Agathe Guilloux

2024

Preprints, Working Papers, …

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Ayoub Abraich, Agathe Guilloux, Blaise Hanczar. SurvCaus : Representation Balancing for Survival Causal Inference. 2024. ⟨hal-04432054⟩

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2023

Journal articles

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Line Farah, Juliette Murris, Isabelle Borget, Agathe Guilloux, Nicolas Martelli, et al.. Assessment of Performance, Interpretability, and Explainability in Artificial Intelligence–Based Health Technologies: What Healthcare Stakeholders Need to Know. Mayo Clinic Proceedings: Digital Health, 2023, 1 (2), pp.120-138. ⟨10.1016/j.mcpdig.2023.02.004⟩. ⟨hal-04348677⟩

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Conference papers

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Linus Bleistein, Adeline Fermanian, Anne-Sophie Jannot, Agathe Guilloux. Learning the Dynamics of Sparsely Observed Interacting Systems. ICML 2023 – 40th International Conference on Machine Learning, Jul 2023, Honolulu, Hawaii, United States. ⟨hal-04336559⟩

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2022

Journal articles

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Aziliz Cottin, Nicolas Pecuchet, Marine Zulian, Agathe Guilloux, Sandrine Katsahian. IDNetwork: A deep illness‐death network based on multi‐state event history process for disease prognostication. Statistics in Medicine, 2022, 41 (9), pp.1573-1598. ⟨10.1002/sim.9310⟩. ⟨hal-03822456⟩

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2021

Journal articles

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Simon Bussy, Mokhtar Alaya, Anne‐sophie Jannot, Agathe Guilloux. Binacox: automatic cut‐point detection in high‐dimensional Cox model with applications in genetics. Biometrics, 2021, ⟨10.1111/biom.13547⟩. ⟨hal-03560951⟩

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Preprints, Working Papers, …

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Maryan Morel, Benjamin Bouyer, Agathe Guilloux, Moussa Laanani, Fanny Leroy, et al.. Screening anxiolytics, hypnotics, antidepressants and neuroleptics for bone fracture risk among elderly: a nation-wide dynamic multivariate self-control study using the SNDS claims database. 2021. ⟨hal-03438806⟩

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2020

Journal articles

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Emmanuelle Six, Agathe Guilloux, Adeline Denis, Arnaud Lecoules, Alessandra Magnani, et al.. Clonal tracking in gene therapy patients reveals a diversity of human hematopoietic differentiation programs. Blood, 2020, 135 (15), pp.1219-1231. ⟨10.1182/blood.2019002350⟩. ⟨hal-03295368⟩

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Preprints, Working Papers, …

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Simon Bussy, Mokhtar Z. Alaya, Anne-Sophie Jannot, Agathe Guilloux. Binacox: automatic cut-point detection in high-dimensional Cox model with applications in genetics. 2020. ⟨hal-01817823v2⟩

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2019

Journal articles

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Mokhtar Z. Alaya, Simon Bussy, Stéphane Gaïffas, Agathe Guilloux. Binarsity: a penalization for one-hot encoded features. Journal of Machine Learning Research, 2019, 20 (118), pp.1−34. ⟨hal-01648382⟩

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Romain Cohen, Elisabeth Hain, Olivier Buhard, Agathe Guilloux, Armelle Bardier, et al.. Association of Primary Resistance to Immune Checkpoint Inhibitors in Metastatic Colorectal Cancer With Misdiagnosis of Microsatellite Instability or Mismatch Repair Deficiency Status. JAMA oncology, 2019, 5 (4), pp.551-555. ⟨10.1001/jamaoncol.2018.4942⟩. ⟨hal-02419371⟩

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Maryan Morel, Emmanuel Bacry, Stéphane Gaïffas, Agathe Guilloux, Fanny Leroy. ConvSCCS: convolutional self-controlled case-seris model for lagged adverser event detection. Biostatistics, 2019, ⟨10.1093/biostatistics/kxz003⟩. ⟨hal-02413920⟩

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Simon Bussy, Agathe Guilloux, Stéphane Gaïffas, Anne-Sophie Jannot. C-mix: a high dimensional mixture model for censored durations, with applications to genetic data. Statistical Methods in Medical Research, 2019, 28 (5), pp.1523–1539. ⟨hal-01648389⟩

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Simon Bussy, Raphaël Veil, Vincent Looten, Anita Burgun, Stéphane Gaiffas, et al.. Comparison of methods for early-readmission prediction in a high-dimensional heterogeneous covariates and time-to-event outcome framework. BMC Medical Research Methodology, 2019, 19 (1), pp.50. ⟨10.1186/s12874-019-0673-4⟩. ⟨hal-02082787⟩

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2018

Journal articles

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Vincent Jonchère, Laetitia Marisa, Malorie Greene, Alain Virouleau, Olivier Buhard, et al.. Identification of Positively and Negatively Selected Driver Gene Mutations Associated With Colorectal Cancer With Microsatellite Instability Positive Selection Pressure Mutational Background Negative Selection Pressure Mutational Frequency Microsatellite length (bp). Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology, 2018, 6 (3), pp.277-300. ⟨10.1016/j.jcmgh.2018.06.002⟩. ⟨hal-02180261⟩

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Preprints, Working Papers, …

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Mokhtar Z. Alaya, Sarah Lemler, Agathe Guilloux, Thibault Allart. High-dimensional time-varying Aalen and Cox models. 2018. ⟨hal-01798390⟩

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Alain Virouleau, Agathe Guilloux, Stéphane Gaïffas, Malgorzata Bogdan. HIGH-DIMENSIONAL ROBUST REGRESSION AND OUTLIERS DETECTION WITH SLOPE. 2018. ⟨hal-01798400⟩

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2017

Conference papers

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Thibault Allart, Guillaume Levieux, Michel Pierfitte, Agathe Guilloux, Stéphane Natkin. Difficulty influence on motivation over time in video games using survival analysis. FDG – Foundation of Digital Games, Aug 2017, Hyannis, United States. ⟨10.1145/3102071.3102085⟩. ⟨hal-02436676⟩

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2016

Journal articles

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Agathe Guilloux, Sarah Lemler, Marie-Luce Taupin. Adaptive kernel estimation of the baseline function in the Cox model with high-dimensional covariates. Journal of Multivariate Analysis, 2016, 148, pp.141-159. ⟨10.1016/j.jmva.2016.03.002⟩. ⟨hal-01327412⟩

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Olivier Buhard, Anaïs Lagrange, Agathe Guilloux, Chrystelle Colas, Mouna Chouchène, et al.. HSP110 T17 simplifies and improves the microsatellite instability testing in patients with colorectal cancer. Journal of Medical Genetics, 2016, 53 (6), pp.377 – 384. ⟨10.1136/jmedgenet-2015-103518⟩. ⟨hal-01427452⟩

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Conference papers

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Thibault Allart, Guillaume Levieux, Michel Pierfitte, Agathe Guilloux, Stéphane Natkin. Design influence on player retention: A method based on time varying survival analysis. IEEE Conference on Computational Intelligence and Games (CIG), Sep 2016, Santorini, Greece. pp.1-8, ⟨10.1109/CIG.2016.7860421⟩. ⟨hal-02436692⟩

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2015

Journal articles

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Mokhtar Z. Alaya, Stéphane Gaïffas, Agathe Guilloux. Learning the intensity of time events with change-points. IEEE Transactions on Information Theory, 2015, 61 (9), pp.5148-5171. ⟨hal-01163415⟩

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Olivier Bouaziz, Agathe Guilloux. A penalized algorithm for event-specific rate models for recurrent events. Biostatistics, 2015. ⟨hal-01053266⟩

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Agathe Guilloux, Sarah Lemler, Marie-Luce Taupin. Adaptive estimation of the baseline hazard function in the Cox model by model selection, with high-dimensional covariates. Journal of Statistical Planning and Inference, 2015, 171, pp.38-62. ⟨10.1016/j.jspi.2015.11.005⟩. ⟨hal-01120683v2⟩

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Preprints, Working Papers, …

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Agathe Guilloux, Sarah Lemler, Marie-Luce Taupin. Adaptive kernel estimation of the baseline function in the Cox model with high-dimensional covariates. 2015. ⟨hal-01171775v2⟩

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2014

Journal articles

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Jean-Yves Dauxois, Agathe Guilloux, Syed N.U.A. Kirmani. Estimation in a Competing Risks Proportional Hazards Model Under Length-biased Sampling With Censoring. Lifetime Data Analysis, 2014, 20 (2), pp.276-302. ⟨10.1007/s10985-013-9248-6⟩. ⟨hal-00605669⟩

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Ada Collura, Anaïs Lagrange, Magali Svrcek, Laetitia Marisa, Olivier Buhard, et al.. Patients With Colorectal Tumors With Microsatellite Instability and Large Deletions in HSP110 T17 Have Improved Response to 5-Fluorouracil–Based Chemotherapy. Gastroenterology, 2014, 146 (2), pp.401-411.e1. ⟨10.1053/j.gastro.2013.10.054⟩. ⟨hal-03030339⟩

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Book sections

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Fabienne Comte, Agathe Guilloux, Elodie Brunel. Estimation/Imputation strategies for missing data in survival analysis. Vincent Couallier, Léo Gerville-Réache, Catherine Huber-Carol, Nikolaos Limnios andMounir Mesbah. Statistical Models and Methods for Reliability and Survival Analysis, John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, USA, pp.229-252, 2014, 9781848216198. ⟨10.1002/9781118826805.ch15⟩. ⟨hal-00818859⟩

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2013

Journal articles

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Elodie Brunel, Fabienne Comte, Agathe Guilloux. Nonparametric estimation for survival data with censoring indicators missing at random. Journal of Statistical Planning and Inference, 2013, 143 (10), pp.1653-1671. ⟨10.1016/j.jspi.2013.04.010⟩. ⟨hal-00679799⟩

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Olivier Bouaziz, Fabienne Comte, Agathe Guilloux. Nonparametric estimation of the intensity function of a recurrent event process. Statistica Sinica, 2013, 23 (2), pp.635-665. ⟨10.5705/ss.2011.137⟩. ⟨hal-00599714⟩

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Preprints, Working Papers, …

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Olivier Bouaziz, Agathe Guilloux. A penalized algorithm for event-specific rate models for recurrent events. 2013. ⟨hal-00811561⟩

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2011

Journal articles

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Fabienne Comte, Stéphane Gaïffas, Agathe Guilloux. Adaptive estimation of the conditional intensity of marker-dependent counting processes. Annales de l’Institut Henri Poincaré (B) Probabilités et Statistiques, 2011, 47 (4), pp.1171-1196. ⟨10.1214/10-AIHP386⟩. ⟨hal-00333356v2⟩

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2009

Journal articles

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Fabienne Comte, Elodie Brunel, Agathe Guilloux. Nonparametric density estimation in presence of bias and censoring. Test, 2009, 18 (1), pp.166-194. ⟨10.1007/s11749-007-0075-5⟩. ⟨hal-00534751⟩

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Conference papers

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Philippe Saint-Pierre, Agathe Guilloux. Fonction de survie bivariée de variables censurées à droite et à gauche. 41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France. ⟨inria-00386760⟩

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Stéphane Gaiffas, Agathe Guilloux. Apprentissage pour des processus de comptage avec covariables. 41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France. ⟨inria-00386764⟩

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Fabienne Comte, Stéphane Gaïffas, Agathe Guilloux. Estimation adaptative pour des processus de comptage dépendant de covariables. 41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France. ⟨inria-00386762⟩

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Preprints, Working Papers, …

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Stéphane Gaïffas, Agathe Guilloux. Learning and adaptive estimation for marker-dependent counting processes. 2009. ⟨hal-00420651⟩

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2008

Journal articles

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Elodie Brunel, Fabienne Comte, Agathe Guilloux. Adaptive nonparametric strategies for censored lifetimes with unknown sampling bias. Scandinavian Journal of Statistics, 2008, 35 (3), pp.557-576. ⟨hal-00317812⟩

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Agathe Guilloux, Philippe Saint-Pierre. Estimateur de la fonction de répartition bivariée avec censures à droite et à gauche. Annales de l’ISUP, 2008, LII (1-2), pp.157-164. ⟨hal-03633194⟩

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Jean-Yves Dauxois, Agathe Guilloux. Nonparametric Inference under Competing Risks and selection-Biased Sampling. Journal of Multivariate Analysis, 2008, 99 (4), pp.589-605. ⟨hal-00501856⟩

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