Publications

Publications HAL du labo/EPI 106416

2023

Article dans une revue

ref_biblio: Gabriel Girard, Jonathan Rafael-Patiño, Raphaël Truffet, Dogu Baran Aydogan, Nagesh Adluru, et al.. Tractography passes the test: Results from the diffusion-simulated connectivity (disco) challenge. NeuroImage, 2023, 277, pp.1-11. ⟨10.1016/j.neuroimage.2023.120231⟩. ⟨hal-04390592⟩
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ref_biblio: Fabien Almairac, Petru Isan, Marie Onno, Théodore Papadopoulo, Lydiane Mondot, et al.. Identifying subcortical connectivity during brain tumor surgery: a multimodal study. Brain Structure and Function, 2023, 228 (3-4), pp.815-830. ⟨10.1007/s00429-023-02623-0⟩. ⟨hal-04391976⟩
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ref_biblio: Joan Belo, Maureen Clerc, Daniele Schön. The effect of familiarity on neural tracking of music stimuli is modulated by mind wandering. AIMS Neuroscience, 2023, 10 (4), pp.319-331. ⟨10.3934/Neuroscience.2023025⟩. ⟨hal-04357054⟩
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2022

Article dans une revue

ref_biblio: Pierre Stahl, Kai Dang, Clair Vandersteen, Nicolas Guevara, Maureen Clerc, et al.. Current distribution of distributed all-polar cochlear implant stimulation mode measured in-situ. PLoS ONE, 2022, 17 (10), pp.e0275961. ⟨10.1371/journal.pone.0275961⟩. ⟨hal-03893742⟩
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ref_biblio: Guillaume Theaud, Manon Edde, Matthieu Dumont, Clément Zotti, Mauro Zucchelli, et al.. DORIS: a diffusion MRI-based 10 tissue class deep learning segmentation algorithm tailored to improve anatomically-constrained tractography. Frontiers in Neuroimaging, 2022. ⟨hal-03694817⟩
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ref_biblio: Samuel Deslauriers-Gauthier, Mauro Zucchelli, Hiba Laghrissi, Rachid Deriche. A Riemannian Revisiting of Structure–Function Mapping Based on Eigenmodes. Frontiers in Neuroimaging, 2022, 1, ⟨10.3389/fnimg.2022.850266⟩. ⟨hal-03677975⟩
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ref_biblio: Isa Costantini, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier. An Anisotropic 4D Filtering Approach to Recover Brain Activation From Paradigm-Free Functional MRI Data. Frontiers in Neuroimaging, 2022, 1, pp.815423. ⟨10.3389/fnimg.2022.815423⟩. ⟨hal-03629113⟩
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ref_biblio: Daniel Martins, O. Dipasquale, K. Davies, E. Cooper, J. Tibble, et al.. Transcriptomic and cellular decoding of functional brain connectivity changes reveal regional brain vulnerability to pro- and anti-inflammatory therapies. Brain, Behavior, and Immunity, 2022, 102, pp.312-323. ⟨10.1016/j.bbi.2022.03.004⟩. ⟨hal-03608740⟩
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Communication dans un congrès

ref_biblio: Pierre Guetschel, Théodore Papadopoulo, Michael Tangermann. Embedding neurophysiological signals. Proceedings of the IEEE MetroXRAINE conference, Oct 2022, Roma, Italy. ⟨hal-03878615⟩
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ref_biblio: Aymene Mohammed Bouayed, Samuel Deslauriers-Gauthier, Mauro Zucchelli, Rachid Deriche. CNN and diffusion MRI’s 4th degree rotational invariants for Alzheimer’s disease identification. International Workshop on Learning with Imbalanced Domains: Theory and Applications, Sep 2022, Grenoble, France. ⟨hal-03740103⟩
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ref_biblio: Igor Carrara, Theodore Papadopoulo. On the use of augmented autocorrelation matrix for the classification of BCI-EEG. Neuromod Meeting 2022, Jun 2022, Nice, France. ⟨hal-03952649⟩
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Poster de conférence

ref_biblio: Sara Sedlar, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche, Théodore Papadopoulo. Shallow convolutional neural network with rank-1 Fourier domain weights for brain signal classification. Proceedings of SophIA 2022, Nov 2022, Sophia Antipolis, France. ⟨hal-03878709⟩
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ref_biblio: Aymene Mohammed Bouayed, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Localization of Brain Microstructure Changes Associated with Alzheimer’s Disease using Class Activation Maps. Soph.I.A Summit 2022 : fifth edition of the international AI conference, Nov 2022, Sophia Antipolis, France. Proceedings of SophIA 2022. ⟨hal-03879975⟩
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ref_biblio: Ludovic Corcos, Théodore Papadopoulo, Samuel Deslauriers-Gauthier. Forward modelling of M/EEG: Towards a new automatic head and brain tissue segmentation system. SophI.A 2022 : fifth international AI conference, Nov 2022, Sophia Antipolis, France. Proceedings of SophIA 2022. ⟨hal-03879971⟩
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ref_biblio: Aurora Rossi, Pierluigi Crescenzi, Samuel Deslauriers-Gauthier, Emanuele Natale. Hyperbolic Model Captures Temporal Small Worldness of Brain Dynamics. NeuroMod meeting 2022, Jun 2022, Antibes, France. . ⟨hal-03685173⟩
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ref_biblio: Aymene Mohammed Bouayed, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Rotation invariant features for Alzheimer’s disease identification using convolutional neural networks. NeuroMod Meeting 2022, Jun 2022, Antibes, France. pp.1-1. ⟨hal-03691436v3⟩
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ref_biblio: Igor Carrara, Senellart Agathe Senellart, Théodore Papadopoulo. On the use of the “Augmented” autocovariance matrix for the classification of BCI-EEG. Proceedings of Cortico Days, Mar 2022, Autrans, France. ⟨hal-03878705⟩
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Thèse

ref_biblio: Sara Sedlar. Domain specific convolutional neural networks for dMRI and M/EEG signal analysis. Medical Imaging. Université Côte d’Azur, 2022. English. ⟨NNT : 2022COAZ4106⟩. ⟨tel-03946862v2⟩
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ref_biblio: Joan Belo. Auditory attention analysis during music listening : making the link between machine learning, electrophysiology and cognition. Computer science. Université Côte d’Azur, 2022. English. ⟨NNT : 2022COAZ4086⟩. ⟨tel-03957453v2⟩
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ref_biblio: Ivana Kojčić. Reconstruction of cortical activity from MEG data using brain networks and transmission delays estimated from dMRI. Medical Imaging. Université Côte d’Azur, 2022. English. ⟨NNT : 2022COAZ4070⟩. ⟨tel-03944354v3⟩
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ref_biblio: Côme Le Breton. Usability of phase synchrony neuromarkers in neurofeedback protocols for epileptic seizures reduction. Signal and Image Processing. Université Côte d’Azur, 2022. English. ⟨NNT : 2022COAZ4058⟩. ⟨tel-03946762⟩
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Pré-publication, Document de travail

ref_biblio: Sarah Mouffok. A revisiting of structure-function mapping using Graph Convolutional Networks. 2022. ⟨hal-03766992⟩
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2021

Article dans une revue

ref_biblio: Alberto de Luca, Andrada Ianus, Alexander Leemans, Marco Palombo, Noam Shemesh, et al.. On the generalizability of diffusion MRI signal representations across acquisition parameters, sequences and tissue types: chronicles of the MEMENTO challenge. NeuroImage, 2021, 240, pp.118367. ⟨10.1016/j.neuroimage.2021.118367⟩. ⟨hal-03172123⟩
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ref_biblio: Elizabeth Levitis, Cassandra Gould van Praag, Remi Gau, Stephan Heunis, Elizabeth Dupre, et al.. Centering inclusivity in the design of online conferences – An OHBM – Open Science perspective. GigaScience, 2021, 10 (8), ⟨10.1093/gigascience/giab051⟩. ⟨inserm-03221005⟩
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ref_biblio: Federica Cruciani, Lorenza Brusini, Mauro Zucchelli, Gustavo Retuci Pinheiro, Francesco Setti, et al.. Interpretable Deep Learning as a mean for decrypting disease signature in Multiple Sclerosis. Journal of Neural Engineering, 2021, ⟨10.1088/1741-2552/ac0f4b⟩. ⟨hal-02971374⟩
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ref_biblio: Matteo Frigo, Emilio Cruciani, David Coudert, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier, et al.. Network alignment and similarity reveal atlas-based topological differences in structural connectomes. Network Neuroscience, 2021, ⟨10.1162/netn_a_00199⟩. ⟨hal-03033777v2⟩
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ref_biblio: Joan Belo, Maureen Clerc, Daniele Schön. EEG-Based Auditory Attention Detection and Its Possible Future Applications for Passive BCI. Frontiers in Computer Science, 2021, 3, ⟨10.3389/fcomp.2021.661178⟩. ⟨hal-03215168⟩
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ref_biblio: Federica Turi, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Long multi-stage training for a motor-impaired user in a BCI competition. Frontiers in Human Neuroscience, 2021, 15, ⟨10.3389/fnhum.2021.647908⟩. ⟨hal-03192449⟩
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ref_biblio: Patryk Filipiak, Fabien Almairac, Théodore Papadopoulo, Denys Fontaine, Lydiane Mondot, et al.. Towards Linking Diffusion MRI based Macro-and Microstructure Measures with Cortico-Cortical Transmission in Brain Tumor Patients. NeuroImage, In press, ⟨10.1016/j.neuroimage.2020.117567⟩. ⟨hal-03015641⟩
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Communication dans un congrès

ref_biblio: Mauro Zucchelli, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Brain Tissue Microstructure Characterization Using dMRI Based Autoencoder Neural-Networks. MICCAI 2021 – 24th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2021, Strasbourg, France. ⟨10.1007/978-3-030-87615-9_5⟩. ⟨hal-03312453⟩
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ref_biblio: Sara Sedlar, Abib Alimi, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier. A spherical convolutional neural network for white matter structure imaging via dMRI. MICCAI 2021 – 24th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2021, Strasbourg / Virtual, France. pp.Pages 529-539, ⟨10.1007/978-3-030-87199-4_50⟩. ⟨hal-03307031⟩
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ref_biblio: Yang Ji, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Structure-Function Mapping via Graph Neural Networks. MLCN 2021 – 4th International Workshop on Machine Learning in Clinical Neuroimaging, Sep 2021, Strasbourg, France. pp.135-144, ⟨10.1007/978-3-030-87586-2_14⟩. ⟨hal-03352550⟩
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ref_biblio: Ivana Kojčić, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier. Incorporating transmission delays supported by diffusion MRI in MEG source reconstruction. ISBI 2021 – 18th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2021, Nice, France. ⟨10.1109/ISBI48211.2021.9433861⟩. ⟨hal-03143148⟩
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ref_biblio: Mauro Zucchelli, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Investigating the effect of DMRI signal representation on fully-connected neural networks brain tissue microstructure estimation. ISBI 2021 – 18th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2021, Nice / Virtual, France. ⟨10.1109/ISBI48211.2021.9434046⟩. ⟨hal-03174220⟩
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ref_biblio: Federica Cruciani, Lorenza Brusini, Mauro Zucchelli, Gustavo Retuci Pinheiro, Francesco Setti, et al.. Explainable 3D-CNN for Multiple Sclerosis patients stratification. ICPR 2020 – 25th International Conference on Pattern Recognition Workshops and Challenges, Jan 2021, Milan, Italy. ⟨10.1007/978-3-030-68796-0_8⟩. ⟨hal-02971361⟩
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Poster de conférence

ref_biblio: Daniel Diaz-Arce, Anis Ghouma, Pierre Guetschel, Théodore Papadopoulo, Massimo Mantegazza, et al.. Tools for convulsive seizures and interictal spikes detection. Congrès Labex ICST, Nov 2021, Nantes, France. ⟨hal-03540822⟩
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ref_biblio: Côme Le Breton, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc. Phase Synchrony Neurofeedback ? BEWARE !. NEC 2021 – Neuroergonomics Conference, Sep 2021, München, Germany. ⟨hal-03538875⟩
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ref_biblio: Sara Sedlar, Johann Benerradi, Côme Le Breton, Rachid Deriche, Théodore Papadopoulo, et al.. Rank-1 CNN for mental workload classification from EEG. Neuroergonomics conference, Sep 2021, Munich (virtual event), Germany. ⟨hal-03357020⟩
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Logiciel

ref_biblio: Matteo Frigo, Mauro Zucchelli, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier. TALON: Tractograms As Linear Operators in Neuroimaging. 2021, ⟨swh:1:dir:f25157ad1b13cb20ac3457d4f6756b49ac63d079;origin=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03116143;visit=swh:1:snp:465d89956196578717f4cb5155e456c279aa6a22;anchor=swh:1:rev:10247a14640a280b9140a27ce003d382d70cccac;path=/⟩. ⟨hal-03116143⟩
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Thèse

ref_biblio: Matteo Frigo. Computational Brain Connectivity Mapping : From Multi-Compartment Modeling To Network Topology Via Tractography Filtering. Signal and Image processing. Université Côte d’Azur, 2021. English. ⟨NNT : 2021COAZ4003⟩. ⟨tel-03273337⟩
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Pré-publication, Document de travail

ref_biblio: Matteo Frigo, Rutger H.J. Fick, Mauro Zucchelli, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Multi-Tissue Multi-Compartment Models of Diffusion MRI. 2021. ⟨hal-03125887⟩
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2020

Article dans une revue

ref_biblio: Maria Carla Piastra, Andreas Nüssing, Johannes Vorwerk, Maureen Clerc, Christian Engwer, et al.. A comprehensive study on electroencephalography and magnetoencephalography sensitivity to cortical and subcortical sources. Human Brain Mapping, 2020, ⟨10.1002/hbm.25272⟩. ⟨hal-03006797⟩
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ref_biblio: Abib Alimi, Samuel Deslauriers-Gauthier, Felix Matuschke, Andreas Müller, Sacha Ea Muenzing, et al.. Analytical and fast Fiber Orientation Distribution reconstruction in 3D-Polarized Light Imaging. Medical Image Analysis, 2020, 65, pp.101760. ⟨10.1016/j.media.2020.101760⟩. ⟨hal-03078848⟩
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ref_biblio: Samuel Deslauriers-Gauthier, Mauro Zucchelli, Matteo Frigo, Rachid Deriche. A Unified Framework for Multimodal Structure-function Mapping Based on Eigenmodes. Medical Image Analysis, 2020, pp.22. ⟨10.1016/j.media.2020.101799⟩. ⟨hal-02925913⟩
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ref_biblio: Samuel Deslauriers-Gauthier, Isa Costantini, Rachid Deriche. Non-invasive inference of information flow using diffusion MRI, functional MRI, and MEG. Journal of Neural Engineering, 2020, 17 (4), pp.19. ⟨10.1088/1741-2552/ab95ec⟩. ⟨hal-02925937⟩
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ref_biblio: Vinod Menon, Guillermo Gallardo, Mark Pinsk, Van-Dang Nguyen, Jing-Rebecca Li, et al.. Microstructural organization of human insula is linked to its macrofunctional circuitry and predicts cognitive control. eLife, 2020, 9, ⟨10.7554/eLife.53470⟩. ⟨hal-02864084⟩
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ref_biblio: Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo. Structural connectivity to reconstruct brain activation and effective connectivity between brain regions. Journal of Neural Engineering, 2020, 17 (3), pp.035006. ⟨10.1088/1741-2552/ab8b2b⟩. ⟨hal-02945585⟩
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ref_biblio: Mauro Zucchelli, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. A Computational Framework For Generating Rotation Invariant Features And Its Application In Diffusion MRI. Medical Image Analysis, 2020, ⟨10.1016/j.media.2019.101597⟩. ⟨hal-02370077⟩
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ref_biblio: Matteo Frigo, Samuel Deslauriers-Gauthier, Drew Parker, Abdol Aziz Ould Ismail, Junghoon John Kim, et al.. Diffusion MRI Tractography Filtering Techniques Change the Topology of Structural Connectomes. Journal of Neural Engineering, In press, ⟨10.1088/1741-2552/abc29b⟩. ⟨hal-02972198⟩
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Communication dans un congrès

ref_biblio: Samuel Deslauriers-Gauthier, Mauro Zucchelli, Rachid Deriche. Predicting brain functional connectivity from structural connectivity using fully connected neural networks. SophIA Summit, Nov 2020, Sophia-Antipolis, France. ⟨hal-03363622⟩
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ref_biblio: Mauro Zucchelli, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Fully-Connected Neural Network and Spherical-Harmonics Rotation Invariant Features improve the estimation of brain tissue microstructure in Diffusion MRI. SOPHI.A Summit 2020, Nov 2020, Sophia Antipolis, France. ⟨hal-02933646⟩
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ref_biblio: Ivana Kojčić, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier. Connectivity-informed M/EEG inverse problem. GRAIL 2020 – MICCAI Workshop on GRaphs in biomedicAl Image anaLysis, Oct 2020, Lima, Peru. ⟨hal-02986430⟩
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ref_biblio: Sara Sedlar, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier. Diffusion MRI fiber orientation distribution function estimation using voxel-wise spherical U-net. International MICCAI Workshop 2020 – Computational Diffusion MRI, Oct 2020, Lima, Peru. ⟨hal-02946371⟩
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ref_biblio: Guillermo Gallardo, Gaston Zanitti, Alfred Anwander, Mat Higger, Sylvain Bouix, et al.. Lesion-Robust White-Matter Bundle Identification through Diffusion Driven Label Fusion. ISMRM 2020 – 28th Annual Meeting & Exhibition, Aug 2020, Sydney / Virtual, Australia. ⟨hal-02478087⟩
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ref_biblio: Isa Costantini, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. A Paradigm Free Regularization Approach to Recover Brain Activations: Validation on Task fMRI. ISMRM 2020 – 28th Annual Meeting & Exhibition of the International Society for Magnetic Resonance in Medicine, Aug 2020, Sydney / Virtual, Australia. ⟨hal-03021387⟩
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ref_biblio: Patryk Filipiak, Fabien Almairac, Théodore Papadopoulo, Denys Fontaine, Lydiane Mondot, et al.. Diffusion MRI-based Connectivity Enriched with Microstructure Information Predicts the Propagation of Cortico-Cortical Evoked Potentials. ISMRM 2020 – 28th Annual Meeting & Exhibition of the International Society for Magnetic Resonance in Medicine, Aug 2020, Sydney / Virtual, Australia. ⟨hal-03008798⟩
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ref_biblio: Abib Alimi, Matteo Frigo, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Quantitative assessment of multi-scale tractography: bridging the resolution gap with 3D-PLI. ISMRM & SMRT Virtual Conference & Exhibition, Aug 2020, Virtual, France. ⟨hal-03048832⟩
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ref_biblio: Matteo Frigo, Mauro Zucchelli, Rutger H.J. Fick, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Multi-compartment modelling of diffusion MRI signal shows TE-based volume fraction bias. OHBM 2020 – 26th meeting of the Organization of Human Brain Mapping, Jun 2020, Montreal, Canada. ⟨hal-02925963⟩
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ref_biblio: Matteo Frigo, Rutger H.J. Fick, Mauro Zucchelli, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Multi Tissue Modelling of Diffusion MRI Signal Reveals Volume Fraction Bias. ISBI 2020 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2020, Iowa City, United States. ⟨10.1109/ISBI45749.2020.9098649⟩. ⟨hal-02473542⟩
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Poster de conférence

ref_biblio: Pierre Guetschel, Théodore Papadopoulo, Fabrice Duprat. EEG signal analysis for epileptic seizure genesis study. Soph.IA, Nov 2020, Sophia Antipolis, France. ⟨hal-03381680⟩
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ref_biblio: Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo. Using Structural Connectivity to Reconstruct Brain Activation and Effective Connectivity. Organization for Human Brain Mapping annual Meeting, Jun 2020, Montreal, Canada. , 2020. ⟨hal-02945690⟩
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ref_biblio: Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. A Unified Model for Structure–function Mapping Based on Eigenmodes. OHBM 2020 – Organisation for Humain Brain Mapping, Jun 2020, Montréal, Canada. ⟨hal-02925986⟩
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Thèse

ref_biblio: Federica Turi. User Adapted Brain-Computer Interface. Human-Computer Interaction [cs.HC]. Université Côte d’Azur, 2020. English. ⟨NNT : 2020COAZ4043⟩. ⟨tel-03149221v2⟩
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ref_biblio: Isa Costantini. Paradigm Free Regularization for fMRI Brain Activation Recovery. Signal and Image processing. Inria Sophia Antipolis – Méditerranée, Université Côte d’Azur, 2020. English. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-03021334⟩
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ref_biblio: Abib Alimi. Three-dimensional Polarized Light Imaging: Towards Multiscale and Multimodal Analysis with Diffusion Magnetic Resonance Imaging. Medical Imaging. Inria Sophia Antipolis – Méditerranée, Université Côte d’Azur, 2020. English. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-03078802⟩
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Pré-publication, Document de travail

ref_biblio: Aymene Mohammed Bouayed, Karim Atif, Rachid Deriche, Abdelhakim Saim. Improving Auto-Encoders’ self-supervised image classification using pseudo-labelling via data augmentation and the perceptual loss. 2020. ⟨hal-03046243⟩
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ref_biblio: Federica Turi, Nathalie T.H. Gayraud, Maureen Clerc. Auto-calibration of c-VEP BCI by word prediction. 2020. ⟨hal-02844024⟩
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2019

Article dans une revue

ref_biblio: Lang Chen, Demian Wassermann, Daniel Abrams, John Kochalka, Guillermo Gallardo-Diez, et al.. The visual word form area (VWFA) is part of both language and attention circuitry. Nature Communications, 2019, 10 (1), ⟨10.1038/s41467-019-13634-z⟩. ⟨hal-02401938⟩
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ref_biblio: Saugat Bhattacharyya, Maureen Clerc, Mitsuhiro Hayashibe. Augmenting Motor Imagery Learning for Brain–Computer Interfacing Using Electrical Stimulation as Feedback. IEEE Transactions on Medical Robotics and Bionics, 2019, 1 (4), pp.247-255. ⟨10.1109/TMRB.2019.2949854⟩. ⟨hal-02401304⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Rachid Deriche. The Dmipy Toolbox: Diffusion MRI Multi-Compartment Modeling and Microstructure Recovery Made Easy. Frontiers in Neuroinformatics, 2019, 13, ⟨10.3389/fninf.2019.00064⟩. ⟨hal-02400877⟩
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ref_biblio: Marco Pizzolato, Guillaume Gilbert, Jean-Philippe Thiran, Maxime Descoteaux, Rachid Deriche. Adaptive phase correction of diffusion-weighted images. NeuroImage, 2019, pp.116274. ⟨10.1016/j.neuroimage.2019.116274⟩. ⟨hal-02402015⟩
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ref_biblio: Samuel Deslauriers-Gauthier, Jean-Marc Lina, Russell Butler, Kevin Whittingstall, Pierre-Michel Bernier, et al.. White Matter Information Flow Mapping from Diffusion MRI and EEG. NeuroImage, 2019, ⟨10.1016/j.neuroimage.2019.116017⟩. ⟨hal-02187859⟩
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ref_biblio: Daniel Santana-Cedres, Luis Gomez, Agustin Trujillo, Miguel Aleman-Flores, Rachid Deriche, et al.. Supervised Classification of Fully PolSAR Images Using Active Contour Models. IEEE Geoscience and Remote Sensing Letters, 2019, 16 (7), pp.1165-1169. ⟨10.1109/LGRS.2019.2892524⟩. ⟨hal-02954675⟩
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ref_biblio: Sébastien Rimbert, Pierre Riff, Nathalie Gayraud, Denis Schmartz, Laurent Bougrain. Median Nerve Stimulation Based BCI: A New Approach to Detect Intraoperative Awareness During General Anesthesia. Frontiers in Neuroscience, 2019, 13, pp.13. ⟨10.3389/fnins.2019.00622⟩. ⟨hal-02159777⟩
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ref_biblio: Sébastien Rimbert, Nathalie T H Gayraud, Laurent Bougrain, Maureen Clerc, Stéphanie Fleck. Can a Subjective Questionnaire Be Used as Brain-Computer Interface Performance Predictor?. Frontiers in Human Neuroscience, 2019, 12, pp.11. ⟨10.3389/fnhum.2018.00529⟩. ⟨hal-01990935⟩
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ref_biblio: Kostiantyn Maksymenko, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Fast Approximation of EEG Forward Problem and Application to Tissue Conductivity Estimation. IEEE Transactions on Medical Imaging, In press, ⟨10.1109/TMI.2019.2936921⟩. ⟨hal-01890242v2⟩
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ref_biblio: Patryk Filipiak, Rutger H.J. Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, et al.. Reducing the number of samples in spatiotemporal dMRI acquisition design. Magnetic Resonance in Medicine, 2019, ⟨10.1002/mrm.27601⟩. ⟨hal-01928734⟩
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ref_biblio: Paul Görlach, Evelyne Hubert, Théo Papadopoulo. Rational invariants of even ternary forms under the orthogonal group. Foundations of Computational Mathematics, 2019, 19, pp.1315-1361. ⟨10.1007/s10208-018-9404-1⟩. ⟨hal-01570853v4⟩
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ref_biblio: Lauren J. O’Donnell, Alessandro Daducci, Demian Wassermann, Christophe Lenglet. Advances in computational and statistical diffusion MRI. NMR in Biomedicine, 2019, 32 (4), pp.e3805. ⟨10.1002/nbm.3805⟩. ⟨hal-02432249⟩
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Communication dans un congrès

ref_biblio: Sara Sedlar, Abib Alimi, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier. Spherical convolutional neural network for diffusion MRI analysis. SophIA Summit, Nov 2019, Sophia-Antipolis, France. ⟨hal-02948387⟩
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ref_biblio: Sébastien Rimbert, Philippe Guerci, Nathalie Gayraud, Claude Meistelman, Laurent Bougrain. Innovative Brain-Computer Interface based on motor cortex activity to detect accidental awareness during general anesthesia. IEEE SMC 2019 – IEEE International Conference on Systems, Man, and Cybernetics, Oct 2019, Bari, Italy. ⟨hal-02166934⟩
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ref_biblio: Federica Turi, Maureen Clerc. Adaptive parameter setting in a code modulated visual evoked potentials BCI. 8th Graz Brain-Computer Interface Conference 2019, Sep 2019, Graz, Austria. ⟨hal-02303562⟩
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ref_biblio: Isa Costantini, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Deconvolution of fMRI Data using a Paradigm Free Iterative Approach based on Partial Differential Equations. OHBM 2019 – Organization for Human Brain Mapping Annual Meeting, Jun 2019, Rome, Italy. ⟨hal-02071193⟩
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ref_biblio: Matteo Frigo, Samuel Deslauriers-Gauthier, Drew Parker, Abdol Aziz Ould Ismail, Junghoon John Kim, et al.. Effects of tractography filtering on the topology and interpretability of connectomes. OHBM 2019 – Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Roma, Italy. ⟨hal-02056641⟩
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ref_biblio: Isa Costantini, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Novel 4-D Algorithm for Functional MRI Image Regularization using Partial Differential Equations. ISMRM 2019 – 27th Annual Meeting of International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2019, Montréal, Canada. ⟨hal-02074345⟩
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ref_biblio: Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Estimation of Axon Conduction Delay, Conduction Speed, and Diameter from Information Flow using Diffusion MRI and MEG. ISMRM 2019 – 27th Annual Meeting of International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2019, Montreal, Canada. ⟨hal-02074059⟩
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ref_biblio: Abib Alimi, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Towards validation of diffusion MRI tractography: bridging the resolution gap with 3D Polarized Light Imaging. ISMRM 2019 – 27th Annual Meeting of International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2019, Montréal, Canada. ⟨hal-02070912⟩
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ref_biblio: Patryk Filipiak, Fabien Almairac, Théodore Papadopoulo, Denys Fontaine, Lydiane Mondot, et al.. Towards Validating Structural Connectivity in the Human Language System: An Intraoperative Cortico-Cortical Stimulation Experiment. 27th Annual ISMRM 2019 – Meeting & Exhibition of the International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2019, Montreal, Canada. ⟨hal-02476639v2⟩
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ref_biblio: Mauro Zucchelli, Drew Parker, Samuel Deslauriers-Gauthier, Junghoon John Kim, Ragini Verma, et al.. A Novel Characterization of Traumatic Brain Injury in White Matter with Diffusion MRI Spherical-Harmonics Rotation Invariants. ISMRM 2019 – 27th Annual Meeting of International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2019, Montreal, Canada. ⟨hal-02071315⟩
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ref_biblio: Patryk Filipiak, Rutger Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, et al.. Coarse-Grained Spatiotemporal Acquisition Design for Diffusion MRI. ISBI 2019 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. ⟨hal-01973588v2⟩
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ref_biblio: Marco Pizzolato, Rachid Deriche, Erick Jorge Canales-Rodriguez, Jean-Philippe Thiran. Spatially Varying Monte Carlo Sure for the Regularization of Biomedical Images. ISBI 2019 – IEEE 16th International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. pp.1639-1642, ⟨10.1109/ISBI.2019.8759338⟩. ⟨hal-02401132⟩
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ref_biblio: Abib Alimi, Samuel Deslauriers-Gauthier, Felix Matuschke, Daniel Schmitz, Markus Axer, et al.. Analytical Fiber ODF Reconstruction in 3D Polarized Light Imaging: Performance Assessment. ISBI 2019 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. ⟨hal-01988262⟩
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ref_biblio: Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Estimation of Axonal Conduction Speed and the Inter Hemispheric Transfer Time using Connectivity Informed Maximum Entropy on the Mean. SPIE Medical Imaging 2019, Feb 2019, San Diego, United States. ⟨hal-02063396⟩
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Mémoire d’étudiant

ref_biblio: Johann Benerradi. Mesure de l’attention auditive par électroencéphalographie. Informatique [cs]. 2019. ⟨hal-02285224⟩
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Poster de conférence

ref_biblio: Ivana Kojčić, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier. Connectivity–informed spatio–temporal MEG source reconstruction: Simulation results using a MAR model. Colloque Line Garnero, Oct 2019, Paris, France. ⟨hal-02379744⟩
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ref_biblio: Sofiane Guebba, Violaine Guy, Théodore Papadopoulo, Marianne Bruno, Maureen Clerc, et al.. Technology Brain Computer Interface for Autonomy: Patient-adapted ergonomic headset for dry-EEG P300 speller. 8th Graz Brain-Computer Interface Conference, Sep 2019, Graz, Austria. ⟨hal-03387284⟩
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ref_biblio: Fabien Lotte, Maureen Clerc, Aurélien Appriou, Amandine Audino, Camille Benaroch, et al.. Inria Research & Development for the Cybathlon BCI series. 8th Graz Brain-Computer Interface Conference 2019, Sep 2019, Graz, Austria. 2019. ⟨hal-02433970⟩
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ref_biblio: Ivana Kojčić, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier. Connectivity-informed solution for spatio-temporal M/EEG source reconstruction. NeuroMod 2019 – First meeting of the NeuroMod Institute, Jul 2019, Fréjus, France. ⟨hal-02279612⟩
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Thèse

ref_biblio: Kostiantyn Maksymenko. Novel algorithmic approaches for the forward and inverse M/EEG problems. Medical Imaging. COMUE Université Côte d’Azur (2015 – 2019), 2019. English. ⟨NNT : 2019AZUR4112⟩. ⟨tel-02404166v2⟩
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2018

Article dans une revue

ref_biblio: Thinhinane Megherbi, Gabriel Girard, Aurobrata Ghosh, Fatima Oulebsir-Boumghar, Rachid Deriche. Fiber orientation distribution function from non-negative sparse recovery with quantitative analysis of local fiber orientations and tractography using DW-MRI datasets. Magnetic Resonance Imaging, 2018, ⟨10.1016/j.mri.2018.10.003⟩. ⟨hal-01912555⟩
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ref_biblio: Mélissa Dali, Olivier Rossel, David Andreu, Laure Laporte, Alfredo Hernández, et al.. Model based optimal multipolar stimulation without a priori knowledge of nerve structure: application to vagus nerve stimulation. Journal of Neural Engineering, 2018, 15 (4), pp.046018. ⟨10.1088/1741-2552/aabeb9⟩. ⟨lirmm-01770039⟩
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ref_biblio: Valerie Sydnor, Ana María Rivas-Grajales, Amanda Lyall, Fan Zhang, Sylvain Bouix, et al.. A comparison of three fiber tract delineation methods and their impact on white matter analysis. NeuroImage, 2018, 178, pp.318-331. ⟨10.1016/j.neuroimage.2018.05.044⟩. ⟨hal-01807178⟩
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ref_biblio: Guillermo Gallardo, William Wells Iii, Rachid Deriche, Demian Wassermann. Groupwise structural parcellation of the whole cortex: A logistic random effects model based approach. NeuroImage, 2018, ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.01.070⟩. ⟨hal-01426625⟩
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ref_biblio: Fabien Lotte, Laurent Bougrain, Andrzej Cichocki, Maureen Clerc, Marco Congedo, et al.. A Review of Classification Algorithms for EEG-based Brain-Computer Interfaces: A 10-year Update. Journal of Neural Engineering, 2018, 15 (3), pp.55. ⟨10.1088/1741-2552/aab2f2⟩. ⟨hal-01846433⟩
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ref_biblio: Dalila Cherifi, Messaoud Boudjada, Abdelatif Morsli, Gabriel Girard, Rachid Deriche. Combining Improved Euler and Runge-Kutta 4th order for Tractography in Diffusion-Weighted MRI. Biomedical Signal Processing and Control, 2018, 41, pp.90 – 99. ⟨10.1016/j.bspc.2017.11.008⟩. ⟨hal-01928276⟩
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ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, et al.. Non-Parametric GraphNet-Regularized Representation of dMRI in Space and Time. Medical Image Analysis, 2018, 43, pp.37–53. ⟨10.1016/j.media.2017.09.002⟩. ⟨hal-01578296⟩
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ref_biblio: Susana Merino-Caviedes, Lucilio Cordero-Grande, Maria Teresa Perez, Pablo Casaseca-De-La-Higuera, Marcos Martín-Fernández, et al.. A Second Order Multi-Stencil Fast Marching Method with a Non-Constant Local Cost Model. IEEE Transactions on Image Processing, In press, pp.1. ⟨10.1109/TIP.2018.2880507⟩. ⟨hal-01921997⟩
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ref_biblio: Yi Hong, Lauren J O’Donnell, Peter Savadjiev, Fan Zhang, Demian Wassermann, et al.. Genetic load determines atrophy in hand cortico-striatal pathways in presymptomatic Huntington’s disease. Human Brain Mapping, In press, ⟨10.1002/hbm.24217⟩. ⟨hal-01787886v2⟩
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ref_biblio: Thomas Brochier, Romain Trachel, Maureen Clerc. Brain-computer interaction for online enhancement of visuospatial attention performance. Journal of Neural Engineering, In press, 15 (4), ⟨10.1088/1741-2552/aabf16⟩. ⟨hal-01794034⟩
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Communication dans un congrès

ref_biblio: Kostiantyn Maksymenko, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Data-driven cortical clustering to provide a family of plausible solutions to M/EEG inverse problem. iTWIST, Nov 2018, Marseille, France. ⟨hal-01946876⟩
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ref_biblio: Abib Alimi, Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Rachid Deriche. Dmipy, a Diffusion Microstructure Imaging toolbox in Python to improve research reproducibility. MICCAI 2018 – Workshop on Computational Diffusion MRI, Sep 2018, Granada, Spain. ⟨hal-01873353⟩
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ref_biblio: Matteo Frigo, Isa Costantini, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier. Resolving the crossing/kissing fiber ambiguity using Functionally Informed COMMIT. Computational Diffusion MRI 2018, Sep 2018, Granada, Spain. ⟨10.1007/978-3-030-05831-9⟩. ⟨hal-01864939⟩
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ref_biblio: Mauro Zucchelli, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. A Closed-Form Solution of Rotation Invariant Spherical Harmonic Features in Diffusion MRI. MICCAI – Computational Diffusion MRI Workshop 2018, Sep 2018, Granada, Spain. ⟨hal-01912148⟩
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ref_biblio: Guillermo Gallardo, Nathalie Gayraud, Rachid Deriche, Maureen Clerc, Samuel Deslauriers-Gauthier, et al.. Solving the Cross-Subject Parcel Matching Problem using Optimal Transport. International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention 2018, Sep 2018, Granada, Spain. ⟨hal-01935684⟩
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ref_biblio: Samuel Deslauriers-Gauthier, Drew Parker, Francois Rheault, Rachid Deriche, Steven Brem, et al.. Edema-informed anatomically constrained particle filter tractography. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2018, Sep 2018, Granada, Spain. ⟨hal-01893110⟩
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ref_biblio: Isa Costantini, Patryk Filipiak, Kostiantyn Maksymenko, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. fMRI Deconvolution via Temporal Regularization using a LASSO model and the LARS algorithm. EMBC’18 – 40th International Engineering in Medicine and Biology Conference, Jul 2018, Honolulu, United States. ⟨hal-01855467⟩
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ref_biblio: Matteo Frigo, Guillermo Gallardo, Isa Costantini, Alessandro Daducci, Demian Wassermann, et al.. Reducing false positive connection in tractograms using joint structure-function filtering. OHBM 2018 – Organization for Human Brain Mapping, Jun 2018, Singapore, Singapore. pp.1-3. ⟨hal-01737434⟩
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ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Rachid Deriche. Mipy: An Open-Source Framework to improve reproducibility in Brain Microstructure Imaging. OHBM 2018 – Human Brain Mapping , Jun 2018, Singapore, Singapore. pp.1-4. ⟨hal-01722146⟩
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ref_biblio: Mauro Zucchelli, Maxime Descoteaux, Gloria Menegaz. Investigating Diffusion-MRI based neurite density estimation model dependency: an in-vivo study on the HCP dataset. ISMRM 2018 – International Society for Magnetic Resonance in Medicine, Jun 2018, Paris, France. ⟨hal-01831823⟩
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ref_biblio: Nathalie T H Gayraud, Guillermo Gallardo, Maureen Clerc, Demian Wassermann. Solving the Cross-Subject Parcel Matching Problem: Comparing Four Methods Using Extrinsic Connectivity. OHBM 2018, Jun 2018, Singapore, Singapore. ⟨hal-01737366v2⟩
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ref_biblio: Loïc Caroux, Eric Campo, Nadine Vigouroux, Eric Bourreau, Maureen Clerc, et al.. MAN : Mise en Place d’une Méthode d’Évaluation Croisée de l’Accès aux Ressources Numériques. HANDICAP, Jun 2018, Paris, France. pp.211-212. ⟨hal-01815554⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc. Conductivity models for functional neuroimaging. SIAM Conference on Imaging Science, Jun 2018, Bologna, Italy. ⟨hal-01888187⟩
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ref_biblio: Federica Turi, Nathalie T H Gayraud, Maureen Clerc. Zero-calibration cVEP BCI using word prediction: a proof of concept. BCI 2018 – 7th International BCI Meeting, May 2018, Pacific Grove, California, United States. ⟨hal-01878015⟩
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ref_biblio: Sébastien Rimbert, Nathalie Gayraud, Maureen Clerc, Stéphanie Fleck, Laurent Bougrain. Can the MIQ-RS questionnaire be used to estimate the performance of a MI-based BCI?. 2018 Seventh International BCI Meeting, May 2018, Pacific Grove, United States. ⟨hal-01889864⟩
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ref_biblio: Théodore Papadopoulo. Inverse source problems in electro- and magneto- encephalography. Inverse problems: modeling and simulation, May 2018, Paradise Bay, Malta. ⟨hal-01963644⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Abib Alimi, Yves Usson, Pierre-Simon Jouk, Gabrielle Michalowicz, Rachid Deriche. An Analytical Fiber ODF Reconstruction in 3D Polarized Light Imaging. ISBI 2018 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington, D.C., United States. pp.1-4. ⟨hal-01688789⟩
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Poster de conférence

ref_biblio: Kostiantyn Maksymenko, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Data-driven cortical clustering to provide a family of plausible solutions to the M/EEG inverse problem. BIOMAG 2018, Aug 2018, Philadelphia, United States. ⟨hal-01874281⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo. OpenMEEG software for forward problems, coping with non-nested geometries. International Conference on Biomagnetism, Aug 2018, Philadelphia, United States. ⟨hal-02077006⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Abib Alimi, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, et al.. Towards the assessment of myelination using time-dependent diffusion MRI indices. ISMRM 2018 – International Society for Magnetic Resonance in Medicine, Jun 2018, Paris, France. pp.1-4. ⟨hal-01723846⟩
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ref_biblio: Patryk Filipiak, Rutger H.J. Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, et al.. Spatio-Temporal dMRI Acquisition Design: Reducing the Number of Samples. ISMRM 2018, Jun 2018, Paris, France. ⟨hal-01719646⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Isa Costantini, Patryk Filipiak, Kostiantyn Maksymenko, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. L1-Norm Regularized Deconvolution of Functional MRI BOLD Signal. C@UCA, Jun 2018, Fréjus, France. ⟨hal-01855505⟩
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ref_biblio: Fabien Almairac, Patryk Filipiak, Lavinia Slabu, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, et al.. Bridging Brain Structure and Function by Correlating Structural Connectivity and Cortico-Cortical Transmission. 2nd C@UCA meeting, Jun 2018, Frejus, France. ⟨hal-01852956⟩
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ref_biblio: Demian Wassermann, Dang Van Nguyen, Guillermo Gallardo, Jing-Rebecca Li, Weidong Cai, et al.. Sensing Von Economo Neurons in the Insula with Multi-shell Diffusion MRI. International Society for Magnetic Resonance in Medicine, 2018, Paris, France. ⟨hal-01807704⟩
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Thèse

ref_biblio: Guillermo Alejandro Gallardo Diez. Inferring and comparing structural parcellations of the human brain using diffusion MRI. Signal and Image processing. Université Côte d’Azur, 2018. English. ⟨NNT : 2018AZUR4233⟩. ⟨tel-02272039⟩
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ref_biblio: Nathalie Gayraud. Adaptive machine learning methods for event related potential-based brain computer interfaces. Signal and Image processing. Université Côte d’Azur, 2018. English. ⟨NNT : 2018AZUR4231⟩. ⟨tel-02100593⟩
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2017

Article dans une revue

ref_biblio: Klaus H Maier-Hein, Peter F. Neher, Christophe Houde, Marc-Alexandre Côté, Eleftherios Garyfallidis, et al.. The challenge of mapping the human connectome based on diffusion tractography. Nature Communications, 2017, 8 (1), ⟨10.1038/s41467-017-01285-x⟩. ⟨hal-01631578⟩
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ref_biblio: Tharindu Ganepola, Zoltan K. Nagy, Aurobrata Ghosh, Théodore Papadopoulo, Daniel C Alexander, et al.. Using diffusion MRI to discriminate areas of cortical grey matter. NeuroImage, 2017, pp.1-13. ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.12.046⟩. ⟨hal-01734650⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Uran Ferizi, Benoit Scherrer, Torben Schneider, Mohammad Alipoor, Odin Eufracio, et al.. Diffusion MRI microstructure models with in vivo human brain Connectom data: results from a multi-group comparison. NMR in Biomedicine, 2017, 30 (9), ⟨10.1002/nbm.3734⟩. ⟨hal-01500472⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Sebastian Hitziger, Maureen Clerc, Sandrine Saillet, Christian Bénar, Théodore Papadopoulo. Adaptive Waveform Learning: A Framework for Modeling Variability in Neurophysiological Signals. IEEE Transactions on Signal Processing, 2017, 65, pp.4324 – 4338. ⟨10.1109/TSP.2017.2698415⟩. ⟨hal-01548428⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Kostiantyn Maksymenko, Bernard Giusiano, Nicolas Roehri, Christian G. Bénar, Jean-Michel Badier. Strategies for statistical thresholding of source localization maps in magnetoencephalography and estimating source extent. Journal of Neuroscience Methods, 2017, 290, pp.95-104. ⟨10.1016/j.jneumeth.2017.07.015⟩. ⟨hal-03577165⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Marsel Mano, Elise Bannier, Fabien Lotte, et al.. Unimodal Versus Bimodal EEG-fMRI Neurofeedback of a Motor Imagery Task. Frontiers in Human Neuroscience, 2017, 11, ⟨10.3389/fnhum.2017.00193⟩. ⟨hal-01519755⟩
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ref_biblio: Marco Pizzolato, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Perfusion deconvolution in DSC-MRI with dispersion-compliant bases. Medical Image Analysis, 2017, 36, pp.197 – 215. ⟨10.1016/j.media.2016.12.001⟩. ⟨hal-01536292⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Isaiah Norton, Ibn Essayed, Fan Zhang, Sonia Pujol, Alex Yarmarkovich, et al.. SlicerDMRI: Open Source Diffusion MRI Software for Brain Cancer Research. Cancer Research, 2017, ⟨10.1158/0008-5472.CAN-17-0332⟩. ⟨hal-01564088⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Violaine Guy, M. H. Soriani, Mariane Bruno, Théodore Papadopoulo, Claude Desnuelle, et al.. Brain computer interface with P300-Speller: usability for disabled patients with Amyotrophic Lateral Sclerosis.. Annals of Physical and Rehabilitation Medicine, 2017. ⟨hal-01562276⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Gabriel Girard, Alessandro Daducci, Laurent Petit, Jean-Philippe Thiran, Kevin Whittingstall, et al.. AxTract: Toward Microstructure Informed Tractography. Human Brain Mapping, 2017, 38 (11), pp.5485-5500. ⟨10.1002/hbm.23741⟩. ⟨hal-01564041⟩
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Communication dans un congrès

ref_biblio: Guillermo Gallardo, Nathalie Thérèse Hélène Gayraud, Maureen Clerc, Demian Wassermann. Matching parcellations using Optimal Transport: a proof of concept. Computational Brain Connectivity Mapping – Winter School Workshop 2017, Nov 2017, Juan-les-Pins, France. ⟨hal-01713345⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Matteo Frigo, Muhamed Barakovic, Jean-Philippe Thiran, Alessandro Daducci. Hierarchical Tractography Optimisation. CoBCoM 2017 – Computational Brain Connectivity Mapping Winter School Workshop, Nov 2017, Juan les Pins, France. pp.1. ⟨hal-01712474⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Nathalie T. H. Gayraud, Alain Rakotomamonjy, Maureen Clerc. Optimal Transport Applied to Transfer Learning For P300 Detection. BCI 2017 – 7th Graz Brain-Computer Interface Conference, Sep 2017, Graz, Austria. pp.6. ⟨hal-01556603⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Samuel Deslauriers-Gauthier, Jean-Marc Lina, Russell Butler, Pierre-Michel Bernier, Kevin Whittingstall, et al.. Inference and Visualization of Information Flow in the Visual Pathway using dMRI and EEG. MICCAI 2017 Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2017, Québec, Canada. ⟨hal-01556352⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Patryk Filipiak, Rutger H.J. Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, et al.. Spatio-Temporal dMRI Acquisition Design: Reducing the Number of $q\tau$ Samples Through a Relaxed Probabilistic Model. MICCAI 2017 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI 2017), Sep 2017, Québec City, Canada. ⟨hal-01562617v3⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Christos Papageorgakis, Sebastian Hitziger, Théodore Papadopoulo. Dictionary Learning for Multidimensional Data. Proceedings of GRETSI 2017, Sep 2017, Juan-les-Pins, France. ⟨hal-01575263⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Emmanuel Olivi, Théodore Papadopoulo. OpenMEEG software for forward problems handling non-nested geometries. BaCI Conference 2017: International Conference on Basic and Clinical Multimodal Imaging, Aug 2017, Bern, Switzerland. ⟨hal-01581710⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo. Spatial regularization based on dMRI to solve EEG/MEG inverse problem. EMBC 2017 – 39th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society , Jul 2017, Jeju, South Korea. ⟨hal-01533396⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Lang Chen, Demian Wassermann, John Kochalka, Vinod Menon. Concordance between white-matter pathways and functional circuits linking the VWFA and IPS. Organisation for the Human Brain Mapping, Jul 2017, Vancouver, Canada. ⟨hal-01558273⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Guillermo Gallardo, Demian Wassermann, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux, Samuel Deslauriers-Gauthier. Information Flow in the White Matter During a Motor Task: A Structural Connectivity Driven Approach. OHBM 2017 Organization for Human Brain Mapping Annual Meeting, Jun 2017, Vancouver, Canada. ⟨hal-01534978⟩
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ref_biblio: Guillermo Gallardo, Rachid Deriche, Demian Wassermann. A Novel Atlas of Human Cerebral Cortex based on Extrinsic Connectivity. OHBM 2017 – Organization for Human Brain Mapping 2017 Annual Meeting, Jun 2017, Vancouver, Canada. ⟨hal-01533516v2⟩
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ref_biblio: Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo. Large brain effective network from EEG/MEG data and dMR information. PRNI 2017 – 7th International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2017, Toronto, Canada. ⟨hal-01533445⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Christos Papageorgakis. Inverse conductivity recovery problem in a spherical geometry from EEG data: uniqueness, reconstruction and stability results. TAMTAM 2017 – 8ème colloque, Tendances dans les Applications Mathématiques en Tunisie Algérie Maroc, May 2017, Hammamet, Tunisia. pp.1. ⟨hal-01526931⟩
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ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, et al.. Multi-Spherical Diffusion MRI: An in-vivo Test- Retest Study of Time-Dependent q-space Indices. ISMRM: 25th Annual Meeting & Exhibition, Apr 2017, Honolulu, United States. ⟨hal-01468214⟩
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ref_biblio: Abib O. Y. Alimi, Marco Pizzolato, Rutger H.J. Fick, Rachid Deriche. Solving the Inclination Sign Ambiguity in Three Dimensional Polarized Light Imaging with a PDE-Based Method. ISBI 2017 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2017, Melbourne, Australia. ⟨hal-01533363⟩
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ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Neda Sepasian, Marco Pizzolato, Andrada Ianus, Rachid Deriche. Assessing the Feasibility of Estimating Axon Diameter using Diffusion Models and Machine Learning. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2017, Melbourne, Australia. ⟨hal-01451664⟩
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ref_biblio: Nahuel Lascano, Guillermo Gallardo, Rachid Deriche, Dorian Mazauric, Demian Wassermann. Extracting the Groupwise Core Structural Connectivity Network: Bridging Statistical and Graph-Theoretical Approaches. Information Processing in Medical Imaging, 2017, Boone, United States. ⟨10.1007/978-3-319-59050-9_30⟩. ⟨hal-01426870v3⟩
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Poster de conférence

ref_biblio: Kostiantyn Maksymenko, Théodore Papadopoulo, Samuel Deslauriers-Gauthier. White matter fiber bundles as a source model in the MEG inverse problem. COBCOM 2017 – Computational Brain Connectivity Mapping, Winter School Workshop, Nov 2017, Juan-les-Pins, France. 2017. ⟨hal-01713075⟩
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ref_biblio: Abib O. Y. Alimi, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche. Regularizing the ODF estimate with the Laplace-Beltrami operator in 3D Polarized Light Imaging. CoBCoM 2017 – Computational Brain Connectivity Mapping Winter School Workshop, Nov 2017, Juan-les-Pins, France. , pp.1. ⟨hal-01659253⟩
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ref_biblio: Isa Costantini, Patryk Filipiak, Kostiantyn Maksymenko, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier. Deconvolution of fMRI BOLD signal in time-domain using an exponential operator and Lasso optimization. CoBCoM 2017 – Computational Brain Connectivity Mapping Winter School Workshop, Nov 2017, Juan Les Pins, France. ⟨hal-01713304⟩
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ref_biblio: Anne-Charlotte Philippe, Sophie Lavault, Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Romain Valabregue, et al.. Brain correlates of apathy in Kleine Levin syndrome: a mean apparent propagator study. International Symposium for Magnetic Resonance in Medicine, May 2017, Honolulu, United States. ⟨hal-01558278⟩
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Thèse

ref_biblio: Kai Dang. Electrical conduction models for cochlear implant stimulation. Other. Université Côte d’Azur, 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4043⟩. ⟨tel-01562277v2⟩
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ref_biblio: Brahim Belaoucha. Using diffusion MR information to reconstruct networks of brain activations from MEG and EEG measurements. Other. Université Côte d’Azur, 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4027⟩. ⟨tel-01534876v2⟩
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ref_biblio: Marco Pizzolato. Computational diffusion & perfusion MRI in brain imaging. Other. Université Côte d’Azur, 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4017⟩. ⟨tel-01536335v2⟩
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ref_biblio: Rutger Fick. Advanced dMRI signal modeling for tissue microstructure characterization. Other. COMUE Université Côte d’Azur (2015 – 2019), 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4006⟩. ⟨tel-01534104v2⟩
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Pré-publication, Document de travail

ref_biblio: Kostiantyn Maksymenko, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc. Fast Approximation of EEG Forward Problem and Application to Tissue Conductivity Estimation. 2017. ⟨hal-01563293⟩
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ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Rachid Deriche. Diffusion MRI Anisotropy: Modeling, Analysis and Interpretation. 2017. ⟨hal-01468675⟩
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2016

Article dans une revue

ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche. MAPL: Tissue Microstructure Estimation Using Laplacian-Regularized MAP-MRI and its Application to HCP Data. NeuroImage, 2016, 134, pp.365-385. ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.03.046⟩. ⟨hal-01291929⟩
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ref_biblio: Rachid Deriche. Computational Brain Connectivity Mapping: A Core Health and Scientific Challenge. Medical Image Analysis, 2016, ⟨10.1016/j.media.2016.06.003⟩. ⟨hal-01335669⟩
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ref_biblio: Saugat Bhattacharyya, Maureen Clerc, Mitsuhiro Hayashibe. A study on the effect of electrical stimulation as a user stimuli for motor imagery classification in Brain-Machine Interface. European Journal of Translational Myology, 2016, 26 (2), pp.165-168. ⟨10.4081/ejtm.2016.6041⟩. ⟨lirmm-01402537⟩
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ref_biblio: Sandrine Saillet, Pascale P. Quilichini, Antoine Ghestem, Bernard Giusiano, Anton I. Ivanov, et al.. Interneurons contribute to the hemodynamic/metabolic response to epileptiform discharges. Journal of Neurophysiology, 2016, 115 (3), pp.1157-1169. ⟨10.1152/jn.00994.2014⟩. ⟨hal-01431280⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: A. Pascarella, C. Todaro, Maureen Clerc, T. Serre, M. Piana. Source modeling of ElectroCorticoGraphy (ECoG) data: Stability analysis and spatial filtering. Journal of Neuroscience Methods, 2016, ⟨10.1016/j.jneumeth.2016.02.012⟩. ⟨hal-01278377⟩
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ref_biblio: Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. A survey of current trends in diffusion MRI for structural brain connectivity. Journal of Neural Engineering, 2016, 13 (1), pp.011001. ⟨10.1088/1741-2560/13/1/011001⟩. ⟨hal-01293828⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Christos Papageorgakis. Uniqueness result for an inverse conductivity recovery problem with application to EEG. 2016, 48. ⟨hal-01303640v2⟩
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ref_biblio: Demian Wassermann, Nikos Makris, Yogesh Rathi, Martha Shenton, Ron Kikinis, et al.. The white matter query language: a novel approach for describing human white matter anatomy. Brain Structure and Function, 2016, ⟨10.1007/s00429-015-1179-4⟩. ⟨hal-01247061⟩
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Communication dans un congrès

ref_biblio: Guillermo Gallardo, Rutger H.J. Fick, William Wells Ill, Rachid Deriche, Demian Wassermann. Groupwise Structural Parcellation of the Cortex: A Sound Approach Based on Logistic Models. CDMRI 2016, Oct 2016, Athens, Greece. ⟨10.1007/978-3-319-54130-3_8⟩. ⟨hal-01358436⟩
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ref_biblio: Marco Pizzolato, Rutger H.J. Fick, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Noise Floor Removal via Phase Correction of Complex Diffusion-Weighted Images: Influence on DTI and q-space Metrics. Computational Diffusion MRI, Oct 2016, Athens, Greece. ⟨hal-01358770⟩
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ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, et al.. Multi-Spherical Diffusion MRI: Exploring Diffusion Time Using Signal Sparsity. MICCAI 2016 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI’16), Oct 2016, Athènes, Greece. ⟨hal-01354985⟩
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ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Madelaine Daianu, Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Russel E. Jacobs, et al.. Comparison of Biomarkers in Transgenic Alzheimer Rats Using Multi-shell Diffusion MRI. MICCAI 2016 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI’16), Oct 2016, Athènes, Greece. ⟨hal-01354981⟩
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ref_biblio: Nathalie T H Gayraud, Nathanael Foy, Maureen Clerc. A Separability Marker Based on High-Dimensional Statistics for Classification Confidence Assessment. IEEE International Conference on Systems, Man, and Cybernetics , Oct 2016, Budapest, Hungary. ⟨hal-01407759⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Saugat Bhattacharyya, Maureen Clerc, Mitsuhiro Hayashibe. A Study on the Effect of Electrical Stimulation During Motor Imagery Learning in Brain-Computer Interfacing. SMC: Systems, Man, and Cybernetics, Oct 2016, Budapest, Hungary. pp.2840-2845, ⟨10.1109/SMC.2016.7844670⟩. ⟨hal-01402794⟩
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ref_biblio: Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo. Iterative two-stage approach to estimate sources and their interactions . 20th International Conference on Biomagnetism (BIOMAG2016), Oct 2016, Seoul, South Korea. ⟨hal-01377967⟩
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ref_biblio: Théo Papadopoulo. Modelling thin tissue compartiments using the immersed FEM (continuous Galerkin). Biomag 2016 – 20th International Conference on Biomagnetism, Oct 2016, Seoul, South Korea. ⟨hal-01412820⟩
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ref_biblio: Gabriel Girard, Alessandro Daducci, Laurent Petit, Jean-Philippe Thiran, Kevin Whittingstall, et al.. Reducing Invalid Connections with Microstructure-Driven Tractography. ISMRM workshops: Breaking the Barriers of Diffusion MRI , Sep 2016, Lisbonne, Portugal. ⟨hal-01408737⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Demian Wassermann, Dorian Mazauric, Guillermo Gallardo-Diez, Rachid Deriche. Extracting the Core Structural Connectivity Network: Guaranteeing Network Connectedness Through a Graph-Theoretical Approach. MICCAI 2016, Sep 2016, Athens, Greece. ⟨hal-01333301v2⟩
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ref_biblio: Brahim Belaoucha, Mouloud Kachouane, Théodore Papadopoulo. Multivariate Autoregressive Model Constrained by Anatomical Connectivity to Reconstruct Focal Sources. 2016 38th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC), Aug 2016, Orlando, United States. ⟨hal-01357167⟩
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ref_biblio: Thinhinane Megherbi, Gabriel Girard, Maxime Descoteaux, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. Evaluation des méthodes d’extraction des orientations locales des faisceaux de fibres par analyse quantitative de la connectivité. Reconnaissance des Formes et l’Intelligence Artificielle (RFIA’16) , Jun 2016, Clermont-Ferrand, France. ⟨hal-01354106⟩
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ref_biblio: Gabriel Girard, Alessandro Daducci, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Demian Wassermann, et al.. Microstructure driven tractography in the human brain . Organization for Human Brain Mapping (OHBM)., Jun 2016, Geneva, Switzerland. ⟨hal-01408727⟩
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ref_biblio: Guillermo Gallardo, William Wells Ill, Rachid Deriche, Demian Wassermann. Efficient Population-Representative Whole-Cortex Parcellation Based on Tractography. Organization for Human Brain Mapping 2016 Annual Meeting, Jun 2016, Genève, Switzerland. ⟨hal-01408881v2⟩
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ref_biblio: Kai Dang, Pierre Stahl, Clair Vandersteen, Nicolas Guevara, Dan Gnansia, et al.. Evaluation of the current distribution of the hybrid common ground stimulation in cochlear implants. 9th International Symposium on Objective Measures in Auditory Implants (OMAI), Jun 2016, Szeged, Hungary. ⟨hal-01377653⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Christos Papageorgakis. On some inverse conductivity recovery problem in a sphere: Uniqueness and reconstruction results with applications to EEG. Problèmes Inverses, Contrôle et Optimisation de Formes (PICOF), Jun 2016, Autrans, France. ⟨hal-01410030⟩
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ref_biblio: Cecilia Lindig-León, Nathalie Gayraud, Laurent Bougrain, Maureen Clerc. Comparison of Hierarchical and Non-Hierarchical Classification for Motor Imagery Based BCI Systems. The Sixth International Brain-Computer Interfaces Meeting, May 2016, Pacific Groove, United States. ⟨hal-01287636⟩
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ref_biblio: Marco Pizzolato, Rutger H.J. Fick, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Improved Vascular Transport Function Characterization in DSC-MRI via Deconvolution with Dispersion-Compliant Bases. ISMRM 2016, May 2016, Singapore, Singapore. ⟨hal-01358775⟩
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ref_biblio: Marco Pizzolato, Rutger H.J. Fick, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Unveiling the Dispersion Kernel in DSC-MRI by Means of Dispersion-Compliant Bases and Control Point Interpolation Techniques. ISMRM 24th Annual Meeting, May 2016, Singapore, Singapore. ⟨hal-01408170⟩
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ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Mauro Zucchelli, Gloria Menegaz, et al.. A sensitivity analysis of q-space indices with respect to changes in axonal diameter, dispersion and tissue composition. 2016 International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2016, Prague, Czech Republic. ⟨hal-01292013⟩
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ref_biblio: Brahim Belaoucha, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Cortical Surface Parcellation via dMRI Using Mutual Nearest Neighbor Condition. 2016 IEEE 13th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2016, Prague, Czech Republic. pp.903–906. ⟨hal-01306239⟩
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ref_biblio: Marco Pizzolato, Timothé Boutelier, Rutger H.J. Fick, Rachid Deriche. Elucidating Dispersion Effects in Perfusion MRI by Means of Dispersion-Compliant Bases. International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2016, Prague, Czech Republic. ⟨10.1109/I978-1-4799-2349-6/16⟩. ⟨hal-01309243⟩
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ref_biblio: M. H. Soriani, Violaine Guy, Mariane Bruno, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc, et al.. Interface cerveau-ordinateur (BCI) : un moyen de communication alternative dans la SLA. Jnlf Nantes 2016 – Journées de Neurologie de langue française 2016, Apr 2016, Nantes, France. ⟨hal-01413326⟩
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ref_biblio: Demian Wassermann, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Rutger H.J. Fick, Anne-Charlotte Philippe, et al.. Quantifying White Matter Microstructure with a
Unified Spatio-Temporal Diffusion Weighted MRI
Continuous Representation. International Symposium of Magnetic Resonance in Medicine, 2016, Singapore, Singapore. ⟨hal-01406348⟩
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Chapitre d’ouvrage

ref_biblio: Maureen Clerc, Emmanuel Daucé, Jeremie Mattout. Adaptive Methods in Machine Learning. Brain-Computer Interfaces 1, Wiley-ISTE, 2016, 978-1-84821-826-0. ⟨hal-01409016⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc, Emmanuel Daucé, Jeremie Mattout. Méthodes adaptatives en apprentissage machine. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 1, ISTE, 2016, 978-1-78405-147-1. ⟨hal-01408906⟩
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ref_biblio: Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Fabien Lotte, Maureen Clerc, Christian Barillot. Brain training with neurofeedback. Brain-Computer Interfaces 1, Wiley-ISTE, 2016. ⟨hal-01413424⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte. Conclusion et perspectives. Les interfaces cerveau-ordinateur 2, ISTE, 2016, 978-1-78405-148-8. ⟨hal-01408972⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte. Conclusion and Perspectives. Brain-Computer Interfaces 2, Wiley-ISTE, 2016, 978-1-84821-963-2. ⟨hal-01409032⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte. Introduction. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Brain-Computer Interfaces 1, Wiley-ISTE, 2016, 978-1-84821-826-0. ⟨hal-01409001⟩
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ref_biblio: Nathanael Foy, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc. OpenViBE Illustration of a P300 Virtual Keyboard. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Brain-Computer Interfaces 2, Wiley-ISTE, 2016, 978-1-84821-963-2. ⟨10.1002/9781119332428.ch13⟩. ⟨hal-01409029⟩
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ref_biblio: Nathanael Foy, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc. Illustration OpenViBE d’un clavier virtuel P300. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 2, ISTE, 2016, 978-1-78405-148-8. ⟨hal-01408947⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc. Prétraitements de données d’électro-encéphalographie. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 1, 2016, 978-1-78405-148-8. ⟨hal-01402595⟩
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ref_biblio: Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Fabien Lotte, Maureen Clerc, Christian Barillot. Entraîner son cerveau avec le neurofeedback. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 1, ISTE editions, pp.277-292, 2016, 978-1-78406-147-0. ⟨hal-01413408⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte. Introduction. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 1, ISTE, 2016, Fondements et méthodes, 978-1-78405-148-8. ⟨hal-01402594⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc. Electroencephalography Data Preprocessing. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Brain-Computer Interfaces 1, Wiley-ISTE, 2016, 978-1-84821-826-0. ⟨10.1002/9781119144977.ch6⟩. ⟨hal-01409009⟩
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Ouvrages

ref_biblio: Marco Pizzolato, Timothé Boutelier, Rachid Deriche (Dir.). Effect of Phase Correction on DTI and q-space Metrics. International Society for Magnetic Resonance in Medicine, 2016. ⟨hal-01408421⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte. Brain-Computer Interfaces 1: Foundations and Methods. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Wiley-ISTE, 2016, Maureen Clerc, 978-1-84821-826-0. ⟨hal-01408991⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte (Dir.). Les interfaces Cerveau-Ordinateur 1 : Fondements et méthodes. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. ISTE, 2016, Maureen Clerc, 978-1-78405-147-1. ⟨hal-01402539⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte (Dir.). Les interfaces cerveau-ordinateur 2 : Technologie et applications. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. ISTE, 2016, 978-1-78405-148-8. ⟨hal-01402544⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte (Dir.). Brain-Computer Interfaces 2: Technology and Applications. Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Wiley-ISTE, 2016, Maureen Clerc. ⟨hal-01408998⟩
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Poster de conférence

ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, et al.. Multi-Spherical MRI: Breaking the Boundaries of Diffusion Time. ISMRM Workshop on: Breaking the Barriers of Diffusion MRI, Sep 2016, Lisbonne, Portugal. . ⟨hal-01360440⟩
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ref_biblio: Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Marsel Mano, Elise Bannier, Fabien Lotte, et al.. EEG-fMRI neurofeedback of a motor imagery task. Organization for Human Brain Mapping, Jun 2016, Genève, Switzerland. ⟨hal-01426182⟩
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Thèse

ref_biblio: Gabriel Girard. White matter tractography guided by anatomical and microstructural priors. Human health and pathology. Université Nice Sophia Antipolis; Université de Sherbrooke (Québec, Canada), 2016. English. ⟨NNT : 2016NICE4014⟩. ⟨tel-01369022⟩
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2015

Article dans une revue

ref_biblio: Lipeng Ning, Frederik Laun, Yaniv Gur, Edward V.R. Dibella, Samuel Deslauriers-Gauthier, et al.. Sparse Reconstruction Challenge for diffusion MRI: Validation on a physical phantom to determine which acquisition scheme and analysis method to use?. Medical Image Analysis, 2015, 26, pp.316-331. ⟨10.1016/j.media.2015.10.012⟩. ⟨hal-01240197⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Matthew Dyson, Eoin Thomas, Laurence Casini, Boris Burle. Online Extraction and Single Trial Analysis of Regions Contributing to Erroneous Feedback Detection. NeuroImage, 2015, 121, pp.146-158. ⟨10.1016/j.neuroimage.2015.06.041⟩. ⟨hal-01199206⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Jorg M. Portegies, Rutger H.J. Fick, Gonzalo R. Sanguinetti, Stephan Meesters, Gabriel Girard, et al.. Improving Fiber Alignment in HARDI by Combining Contextual PDE Flow with Constrained Spherical Deconvolution. PLoS ONE, 2015, 10 (10), ⟨10.1371/journal.pone.0138122⟩. ⟨hal-01242740⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Joy T Matsui, Jatin G Vaidya, Demian Wassermann, Regina Eunyoung Kim, Vincent A Magnotta, et al.. Prefrontal cortex white matter tracts in prodromal Huntington disease.. Human Brain Mapping, 2015, 36 (10), pp.3717-32. ⟨10.1002/hbm.22835⟩. ⟨hal-01152276⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Romain E. Trachel, Maureen Clerc, Thomas G. Brochier. Decoding covert shifts of attention induced by ambiguous visuospatial cues. Frontiers in Human Neuroscience, 2015, pp.9. ⟨10.3389/fnhum.2015.00358⟩. ⟨hal-01202766⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Tarik Zakaraia Benmerar, Mouloud Kachouane, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. A Hybrid SaaS/Grid Architecture for Diffusion MRI in Brain Imaging Field: SaaS as a New Access Model for Computation Grids. International Journal of Organizational and Collective Intelligence (IJOCI), 2015, 4 (4), pp.35. ⟨10.4018/ijoci.2014100102⟩. ⟨hal-01239760⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Dietsje Jolles, Demian Wassermann, Ritika Chokhani, Jennifer Richardson, Caitlin Tenison, et al.. Plasticity of left perisylvian white-matter tracts is associated with individual differences in math learning
Brain Structure and Function
. Brain Structure and Function, 2015, pp.15. ⟨10.1007/s00429-014-0975-6⟩. ⟨hal-01099660⟩
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ref_biblio: Eleftherios Garyfallidis, Omar Cepeda, Demian Wassermann, Maxime Descoteaux. Robust and efficient linear registration of white-matter fascicles in the space of streamlines
. NeuroImage, 2015, In press. ⟨10.1016/j.neuroimage.2015.05.016⟩. ⟨hal-01153043⟩
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Communication dans un congrès

ref_biblio: Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Tanguy Duval, Jennifer S. W. Campbell, Timothé Boutelier, et al.. A Temperature Phantom to Probe the Ensemble Average Propagator Asymmetry: an In-Silico Study. Computational Diffusion Magnetic Resonance Imaging, Oct 2015, Munich, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-28588-7_16⟩. ⟨hal-01218143⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Christos Papageorgakis, Sebastian Hitziger, Théodore Papadopoulo. Dictionary learning for M/EEG multidimensional data. International conference on basic and clinical multimodal imaging (BACI), Sep 2015, Utrecht, Netherlands. ⟨hal-01243284⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo. MEG/EEG reconstruction in the reduced source space. International Conference on Basic and Clinical Multimodal Imaging, Sep 2015, Utrecht, Netherlands. ⟨hal-01207169⟩
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ref_biblio: Brahim Belaoucha, Jean-Marc Lina, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. MEM-diffusion MRI framework to solve MEEG inverse problem. 2015 23rd European Signal Processing Conference (EUSIPCO), Aug 2015, Nice, France. ⟨hal-01207165⟩
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ref_biblio: Gabriel Girard, Rutger H.J. Fick, Maxime Descoteaux, Rachid Deriche, Demian Wassermann. AxTract: microstructure-driven tractography based on the ensemble average propagator. Information Processing in Medical Imaging, Jun 2015, Isle of Skye, United Kingdom. ⟨10.1007/978-3-319-19992-4_53⟩. ⟨hal-01152267⟩
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ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Marco Pizzolato, Rachid Deriche. A Unifying Framework for Spatial and Temporal Diffusion in Diffusion MRI. Information Processing in Medical Imaging (IPMI), Jun 2015, Sabhal Mor Ostaig, Isle of Skye, United Kingdom. ⟨hal-01140070⟩
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ref_biblio: Gabriel Girard, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Structural connectivity reproducibility through multiple acquisitions. Organization for Human Brain Mapping, Jun 2015, Honolulu, United States. ⟨hal-01174327⟩
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ref_biblio: Gabriel Girard, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Studying white matter tractography reproducibility through connectivity matrices. International Symposium on Magnetic Resonance in Medicine, May 2015, Toronto, Canada. ⟨hal-01174328⟩
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ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Mauro Zucchelli, Gabriel Girard, Gloria Menegaz, Maxime Descoteaux, et al.. How to get more out of a clinically feasible 64 Gradient dMRI Acquisition: Multi-Shell versus Single-Shell. International Society for Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM), May 2015, Toronto, Ontario, Canada. ⟨hal-01140076⟩
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ref_biblio: Kai Dang, Maureen Clerc, Clair Vandersteen, Nicolas Guevara, Dan Gnansia. In situ validation of a parametric model of electrical field distribution in an implanted cochlea. 7th International IEEE EMBS Conference on Neural Engineering, Apr 2015, Montpellier, France, France. ⟨10.1109/NER.2015.7146711⟩. ⟨hal-01242020⟩
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ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Mauro Zucchelli, Gabriel Girard, Maxime Descoteaux, Gloria Menegaz, et al.. Using 3D-SHORE and MAP-MRI to Obtain Both Tractography and Microstructural Constrast from a Clinical DMRI Acquisition. International Symposium on BIOMEDICAL IMAGING: From Nano to Macro, Apr 2015, Brooklyn, New York City, United States. ⟨hal-01140011⟩
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ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche. Laplacian-Regularized MAP-MRI: Improving Axonal Caliber Estimation. International Symposium on BIOMEDICAL IMAGING: From Nano to Macro, Apr 2015, Brooklyn, New York City, United States. ⟨hal-01140021⟩
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ref_biblio: Marco Pizzolato, Aurobrata Ghosh, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Perfusion MRI Deconvolution with Delay Estimation and Non-Negativity Constraints. International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2015, Brooklyn, New York, United States. ⟨10.1109/ISBI.2015.7164057⟩. ⟨hal-01143213⟩
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ref_biblio: Tobias Scheer, Fabien Mathy, Demian Wassermann. Sahin et al. (2009) en modalité non-invasive : expérience pilote et perspectives. Journée de l’axe MTC-NSC, 2015, Université Nice Sophia antipolis, Nice, France. ⟨hal-01359317⟩
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ref_biblio: Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Exploiting the Phase in Diffusion MRI for Microstructure Recovery: Towards Axonal Tortuosity via Asymmetric Diffusion Processes. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, 2015, Munich, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-24553-9_14⟩. ⟨hal-01152672⟩
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Chapitre d’ouvrage

ref_biblio: Fabien Lotte, Laurent Bougrain, Maureen Clerc. Electroencephalography (EEG)-based Brain-Computer Interfaces. Wiley Encyclopedia of Electrical and Electronics Engineering, Wiley, pp.44, 2015, ⟨10.1002/047134608X.W8278⟩. ⟨hal-01167515⟩
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Poster de conférence

ref_biblio: Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Exploiting the Phase in Diffusion MRI for Microstructure Recovery: Towards Axonal Tortuosity via Asymmetric Diffusion Processes. MICCAI 2015, Oct 2015, Munich, Germany. ⟨hal-01358805⟩
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ref_biblio: Christos Papageorgakis, Benjamin Lanfer, Maureen Clerc. Influence of skull modelling on conductivity estimation for EEG source analysis. International conference on basic and clinical multimodal imaging (BACI), Sep 2015, Utrecht, Netherlands. . ⟨hal-01244392⟩
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ref_biblio: Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Christos Papageorgakis. Inverse skull conductivity estimation problems from EEG data. 1st International Conference on Mathematical Neuroscience (ICMNS), Jun 2015, Juan-les-Pins, France. . ⟨hal-01243059⟩
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ref_biblio: Kai Dang, Clair Vandersteen, Nicolas Guevara, Maureen Clerc, Dan Gnansia. Realistic Simulation of Electric Potential Distributions of Different Stimulation Modes in an Implanted Cochlea. Association of Research in Otolaryngology 38th MidWinter Meeting, Feb 2015, Baltimore, United States. ⟨hal-01128098⟩
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Thèse

ref_biblio: Sebastian Hitziger. Modeling the variability of electrical activity in the brain. Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2015. English. ⟨NNT : 2015NICE4015⟩. ⟨tel-01175851⟩
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Vidéo

ref_biblio: Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Exploiting the Phase in Diffusion MRI for Microstructure Recovery: Towards Axonal Tortuosity via Asymmetric Diffusion Processes. 2015. ⟨medihal-01358880⟩
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2014

Article dans une revue

ref_biblio: Jian Cheng, Rachid Deriche, Jiang Tianzi, Dinggang Shen, Pew-Thian Yap. Non-Negative Spherical Deconvolution (NNSD) for estimation of fiber Orientation Distribution Function in single-/multi-shell diffusion MRI. NeuroImage, 2014, 11 (1), pp.750-764. ⟨hal-01078338⟩
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ref_biblio: Thinhinane Megherbi, Mouloud Kachouane, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. Crossing Fibers Detection with an Analytical High Order Tensor Decomposition. Computational and Mathematical Methods in Medicine, 2014, 2014, pp.1-18. ⟨hal-01078352⟩
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ref_biblio: Gabriel Girard, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Towards quantitative connectivity analysis: reducing tractography biases. NeuroImage, 2014, pp.266-278. ⟨10.1016/j.neuroimage.2014.04.074⟩. ⟨hal-00991846⟩
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ref_biblio: Alessandro Daducci, Erick Canales Rodgriguez, Maxime Descoteaux, Eleftherios Garyfallidis, Yaniv Gur, et al.. Quantitative comparison of reconstruction methods for intra-voxel fiber recovery from diffusion MRI. IEEE Transactions on Medical Imaging, 2014, 99, pp.384-399. ⟨10.1109/TMI.2013.2285500⟩. ⟨hal-00908289⟩
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ref_biblio: Michael Paquette, Sylvain Merlet, Guillaume Gilbert, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Comparison of sampling strategies and sparsifying transforms to improve compressed sensing diffusion spectrum imaging. Magnetic Resonance in Medicine, 2014, Article first published online: 29 JAN 2014. ⟨10.1002/mrm.25093⟩. ⟨hal-00945734⟩
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Communication dans un congrès

ref_biblio: Mouloud Kachouane, Thinhinane Megherbi, Sihem Zeggout, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. ODF’s maxima extraction using Particle Swarm Optimization. Biomedical. Biomedical Engineering International Conference, Oct 2014, Tlemcen, Algeria. ⟨hal-01239791⟩
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ref_biblio: Kai Dang, Maureen Clerc, Jonathan Laudanski. A 3D Model-based Simulation of the Electric Field During Cochlear Stimulation. 8th International Symposium on Objective Measures in Auditory Implants, Oct 2014, Toronto, Canada. ⟨hal-01103374⟩
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ref_biblio: Marco Pizzolato, Aurobrata Ghosh, Timothé Boutelier, Rachid Deriche. Magnitude and complex based diffusion signal reconstruction. CDMRI’14, Sep 2014, Boston, United States. ⟨10.1007/978-3-319-⟩. ⟨hal-01095127⟩
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ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche. An Analytical 3D Laplacian Regularized SHORE Basis and Its Impact on EAP Reconstruction and Microstructure Recovery. CD-MRI, Sep 2014, Boston, United States. ⟨hal-01095271⟩
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ref_biblio: Eoin Thomas, Emmanuel Daucé, Dieter Devlaminck, Loïc Mahé, Alexandra Carpentier, et al.. CoAdapt P300 speller: optimized flashing sequences and online learning. 6th International Brain Computer Interface Conference, Sep 2014, Graz, Austria. ⟨hal-01103441⟩
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ref_biblio: Théodore Papadopoulo, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. Complete Set of Invariants of a 4th Order Tensor: The 12 Tasks of HARDI from Ternary Quartics. {Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2014}, Sep 2014, Boston, United States. pp.233 – 240, ⟨10.1007/978-3-319-10443-0_30⟩. ⟨hal-01092492⟩
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ref_biblio: Thinhinane Megherbi, Aurobrata Ghosh, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. Fiber Orientation Distribution from Non-Negative Sparse Recovery. MICCAI 2014 Workshop on Computational Diffusion MRI, Sep 2014, Boston, United States. ⟨hal-01104163⟩
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ref_biblio: Brahim Belaoucha, Jean-Marc Lina, Maureen Clerc, Anne-Charlotte Philippe, Christophe Grova, et al.. Using diffusion MRI information in the Maximum Entropy on Mean framework to solve MEG/EEG inverse problem. The 19th International Conference on Biomagnetism, Aug 2014, Halifax, Canada. ⟨hal-01095785⟩
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ref_biblio: Brahim Belaoucha, Anne-Charlotte Philippe, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Diffusion Magnetic Resonance information as a regularization term for MEG/EEG inverse problem. The 19th International Conference on Biomagnetism, Aug 2014, Halifax, Canada. ⟨hal-01095449⟩
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ref_biblio: Rutger H.J. Fick, Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche. Extracting a biomarker for the mean cross-sectional area from the ODF. Human Brain Mapping, Jul 2014, Hamburg, Germany. ⟨hal-01095197⟩
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ref_biblio: Thinhinane Megherbi, Mouloud Kachouane, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. Détection des croisements de fibre en IRM de diffusion par décomposition de tenseur : Approche analytique. Reconnaissance de Formes et Intelligence Artificielle (RFIA) 2014, Jun 2014, France. ⟨hal-00989135⟩
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ref_biblio: Gabriel Girard, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Connectivity directionally-encoded color map: a streamline-based color mapping. The Organization for Human Brain Mapping (OHBM), Jun 2014, Hambourg, Germany. ⟨hal-01103640⟩
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ref_biblio: Mouloud Kachouane, Thinhinane Megherbi, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. Use of Particle Swarm Optimization for ODF Maxima Extraction. IEEE EMBS International Student Conference, ISC 2014, IEEE EMBS, Jun 2014, kuala lumpur, Malaysia. ⟨hal-01239824⟩
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ref_biblio: Demian Wassermann, James Ross, George Washko, William M Wells, Raul San Jose-Estepar. Deformable Registration of Feature-Endowed Point Sets Based on Tensor Fields. Computer Vision and Pattern Recognition, IEEE, Jun 2014, Columbus, Ohio, United States. pp.2729-2735, ⟨10.1109/CVPR.2014.355⟩. ⟨hal-01153110⟩
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ref_biblio: Girard Gabriel, Whittingstall Kevin, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Choosing Tractography Parameters to Improve Connectivity Mapping. International Symposium on Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM’14), May 2014, Milan, Italy. ⟨hal-00945992⟩
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ref_biblio: Mauro Zucchelli, Eleftherios Garyfallidis, Michael Paquette, Sylvain Merlet, Gloria Menegaz, et al.. Comparison between discrete and continuous propagator indices from Cartesian q-space DSI sampling. ISMRM : Intl. Soc. Mag. Reson. Med., May 2014, Milan, Italy. pp.4294. ⟨hal-00991876⟩
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ref_biblio: Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche. NMR Characterization of Cylinder Radii Distributions Using a SHORE-Based Regularization Method. ISMRM : Intl. Soc. Mag. Reson. Med, May 2014, Milan, Italy. pp.4419. ⟨hal-00991736⟩
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ref_biblio: Michael Paquette, Sylvain Merlet, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. DSI 101: Better ODFs for Free. ISMRM : Intl. Soc. Mag. Reson. Med. 22, May 2014, Milan, Italy. pp.0802. ⟨hal-00991861⟩
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ref_biblio: Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche. Efficient Axon Diameter Distribution Recovery with Long Diffusion Time. ISMRM : Intl. Soc. Mag. Reson. Med, May 2014, Milan, Italy. pp.0792. ⟨hal-00991734⟩
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ref_biblio: Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. Greedy NNLS: Fiber Orientation Distribution from Non-Negatively Constrained Sparse Recovery. ISMRM : Intl. Soc. Mag. Reson. Med., May 2014, Milan, Italy. pp.2610. ⟨hal-00991739⟩
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ref_biblio: Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche. Mapping Average Axon Diameters under Long Diffusion Time,. ISBI 2014, Apr 2014, Beijing, China. pp.242–245. ⟨hal-00991735⟩
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ref_biblio: Makhlouf Laouchedi, Thinhinane Megherbi, Houssem Khabatti, Ishak Serrat, Rachid Deriche, et al.. Odf Maxima Computation Using Hill Climbing Algorithm. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Beijing, China. pp.722-725. ⟨hal-00991741⟩
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ref_biblio: Emmanuel Daucé, Eoin Thomas. Evidence build-up facilitates on-line adaptivity in dynamic environments: example of the BCI P300-speller. 22nd European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2014, Bruges, Belgium. ⟨hal-01104024⟩
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ref_biblio: Eleftherios Garyfallidis, Demian Wassermann, Maxime Descoteaux. Direct native-space fiber bundle alignment for group comparisons. International Society for Magnetic Resonance Imaging (ISMRM), 2014, Milan, Italy. ⟨hal-00991740⟩
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ref_biblio: Demian Wassermann, Matt Toews, Marc Niethammer, William (sandy) Wells Iii. Probabilistic Diffeomorphic Registration: Representing Uncertainty. Biomedical Image Registration, 2014, London, United Kingdom. pp.72 – 82, ⟨10.1007/978-3-319-08554-8_8⟩. ⟨hal-01095091v2⟩
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Poster de conférence

ref_biblio: Anne-Charlotte Philippe, Théodore Papadopoulo, Christian G. Bénar, Jean-Michel Badier, Maureen Clerc, et al.. Propagation of epileptic spikes revealed by diffusion-based constrained MEG source reconstruction. 19th International Conference on Biomagnetism, Aug 2014, Halifax, Canada. 2014. ⟨hal-01104109⟩
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ref_biblio: Sebastian Hitziger, Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Sandrine Saillet, Christian G. Bénar, et al.. Electro-Metabolic Coupling Investigated with Jitter Invariant Dictionary Learning. OHBM 2014, Jun 2014, Hamburg, Germany. . ⟨hal-01094674⟩
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ref_biblio: Todor Jordanov, Jean-Paul Marmorat, Maureen Clerc, Juliette Leblond, Andre Waelkens, et al.. FindSources3D – Source Localization Using Rational Approximation on Plane Sections. Organization Human Brain Mapping, Annual Meeting, Jun 2014, Hamburg, Germany. , Poster listings. ⟨hal-01098108⟩
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Thèse

ref_biblio: Romain Trachel. Protocoles d’interaction cerveau-machine pour améliorer la performance d’attention visuo-spatiale chez l’homme. Autre. Université Nice Sophia Antipolis, 2014. Français. ⟨NNT : 2014NICE4038⟩. ⟨tel-01077931⟩
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2013

Article dans une revue

ref_biblio: Sylvain L. Merlet, Rachid Deriche. Continuous diffusion signal, EAP and ODF estimation via Compressive Sensing in diffusion MRI. Medical Image Analysis, 2013, 17 (5), pp.556-572. ⟨10.1016/j.media.2013.02.010⟩. ⟨hal-00815108⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Aurobrata Ghosh, Tristan Milne, Rachid Deriche. Constrained diffusion kurtosis imaging using ternary quartics & MLE. Magnetic Resonance in Medicine, 2013, ⟨10.1002/mrm.24781⟩. ⟨hal-00842786⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Aurobrata Ghosh, Elias Tsigaridas, Bernard Mourrain, Rachid Deriche. A polynomial approach for extracting the extrema of a spherical function and its application in diffusion MRI. Medical Image Analysis, 2013, 17 (5), pp.503-514. ⟨10.1016/j.media.2013.03.004⟩. ⟨hal-00815120⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Sylvain L. Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. A computational diffusion MRI and parametric dictionary learning framework for modeling the diffusion signal and its features. Medical Image Analysis, 2013, pp.MEDIMA779. ⟨10.1016/j.media.2013.04.011⟩. ⟨hal-00820817⟩
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ref_biblio: Emmanuel Caruyer, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche. Design of multishell sampling schemes with uniform coverage in diffusion MRI. Magnetic Resonance in Medicine, 2013, 69 (6), pp.1534-1540. ⟨10.1002/mrm.24736⟩. ⟨hal-00821688⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc. Review of “Brain-Computer Interfaces, principles and practise”, edited by Jonathan R. Wolpaw and Elizabeth Winter Wolpaw. BioMedical Engineering OnLine, 2013, 12 (22), ⟨10.1186/1475-925X-12-22⟩. ⟨hal-00804545⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Meizhu Liu, Baba Vemuri, Rachid Deriche. A Robust Variational Approach for Simultaneous Smoothing and Estimation of DTI. NeuroImage, 2013, 67, pp.33-41. ⟨10.1016/j.neuroimage.2012.11.012⟩. ⟨hal-00808015⟩
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ref_biblio: Joan Fruitet, Alexandra Carpentier, Rémi Munos, Maureen Clerc. Automatic motor task selection via a bandit algorithm for a brain-controlled button. Journal of Neural Engineering, 2013, 10 (1), ⟨10.1088/1741-2560/10/1/016012⟩. ⟨hal-00798561⟩
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ref_biblio: Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche. Motion Detection in Diffusion MRI via Online ODF Estimation. International Journal of Biomedical Imaging, 2013, 2013 (Article ID 84936), pp.1-8. ⟨10.1155/2013/849363⟩. ⟨hal-00798582⟩
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ref_biblio: Manuel Zaepffel, Romain Trachel, Bjørg Elisabeth Kilavik, Thomas Brochier. Modulations of EEG Beta Power during Planning and Execution of Grasping Movements. PLoS ONE, 2013, 27, pp.11877 – 11877. ⟨10.1371/journal.pone.0060060.g003⟩. ⟨hal-01464143⟩
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ref_biblio: Eoin Thomas, Matthew Dyson, Maureen Clerc. An analysis of performance evaluation for motor-imagery based BCI. Journal of Neural Engineering, 2013, 10 (3), pp.1-15. ⟨10.1088/1741-2560/10/3/031001⟩. ⟨hal-00821971⟩
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ref_biblio: Eoin Thomas, Joan Fruitet, Maureen Clerc. Combining ERD and ERS features to create a system-paced BCI. Journal of Neuroscience Methods, 2013, 216 (2), pp.96-103. ⟨10.1016/j.jneumeth.2013.03.026⟩. ⟨hal-00821973⟩
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Communication dans un congrès

ref_biblio: Romain Trachel, Thomas Brochier, Maureen Clerc. Adaptive and Warning Displays with Brain-Computer Interfaces : Enhanced Visuospatial Attention Performance. IEEE/EMBS 6th international conference on neural engineering, Nov 2013, San diego, United States. ⟨hal-00903288⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Eoin M. Thomas, Maureen Clerc, Alexandra Carpentier, Emmanuel Daucé, Dieter Devlaminck, et al.. Optimizing P300-speller sequences by RIP-ping groups apart. IEEE/EMBS 6th international conference on neural engineering (2013), IEEE/EMBS, Nov 2013, San Diego, United States. ⟨hal-00907781⟩
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ref_biblio: Jian Cheng, Tianzi Jiang, Rachid Deriche, Shen Dinggang, Yap Pew-Thian. Regularized Spherical Polar Fourier Diffusion MRI with Optimal Dictionary Learning. The 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.639-646, ⟨10.1007/978-3-642-40811-3_80⟩. ⟨hal-00824507⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Jian Cheng, Rachid Deriche, Tianzi Jiang, Dinggang Shen, Pew-Thian Yap. Non-Negative Spherical Deconvolution (NNSD) for Fiber Orientation Distribution Function Estimation. MICCAI Workshop Computational Diffusion and Brain Connectivity, Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.81-93, ⟨10.1007/978-3-319-02475-2_8⟩. ⟨hal-00967829⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Maureen Clerc, Jérémie Mattout, Emmanuel Maby, Dieter Devlaminck, Théodore Papadopoulo, et al.. Verbal Communication through Brain Computer Interfaces. Interspeech – 14th Annual Conference of the International Speech Communication Association – 2013, Frédéric Bimbot, Aug 2013, Lyon, France. ⟨hal-00842851⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Dalila Cherifi, Ali Chellouche, Amazigh Ait Ouakli, Youcef Benamara, Rachid Deriche. Tensor Estimation and Visualization using dMRI. 8th International Workshop on Systems, Signal Processing and their Applications (WoSSPA), 2013, CDTA, May 2013, Zeralda, Algeria. ⟨hal-00917618⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Sebastian Hitziger, Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Sandrine Saillet, Christian Bénar, et al.. Jitter-Adaptive Dictionary Learning -Application to Multi-Trial Neuroelectric Signals. ICLR – 1st International Conference on Learning Representations – 2013, Yoshua Bengio, Yann Lecun, May 2013, Phoenix, Arizona, United States. ⟨hal-01094619⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Romain Trachel, Thomas Brochier, Maureen Clerc. Enhancing Visuospatial Attention Performance with Brain-Computer Interfaces. ACM SIGCHI Conference on Human Factors in Computing Systems, Apr 2013, Paris, France. pp.ACM 978-1-4503-1952-2. ⟨hal-00817799⟩
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ref_biblio: Sylvain L. Merlet, Michael Paquette, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Compressive Sensing DSI. International Symposium on BIOMEDICAL IMAGING: From Nano to Macro – ISBI HARDI Reconstruction Challenge, Apr 2013, San Francisco, United States. ⟨hal-00908209⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Jian Cheng, Rachid Deriche, Tianzi Jiang, Dinggang Shen, Pew-Thian Yap. Non-Local Non-Negative Spherical Deconvolution for Single and Multiple Shell Diffusion MRI. HARDI Reconstruction Challenge, International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2013, San Francisco, United States. pp.1. ⟨hal-00967830⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Anne-Charlotte Philippe, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche. Cortex parcellation via diffusion data as prior knowledge for the MEG inverse problem. Biomedical Imaging (ISBI), 2013 IEEE 10th International Symposium on, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.994-997, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556644⟩. ⟨hal-00858019⟩
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ref_biblio: Aurobrata Ghosh, Thinhinane Megherbi, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche. Fiber Orientation Distribution from Non-Negative Sparse Recovery. International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2013, San Francisco, CA, United States. ⟨hal-00808065⟩
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ref_biblio: Manuel Moussallam, Alexandre Gramfort, Gael Richard, Laurent Daudet. Débruitage Aveugle par Décompositions Parcimonieuses et Aléatoires,. GRETSI, 2013, Brest, France. ⟨hal-02713678⟩
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Chapitre d’ouvrage

ref_biblio: Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. 4th Order Symmetric Tensors and Positive ADC Modelling. Anna Vilanova and Carl-Fredrik Westin and Bernhard Burgeth. Visualization and Processing of Tensors and Higher Order Descriptors for Multi-Valued Data (Dagstuhl Seminar 11501), Springer, 2013. ⟨hal-00848513⟩
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ref_biblio: Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. From Diffusion MRI to Brain Connectomics. Cazals, Frédéric and Kornprobst, Pierre. Modeling in Computational Biology and Biomedicine: A Multidisciplinary Endeavor, Springer, pp.193-234, 2013, 978-3-642-31208-3. ⟨10.1007/978-3-642-31208-3⟩. ⟨hal-00667912⟩
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ref_biblio: Thomas Schultz, Andrea Fuster, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche, Luc Florack, et al.. Higher-Order Tensors in Diffusion Imaging. Burgeth, B. and Vilanova, A. and Westin, C. F. Visualization and Processing of Tensors and Higher Order Descriptors for Multi-Valued Data. Dagstuhl Seminar 2011, Springer, 2013. ⟨hal-00848526⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Christian G. Bénar. Single-Trial Analysis of Bioelectromagnetic Signals: The Quest for Hidden Information. Cazals, Frederic and Kornprobst, Pierre. Modeling in Computational Biology and Biomedicine: A Multidisciplinary Endeavor, Springer, pp.237–259, 2013, 978-3-642-31208-3. ⟨10.1007/978-3-642-31208-3⟩. ⟨hal-00849690⟩
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Brevet

ref_biblio: Maureen Clerc, Romain Trachel, Thomas Brochier. Système et Procédé de commande et de contrôle d’un appareil pilotable par un opérateur. France, N° de brevet: 1360563. 2013. ⟨hal-01563283⟩
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Poster de conférence

ref_biblio: Sebastian Hitziger, Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Sandrine Saillet, Christian G. Bénar, et al.. Jitter-Adaptive Dictionary Learning – Application to Multi-Trial Neuroelectric Signals. International Conference on Learning Representations 2013, May 2013, Phoenix, Arizona, United States. 2013. ⟨hal-01094663⟩
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Document associé à des manifestations scientifiques

ref_biblio: Anne-Charlotte Philippe, Christian Bénar, Jean-Michel Badier, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, et al.. Propagation of epileptic spikes revealed by diffusion-based constrained MEG source reconstruction. Scale-free Dynamics and Networks in Neuroscience, Oct 2013, Montreal, Canada. ⟨hal-00908664⟩
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Thèse

ref_biblio: Anne-Charlotte Philippe. Régularisation du problème inverse MEG par IRM de diffusion. Autre. Université Nice Sophia Antipolis, 2013. Français. ⟨NNT : 2013NICE4135⟩. ⟨tel-00939159v2⟩
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ref_biblio: Sylvain Merlet. Compressive sensing in diffusion MRI. Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2013. English. ⟨NNT : 2013NICE4061⟩. ⟨tel-00908369v2⟩
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2012

Article dans une revue

ref_biblio: Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. Fast and Analytical EAP Approximation from a 4th-Order Tensor. International Journal of Biomedical Imaging, 2012, 2012 (Article ID 192730), pp.1-9. ⟨10.1155/2012/192730⟩. ⟨hal-00798581⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Théodore Papadopoulo. Source localization using rational approximation on plane sections. Inverse Problems, 2012, 28 (5), Article number 055018 – 24 p. ⟨10.1088/0266-5611/28/5/055018⟩. ⟨hal-00699541⟩
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ref_biblio: Anne-Charlotte Philippe. L’art assisté par ordinateur. Interstices, 2012. ⟨hal-01350321⟩
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ref_biblio: Panayotis Katsaloulis, Aurobrata Ghosh, Anne-Charlotte Philippe, Astero Provata, Rachid Deriche. Fractality in the neuron axonal topography of the human brain based on 3-D diffusion MRI. The European Physical Journal B: Condensed Matter and Complex Systems, 2012, 85 (5), pp.150-157. ⟨10.1140/epjb/e2012-30045-y⟩. ⟨hal-00712701⟩
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ref_biblio: Bjørg Elisabeth Kilavik, Adrian Ponce-Alvarez, Romain Trachel, Joachim Confais, Sylvain Takerkart, et al.. Context-Related Frequency Modulations of Macaque Motor Cortical LFP Beta Oscillations. Cerebral Cortex, 2012, 22 (9), pp.2148-2159. ⟨10.1093/cercor/bhr299⟩. ⟨hal-00816339v2⟩
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ref_biblio: Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche. Diffusion MRI Signal Reconstruction with Continuity Constraint and Optimal Regularization. Medical Image Analysis, 2012, 16 (6), pp.1113-1120. ⟨10.1016/j.media.2012.06.011⟩. ⟨hal-00711883⟩
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Communication dans un congrès

ref_biblio: Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche. A Computational Framework for Experimental Design in Diffusion MRI. CDMRI – MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI, Oct 2012, Nice, France. ⟨hal-00747700⟩
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ref_biblio: Jian Cheng, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. Nonnegative Deﬁnite EAP and ODF Estimation via a Uniﬁed Multi-Shell HARDI Reconstruction. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2012, Oct 2012, Nice, France. pp.313-321, ⟨10.1007/978-3-642-33418-4_39⟩. ⟨hal-00759014⟩
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ref_biblio: Sylvain Merlet, Anne-Charlotte Philippe, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Tractography via the Ensemble Average Propagator in diffusion MRI. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2012, Nice, France. pp.7511. ⟨hal-00727797⟩
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ref_biblio: Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche. Parametric dictionary learning for modeling EAP and ODF in diffusion MRI. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2012, Nice, France. 8 p. ⟨hal-00728067⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc, Carsten Wolters, Johannes Vorwerk, Martin Burger. Comparison of Boundary Element and Finite Element Approaches to the EEG Forward Problem. BMT 2012, Sep 2012, Jena, Germany. pp.795-798, ⟨10.1515/bmt-2012-4152⟩. ⟨hal-00736523⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Anne-Charlotte Philippe, Jean-Christophe Lombardo. Study of the brain connectivity in an Immersive Space. AFRV, Sep 2012, Strasbourg, France. ⟨hal-00760084⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Anne-Charlotte Philippe, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche. Whole cortex parcellation combining analysis of MEG forward problem, structural connectivity and Brodmann atlas. BIOMAG, Aug 2012, Paris, France. ⟨hal-00760042⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Sylvain Merlet, Michael Paquette, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux. Ensemble Average Propagator Reconstruction via Compressed Sensing: Discrete or Continuous Bases ?. ISMRM 20th Annual Meeting (2012), May 2012, Australia. pp.2277. ⟨hal-00712687⟩
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ref_biblio: Sylvain Merlet, Rachid Deriche, Kevin Whittingstall, Maxime Descoteaux. Diffusion and multiple orientations from 1.5 MR systems with limited gradient tables. ISMRM 20th Annual Meeting (2012), May 2012, Melbourne, Australia. pp.1922. ⟨hal-00712686⟩
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ref_biblio: Aurobrata Ghosh, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche. BIOMARKERS FOR HARDI: 2nd & 4th ORDER TENSOR INVARIANTS. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro – 2012, May 2012, Barcelona, Spain. ⟨hal-00667905⟩
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ref_biblio: Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche. Optimal Regularization for MR Diffusion Signal Reconstruction. ISBI – 9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, May 2012, Barcelona, Spain. ⟨hal-00660635⟩
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ref_biblio: Anne-Charlotte Philippe, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche. A nested cortex parcellation combining analysis of MEG forward problem and diffusion MRI tractography. ISBI – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging – 2012, May 2012, Barcelona, Spain. ⟨hal-00662776⟩
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ref_biblio: Gonzalo Vegas-Sánchez-Ferrero, Antonio Tristán-Vega, Santiago Aja-Fernández, Marcos Martín-Fernández, C. Palencia, et al.. Anisotropic LMMSE denoising of MRI based on statistical tissue models. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI)., May 2012, Barcelona, Spain. pp.1519-1522. ⟨hal-00712669⟩
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ref_biblio: Meizhu Liu, Baba Vemuri, Rachid Deriche. UNSUPERVISED AUTOMATIC WHITE MATTER FIBER CLUSTERING USING A GAUSSIAN MIXTURE MODEL. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI)., May 2012, Barcelona, Spain. pp.522-525. ⟨hal-00712673⟩
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ref_biblio: Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. Parametric Dictionary Learning in Diffusion MRI. HARDI reconstruction workshop – ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, Alessandro Daducci and Jean-Philippe Thiran and Yves Wiaux, May 2012, Barcelona, Spain. ⟨hal-00697102⟩
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ref_biblio: Ali Demir, Mustafa Unel, Rachid Deriche, Gozde Unal. Elliptic fourier features of brain white matter pathways. Signal Processing and Communications Applications Conference (SIU), 2012 20th, Apr 2012, Fethiye, Turkey, Turkey. pp.1-4, ⟨10.1109/SIU.2012.6204642⟩. ⟨hal-00713002⟩
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ref_biblio: Anne-Charlotte Philippe, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche. dMRI tractography of WM fibers to recover the anatomical connectivity supporting a MEG epileptic network. SFRMBM, Mar 2012, Marseille, France. ⟨hal-00760041⟩
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ref_biblio: Rachid Deriche, John Treilhard. Using Radial NMR Profiles to Characterize Pore Size Distributions. Medical Imaging 2012: Image Processing, SPIE, Feb 2012, San Diego, CA, United States. pp.83140L-1–83140L-13, ⟨10.1117/12.910673⟩. ⟨hal-00712695⟩
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ref_biblio: Emmanuel Olivi, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Domain Decomposition to handle versatile conductivity models. Proceedings of Biomag, 2012, Paris, France. ⟨hal-00789734⟩
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ref_biblio: Aurobrata Ghosh, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche. Generalized Invariants of a 4th order tensor: Building blocks for new biomarkers in dMRI. Computational Diffusion MRI Workshop (CDMRI), MICCAI, 2012, Nice, France. pp.165―173. ⟨hal-00789763⟩
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ref_biblio: Eoin M. Thomas, Joan Fruitet, Maureen Clerc. Investigating brief motor imagery for an ERD/ERS based BCI. EMBC: Engineering in Medicine and Biology Conference, 2012, San Diego, CA, United States. pp.2929-2932, ⟨10.1109/EMBC.2012.6346577⟩. ⟨hal-00789765⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Tristan Milne, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. Constrained Diffusion Kurtosis Imaging Using Ternary Quartics and MLE. Computational Diffusion MRI Workshop (CDMRI), 2012, MICCAI, 2012, Nice, France. pp.153―164. ⟨hal-00789755⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Joan Fruitet, Alexandra Carpentier, Rémi Munos, Maureen Clerc. Bandit Algorithms boost Brain Computer Interfaces for motor-task selection of a brain-controlled button. Advances in Neural Information Processing Systems, 2012, Lake Tahoe, Nevada, United States. pp.458–466. ⟨hal-00771495⟩
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Chapitre d’ouvrage

ref_biblio: Jan C. de Munck, Carsten Wolters, Maureen Clerc. EEG and MEG: forward modeling. Brette, Romain and Destexhe, Alain. Handbook of Neural Activity Measurement, Cambridge University Press, pp.192-256, 2012, 978-0-521-51622-8. ⟨hal-00736444⟩
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Autre publication scientifique

ref_biblio: Anne-Charlotte Philippe. L’art assisté par ordinateur. 2012. ⟨hal-00789767⟩
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Document associé à des manifestations scientifiques

ref_biblio: Emmanuel Olivi, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc. The adjoint method of OpenMEEG for EEG and MEG with large source space. Proceedings of Biomag, 2012, Paris, France. 2012. ⟨hal-00789736⟩
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Thèse

ref_biblio: Emmanuel Caruyer. IRM de diffusion du Q-space : Acquisition et pré-traitements. Medical Imaging. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. English. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00750144⟩
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ref_biblio: Joan Fruitet. Interfaces Cerveau-Machines basées sur l’imagination de mouvements brefs : vers des boutons contrôlés par la pensée. Traitement du signal et de l’image [eess.SP]. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00838704⟩
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ref_biblio: Jian Cheng. Estimation and Processing of Ensemble Average Propagator and Its Features in Diffusion MRI. Medical Imaging. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. English. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00759048⟩
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2011

Article dans une revue

ref_biblio: Maxime Descoteaux, Rachid Deriche, Denis Lebihan, Jean-François Mangin, Cyril Poupon. Multiple q-shell diffusion propagator imaging. Medical Image Analysis, 2011, 15 (4), pp.603-621. ⟨10.1016/j.media.2010.07.001⟩. ⟨hal-00531473⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Jiamin Liu, Kabadi Suraj, Uitert Robert Van, Ronald M. Summers, Nicholas Petrick, et al.. Improved computer-aided detection of small polyps in CT colonography using interpolation for curvature estimation. Medical Physics, 2011, 38 (7), ⟨10.1118/1.3596529⟩. ⟨hal-00645561⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Nicole Voges, Solenna Blanchard, Fabrice Wendling, Olivier David, Habib Benali, et al.. Modeling of the Neurovascular Coupling in Epileptic Discharges.. Brain Topography: a Journal of Cerebral Function and Dynamics, 2011, 25 (2), pp.136-156. ⟨10.1007/s10548-011-0190-1⟩. ⟨inserm-00613123⟩
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ref_biblio: Solenna Blanchard, Théodore Papadopoulo, Christian-George Bénar, Nicole Voges, Maureen Clerc, et al.. Relationship between flow and metabolism in BOLD signals: insights from biophysical models.. Brain Topography: a Journal of Cerebral Function and Dynamics, 2011, 24 (1), pp.40-53. ⟨10.1007/s10548-010-0166-6⟩. ⟨inserm-00613116⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Joan Fruitet, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Preliminary study for an offline hybrid BCI using sensorimotor rhythms and beta rebound. International Journal of bioelectromagnetism, 2011, 13 (2), pp.70-71. ⟨hal-00727086⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc. Forward Field Computation with OpenMEEG.. Computational Intelligence and Neuroscience, 2011, 2011, pp.923703. ⟨10.1155/2011/923703⟩. ⟨inria-00584205⟩
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Communication dans un congrès

ref_biblio: Emmanuel Caruyer, Jian Cheng, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Tianzi Jiang, et al.. Optimal Design of Multiple Q-shells experiments for Diffusion MRI. MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI – CDMRI’11, Sep 2011, Toronto, Canada. ⟨inria-00617663⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Jian Cheng, Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, et al.. Compressive Sensing Ensemble Average Propagator Estimation via L1 Spherical Polar Fourier Imaging. MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI – CDMRI’11, Sep 2011, Toronto, Canada. ⟨inria-00615434⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Meizhu Liu, Baba Vemuri, Rachid Deriche. Simultaneous Smoothing and Estimation of DTI via Robust Variational Non-local Means. MICCAI Workshop Computational Diffusion MRI, Sep 2011, Toronto, Canada. ⟨hal-00645007⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. Diffeomorphism Invariant Riemannian Framework for Ensemble Average Propagator Computing. MICCAI – 2011 – 14th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2011, Toronto, Canada. ⟨inria-00615431⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche. Impact of radial and angular sampling on multiple shells acquisition in diffusion MRI. MICCAI 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.113-121. ⟨hal-00614387⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Jian Cheng, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. Theoretical Analysis and Practical Insights on EAP Estimation via a Unified HARDI Framework. MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI), Sep 2011, Toronto, Canada. ⟨inria-00615430⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Aurobrata Ghosh, Demian Wassermann, Rachid Deriche. A Polynomial Approach for Maxima Extraction and Its Application to Tractography in HARDI. Information Processing in Medical Imaging, Jul 2011, Irsee, Germany. pp.723-734, ⟨10.1007/978-3-642-22092-0_59⟩. ⟨inria-00610195⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Emmanuel Caruyer, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche. Incremental gradient table for multiple Q-shells diffusion MRI. HBM 17th Annual Meeting, Jun 2011, Québec, Canada. ⟨inria-00617957⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. A Riemannian Framework for Ensemble Average Propagator Computing. ISMRM, May 2011, Montréal, Canada. ⟨inria-00615436⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche. On Line Reconstruction and Motion Detection in HARDI. 19th ISMRM annual meeting, May 2011, Montréal, Canada. ⟨inria-00560899⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Maureen Clerc, Laurent Koessler, Jean-Michel Badier, Martine Gavaret. In vivo scalp-to-skull conductivity ratio calibration: an EIT study. 12th International Conference in Electrical Impedance Tomography, EIT 2011, May 2011, Bath, United Kingdom. ⟨hal-00789732⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Jian Cheng, Sylvain Merlet, Aurobrata Ghosh, Emmanuel Caruyer, Tianzi Jiang, et al.. Compressive Sensing Ensemble Average Propagator Estimation via L1 Spherical Polar Fourier Imaging. ISMRM, May 2011, Montréal, Canada. ⟨inria-00615437⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. EXTRACTING GEOMETRICAL FEATURES & PEAK FRACTIONAL ANISOTROPY FROM THE ODF FOR WHITE MATTER CHARACTERIZATION. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Wright, Steve and Pan, Xiaochuan and Liebling, Michael, Mar 2011, Chicago, United States. ⟨hal-00645804⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche. Online Motion Detection in High Angular Resolution Diffusion Imaging. International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Mar 2011, Chicago, United States. ⟨inria-00559904v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Emmanuel Olivi, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc. Handling white-matter anisotropy in BEM for the EEG forward problem. ISBI 2011 – 8th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Mar 2011, Chicago, United States. pp.799 – 802, ⟨10.1109/ISBI.2011.5872526⟩. ⟨inria-00578876v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Sylvain Merlet, Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. Spherical Polar Fourier EAP and ODF Reconstruction via Compressed Sensing in Diffusion MRI. ISBI, Mar 2011, Chicago, United States. ⟨inria-00585694⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Pablo Barttfeld, Jorge Calvar, Sebastian Cukier, Rachid Deriche, Ramon Leiguarda, et al.. Large-scale network analysis reflects big-world characteristics in ASD. 17th Annual Meeting of the Organization on Human Brain Mapping, 2011, Quebec City, Canada. ⟨hal-00789730⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Maureen Clerc, Jean-Michel Badier, Emmanuel Olivi, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo. OpenMEEG for calibrating the conductivity of nested compartment models. EIT conference, 2011, Bath, United Kingdom. ⟨hal-00789731⟩
Accès au bibtex

HDR

ref_biblio: Théodore Papadopoulo. Contributions and perspectives to computer vision, image processing and EEG/MEG data analysis. Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV]. Université Nice Sophia Antipolis, 2011. ⟨tel-00847782⟩
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Poster de conférence

ref_biblio: Emmanuel Olivi, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc. Adjoint method for lead-fields computation in MEEG.. HBM’2011, Jun 2011, Québec City, Canada. ⟨inria-00603769⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Demian Wassermann, Anne-Charlotte Philippe, Pablo Barttfeld, Bruno Wicker, Mariano Sigman, et al.. Tract-based statistical analyzes in dMRI in autism spectrum disorder. 17th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2011, Quebec, Canada. ⟨hal-00649766⟩
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Rapport

ref_biblio: Joan Fruitet, Alexandra Carpentier, Rémi Munos, Maureen Clerc. Automatic motor task selection via a bandit algorithm for a brain-controlled button. [Rapport de recherche] RR-7721, INRIA. 2011. ⟨inria-00624686⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Théodore Papadopoulo. Source localization using rational approximation on plane sections. [Research Report] RR-7704, INRIA. 2011, pp.29. ⟨inria-00613644v2⟩
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Thèse

ref_biblio: Emmanuel Olivi. Coupling of numerical methods for the forward problem in Magneto- and Electro-Encephalography. Numerical Analysis [cs.NA]. Université Nice Sophia Antipolis, 2011. English. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00838707⟩
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ref_biblio: Aurobrata Ghosh. High Order Models in Diffusion MRI and Applications. Traitement du signal et de l’image [eess.SP]. Université Nice Sophia Antipolis, 2011. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00645820⟩
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2010

Article dans une revue

ref_biblio: Benoit Cottereau, Jean Lorenceau, Alexandre Gramfort, Maureen Clerc, Bertrand Thirion, et al.. Phase delays within visual cortex shape the response to steady-state visual stimulation.. NeuroImage, 2010, 54 (3), pp.1919-1929. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.10.004⟩. ⟨inria-00526019⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Sylvain Baillet, Maureen Clerc. Tracking cortical activity from M/EEG using graph-cuts with spatiotemporal constraints.. NeuroImage, 2010, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.09.087⟩. ⟨inria-00526020⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc. OpenMEEG: opensource software for quasistatic bioelectromagnetics. BioMedical Engineering OnLine, 2010, 9 (1), pp.45. ⟨10.1186/1475-925X-9-45⟩. ⟨inria-00467061v2⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Sylvain Vallaghé, Théodore Papadopoulo. A Trilinear Immersed Finite Element Method for Solving the Electroencephalography Forward Problem. SIAM Journal on Scientific Computing, 2010, 32 (4), pp.2379-2394. ⟨10.1137/09075038X⟩. ⟨inria-00536265⟩
Accès au texte intégral et bibtex

ref_biblio: Thomas Brox, Mikaël Rousson, Rachid Deriche, Joachim Weickert. Colour, texture, and motion in level set based segmentation and tracking.. Image and Vision Computing, 2010, 28 (3), pp.376-390. ⟨10.1016/j.imavis.2009.06.009⟩. ⟨hal-00531465⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Joan Fruitet, Dennis J Mcfarland, Jonathan R Wolpaw. A comparison of regression techniques for a two-dimensional sensorimotor rhythm-based brain-computer interface.. Journal of Neural Engineering, 2010, 7 (1), pp.16003. ⟨10.1088/1741-2560/7/1/016003⟩. ⟨inria-00498774⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Demian Wassermann, L. Bloy, E. Kanterakis, R. Verma, Rachid Deriche. Unsupervised white matter fiber clustering and tract probability map generation: Applications of a Gaussian process framework for white matter fibers. NeuroImage, 2010, 51 (1), pp.228-241. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.01.004⟩. ⟨inria-00496898⟩
Accès au bibtex

ref_biblio: Alexandre Gramfort, Renaud Keriven, Maureen Clerc. Graph-Based Variability Estimation in Single-Trial Event-Related Neural Responses. IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2010, 57 (5), pp.1051 – 1061. ⟨10.1109/TBME.2009.2037139⟩. ⟨inria-00497023⟩
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Communication dans un congrès

ref_biblio: Demian Wassermann, Efstathios Kanterakis, Ruben C. Gur, Rachid Deriche, Ragini Verma. Diffusion-based population statistics using tract probability maps. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI, Sep 2010, Beijing, China. pp.631-639, ⟨10.1007/978-3-642-15705-9_77⟩. ⟨hal-00849707⟩
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ref_biblio: Sylvain Merlet, Rachid Deriche. Compressed Sensing for Accelerated EAP Recovery in Diffusion MRI. MICCAI, Sep 2010, Pekin, China. pp.Page 14. ⟨inria-00536278⟩
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ref_biblio: Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. Model-free and Analytical EAP Reconstruction via Spherical Polar Fourier Diffusion MRI. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI, Sep 2010, Beijing, China. pp.590-597, ⟨10.1007/978-3-642-15705-9_72⟩. ⟨inria-00496932⟩
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ref_biblio: Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche, Tianzi Jiang. Model-Free, Regularized, Fast, and Robust Analytical Orientation Distribution Function Estimation. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2010, Sep 2010, Beijing, China. ⟨inria-00496929⟩
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ref_biblio: Joan Fruitet, Maureen Clerc. Reconstruction of cortical sources activities for online classification of electroencephalographic signals.. EMBC 2010, Aug 2010, Buenos Aires, Argentina. ⟨inria-00498768⟩
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ref_biblio: Caroline Malherbe, E. Bardinet, Arnaud Messé, Vincent Perlbarg, Guillaume Marrelec, et al.. A bootstrap method to improve brain subcortical network segregation in resting-state fMRI data. COMPSTAT 2010 – 19th international symposium on computational statistics, Aug 2010, Paris, France. pp.1335-1342. ⟨inria-00538258⟩
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ref_biblio: Nicole Voges, Solenna Blanchard, Fabrice Wendling, Olivier David, Habib Benali, et al.. Application of a hemodynamic model to epileptic spikes. Cinquième conférence plénière française de Neurosciences Computationnelles, “Neurocomp’10”, Aug 2010, Lyon, France. ⟨hal-00553405⟩
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ref_biblio: Nicole Voges, Solenna Blanchard, Fabrice Wendling, Habib Benali, Olivier David, et al.. Investigation of BOLD responses to epileptic spikes: a combined modeling and data analysis approach. Human Brain Mapping, Jun 2010, Barcelonna, Spain. ⟨hal-00849610⟩
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ref_biblio: Sylvain Vallaghé, Théodore Papadopoulo. A trilinear immersed FEM for solving the EEG forward problem. ECCM IV – IV European Congress on Computational Mechanics: Solids, Structures and Coupled Problems in Engineering, May 2010, Paris, France. ⟨hal-00789728⟩
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ref_biblio: Aurobrata Ghosh, Evren Dr Ozarslan, Rachid Deriche. Challenges in Reconstructing the Propagator via a Cumulant Expansion of the One-Dimensional q-space MR Signal. Proceedings ISMRM, May 2010, Stockholm, Sweden. ⟨inria-00496885⟩
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ref_biblio: Sylvain Baillet, Richard Leahy, François Tadel, John C. Mosher, Arnaud Delorme, et al.. Academic Software Toolboxes for the Analysis of MEG Data. Biomag 2010, S. Supek, May 2010, Dubrovnik, Croatia. pp.101-104. ⟨inria-00497071⟩
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ref_biblio: Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Emmanuel Olivi, Théodore Papadopoulo. The symmetric BEM: bringing in more variables for better accuracy. Biomag 2010, S. Supek, May 2010, Dubrovnik, Croatia. pp.109-112, ⟨10.1007/978-3-642-12197-5_21⟩. ⟨inria-00497081⟩
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ref_biblio: Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche. FAST AND CLOSED-FORM ENSEMBLE-AVERAGE-PROPAGATOR APPROXIMATION FROM THE 4TH-ORDER DIFFUSION TENSOR. The IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2010, Stockholm, Sweden. ⟨inria-00496877⟩
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ref_biblio: Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Ryan Muetzel, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, et al.. Online orientation distribution function reconstruction in constant solid angle and its application to motion detection in HARDI. International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. ⟨inria-00559884⟩
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ref_biblio: Emmanuel Olivi, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Domain decomposition for coupling finite and boundary element methods in EEG. Biomag 2010, S. Supek, Apr 2010, Dubrovnik, Croatia. pp.120-123, ⟨10.1007/978-3-642-12197-5_24⟩. ⟨inria-00497099⟩
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ref_biblio: Théodore Papadopoulo, Sylvain Vallaghé, Maureen Clerc. The adjoint method for general EEG and MEG sensor-based lead field equations. Biomag 2010 – 17th International Conference on Biomagnetism, S. Supek, Mar 2010, Dubrovnik, Croatia. pp.105-108, ⟨10.1007/978-3-642-12197-5_20⟩. ⟨inria-00497088⟩
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ref_biblio: Demian Wassermann, Julien Cohen-Adad, Stéphane Lehericy, Habib Benali, Serge Rossignol, et al.. Fully Automated Straightening of the Spinal Cord using Fiber Tractography. 18th. International Symposium on Magnetic Resonance in Medicine, 2010, Stockholm, Sweden. ⟨inria-00496905⟩
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ref_biblio: M. Sharman, Julien Cohen-Adad, M Descoteaux, Arnaud Messé, Habib Benali, et al.. Impact of outliers in DTI and Q-Ball imaging — clinical implications and correction strategies. Proceedings of the ISMRM 18th Annual Scientific Meeting and Exhibition, 2010, Stockholm, Sweden, Sweden. ⟨inria-00538304⟩
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ref_biblio: Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. Fast, model-free, analytical diffusion PDF profile estimation from the DWI signals. the Sixteenth Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), 2010, Barcelona, Spain. ⟨inria-00497244⟩
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ref_biblio: Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. Riemannian Median and Its Applications for Orientation Distribution Function Computing. 18th Scientific Meeting and Exhibition of the (ISMRM), 2010, Stockholm, Sweden. ⟨inria-00497246⟩
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ref_biblio: Caroline Malherbe, Arnaud Messé, Mélanie Pélégrini-Issac, S Lehéricy, Habib Benali. Comparing functional and anatomical segregation in the basal ganglia using fMRI and fiber tracking. Proceedings of the 16th International Conference on Functional Mapping of the Human Brain, 2010, Barcelone, Spain, Spain. ⟨inria-00538301⟩
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ref_biblio: Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche. Fast, Model-Free , Analytical ODF Reconstruction from the Q-Space Signal. the Sixteenth Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), 2010, Barcelona, Spain. ⟨inria-00497243⟩
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ref_biblio: Emmanuel Olivi, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo. Domain decomposition for coupling finite and boundary element methods with non-matching grids in Electro-Encephalography. Proceedings of ECCM, 2010, Paris, France. ⟨hal-00789727⟩
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ref_biblio: Arnaud Messé, Guillaume Marrelec, Mélanie Pélégrini-Issac, Habib Benali. A spatial autoregressive model to link structure to function: a combined fMRI and DTI approach. Proceedings of the 16th International Conference on Functional Mapping of the Human Brain, 2010, Barcelone, Spain, Spain. ⟨inria-00538284⟩
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ref_biblio: Demian Wassermann, Julien Cohen-Adad, Stéphane Lehericy, Habib Benali, Serge Rossignol, et al.. STRAIGHTENING THE SPINAL CORD USING FIBER TRACTOGRAPHY. International Symposium on Biomedical Imaging, 2010, rotterdam, Netherlands. ⟨inria-00496908⟩
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ref_biblio: Maxime Descoteaux, Cheng Guan Koay, Peter J. Basser, Rachid Deriche. Analytical Q-Ball Imaging with Optimal Regularization. ISMRM 18th Scientific Meeting and Exhibition, 2010, Stockholm, Sweden. ⟨hal-00789771⟩
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Poster de conférence

ref_biblio: Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc. OpenMEEG for M/EEG forward modeling: a comparison study. Human Brain Mapping, Jun 2010, Barcelone, Spain. ⟨inria-00502745⟩
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ref_biblio: Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc. An empirical evaluation of free BEM solvers for M/EEG forward modeling. Biomag, May 2010, Dubrovnik, Croatia. 2010. ⟨hal-00776674⟩
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Thèse

ref_biblio: Arnaud Messé. Caractérisation de la relation structure-fonction dans le cerveau humain à partir de données d’IRM fonctionnelle et de diffusion : méthodes et applications cognitive et clinique. Neurosciences [q-bio.NC]. Université Nice Sophia Antipolis, 2010. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00845014⟩
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ref_biblio: Demian Wassermann. Automated In Vivo Dissection of White Matter Structures from Diffusion Magnetic Resonance Imaging. Medical Imaging. Université Nice Sophia Antipolis, 2010. English. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00827022⟩
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