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Publications HAL de Warfield du labo/EPI visages

2017

Journal articles

titre
Longitudinal multiple sclerosis lesion segmentation: Resource and challenge
auteur
Aaron Carass, Snehashis Roy, Amod Jog, Jennifer L. Cuzzocreo, Elizabeth Magrath, Adrian Gherman, Julia Button, James Nguyen, Ferran Prados, Carole Sudre, Manuel Jorge Cardoso, Niamh Cawley, Olga Ciccarelli, Claudia Wheeler-Kingshott, Sébastien Ourselin, Laurence Catanese, Hrishikesh Deshpande, Pierre Maurel, Olivier Commowick, Christian Barillot, Xavier Tomas-Fernandez, Simon Warfield, Suthirth Vaidya, Abhijith Chunduru, Ramanathan Muthuganapathy, Ganapathy Krishnamurthi, Andrew Jesson, Tal Arbel, Oskar Maier, Heinz Handels, Leonardo Iheme, Devrim Unay, Saurabh Jain, Diana Sima, Dirk Smeets, Mohsen Ghafoorian, Bram Platel, Ariel Birenbaum, Hayit Greenspan, Pierre-Louis Bazin, Peter Calabresi, Ciprian Crainiceanu, Lotta Ellingsen, Daniel Reich, Jerry Prince, Dzung Pham
article
NeuroImage, Elsevier, 2017, 148, pp.77 – 102. 〈10.1016/j.neuroimage.2016.12.064〉
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2016.12.064
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-01480156/file/2017-NI-Carass-Challenge-2016_Dec_22.pdf BibTex
titre
Block-Matching Distortion Correction of Echo-Planar Images With Opposite Phase Encoding Directions
auteur
Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Elise Bannier, Benoit Scherrer, Maxime Taquet, Simon K. Warfield, Christian Barillot
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, 36 (5), pp.1106 – 1115. 〈10.1109/TMI.2016.2646920〉
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2016.2646920
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https://hal.inria.fr/hal-01436561/file/TMI_FinalVersion_WithoutCopyright.pdf BibTex

Conference papers

titre
Multi-Compartment T2 Relaxometry Model Using Gamma Distribution Representations: A Framework for Quantitative Estimation of Brain Tissue Microstructures
auteur
Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Simon K. Warfield, Christian Barillot
article
ISMRM 25TH ANNUAL MEETING & EXHIBITION, Apr 2017, Honolulu, Hawaii, USA, United States
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BibTex
titre
Gaining Insights Into Multiple Sclerosis Lesion Characteristics from Brain Tissue Microstructure Information: A Multi-Compartment T2 Relaxometry Approach
auteur
Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Simon Warfield, Christian Barillot
article
ISMRM 25TH ANNUAL MEETING & EXHIBITION, Apr 2017, Honolulu, Hawaii, USA, United States
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-01543061/file/Gauss-MCM-poster.pdf BibTex

2016

Conference papers

titre
Comprehensive Maximum Likelihood Estimation of Diffusion Compartment Models Towards Reliable Mapping of Brain Microstructure
auteur
Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Simon Warfield, Simone Vantini
article
19th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2016, Athens, Greece. 9902, pp.622 – 630, 2016, LNCS. 〈10.1007/978-3-319-46726-9_72〉
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-46726-9_72
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-01349556/file/MICCAI2016.pdf BibTex
titre
Maximum Likelihood Estimators of Brain White Matter Microstructure
auteur
Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Simone Vantini, Simon Warfield
article
48th Scientific Meeting of the Italian Statistical Society, Jun 2016, Salerno, Italy
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-01347200/file/SIS2016.pdf BibTex

2015

Conference papers

titre
Symmetric Block-Matching Registration for the Distortion Correction of Echo-Planar Images
auteur
Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Maxime Taquet, Elise Bannier, Benoit Scherrer, Simon Warfield, Christian Barillot
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, New York, United States. pp.717-720, 2015
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-01118766/file/215_0204.pdf BibTex

2014

Journal articles

titre
A Mathematical Framework for the Registration and Analysis of Multi-Fascicle Models for Population Studies of the Brain Microstructure
auteur
Maxime Taquet, Benoit Scherrer, Olivier Commowick, Jurriaan Peters, Mustafa Sahin, Benoît Macq, Simon K. Warfield
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2014, 33 (2), pp.504-517. 〈10.1109/TMI.2013.2289381〉
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2013.2289381
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00903679/file/taquet_tmi.pdf BibTex

Conference papers

titre
Tracking the Cortico-Spinal Tract as a Multi-Modal Distribution of Streamlines from Local White Matter Microstructure Models
auteur
Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Xavier Tomas-Fernandez, Jolene Singh, Simon K. Warfield
article
MICCAI Challenge on DTI Tractography Proceedings, Sep 2014, Boston, United States. pp.21-32, 2014
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-01066812/file/Miccai2014_DTI_Challenge_Stamm_withAcknowlegments.pdf BibTex
titre
Non-central chi estimation of multi-compartment models improves model selection by reducing overfitting
auteur
Aymeric Stamm, Benoit Scherrer, Stefano Baraldo, Olivier Commowick, Simon K. Warfield
article
ISMRM, May 2014, Milan, Italy. pp.2623, 2014
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00993964/file/2623.pdf BibTex
titre
Fast and robust detection of the optimal number of fascicles in diffusion images using model averaging theory
auteur
Aymeric Stamm, Benoit Scherrer, Olivier Commowick, Christian Barillot, Simon K. Warfield
article
ISMRM, May 2014, Milan, Italy. pp.2629, 2014
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00993965/file/2629.pdf BibTex

2012

Journal articles

titre
Estimating A Reference Standard Segmentation with Spatially Varying Performance Parameters: Local MAP STAPLE
auteur
Olivier Commowick, Alireza Akhondi-Asl, Simon K. Warfield
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2012, 31 (8), pp.1593-1606. 〈10.1109/TMI.2012.2197406〉
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2012.2197406
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00697775/file/TMI_LocalStaple_Final.pdf BibTex
titre
Automated delineation of white matter fiber tracts with a multiple region-of-interest approach.
auteur
Ralph Suarez, Olivier Commowick, Sanjay Prabhu, Simon K. Warfield
article
NeuroImage, Elsevier, 2012, 59 (4), pp.3690-3700. 〈10.1016/j.neuroimage.2011.11.043〉
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2011.11.043
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Conference papers

titre
Registration and Analysis of White Matter Group Differences with a Multi-Fiber Model
auteur
Maxime Taquet, Benoit Scherrer, Olivier Commowick, Jurriaan Peters, Mustafa Sahin, Benoît Macq, Simon K. Warfield
article
15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. 7512, pp.313-320, 2012, LNCS
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00716110/file/paper_1124.pdf BibTex

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