2024
Preprints, Working Papers, …
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- Marion Naveau, Maud Delattre, Laure Sansonnet. Posterior contraction rates in a sparse non-linear mixed-effects model. 2024. ⟨hal-04561040v2⟩
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- Kevin Bleakley. Extreme change-point detection. 2024. ⟨hal-04523912v2⟩
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2023
Journal articles
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- Marion Naveau, Guillaume Kon Kam King, Renaud Rincent, Laure Sansonnet, Maud Delattre. Bayesian high-dimensional covariate selection in non-linear mixed-effects models using the SAEM algorithm. Statistics and Computing, 2023, 34 (1), pp.53. ⟨10.1007/s11222-023-10367-4⟩. ⟨hal-04395282⟩
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- Maud Delattre, Yusuke Toda, Hiroyoshi Iwata, Jessica Tressou. Modeling soybean growth: A mixed model approach. PLoS Computational Biology, 2023, 20 (7), pp.e1011258. ⟨10.1371/journal.pcbi.1011258⟩. ⟨hal-04220837⟩
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- Maud Delattre, Estelle Kuhn. Computing an empirical Fisher information matrix estimate in latent variable models through stochastic approximation. Computo, 2023, ⟨10.57750/r5gx-jk62⟩. ⟨hal-04347257⟩
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Conference papers
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- Marion Naveau, Laure Sansonnet, Maud Delattre. Selection consistency in non-linear mixed-effects models under spike-and-slab prior. Colloque Jeunes Probabilistes et Statisticiens, Oct 2023, Saint Pierre d’Oleron, France. ⟨hal-04248058⟩
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- Charlotte Baey, Maud Delattre, Estelle Kuhn, Jean-Benoist Leger, Sarah Lemler. Efficient preconditioned stochastic gradient descent for estimation in latent variable models. 40th International Conference on Machine Learning, Jul 2023, Honolulu, United States. ⟨hal-04131641⟩
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- Marion Naveau, Guillaume Kon Kam King, Renaud Rincent, Laure Sansonnet, Maud Delattre. High-dimensional variable selection in non-linear mixed-effects models using a stochastic EM spike-and-slab. European Meeting of Statisticians, Bernoulli Society, Jul 2023, Warsaw, Poland. ⟨hal-04248037⟩
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- Maud Delattre. Sélection de variables bayésienne en grande dimension dans les modèles non-linéaires à effets mixtes. Journées de statistiques de Rennes, Apr 2023, Rennes, France. ⟨hal-04210257⟩
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Preprints, Working Papers, …
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- Marion Naveau, Guillaume Kon Kam King, Renaud Rincent, Laure Sansonnet, Maud Delattre. Bayesian high-dimensional covariate selection in non-linear mixed-effects models using the SAEM algorithm. 2023. ⟨hal-03685060v4⟩
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- Maud Delattre, Estelle Kuhn. Estimating Fisher Information Matrix in Latent Variable Models based on the Score Function. 2023. ⟨hal-02285712v2⟩
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2022
Journal articles
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- Romain Narci, Maud Delattre, Catherine Larédo, Elisabeta Vergu. Inference in Gaussian state-space models with mixed effects for multiple epidemic dynamics. Journal of Mathematical Biology, 2022, 85, pp.40. ⟨10.1007/s00285-022-01806-3⟩. ⟨hal-03347365⟩
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- Jean David Pommier, Chris Gorman, Yoann Crabol, Kevin Bleakley, Heng Sothy, et al.. Childhood encephalitis in the Greater Mekong region (the SouthEast Asia Encephalitis Project): a multicentre prospective study. The Lancet global health, 2022, 10 (7), pp.e989-e1002. ⟨10.1016/S2214-109X(22)00174-7⟩. ⟨hal-03823946⟩
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- Juliette Paireau, Alessio Andronico, Nathanaël El Hoz, Maylis Layan, Pascal Crepey, et al.. An ensemble model based on early predictors to forecast COVID-19 health care demand in France. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2022, 119 (18), pp.e2103302119. ⟨10.1073/pnas.2103302119⟩. ⟨pasteur-03690824v3⟩
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- Marc Lavielle. Using hospital data for monitoring the dynamics of COVID 19 in France. Journal of Data Science, Statistics, and Visualisation, 2022, ⟨10.52933/jdssv.v2i7.48⟩. ⟨hal-03321804v2⟩
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- Mélanie Prague, Marc Lavielle. SAMBA: a Novel Method for Fast Automatic Model Building in Nonlinear Mixed-Effects Models. CPT: Pharmacometrics and Systems Pharmacology, 2022, 11 (2), ⟨10.1002/psp4.12742⟩. ⟨hal-03410025⟩
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Conference papers
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- Maud Delattre. Statistical analysis of stochastic processes and applications in life science. Journées MAS 2022, Aug 2022, Rouen, France. ⟨hal-04083875⟩
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- Marion Naveau, Guillaume Kon Kam King, Laure Sansonnet, Maud Delattre. Bayesian high-dimensional variable selection in non-linear mixed-effects models using the SAEM algorithm. 53ème Journées de Statistique de la Société Française de Statistique, Jun 2022, Lyon, France. ⟨hal-04247962⟩
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- Marion Naveau, Guillaume Kon Kam King, Laure Sansonnet, Maud Delattre. Bayesian high-dimensional variable selection in non-linear mixed-effects models using the SAEM algorithm. Journée APPLIBUGS, Jun 2022, Lyon, France. ⟨hal-04247984⟩
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- Maud Delattre, Hiroyoshi Iwata, Jessica Tressou. Modelling soybean growth: a nonlinear mixed model approach. EcoSta, Jun 2022, Kyoto, Japan. ⟨hal-04083815⟩
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- Marion Naveau, Guillaume Kon Kam King, Laure Sansonnet, Maud Delattre. Sélection de variables en grande dimension dans les modèles non linéaires à effets mixtes. 9ème Rencontre des Jeunes Statisticiens, Apr 2022, Porquerolles, France. ⟨hal-04247947⟩
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Poster communications
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- Marion Naveau, Guillaume Kon Kam King, Laure Sansonnet, Maud Delattre. High-dimensional variable selection in non-linear mixed effects models using a stochastic EM spike-and-slab. ISBA World Meeting, Jun 2022, Montréal, Canada. . ⟨hal-04248003⟩
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Preprints, Working Papers, …
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- Kevin Bleakley, Camille Fortas, Veasna Duong, Sowath Ly, Tineke Cantaert, et al.. Multivariate evidence-based pediatric dengue severity prediction at hospital arrival. 2022. ⟨hal-03881145⟩
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- Anna Polesskaya, Arthur Boutillon, Sheng Yang, Yanan Wang, Stéphane Romero, et al.. Restrained activation of CYFIP2-containing WAVE complexes controls membrane protrusions and cell migration. 2022. ⟨hal-03823496⟩
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2021
Journal articles
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- Romain Narci, Maud Delattre, Catherine Larédo, Elisabeta Vergu. Inference for partially observed epidemic dynamics guided by Kalman filtering techniques. Computational Statistics and Data Analysis, 2021, 164, ⟨10.1016/j.csda.2021.107319⟩. ⟨hal-02475936v4⟩
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- Marc Lavielle, Matthieu Faron, Jérémie H Lefevre, Jean-David Zeitoun. Predicting the propagation of COVID-19 at an international scale: extension of an SIR model. BMJ Open, 2021, 11 (5), pp.e041472. ⟨10.1136/bmjopen-2020-041472⟩. ⟨hal-03239518⟩
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- Jean-David Pommier, Frederic Martino, Kevin Bleakley, Laure Flurin, Fabien Van Roy, et al.. A Tale of a Two Waves Epidemic: Characteristics and Mortality Risk Factors for COVID-19 ICU Patients in the French West Indies. Journal of Biology and Today’s World, 2021, ⟨10.21203/rs.3.rs-200243/v1⟩. ⟨hal-03536693⟩
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- Jean-David Zeitoun, Matthieu Faron, Sylvain Manternach, Jerome Fourquet, Marc Lavielle, et al.. Reciprocal association between participation to a national election and the epidemic spread of COVID-19 in France: nationwide observational and dynamic modeling study.. European Journal of Public Health, 2021, ⟨10.1101/2020.05.14.20090100⟩. ⟨hal-02995300⟩
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- Maud Delattre. A review on asymptotic inference in stochastic differential equations with mixed-effects. Japanese Journal of Statistics and Data Science , 2021, ⟨10.1007/s42081-021-00105-3⟩. ⟨hal-02938697⟩
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Reports
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Synthèse sur la détection des produits issus des nouvelles technologies génomiques (NGT) appliquées aux plantes. Paris, Paris, le 26 novembre 2021. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2021, 29 p. ⟨hal-03752888⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. AVIS en réponse à la saisine HCB – dossier 2020-172. Paris, le 06 septembre 2021. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2021, 26 p. ⟨hal-03752894⟩
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Preprints, Working Papers, …
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- Marc Lavielle. Some EM-type algorithms for incomplete data model building. 2021. ⟨hal-03512130⟩
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2020
Journal articles
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- Masoomeh Taghipoor, Maud Delattre, Sylvie Giger-Reverdin. A novel modelling approach to quantify the response of dairy goats to a high-concentrate diet. Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.20376. ⟨10.1038/s41598-020-77353-y⟩. ⟨hal-03132771⟩
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- Maud Delattre, Marie-Anne Poursat. An iterative algorithm for joint covariate and random effect selection in mixed effects models. The international journal of biostatistics, 2020, 16 (2), ⟨10.1515/ijb-2019-0082⟩. ⟨hal-03144783⟩
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- Marc Lavielle, Philip Waggoner. Exploring and Comparing Unsupervised Clustering Algorithms. Journal of Open Research Software, 2020, 8, ⟨10.5334/jors.269⟩. ⟨hal-03031919⟩
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- Jérémie Goulnik, Sylvain Plantureux, Marc Thery, Mathilde Baude, Maud Delattre, et al.. Floral trait functional diversity is related to soil characteristics and positively influences pollination function in semi-natural grasslands. Agriculture, Ecosystems & Environment, 2020, 301, pp.107033. ⟨10.1016/j.agee.2020.107033⟩. ⟨hal-02915375⟩
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- Antoine Dowek, Laetitia Minh Mai Lê, Tom Rohmer, François-Xavier Legrand, Hynd Remita, et al.. A mathematical approach to deal with nanoparticle polydispersity in surface enhanced Raman spectroscopy to quantify antineoplastic agents. Talanta, 2020, 217, pp.121040. ⟨10.1016/j.talanta.2020.121040⟩. ⟨hal-02557279⟩
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- Antoine Dowek, Laetitia Minh Mai Lê, Tom Rohmer, François-Xavier Legrand, Hynd Remita, et al.. A mathematical approach to deal with nanoparticle polydispersity in surface enhanced Raman spectroscopy to quantify antineoplastic agents. Talanta, 2020, 217, pp.121040. ⟨10.1016/j.talanta.2020.121040⟩. ⟨hal-04294318⟩
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- Antoine Dowek, Laetitia Minh Mai Lê, Tom Rohmer, François-Xavier Legrand, Hynd Remita, et al.. A mathematical approach to deal with nanoparticle polydispersity in surface enhanced Raman spectroscopy to quantify antineoplastic agents. Talanta, 2020, 217, pp.121040. ⟨10.1016/j.talanta.2020.121040⟩. ⟨hal-03437402⟩
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- Hugo Lachuer, Pallavi Mathur, Kevin Bleakley, Kristine Schauer. Quantifying Spatiotemporal Parameters of Cellular Exocytosis in Micropatterned Cells. Journal of visualized experiments : JoVE, 2020, 163, ⟨10.3791/60801⟩. ⟨hal-03033396⟩
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- ref_biblio
- Philippe Dussart, Veasna Duong, Kevin Bleakley, Camille Fortas, Patrich Lorn Try, et al.. Comparison of dengue case classification schemes and evaluation of biological changes in different dengue clinical patterns in a longitudinal follow-up of hospitalized children in Cambodia. PLoS Neglected Tropical Diseases, 2020, 14 (9), pp.e0008603. ⟨10.1371/journal.pntd.0008603⟩. ⟨hal-03033376⟩
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- Edith Nicol, Yao Xu, Zsuzsanna Varga, Said Kinani, Stéphane Bouchonnet, et al.. SPIX: a new software package to reveal chemical reactions at trace amounts in very complex mixtures from high-resolution mass spectra data sets. Rapid Communications in Mass Spectrometry, In press. ⟨hal-03029906⟩
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- ref_biblio
- Marion Tharrey, François Mariotti, Andrew Mashchak, Pierre Barbillon, Maud Delattre, et al.. Patterns of amino acids intake are strongly associated with cardiovascular mortality, independently of the sources of protein. International Journal of Epidemiology, 2020, 49 (1), pp.312 – 321. ⟨10.1093/ije/dyz194⟩. ⟨hal-02366516⟩
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Conference papers
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- Jérémie Goulnik, Sylvain Plantureux, Marc Théry, Mathilde Baude, Maud Delattre, et al.. Pollination function is positively influenced by floral traits functional diversity in semi-natural grasslands. 28th General Meeting of the European Grassland Federation – 2020 EGF, Oct 2020, Helsinki, Finland. ⟨hal-02974143⟩
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Habilitation à diriger des recherches
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- Maud Delattre. Etudes de modèles markoviens à variables latentes avec applications à la pharmacologie et à l’épidémiologie.. Statistiques [math.ST]. Université Paris-Saclay, 2020. ⟨tel-03202055⟩
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Reports
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- Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Commentaires sur le rapport de surveillance de culture du MON 810 en 2018. Paris, le 25 février 2020. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2020, 35 p. ⟨hal-02917702⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine du 2 juillet 2020 relative au projet de décret modifiant l’article D.531-2 du code de l’environnement. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2020, 44 p. ⟨hal-02917686⟩
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Preprints, Working Papers, …
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- Rolando de La Cruz, Marc Lavielle, Cristian Meza, Vicente Núñez-Antón. Alternative subgroup joint analysis proposal of nonlinear longitudinal and time-to-event data for modeling pregnancy miscarriage. 2020. ⟨hal-03029909⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
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- ref_biblio
- Anna Polesskaya, Arthur Boutillon, Yanan Wang, Marc Lavielle, Sophie Vacher, et al.. CYFIP2 containing WAVE complexes inhibit cell migration. 2020. ⟨hal-03014297⟩
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- ref_biblio
- Marc Lavielle, Matthieu Faron, Jeremie Lefevre, Jean-David Zeitoun. Extension of a SIR model for modelling the propagation of Covid-19 in several countries.. 2020. ⟨hal-02995305⟩
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- ref_biblio
- Emilie Sbidian, Julie Josse, Guillaume Lemaître, Imke Mayer, Melodie Bernaux, et al.. Hydroxychloroquine with or without azithromycin and in-hospital mortality or discharge in patients hospitalized for COVID-19 infection: a cohort study of 4,642 in-patients in France. 2020. ⟨hal-02995319⟩
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2019
Journal articles
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- Wei Jiang, Julie Josse, Marc Lavielle. Logistic Regression with Missing Covariates — Parameter Estimation, Model Selection and Prediction. Computational Statistics and Data Analysis, In press, pp.106907. ⟨10.1016/j.csda.2019.106907⟩. ⟨hal-01958835v2⟩
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- Mor Absa Loum, Marie-Anne Poursat, Abdourahmane Sow, Amadou Alpha Sall, Cheikh Loucoubar, et al.. Multinomial Logistic Model for Coinfection Diagnosis Between Arbovirus and Malaria in Kedougou. The international journal of biostatistics, 2019, 15 (2), ⟨10.1515/ijb-2017-0015⟩. ⟨hal-02399409⟩
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- Belhal Karimi, Marc Lavielle, Éric Moulines. f-SAEM: A fast Stochastic Approximation of the EM algorithm for nonlinear mixed effects models. Computational Statistics and Data Analysis, In press, ⟨10.1016/j.csda.2019.07.001⟩. ⟨hal-01958248⟩
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- Maxime Touzot, Pascal Seris, Catherine Maheas, Jill Vanmassenhove, Anne-Lyse Langlois, et al.. A mathematical model to predict BNP levels in hemodialysis patients. Nephrology, 2019, ⟨10.1111/nep.13586⟩. ⟨hal-02127228⟩
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- Aline Marguet, Marc Lavielle, Eugenio Cinquemani. Inheritance and variability of kinetic gene expression parameters in microbial cells: modeling and inference from lineage tree data. Bioinformatics, 2019, 35 (14), pp.i586-i595. ⟨10.1093/bioinformatics/btz378⟩. ⟨hal-02317115⟩
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Conference papers
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- Belhal Karimi, Hoi-To Wai, Éric Moulines, Marc Lavielle. On the Global Convergence of (Fast) Incremental Expectation Maximization Methods. NeurIPS 2019 – 33th Annual Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2019, Vancouver, Canada. ⟨hal-02334656v2⟩
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-
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- Maud Delattre, Estelle Kuhn. Estimating Fisher information matrix in latent variable models based on the score function. 32. European Meeting of Statisticians -EMS, May 2019, Palermo, Italy. ⟨hal-02735033⟩
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-
Reports
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB sur le dossier EFSA-GMO-ES-2018-154. Paris, le 5 avril 2019. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2019, 14 p. ⟨hal-03354427⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – dossier 2018-151. Paris, le 10 janvier 2019. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2019. ⟨hal-02790157⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – dossier RX-015. Paris, le 26 février 2019. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2019. ⟨hal-02788222⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – dossier RX-016. Paris, le 21 février 2019. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2019, 23 p. ⟨hal-02917709⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB- dossier 2019-159. Paris, le 16 décembre 2019. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2019, 34 p. ⟨hal-02917777⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – dossier EFSA-GMO-RX-013. Paris, le 30 janvier 2019. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2019. ⟨hal-02788108⟩
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- Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – EFSA-GMO-ES-2018-154. Paris, le 5 avril 2019. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2019. ⟨hal-02790350⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – habilitation agents 2019. Paris, le 4 juillet 2019. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2019, 2 p. ⟨hal-03354431⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – habilitation agents juillet 2019. Paris, le 19 septembre 2019. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2019, 2 p. ⟨hal-03354433⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – dossier EFSA-GMO-NL-2018-153. Paris, le 24 mai 2019. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2019. ⟨hal-02790080⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Commentaires sur le rapport de surveillance de culture du MON 810 en 2017. Paris, le 23 décembre 2019. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2019, 41 p. ⟨hal-02917782⟩
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Preprints, Working Papers, …
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- Belhal Karimi, Marc Lavielle, Éric Moulines. On the Convergence Properties of the Mini-Batch EM and MCEM Algorithms. 2019. ⟨hal-02334485⟩
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- Mor Absa Loum, Marie-Anne Poursat, Abdourahmane Sow, Amadou Alpha Sall, Cheikh Loucoubar, et al.. Multinomial logistic model for coinfection diagnosis between arbovirus and malaria in Kedougou. 2019. ⟨hal-01675617v2⟩
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2018
Journal articles
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- Florian Le Billan, Larbi Amazit, Kevin Bleakley, Qiong-Yao Xue, Eric Pussard, et al.. Corticosteroid receptors adopt distinct cyclical transcriptional signatures. FASEB Journal, 2018, 32 (10), pp.5626-5639. ⟨10.1096/fj.201800391RR⟩. ⟨hal-01960262⟩
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- Iryna Nikolayeva, Pierre Bost, Isabelle Casademont, Veasna Duong, Fanny Koeth, et al.. A Blood RNA Signature Detecting Severe Disease in Young Dengue Patients at Hospital Arrival. Journal of Infectious Diseases, 2018, 217 (11), pp.1690-1698. ⟨10.1093/infdis/jiy086⟩. ⟨pasteur-02088893⟩
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- Marc Cerou, Marc Lavielle, Karl Brendel, Marylore Chenel, Emmanuelle Comets. Development and performance of npde for the evaluation of time-to-event models. Pharmaceutical Research, 2018, 35 (2), pp.30. ⟨10.1007/s11095-017-2291-3⟩. ⟨inserm-01695500v2⟩
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- Marion Tharrey, François Mariotti, Andrew Mashchak, Pierre M Barbillon, Maud Delattre, et al.. Patterns of plant and animal protein intake are strongly associated with cardiovascular mortality: the Adventist Health Study-2 cohort. International Journal of Epidemiology, 2018, 47 (5), pp.1603-1612. ⟨10.1093/ije/dyy030⟩. ⟨hal-01766695⟩
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- François Alla, Nelly Agrinier, Marc Lavielle, Patrick Rossignol, Damien Gonthier, et al.. Impact of the interruption of a large heart failure regional disease management program on hospital admission rate: a population-based study. European Journal of Heart Failure, In press, 20 (6), pp.1066-1068. ⟨10.1002/ejhf.1193⟩. ⟨hal-01727632⟩
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- Marc Lavielle. Pharmacometrics Models with Hidden Markovian Dynamics. Journal of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics, 2018, 45 (1), pp.91–105. ⟨10.1007/s10928-017-9541-1⟩. ⟨hal-01665722⟩
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- Maud Delattre, Valentine Genon-Catalot, Catherine Laredo. Approximate maximum likelihood estimation for stochastic differential equations with random effects in the drift and the diffusion. Metrika, 2018, 81 (4), pp.953-983. ⟨10.1007/s00184-018-0666-z⟩. ⟨hal-02621496⟩
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- Maud Delattre, Valentine Genon-Catalot, Catherine Laredo. Parametric inference for discrete observations of diffusion processes with mixed effects. Stochastic Processes and their Applications, 2018, 128 (6), pp.1929-1957. ⟨10.1016/j.spa.2017.08.016⟩. ⟨hal-02622519⟩
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Conference papers
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- Belhal Karimi, Marc Lavielle. Efficient Metropolis-Hastings sampling for nonlinear mixed effects models. BAYSM 2018 – Bayesian Young Statisticians Meeting, Jul 2018, Warwick, United Kingdom. ⟨hal-01958247v2⟩
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- Maud Delattre, Romain Narci, Catherine Larédo, Elisabeta Vergu. Estimation for partially observed epidemic dynamics with measurement errors. Dynstoch, Jun 2018, Porto, Portugal. ⟨hal-04083830⟩
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- Estelle Kuhn, Maud Delattre. Un nouvel estimateur pour l’information de Fisher dans les modèles à variables latentes. SFdS- 50ème Journées de Statistique de la SFdS (JdS’2018), May 2018, Pallaiseau, France. ⟨hal-02735037⟩
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Reports
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – dossier 2018-150. Paris, le 24 octobre 2018. [0] –. 2018. ⟨hal-02789394⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie Anne M. A. Barny, et al.. Commentaires sur le projet de document consensus de l’OCDE sur les considérations environnementales relatives à l’évaluation des risques associé. Paris, le 23 mai 2018. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2018, 25 p. ⟨hal-02917623⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – dossier 2014-123. Paris, le 27 juin 2018. [0] –. 2018. ⟨hal-02787190⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – dossier EFSA-GMO-RX009. Paris, le 4 juin 2018. [0] –. 2018. ⟨hal-02787185⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie Anne M. A. Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – dossier C/NL/06/01_001. Paris, le 17 octobre 2018. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2018, 25 p. ⟨hal-02917630⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – dossier 2017-143. Paris, le 15 mai 2018. [0] –. 2018. ⟨hal-02787191⟩
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2017
Journal articles
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- Etienne Simon-Loriere, Veasna Duong, Ahmed Tawfik, Sivlin Ung, Sowath Ly, et al.. Increased adaptive immune responses and proper feedback regulation protect against clinical dengue. Science Translational Medicine, 2017, 9 (405), pp.eaal5088. ⟨10.1126/scitranslmed.aal5088⟩. ⟨hal-01656594⟩
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- Pierre Barbillon, Célia Barthélémy, Adeline Samson. Parametric estimation of complex mixed models based on meta-model approach. Statistics and Computing, 2017, 27 (4), pp.1111-1128. ⟨10.1007/s11222-016-9674-x⟩. ⟨hal-01162351⟩
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- Pierre Colin, Maud Delattre, P. Minini, S. Micallef. An escalation for bivariate binary endpoints controlling the risk of overtoxicity (EBE-CRO ): managing efficacy and toxicity in early oncologyvClinical trials. Journal of Biopharmaceutical Statistics, 2017, 27 (6), pp.1-19. ⟨10.1080/10543406.2017.1295248⟩. ⟨hal-01533853⟩
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- Emmanuelle Comets, Audrey Paris Lavenu, Marc Lavielle. Parameter Estimation in Nonlinear Mixed Effect Models Using saemix, an R Implementation of the SAEM Algorithm. Journal of Statistical Software, 2017, 80 (3), pp.i03. ⟨10.18637/jss.v080.i03⟩. ⟨inserm-01502767⟩
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- Vincent Brault, Maud Delattre, Tristan Mary-Huard, Céline Leduc. Estimating the number of block boundaries from diagonal blockwise matrices without penalization. Scandinavian Journal of Statistics, 2017, 44 (2), pp.563-580. ⟨10.1111/sjos.12266⟩. ⟨hal-01533843⟩
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Conference papers
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- Estelle Kuhn, Maud Delattre. Estimating the Fisher information matrix in latent variable models. ERCIM WG on computational and methodological statistics, Dec 2017, Londres, United Kingdom. pp.272. ⟨hal-02735038⟩
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Reports
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- Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, Philippe Berny, Pascal Boireau, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – dossier C/NL/04/02_001. Paris, le 13 mars 2017. [0] Haut conseil des biotechnologies. 2017. ⟨hal-02789356⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. HCB_ Avis sur les risques environnementaux et sanitaires liés à la mise sur le marche de pétunias génétiquement modifiés non-autorisés. [0] Inrae. 2017. ⟨hal-02789212⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB du 12 octobre 2015 concernant l’utilisation de moustiques génétiquement modifiés dans le cadre de la lutte antivectorielle. Paris, le 31 mai 2017. [0] Haut conseil des biotechnologies. 2017. ⟨hal-02789521⟩
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- Estelle Kuhn, Maud Delattre. Estimating Fisher Information Matrix in Latent Variable Models. [Technical Report] 2017. ⟨hal-02790629⟩
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- Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, Pascal Boireau, et al.. EFSA-GMO-DE-2017-141 1. [0] Haut Conseil Des Biotechnologies. 2017. ⟨hal-02791061⟩
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- Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, Pascal Boireau, et al.. Avis sur les nouvelles techniques d’obtention de plantes (New plant breeding techniques-NPBT). [0] Haut Conseil de Biotechnologie. 2017. ⟨hal-02791518⟩
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2016
Journal articles
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- Marc Lavielle, Leon Aarons. What do we mean by identiability in mixed effects models?. Journal of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics, 2016. ⟨hal-01365535⟩
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- Maud Delattre, Valentine Genon-Catalot, Adeline Samson. Mixtures of stochastic differential equations with random effects: Application to data clustering. Journal of Statistical Planning and Inference, 2016, 173, pp.109-124. ⟨10.1016/j.jspi.2015.12.003⟩. ⟨hal-01218612⟩
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- Gérard Biau, Kevin Bleakley, Benoît Cadre. The Statistical Performance of Collaborative Inference. Journal of Machine Learning Research, 2016, 17. ⟨hal-01170254v2⟩
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- Gérard Biau, Kevin Bleakley, David Mason. Long signal change-point detection. Electronic Journal of Statistics , 2016, 10, pp.2097-2123. ⟨10.1214/16-EJS1164⟩. ⟨hal-01140119v2⟩
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- Marc Lavielle, Benjamin Ribba. Enhanced Method for Diagnosing Pharmacometric Models: Random Sampling from Conditional Distributions. Pharmaceutical Research, 2016, ⟨10.1007/s11095-016-2020-3⟩. ⟨hal-01365532⟩
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Conference papers
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- Maud Delattre, Marie-Anne Poursat. On BIC for mixed-effects models. CMStatistics, 2016, Séville, Spain. ⟨hal-04083845⟩
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- Tristan Mary-Huard, Stephane Robin, Celine Levy Leduc, Maud Delattre, Vincent Brault, et al.. Diagonal blockwise matrix segmentation in computational biology. IFCAM Workshop, 2016, Bangalore, India. ⟨hal-02795763⟩
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-
Reports
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, Philippe Berny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – dossier EFSA-GMO-RX-003. Paris, le 9 décembre 2016. [0] Haut conseil des biotechnologies. 2016. ⟨hal-02795354⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Frédérique Angevin, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – dossier NL-2011-96. Paris, le 13 janvier 2016. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2016. ⟨hal-02800686⟩
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- Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie-Anne Barny, Florence Bellivier, Philippe Berny, et al.. Comité Scientifique Avis en réponse à la saisine HCB – dossier NL-2005-28. Paris, le 17 mars 2016. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2016. ⟨hal-02915560⟩
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Preprints, Working Papers, …
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- Marc Lavielle, Leon Aarons. What do we mean by identifiability in mixed effects models?. 2016. ⟨hal-01251986⟩
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- Maud Delattre, Valentine Genon-Catalot, Catherine Larédo. Estimation of the joint distribution of random effects for a discretely observed diffusion with random effects. 2016. ⟨hal-01446063⟩
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- Maud Delattre, Valentine Genon-Catalot, Catherine Larédo. Parametric inference for discrete observations of diffusion processes with mixed effects. 2016. ⟨hal-01332630⟩
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2015
Journal articles
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- Christian Jeleazcov, Marc Lavielle, Jürgen Schüttler, Harald Ihmsen. Pharmacodynamic response modelling of arterial blood pressure in adult volunteers during propofol anaesthesia. British Journal of Anaesthesia, 2015, ⟨10.1093/bja/aeu553⟩. ⟨hal-01252009⟩
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- Pierre Colin, Sandrine Micallef, Maud Delattre, Pierre Mancini, Éric Parent. Towards using a full spectrum of early clinical trial data: a retrospective analysis to compare potential longitudinal categorical models for molecular targeted therapies in oncology. Statistics in Medicine, 2015, Special Issue: Papers from the Seventh International French Society of Statistics Meeting on Statistical Methods in Biopharmacy: Emerging Topics for Statistical Methodology in Clinical Drug Development, 34 (2), pp.2999-3016. ⟨10.1002/sim.6548⟩. ⟨hal-01197648⟩
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- P Mazzocco, Célia Barthélémy, G Kaloshi, Marc Lavielle, D Ricard, et al.. Prediction of Response to Temozolomide in Low-Grade Glioma Patients Based on Tumor Size Dynamics and Genetic Characteristics. CPT: Pharmacometrics and Systems Pharmacology, 2015, 4 (12), pp.728-737. ⟨10.1002/psp4.54⟩. ⟨hal-01252076⟩
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- ref_biblio
- Kostas Biliouris, Marc Lavielle, Mirjam Trame. MatVPC: A User-Friendly MATLAB-Based Tool for the Simulation and Evaluation of Systems Pharmacology Models. CPT: Pharmacometrics and Systems Pharmacology, 2015, ⟨10.1002/psp4.12011⟩. ⟨hal-01252020⟩
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- Jia Li, Marie-Anne Poursat, Damien Drubay, Arnaud Motz, Zohra Saci, et al.. A Dual Model for Prioritizing Cancer Mutations in the Non-coding Genome Based on Germline and Somatic Events. PLoS Computational Biology, 2015, 11 (11), pp.e1004583. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004583⟩. ⟨hal-01274705⟩
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- ref_biblio
- Cyprien Mbogning, Kevin Bleakley, Marc Lavielle. Joint modeling of longitudinal and repeated time-to-event data using nonlinear mixed-effects models and the SAEM algorithm. Journal of Statistical Computation and Simulation, 2015, 85 (8), pp.1512–1528. ⟨10.1080/00949655.2013.878938⟩. ⟨hal-01122140⟩
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- Maud Delattre, Valentine Genon-Catalot, Adeline Samson. Estimation of population parameters in stochastic differential equations with random effects in the diffusion coefficient. ESAIM: Probability and Statistics, 2015, 19, pp.671-688. ⟨10.1051/ps/2015006⟩. ⟨hal-01056917v2⟩
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Conference papers
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- Pierre Barbillon, Célia Barthelemy, Adeline Leclercq-Samson. Parametric estimation of complex mixed models based on meta-model approach. CMStatistics 2015 – 8th International Conference of the ERCIM WG on Computational and Methodological Statistics, Dec 2015, Londres, United Kingdom. ⟨hal-01600700⟩
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Reports
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- Raphaël Kuate, Marc Lavielle, Eric Blaudez, Kaelig Chatel, Jean-François Si Abdallah. A finite element solver for PDEs in MONOLIX. [Research Report] RR-8717, INRIA. 2015. ⟨hal-01144679v2⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie Anne M. A. Barny, Florence Bellivier, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB – dossier NL-2005-23. Paris, le 21 octobre 2015. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2015, 39 p. ⟨hal-02917605⟩
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- Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie Anne M. A. Barny, Florence Bellivier, Philippe Berny, et al.. Comité Scientifique Avis en réponse à la saisine HCB – dossier BE-2015-1251. Paris, le 18 décembre 2015. [0] Haut Conseil des biotechnologies. 2015. ⟨hal-02800867⟩
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- Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie Anne M. A. Barny, Florence Bellivier, Philippe Berny, et al.. Avis en réponse à la saisine 150519 – dossier C-NL-13-01. Paris, le 7 septembre 2015. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2015, 27 p. ⟨hal-02917581⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie Anne M. A. Barny, Florence Bellivier, et al.. Avis en réponse à la saisine HCB 150129 – dossier 2014-1211 concernant le dossier EFSA-GMO-NL-2014-121. Paris, le 22 avril 2015. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2015, 23 p. ⟨hal-02917533⟩
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- . Comité Scientifique Du Haut Conseil Des Biotechnologies, Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie Anne M. A. Barny, Florence Bellivier, et al.. Avis en réponse à la saisine 150519 – dossier C-NL-13-02. Paris, le 7 septembre 2015. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2015, 21 p. ⟨hal-02917593⟩
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- Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie Anne M. A. Barny, Florence Bellivier, Philippe Berny, et al.. Avis en réponse à la saisine 150129- saisine HCB -dossier 2014-121 concernant le dossier EFSA-GMO-NL-2014-121. [0] Haut Conseil des biotechnologies. 2015. ⟨hal-02800022⟩
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- Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie Anne M. A. Barny, Florence Bellivier, Philippe Berny, et al.. Comité Scientifique, Paris, le 23 juin 2015 avis en réponse à la saisine du 24 avril 2014 de Messieurs Bernard Accoyer et Jean Bizet suite à la proposition de loi relative à l’interdiction de la mise en culture des variétés de maïs génétiquement modifié sur le territoire français1. [0] Haut Conseil des biotechnologies. 2015. ⟨hal-02801204⟩
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- Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie Anne M. A. Barny, Florence Bellivier, Philippe Berny, et al.. Comité scientifique avis en réponse à la saisine HCB – dossier BE-2011-981. Paris, le 12 novembre 2015. [0] Haut Conseil des biotechnologies. 2015. ⟨hal-02797665⟩
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2014
Journal articles
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- Celine Lévy-Leduc, Maud Delattre, T. Mary-Huard, S. Robin. Two-dimensional segmentation for analyzing Hi-C data. Bioinformatics, 2014, 30 (17), pp.i386-i392. ⟨10.1093/bioinformatics/btu443⟩. ⟨hal-04083798⟩
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- Marc Lavielle, Cyprien Mbogning. An improved SAEM algorithm for maximum likelihood estimation in mixtures of non linear mixed effects models. Statistics and Computing, 2014, 24 (5), pp.693–707. ⟨10.1007/s11222-013-9396-2⟩. ⟨hal-00916817⟩
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- Maud Delattre, Marc Lavielle, Marie-Anne Poursat. A note on BIC in mixed-effects models. Electronic Journal of Statistics , 2014, 8, pp.456–475. ⟨10.1214/14-EJS890⟩. ⟨hal-00991708⟩
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Conference papers
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- Celine Levy Leduc, Maud Delattre, Tristan Mary-Huard, Stephane Robin. Two-dimensional segmentation for analyzing HiC data. ECCB 2014: The 13th European Conference on Computational Biology, Sep 2014, Strasbourg, France. pp.386-392, ⟨10.1093/bioinformatics/btu443⟩. ⟨hal-01148580⟩
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- Stéphanie Mahevas, Nicolas Bez, Sophie Bertrand, Manuela Capello, Maud Delattre, et al.. Validation data: keystone to move state-space models for movements to operational models for fisheries and marine ecology. ISEC’2014 : International Statistical Ecology Conference, Jul 2014, Montpellier, France. ⟨hal-01865154⟩
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- Maud Delattre, Rémi Choquet. Estimating variability from capture-recapture data using the SAEM algorithm. Isec (International Statistical Ecology Conference), 2014, Montpellier, France. ⟨hal-04083859⟩
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Books
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- Marc Lavielle. Mixed Effects Models for the Population Approach: Models, Tasks, Methods and Tools. Chapman and Hall/CRC, 2014, 9781482226508. ⟨hal-01122873⟩
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-
Reports
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- Raphaël Kuate, Marc Lavielle, Eric Blaudez, Kaelig Chatel, Jerome Marquet, et al.. A delay differential equation solver for MONOLIX & MLXPLORE. [Research Report] RR-8489, INRIA. 2014, pp.19. ⟨hal-00952874⟩
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- ref_biblio
- Claude Bagnis, Avner Bar-Hen, Marie Anne M. A. Barny, Florence Bellivier, Philippe Berny, et al.. Avis en réponse à la saisine du 7 novembre 2013, de Madame Marie-Christine Blandin, relative à l’article de Snell et al. (Food and Chemical Toxicology, 2012). [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2014. ⟨hal-02801289⟩
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2013
Journal articles
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- Sébastien Martin, Bertrand Maury. Modeling of the oxygen transfer in the respiratory process. ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, 2013, 47 (04), pp.935-960. ⟨10.1051/m2an/2012052⟩. ⟨hal-00714239v2⟩
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- Marie-Cécile Faure, Jean-Claude Sulpice, Maud Delattre, Marc Lavielle, Magali Prigent, et al.. The recruitment of p47phox and Rac2G12V at the phagosome is transient and phosphatidylserine-dependent. Biology of the Cell, 2013, 105, pp.1–18. ⟨10.1111/boc.201300010⟩. ⟨hal-01555264v2⟩
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- France Mentré, Marylore Chenel, Emmanuelle Comets, Joachim Grevel, Andrew C. Hooker, et al.. Current Use and Developments Needed for Optimal Design in Pharmacometrics: A Study Performed Among DDMoRe’s European Federation of Pharmaceutical Industries and Associations Members. CPT: Pharmacometrics and Systems Pharmacology, 2013, 2, pp.e46. ⟨10.1038/psp.2013.19⟩. ⟨hal-01122163⟩
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- Maud Delattre, Marc Lavielle. Coupling the SAEM algorithm and the extended Kalman filter for maximum likelihood estimation in mixed-effects diffusion models. Statistics and Its Interface, 2013, 6 (4), pp.519–532. ⟨hal-00916803⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
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- ref_biblio
- Marc Lavielle. Rôle et limites de la statistique dans l’évaluation des risques sanitaires liés aux OGM. Statistique et Société, 2013, 1 (1), pp.mai 2013. ⟨hal-00916844⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
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- Maud Delattre, Valentine Genon-Catalot, Adeline Samson. Maximum likelihood estimation for stochastic differential equations with random effects. Scandinavian Journal of Statistics, 2013, 40 (2), pp.322-343. ⟨10.1111/j.1467-9469.2012.00813.x/abstract⟩. ⟨hal-00650844⟩
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Conference papers
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- Maud Delattre, Marc Lavielle. Equations diférentielles stochastiques en pharmacocinétique de population : modèles et méthodologie
. 45e Journées de Statistique de la SfDS, May 2013, Toulouse, France. ⟨hal-01589553⟩
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- Maud Delattre, Marc Lavielle. Population pharmacokinetics and stochastic differential equations : Models and methods. Dynstoch 2013, Apr 2013, Copenhagen, Denmark. ⟨hal-01586993⟩
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Books
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- Bertrand Maury. The Respiratory System in Equations. Springer, pp.300, 2013, 978-8847052130. ⟨hal-00929739⟩
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Reports
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine 130110- saisine HCB – dossier 2012-1041 concernant le dossier EFSA-GMO-ES-2012-104. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2013. ⟨hal-02915955⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine 130418- saisine HCB – dossier 2012-1061 concernant le dossier EFSA-GMO-NL-2012-106. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2013. ⟨hal-02915579⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Nicolas Ferry, et al.. AVIS en réponse à la saisine 130211- saisine HCB – dossier 2009-751 concernant le dossier EFSA-GMO-NL-2009-75. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2013. ⟨hal-02915583⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. COMMENTAIRES sur le rapport de surveillance de culture du MON 810 en 2012. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2013. ⟨hal-02915576⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Robert Drillien, Yves Bertheau, Jean-Jacques Leguay, Pascal Boireau, et al.. AVIS en réponse à la saisine 121206- saisine HCB – dossier 2012-109 concernant le dossier EFSA-GMO-NL-2012-109. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2013. ⟨hal-02915967⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine 130930- saisine HCB – dossier 2012-1081 concernant le dossier EFSA-GMO-NL-2012-108. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2013. ⟨hal-02915568⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Denis Bourguet, Florence Coignard, et al.. AVIS en réponse à la saisine 130213-saisine HCB-B/FR/12.12.011 concernant le dossier B/FR/12.12.01. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2013. ⟨hal-02915585⟩
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2012
Journal articles
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- Maud Delattre, Marc Lavielle. Maximum likelihood estimation in discrete mixed hidden Markov models using the SAEM algorithm. Computational Statistics and Data Analysis, 2012, 56 (6), pp.2073-2085. ⟨10.1016/j.csda.2011.12.017⟩. ⟨hal-00756599⟩
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- Maud Delattre, Radojka M. Savic, Raymond Miller, Mats O. Karlsson, Marc Lavielle. Analysis of exposure-response of CI-945 in patients with epilepsy: application of novel Mixed Hidden Markov Modelling Methodology. Journal of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics, 2012, 39 (3), pp.263-271. ⟨hal-00756603⟩
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- Nicolas Servant, Marc Bollet, Hans Halfwerk, Kevin Bleakley, Bas Kreike, et al.. Search for a gene expression signature of breast cancer local recurrence in young women.. Clinical Cancer Research, 2012, 18 (6), pp.1704-15. ⟨10.1158/1078-0432.CCR-11-1954⟩. ⟨hal-00756723⟩
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- Maud Delattre, Radojka M. Savic, Raymond Miller, Mats O. Karlsson, Marc Lavielle. Analysis of exposure–response of CI-945 in patients with epilepsy: application of novel mixed hidden Markov modeling methodology. Journal of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics, 2012, 39 (3), pp.263 – 271. ⟨10.1007/s10928-012-9248-2⟩. ⟨hal-01560511⟩
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- Cyprien Mbogning, Kevin Bleakley, Marc Lavielle. Between-subject and within-subject model mixtures for classifying HIV treatment response. Progress in Applied Mathematics, 2012, 4 (2), pp.148-166. ⟨hal-00756615⟩
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- Joachim Grevel, Marc Lavielle. A safe bet?. European Biopharmaceutical Review, 2012. ⟨hal-00756608⟩
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- Merlin Keller, Marc Lavielle. Random threshold for linear model selection, revisited. Statistics and Its Interface, 2012, 5 (2), pp.263-275. ⟨hal-00756592⟩
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Conference papers
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- Audrey Lavenu, Emmanuelle Comets, Marc Lavielle. saemix, an R version of the SAEM algorithm for parameter estimation in nonlinear mixed effect models. 1ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France. ⟨hal-00717539⟩
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- Marie-Anne Poursat, Maud Delattre. Sélection de variables dans les modèles non-linéaires mixtes. 44e Journées de Statistiques – JdS’2012, May 2012, Bruxelles, Belgique. ⟨hal-01631001⟩
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- Maud Delattre, Valentine Genon-Catalot, Adeline Samson. Maximum likelihood estimation for stochastic differential equations with random effects. Dynstoch, 2012, Paris, France. ⟨hal-04083864⟩
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Reports
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- Maud Delattre, Marc Lavielle, Marie-Anne Poursat. BIC selection procedures in mixed effects models. [Technical Report] RR-7948, INRIA. 2012. ⟨hal-00696435⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine 110310-saisine HCB- dossiers culture concernant notamment le dossier EFSA-GMO-UK-2008-60. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2012. ⟨hal-02915971⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. COMMENTAIRES sur le rapport de surveillance de culture d’Amflora en 2011. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2012. ⟨hal-02915972⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS Commentaires sur le document d’orientation de l’AESA relatif aux plans de surveillance environnementale post-commercialisation des plantes génétiquement modifiées, en vue de sa transcription en norme contraignante par la Commission européenne. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2012. ⟨hal-02915559⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine 120411-saisine HCB- dossier 2011-1011 concernant le dossier EFSA-GMO-BE-2011-101. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2012. ⟨hal-02915976⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. Avis en réponse à la saisine du 24 septembre 2012 relative à l’article de Séralini et al. (Food and Chemical Toxicology, 2012). [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2012. ⟨hal-02916042⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Robert Drillien, Yves Bertheau, François Coléno, Jean-Jacques Leguay, et al.. AVIS en réponse à la saisine 120315-saisine HCB- dossier 2009-73 concernant le dossier EFSA-GMO-NL-2009-73. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2012. ⟨hal-02915978⟩
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Theses
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- Maud Delattre. Inférence statistique dans les modèles mixtes à dynamique Markovienne. Applications [stat.AP]. Université Paris Sud – Paris XI, 2012. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00765708⟩
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- Maud Delattre. Inférence statistique dans les modèles mixtes à dynamique Markovienne. Life Sciences [q-bio]. Université Paris Sud – Paris 11, 2012. English. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-02810777⟩
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2011
Journal articles
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- Anne Dubois, Marc Lavielle, Sandro Gsteiger, Etienne Pigeolet, France Mentré. Model-based analyses of bioequivalence crossover trials using the stochastic approximation expectation maximisation algorithm.. Statistics in Medicine, 2011, 30 (21), pp.2582-600. ⟨10.1002/sim.4286⟩. ⟨inserm-00643832⟩
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- Marc Lavielle, Adeline Samson, Ana Karina Fermin, France Mentré. Maximum likelihood estimation of long-term HIV dynamic models and antiviral response. Biometrics, 2011, 67 (1), pp.250-9. ⟨10.1111/j.1541-0420.2010.01422.x⟩. ⟨inserm-00486937⟩
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- Marc Lavielle, Kevin Bleakley. Automatic data binning for improved visual diagnosis of pharmacometric models. Journal of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics, 2011, 38 (6), pp.861-871. ⟨10.1007/s10928-011-9223-3⟩. ⟨hal-00654842⟩
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- Rada Savic, France Mentré, Marc Lavielle. Implementation and Evaluation of the SAEM algorithm for longitudinal ordered categorical data with an illustration in pharmacokinetics-pharmacodynamics. AAPS Journal, 2011, 13 (1), pp.44-53. ⟨10.1208/s12248-010-9238-5⟩. ⟨hal-00637400⟩
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Reports
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. Réponse à la consultation publique de l’AESA sur le projet de lignes directrices sur les plans de surveillance environnementale post-commercialisation des plantes génétiquement modifiées. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02915547⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Florence Coignard, Hubert De Verneuil, et al.. AVIS en réponse à la saisine 110317-saisine HCB- dossier 2010-89 concernant le dossier EFSA-GMO-NL-2010-89. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02915996⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. Réponse à la consultation de l’AESA sur le choix des comparateurs dans l’évaluation des risques des plantes génétiquement modifiées. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02915992⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine1 110310-saisine HCB- dossiers culture concernant notamment le dossier EFSA-GMO-NL-2005-24. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02915990⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Maryse Deguergue, et al.. AVIS en réponse à la saisine 110426-saisine HCB- dossier 2010-88 concernant le dossier EFSA-GMO-SE-2010-88. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02915995⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. Réponse à la consultation publique de l’AESA sur le projet de document d’orientation relatif aux études de toxicité sub-chronique de 90 jours sur les denrées alimentaires et aliments pour animaux menées chez les rongeurs. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02915553⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Denis Bourguet, Florence Coignard, et al.. AVIS en réponse à la saisine 110120-saisine HCB- dossier 2009-69 concernant le dossier EFSA-GMO-NL-2009-69.. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02916000⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. Commentaires sur le projet de document de l’OCDE sur les considérations environnementales relatives à l’évaluation des risques associes à la dissémination des plantes génétiquement modifiées. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02915536⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. Réponse à la consultation de l’AESA sur le choix des comparateurs dans l’évaluation des risques des plantes génétiquement modifiées. Paris, le 14 janvier 2011. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011, 16 p. ⟨hal-02915488⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine 110126-saisine HCB- dossier 2010-83 concernant le dossier EFSA-GMO-UK-2010-83. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02915998⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine du 8 décembre 2010. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02915492⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine 110915-saisine HCB- dossier 2011-91 concernant le dossier EFSA-GMO-NL-2011-91. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02915979⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. COMMENTAIRES sur le rapport de surveillance de culture du MON 810 en 2009. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02916007⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS Commentaires sur les lignes directrices de l’AESA relatives à l’évaluation environnementale des plantes génétiquement modifiées, en vue de leur transcription par la Commission européenne en norme contraignante pour le pétitionnaire. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02915530⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine sur le projet de décret relatif à l’étiquetage des denrées alimentaires issues de filières qualifiées « sans organismes génétiquement modifiés ». [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02915527⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine 100506-projet saisine HCB-coexistence sur la définition des conditions techniques relatives à la mise en culture, la récolte, le stockage et le transport des végétaux génétiquement modifiés. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02915555⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine1 100826-saisine HCB- dossier 2010-82 concernant notamment le dossier EFSA-GMO-DE-2010-82. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2011. ⟨hal-02915982⟩
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Preprints, Working Papers, …
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- Kevin Bleakley, Marc Lavielle. Effective strategies for segmenting data into coherent subsets. 2011. ⟨hal-00642621⟩
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- Kevin Bleakley, Jean-Philippe Vert. The group fused Lasso for multiple change-point detection. 2011. ⟨hal-00602121⟩
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2010
Journal articles
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- Maud Delattre. Inference in Mixed Hidden Markov Models and Applications to Medical Studies. Journal de la Société Française de Statistique, 2010, 151 (1), pp.90-105. ⟨hal-00637419⟩
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- Phylinda Chan, Philippe Jacqmin, Marc Lavielle, Lynn Mcfadyen, Barry Weatherley. The Use of the SAEM Algorithm in MONOLIX Software for Estimation of Population Pharmacokinetic-Pharmacodynamic-Viral Dynamics Parameters of Maraviroc in Asymptomatic HIV Subjects. Journal of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics, 2010, 38 (1), pp.41-61. ⟨10.1007/s10928-010-9175-z⟩. ⟨hal-00637403⟩
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- Eric Snoeck, Pascal Chanu, Marc Lavielle, Philippe Jacqmin, Niclas Jonsson, et al.. A Comprehensive Hepatitis C Viral Kinetic Model Explaining Cure. Clinical Pharmacology and Therapeutics, 2010, 87 (6), pp.706-713. ⟨hal-00637434⟩
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Conference papers
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- Catherine Laredo, Brigitte Schaeffer, Nicolas Vergne, Olivier David, Frédéric Austerlitz, et al.. Taux d’erreurs des méthodes phylogénétiques et des méthodes statistiques de classification pour le Barcode ADN. Projet IFORA, Jun 2010, Montpellier, France. pp.45. ⟨hal-02754486⟩
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- Maud Delattre. Les modèles de Markov cachés à effets mixtes. 42èmes Journées de Statistique, 2010, Marseille, France, France. ⟨inria-00494812⟩
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Documents associated with scientific events
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- Kevin Bleakley. Progress and open challenges in extremely high-dimensional medical outcome prediction. Journées MAS et Journée en l’honneur de Jacques Neveu, Aug 2010, Talence, France. ⟨inria-00509772⟩
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Reports
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine1 100605-saisine HCB- décret déclaration sur le projet de décret relatif à la mise en culture de végétaux génétiquement modifiés. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2010. ⟨hal-02916008⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine1 091201-saisine HCB-info compl oeillets concernant notamment le dossier C/NL/97/13-01. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2010. ⟨hal-02916016⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine 100510-saisine HCB- dossiers imports concernant notamment le dossier EFSA-GMO-RX-40-3-2. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2010. ⟨hal-02916002⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine1 100616-saisine HCB- dossier 2010-79 concernant le dossier EFSA-GMO-BE-2010-79. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2010. ⟨hal-02916003⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Denis Bourguet, Florence Coignard, et al.. COMMENTAIRES sur le rapport de surveillance de culture d’Amflora en 2010. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2010. ⟨hal-02915993⟩
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- Comité Scientifique, Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, et al.. Avis sur le dossier EFSA-GMO-NL-2009-72. Paris, le 03/02/2010. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2010, 27 p. ⟨hal-02916035⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. Avis sur le dossier B/FR/09.11.01. Paris, le 15 mars 2010. [0] Haut Conseil des biotechnologies. 2010, 15 p. ⟨hal-02916027⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. Réponse à la saisine 100319-saisine HCB-lignes directrices AESA. Paris, le 28 avril 2010. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2010, 24 p. ⟨hal-02915463⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. Avis en réponse à la saisine1 100226-saisine HCB-dossier 1507 culture concernant la partie « culture » du dossier C/ES/01/012. Paris, le 6 mai 2010. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2010, 34 p. ⟨hal-02916023⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. Avis en réponse à la saisine1 100118-saisine HCB- dossier Bt11 culture concernant la partie « culture » du dossier C/F/96/05.10. Paris, le 16 avril 2010. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2010, 33 p. ⟨hal-02916024⟩
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- Comité Scientifique, Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, et al.. Avis sur le dossier EFSA/GMO/DE/2008/63. Paris, le le 07/01/2010. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2010, 22 p. ⟨hal-02916034⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. Avis en réponse à la saisine1 100301-saisine HCB-dossier pomme de terre culture relative au dossier C/SE/96/3501. Paris, le 12 juillet 2010. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2010, 38 p. ⟨hal-02916018⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine1 091211-saisine HCB- dossier 2009-73 concernant le dossier EFSA-GMO-NL-2009-73. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2010. ⟨hal-02916005⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine1 091201-saisine HCB-info compl oeillets concernant notamment le dossier C/NL/09/02.. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2010. ⟨hal-02916013⟩
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- Jean-Christophe Pagès, Jean-Jacques Leguay, Yves Bertheau, Pascal Boireau, Denis Bourguet, et al.. AVIS en réponse à la saisine1 091201-saisine HCB-info compl oeillets concernant notamment le dossier C/NL/09/01. [0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2010. ⟨hal-02916010⟩
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