2020

Journal articles

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Kévin Uguen, Claire Jubin, Yannis Duffourd, Claire Bardel, Valérie Malan, et al.. Genome sequencing in cytogenetics: Comparison of short‐read and linked‐read approaches for germline structural variant detection and characterization. Molecular Genetics & Genomic Medicine, 2020, 8 (3), ⟨10.1002/mgg3.1114⟩. ⟨hal-04383042⟩

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Kévin Uguen, Claire Jubin, Yannis Duffourd, Claire Bardel, Valérie Malan, et al.. Genome sequencing in cytogenetics: Comparison of short‐read and linked‐read approaches for germline structural variant detection and characterization. Molecular Genetics & Genomic Medicine, 2020, pp.1-10. ⟨10.1002/mgg3.1114⟩. ⟨hal-02467795⟩

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2018

Journal articles

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Vinicius Garcia Pinto, Lucas Mello Schnorr, Luka Stanisic, Arnaud Legrand, Samuel Thibault, et al.. A Visual Performance Analysis Framework for Task-based Parallel Applications running on Hybrid Clusters. Concurrency and Computation: Practice and Experience, 2018, 30 (18), pp.1-31. ⟨10.1002/cpe.4472⟩. ⟨hal-01616632v2⟩

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Conference papers

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Vinicius Garcia Pinto, Lucas Mello Schnorr, Arnaud Legrand, Samuel Thibault, Luka Stanisic, et al.. Detecção de Anomalias de Desempenho em Aplicações de Alto Desempenho baseadas em Tarefas em Clusters Híbridos. WPerformance 2018 – 17º Workshop em Desempenho de Sistemas Computacionais e de Comunicação, Jul 2018, Natal, Brazil. pp.1-14. ⟨hal-01842038⟩

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2017

Conference papers

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Benoit Badrignans, Vincent Danjean, Jean-Guillaume Dumas, Philippe Elbaz-Vincent, Sabine Machenaud, et al.. Security Architecture for Point-to-Point Splitting Protocols. WCICSS 2017 – IEEE World Congress on Industrial Control Systems Security, Dec 2017, Cambridge, United Kingdom. ⟨hal-01657605⟩

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Software

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Simon Archipoff, Cédric Augonnet, Olivier Aumage, Guillaume Beauchamp, Bérenger Bramas, et al.. StarPU. 2017, ⟨swh:1:dir:b6e19d99449a78805e7a55a341fbaba2bc431973;origin=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02443512;visit=swh:1:snp:c21d3dfbd96e4fb502c534e59644dba14c542100;anchor=swh:1:rev:31be198773f103324593d26369f135fbde5b97f8;path=/⟩. ⟨hal-01730321v2⟩

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2016

Conference papers

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Vinicius Garcia Pinto, Luka Stanisic, Arnaud Legrand, Lucas Mello Schnorr, Samuel Thibault, et al.. Analyzing Dynamic Task-Based Applications on Hybrid Platforms: An Agile Scripting Approach. VPA 2016 – 3rd Workshop on Visual Performance Analysis, Nov 2016, Salt Lake City, United States. pp.17-24, ⟨10.1109/VPA.2016.008⟩. ⟨hal-01353962v2⟩

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2015

Journal articles

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Joao Vicente Ferreira Lima, Thierry Gautier, Vincent Danjean, Bruno Raffin, Nicolas Maillard. Design and analysis of scheduling strategies for multi-CPU and multi-GPU architectures. Parallel Computing, 2015, 44, pp.37-52. ⟨10.1016/j.parco.2015.03.001⟩. ⟨hal-01132037⟩

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Luka Stanisic, Arnaud Legrand, Vincent Danjean. An Effective Git And Org-Mode Based Workflow For Reproducible Research. Operating Systems Review, 2015, 49, pp.61 – 70. ⟨10.1145/2723872.2723881⟩. ⟨hal-01112795⟩

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2012

Conference papers

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Joao Vicente Ferreira Lima, Thierry Gautier, Nicolas Maillard, Vincent Danjean. Exploiting Concurrent GPU Operations for Efficient Work Stealing on Multi-GPUs. 24rd International Symposium on Computer Architecture and High Performance Computing (SBAC-PAD), Oct 2012, Columbia University, New York, United States. pp.75-82, ⟨10.1109/SBAC-PAD.2012.28⟩. ⟨hal-00735470⟩

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Francois Broquedis, Thierry Gautier, Vincent Danjean. libKOMP, an Efficient OpenMP Runtime System for Both Fork-Join and Data Flow Paradigms. IWOMP, 2012, Rome, Italy. pp.102-115, ⟨10.1007/978-3-642-30961-8_8⟩. ⟨hal-00796253⟩

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2011

Reports

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Fabien Le Mentec, Thierry Gautier, Vincent Danjean. The X-Kaapi’s Application Programming Interface. Part I: Data Flow Programming. [Technical Report] RT-0418, INRIA. 2011, pp.48. ⟨hal-00648245⟩

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Fabien Le Mentec, Vincent Danjean, Thierry Gautier. X-Kaapi C programming interface. [Technical Report] RT-0417, INRIA. 2011, pp.18. ⟨hal-00647474⟩

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2010

Journal articles

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Marc Tchiboukdjian, Vincent Danjean, Bruno Raffin. Binary Mesh Partitioning for Cache-Efficient Visualization. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, 2010, 16 (5), pp.815-828. ⟨hal-00685930⟩

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Conference papers

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Amine Bourki, Guillaume Chaslot, Matthieu Coulm, Vincent Danjean, Hassen Doghmen, et al.. Scalability and Parallelization of Monte-Carlo Tree Search. The International Conference on Computers and Games 2010, Sep 2010, Kanazawa, Japan. ⟨inria-00512854⟩

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Vincent Danjean, Marc Tchiboukdjian, Bruno Raffin. Cache-Efficient Parallel Isosurface Extraction. Eurographics 2010 Symposium on Parallel Graphics and Visualization (EGPGV’10), 2010, Norrköping, Unknown Region. ⟨hal-01856369⟩

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Marc Tchiboukdjian, Vincent Danjean, Thierry Gautier, Fabien Le Mentec, Bruno Raffin. A Work Stealing Algorithm for Parallel Loops on Shared Cache Multicores. EGPGV’10 – Eurographics 2010 Symposium on Parallel Graphics and Visualization, 2010, Norrköping, Norway. ⟨hal-00685934⟩

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Marc Tchiboukdjian, Vincent Danjean, Bruno Raffin. Cache-Efficient Parallel Isosurface Extraction for Shared Cache Multicores. Eurographics 2010 Symposium on Parallel Graphics and Visualization (EGPGV’10), 2010, Norrköping, Sweden. ⟨hal-00798445⟩

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Book sections

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Vincent Danjean. Corrigé du concours Informatique MP 2010 de l’École Polytechnique. Mathématiques et Informatique MP : Corrigés des concours 2010 Polytechnique, Mines-Ponts, Centrale-Supélec, CCP, H&K, pp.304, 2010, 978-2-35141-061-5. ⟨hal-01121832⟩

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Reports

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Marc Tchiboukdjian, Vincent Danjean, Thierry Gautier, Fabien Le Mentec, Bruno Raffin. Adaptive Algorithms for Shared Cache on Multicore. [Research Report] RR-7256, INRIA. 2010, pp.17. ⟨inria-00473617⟩

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2009

Journal articles

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Claire Bardel, Vincent Danjean, Pierre-Emmanuel Morange, Emmanuelle Génin, Pierre Darlu. On the Use of Phylogeny-Based Tests to Detect Association between Quantitative Traits and Haplotypes. Genetic Epidemiology, 2009, 33 (8), pp.729-739. ⟨10.1002/gepi.20425⟩. ⟨hal-00800411⟩

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Conference papers

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Vincent Danjean, Thierry Gautier. Utilisation des grilles pour le calcul scientifique. Congrès National de Mathématiques Appliquées et Industrielles (SMAI 2009), 2009, La Colle sur Loup, Alpes Maritimes, France, France. ⟨hal-00800431⟩

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Book sections

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Vincent Danjean. Corrigé du concours Informatique MP 2009 de l’École Polytechnique. MP, Mathématiques et Informatique, Polytechnique, Mines/Ponts, Centrale/Supélec, CCP : Annales corrigées, Concours 2009, H&K, pp.312, 2009. ⟨hal-01121848⟩

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Reports

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Marc Tchiboukdjian, Vincent Danjean, Bruno Raffin. Binary Mesh Partitioning for Cache-Efficient Processing. [Research Report] RR-7118, INRIA. 2009. ⟨inria-00436052⟩

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2008

Conference papers

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Marc Tchiboukdjian, Vincent Danjean, Bruno Raffin. A Fast Cache-Oblivious Mesh Layout with Theoretical Guarantees. International Workshop on Super Visualization (IWSV’08), Jun 2008, Kos, Greece. ⟨inria-00436053⟩

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Book sections

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Vincent Danjean. Corrigé du concours Informatique MP 2008 de l’École Polytechnique. Mathématiques et informatique MP : Corrigés des concours 2008 Polytechnique, Mines-Ponts, Centrale-Supélec, CCP, H&K, pp.320, 2008. ⟨hal-01121861⟩

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Vincent Danjean. Autour de la suite de Fibonacci. Un calcul de PPCM. Concours Commun Centrale-Supélec MP/PC : Tome 1, 2005-2007 (Mathématiques, Informatique, Physique et Chimie), 1, H&K, pp.974, 2008, Tome 1, 978-2-35141-029-5. ⟨hal-01121809⟩

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2007

Book sections

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Vincent Danjean. Corrigé du concours Informatique MP 2007 de l’École Centrale. Mathématiques et informatique MP : Corrigés des concours 2007 Polytechnique, Mines-Ponts, Centrale-Supélec, CCP, H&K, pp.288, 2007, 978-2-35141-020-2. ⟨hal-01121864⟩

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2006

Conference papers

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Van-Dat Cung, Vincent Danjean, Jean-Guillaume Dumas, Thierry Gautier, Guillaume Huard, et al.. Adaptive and Hybrid Algorithms: classification and illustration on triangular system solving. Transgressive Computing 2006, Apr 2006, Grenade, Spain. pp.131-148. ⟨hal-00318540⟩

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2005

Journal articles

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Claire Bardel, Vincent Danjean, Jean-Pierre Hugot, Pierre Darlu, Emmanuelle Génin. On the use of haplotype phylogeny to detect disease susceptibility loci.. BMC Genetics, 2005, 6, pp.24. ⟨10.1186/1471-2156-6-24⟩. ⟨inserm-00090521⟩

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Pierre-André Wacrenier, Vincent Danjean. Mécanismes de traces efficaces pour programmes multithreadés. Revue des Sciences et Technologies de l’Information – Série TSI : Technique et Science Informatiques, 2005, 24, pp.525–545. ⟨hal-00301499⟩

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Conference papers

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Vincent Danjean, Raymond Namyst, Pierre-André Wacrenier. An Efficient Multi-level Trace Toolkit for Multi-threaded Applications. Euro-Par 2005 Parallel Processing, Aug 2005, Lisbon, Portugal. pp.166-175, ⟨10.1007/11549468_21⟩. ⟨hal-00360309⟩

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Reports

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Vincent Danjean, Pierre-André Wacrenier, Raymond Namyst. An Efficient Multi-level Trace Toolkit for Multi-threaded Applications. [Research Report] RR-5513, INRIA. 2005, pp.12. ⟨inria-00070493⟩

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2004

Theses

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Vincent Danjean. Contribution à l’élaboration d’ordonnanceurs de processus légers performants et portables pour architectures multiprocesseurs. Réseaux et télécommunications [cs.NI]. Ecole normale supérieure de lyon – ENS LYON, 2004. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00009541⟩

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2002

Reports

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Luc Bougé, Vincent Danjean, Raymond Namyst. Improving Reactivity to I/O Events in Multithreaded Environments Using a Uniform, Scheduler-Centric API. [Research Report] RR-4471, INRIA. 2002. ⟨inria-00072117⟩

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2000

Reports

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Vincent Danjean. Linux Activations : un support système performant pour les applications de calcul multithreads. [Research Report] LIP RR-2000-14, Laboratoire de l’informatique du parallélisme. 2000, 2+9p. ⟨hal-02101929⟩

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