2024
Journal articles
- titre
- SWoTTeD: an extension of tensor decomposition to temporal phenotyping
- auteur
- Hana Sebia, Thomas Guyet, Etienne Audureau
- article
- Machine Learning, 2024, ⟨10.1007/s10994-024-06545-8⟩
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- titre
- A Coupled Neural Field Model for the Standard Consolidation Theory
- auteur
- Lisa Blum Moyse, Hugues Berry
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2024, 588, pp.111818
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Conference papers
- titre
- Plateformisation de l’apprentissage machine en épidémiologie: enjeux philosophiques
- auteur
- Éric Pardoux, Thomas Guyet
- article
- Conférence Nationale en Intelligence Artificielle, Jul 2024, La Rochelle, France
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- titre
- Plateformisation de l’apprentissage machine en épidémiologie : enjeux philosophiques
- auteur
- Éric Pardoux, Thomas Guyet
- article
- Conférence National en Intelligence Artificielle, AFIA, Jul 2024, La Rochelle, France
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- titre
- SNDS: contexte, contenu et usages de la base de l’assurance maladie
- auteur
- Thomas Guyet
- article
- Symposium MADICS, GdR MADICS, May 2024, Blois, France
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- titre
- Catégorisation de séquences temporelles – Application à l’analyse de parcours de soins
- auteur
- Enoal Gesny, Pierre Pinson, Thomas Guyet
- article
- Extraction et Gestion des Connaissances (EGC), Jan 2024, Dijon, France. pp.119-130
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Book sections
- titre
- Computational Models of Astrocyte Function at Glutamatergic Synapses
- auteur
- Kerstin Lenk, Audrey Denizot, Barbara Genocchi, Ippa Seppälä, Marsa Taheri, Suhita Nadkarni
- article
- Maria Kukley. New Technologies for Glutamate Interaction: Neurons and Glia, 2780, Springer US, pp.229-263, 2024, Neuromethods, ⟨10.1007/978-1-0716-3742-5_11⟩
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Books
- titre
- Conférence Nationale d’Intelligence Artificielle Année 2024
- auteur
- Emmanuel Adam, Thomas Guyet, Benoit Le Blanc, Dominique Longin, Nadia Abchiche-Mimouni, Ghislain Atemezing, Nathalie Aussenac-Gilles, Jean-Guy Mailly, Catherine Roussey, François Schwarzentruber, Anaelle Wilczynski, Haïfa Zargayouna
- article
- Association Française pour l’Intelligence Artificielle, 2024
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Poster communications
- titre
- Single-cell multi-omics data integration powered by PCA-like autoencoders
- auteur
- Thibaut Peyric, Anton Crombach, Thomas Guyet
- article
- JOBIM 2024, Jun 2024, Toulouse, France
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Preprints, Working Papers, …
- titre
- Vascular Segmentation of Functional Ultrasound Images using Deep Learning
- auteur
- Hana Sebia, Thomas Guyet, Mickaël Pereira, Marco Valdebenito, Hugues Berry, Benjamin Vidal
- article
- 2024
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- titre
- Enhancing Fluorescence Correlation Spectroscopy with Machine Learning for Advanced Analysis of Anomalous Diffusion
- auteur
- Nathan Quiblier, Jan-Michael Rye, Pierre Leclerc, Henri Truong, Abdelkrim Hannou, Laurent Héliot, Hugues Berry
- article
- 2024
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Automatic analysis of negation cues and scopes for medical texts in French using language models
- auteur
- Salim Sadoune, Antoine Richard, François Talbot, Thomas Guyet, Loïc Boussel, Hugues Berry
- article
- 2024
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Modeling compartmentalization within intracellular signaling pathway
- auteur
- Claire Alamichel, Juan Calvo, Erwan Hingant, Saoussen Latrach, Nathan Quiblier, Romain Yvinec
- article
- 2024
- Accès au texte intégral et bibtex
2023
Journal articles
- titre
- Sky-signatures: detecting and characterizing recurrent behavior in sequential data
- auteur
- Clément Gautrais, Peggy Cellier, Thomas Guyet, René Quiniou, Alexandre Termier
- article
- Data Mining and Knowledge Discovery, 2023, ⟨10.1007/s10618-023-00949-1⟩
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- titre
- Admissible generalisation of temporal sequences as chronicles
- auteur
- Thomas Guyet
- article
- Journal of Applied Non-Classical Logics, 2023, 33 (3-4), pp.641-653. ⟨10.1080/11663081.2023.2244717⟩
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- titre
- Quantifying membrane binding and diffusion with fluorescence correlation spectroscopy diffusion laws
- auteur
- Anita Mouttou, Erwan Bremaud, Julien Noero, Rayane Dibsy, Coline Arone, Johnson Mak, Delphine Muriaux, Hugues Berry, Cyril Favard
- article
- Biophysical Journal, 2023, 122 (11), pp.2216-2229. ⟨10.1016/j.bpj.2023.01.006⟩
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Conference papers
- titre
- Declarative Sequential Pattern Mining in ASP
- auteur
- Thomas Guyet
- article
- Conference on Inductive Logic Programming (ILP), Nov 2023, Bari, Italy
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- titre
- Interactive Visualization of Counterfactual Explanations for Tabular Data
- auteur
- Victor Guyomard, Françoise Fessant, Thomas Guyet, Tassadit Bouadi, Alexandre Termier
- article
- ECML/PKDD 2023 – European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases, Sep 2023, Turin, Italy. pp.330-334, ⟨10.1007/978-3-031-43430-3_25⟩
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- titre
- Generating robust counterfactual explanations
- auteur
- Victor Guyomard, Françoise Fessant, Thomas Guyet, Tassadit Bouadi, Alexandre Termier
- article
- ECML/PKDD – European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases, Sep 2023, Turin (Italie), Italy. pp.1-16
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- titre
- Analyse d’une enquête sur la sémantique des motifs séquentiels avec négation
- auteur
- Thomas Guyet
- article
- CNIA 2023 – Conférence Nationale en Intelligence Artificielle, PFIA, Jul 2023, Strasbourg, France. pp.62-71
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- titre
- Interface d’interrogation graphique de parcours de soins à base de chroniques
- auteur
- Pegdwendé N Sawadogo, Thomas Guyet, Etienne Audureau
- article
- Conférence Extraction et gestion de connaissances, Jan 2023, Lyon, France
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- titre
- Visualiser des explications contrefactuelles pour des données tabulaires
- auteur
- Victor Guyomard, François Wallyn, Françoise Fessant, Thomas Guyet, Tassadit Bouadi, Alexandre Termier
- article
- EGC 2023 – Conférence Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2023, Lyon, France. pp.557-564
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- titre
- Une extension de la décomposition tensorielle au phénotypage temporel
- auteur
- Hana Sebia, Thomas Guyet, Etienne Audureau
- article
- EGC 2023 – 23ème Conférence Francophone sur l’Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2023, Lyon, France
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- titre
- IA et données de santé : regards croisés sur les droits, devoirs et responsabilités des personnes publiques
- auteur
- Thomas Guyet, Pierre Saurel, Hélène Muscat, Christine Paillard, Tristan Allard, Nolwenn Le Meur, Danièle Bourcier, Emmanuel Oger, André Happe
- article
- Enjeux scientifiques et sociaux de l’IA, MITI/CNRS, Jan 2023, Paris, France
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Book sections
- titre
- Les utilisations de l’IA pour l’hôpital et la santé publique : données nécessaires, applications et obstacles potentiels
- auteur
- Hugues Berry
- article
- Christian Paul; Daniel Le Métayer. Maîtriser l’IA au service de l’action publique, Berger-Levrault, 2023, 978-2-7013-2183-7
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Books
- titre
- Conférence Nationale d’Intelligence Artificielle Année 2023
- auteur
- Emmanuel Adam, Thomas Guyet, Benoit Le Blanc, Dominique Longin, Zied Bouraoui, Sandra Bringay, Romaric Gaudel, Charlotte Laclau, Christelle Launois, Maxime Morge, Catherine Roussey, François Schwarzentruber, Cassia Trojahn, Élise Vareilles, Anaelle Wilczynski
- article
- Association Française pour l’Intelligence Artificielle, 2023
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- titre
- Chronicles: Formalization of a Temporal Model
- auteur
- Thomas Guyet, Philippe Besnard
- article
- Springer International Publishing, pp.121, 2023, SpringerBriefs in Computer Science (BRIEFSCOMPUTER), 978-3-031-33692-8. ⟨10.1007/978-3-031-33693-5⟩
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Documents associated with scientific events
- titre
- Ethical and legal issues in the design and use of AI systems in health
- auteur
- Thomas Guyet
- article
- eHealth and Ethics 2023, Apr 2023, Nanterre, France.
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Proceedings
- titre
- Advanced Analytics and Learning on Temporal Data
- auteur
- Georgiana Ifrim, Romain Tavenard, Anthony Bagnall, Patrick Schaefer, Simon Malinowski, Thomas Guyet, Vincent Lemaire
- article
- AALTD 2023 – 8th Workshop on Advanced Analytics and Learning on Temporal Data, 14343, Springer Nature Switzerland, 2023, Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-031-49896-1⟩
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Software
- titre
- ChemFeat
- auteur
- Jan Michael Rye
- article
- 2023, ⟨swh:1:dir:97647e8cc377bcb350f3169bdf1218da6f0152bf;origin=https://gitlab.inria.fr/jrye/chemfeat.git;visit=swh:1:snp:02443124ed4ee0d8d724fefd38bf9b271361cc09;anchor=swh:1:rev:25bfa1d9d55358292cbdf185f96f20c4d9f17893⟩
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- titre
- MolPred
- auteur
- Jan-Michael Rye
- article
- 2023, ⟨swh:1:dir:30804037d1dfde5004422d725625b765d5e68101;origin=https://gitlab.inria.fr/jrye/molpred.git;visit=swh:1:snp:401a0b556180686321959104732de8127df4f235;anchor=swh:1:rev:5dd0d37ab787a10a0b3baa55e685c7c83a8071f0⟩
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- titre
- Hydronaut
- auteur
- Jan-Michael Rye
- article
- 2023, ⟨swh:1:dir:9e229160ec54cad819527ce8726ddff662933a5c;origin=https://gitlab.inria.fr/jrye/hydronaut.git;visit=swh:1:snp:bf5f6a804696373ea8ad4b34e7d25a93ea922185;anchor=swh:1:rev:39fe2327cfc98544d039d53c0189fc4469dfac3f⟩
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Preprints, Working Papers, …
- titre
- Analyse automatique de négations pour la radiologie et autres textes cliniques en français par modèles de langage
- auteur
- S Sadoune, Antoine Fraboulet, A Richard, F Talbot, L. Boussel, Hugues Berry
- article
- 2023
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Videos
- titre
- SWoTTeD : An Extension of Tensor Decomposition to Temporal Phenotyping
- auteur
- Hana Sebia
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
2022
Journal articles
- titre
- Lactate supply overtakes glucose when neural computational and cognitive loads scale up
- auteur
- Yulia Dembitskaya, Charlotte Piette, Sylvie Perez, Hugues Berry, Pierre J Magistretti, Laurent Venance
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2022, 119 (47), ⟨10.1073/pnas.2212004119⟩
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- titre
- Control of Ca2+ signals by astrocyte nanoscale morphology at tripartite synapses
- auteur
- Audrey Denizot, Misa Arizono, Valentin Nägerl, Hugues Berry, Erik de Schutter
- article
- Glia, 2022, ⟨10.1002/glia.24258⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Modelling the modulation of cortical Up-Down state switching by astrocytes
- auteur
- Lisa Blum Moyse, Hugues Berry
- article
- PLoS Computational Biology, 2022, 18 (7), pp.e1010296. ⟨10.1371/journal.pcbi.1010296⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Monitoring of grassland productivity using Sentinel-2 remote sensing data
- auteur
- Pauline Dusseux, Thomas Guyet, Pierre Pattier, Valentin Barbier, Hervé Nicolas
- article
- International Journal of Applied Earth Observation and Geoinformation, 2022, 111, pp.102843. ⟨10.1016/j.jag.2022.102843⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Reinforcing interdisciplinary collaborations to unravel the astrocyte “Calcium Code
- auteur
- Ana Covelo, Anaïs Badoual, Audrey Denizot
- article
- Journal of Molecular Neuroscience, 2022, ⟨10.1007/s12031-022-02006-w⟩
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- titre
- HERDECT -Utilisation des données satellites Sentinel-2 pour quantifier la production d’herbe
- auteur
- Pauline Dusseux, Elise Michel, Thomas Guyet, Fabienne Launay, Alain Airiaud, Hervé Nicolas, P. Pattier, Jacques Fradin, Marc Fougère
- article
- Innovations Agronomiques, 2022, 85, pp.171-183. ⟨10.17180/ciag-2022-vol85-art13⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- SECURE-GEGELATI Always-On Intrusion Detection through GEGELATI Lightweight Tangled Program Graphs
- auteur
- Nicolas Sourbier, Karol Desnos, Thomas Guyet, Frédéric Majorczyk, Olivier Gesny, Maxime Pelcat
- article
- Journal of Signal Processing Systems, 2022, Design and Architectures for Signal and Image Processing 2021, 94 (7), pp.753-770. ⟨10.1007/s11265-021-01728-1⟩
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Conference papers
- titre
- Logical forms of chronicles
- auteur
- Thomas Guyet, Nicolas Markey
- article
- TIME 2022 – 29th International Symposium on Temporal Representation and Reasoning, Nov 2022, Virtual, Heard & McDonald Islands. pp.1-15
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- VCNet: A self-explaining model for realistic counterfactual generation
- auteur
- Victor Guyomard, Françoise Fessant, Thomas Guyet, Tassadit Bouadi, Alexandre Termier
- article
- ECML PKDD 2022 – European Conference on Machine Learning and Knowledge Discovery in Databases., Sep 2022, Grenoble, France. pp.1-16
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Experimental study of time series forecasting methods for groundwater level prediction
- auteur
- Michael Franklin Mbouopda, Thomas Guyet, Nicolas Labroche, Abel Henriot
- article
- ECML/PKDD 2022 – ECML/PKDD Workshop on Advanced Analytics and Learning on Temporal Data, Sep 2022, Grenoble, France. pp.1-16
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Imbalanced Classification with TPG Genetic Programming: Impact of Problem Imbalance and Selection Mechanisms
- auteur
- Nicolas Sourbier, Justine Bonnot, Karol Desnos, Frédéric Majorczyk, Olivier Gesny, Thomas Guyet, Maxime Pelcat
- article
- GECCO 2022 – Genetic and Evolutionary Computation Conference, Jul 2022, Boston, United States. pp.1-4, ⟨10.1145/3520304.3529008⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Conceptions de phénotypes computationnels pour la recherche en santé publique
- auteur
- Pegdwendé Sawadogo, Thomas Guyet, Etienne Audureau
- article
- Santé et IA 2022, Jun 2022, Saint-Etienne, France
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Incremental Mining of Frequent Serial Episodes Considering Multiple Occurrences
- auteur
- Thomas Guyet, Wenbin Zhang, Albert Bifet
- article
- ICCS 2022 – 22nd International Conference on Computational Science, Jun 2022, London, United Kingdom. pp.460-472, ⟨10.1007/978-3-031-08751-6_33⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Temporal Disaggregation of the Cumulative Grass Growth
- auteur
- Thomas Guyet, Laurent Spillemaecker, Simon Malinowski, Anne-Isabelle Graux
- article
- ICPRAI 2022 – 3rd International Conference on Pattern Recognition and Artificial Intelligence, Jun 2022, Paris, France. pp.383-394, ⟨10.1007/978-3-031-09282-4_32⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Générer des explications contrefactuelles à l’aide d’un autoencodeur supervisé
- auteur
- Victor Guyomard, Françoise Fessant, Tassadit Bouadi, Thomas Guyet
- article
- Extraction et Gestion des Connaissances, EGC’2022, Apr 2022, Blois, France
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- XPM: An explainable-by-design pattern-based estrus detection approach to improve resource use in dairy farms
- auteur
- Issei Harada, Kevin Fauvel, Thomas Guyet, Véronique Masson, Alexandre Termier, Philippe Faverdin
- article
- AAAI 2022 – 36th AAAI Conference on Artificial Intelligence, Feb 2022, Vancouver, Canada. pp.1-10
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Prédiction du niveau de nappes phréatiques : comparaison d’approches locale, globale et hybride
- auteur
- Lola Beuchée, Thomas Guyet, Simon Malinowski
- article
- EGC 2022 – Conférence francophone sur l’Extraction et la Gestion des Connaissances, Jan 2022, Blois, France
- Accès au texte intégral et bibtex
- titre
- Désagrégation temporelle du cumul annuel de croissance de l’herbe
- auteur
- Laurent Spillemaecker, Thomas Guyet, Simon Malinowski, Anne-Isabelle Graux
- article
- EGC 2022 – Conférence francophone sur l’Extraction et gestion des connaissances, Jan 2022, Blois, France. pp.27-38
- Accès au texte intégral et bibtex
Book sections
- titre
- Pandémie de Covid-19. L’aide de l’IA et du numérique
- auteur
- Hugues Berry, Laurence Watier
- article
- Bernard NORDLINGER; Cedric VILLANI; Olivier de FRESNOYE. Médecine et intelligence artificielle, CNRS, 2022, 9782271141514
- Accès au bibtex
Books
- titre
- Conférence Nationale d’Intelligence Artificielle Année 2022
- auteur
- Zied Bouraoui, Valérie Camps, Éric Gaussier, Maxime Guériau, Christelle Launois, Nicolas Prcovic, Céline Rouveirol, Fatiha Saïs, François Schwarzentruber, Anaelle Wilczynski, Yves Demazeau, Thomas Guyet, Dominique Longin, Davy Monticolo, Ahmed Samet
- article
- Association Française d’Intelligence Artificielle, pp.1-239, 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
Preprints, Working Papers, …
- titre
- The endoplasmic reticulum in perisynaptic astrocytic processes: shape, distribution and effect on calcium activity
- auteur
- Audrey Denizot, María Fernanda Veloz Castillo, Pavel Puchenkov, Corrado Calì, Erik de Schutter
- article
- 2022
- Accès au texte intégral et bibtex