Publications

Publications HAL du labo/EPI bigs; simba

2024

Journal articles

titre
Deciphering rind color heterogeneity of smear-ripened Munster cheese and its Association with microbiota
auteur
Amandine J. Martin, Anne-Marie Revol-Junelles, Jérémy Petit, Claire Gaiani, Marcia Leyva Salas, Nathan Nourdin, Mohammed Khatbane, Paulo Mafra de Almeida Costa, Sandie Ferrigno, Bruno Ebel, Myriam Schivi, Annelore Elfassy, Cécile Mangavel, Frédéric Borges
article
Foods, 2024, 13 (14), pp.2233. ⟨10.3390/foods13142233⟩
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titre
MultiRNAflow: integrated analysis of temporal RNA-seq data with multiple biological conditions
auteur
Rodolphe Loubaton, Nicolas Champagnat, Pierre Vallois, Laurent Vallat
article
Bioinformatics, 2024, 40 (5), pp.4. ⟨10.1093/bioinformatics/btae315⟩
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https://inria.hal.science/hal-04407596/file/btae315.pdf BibTex
titre
Stochastic modeling of a gene regulatory network driving B cell development in germinal centers
auteur
Alexey Koshkin, Ulysse Herbach, María Rodríguez Martínez, Olivier Gandrillon, Fabien Crauste
article
PLoS ONE, 2024, 19 (3), pp.e0301022. ⟨10.1371/journal.pone.0301022⟩
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https://hal.science/hal-04490302/file/journal.pone.0301022.pdf BibTex
titre
Quasi-stationary behavior for a piecewise deterministic Markov model of chemostat: the Crump-Young model
auteur
Bertrand Cloez, Coralie Fritsch
article
Annales Henri Lebesgue, In press
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https://inria.hal.science/hal-03660678/file/article.pdf BibTex
titre
Stochastic approximation of eigenvectors and eigenvalues of the Q-symmetric expectation of a random matrix
auteur
Jean-Marie Monnez
article
Communications in Statistics – Theory and Methods, 2024, 53 (5), pp.1669-1683. ⟨10.1080/03610926.2022.2107225⟩
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https://hal.science/hal-03956687/file/Online%20estim%20EV%20Q-sym%20matrix%2020220823.pdf BibTex
titre
The Multi-type Bisexual Galton-Watson Branching Process
auteur
Coralie Fritsch, Denis Villemonais, Nicolás Zalduendo
article
Annales de l’Institut Henri Poincaré (B) Probabilités et Statistiques, In press, ⟨10.48550/arXiv.2206.09622⟩
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https://hal.science/hal-03696115/file/Final%20Draft.pdf BibTex
titre
Binary branching processes with Moran type interactions
auteur
Alexander M.G Cox, E Horton, D Villemonais
article
Annales de l’Institut Henri Poincaré (B) Probabilités et Statistiques, In press, ⟨10.48550/arXiv.2207.03323⟩
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https://inria.hal.science/hal-03715678/file/BBMMI_arXiv.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Mechanistic-statistical model for the expansion of ash dieback
auteur
Coralie Fritsch, Marie Grosdidier, Anne Gégout-Petit, Benoit Marçais
article
2024
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https://hal.science/hal-04690647/file/chalarose.pdf BibTex
titre
Stochastic branching models for the telomeres dynamics in a model including telomerase activity
auteur
Athanase Benetos, Coralie Fritsch, Emma Horton, Lionel Lenotre, Simon Toupance, Denis Villemonais
article
2024
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https://hal.science/hal-04648211/file/BranchingTelomere.pdf BibTex
titre
Quasi-stationary distributions in reducible state spaces
auteur
Nicolas Champagnat, Denis Villemonais
article
2024
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https://hal.science/hal-03541248/file/note-reducible_2024_07_09.pdf BibTex
titre
A quasi-stationary approach to the long-term asymptotics of the growth-fragmentation equation
auteur
Denis Villemonais, Alexander Watson
article
2024
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https://hal.science/hal-03588374/file/Growth_frag_26.pdf BibTex
titre
Semi-Lasso: a weighted Lasso designed for the integration of known regressors in linear model
auteur
Nicolas Champagnat, Anne Gégout-Petit, Anouk Rago
article
2024
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https://inria.hal.science/hal-04517255/file/semi-LASSO.pdf BibTex
titre
Quasi-limiting behaviour of the sub-critical Multitype Bisexual Galton-Watson Branching Process
auteur
Coralie Fritsch, Denis Villemonais, Nicolás Zalduendo
article
2024
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https://hal.science/hal-04628438/file/article_QSD_bGWbp.pdf BibTex

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