Publications 2025

Publications HAL du labo/EPI bigs; simba

2025

Journal articles

titre
A note on the top Lyapunov exponent of linear cooperative systems
auteur
Michel Benaïm, Claude Lobry, Tewfik Sari, Édouard Strickler
article
Annales de la Faculté des Sciences de Toulouse. Mathématiques., 2025, 34 (1), pp.225-241. ⟨10.5802/afst.1811⟩
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https://hal.science/hal-04237453/file/2302.05874.pdf BibTex
titre
Uncovering candidate Nanog-Helper genes in early mouse embryo differentiation using differential entropy and network inference
auteur
Francisco Prista von Bonhorst, Olivier Gandrillon, Ulysse Herbach, Corentin Robert, Claire Chazaud, Yannick de Decker, Didier Gonze, Geneviève Dupont
article
Scientific Reports, 2025, 15 (1), pp.19975. ⟨10.1038/s41598-025-03956-y⟩
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titre
Stochastic branching models for the telomeres dynamics in a model including telomerase activity
auteur
Athanase Benetos, Coralie Fritsch, Emma Horton, Lionel Lenotre, Simon Toupance, Denis Villemonais
article
Journal of Mathematical Biology, 2025, 91 (8), ⟨10.1007/s00285-025-02230-z⟩
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https://hal.science/hal-04648211/file/BranchingTelomere.pdf BibTex
titre
A quasi-stationary approach to the long-term asymptotics of the growth-fragmentation equation
auteur
Denis Villemonais, Alexander Watson
article
The Annals of Applied Probability, 2025, 35 (2), ⟨10.1214/24-AAP2142⟩
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https://hal.science/hal-03588374/file/Growth_frag_26.pdf BibTex
titre
Degenerate processes killed at the boundary of a domain
auteur
Michel Benaïm, Nicolas Champagnat, William Oçafrain, Denis Villemonais
article
Annals of Probability, 2025, 53 (2), pp.720-752. ⟨10.1214/24-AOP1720⟩
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https://inria.hal.science/hal-03278551/file/KilledProcessesVI.pdf BibTex
titre
Convergence of population processes with small and frequent mutations to the canonical equation of adaptive dynamics
auteur
Nicolas Champagnat, Vincent Hass
article
The Annals of Applied Probability, 2025, 35 (1), pp.1-63. ⟨10.1214/24-AAP2103⟩
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https://hal.science/hal-04034027/file/Champagnat_Hass_Convergence_of_population_processes_with_small_and_frequent_mutations_to_the_CEAD_v4.pdf BibTex
titre
An extended Oja process for streaming canonical analysis
auteur
Jean-Marie Monnez
article
Communications in Statistics – Theory and Methods, In press
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https://hal.science/hal-04351700/file/Extended%20Oja%20for%20streaming%20CA%2020250426.pdf BibTex
titre
Dispersal-induced growth or decay in a time-periodic environment. The case of reducible migration matrices
auteur
Michel Benaim, Claude Lobry, Tewfik Sari, Edouard Strickler
article
Journal of Mathematical Biology, 2025, 91 (3), pp.26. ⟨10.1007/s00285-025-02258-1⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04523334/file/BLSS_ReducibleMigration_2025_06_10.pdf BibTex
titre
Drawdowns of Diffusions
auteur
Paavo Salminen, Pierre Vallois
article
ESAIM: Probability and Statistics, 2025, 29, pp.357-380. ⟨10.1051/ps/2025010⟩
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https://hal.science/hal-05201314/file/ps240080.pdf BibTex
titre
Uniform Wasserstein convergence of penalized Markov processes
auteur
Nicolas Champagnat, Édouard Strickler, Denis Villemonais
article
Probability Theory and Related Fields, 2025, 192 (3-4), pp.1031-1069. ⟨10.1007/s00440-025-01385-6⟩
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https://arxiv.org/pdf/2306.16051 BibTex

Conference papers

titre
Efficient Stochastic Simulation of Gene Regulatory Networks Using Hybrid Models of Transcriptional Bursting
auteur
Mathilde Gaillard, Ulysse Herbach
article
Computational Methods in Systems Biology, Sep 2025, Lyon, France. pp.109-125, ⟨10.1007/978-3-032-01436-8_7⟩
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https://arxiv.org/pdf/2507.01922 BibTex

Lectures

titre
Streaming data analysis Canonical analysis of two random vectors
auteur
Jean-Marie Monnez
article
Doctoral. Analyse des flux de données, Université de Lorraine, France. 2025, pp.18
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https://hal.science/hal-04908126/file/Lecture%20SA%20for%20streaming%20CA20250226.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Ergodicity and regularity properties of ODEs with semi-Markov switching
auteur
Tobias Hurth, Edouard Strickler
article
2025
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https://hal.science/hal-05289433/file/semi_markov.pdf BibTex
titre
On ecological models with sublinear growth
auteur
Nicolas Champagnat, Pablo Marquet, Cristóbal Quiñinao, Rolando Rebolledo, Mauricio Tejo, Leonardo Videla, Nicolás Zalduendo Vidal
article
2025
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https://inria.hal.science/hal-05156816/file/Sublinear_growth_HAL.pdf BibTex
titre
Modelling the effects of biological intervention in a dynamical gene network
auteur
Nicolas Champagnat, Rodolphe Loubaton, Laurent Vallat, Pierre Vallois
article
2025
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https://inria.hal.science/hal-05058235/file/GNI-prediction-6may2025.pdf BibTex
titre
An individual-based stochastic model reveals strong constraints on allometric relationships with minimal metabolic and ecological assumptions
auteur
Sylvain Billiard, Virgile Brodu, Nicolas Champagnat, Coralie Fritsch
article
2025
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https://hal.science/hal-04904545/file/An%20individual-based%20model%20for%20allometric%20relationships.pdf BibTex