Publications

Publications HAL du labo/EPI mycenae

2018

Journal articles

titre
Coupled multiple timescale dynamics in populations of endocrine neurons: Pulsatile and surge patterns of GnRH secretion
auteur
Elif Köksal Ersöz, Alexandre Vidal, Frédérique Clément
article
SIAM Journal on Applied Dynamical Systems, 2018, 17 (1), pp.1052-1090. ⟨10.1137/16M1103695⟩
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Book sections

titre
Folliculogenesis
auteur
Danielle Monniaux, Véronique Cadoret, Frédérique Clément, Rozenn Dalbies-Tran, Sébastien Elis, Stéphane Fabre, Virginie Maillard, Philippe Monget, Svetlana Uzbekova
article
Reference Module in Biomedical Sciences, Elsevier, 22p., 2018, 978-0-12-801238-3
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2017

Journal articles

titre
Wild oscillations in a nonlinear neuron model with resets: (I) Bursting, spike adding and chaos
auteur
Jonathan Rubin, Justyna Signerska-Rynkowska, Jonathan Touboul, Alexandre Vidal
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, 2017, 22, pp.3967-4002. ⟨10.3934/dcdsb.2017204⟩
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https://arxiv.org/pdf/1611.02740 BibTex
titre
Synchronization of weakly coupled canard oscillators
auteur
Elif Köksal Ersöz, Mathieu Desroches, Martin Krupa
article
Physica D: Nonlinear Phenomena, 2017, 349, pp.46-61. ⟨10.1016/j.physd.2017.02.016⟩
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https://inria.hal.science/hal-01558897/file/KDK_PhysicaD_accepted.pdf BibTex
titre
Power-law statistics and universal scaling in the absence of criticality
auteur
Jonathan Touboul, Alain Destexhe
article
Physical Review E , 2017, 95 (1), pp.012413. ⟨10.1103/PhysRevE.95.012413⟩
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titre
Wild oscillations in a nonlinear neuron model with resets: (II) Mixed-mode oscillations
auteur
Justyna Signerska-Rynkowska, Jonathan Touboul, Alexandre Vidal, Jonathan Rubin
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, 2017, 22 (10), pp.4003-4039. ⟨10.3934/dcdsb.2017205⟩
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https://arxiv.org/pdf/1509.08282 BibTex
titre
Studies of the Petrov Module for a Family of Generalized Liénard Integrable Systems
auteur
Lucile Mégret
article
Qualitative Theory of Dynamical Systems, 2017, 20 (2), pp.1-21. ⟨10.1007/s12346-017-0250-3⟩
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https://inria.hal.science/hal-01571808/file/ManuscriptMegret.pdf BibTex
titre
Dimensional Reduction of a Multiscale Model Based on Long Time Asymptotics
auteur
Frédérique Clément, Frédéric Coquel, Marie Postel, Kim Long Tran
article
Multiscale Modeling and Simulation: A SIAM Interdisciplinary Journal, 2017, 15 (3), pp.1198 – 1241. ⟨10.1137/16M1062545⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01325275/file/dimensional-reduction-CCPT.pdf BibTex

Conference papers

titre
Dynamiques de populations cellulaires structurées Morphogenèse des follicules ovariens
auteur
Frédérique Clément, Frédérique Robin, Romain Yvinec
article
Session du GDR Mamovi 2017, 2017, Villeurbanne, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02785500/file/2017_Cl%C3%A9ment_mathbio_folliculo_1.pdf BibTex

Poster communications

titre
Multiscale modeling of the morphogenesis of ovarian follicles: a cell-dynamics based approach
auteur
Frédérique Clément, Frédérique Robin, Romain Yvinec
article
2. Journées du GdR 3606 Repro, Apr 2017, Tours, France. 75 p., 2017, 2èmes Journées Scientifiques du GdR Repro
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2016

Journal articles

titre
Enhanced Abventricular Proliferation Compensates Cell Death in the Embryonic Cerebral Cortex
auteur
Betty Freret-Hodara, Yi Cui, Amélie Griveau, Lisa Vigier, Yoko Arai, Jonathan Touboul, Alessandra Pierani
article
Cerebral Cortex, 2016
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titre
On the dynamics of random neuronal networks
auteur
Philippe Robert, Jonathan Touboul
article
Journal of Statistical Physics, 2016, 165 (3), pp.545-584. ⟨10.1007/s10955-016-1622-9⟩
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https://arxiv.org/pdf/1410.4072 BibTex
titre
Mixed-Mode Oscillations in a piecewise linear system with multiple time scale coupling
auteur
Soledad Fernández-García, Maciej Krupa, Frédérique Clément
article
Physica D: Nonlinear Phenomena, 2016, 332, pp.9-22. ⟨10.1016/j.physd.2016.06.002⟩
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https://inria.hal.science/hal-01342978/file/mmo-pwl-multiple-timescales.pdf BibTex
titre
Multiscale mathematical modeling of the hypothalamo-pituitary-gonadal axis
auteur
Frédérique Clément
article
Theriogenology, 2016, 86 (1), pp.11-21. ⟨10.1016/j.theriogenology.2016.04.063⟩
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https://inria.hal.science/hal-01334304/file/Multiscale%20mathematical%20modeling%20of%20the%20hypothalamo-pituitary-gonadal%20axis.pdf BibTex
titre
Multiscale modeling of ovarian follicular development: From follicular morphogenesis to selection for ovulation
auteur
Danielle Monniaux, Philippe Michel, Marie Postel, Frédérique Clément
article
Biology of the Cell, 2016, 108 (6), pp.1-12. ⟨10.1111/boc.201500087⟩
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https://inria.hal.science/hal-01294630/file/Monniaux-et-al-2016-multiscale-modeling.pdf BibTex
titre
Canard-Mediated (De)Synchronization in Coupled Phantom Bursters
auteur
Elif Köksal Ersöz, Mathieu Desroches, Maciej Krupa, Frédérique Clément
article
SIAM Journal on Applied Dynamical Systems, 2016, 15 (1), pp.580-608. ⟨10.1137/15M101840X⟩
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BibTex
titre
Heteroclinic cycles in Hopfield networks
auteur
Pascal Chossat, Maciej Krupa
article
Journal of Nonlinear Science, 2016, ⟨10.1007/s00332-015-9276-3⟩
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https://inria.hal.science/hal-01096505/file/stocyc1210.pdf BibTex
titre
On a Kinetic Fitzhugh–Nagumo Model of Neuronal Network
auteur
Stéphane Mischler, Cristóbal Quiñinao, Jonathan Touboul
article
Communications in Mathematical Physics, 2016, 342 (3), pp.1001-1042. ⟨10.1007/s00220-015-2556-9⟩
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https://hal.science/hal-01108872/file/FitzHughN-MQT-Hal.pdf https://hal.science/hal-01108872/file/distributionJlarge1.pdf https://hal.science/hal-01108872/file/distributionJmedium1.pdf https://hal.science/hal-01108872/file/distributionJsmall1.pdf https://hal.science/hal-01108872/file/recoveryJlarge1.pdf https://hal.science/hal-01108872/file/recoveryJmedium.pdf https://hal.science/hal-01108872/file/recoveryJsmall.pdf https://hal.science/hal-01108872/file/voltageJlarge1.pdf https://hal.science/hal-01108872/file/voltageJmedium.pdf https://hal.science/hal-01108872/file/voltageJsmall.pdf BibTex
titre
Cell-Kinetics Based Calibration of a Multiscale Model of Structured Cell Populations in Ovarian Follicles
auteur
Benjamin Aymard, Frédérique Clément, Danielle Monniaux, Marie Postel
article
SIAM Journal on Applied Mathematics, 2016, 76 (4), pp.1471-1491. ⟨10.1137/15M1030327⟩
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https://hal.science/hal-01186381/file/M103032_SIAP.pdf BibTex
titre
The real Ginibre ensemble with k=O(n) real eigenvalues
auteur
Luis Carlos Garcia del Molino, Khashayar Pakdaman, Jonathan Touboul, Gilles Wainrib
article
Journal of Statistical Physics, 2016, 163 (2), pp.303-323. ⟨10.1007/s10955-016-1485-0⟩
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BibTex
titre
Canard explosion in delayed equations with multiple timescales
auteur
Maciej Krupa, Jonathan Touboul
article
Journal of Dynamics and Differential Equations, 2016, 28 (2), pp.471-491. ⟨10.1007/s10884-015-9478-2⟩
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BibTex
titre
Parsimony, exhaustivity and balanced detection in neocortex
auteur
Alberto Romagnoni, Jérôme Ribot, Daniel Bennequin, Jonathan Touboul
article
PLoS Computational Biology, 2016, 11 (11), pp.e1004623. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004623⟩
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https://hal.science/hal-01253410/file/journal.pcbi.1004623.pdf BibTex

Book sections

titre
Modeling the Dynamics of Gonadotropin-Releasing Hormone (GnRH) Secretion in the Course of an Ovarian Cycle
auteur
Frédérique Clément, Alexandre Vidal
article
Duncan J MacGregor; Gareth Leng. Computational Neuroendocrinology, John Wiley & Sons, 2016, Wiley-INF neuroendocrinology series, 9781119951698
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Theses

titre
Limits cycles explosions, qualitative analysis, numerical simulations and models
auteur
Lucile Mégret
article
Analyse numérique [math.NA]. Université Pierre et Marie Curie – Paris VI, 2016. Français. ⟨NNT : 2016PA066359⟩
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https://theses.hal.science/tel-01484461/file/2016PA066359Dif.pdf BibTex

2015

Journal articles

titre
Analysis of Interspike-Intervals for the General Class of Integrate-and-Fire Models with Periodic Drive
auteur
Justyna Signerska-Rynkowska
article
Mathematical Modelling and Analysis, 2015, 20 (5), pp.22. ⟨10.3846/13926292.2015.1085459⟩
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BibTex
titre
Canard solutions in planar piecewise linear systems with three zones
auteur
Soledad Fernández-García, Mathieu Desroches, Martin Krupa, Antonio Teruel
article
Dynamical Systems, 2015, pp.25. ⟨10.1080/14689367.2015.1079304⟩
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titre
Canard-induced loss of stability across a homoclinic bifurcation
auteur
Mathieu Desroches, Jean-Pierre Françoise, Lucile Mégret
article
Revue Africaine de Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées, 2015, Volume 20 – 2015 – Special issue – Colloquium in Honor of Éric Benoît, pp.47-62. ⟨10.46298/arima.1989⟩
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https://inria.hal.science/hal-01093445/file/vol.20.pp.47-62.pdf BibTex
titre
A Multiple Time Scale Coupling of Piecewise Linear Oscillators. Application to a Neuroendocrine System
auteur
Soledad Fernández-García, Mathieu Desroches, Maciej Krupa, Frédérique Clément
article
SIAM Journal on Applied Dynamical Systems, 2015, 14 (2), pp.31. ⟨10.1137/140984464⟩
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BibTex
titre
Noise-induced canard and mixed-mode oscillations in large stochastic networks with multiple timescales
auteur
Jonathan Touboul, Maciej Krupa, Mathieu Desroches
article
SIAM Journal on Applied Mathematics, 2015, 75 (5), pp.26
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BibTex
titre
Limits and dynamics of randomly connected neuronal networks
auteur
Cristóbal Quiñinao, Jonathan Touboul
article
Acta Applicandae Mathematicae, 2015, 136 (1), pp.167-192. ⟨10.1007/s10440-014-9945-5⟩
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https://arxiv.org/pdf/1306.5175 BibTex
titre
Competition and boundary formation in heterogeneous media: Application to neuronal differentiation
auteur
Benoît Perthame, Cristóbal Quiñinao, Jonathan Touboul
article
Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2015, 25 (13), pp.2477-2502. ⟨10.1142/S0218202515400151⟩
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https://hal.science/hal-01054813/file/notes_v12.pdf BibTex
titre
Pinwheel-dipole configuration in cat early visual cortex.
auteur
Jérôme Ribot, Alberto Romagnoni, Chantal Milleret, Daniel Bennequin, Jonathan Touboul
article
NeuroImage, 2015, 128, pp.63-73. ⟨10.1016/j.neuroimage.2015.12.022⟩
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BibTex
titre
Local homeoprotein diffusion can stabilize boundaries generated by graded positional cues
auteur
Cristóbal Quiñinao, Alain Prochiantz, Jonathan Touboul
article
Development (Cambridge, England), 2015, 142 (10), pp.1860-1868. ⟨10.1242/dev.113688⟩
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BibTex
titre
Lhx2 regulates the timing of β-catenin-dependent cortical neurogenesis
auteur
Lea-Chia-Ling Hsu, Sean Nam, Yi Cui, Ching-Pu Chang, Chia-Fang Wang, Hung-Chih Kuo, Jonathan Touboul, Shen-Ju Chou
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015, 112 (39), pp.12199-204. ⟨10.1073/pnas.1507145112⟩
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BibTex
titre
Complex oscillations in the delayed van der Pol equation
auteur
Maciej Krupa, Jonathan Touboul
article
Journal of Nonlinear Science, 2015, 26 (1), pp.38. ⟨10.1007/s00332-015-9268-3⟩
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BibTex
titre
Absorption properties of stochastic equations with Hölder diffusion coefficients
auteur
Jonathan Touboul, Gilles Wainrib
article
Physica D: Nonlinear Phenomena, 2015, 307, pp.18
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https://arxiv.org/pdf/1205.0172 BibTex

Conference papers

titre
A Multiscale model for the terminal development of ovarian follicles
auteur
Benjamin Aymard, Frédérique Clément, Danielle Monniaux, Marie Postel
article
1 Journées du GdR 3606 Repro, Université de Haute Bretagne ( Rennes 2 ) (UR 2). Rennes, FRA., Apr 2015, Rennes, France. 105 p
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BibTex
titre
Multiscale model-based insight on ovarian follicular development
auteur
Frédérique Clement, P. Michel, Danielle Monniaux, T. Stiehl
article
1 Journées du GdR 3606 Repro, Université de Haute Bretagne ( Rennes 2 ) (UR 2). Rennes, FRA., Apr 2015, Rennes, France. 105 p
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2014

Journal articles

titre
Border collision bifurcations of stroboscopic maps in periodically driven spiking models
auteur
Albert Granados, Maciej Krupa, Frédérique Clément
article
SIAM Journal on Applied Dynamical Systems, 2014, 13 (4), pp.30. ⟨10.1137/13094637X⟩
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https://arxiv.org/pdf/1310.1054 BibTex
titre
On the Dynamics of the Adenylate Energy System: Homeorhesis vs Homeostasis
auteur
Ildefonso M. de La Fuente, Jesús M. Cortés, Edelmira Valero, Mathieu Desroches, Serafim Rodrigues, Iker Malaina, Luis Martínez
article
PLoS ONE, 2014, 9 (10), pp.e108676. ⟨10.1371/journal.pone.0108676⟩
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BibTex
titre
Adaptive mesh refinement strategy for a nonconservative transport problem
auteur
Benjamin Aymard, Frédérique Clément, Marie Postel
article
ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, 2014, pp.1381 – 1412. ⟨10.1051/m2an/2014014⟩
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https://hal.science/hal-00865429/file/ACP_M2AN_HAL.pdf BibTex
titre
The Ovarian Reserve of Primordial Follicles and the Dynamic Reserve of Antral Growing Follicles: What Is the Link?
auteur
Danielle Monniaux, Frédérique Clément, Rozenn Dalbies-Tran, Anthony Estienne, Stéphane Fabre, Camille Mansanet, Philippe Monget
article
Biology of Reproduction, 2014, 90 (4), pp.11. ⟨10.1095/biolreprod.113.117077⟩
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BibTex
titre
Pulsatile localized dynamics in delayed neural-field equations in arbitrary dimension
auteur
Grégory Faye, Jonathan Touboul
article
SIAM Journal on Applied Mathematics, 2014, 74 (5), pp.1657-1690. ⟨10.1137/140955458⟩
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https://arxiv.org/pdf/1402.0530 BibTex
titre
Mixed-mode oscillations due to a singular Hopf bifurcation in a forest pest model
auteur
Morten Brøns, Mathieu Desroches, Maciej Krupa
article
Mathematical Population Studies, 2014, pp.1-22
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BibTex
titre
The heterogeneous gas with singular interaction: Generalized circular law and heterogeneous renormalized energy
auteur
Jonathan Touboul, Luis Carlos Garcia del Molino, K. Pakdaman
article
Journal of Physics A General Physics (1968-1972), 2014, pp.26. ⟨10.1088/1751-8113/48/4/045208⟩
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https://arxiv.org/pdf/1402.7007 BibTex
titre
Index Distribution of the Ginibre Ensemble
auteur
Romain Allez, Jonathan Touboul, Gilles Wainrib
article
Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical, 2014, 47, pp.042001. ⟨10.1088/1751-8113/47/4/042001⟩
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https://arxiv.org/pdf/1310.5039 BibTex
titre
Spatially extended networks with singular multi-scale connectivity patterns
auteur
Jonathan Touboul
article
Journal of Statistical Physics, 2014, pp.27. ⟨10.1007/s10955-014-1015-x⟩
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https://arxiv.org/pdf/1309.4655 BibTex
titre
Interpreting frequency responses to dose-conserved pulsatile input signals in simple cell signaling motifs.
auteur
Patrick A Fletcher, Frédérique Clément, Alexandre Vidal, Joel Tabak, Richard Bertram
article
PLoS ONE, 2014, 9 (4), pp.e95613. ⟨10.1371/journal.pone.0095613⟩
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https://inria.hal.science/hal-00981377/file/a60d5e56ac814a785fb455e44816833f.pdf BibTex
titre
Propagation of chaos in neural fields
auteur
Jonathan Touboul
article
The Annals of Applied Probability, 2014, (in press), 24 (3), pp.1298–1327. ⟨10.1214/13-AAP950⟩
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https://arxiv.org/pdf/1108.2414 BibTex

Conference papers

titre
Mixed-Mode Bursting Oscillations (MMBOs): slow passage through spike-adding canard explosion.
auteur
Mathieu Desroches
article
Multi-Scale Models, Slow-Fast Differential Equations, Averaging in Ecology and Neuroscience, Nov 2014, Bernoulli Centre, EPFL, Lausanne, Switzerland
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BibTex
titre
Canards in 3D piecewise-linear slow-fast systems, application to neuron models.
auteur
Mathieu Desroches
article
The 10th AIMS Conference on Dynamical Systems, Differential Equations and Applications, Jul 2014, Madrid, Spain
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BibTex
titre
The pinwheel-dipole organization of orientation and spatial frequency maps, and their common organizing principles.
auteur
Jonathan Touboul
article
5th France-Israël binational conference on neurosciences, Feb 2014, Sde Boker, Israel
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2013

Journal articles

titre
Multiscale modelling of ovarian follicular selection.
auteur
Frédérique Clément, Danielle Monniaux
article
Progress in Biophysics and Molecular Biology, 2013, 113 (3), pp.398-408. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2012.12.005⟩
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BibTex
titre
Optimal control of cell mass and maturity in a model of follicular ovulation
auteur
Frédérique Clément, Jean-Michel Coron, Peipei Shang
article
SIAM Journal on Control and Optimization, 2013, 51 (2), pp.824-847. ⟨10.1137/120862247⟩
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https://hal.science/hal-00667538/file/2012-follicle.pdf BibTex
titre
A numerical method for kinetic equations with discontinuous equations : application to mathematical modeling of cell dynamics
auteur
Benjamin Aymard, Frédérique Clément, Frédéric Coquel, Marie Postel
article
SIAM Journal on Scientific Computing, 2013, 35 (6), 27 p. ⟨10.1137/120904238⟩
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https://hal.science/hal-00751454/file/R12083.pdf BibTex
titre
Cauchy problem for multiscale conservation laws: Application to structured cell populations
auteur
Peipei Shang
article
Journal of Mathematical Analysis and Applications, 2013, 401 (2), pp.896 – 920. ⟨10.1016/j.jmaa.2013.01.001⟩
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https://arxiv.org/pdf/1010.2132 BibTex
titre
Coupled somatic cell kinetics and germ cell growth: multiscale model-based insight on ovarian follicular development
auteur
Philippe Michel, Thomas Stiehl, Danielle Monniaux, Frédérique Clément
article
Multiscale Modeling and Simulation: A SIAM Interdisciplinary Journal, 2013, 11 (3), pp.719-746. ⟨10.1137/120897249⟩
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https://hal.science/hal-00845679/file/Coupled-oocyte-follicle-MiStMoCl.pdf BibTex
titre
A Network Model of the Periodic Synchronization Process in the Dynamics of Calcium Concentration in GnRH Neurons
auteur
Maciej Krupa, Alexandre Vidal, Frédérique Clément
article
Journal of Mathematical Neuroscience, 2013, 3 (1), pp.4. ⟨10.1186/2190-8567-3-4⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00822007/file/2190-8567-3-4.pdf BibTex