Publications

Publications HAL de la structure 525218

2022

Journal articles

titre
Enumeration of Irredundant Forests
auteur
Florian Ingels, Romain Azaïs
article
Theoretical Computer Science, Elsevier, 2022, ⟨10.1016/j.tcs.2022.04.033⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02511901/file/main.pdf BibTex
titre
cvmgof: an R package for Cramér-von Mises goodness-of-fit tests in regression models
auteur
Romain Azaïs, Sandie Ferrigno, Marie-José Martinez
article
Journal of Statistical Computation and Simulation, Taylor & Francis, 2022, 92 (6), pp.1246-1266. ⟨10.1080/00949655.2021.1991346⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03101612/file/cvmgof_paper.pdf BibTex

Book sections

titre
Introduction to to Computational Modeling of Multicellular Tissues
auteur
Jean-Louis Dinh, Christophe Godin, Eugenio Azpeitia
article
Plant Systems Biology, 2395, Springer New York, pp.107-145, 2022, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-0716-1816-5_7⟩
Accès au bibtex
BibTex

2021

Journal articles

titre
What shoots can teach about theories of plant form
auteur
Teva Vernoux, Fabrice Besnard, Christophe Godin
article
Nature Plants, Nature Publishing Group, 2021, 7 (6), pp.716-724. ⟨10.1038/s41477-021-00930-0⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03393502/file/Plant_Form_Perspective_Final_Ref_formatted.pdf BibTex
titre
BVPy: A FEniCS-based Python package to ease the expression and study of boundary value problems in Biology.
auteur
Florian Gacon, Christophe Godin, Olivier Ali
article
Journal of Open Source Software, Open Journals, 2021, 6 (59), pp.1-6. ⟨10.21105/joss.02831⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
A multiscale analysis of early flower development in Arabidopsis provides an integrated view of molecular regulation and growth control
auteur
Yassin Refahi, Argyris Zardilis, Gaël Michelin, Raymond Wightman, Bruno Leggio, Jonathan Legrand, Emmanuel Faure, Laetitia Vachez, Alessia Armezzani, Anne-Evodie Risson, Feng Zhao, Pradeep Das, Nathanaël Prunet, Elliot Meyerowitz, Christophe Godin, Grégoire Malandain, Henrik Jönsson, Jan Traas
article
Developmental Cell, Elsevier, 2021, 56 (4), pp.540-556.e8. ⟨10.1016/j.devcel.2021.01.019⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-03299500/file/2020.09.25.313312v1.full.pdf BibTex
titre
Organ geometry channels reproductive cell fate in the Arabidopsis ovule primordium
auteur
Elvira Hernandez-Lagana, Gabriella Mosca, Ethel Mendocilla-Sato, Nuno Pires, Anja Frey, Alejandro Giraldo-Fonseca, Caroline Michaud, Ueli Grossniklaus, Olivier Hamant, Christophe Godin, Arezki Boudaoud, Daniel Grimanelli, Daphné Autran, Célia Baroux
article
eLife, eLife Sciences Publication, 2021, 10, pp.e66031. ⟨10.7554/eLife.66031⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03533741/file/elife-66031-v2.pdf BibTex
titre
Cauliflower fractal forms arise from perturbations of floral gene networks
auteur
Eugenio Azpeitia, Gabrielle Tichtinsky, Marie Le Masson, Antonio Serrano-Mislata, Jérémy Lucas, Veronica Gregis, Carlos Gimenez, Nathanaël Prunet, Etienne Farcot, Martin Kater, Desmond Bradley, Francisco Madueño, Christophe Godin, Francois Parcy
article
Science, American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2021, 373 (6551), pp.192-197. ⟨10.1126/science.abg5999⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03291136/file/Azpeitia%20et%20al_main_final.pdf BibTex

Conference papers

titre
Transferring PointNet++ Segmentation from Virtual to Real Plants
auteur
Ayan Chaudhury, Peter Hanappe, Romain Azaïs, Christophe Godin, David Colliaux
article
ICCV 2021 – International Conference on Computer Vision, Oct 2021, Montreal, Canada. pp.1-3
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03540304/file/cvppa2021.pdf BibTex
titre
Isomorphic unordered labeled trees up to substitution ciphering
auteur
Florian Ingels, Romain Azaïs
article
International Workshop on Combinatorial Algorithms, Jul 2021, Ottawa, Canada. pp.385-399, ⟨10.1007/978-3-030-79987-8_27⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/2105.05685 BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Endosperm turgor pressure both promotes and restricts seed growth and size
auteur
Audrey Creff, Olivier Ali, Vincent Bayle, Gwyneth Ingram, Benoit Landrein
article
2021
Accès au bibtex
BibTex
titre
A quantitative gibberellin signalling biosensor reveals a role for gibberellins in internode specification at the shoot apical meristem
auteur
Teva Vernoux, Bihai Shi, Amelia Felipo-Benavent, Guillaume Cerutti, Carlos Galvan-Ampudia, Lucas Jilli, Geraldine Brunoud, Jérome Mutterer, Lali Sakvarelidze-Achard, Jean-Michel Davière, Alejandro Navarro-Galiano, Ankit Walia, Shani Lazary, Jonathan Legrand, Roy Weinstein, Alexander Jones, Salomé Prat, Patrick Achard
article
2021
Accès au bibtex
BibTex
titre
Maximum likelihood estimation for spinal-structured trees
auteur
Romain Azaïs, Benoît Henry
article
2021
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/2101.05099 BibTex

2020

Journal articles

titre
Phyllotaxis as geometric canalization during plant development
auteur
Christophe Godin, Christophe Golé, Stéphane Douady
article
Development (Cambridge, England), Company of Biologists, 2020, 147 (19), pp.1-45. ⟨10.1242/dev.165878⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03014239/file/Manuscript%20%2B%20suppmat.pdf BibTex
titre
Contact area-dependent cell communication and the morphological invariance of ascidian embryogenesis
auteur
Léo Guignard, Ulla-Maj Fiuza, Bruno Leggio, Julien Laussu, Emmanuel Faure, Gaël Michelin, Kilian Biasuz, Lars Hufnagel, Grégoire Malandain, Christophe Godin, Patrick Lemaire
article
Science, American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2020, 369 (6500), pp.158. ⟨10.1126/science.aar5663⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
Skeletonization of Plant Point Cloud Data Using Stochastic Optimization Framework
auteur
Ayan Chaudhury, Christophe Godin
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2020, 11, ⟨10.3389/fpls.2020.00773⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03029993/file/2020_Chaudhury_Front_Plant_Sci.pdf BibTex
titre
Temporal integration of auxin information for the regulation of patterning
auteur
Carlos Galvan-Ampudia, Guillaume Cerutti, Jonathan Legrand, Geraldine Brunoud, Raquel Martin Arevalillo, Romain Azaïs, Vincent Bayle, Steven Moussu, Christian Wenzl, Yvon Jaillais, Jan U Lohmann, Christophe Godin, Teva Vernoux
article
eLife, eLife Sciences Publication, 2020, 9, ⟨10.7554/eLife.55832⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02368529/file/elife-55832-v1%20%283%29.pdf BibTex
titre
The Weight Function in the Subtree Kernel is Decisive
auteur
Romain Azaïs, Florian Ingels
article
Journal of Machine Learning Research, Microtome Publishing, 2020, 21, pp.1-36
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02097593/file/main.pdf BibTex
titre
Cellular Heterogeneity in Pressure and Growth Emerges from Tissue Topology and Geometry
auteur
Yuchen Long, Ibrahim Cheddadi, Gabriella Mosca, Vincent Mirabet, Mathilde Dumond, Annamaria Kiss, Jan Traas, Christophe Godin, Arezki Boudaoud
article
Current Biology – CB, Elsevier, 2020, 30 (8), pp.1504-1516.e8. ⟨10.1016/j.cub.2020.02.027⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
Sugar availability suppresses the auxin-induced strigolactone pathway to promote bud outgrowth
auteur
Jessica Bertheloot, Francois Barbier, Fréderic Boudon, Maria Dolores Perez-Garcia, Thomas Peron, Sylvie Citerne, Elizabeth Dun, Christine Beveridge, Christophe Godin, Soulaiman Sakr
article
New Phytologist, Wiley, 2020, 225 (2), pp.866-879. ⟨10.1111/nph.16201⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-agrocampus-ouest.archives-ouvertes.fr/hal-02402977/file/Bertheloot_et_al-2019-New_Phytologist%281%29.pdf BibTex
titre
Cortical tension overrides geometrical cues to orient microtubules in confined protoplasts
auteur
Leia Colin, Antoine Chevallier, Satoru Tsugawa, Florian Gacon, Christophe Godin, Virgile Viasnoff, Timothy Saunders, Olivier Hamant
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, National Academy of Sciences, 2020, 117 (51), pp.32731-32738. ⟨10.1073/pnas.2008895117⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03063893/file/Colin%20PNAS%202020.pdf BibTex
titre
Microtubule-Mediated Wall Anisotropy Contributes to Leaf Blade Flattening
auteur
Feng Zhao, Fei Du, Hadrien Oliveri, Lüwen Zhou, Olivier Ali, Wenqian Chen, Shiliang Feng, Qingqing Wang, Shouqin Lü, Mian Long, René Schneider, Arun Sampathkumar, Christophe Godin, Jan Traas, Yuling Jiao
article
Current Biology – CB, Elsevier, 2020, 30 (20), pp.3972. ⟨10.1016/j.cub.2020.07.076⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02370615/file/604710.full.pdf BibTex
titre
Bounds on mixed state entanglement
auteur
Bruno Leggio, Anna Napoli, Hiromichi Nakazato, Antonino Messina
article
Entropy, MDPI, 2020, 22 (1), pp.62. ⟨10.3390/e22010062⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02395355/file/1912.01997.pdf BibTex

Conference papers

titre
A Reverse Search Method for the Enumeration of Unordered Forests using DAG Compression
auteur
Florian Ingels, Romain Azaïs
article
WEPA 2020 – Fourth International Workshop on Enumeration Problems and Applications, Dec 2020, Online, France. pp.1-3
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03051733/file/extended_abstract_ingels_azais_wepa2020.pdf BibTex
titre
3D Plant Phenotyping: All You Need is Labelled Point Cloud Data
auteur
Ayan Chaudhury, Frédéric Boudon, Christophe Godin
article
CVPPP-ECCV 2020 – Workshop on Computer Vision Problems in Plant Phenotyping, Aug 2020, Glasgow, United Kingdom. pp.1-17
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03030004/file/CVPPP_20.pdf BibTex
titre
Phenotyping and modeling of water transport in roots
auteur
Yann Boursiac, Christophe Pradal, Fabrice Bauget, Stathis Delivorias, Mikael Lucas, Christophe Godin, Christophe Maurel
article
iCROPM 2020 – Satellite workshop : Phenotyping and modeling of plant anchorage and physiology, Feb 2020, Montpellier, France
Accès au bibtex
BibTex

Book sections

titre
Estimation of Piecewise-Deterministic Trajectories in a Quantum Optics Scenario
auteur
Bruno Leggio, Romain Azaïs
article
Statistical Topics and Stochastic Models for Dependent Data with Applications, 2020
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02389225/file/PDPTQuantOpt.pdf BibTex

2019

Journal articles

titre
Introduction
auteur
Mark Alber, Christophe Godin, Philip K. Maini, Roeland M.H. Merks, Eric Mjolsness
article
Bulletin of Mathematical Biology, Springer Verlag, 2019, pp.3214-3218. ⟨10.1007/s11538-019-00649-2⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
Coupling water fluxes with cell wall mechanics in a multicellular model of plant development
auteur
Ibrahim Cheddadi, Michel Génard, Nadia Bertin, Christophe Godin
article
PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2019, 15 (6), pp.e1007121. ⟨10.1371/journal.pcbi.1007121⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02196768/file/plosComp2019.pdf BibTex
titre
Treex : a Python package for manipulating rooted trees
auteur
Romain Azaïs, Guillaume Cerutti, Didier Gemmerlé, Florian Ingels
article
Journal of Open Source Software, Open Journals, 2019, 4 (38), pp.1-2. ⟨10.21105/joss.01351⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
Estimation of the average number of continuous crossings for non-stationary non-diffusion processes
auteur
Romain Azaïs, Alexandre Genadot
article
Journal of Statistical Planning and Inference, Elsevier, 2019, 198, pp.119-138. ⟨10.1016/j.jspi.2018.04.002⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01499914/file/crossings.pdf BibTex
titre
Regulation of plant cell wall stiffness by mechanical stress: a mesoscale physical model
auteur
Hadrien Oliveri, Jan Traas, Christophe Godin, Olivier Ali
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2019, 78 (3), pp.625-653. ⟨10.1007/s00285-018-1286-y⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01691110/file/oliveri_et_al2018_regulation.pdf BibTex
titre
Simulating Turgor-Induced Stress Patterns in Multilayered Plant Tissues
auteur
Olivier Ali, Hadrien Oliveri, Jan Traas, Christophe Godin
article
Bulletin of Mathematical Biology, Springer Verlag, 2019, 81 (8), pp.1-23. ⟨10.1007/s11538-019-00622-z⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-02154814/file/alietal_2019_Author_proof.pdf BibTex
titre
Inference for conditioned Galton-Watson trees from their Harris path
auteur
Romain Azaïs, Alexandre Genadot, Benoît Henry
article
ALEA : Latin American Journal of Probability and Mathematical Statistics, Instituto Nacional de Matemática Pura e Aplicada, 2019, 16 (1), pp.1-45. ⟨10.30757/ALEA.v16-21⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01360650/file/main.pdf BibTex
titre
Nearest embedded and embedding self-nested trees
auteur
Romain Azaïs
article
Algorithms, MDPI, 2019, 12 (9), pp.1-16. ⟨10.3390/a12090180⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01584078/file/main.pdf BibTex
titre
Light Regulation of Axillary Bud Outgrowth Along Plant Axes: An Overview of the Roles of Sugars and Hormones
auteur
Anne Schneider, Christophe Godin, Frédéric Boudon, Sabine Demotes-Mainard, Soulaiman Sakr, Jessica Bertheloot
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2019, 10, pp.1-17. ⟨10.3389/fpls.2019.01296⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02327576/file/Schneider%20et%20al%202019%20Frontiers%20Pl%20Sci.pdf BibTex
titre
MorphoNet: an interactive online morphological browser to explore complex multi-scale data
auteur
Bruno Leggio, Julien Laussu, Axel Carlier, Christophe Godin, Patrick Lemaire, Emmanuel Faure
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2019, 10 (2812), pp.1-8. ⟨10.1038/s41467-019-10668-1⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01938153/file/s41467-019-10668-1.pdf BibTex

Conference papers

titre
SPONGE: Software-Defined Traffic Engineering to Absorb Influx of Network Traffic
auteur
Benoît Henry, Shihabur Chowdhury, Abdelkader Lahmadi, Romain Azaïs, Jérôme François, Raouf Boutaba
article
LCN 2019 – 44th IEEE Conference on Local Computer Networks, Oct 2019, Osnabrück, Germany
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02403616/file/sponge_lcn_19.pdf BibTex
titre
Quantifying cell polarities in confocal images using 3D wall meshes
auteur
Guillaume Cerutti, Carlos Galvan Ampudia, Jonathan Legrand, Christophe Godin, Teva Vernoux
article
IAMPS 2019 – 7th International Workshop on Image Analysis Methods in the Plant Sciences, Jul 2019, Bron, France. pp.1-2
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02176398/file/IAMPS_2019.pdf BibTex
titre
De l’importance de la fonction de poids dans le noyau des sous-arbres
auteur
Florian Ingels, Romain Azaïs
article
JdS 2019 – 51èmes Journées de Statistique, Jun 2019, Nancy, France. pp.1-6
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02129866/file/Subtree_kernel_Ingels_Azais.pdf BibTex
titre
Régression polynomiale par morceaux sous contrainte de régularité pour la propagation de fissures
auteur
Florine Greciet, Romain Azaïs, Anne Gégout-Petit
article
JdS 2019 – 51èmes Journées de Statistique, Jun 2019, Nancy, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02172747/file/jds19.pdf BibTex
titre
Approximation of trees by self-nested trees
auteur
Romain Azaïs, Jean-Baptiste Durand, Christophe Godin
article
ALENEX 2019 – Algorithm Engineering and Experiments, Jan 2019, San Diego, United States. pp.39-53, ⟨10.1137/1.9781611975499.4⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01294013/file/paper.pdf BibTex

Software

titre
OpenAlea
auteur
Christophe Pradal, Christian Fournier, Frédéric Boudon, Patrick Valduriez, Esther Pacitti, Yann Guédon, Christophe Godin
article
2019
Accès au bibtex
BibTex

Theses

titre
On the role of mechanical feedback in plant morphogenesis
auteur
Hadrien Oliveri
article
Modeling and Simulation. Université Montpellier, 2019. English. ⟨NNT : 2019MONTS021⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/tel-02176096/file/OLIVERI_2019_archivage.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Geometry Reconstruction of Plants
auteur
Ayan Chaudhury, Christophe Godin
article
2019
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02414486/file/GeometryModelling_bookChapter.pdf BibTex
titre
Phyllotaxis: a remarkable example of developmental canalization in plants
auteur
Christophe Godin, Christophe Golé, Stéphane Douady
article
2019
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02370969/file/PhyllotaxisPrimer%28r%29.pdf BibTex
titre
Multiscale mechanical model for cell division orientation in developing biological systems
auteur
Bruno Leggio, Julien Laussu, Emmanuel Faure, Patrick Lemaire, Christophe Godin
article
2019
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02367600/file/785337.full.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
The “computable egg”: Myth or useful concept?
auteur
Kilian Biasuz, Bruno Leggio, Emmanuel Faure, Patrick Lemaire
article
Current Opinion in Systems Biology, Elsevier, 2018, 11, pp.91-97. ⟨10.1016/j.coisb.2018.09.003⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
Transcriptional induction of cell wall remodelling genes is coupled to microtubule-driven growth isotropy at the shoot apex in Arabidopsis
auteur
Alessia Armezzani, Ursula Abad, Olivier Ali, Amélie Andres Robin, Laetitia Vachez, Antoine Larrieu, Ewa Mellerowicz, Ludivine Taconnat, Virginie Battu, Thomas Stanislas, Mengying Liu, Teva Vernoux, Jan Traas, Massimiliano Sassi
article
Development (Cambridge, England), Company of Biologists, 2018, 145 (11), ⟨10.1242/dev.162255⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01894645/file/CA51A8F3-17C5-40B9-8066-171241C3A773.pdf BibTex
titre
Bark and Leaf Fusion Systems to Improve Automatic Tree Species Recognition
auteur
Sarah Bertrand, Rihab Ben Ameur, Guillaume Cerutti, Didier Coquin, Lionel Valet, Laure Tougne
article
Ecological Informatics, Elsevier, 2018, ⟨10.1016/j.ecoinf.2018.05.007⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
An Image Analysis Pipeline to Quantify Emerging Cracks in Materials or Adhesion Defects in Living Tissues
auteur
Stéphane Verger, Guillaume Cerutti, Olivier Hamant
article
Bio-protocol , Bio-protocol LCC, 2018, 8 (19)
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01940178/file/Bio-protocol3036.pdf BibTex

Conference papers

titre
Detection and modeling of the propagation regimes in fatigue crack propagation
auteur
Florine Greciet, Romain Azaïs, Anne Gégout-Petit
article
ENBIS 2018 – 18th Annual Conference of the European Network for Business and Industrial Statistics, Sep 2018, Nancy, France
Accès au bibtex
BibTex

Book sections

titre
Level Crossings and Absorption of an Insurance Model
auteur
Romain Azaïs, Alexandre Genadot
article
Romain Azaïs; Florian Bouguet. Statistical Inference for Piecewise-deterministic Markov Processes, Wiley, pp.65-105, 2018, 978-1-786-30302-8. ⟨10.1002/9781119507338.ch3⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01862266/file/chapter_ins.pdf BibTex
titre
Rupture detection in fatigue crack propagation
auteur
Romain Azaïs, Anne Gégout-Petit, Florine Greciet
article
Romain Azaïs; Florian Bouguet. Statistical Inference for Piecewise-deterministic Markov Processes, Wiley, pp.173-207, 2018, 978-1-786-30302-8. ⟨10.1002/9781119507338.ch6⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01862267/file/chapter_fcp.pdf BibTex

Directions of work or proceedings

titre
Statistical Inference for Piecewise-deterministic Markov Processes
auteur
Romain Azaïs, Florian Bouguet
article
France. Wiley, pp.i-xxxiv 1-260, 2018, 9781119544036. ⟨10.1002/9781119507338⟩
Accès au bibtex
BibTex

Poster communications

titre
Stress-based regulation of multicellular plant growth: a finite element modeling approach applied to planar leaf morphogenesis
auteur
Hadrien Oliveri, Feng Zhao, Olivier Ali, Jan Traas, Christophe Godin
article
ICSB 2018 – 19th International Conference on Systems Biology, Oct 2018, Lyon, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01897027/file/Poster%20ICSB.pdf BibTex
titre
Visualization of Leaf Botanical Features Extracted from AlexNet Convolutional Layers
auteur
Sarah Bertrand, Guillaume Cerutti, Laure Tougne
article
IAMPS – International Workshop on Image Analysis Methods for the Plant Sciences 2018, Jan 2018, Nottingham, United Kingdom
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01691924/file/Visualization_of_Leaf_Botanical_Features_Extracted_from_AlexNet_Convolutional_Layers.pdf BibTex
titre
A parametric active 4D model for the automatic construction of developmental atlases from confocal images of shoot apical meristems
auteur
Guillaume Cerutti, Carlos Galvan-Ampudia, Jonathan Legrand, Teva Vernoux, Christophe Godin
article
IAMPS – International Workshop on Image Analysis Methods for the Plant Sciences 2018, Jan 2018, Nottingham, United Kingdom. 2018
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01692584/file/IAMPS_Poster.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
From spatio-temporal morphogenetic gradients to rhythmic patterning at the shoot apex
auteur
Carlos Galvan-Ampudia, Guillaume Cerutti, Jonathan Legrand, Romain Azaïs, Geraldine Brunoud, Steven Moussu, Christian Wenzl, Jan Lohmann, Christophe Godin, Teva Vernoux
article
2018
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01937928/file/469718.full.pdf BibTex

2017

Journal articles

titre
Estimating wheat green area index from ground-based LiDAR measurement using a 3D canopy structure model
auteur
Shouyang Liu, Frédéric Baret, Mariem Abichou, Frédéric Boudon, Samuel Thomas, Kaiguang Zhao, Christian Fournier, Bruno Andrieu, Kamran Irfan, Matthieu Hemmerlé, Benoit de Solan
article
Agricultural and Forest Meteorology, Elsevier Masson, 2017, 247, pp.12 – 20. ⟨10.1016/j.agrformet.2017.07.007⟩
Accès au bibtex
BibTex

Conference papers

titre
Segmentation Algorithm on Smartphone Dual Camera: Application to Plant Organs in the Wild
auteur
Sarah Bertrand, Guillaume Cerutti, Laure Tougne
article
10th International Conference on Machine Vision, Nov 2017, Vienna, Austria
Accès au bibtex
BibTex

Comments are closed.