992〉
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Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche. NMR Characterization of Cylinder Radii Distributions Using a SHORE-Based Regularization Method. ISMRM : Intl. Soc. Mag. Reson. Med, May 2014, Milan, Italy. pp.4419, 2014. 〈hal-00991736〉
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Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche. Efficient Axon Diameter Distribution Recovery with Long Diffusion Time. ISMRM : Intl. Soc. Mag. Reson. Med, May 2014, Milan, Italy. pp.0792, 2014. 〈hal-00991734〉
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Mauro Zucchelli, Eleftherios Garyfallidis, Michael Paquette, Sylvain Merlet, Gloria Menegaz, et al.. Comparison between discrete and continuous propagator indices from Cartesian q-space DSI sampling. ISMRM : Intl. Soc. Mag. Reson. Med., May 2014, Milan, Italy. pp.4294, 2014. 〈hal-00991876〉
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Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. Greedy NNLS: Fiber Orientation Distribution from Non-Negatively Constrained Sparse Recovery. ISMRM : Intl. Soc. Mag. Reson. Med., May 2014, Milan, Italy. pp.2610, 2014. 〈hal-00991739〉
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Michael Paquette, Sylvain Merlet, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. DSI 101: Better ODFs for Free. ISMRM : Intl. Soc. Mag. Reson. Med. 22, May 2014, Milan, Italy. pp.0802, 2014. 〈hal-00991861〉
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Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche. Mapping Average Axon Diameters under Long Diffusion Time,. ISBI 2014, Apr 2014, Beijing, China. pp.242–245, 2014. 〈hal-00991735〉
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Makhlouf Laouchedi, Thinhinane Megherbi, Houssem Khabatti, Ishak Serrat, Rachid Deriche, et al.. Odf Maxima Computation Using Hill Climbing Algorithm. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Beijing, China. pp.722-725, 2014. 〈hal-00991741〉
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Emmanuel Daucé, Eoin Thomas. Evidence build-up facilitates on-line adaptivity in dynamic environments: example of the BCI P300-speller. 22nd European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2014, Bruges, Belgium. 2014. 〈hal-01104024〉
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Demian Wassermann, Matt Toews, Marc Niethammer, William Wells Iii. Probabilistic Diffeomorphic Registration: Representing Uncertainty. Biomedical Image Registration, 2014, London, United Kingdom. pp.72 – 82, 2014, 〈10.1007/978-3-319-08554-8_8〉. 〈hal-01095091v2〉
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Eleftherios Garyfallidis, Demian Wassermann, Maxime Descoteaux. Direct native-space fiber bundle alignment for group comparisons. International Society for Magnetic Resonance Imaging (ISMRM), 2014, Milan, Italy. 2014. 〈hal-00991740〉
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Poster

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Anne-Charlotte Philippe, Théodore Papadopoulo, Christian G. Bénar, Jean-Michel Badier, Maureen Clerc, et al.. Propagation of epileptic spikes revealed by diffusion-basedconstrained MEG source reconstruction. 19th International Conference on Biomagnetism, Aug 2014, Halifax, Canada. 2014. 〈hal-01104109〉
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Todor Jordanov, Jean-Paul Marmorat, Maureen Clerc, Juliette Leblond, Andre Waelkens, et al.. FindSources3D – Source Localization Using Rational Approximation on Plane Sections. Organization Human Brain Mapping, Annual Meeting, Jun 2014, Hamburg, Germany. Poster listings. 〈http://www.humanbrainmapping.org/i4a/pages/index.cfm?pageID=3565〉. 〈hal-01098108〉
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Sebastian Hitziger, Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Sandrine Saillet, Christian G. Bénar, et al.. Electro-Metabolic Coupling Investigated with Jitter Invariant Dictionary Learning. OHBM 2014, Jun 2014, Hamburg, Germany. 〈http://www.humanbrainmapping.org/i4a/pages/index.cfm?pageid=3565〉. 〈hal-01094674〉
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Thèse

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Romain Trachel. Protocoles d’interaction cerveau-machine pour améliorer la performance d’attention visuo-spatiale chez l’homme. Autre. Université Nice Sophia Antipolis, 2014. Français. 〈NNT : 2014NICE4038〉. 〈tel-01077931〉
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2013

Article dans une revue

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Sylvain Merlet, Rachid Deriche. Continuous diffusion signal, EAP and ODF estimation via Compressive Sensing in diffusion MRI. Medical Image Analysis, Elsevier, 2013, 17 (5), pp.556-572. 〈10.1016/j.media.2013.02.010〉. 〈hal-00815108〉
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Aurobrata Ghosh, Tristan Milne, Rachid Deriche. Constrained diffusion kurtosis imaging using ternary quartics & MLE. Magnetic Resonance in Medicine, Wiley, 2013, 〈http://dx.doi.org/10.1002/mrm.24781〉. 〈10.1002/mrm.24781〉. 〈hal-00842786〉
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Aurobrata Ghosh, Elias Tsigaridas, Bernard Mourrain, Rachid Deriche. A polynomial approach for extracting the extrema of a spherical function and its application in diffusion MRI. Medical Image Analysis, Elsevier, 2013, 17 (5), pp.503-514. 〈10.1016/j.media.2013.03.004〉. 〈hal-00815120〉
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Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. A computational diffusion MRI and parametric dictionary learning framework for modeling the diffusion signal and its features. Medical Image Analysis, Elsevier, 2013, pp.MEDIMA779. 〈10.1016/j.media.2013.04.011〉. 〈hal-00820817〉
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Emmanuel Caruyer, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche. Design of multishell sampling schemes with uniform coverage in diffusion MRI. Magnetic Resonance in Medicine, Wiley, 2013, 69 (6), pp.1534-1540. 〈10.1002/mrm.24736〉. 〈hal-00821688〉
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https://hal.inria.fr/hal-00821688/file/article.pdf BibTex
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Maureen Clerc. Review of “Brain-Computer Interfaces, principles and practise”, edited by Jonathan R. Wolpaw and Elizabeth Winter Wolpaw. BioMedical Engineering OnLine, BioMed Central, 2013, 12 (22), 〈10.1186/1475-925X-12-22〉. 〈hal-00804545〉
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Meizhu Liu, Baba Vemuri, Rachid Deriche. A Robust Variational Approach for Simultaneous Smoothing and Estimation of DTI. NeuroImage, Elsevier, 2013, 67, pp.33-41. 〈http://dx.doi.org/10.1016/j.neuroimage.2012.11.012〉. 〈10.1016/j.neuroimage.2012.11.012〉. 〈hal-00808015〉
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Joan Fruitet, Alexandra Carpentier, Rémi Munos, Maureen Clerc. Automatic motor task selection via a bandit algorithm for a brain-controlled button. Journal of Neural Engineering, IOP Publishing, 2013, 10 (1), 〈10.1088/1741-2560/10/1/016012〉. 〈hal-00798561〉
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Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche. Motion Detection in Diffusion MRI via Online ODF Estimation. International Journal of Biomedical Imaging, Hindawi Publishing Corporation, 2013, 2013 (Article ID 84936), pp.1-8. 〈10.1155/2013/849363〉. 〈hal-00798582〉
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Eoin Thomas, Joan Fruitet, Maureen Clerc. Combining ERD and ERS features to create a system-paced BCI. Journal of Neuroscience Methods, Elsevier, 2013, 〈10.1016/j.jneumeth.2013.03.026〉. 〈hal-00821973〉
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Eoin Thomas, Matthew Dyson, Maureen Clerc. An analysis of performance evaluation for motor-imagery based BCI. Journal of Neural Engineering, IOP Publishing, 2013, 〈10.1088/1741-2560/10/3/031001〉. 〈hal-00821971〉
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Manuel Zaepffel, Romain Trachel, Bjørg Kilavik, Thomas Brochier. Modulations of EEG Beta Power during Planning and Execution of Grasping Movements. PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 27, pp.11877 – 11877. 〈10.1371/journal.pone.0060060.g003〉. 〈hal-01464143〉
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Communication dans un congrès

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Romain Trachel, Thomas Brochier, Maureen Clerc. Adaptive and Warning Displays with Brain-Computer Interfaces : Enhanced Visuospatial Attention Performance. IEEE/EMBS 6th international conference on neural engineering, Nov 2013, San diego, United States. 2013. 〈hal-00903288〉
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Eoin M. Thomas, Maureen Clerc, Alexandra Carpentier, Emmanuel Daucé, Dieter Devlaminck, et al.. Optimizing P300-speller sequences by RIP-ping groups apart. IEEE/EMBS 6th international conference on neural engineering (2013), Nov 2013, San Diego, United States. 2013. 〈hal-00907781〉
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https://hal.inria.fr/hal-00907781/file/0125_MS_revised.pdf BibTex
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Jian Cheng, Tianzi Jiang, Rachid Deriche, Shen Dinggang, Yap Pew-Thian. Regularized Spherical Polar Fourier Diffusion MRI with Optimal Dictionary Learning. Kensaku Mori and Ichiro Sakuma and Yoshinobu Sato and Christian Barillot and Nassir Navab. The 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Sep 2013, Nagoya, Japan. Springer, 8149, pp.639-646, 2013, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-40811-3_80〉. 〈hal-00824507〉
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https://hal.inria.fr/hal-00824507/file/DL_SPFI_MICCAI.pdf BibTex
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Jian Cheng, Rachid Deriche, Tianzi Jiang, Dinggang Shen, Pew-Thian Yap. Non-Negative Spherical Deconvolution (NNSD) for Fiber Orientation Distribution Function Estimation. MICCAI Workshop Computational Diffusion and Brain Connectivity, Sep 2013, Nagoya, Japan. Springer, pp.81-93, 2014, 〈10.1007/978-3-319-02475-2_8〉. 〈hal-00967829〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00967829/file/NNSD_CDMRI2013.pdf BibTex
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Maureen Clerc, Jérémie Mattout, Emmanuel Maby, Dieter Devlaminck, Théodore Papadopoulo, et al.. Verbal Communication through Brain Computer Interfaces. Interspeech – 14th Annual Conference of the International Speech Communication Association – 2013, Aug 2013, Lyon, France. 2013. 〈hal-00842851〉
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https://hal.inria.fr/hal-00842851/file/Interspeech_BCI.pdf BibTex
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Dalila Cherifi, Ali Chellouche, Amazigh Ait Ouakli, Youcef Benamara, Rachid Deriche. Tensor Estimation and Visualization using dMRI. 8th International Workshop on Systems, Signal Processing and their Applications (WoSSPA), 2013, May 2013, Zeralda, Algeria. 2013, 〈http://qspace.qu.edu.qa/handle/10576/10883〉. 〈hal-00917618〉
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Sebastian Hitziger, Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Sandrine Saillet, Christian Bénar, et al.. Jitter-Adaptive Dictionary Learning -Application to Multi-Trial Neuroelectric Signals. ICLR – 1st International Conference on Learning Representations – 2013, May 2013, Phoenix, Arizona, United States. 2013, 〈https://sites.google.com/site/representationlearning2013/〉. 〈hal-01094619〉
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https://hal.inria.fr/hal-01094619/file/1301.3611%281%29.pdf BibTex
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Romain Trachel, Thomas Brochier, Maureen Clerc. Enhancing Visuospatial Attention Performance with Brain-Computer Interfaces. ACM SIGCHI Conference on Human Factors in Computing Systems, Apr 2013, Paris, France. pp.ACM 978-1-4503-1952-2, 2013. 〈hal-00817799〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00817799/file/trachel_paper_wip_chi2013.pdf BibTex
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Jian Cheng, Rachid Deriche, Tianzi Jiang, Dinggang Shen, Pew-Thian Yap. Non-Local Non-Negative Spherical Deconvolution for Single and Multiple Shell Diffusion MRI. HARDI Reconstruction Challenge, International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2013, San Francisco, United States. pp.1, 2013. 〈hal-00967830〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00967830/file/JianCheng-abstract-ISBI2013.pdf BibTex
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Anne-Charlotte Philippe, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche. Cortex parcellation via diffusion data as prior knowledge for the MEG inverse problem. Biomedical Imaging (ISBI), 2013 IEEE 10th International Symposium on, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.994-997, 2013, 〈10.1109/ISBI.2013.6556644〉. 〈hal-00858019〉
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Sylvain Merlet, Michael Paquette, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Compressive Sensing DSI. International Symposium on BIOMEDICAL IMAGING: From Nano to Macro – ISBI HARDI Reconstruction Challenge, Apr 2013, San Francisco, United States. 2013. 〈hal-00908209〉
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Aurobrata Ghosh, Thinhinane Megherbi, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. Fiber Orientation Distribution from Non-Negative Sparse Recovery. International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2013, San Francisco, CA, United States. 2013. 〈hal-00808065〉
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Chapitre d’ouvrage

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Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. From Diffusion MRI to Brain Connectomics. Cazals, Frédéric and Kornprobst, Pierre. Modeling in Computational Biology and Biomedicine: A Multidisciplinary Endeavor, Springer, pp.193-234, 2013, 978-3-642-31208-3. 〈10.1007/978-3-642-31208-3〉. 〈hal-00667912〉
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Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Christian Bénar. Single-Trial Analysis of Bioelectromagnetic Signals: The Quest for Hidden Information. Cazals, Frederic and Kornprobst, Pierre. Modeling in Computational Biology and Biomedicine: A Multidisciplinary Endeavor, Springer, pp.237–259, 2013, 978-3-642-31208-3. 〈10.1007/978-3-642-31208-3〉. 〈hal-00849690〉
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Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. 4th Order Symmetric Tensors and Positive ADC Modelling. Anna Vilanova and Carl-Fredrik Westin and Bernhard Burgeth. Visualization and Processing of Tensors and Higher Order Descriptors for Multi-Valued Data (Dagstuhl Seminar 11501), Springer, 2013. 〈hal-00848513〉
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https://hal.inria.fr/hal-00848513/file/hot4_and_positiveADC.pdf BibTex
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Thomas Schultz, Andrea Fuster, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche, Luc Florack, et al.. Higher-Order Tensors in Diffusion Imaging. Burgeth, B. and Vilanova, A. and Westin, C. F. Visualization and Processing of Tensors and Higher Order Descriptors for Multi-Valued Data. Dagstuhl Seminar 2011, Springer, 2013. 〈hal-00848526〉
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https://hal.inria.fr/hal-00848526/file/tensors-in-dwi-FINAL-Schultz.pdf BibTex

Brevet

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Maureen Clerc, Romain Trachel, Thomas Brochier. Système et Procédé de commande et de contrôle d’un appareil pilotable par un opérateur. France, N° de brevet: 1360563. 2013. 〈hal-01563283〉
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Poster

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Sebastian Hitziger, Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Sandrine Saillet, Christian Bénar, et al.. Jitter-Adaptive Dictionary Learning – Application to Multi-Trial Neuroelectric Signals. International Conference on Learning Representations 2013, May 2013, Phoenix, Arizona, United States. 2013. 〈hal-01094663〉
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Document associé à des manifestations scientifiques

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Anne-Charlotte Philippe, Christian Bénar, Jean-Michel Badier, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, et al.. Propagation of epileptic spikes revealed by diffusion-based constrained MEG source reconstruction. Scale-free Dynamics and Networks in Neuroscience, Oct 2013, Montreal, Canada. 〈hal-00908664〉
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Thèse

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Anne-Charlotte Philippe. Régularisation du problème inverse MEG par IRM de diffusion. Autre. Université Nice Sophia Antipolis, 2013. Français. 〈NNT : 2013NICE4135〉. 〈tel-00939159v2〉
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Sylvain Merlet. Compressive sensing in diffusion MRI. Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2013. English. 〈NNT : 2013NICE4061〉. 〈tel-00908369v2〉
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2012

Article dans une revue

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Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. Fast and Analytical EAP Approximation from a 4th-Order Tensor. International Journal of Biomedical Imaging, Hindawi Publishing Corporation, 2012, 2012 (Article ID 192730), pp.1-9. 〈10.1155/2012/192730〉. 〈hal-00798581〉
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Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Théodore Papadopoulo. Source localization using rational approximation on plane sections. Inverse Problems, IOP Publishing, 2012, 28 (5), Article number 055018 – 24 p. 〈10.1088/0266-5611/28/5/055018〉. 〈hal-00699541〉
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Anne-Charlotte Philippe. L’art assisté par ordinateur. Interstices, INRIA, 2012, 〈https://interstices.info/jcms/i_58118/l-art-assiste-par-ordinateur〉. 〈hal-01350321〉
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Panayotis Katsaloulis, Aurobrata Ghosh, Anne-Charlotte Philippe, Astero Provata, Rachid Deriche. Fractality in the neuron axonal topography of the human brain based on 3-D diffusion MRI. European Physical Journal B: Condensed Matter and Complex Systems, Springer-Verlag, 2012, 85 (5), pp.150-157. 〈10.1140/epjb/e2012-30045-y〉. 〈hal-00712701〉
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Bjørg Kilavik, Adrian Ponce-Alvarez, Romain Trachel, Joachim Confais, Sylvain Takerkart, et al.. Context-Related Frequency Modulations of Macaque Motor Cortical LFP Beta Oscillations. Cerebral Cortex, Oxford University Press (OUP), 2012, 22, pp.2148 – 2159. 〈10.1093/cercor/bhr299〉. 〈hal-00816339v2〉
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-00816339/file/Kilavik--Riehle2012.pdf BibTex
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Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche. Diffusion MRI Signal Reconstruction with Continuity Constraint and Optimal Regularization. Medical Image Analysis, Elsevier, 2012, 16 (6), pp.1113-1120. 〈10.1016/j.media.2012.06.011〉. 〈hal-00711883〉
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Communication dans un congrès

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Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche. A Computational Framework for Experimental Design in Diffusion MRI. CDMRI – MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI, Oct 2012, Nice, France. 2012. 〈hal-00747700〉
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Sylvain Merlet, Anne-Charlotte Philippe, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Tractography via the Ensemble Average Propagator in diffusion MRI. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2012, Nice, France. Springer, 7511, pp.7511, 2012, Lecture Notes in Computer Science. 〈hal-00727797〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00727797/file/paper_789.pdf BibTex
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Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche. Parametric dictionary learning for modeling EAP and ODF in diffusion MRI. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2012, Nice, France. Springer, 7512, 8 p., 2012, Lecture notes in computer science. 〈hal-00728067〉
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Jian Cheng, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. Nonnegative Definite EAP and ODF Estimation via a Unified Multi-Shell HARDI Reconstruction. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2012, Oct 2012, Nice, France. 7511, pp.313-321, 2012, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-33418-4_39〉. 〈hal-00759014〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00759014/file/paper469.pdf BibTex
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Maureen Clerc, Carsten Wolters, Johannes Vorwerk, Martin Burger. Comparison of Boundary Element and Finite Element Approaches to the EEG Forward Problem. BMT 2012, Sep 2012, Jena, Germany. Walter De Gruyter, 57, pp.795-798, 2012, Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik. 〈http://www.degruyter.com/view/j/bmte.2012.57.issue-s1-O/bmt-2012-4152/bmt-2012-4152.xml?format=INT〉. 〈10.1515/bmt-2012-4152〉. 〈hal-00736523〉
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Anne-Charlotte Philippe, Jean-Christophe Lombardo. Study of the brain connectivity in an Immersive Space. AFRV, Sep 2012, Strasbourg, France. 2012. 〈hal-00760084〉
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Anne-Charlotte Philippe, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche. Whole cortex parcellation combining analysis of MEG forward problem, structural connectivity and Brodmann atlas. BIOMAG, Aug 2012, Paris, France. 2012. 〈hal-00760042〉
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Sylvain Merlet, Michael Paquette, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Ensemble Average Propagator Reconstruction via Compressed Sensing: Discrete or Continuous Bases ?. ISMRM 20th Annual Meeting (2012), May 2012, Australia. pp.2277, 2012. 〈hal-00712687〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00712687/file/abstract_ISMRM_CS-basis_submitted.pdf BibTex
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Sylvain Merlet, Rachid Deriche, Kevin Whittingstall, Maxime Descoteaux. Diffusion and multiple orientations from 1.5 MR systems with limited gradient tables. ISMRM 20th Annual Meeting (2012), May 2012, Melbourne, Australia. pp.1922, 2012. 〈hal-00712686〉
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Meizhu Liu, Baba Vemuri, Rachid Deriche. UNSUPERVISED AUTOMATIC WHITE MATTER FIBER CLUSTERING USING A GAUSSIAN MIXTURE MODEL. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI)., May 2012, Barcelona, Spain. pp.522-525, 2012. 〈hal-00712673〉
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Gonzalo Vegas-Sánchez-Ferrero, Antonio Tristán-Vega, Santiago Aja-Fernández, Marcos Martín-Fernández, C. Palencia, et al.. Anisotropic LMMSE denoising of MRI based on statistical tissue models. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI)., May 2012, Barcelona, Spain. pp.1519-1522, 2012. 〈hal-00712669〉
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Aurobrata Ghosh, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche. BIOMARKERS FOR HARDI: 2nd & 4th ORDER TENSOR INVARIANTS. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro – 2012, May 2012, Barcelona, Spain. 2012. 〈hal-00667905〉
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https://hal.inria.fr/hal-00667905/file/isbi12.pdf BibTex
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Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche. Optimal Regularization for MR Diffusion Signal Reconstruction. ISBI – 9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, May 2012, Barcelona, Spain. 2012. 〈hal-00660635〉
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https://hal.inria.fr/hal-00660635/file/article.pdf BibTex
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Anne-Charlotte Philippe, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche. A nested cortex parcellation combining analysis of MEG forward problem and diffusion MRI tractography. ISBI – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging – 2012, May 2012, Barcelona, Spain. 2012. 〈hal-00662776〉
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https://hal.inria.fr/hal-00662776/file/PHILIPPE_Ac_ISBI12.pdf BibTex
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Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. Parametric Dictionary Learning in Diffusion MRI. HARDI reconstruction workshop – ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, May 2012, Barcelona, Spain. 2012. 〈hal-00697102〉
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https://hal.inria.fr/hal-00697102/file/merlet-caruyer-etal_HARDI-Contest-ISBI-2012.pdf BibTex
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Ali Demir, Mustafa Unel, Rachid Deriche, Gozde Unal. Elliptic fourier features of brain white matter pathways. Signal Processing and Communications Applications Conference (SIU), 2012 20th, Apr 2012, Fethiye, Turkey, Turkey. IEEE, pp.1-4, 2012, 〈10.1109/SIU.2012.6204642〉. 〈hal-00713002〉
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Anne-Charlotte Philippe, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche. dMRI tractography of WM fibers to recover the anatomical connectivity supporting a MEG epileptic network. SFRMBM, Mar 2012, Marseille, France. 2012. 〈hal-00760041〉
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Rachid Deriche, John Treilhard. Using Radial NMR Profiles to Characterize Pore Size Distributions. David R. Haynor, Sébastien Ourselin. Medical Imaging 2012: Image Processing, Feb 2012, San Diego, CA, United States. Vol. 8314, pp.83140L-1–83140L-13, 2012, 〈10.1117/12.910673〉. 〈hal-00712695〉
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Joan Fruitet, Alexandra Carpentier, Rémi Munos, Maureen Clerc. Bandit Algorithms boost Brain Computer Interfaces for motor-task selection of a brain-controlled button. P. Bartlett and F.C.N. Pereira and C.J.C. Burges and L. Bottou and K.Q. Weinberger. Advances in Neural Information Processing Systems, 2012, Lake Tahoe, Nevada, United States. Neural Information Processing Systems (NIPS) Foundation, 25, pp.458–466, 2012. 〈hal-00771495〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00771495/file/NIPS.pdf BibTex
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Eoin M. Thomas, Joan Fruitet, Maureen Clerc. Investigating brief motor imagery for an ERD/ERS based BCI. EMBC: Engineering in Medicine and Biology Conference, 2012, San Diego, CA, United States. 34th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, pp.2929-2932, 2012, 〈10.1109/EMBC.2012.6346577〉. 〈hal-00789765〉
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Emmanuel Olivi, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Domain Decomposition to handle versatile conductivity models. Proceedings of Biomag, 2012, Paris, France. 2012. 〈hal-00789734〉
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Tristan Milne, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. Constrained Diffusion Kurtosis Imaging Using Ternary Quartics and MLE. Computational Diffusion MRI Workshop (CDMRI), 2012, MICCAI, 2012, Nice, France. pp.153―164, 2012. 〈hal-00789755〉
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Aurobrata Ghosh, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche. Generalized Invariants of a 4th order tensor: Building blocks for new biomarkers in dMRI. Computational Diffusion MRI Workshop (CDMRI), MICCAI, 2012, Nice, France. pp.165―173, 2012. 〈hal-00789763〉
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Chapitre d’ouvrage

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Jan De Munck, Carsten Wolters, Maureen Clerc. EEG and MEG: forward modeling. Brette, Romain and Destexhe, Alain. Handbook of Neural Activity Measurement, Cambridge University Press, pp.192-256, 2012, 978-0-521-51622-8. 〈hal-00736444〉
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Autre publication

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Anne-Charlotte Philippe. L’art assisté par ordinateur. article de vulgarisation scientifique. 2012. 〈hal-00789767〉
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Document associé à des manifestations scientifiques

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Emmanuel Olivi, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc. The adjoint method of OpenMEEG for EEG and MEG with large source space. Proceedings of Biomag, 2012, Paris, France. 2012. 〈hal-00789736〉
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Thèse

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Emmanuel Caruyer. IRM de diffusion du Q-space : Acquisition et pré-traitements. Medical Imaging. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. English. 〈tel-00750144〉
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Joan Fruitet. Interfaces Cerveau-Machines basées sur l’imagination de mouvements brefs : vers des boutons contrôlés par la pensée. Traitement du signal et de l’image. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. Français. 〈tel-00838704〉
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Jian Cheng. Estimation and Processing of Ensemble Average Propagator and Its Features in Diffusion MRI. Medical Imaging. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. English. 〈tel-00759048〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00759048/file/thesis_JianCheng.pdf BibTex

2011

Article dans une revue

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Maxime Descoteaux, Rachid Deriche, Denis Lebihan, Jean-François Mangin, Cyril Poupon. Multiple q-shell diffusion propagator imaging. Medical Image Analysis, Elsevier, 2011, 15 (4), pp.603-621. 〈10.1016/j.media.2010.07.001〉. 〈hal-00531473〉
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BibTex
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Jiamin Liu, Kabadi Suraj, Uitert Robert Van, Ronald M. Summers, Nicholas Petrick, et al.. Improved computer-aided detection of small polyps in CT colonography using interpolation for curvature estimation. Medical Physics, American Association of Physicists in Medicine, 2011, 38 (7), 〈10.1118/1.3596529〉. 〈hal-00645561〉
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Nicole Voges, Solenna Blanchard, Fabrice Wendling, Olivier David, Habib Benali, et al.. Modeling of the Neurovascular Coupling in Epileptic Discharges.. Brain Topography, Springer Verlag, 2011, 25 (2), pp.136-156. 〈10.1007/s10548-011-0190-1〉. 〈inserm-00613123〉
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Solenna Blanchard, Théodore Papadopoulo, Christian-George Bénar, Nicole Voges, Maureen Clerc, et al.. Relationship between flow and metabolism in BOLD signals: insights from biophysical models.. Brain Topography, Springer Verlag, 2011, 24 (1), pp.40-53. 〈10.1007/s10548-010-0166-6〉. 〈inserm-00613116〉
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Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc. Forward Field Computation with OpenMEEG.. Computational Intelligence and Neuroscience, Hindawi Publishing Corporation, 2011, 2011, pp.923703. 〈10.1155/2011/923703〉. 〈inria-00584205〉
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Joan Fruitet, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Preliminary study for an offline hybrid BCI using sensorimotor rhythms and beta rebound. International Journal of bioelectromagnetism, International Society for Bioelectromagnetism, 2011, 13 (2), pp.70-71. 〈hal-00727086〉
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https://hal.inria.fr/hal-00727086/file/2011_v13_no2_70-71.pdf BibTex

Communication dans un congrès

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Emmanuel Caruyer, Jian Cheng, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Tianzi Jiang, et al.. Optimal Design of Multiple Q-shells experiments for Diffusion MRI. MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI – CDMRI’11, Sep 2011, Toronto, Canada. 2011. 〈inria-00617663〉
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https://hal.inria.fr/inria-00617663/file/article.pdf BibTex
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Meizhu Liu, Baba Vemuri, Rachid Deriche. Simultaneous Smoothing and Estimation of DTI via Robust Variational Non-local Means. MICCAI Workshop Computational Diffusion MRI, Sep 2011, Toronto, Canada. 2011. 〈hal-00645007〉
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https://hal.inria.fr/hal-00645007/file/Liu-vemuri-etal_11.pdf BibTex
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Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche. Impact of radial and angular sampling on multiple shells acquisition in diffusion MRI. Fichtinger, Gabor and Martel, Anne and Peters, Terry. MICCAI 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. Springer, 6891, pp.113-121, 2011, Lecture Notes in Computer Science. 〈hal-00614387〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00614387/file/MICCAI_2011_paperReady.pdf BibTex
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Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. Diffeomorphism Invariant Riemannian Framework for Ensemble Average Propagator Computing. MICCAI – 2011 – 14th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2011, Toronto, Canada. 2011. 〈inria-00615431〉
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https://hal.inria.fr/inria-00615431/file/RiemannianFramework4EAP_MICCAI2011.pdf BibTex
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Jian Cheng, Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, et al.. Compressive Sensing Ensemble Average Propagator Estimation via L1 Spherical Polar Fourier Imaging. MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI – CDMRI’11, Sep 2011, Toronto, Canada. 2011. 〈inria-00615434〉
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https://hal.inria.fr/inria-00615434/file/L1-SPFI_CDMRI2011.pdf BibTex
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Jian Cheng, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. Theoretical Analysis and Practical Insights on EAP Estimation via a Unified HARDI Framework. MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI), Sep 2011, Toronto, Canada. 2011. 〈inria-00615430〉
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https://hal.inria.fr/inria-00615430/file/AFTSC_compare_CDMRI2011.pdf BibTex
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Aurobrata Ghosh, Demian Wassermann, Rachid Deriche. A Polynomial Approach for Maxima Extraction and Its Application to Tractography in HARDI. Gábor Székely and Horst K. Hahn. Information Processing in Medical Imaging, Jul 2011, Irsee, Germany. Springer, 6801, pp.723-734, 2011, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-22092-0_59〉. 〈inria-00610195〉
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https://hal.inria.fr/inria-00610195/file/ipmi11_cameraReady.pdf BibTex
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Emmanuel Caruyer, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche. Incremental gradient table for multiple Q-shells diffusion MRI. HBM 17th Annual Meeting, Jun 2011, Québec, Canada. 2011. 〈inria-00617957〉
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https://hal.inria.fr/inria-00617957/file/article.pdf BibTex
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Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. A Riemannian Framework for Ensemble Average Propagator Computing. ISMRM, May 2011, Montréal, Canada. 2011. 〈inria-00615436〉
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https://hal.inria.fr/inria-00615436/file/RiemannianEAP_ismrm_2011_final.pdf BibTex
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Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche. On Line Reconstruction and Motion Detection in HARDI. 19th ISMRM annual meeting, May 2011, Montréal, Canada. 2011. 〈inria-00560899〉
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https://hal.inria.fr/inria-00560899/file/ISMRM11.pdf BibTex
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Maureen Clerc, Laurent Koessler, Jean-Michel Badier, Martine Gavaret. In vivo scalp-to-skull conductivity ratio calibration: an EIT study. 12th International Conference in Electrical Impedance Tomography, EIT 2011, May 2011, Bath, United Kingdom. 2011. 〈hal-00789732〉
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Jian Cheng, Sylvain Merlet, Aurobrata Ghosh, Emmanuel Caruyer, Tianzi Jiang, et al.. Compressive Sensing Ensemble Average Propagator Estimation via L1 Spherical Polar Fourier Imaging. ISMRM, May 2011, Montréal, Canada. 2011. 〈inria-00615437〉
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https://hal.inria.fr/inria-00615437/file/L1SPFI_CS_ISMRM_final.pdf BibTex
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Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. EXTRACTING GEOMETRICAL FEATURES & PEAK FRACTIONAL ANISOTROPY FROM THE ODF FOR WHITE MATTER CHARACTERIZATION. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Mar 2011, Chicago, United States. 2011. 〈hal-00645804〉
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https://hal.inria.fr/hal-00645804/file/output.pdf BibTex
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Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche. Online Motion Detection in High Angular Resolution Diffusion Imaging. International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Mar 2011, Chicago, United States. 2011. 〈inria-00559904v2〉
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https://hal.inria.fr/inria-00559904/file/article.pdf BibTex
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Sylvain Merlet, Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. Spherical Polar Fourier EAP and ODF Reconstruction via Compressed Sensing in Diffusion MRI. ISBI, Mar 2011, Chicago, United States. 2011. 〈inria-00585694〉
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https://hal.inria.fr/inria-00585694/file/ISBI_2011_paperReady.pdf BibTex
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Emmanuel Olivi, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc. Handling white-matter anisotropy in BEM for the EEG forward problem. ISBI -8th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro – 2011, Mar 2011, Chicago, United States. IEEE, pp.799 – 802, 2011, Proceedings of the 8th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, ISBI 2011. 〈10.1109/ISBI.2011.5872526〉. 〈inria-00578876v2〉
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Pablo Barttfeld, Jorge Calvar, Sebastian Cukier, Rachid Deriche, Ramon Leiguarda, et al.. Large-scale network analysis reflects big-world characteristics in ASD. 17th Annual Meeting of the Organization on Human Brain Mapping, 2011, Quebec City, Canada. 2011. 〈hal-00789730〉
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Maureen Clerc, Jean-Michel Badier, Emmanuel Olivi, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo. OpenMEEG for calibrating the conductivity of nested compartment models. EIT conference, 2011, Bath, United Kingdom. 2011. 〈hal-00789731〉
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HDR

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Théodore Papadopoulo. Contributions and perspectives to computer vision, image processing and EEG/MEG data analysis. Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV]. Université Nice Sophia Antipolis, 2011. 〈tel-00847782〉
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Poster

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Demian Wassermann, Anne-Charlotte Philippe, Pablo Barttfeld, Bruno Wicker, Mariano Sigman, et al.. Tract-based statistical analyzes in dMRI in autism spectrum disorder. 17th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2011, Quebec, Canada. 〈hal-00649766〉
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Emmanuel Olivi, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc. Adjoint method for lead-fields computation in MEEG.. HBM’2011, Jun 2011, Québec City, Canada. 〈inria-00603769〉
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Rapport

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Joan Fruitet, Alexandra Carpentier, Rémi Munos, Maureen Clerc. Automatic motor task selection via a bandit algorithm for a brain-controlled button. [Rapport de recherche] RR-7721, INRIA. 2011. 〈inria-00624686〉
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Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Théodore Papadopoulo. Source localization using rational approximation on plane sections. [Research Report] RR-7704, INRIA. 2011, pp.29. 〈inria-00613644v2〉
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Thèse

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Emmanuel Olivi. Coupling of numerical methods for the forward problem in Magneto- and Electro-Encephalography. Numerical Analysis [cs.NA]. Université Nice Sophia Antipolis, 2011. English. 〈tel-00838707〉
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Aurobrata Ghosh. High Order Models in Diffusion MRI and Applications. Traitement du signal et de l’image. Université Nice Sophia Antipolis, 2011. Français. 〈tel-00645820〉
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2010

Article dans une revue

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Benoit Cottereau, Jean Lorenceau, Alexandre Gramfort, Maureen Clerc, Bertrand Thirion, et al.. Phase delays within visual cortex shape the response to steady-state visual stimulation.. NeuroImage, Elsevier, 2010, 54 (3), pp.1919-1929. 〈10.1016/j.neuroimage.2010.10.004〉. 〈inria-00526019〉
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Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Sylvain Baillet, Maureen Clerc. Tracking cortical activity from M/EEG using graph-cuts with spatiotemporal constraints.. NeuroImage, Elsevier, 2010, epub ahead of print. 〈10.1016/j.neuroimage.2010.09.087〉. 〈inria-00526020〉
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Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc. OpenMEEG: opensource software for quasistatic bioelectromagnetics. BioMedical Engineering OnLine, BioMed Central, 2010, 9 (1), pp.45. 〈http://www.biomedical-engineering-online.com/content/9/1/45〉. 〈10.1186/1475-925X-9-45〉. 〈inria-00467061v2〉
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Thomas Brox, Mikaël Rousson, Rachid Deriche, Joachim Weickert. Colour, texture, and motion in level set based segmentation and tracking.. Image and Vision Computing, Elsevier, 2010, 28 (3), pp.376-390. 〈10.1016/j.imavis.2009.06.009〉. 〈hal-00531465〉
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Joan Fruitet, Dennis J Mcfarland, Jonathan R Wolpaw. A comparison of regression techniques for a two-dimensional sensorimotor rhythm-based brain-computer interface.. Journal of Neural Engineering, IOP Publishing, 2010, 7 (1), pp.16003. 〈10.1088/1741-2560/7/1/016003〉. 〈inria-00498774〉
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Demian Wassermann, L. Bloy, E. Kanterakis, R. Verma, Rachid Deriche. Unsupervised white matter fiber clustering and tract probability map generation: Applications of a Gaussian process framework for white matter fibers. NeuroImage, Elsevier, 2010, 51 (1), pp.228-241. 〈10.1016/j.neuroimage.2010.01.004〉. 〈inria-00496898〉
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Alexandre Gramfort, Renaud Keriven, Maureen Clerc. Graph-Based Variability Estimation in Single-Trial Event-Related Neural Responses. IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2010, 57 (5), pp.1051 – 1061. 〈10.1109/TBME.2009.2037139〉. 〈inria-00497023〉
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Sylvain Vallaghé, Théodore Papadopoulo. A Trilinear Immersed Finite Element Method for Solving the Electroencephalography Forward Problem. SIAM Journal on Scientific Computing, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2010, 32 (4), pp.2379-2394. 〈http://link.aip.org/link/?SCE/32/2379/1〉. 〈10.1137/09075038X〉. 〈inria-00536265〉
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Communication dans un congrès

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Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. Model-free and Analytical EAP Reconstruction via Spherical Polar Fourier Diffusion MRI. Tianzi Jiang and Nassir Navab and Josien P. W. Pluim and Max A. Viergever. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI, Sep 2010, Beijing, China. Springer, 6361 – Part I, pp.590-597, 2010, Lecture Notes in Computer Science – LNCS. 〈10.1007/978-3-642-15705-9_72〉. 〈inria-00496932〉
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Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche, Tianzi Jiang. Model-Free, Regularized, Fast, and Robust Analytical Orientation Distribution Function Estimation. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2010, Sep 2010, Beijing, China. 2010. 〈inria-00496929〉
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Demian Wassermann, Efstathios Kanterakis, Ruben C. Gur, Rachid Deriche, Ragini Verma. Diffusion-based population statistics using tract probability maps. Jiang, Tianzi and Navab, Nassir and Pluim, Josien P.W. and Viergever, Max A. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI, Sep 2010, Beijing, China. Springer-Verlag, 6361, pp.631-639, 2010, Lecture Notes in Computer Science – LNCS. 〈10.1007/978-3-642-15705-9_77〉. 〈hal-00849707〉
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Sylvain Merlet, Rachid Deriche. Compressed Sensing for Accelerated EAP Recovery in Diffusion MRI. MICCAI, Sep 2010, Pekin, China. pp.Page 14, 2010. 〈inria-00536278〉
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Joan Fruitet, Maureen Clerc. Reconstruction of cortical sources activities for online classification of electroencephalographic signals.. EMBC 2010, Aug 2010, Buenos Aires, Argentina. 2010. 〈inria-00498768〉
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Caroline Malherbe, E. Bardinet, Arnaud Messé, Vincent Perlbarg, Guillaume Marrelec, et al.. A bootstrap method to improve brain subcortical network segregation in resting-state fMRI data. COMPSTAT – 19th international symposium on computational statistics – 2010, Aug 2010, Paris, France. Springer, pp.1335-1342, 2010, Proceedings of the 19th international symposium on computational statistics. 〈inria-00538258〉
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Nicole Voges, Solenna Blanchard, Fabrice Wendling, Olivier David, Habib Benali, et al.. Application of a hemodynamic model to epileptic spikes. Cinquième conférence plénière française de Neurosciences Computationnelles, “Neurocomp’10”, Aug 2010, Lyon, France. 〈hal-00553405〉
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Nicole Voges, Solenna Blanchard, Fabrice Wendling, Habib Benali, Olivier David, et al.. Investigation of BOLD responses to epileptic spikes: a combined modeling and data analysis approach. Human Brain Mapping, Jun 2010, Barcelonna, Spain. 2010. 〈hal-00849610〉
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Sylvain Vallaghé, Théodore Papadopoulo. A trilinear immersed FEM for solving the EEG forward problem. ECCM IV – IV European Congress on Computational Mechanics: Solids, Structures and Coupled Problems in Engineering, May 2010, Paris, France. 2010. 〈hal-00789728〉
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Aurobrata Ghosh, Evren Ozarslan, Rachid Deriche. Challenges in Reconstructing the Propagator via a Cumulant Expansion of the One-Dimensional q-space MR Signal. Proceedings ISMRM, May 2010, Stockholm, Sweden. 2010. 〈inria-00496885〉
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Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Emmanuel Olivi, Théodore Papadopoulo. The symmetric BEM: bringing in more variables for better accuracy. Supek, Selma and Susac, Ana. Biomag 2010, May 2010, Dubrovnik, Croatia. Springer, 28, pp.109-112, 2010, Advances in Biomagnetism. 〈http://www.springerlink.com/content/tq30518q02762u52/fulltext.pdf〉. 〈10.1007/978-3-642-12197-5_21〉. 〈inria-00497081〉
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Sylvain Baillet, Richard Leahy, François Tadel, John Mosher, Arnaud Delorme, et al.. Academic Software Toolboxes for the Analysis of MEG Data. Supek, Selma and Susac, Ana. Biomag 2010, May 2010, Dubrovnik, Croatia. Springer, 28, pp.101-104, 2010, IFMBE Proceedings. 〈http://www.springerlink.com/content/w02m0814u77122j3/?p=022fbc1435c049e5a4b5fc5c1fa124fc&pi=0〉. 〈inria-00497071〉
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Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. FAST AND CLOSED-FORM ENSEMBLE-AVERAGE-PROPAGATOR APPROXIMATION FROM THE 4TH-ORDER DIFFUSION TENSOR. The IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2010, Stockholm, Sweden. 2010. 〈inria-00496877〉
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Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Ryan Muetzel, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, et al.. Online orientation distribution function reconstruction in constant solid angle and its application to motion detection in HARDI. International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. 2010. 〈inria-00559884〉
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Emmanuel Olivi, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Domain decomposition for coupling finite and boundary element methods in EEG. Supek, Selma and Susac, Ana. Biomag 2010, Apr 2010, Dubrovnik, Croatia. Springer, 28, pp.120-123, 2010, IFMBE Proceedings. 〈http://www.springerlink.com/content/l81178685xj4788h/fulltext.pdf〉. 〈10.1007/978-3-642-12197-5_24〉. 〈inria-00497099〉
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Théodore Papadopoulo, Sylvain Vallaghé, Maureen Clerc. The adjoint method for general EEG and MEG sensor-based lead field equations. Supek, Selma and Susac, Ana. Biomag 2010 – 17th International Conference on Biomagnetism, Mar 2010, Dubrovnik, Croatia. Springer, 28, pp.105-108, 2010, IFMBE Proceedings. 〈http://www.springerlink.com/content/m356045q457k2715/fulltext.pdf〉. 〈10.1007/978-3-642-12197-5_20〉. 〈inria-00497088〉
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Demian Wassermann, Julien Cohen-Adad, Stéphane Lehericy, Habib Benali, Serge Rossignol, et al.. Fully Automated Straightening of the Spinal Cord using Fiber Tractography. 18th. International Symposium on Magnetic Resonance in Medicine, 2010, Stockholm, Sweden. 2010. 〈inria-00496905〉
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Demian Wassermann, Julien Cohen-Adad, Stéphane Lehericy, Habib Benali, Serge Rossignol, et al.. STRAIGHTENING THE SPINAL CORD USING FIBER TRACTOGRAPHY. International Symposium on Biomedical Imaging, 2010, rotterdam, Netherlands. 2010. 〈inria-00496908〉
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Arnaud Messé, Guillaume Marrelec, Mélanie Pélégrini-Issac, Habib Benali. A spatial autoregressive model to link structure to function: a combined fMRI and DTI approach. Proceedings of the 16th International Conference on Functional Mapping of the Human Brain, 2010, Barcelone, Spain, Spain. 2010. 〈inria-00538284〉
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Arnaud Messé, C Delmaire, Yulia Worbe, Guillaume Marrelec, R Valabrègue, et al.. Connectivity-based delineation of basal ganglia using hierarchical classification. Proceedings of the 16th International Conference on Functional Mapping of the Human Brain, 2010, Barcelone, Spain, Spain. 2010. 〈inria-00538289〉
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L. Marrakchi-Kacem, F Poupon, P Roca, A Tucholka, C Delmaire, et al.. Probabilistic atlas of the connections between the basal ganglia and the cortex. Proceedings of the ISMRM 18th Annual Scientific Meeting and Exhibition, 2010, Stockholm, Sweden, Sweden. 2010. 〈inria-00538303〉
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Caroline Malherbe, Arnaud Messé, Mélanie Pélégrini-Issac, S Lehéricy, Habib Benali. Comparing functional and anatomical segregation in the basal ganglia using fMRI and fiber tracking. Proceedings of the 16th International Conference on Functional Mapping of the Human Brain, 2010, Barcelone, Spain, Spain. 2010. 〈inria-00538301〉
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M. Sharman, Julien Cohen-Adad, M Descoteaux, Arnaud Messé, Habib Benali, et al.. Impact of outliers in DTI and Q-Ball imaging — clinical implications and correction strategies. Proceedings of the ISMRM 18th Annual Scientific Meeting and Exhibition, 2010, Stockholm, Sweden, Sweden. 2010. 〈inria-00538304〉
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Emmanuel Olivi, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Domain decomposition for coupling finite and boundary element methods with non-matching grids in Electro-Encephalography. Proceedings of ECCM, 2010, Paris, France. 2010. 〈hal-00789727〉
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Maxime Descoteaux, Cheng Guan Koay, Peter J. Basser, Rachid Deriche. Analytical Q-Ball Imaging with Optimal Regularization. ISMRM 18th Scientific Meeting and Exhibition, 2010, Stockholm, Sweden. 2010. 〈hal-00789771〉
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Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. Fast, Model-Free , Analytical ODF Reconstruction from the Q-Space Signal. the Sixteenth Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), 2010, Barcelona, Spain. 2010. 〈inria-00497243〉
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Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. Riemannian Median and Its Applications for Orientation Distribution Function Computing. 18th Scientific Meeting and Exhibition of the (ISMRM), 2010, Stockholm, Sweden. 2010. 〈inria-00497246〉
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https://hal.inria.fr/inria-00497246/file/Riemannian_Median_for_ODF_ISMRM2010.pdf BibTex
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Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. Fast, model-free, analytical diffusion PDF profile estimation from the DWI signals. the Sixteenth Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), 2010, Barcelona, Spain. 2010. 〈inria-00497244〉
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https://hal.inria.fr/inria-00497244/file/PDF_OHBM2010.pdf BibTex

Poster

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Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc. OpenMEEG for M/EEG forward modeling: a comparison study. Human Brain Mapping, Jun 2010, Barcelone, Spain. 〈inria-00502745〉
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Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc. An empirical evaluation of free BEM solvers for M/EEG forward modeling. Biomag, May 2010, Dubrovnik, Croatia. 2010. 〈hal-00776674〉
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Thèse

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Arnaud Messé. Caractérisation de la relation structure-fonction dans le cerveau humain à partir de données d’IRM fonctionnelle et de diffusion : méthodes et applications cognitive et clinique. Neurosciences [q-bio.NC]. Université Nice Sophia Antipolis, 2010. Français. 〈tel-00845014〉
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Demian Wassermann. Automated In Vivo Dissection of White Matter Structures from Diffusion Magnetic Resonance Imaging. Medical Imaging. Université Nice Sophia Antipolis, 2010. English. 〈tel-00827022〉
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