2025
Journal articles
- titre
- Deep-learning and hemodynamics models: efficient complementarity for disease diagnosis and surgery planning
- auteur
- Irene Vignon-Clementel
- article
- Multidisciplinary Biomechanics Journal, 2025, 49th congress of the Société de Biomécanique, ⟨10.46298/mbj.14522⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- A comparative study of lumped heart models for personalized medicine through sensitivity and identifiability analysis
- auteur
- Marie Haghebaert, Pavlos Varsos, Roel Meiburg, Irene Vignon-Clementel
- article
- 2025
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-
2024
Journal articles
- titre
- A liver digital twin for in silico testing of cellular and inter-cellular mechanisms in regeneration after drug-induced damage
- auteur
- Jieling Zhao, Ahmed Ghallab, Reham Hassan, Steven Dooley, Jan Georg Hengstler, Dirk Drasdo
- article
- iScience, 2024, 27 (2), pp.108077. ⟨10.1016/j.isci.2023.108077⟩
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-
Conference papers
- titre
- Enhancing the automatic segmentation and analysis of 3D liver vasculature models
- auteur
- Yassine Machta, Omar Ali, Kevin Hakkakian, Ana Vlasceanu, Amaury Facque, Nicolas Golse, Irene Vignon-Clementel
- article
- ADSMI 2024 @ MICCAI Workshop on Advancing Data Solutions in Medical Imaging AI, Oct 2024, Marrakesh, Morocco
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-
- titre
- Convex optimization for binary tree-based transport networks
- auteur
- Raoul Sallé de Chou, Mohamed Ali Srir, Laurent Najman, Nicolas Passat, Hugues Talbot, Irene Vignon-Clementel
- article
- International Conference on Discrete Geometry and Mathematical Morphology (DGMM), 2024, Florence, Italy. pp.217-228, ⟨10.1007/978-3-031-57793-2_17⟩
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-
Book sections
- titre
- Microvascular modeling for medical imaging and toxicity assessment
- auteur
- Jérôme Kowalski, Dirk Drasdo, Peter Kottman, Jules Dichamp, Irene Vignon-Clementel
- article
- Linninger, A.; Mardal, KA.; Zunino, P. Quantitative approaches to microcirculation: mathematical models, computational methods, measurements and data analysis, 36, Springer; Springer Nature Switzerland, pp.49-85, 2024, SEMA SIMAI Springer Series, ⟨10.1007/978-3-031-58519-7_3⟩
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-
Proceedings
- titre
- CompuTiX: A library for agent based modeling (not only) at a tissue-scale
- auteur
- Jiří Pešek, Jules Dichamp, Peter Kottman, Charles Boulitrop, Dirk Drasdo
- article
- COMBINE 2024 – Conference of the Computational Modeling in Biology Network : September 1-5, 2024, University of Stuttgart, COMBINE, 2024, COMBINE 2024 – Conference of the Computational Modeling in Biology Network : September 1-5, 2024, University of Stuttgart, ⟨10.24407/KXP:1902121317⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Variance-based loss function for improved regularization
- auteur
- John M Hanna, Irene Vignon-Clementel
- article
- 2024
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-
- titre
- A comparative analysis of metamodels for lumped cardiovascular models, and pipeline for sensitivity analysis, parameter estimation, and uncertainty quantification
- auteur
- John M Hanna, Pavlos Varsos, Jérôme Kowalski, Lorenzo Sala, Roel Meiburg, Irene Vignon-Clementel
- article
- 2024
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-
2023
Journal articles
- titre
- An integrative experimental and computational twin modeling approach to understand clonal dynamics in the normal liver
- auteur
- Dirk Drasdo, Jieling Zhao
- article
- Journal of Hepatology, 2023, 79 (2), pp.273-276. ⟨10.1016/j.jhep.2023.05.016⟩
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-
- titre
- A proof-of-concept pipeline to guide evaluation of tumor tissue perfusion by dynamic contrast-agent imaging: Direct simulation and inverse tracer-kinetic procedures
- auteur
- Irene Vignon-Clementel, Nick Jagiella, Jules Dichamp, Jérôme Kowalski, Wiltrud Lederle, Hendrik Laue, Fabian Kiessling, Oliver Sedlaczek, Dirk Drasdo
- article
- Frontiers in Bioinformatics, 2023, 3, ⟨10.3389/fbinf.2023.977228⟩
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-
- titre
- Sensitivity Analysis of a Mathematical Model Simulating the Post-Hepatectomy Hemodynamics Response
- auteur
- Lorenzo Sala, Nicolas Golse, Alexandre Joosten, Eric Vibert, Irene Vignon-Clementel
- article
- Annals of Biomedical Engineering, 2023, ⟨10.1007/s10439-022-03098-6⟩
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-
- titre
- In-vitro to in-vivo acetaminophen hepatotoxicity extrapolation using classical schemes, pharmaco-dynamic models and a multiscale spatial-temporal liver twin
- auteur
- Jules Dichamp, Geraldine Cellière, Ahmed Ghallab, Reham Hassan, Noemie Boissier, Ute Hofmann, Joerg Reinders, Selahaddin Sezgin, Sebastian Zühlke, Jan Hengstler, Dirk Drasdo
- article
- Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, In press, 11, ⟨10.3389/fbioe.2023.1049564⟩
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-
Conference papers
- titre
- Understanding Organ Vascular Behavior Through their Architecture
- auteur
- Jerome Kowalski, Lorenzo Sala, Dirk Drasdo, Irene Vignon-Clementel
- article
- The 12th International Conference on Complex Networks and their Applications, Nov 2023, Menton, France
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-
- titre
- Sensitivity Analysis of a Mathematical Model Simulating the Post-Hepatectomy Hemodynamics Response
- auteur
- Lorenzo Sala, Nicolas Golse, Alexandre Joosten, Eric Vibert, Irene Vignon-Clementel
- article
- CMBBE 2023 – 18th International Symposium on Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering, May 2023, Paris, France. pp.270 – 289
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-
Book sections
- titre
- Simulations hémodynamiques : paramétrage, données cliniques, planification d’interventions
- auteur
- Irene Vignon-Clementel, Sanjay Pant
- article
- Valérie DEPLANO; José-Maria FULLUNA; Claude VERDIER. Écoulements biologiques dans les grands vaisseaux: dialogue entre modélisations numériques et études expérimentales in vitro/in vivo, ISTE, 2023, 978-1-78948-065-8
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- A digital liver twin demonstrating the interplay between biomechanics and cell kinetics can explain fibrotic scar formation
- auteur
- Jieling Zhao, Seddik Hammad, Mathieu de Langlard, Pia Erdoesi, Yueni Li, Paul van Liedekerke, Andreas Buttenschoen, Manuel Winkler, Sina W Kürschner, Philipp-Sebastian Koch, Niels Grabe, Jan G Hengstler, Matthias P Ebert, Steven Dooley, Dirk Drasdo
- article
- 2023
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-
2022
Journal articles
- titre
- 4D flow cardiovascular magnetic resonance recovery profiles following pulmonary endarterectomy in chronic thromboembolic pulmonary hypertension
- auteur
- Melody Dong, Arshid Azarine, Francois Haddad, Myriam Amsallem, Young-Wouk Kim, Weiguang Yang, Elie Fadel, Laure Aubrege, Michael Loecher, Daniel Ennis, Jérôme Le Pavec, Irene Vignon-Clementel, Jeffrey Feinstein, Olaf Mercier, Alison Marsden
- article
- Journal of Cardiovascular Magnetic Resonance, 2022, 24 (1), pp.59. ⟨10.1186/s12968-022-00893-x⟩
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-
- titre
- Multiscale modelling of Potts shunt as a potential palliative treatment for suprasystemic idiopathic pulmonary artery hypertension: a paediatric case study
- auteur
- Sanjay Pant, Aleksander Sizarov, Angela Knepper, Gaëtan Gossard, Alberto Noferi, Younes Boudjemline, Irene Vignon-Clementel
- article
- Biomechanics and Modeling in Mechanobiology, 2022, 21 (2), pp.471-511. ⟨10.1007/s10237-021-01545-2⟩
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-
- titre
- Special Issue of the VPH2020 Conference: “Virtual Physiological Human: When Models, Methods and Experiments Meet the Clinic”
- auteur
- Irène Vignon-Clémentel, Dominique Chapelle, Philippe Moireau, Abdul I. Barakat, A. Bel-Brunon, Eric Vibert
- article
- Annals of Biomedical Engineering, 2022, 50 (5), pp.483-484. ⟨10.1007/s10439-022-02943-y⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Guided interactive image segmentation using machine learning and color-based image set clustering
- auteur
- Adrian Friebel, Tim Johann, Dirk Drasdo, Stefan Hoehme
- article
- Bioinformatics, 2022, 38 (19), pp.4622-4628. ⟨10.1093/bioinformatics/btac547⟩
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-
Conference papers
- titre
- Impact of Carotid Geometry on Sickle Cell Diseases-Related Cerebral Vasculopthy Development
- auteur
- Kim-Anh Nguyen-Peyre, Weiqiang Liu, Lazaros Papamanolis, Christian Kassasseya, Nour Belkeziz, Valentin Amar, Gabriel Nahas, Saskia Eckert, Pierre Vedel, Laurène Lenoir, Katy Drémont, Sabine Cleophax, France Pirenne, Frédéric Segonds, Suzanne Verlhac, Irene Vignon-Clementel, Pablo Bartolucci
- article
- 64th ASH American Society of Hematology Annual Meeting, Dec 2022, New Orleans, United States. pp.7820 – 7821, ⟨10.1182/blood-2022-156410⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Learning to Jointly Segment the Liver, Lesions and Vessels from Partially Annotated Datasets
- auteur
- Omar Ali, Alexandre Bone, Marc-Michel Rohe, Eric Vibert, Irene Vignon-Clementel
- article
- ICIP 2022 – IEEE International Conference on Image Processing, Oct 2022, Bordeaux, France. pp.3626-3630, ⟨10.1109/ICIP46576.2022.9897470⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- CoRe: An Automated Pipeline for the Prediction of Liver Resection Complexity from Preoperative CT Scans
- auteur
- Omar Ali, Alexandre Bône, Caterina Accardo, Omar Belkouchi, Marc-Michel Rohe, Eric Vibert, Irene Vignon-Clementel
- article
- MICCAI 2022 – workshop on Medical Image Assisted BIomarkers’ Discovery, Sep 2022, Singapore, Singapore. pp.125-133, ⟨10.1007/978-3-031-19660-7_12⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- Modeling the Pulmonary Circulation in CHD: Clinical Concepts, Engineering Applications, and an Integrated Medico-Engineering Approach
- auteur
- Weiguang Yang, Jeffrey Feinstein, Irene Vignon-Clementel
- article
- Modelling Congenital Heart Disease, Springer International Publishing, pp.157-167, 2022, Modelling Congenital Heart Disease, ⟨10.1007/978-3-030-88892-3_14⟩
- Accès au bibtex
-
Poster communications
- titre
- Numerical investigation of particle aggregate steering with magnetic resonance navigation for targeted embolization
- auteur
- Mahdi Rezaei Adariani, Jiří Pešek, Ning Li, Charlotte Debbaut, Gilles Soulez, Irene Vignon-Clementel
- article
- 75th Annual Meeting of the Division of Fluid Dynamics, Nov 2022, Indianapolis, United States
- Accès au bibtex
-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Diffusion-weighted MRI -guided needle biopsies permit quantitative tumor heterogeneity assessment and cell load estimation
- auteur
- Yi Yin, Kai Breuhahn, Hans-Ulrich Kauczor, Oliver Sedlaczek, Irene Vignon-Clementel, Dirk Drasdo
- article
- 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modelling the orchestration of different types of cells and factors during liver regeneration in a virtual liver twin
- auteur
- Jieling Zhao, Hassan Reham, Ahmed Ghallab, Jan G. Hengstler, Dirk Drasdo
- article
- 2022
- Accès au bibtex
-
