Publications

The publication list of Macbes will appear hereafter. To find the publications of the members of Macbes before 2023, you should look for the publications of the Biocore Project-Team.

Publications HAL du labo/EPI MACBES

2024

Conference papers

titre
Re-mating consequences on the efficiency of the sterile insect technique
auteur
Marine A. Courtois, Taha Belkhayate, Crésus Kounoudji, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau, Ludovic Mailleret, Louise van Oudenhove
article
DSABNS – 15th Conference on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences, Feb 2024, Caparica, Portugal
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https://hal.inrae.fr/hal-04452111/file/CT_dsabns2024.pdf BibTex
titre
Mathematical modelling for sustainable crop protection
auteur
Suzanne Touzeau
article
15th International Conference on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences (DSABNS), Feb 2024, Caparica, Portugal
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-04452000/file/MS_dsabns2024_ST.pdf BibTex
titre
Biological control of diamondback moth: a mathematical approach
auteur
Aurelien Kambeu Youmbi, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Berge Tsanou
article
15th International Conference on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences (DSABNS), Feb 2024, Caparica, Portugal
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-04452042/file/CT_dsabns2024.pdf BibTex

Poster communications

titre
Mathematical modeling and control of nematode impact on banana production
auteur
Frank Kemayou, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Samuel Bowong
article
15th International Conference on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences (DSABNS), Feb 2024, Caparica, Portugal.
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-04452078/file/CT_dsabns2024.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Analytic solutions for the circadian oscillator characterize cycle dynamics and its robustness
auteur
Odile Burckard, Madalena Chaves
article
2024
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https://hal.science/hal-04391710/file/submitted-dec2024.pdf BibTex
titre
Cournot oligopoly: a discrete time sticky-prices paradox
auteur
Marc Deschamps, Pierre Bernhard
article
2024
Accès au texte intégral et bibtex
https://univ-fcomte.hal.science/hal-04390731/file/WP-2024-01.pdf BibTex
titre
How residual fertility impacts the efficiency of crop pest control by the sterile insect technique
auteur
Marine A Courtois, Ludovic Mailleret, Suzanne Touzeau, Louise van Oudenhove, Frédéric Grognard
article
2024
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https://hal.inrae.fr/hal-04403761/file/Manuscrit_JTB_final.pdf BibTex

2023

Journal articles

titre
A double-spiral maze and hi-resolution tracking pipeline to study dispersal by groups of minute insects
auteur
Melina Cointe, V. Burte, G. Perez, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
article
Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.5200. ⟨10.1038/s41598-023-31630-8⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-04144010/file/s41598-023-31630-8.pdf BibTex
titre
When complex movement yields simple dispersal: behavioural heterogeneity, spatial spread and parasitism in groups of micro-wasps
auteur
Victor Burte, Melina Cointe, Guy Perez, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
article
Movement Ecology, 2023, 11 (1), pp.13. ⟨10.1186/s40462-023-00371-8⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04047110/file/s40462-023-00371-8.pdf BibTex
titre
Stability analysis of a bacterial growth model through computer algebra
auteur
Agustín Gabriel Yabo, Mohab Safey El Din, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
article
MathematicS In Action, 2023, 12 (1), pp.175-189. ⟨10.5802/msia.37⟩
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https://hal.science/hal-03671432/file/MSIA_2023__12_1_175_0.pdf BibTex
titre
Colonisation debt: when invasion history impacts current range expansion
auteur
Thibaut Morel-Journel, Marjorie Haond, Lana Dunan, Ludovic Mailleret, Elodie Vercken
article
Peer Community Journal, 2023, 3, pp.e59. ⟨10.24072/pcjournal.293⟩
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https://hal.science/hal-04236191/file/10_24072_pcjournal_293.pdf BibTex
titre
Weak synchronization and convergence in coupled genetic regulatory networks: Applications to damped oscillators and multistable circuits
auteur
Nicolas Augier, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
article
International Journal of Robust and Nonlinear Control, 2023, 33 (9), pp.4867-4892. ⟨10.1002/rnc.6061⟩
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https://inria.hal.science/hal-03270268/file/lyapunov.pdf BibTex
titre
Resource allocation accounts for the large variability of rate-yield phenotypes across bacterial strains
auteur
Valentina Baldazzi, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé, Tomas Gedeon, Hidde de Jong
article
eLife, 2023, 12, pp.1-29. ⟨10.7554/eLife.79815⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04145943/file/2022.04.27.489666.full.pdf BibTex
titre
The proportion of resistant hosts in mixtures should be biased towards the resistance with the lowest breaking cost
auteur
Pauline Clin, Frédéric Grognard, Didier Andrivon, Ludovic Mailleret, Frédéric M. Hamelin
article
PLoS Computational Biology, 2023, 19 (5), pp.e1011146. ⟨10.1371/journal.pcbi.1011146⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04143995/file/journal.pcbi.1011146.pdf BibTex
titre
Improving sustainable crop protection using population genetics concepts
auteur
Méline Saubin, Clémentine Louet, Lydia Bousset, Frédéric Fabre, Pascal Frey, Isabelle Fudal, Frédéric Grognard, Frédéric M. Hamelin, Ludovic Mailleret, Solenn Stoeckel, Suzanne Touzeau, Benjamin Petre, Fabien Halkett
article
Molecular Ecology, 2023, 32 (10), pp.2461-2471. ⟨10.1111/mec.16634⟩
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https://hal.science/hal-03394837/file/Note_opinion.pdf BibTex
titre
Migration pulsedness alters patterns of allele fixation and local adaptation in a mainland-island model
auteur
Flora Aubree, Baptiste Lac, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
article
Evolution – International Journal of Organic Evolution, 2023, 77 (3), pp.718-730. ⟨10.1093/evolut/qpac067⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04047090/file/2021.06.24.449762v3.full.pdf BibTex
titre
Large satellite constellations and space debris: exploratory analysis of strategic management of the space commons
auteur
Pierre Bernhard, Marc Deschamps, Georges Zaccour
article
European Journal of Operational Research, 2023, 304 (3), pp.1140-1157. ⟨10.1016/j.ejor.2022.04.030⟩
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https://inria.hal.science/hal-03909662/file/berdeszacelsV3.pdf BibTex
titre
Impulsive modelling of rust dynamics and predator releases for biocontrol
auteur
Clotilde Djuikem, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau
article
Mathematical Biosciences, 2023, 356, pp.108968. ⟨10.1016/j.mbs.2023.108968⟩
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https://inria.hal.science/hal-03952381/file/Djuikem-etal_2022-11_preprint.pdf BibTex
titre
Optimal protein production by a synthetic microbial consortium: Coexistence, distribution of labor, and syntrophy
auteur
Carlos Martinez, Eugenio Cinquemani, Hidde de Jong, Jean-Luc Gouzé
article
Journal of Mathematical Biology, 2023, 87 (1), pp.1-37. ⟨10.1007/s00285-023-01935-3⟩
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https://inria.hal.science/hal-03525249/file/Optimal_protein_production_by_a_synthetic_microbia-2.pdf BibTex
titre
Optimal Control of Coffee Berry Borers: Synergy Between Bio-insecticide and Traps
auteur
Yves Fotso Fotso, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Berge Tsanou, Samuel Bowong
article
Journal of Optimization Theory and Applications, 2023, 196 (3), pp.882-899. ⟨10.1007/s10957-022-02151-7⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03954863/file/CBB-Berries_preprint_2022.pdf BibTex

Conference papers

titre
Couplage et synchronisation d’horloges circadiennes périphériques
auteur
Odile Burckard, Madalena Chaves, Franck Delaunay, Michèle Teboul
article
48ème congrès de la Société Francophone de Chronobiologie, Oct 2023, Paris, France. pp.249, ⟨10.1016/j.msom.2023.10.021⟩
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https://hal.science/hal-04391603/file/SFC-Paris-abstract2023-hal.pdf BibTex
titre
Resource allocation strategies behind rate-yield phenotypes in E.coli
auteur
Valentina Baldazzi, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé, Tomas Gedeon, Hidde de Jong
article
2023 – Workshop on Advanced School on Quantitative Principles in Microbial Physiology: from Single Cells to Cell Communities, ICTP, Oct 2023, Trieste, Italy. pp.1
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https://hal.inrae.fr/hal-04216644/file/abstract_talk.pdf BibTex
titre
Modelling plant-nematodes interactions to understand plant tolerance
auteur
Joseph Junior Penlap Tamagoua, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Valentina Baldazzi
article
IMACS 2023 – 21st World Congress of the International Association for Mathematics and Computers in Simulation, Sep 2023, Rome, Italy
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https://hal.inrae.fr/hal-04216608/file/abstract_IMACS23_final.pdf BibTex
titre
Ringed micro-habitats as supplementations for predatory mites
auteur
Cécile Bresch, Louise van Oudenhove, Julie Nardini, Lucas Browet, Lydia Ottenwaelder, Ludovic Mailleret
article
IOBC-WPRS WGs 2023 – Integrated control in protected crops, temperate and mediterranean climate, Aug 2023, Brest, France
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https://hal.inrae.fr/hal-04166972/file/bresch-IOBC-brest-et-al-2023_rev1.pdf BibTex
titre
Cycle dynamics and synchronization analysis for biological oscillators
auteur
Madalena Chaves
article
International School and Conference on Network Science, Jul 2023, Vienna, Austria
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BibTex
titre
Impulsive modelling of rust dynamics and predator releases
auteur
Clotilde Djuikem, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau
article
CMPD6 – Computational and Mathematical Population Dynamics, May 2023, Winnipeg, Canada
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BibTex
titre
Modelling plant – nematode interactions to understand plant tolerance
auteur
Joseph Junior Penlap Tamagoua, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Valentina Baldazzi
article
MPDEE 2023 – Conference on Mathematical Population Dynamics, Ecology and Evolution, Apr 2023, Marseille, France
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BibTex
titre
A sex- and stage-structured population dynamics model for pest control using the sterile insect technique
auteur
Crésus Kounoudji, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Louise van Oudenhove, Ludovic Mailleret
article
MPDEE 2023 – Mathematical Population Dynamics, Ecology and Evolution, Apr 2023, Marseille, France
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https://hal.inrae.fr/hal-04144139/file/topo.pdf BibTex
titre
Self-financing model for cabbage crops
auteur
Aurelien Kambeu Youmbi, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Berge Tsanou
article
MPDEE 2023 – Conference on Mathematical Population Dynamics, Ecology and Evolution, Apr 2023, Marseille, France
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BibTex
titre
Pulsed perturbations in population dynamics
auteur
Ludovic Mailleret
article
MOMI2023 – Le MOnde des Mathématiques Industrielles, Apr 2023, Sophia Antipolis (06), France
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https://hal.inrae.fr/hal-04144067/file/mailleret_momi_2023.pdf BibTex
titre
How does residual fertility impact the effectiveness of the sterile insect technique in controlling Ceratitis capitata?
auteur
Marine Courtois, Kévan Rastello, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Suzanne Touzeau, Louise van Oudenhove
article
MPDEE 2023 – Mathematical Population Dynamics, Ecology and Evolution, Apr 2023, Marseille, France
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https://hal.inrae.fr/hal-04144121/file/Marine_COURTOIS_Talk_CIRM_avril23.pdf BibTex
titre
Life is not a long quiet river: consequences of migration pulsedness for adaptation and divergence
auteur
Flora Aubree, Baptiste Lac, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
article
Complex Days 2023, Académie Systèmes Complexes 2023, Feb 2023, Nice, France
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BibTex
titre
Bridging behavior and spatial propagation: a new double spiral maze and image analysis pipeline to study dispersal in groups of minute insects
auteur
Mélina Cointe, Victor Burte, Guy Perez, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
article
UCA Complex Days 2023, Académie Systèmes Complexes, Feb 2023, Nice, France
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BibTex
titre
Hands on Pluto : dynamical systems with reactive Julia notebooks
auteur
Ludovic Mailleret
article
Julia day, Jan 2023, Sophia Antipolis, France
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https://hal.inrae.fr/hal-04144081/file/pres_pluto.pdf BibTex
titre
Observer Design via Non-Monotone Lyapunov Functions for Monitoring Heterotrophic Microalgae
auteur
Juan Carlos Arceo, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé
article
22nd IFAC World Congress, 2023, Yokohama, Japan
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https://inria.hal.science/hal-04229860/file/_IFAC_2023__Observer_Design_via_Non_Monotone_Lyapunov_Functions_for_Monitoring_Heterotrophic_Microalgae-1.pdf BibTex

Habilitation à diriger des recherches

titre
Modelling and control of managed ecosystems, from bioreactors to agroecosystems
auteur
Frédéric Grognard
article
Automatic Control Engineering. Université Côte D’Azur, 2023
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https://inria.hal.science/tel-04176866/file/manuscritHDR-Grognard.pdf BibTex

Poster communications

titre
Benchmark for quantitative characterization of circadian clock models
auteur
Odile Burckard, Madalena Chaves
article
21st International Conference on Computational Methods in Systems Biology, Sep 2023, Luxembourg City, Luxembourg. , Lecture notes in computer science. Lecture Notes in Bioinformatics, LNCS.LNBI-14137, Computational Methods in Systems Biology 21st International Conference, CMSB 2023, Luxembourg City, Luxembourg, September 13–15, 2023, Proceedings
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BibTex
titre
Sterile Insect Technique for crop protection: accounting for residual fertility
auteur
Marine Courtois, Kévan Rastello, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Suzanne Touzeau, Louise van Oudenhove
article
Le MOnde des Mathématiques Industrielles, MOMI2023, Apr 2023, Sophia Antipolis, France.
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https://hal.inrae.fr/hal-04144059/file/Poster_DSABNS_Bilbao_Courtois_2023.pdf BibTex
titre
Ecophysiological modelling of plant-nematode interactions to understand plant tolerance
auteur
Joseph Junior Penlap Tamagoua, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Valentina Baldazzi
article
DSABNS 2023 Conference – 14th International Conference on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences, Feb 2023, Bilbao, Spain. 2023
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-04146030/file/P_Joseph_Penlap_dsabns2023.pdf BibTex
titre
Sterile insect technique for crop protection: accounting for residual fertility
auteur
Marine Courtois, Kévan Rastello, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Suzanne Touzeau, Louise van Oudenhove
article
DSABNS 2023 – 14th Conference on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences, Feb 2023, Bilbao, Spain, Spain.
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-04049975/file/Abstract_DSABNS_Bilbao_Courtois_2023.pdf BibTex

Theses

titre
Modeling cancer drug response dynamics in single-cells to predict the emergence of drug-tolerant cells
auteur
Marielle Péré
article
Modeling and Simulation. Université Côte d’Azur, 2023. English. ⟨NNT : ⟩
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https://inria.hal.science/tel-04350085/file/Thesis_MariellePere.pdf BibTex
titre
Mathematical modelling and control of perennial plant phytopathogens
auteur
Clotilde Djuikem
article
Automatic Control Engineering. Université Côte d’Azur, 2023. English. ⟨NNT : 2023COAZ4002⟩
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https://theses.hal.science/tel-04026720/file/2023COAZ4002.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Optimal bacterial resource allocation strategies in batch processing
auteur
Agustín Gabriel Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
article
2023
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03710681/file/Optimal_bacterial_resource_allocation_in_batch_processing%20%281%29.pdf BibTex
titre
Assessing Inter-Individual Genetic Variability in Peach Sugar Metabolism through Reliable Parameter Estimation of a Kinetic Model
auteur
Hussein Kanso, Mohamed-Mahmoud Memah, Valentina Baldazzi, Bénédicte Quilot-Turion, Charlotte Baey
article
2023
Accès au bibtex
BibTex
titre
Colonisation debt: when invasion history impacts current range expansion
auteur
Thibaut Morel-Journel, Marjorie Haond, Lana Dunan, Ludovic Mailleret, Elodie Vercken
article
2023
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-04144037/file/2022.11.13.516255v4.full.pdf BibTex
titre
Numerical approach to the identification of fractional differential equations and applications in epidemics
auteur
Jacky Cresson, Marielle Péré, Anna Szafranska
article
2023
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-04065555/file/PredictionNishiuraWithoutWeights_h01093.pdf BibTex
titre
A double-spiral maze and hi-resolution tracking pipeline to study dispersal by groups of minute insects
auteur
Melina Cointe, Victor Burte, Guy Perez, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
article
2023
Accès au bibtex
BibTex
titre
Optimal impulsive control of coffee berry borers in a berry age-structured epidemiological model
auteur
Yves Fotso Fotso, Suzanne Touzeau, Berge Tsanou, Frédéric Grognard, Samuel Bowong
article
2023
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-04100767/file/2023_ARIMA_38_FotsoFotso.pdf BibTex

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