2024
Journal articles
- titre
- Metrics reloaded: recommendations for image analysis validation
- auteur
- Lena Maier-Hein, Annika Reinke, Patrick Godau, Minu Tizabi, Florian Buettner, Evangelia Christodoulou, Ben Glocker, Fabian Isensee, Jens Kleesiek, Michal Kozubek, Mauricio Reyes, Michael Riegler, Manuel Wiesenfarth, A Emre Kavur, Carole Sudre, Michael Baumgartner, Matthias Eisenmann, Doreen Heckmann-Nötzel, Tim Rädsch, Laura Acion, Michela Antonelli, Tal Arbel, Spyridon Bakas, Arriel Benis, Matthew Blaschko, M Jorge Cardoso, Veronika Cheplygina, Beth Cimini, Gary Collins, Keyvan Farahani, Luciana Ferrer, Adrian Galdran, Bram van Ginneken, Robert Haase, Daniel Hashimoto, Michael Hoffman, Merel Huisman, Pierre Jannin, Charles Kahn, Dagmar Kainmueller, Bernhard Kainz, Alexandros Karargyris, Alan Karthikesalingam, Florian Kofler, Annette Kopp-Schneider, Anna Kreshuk, Tahsin Kurc, Bennett Landman, Geert Litjens, Amin Madani, Klaus Maier-Hein, Anne Martel, Peter Mattson, Erik Meijering, Bjoern Menze, Karel Moons, Henning Müller, Brennan Nichyporuk, Felix Nickel, Jens Petersen, Nasir Rajpoot, Nicola Rieke, Julio Saez-Rodriguez, Clara Sánchez, Shravya Shetty, Maarten van Smeden, Ronald Summers, Abdel Taha, Aleksei Tiulpin, Sotirios Tsaftaris, Ben van Calster, Gaël Varoquaux, Paul Jäger
- article
- Nature Methods, 2024, 21 (2), pp.195-212. ⟨10.1038/s41592-023-02151-z⟩
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-
- titre
- Understanding metric-related pitfalls in image analysis validation
- auteur
- Annika Reinke, Minu D. Tizabi, Michael Baumgartner, Matthias Eisenmann, Doreen Heckmann-Nötzel, A. Emre Kavur, Tim Rädsch, Carole H. Sudre, Laura Acion, Michela Antonelli, Tal Arbel, Spyridon Bakas, Arriel Benis, Matthew Blaschko, Florian Buettner, M. Jorge Cardoso, Veronika Cheplygina, Jianxu Chen, Evangelia Christodoulou, Beth A. Cimini, Gary S. Collins, Keyvan Farahani, Luciana Ferrer, Adrian Galdran, Bram van Ginneken, Ben Glocker, Patrick Godau, Robert Haase, Daniel A. Hashimoto, Michael M. Hoffman, Merel Huisman, Fabian Isensee, Pierre Jannin, Charles E. Kahn, Dagmar Kainmueller, Bernhard Kainz, Alexandros Karargyris, Alan Karthikesalingam, Hannes Kenngott, Jens Kleesiek, Florian Kofler, Thijs Kooi, Annette Kopp-Schneider, Michal Kozubek, Anna Kreshuk, Tahsin Kurc, Bennett A. Landman, Geert Litjens, Amin Madani, Klaus Maier-Hein, Anne L. Martel, Peter Mattson, Erik Meijering, Bjoern Menze, Karel G. M. Moons, Henning Müller, Brennan Nichyporuk, Felix Nickel, Jens Petersen, Susanne M. Rafelski, Nasir Rajpoot, Mauricio Reyes, Michael A. Riegler, Nicola Rieke, Julio Saez-Rodriguez, Clara I. Sánchez, Shravya Shetty, Ronald M. Summers, Abdel A. Taha, Aleksei Tiulpin, Sotirios A. Tsaftaris, Ben van Calster, Gaël Varoquaux, Ziv R. Yaniv, Paul F. Jäger, Lena Maier-Hein
- article
- Nature Methods, 2024, 21, pp.182-194. ⟨10.1038/s41592-023-02150-0⟩
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-
- titre
- Causal inference methods for combining randomized trials and observational studies: a review
- auteur
- Bénédicte Colnet, Imke Mayer, Guanhua Chen, Awa Dieng, Ruohong Li, Gaël Varoquaux, Jean-Philippe Vert, Julie Josse, Shu Yang
- article
- Statistical Science, In press
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- On the consistency of supervised learning with missing values
- auteur
- Julie Josse, Jacob M. Chen, Nicolas Prost, Erwan Scornet, Gaël Varoquaux
- article
- 2024
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-
2023
Journal articles
- titre
- Fourier representation of the diffusion MRI signal using layer potentials
- auteur
- Chengran Fang, Demian Wassermann, Jing-Rebecca Li
- article
- SIAM Journal on Applied Mathematics, 2023, 83 (1), pp.99-121. ⟨10.1137/21M1439572⟩
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-
- titre
- Cerebral autoregulation and cerebral blood flow response to mean arterial pressure challenge following induction of general anaesthesia for neuroradiology procedure
- auteur
- Elsa Manquat, Hugues Ravaux, Jihane Souilamas, Thibaut Chamoux, Jona Joaquim, Etienne Gayat, Fabrice Vallée, Jérôme Cartailler
- article
- Frontiers in Anesthesiology, 2023, 2, pp.1169961. ⟨10.3389/fanes.2023.1169961⟩
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-
Conference papers
- titre
- False Discovery Proportion control for aggregated Knockoffs
- auteur
- Alexandre Blain, Bertrand Thirion, Olivier Grisel, Pierre Neuvial
- article
- NeurIPS 2023 – 37th Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2023, New Orleans, United States. ⟨10.48550/arXiv.2310.10373⟩
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-
- titre
- GLADIS: A General and Large Acronym Disambiguation Benchmark
- auteur
- Lihu Chen, Gaël Varoquaux, Fabian M. Suchanek
- article
- EACL 2023 – The 17th Conference of the European Chapter of the Association for Computational Linguistics, May 2023, Dubrovnik, Croatia
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-
- titre
- Denoising of FMRI volumes using local low rank methods
- auteur
- Pierre-Antoine Comby, Zaineb Amor, Alexandre Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- ISBI 2023 – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2023, Carthagena de India, Colombia. pp.1-5, ⟨10.1109/ISBI53787.2023.10230489⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Aligning individual brains with Fused Unbalanced Gromov-Wasserstein
- auteur
- Alexis Thual, Huy Tran, Tatiana Zemskova, Nicolas Courty, Rémi Flamary, Stanislas Dehaene, Bertrand Thirion
- article
- 2023
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-
2022
Journal articles
- titre
- Comprehensive decoding mental processes from Web repositories of functional brain images
- auteur
- Romuald Menuet, Raphael Meudec, Jérôme Dockès, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- Scientific Reports, 2022, 12 (7050), ⟨10.1038/s41598-022-10710-1⟩
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-
- titre
- Wavelets in the deep learning era
- auteur
- Zaccharie Ramzi, Kevin Michalewicz, Jean-Luc Starck, Thomas Moreau, Philippe Ciuciu
- article
- Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2022, 65, ⟨10.1007/s10851-022-01123-w⟩
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-
- titre
- Deep language algorithms predict semantic comprehension from brain activity
- auteur
- Charlotte Caucheteux, Alexandre Gramfort, Jean-Rémi King
- article
- Scientific Reports, 2022, ⟨10.1038/s41598-022-20460-9⟩
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-
- titre
- Iterative static $\Delta$B0 field map estimation for off-resonance correction in non-Cartesian susceptibility weighted imaging
- auteur
- Guillaume Daval-Frérot, Aurélien Massire, Boris Mailhé, Mariappan Nadar, Alexandre Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- Magnetic Resonance in Medicine, In press, 88 (4), pp.1592-1607. ⟨10.1002/mrm.29297⟩
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-
- titre
- Inverting brain grey matter models with likelihood-free inference: a tool for trustable cytoarchitecture measurements
- auteur
- Maëliss Jallais, Pedro Luiz Coelho Rodrigues, Alexandre Gramfort, Demian Wassermann
- article
- Journal of Machine Learning for Biomedical Imaging, 2022, pp.1-27. ⟨10.48550/arXiv.2111.08693⟩
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-
- titre
- Robust learning from corrupted EEG with dynamic spatial filtering
- auteur
- Hubert Banville, Sean U N Wood, Chris Aimone, Denis-Alexander Engemann, Alexandre Gramfort
- article
- NeuroImage, 2022, 251, pp.118994. ⟨10.1016/j.neuroimage.2022.118994⟩
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-
- titre
- Implicit differentiation for fast hyperparameter selection in non-smooth convex learning
- auteur
- Quentin Bertrand, Quentin Klopfenstein, Mathurin Massias, Mathieu Blondel, Samuel Vaiter, Alexandre Gramfort, Joseph Salmon
- article
- Journal of Machine Learning Research, 2022, 23 (149), pp.1-48
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-
- titre
- ICU Bed Availability Monitoring and analysis in the Grand Est region of France during the COVID-19 epidemic
- auteur
- Consortium Icubam, Laurent Bonnasse-Gahot, Maxime Dénès, Gabriel Dulac-Arnold, Sertan Girgin, François Husson, Valentin Iovene, Julie Josse, Antoine Kimmoun, François Landes, Jean-Pierre Nadal, Romain Primet, Frederico Quintao, Pierre Guillaume Raverdy, Vincent Rouvreau, Olivier Teboul, Roman Yurchak
- article
- Statistique et Société, 2022, ⟨10.1101/2020.05.18.20091264⟩
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-
- titre
- How to remove or control confounds in predictive models, with applications to brain biomarkers
- auteur
- Darya Chyzhyk, Gaël Varoquaux, Michael Milham, Bertrand Thirion
- article
- GigaScience, 2022, 11, ⟨10.1093/gigascience/giac014⟩
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-
- titre
- Brains and algorithms partially converge in natural language processing
- auteur
- Charlotte Caucheteux, Jean-Rémi King
- article
- Communications Biology, 2022, ⟨10.1038/s42003-022-03036-1⟩
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-
- titre
- A unified view on beamformers for M/EEG source reconstruction
- auteur
- Britta Westner, Sarang Dalal, Alexandre Gramfort, Vladimir Litvak, John Mosher, Robert Oostenveld, Jan-Mathijs Schoffelen
- article
- NeuroImage, 2022, 246, pp.118789. ⟨10.1016/j.neuroimage.2021.118789⟩
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-
- titre
- NC-PDNet: a Density-Compensated Unrolled Network for 2D and 3D non-Cartesian MRI Reconstruction
- auteur
- Zaccharie Ramzi, Chaithya Giliyar Radhakrishna, Jean-Luc Starck, Philippe Ciuciu
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2022, ⟨10.1109/TMI.2022.3144619⟩
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-
- titre
- Iterative static ∆B0 field map estimation for off-resonance correction in non-Cartesian susceptibility weighted imaging
- auteur
- Guillaume Daval-Frérot, Aurélien Massire, Boris Mailhé, Mariappan S. Nadar, Alexandre Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- Magnetic Resonance in Medicine, In press
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-
- titre
- Scalable Query Answering under Uncertainty to Neuroscientific Ontological Knowledge: The NeuroLang Approach
- auteur
- Gaston E Zanitti, Yamil Soto, Valentin Iovene, Maria Vanina Martinez, Ricardo O Rodriguez, Gerardo I Simari, Demian Wassermann
- article
- Neuroinformatics, 2022, ⟨10.3389/fninf.2014.00014⟩
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-
- titre
- Foundational number sense training gains are predicted by hippocampal–parietal circuits
- auteur
- Hyesang Chang, Lang Chen, Yuan Zhang, Ye Xie, Carlo de Los Angeles, Emma Adair, Gaston Zanitti, Demian Wassermann, Miriam Rosenberg-Lee, Vinod Menon
- article
- Journal of Neuroscience, 2022, 42 (19), pp.JN-RM-1005-21. ⟨10.1523/JNEUROSCI.1005-21.2022⟩
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-
- titre
- Notip: Non-parametric True Discovery Proportion control for brain imaging
- auteur
- Alexandre Blain, Bertrand Thirion, Pierre Neuvial
- article
- NeuroImage, 2022, 260, pp.119492. ⟨10.1016/j.neuroimage.2022.119492⟩
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-
- titre
- Meta-Analysis of the Functional Neuroimaging Literature with Probabilistic Logic Programming
- auteur
- Majd Abdallah, Valentin Iovene, Gaston Zanitti, Demian Wassermann
- article
- Scientific Reports, 2022, ⟨10.1038/s41598-022-21801-4⟩
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-
- titre
- Benchmarking missing-values approaches for predictive models on health databases
- auteur
- Alexandre Perez-Lebel, Gaël Varoquaux, Marine Le Morvan, Julie Josse, Jean-Baptiste Poline
- article
- GigaScience, In press, ⟨10.1093/gigascience/giac013⟩
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-
- titre
- Functional gradients in the human lateral prefrontal cortex revealed by a comprehensive coordinate-based meta-analysis
- auteur
- Majd Abdallah, Gaston Zanitti, Valentin Iovene, Demian Wassermann
- article
- eLife, In press, ⟨10.7554/eLife.76926⟩
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-
Conference papers
- titre
- Toward a realistic model of speech processing in the brain with self-supervised learning
- auteur
- Juliette Millet, Charlotte Caucheteux, Pierre Orhan, Yves Boubenec, Alexandre Gramfort, Christophe C Pallier, Ewan Dunbar, Jean-Rémi King
- article
- NeurIPS 2022 – 36th Conference on Neural Information Processing Systems, Nov 2022, New Orleans, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Aligning individual brains with Fused Unbalanced Gromov-Wasserstein
- auteur
- Alexis Thual, Huy Tran, Tatiana Zemskova, Nicolas Courty, Rémi Flamary, Stanislas Dehaene, Bertrand Thirion
- article
- NeurIPS 2022 – Conference on Neural Information Processing Systems, Nov 2022, New-Orlean, France
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-
- titre
- Wrong HAL Entry
- auteur
- Juliette Millet, Charlotte Caucheteux, Pierre Orhan, Yves Boubenec, Alexandre Gramfort, Jean-Rémi King, Ewan Dunbar, Christophe C Pallier
- article
- NeurIPS 2022 – Thirty-sixth Conference on Neural Information Processing Systems, Nov 2022, New Orleans, United States
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-
- titre
- Neural Language Models are not Born Equal to Fit Brain Data, but Training Helps
- auteur
- Alexandre Pasquiou, Yair Lakretz, John Hale, Bertrand Thirion, Christophe Pallier
- article
- ICML 2022 – 39th International Conference on Machine Learning, Jul 2022, Baltimore, United States. pp.18
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-
- titre
- Recent advances in electron tomography and applications in the semiconductor Industry
- auteur
- Zineb Saghi, Guillaume Biagi, Martin Jacob, Philippe Ciuciu
- article
- FCMN 2022 – International Conference on Frontiers of Characterization and Metrology for Nanoelectronics, Jun 2022, Monterey, United States
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-
- titre
- Towards Heterogeneous Data Integration: The NeuroLang Approach
- auteur
- Gastón E Zanitti, Majd Abdallah, Demian Wassermann
- article
- OHBM 2022 – Organization for Human Brain Mapping, Jun 2022, Glasgow, United Kingdom
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-
- titre
- MORE-SPARKLING: non-cartesian trajectories with minimized off-resonance effects
- auteur
- Chaithya Giliyar Radhakrishna, Guillaume Daval-Frérot, Aurélien Massire, Boris Mailhé, Mariappan Nadar, Alexandre Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- Joint Annual Meeting ISMRM-ESMRMB & ISMRT 31st Annual Meeting, May 2022, London, United Kingdom
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Understanding approximate and unrolled dictionary learning for pattern recovery
- auteur
- Benoît Malézieux, Thomas Moreau, Matthieu Kowalski
- article
- International Conference on Learning Representations, Apr 2022, Online, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- DriPP: Driven point processes to model stimuli induced patterns in M/EEG signals
- auteur
- Cédric Allain, Alexandre Gramfort, Thomas Moreau
- article
- ICLR 2022 – 10th International Conference on Learning Representations, Apr 2022, online, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- SHINE: SHaring the INverse Estimate from the forward pass for bi-level optimization and implicit models
- auteur
- Zaccharie Ramzi, Florian Mannel, Shaojie Bai, Jean-Luc Starck, Philippe Ciuciu, Thomas Moreau
- article
- ICLR 2022 – International Conference on Learning Representations, Apr 2022, Virtual, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- ADAVI: Automatic Dual Amortized Variational Inference Applied To Pyramidal Bayesian Models
- auteur
- Louis Rouillard, Demian Wassermann
- article
- ICLR 2022, Apr 2022, Virtual, France. ⟨10.48550/arXiv.2106.12248⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- MC-PDNET: Deep unrolled neural network for multi-contrast mr image reconstruction from undersampled k-space data
- auteur
- Kumari Pooja, Zaccharie Ramzi, Chaithya Giliyar Radhakrishna, Philippe Ciuciu
- article
- ISBI 2022 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2022, IEEE, Mar 2022, Kolkata, India
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Poster communications
- titre
- Benchmarking learned non-Cartesian k-space trajectories and reconstruction networks
- auteur
- Chaithya Giliyar Radhakrishna, Philippe Ciuciu
- article
- Joint Annual Meeting ISMRM-ESMRMB & ISMRT 31st Annual Meeting, May 2022, London, United Kingdom
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Theses
- titre
- Advanced deep neural networks for MRI image reconstruction from highly undersampled data in challenging acquisition settings
- auteur
- Zaccharie Ramzi
- article
- Medical Imaging. Université Paris-Saclay, 2022. English. ⟨NNT : 2022UPAST025⟩
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-
- titre
- Enabling cortical cell-specific sensitivity on diffusion MRI microstructure measurements using likelihood-free inference
- auteur
- Maëliss Jallais
- article
- Medical Imaging. Université Paris-Saclay, 2022. English. ⟨NNT : 2022UPASG012⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Enabling real-world EEG applications with deep learning
- auteur
- Hubert Banville
- article
- Artificial Intelligence [cs.AI]. Université Paris-Saclay, 2022. English. ⟨NNT : 2022UPASG005⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Decoding speech from non-invasive brain recordings
- auteur
- Alexandre Défossez, Charlotte Caucheteux, Jeremy Rapin, Ori Kabeli, Jean-Rémi King
- article
- 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Emergence of β and γ networks following multisensory training
- auteur
- Daria La Rocca, Philippe Ciuciu, Denis Engemann, Virginie van Wassenhove
- article
- 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Repurposing EEG monitoring of general anaesthesia for building biomarkers of brain ageing: An exploratory study
- auteur
- David Sabbagh, Jérôme Cartailler, Cyril Touchard, Jona Joachim, Alexandre Mebazaa, Fabrice Vallée, Étienne Gayat, Alexandre Gramfort, Denis Engemann
- article
- 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2021
Journal articles
- titre
- Multivariate semi-blind deconvolution of fMRI time series
- auteur
- Hamza Cherkaoui, Thomas Moreau, Abderrahim Halimi, Claire Leroy, Philippe Ciuciu
- article
- NeuroImage, 2021, ⟨10.1016/j.neuroimage.2021.118418⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Numerical uncertainty in analytical pipelines lead to impactful variability in brain networks
- auteur
- Gregory Kiar, Yohan Chatelain, Pablo de Oliveira Castro, Eric Petit, Ariel Rokem, Gaël Varoquaux, Bratislav Misic, Alan Evans, Tristan Glatard
- article
- PLoS ONE, 2021, 16 (11), pp.e0250755. ⟨10.1371/journal.pone.0250755⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An empirical evaluation of functional alignment using inter-subject decoding
- auteur
- Thomas Bazeille, Elizabeth Dupre, Hugo Richard, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- NeuroImage, 2021, 245, ⟨10.1016/j.neuroimage.2021.118683⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dexamethasone Use and Mortality in Hospitalized Patients with Coronavirus Disease 2019: a Multicenter Retrospective Observational Study
- auteur
- Nicolas Hoertel, Marina Sánchez-Rico, Raphaël Vernet, Nathanaël Beeker, Antoine Neuraz, Jesús M Alvarado, Christel Daniel, Nicolas Paris, Alexandre Gramfort, Guillaume Lemaitre, Elisa Salamanca, Mélodie Bernaux, Ali Bellamine, Anita Burgun, Frédéric Limosin
- article
- British Journal of Clinical Pharmacology, 2021, 87 (10), pp.3766-3775. ⟨10.1111/bcp.14784⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Clinical Characteristics, Care Trajectories and Mortality Rate of SARS-CoV-2 Infected Cancer Patients: A Multicenter Cohort Study
- auteur
- Marc-Antoine Benderra, Ainhoa Aparicio, Judith Leblanc, Demian Wassermann, Emmanuelle Kempf, Gilles Galula, Mélodie Bernaux, Anthony Canellas, Thomas Moreau, Ali Bellamine, Jean-Philippe Spano, Christel Daniel, Julien Champ, Florence Canouï-Poitrine, Joseph Gligorov
- article
- Cancers, 2021, 13 (19), pp.4749. ⟨10.3390/cancers13194749⟩
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-
- titre
- Response to Letter to the Editor from Woolcott and Castilla-Bancayán: “Diabetes Increases Severe COVID-19 Outcomes Primarily in Younger Adults”
- auteur
- Marc Diedisheim, Etienne Dancoisne, Jean-François Gautier, Etienne Larger, Emmanuel Cosson, Bruno Fève, Philippe Chanson, Sébastien Czernichow, Sopio Tatulashvili, Marie-Laure Raffin-Sanson, Kankoé Sallah, Muriel Bourgeon, Christiane Ajzenberg, Agnès Hartemann, Christel Daniel, Thomas Moreau, Ronan Roussel, Louis Potier
- article
- Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, 2021, ⟨10.1210/clinem/dgab583⟩
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-
- titre
- From deep brain phenotyping to functional atlasing
- auteur
- Bertrand Thirion, Alexis Thual, Ana Luísa Pinho
- article
- Current Opinion in Behavioral Sciences, 2021, 40, pp.201-212. ⟨10.1016/j.cobeha.2021.05.004⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Tissue outcome prediction in hyperacute ischemic stroke: Comparison of machine learning models
- auteur
- Joseph Benzakoun, Sylvain Charron, Guillaume Turc, Wagih Ben Hassen, Laurence Legrand, Grégoire Boulouis, Olivier Naggara, Jean-Claude Baron, Bertrand Thirion, Catherine Oppenheim
- article
- Journal of Cerebral Blood Flow and Metabolism, 2021, pp.0271678X2110243. ⟨10.1177/0271678X211024371⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Diabetes increases severe COVID-19 outcomes primarily in younger adults Age and diabetes in COVID-19 severity
- auteur
- Marc Diedisheim, Etienne Dancoisne, Jean-François Gautier, Etienne Larger, Emmanuel Cosson, Bruno Fève, Philippe Chanson, Sébastien Czernichow, Sopio Tatulashvili, Marie-Laure Raffin-Sanson, Muriel Bourgeon, Christiane Ajzenberg, Agnès Hartemann, Christel Daniel, Thomas Moreau, Ronan Roussel, Louis Potier
- article
- Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, 2021, 106 (9), pp.E3364-E3368. ⟨10.1210/clinem/dgab393⟩
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-
- titre
- Gradient-based and wavelet-based compressed sensing approaches for highly undersampled tomographic datasets
- auteur
- Martin Jacob, Loubna El Gueddari, Jyh-Miin Lin, Gabriele Navarro, Audrey Jannaud, Guido Mula, Pascale Bayle-Guillemaud, Philippe Ciuciu, Zineb Saghi
- article
- Ultramicroscopy, 2021, 225, pp.113289. ⟨10.1016/j.ultramic.2021.113289⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Extracting representations of cognition across neuroimaging studies improves brain decoding
- auteur
- Arthur Mensch, Julien Mairal, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- PLoS Computational Biology, 2021, 17 (5), pp.e1008795:1-20. ⟨10.1371/journal.pcbi.1008795⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Spectral independent component analysis with noise modeling for M/EEG source separation
- auteur
- Pierre Ablin, Jean-François Cardoso, Alexandre Gramfort
- article
- Journal of Neuroscience Methods, 2021, 356, ⟨10.1016/j.jneumeth.2021.109144⟩
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-
- titre
- Functional annotation of human cognitive states using deep graph convolution
- auteur
- Yu Zhang, Loïc Tetrel, Bertrand Thirion, Pierre Bellec
- article
- NeuroImage, 2021, 231, pp.117847. ⟨10.1016/j.neuroimage.2021.117847⟩
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-
- titre
- POT : Python Optimal Transport
- auteur
- Rémi Flamary, Nicolas Courty, Alexandre Gramfort, Mokhtar Zahdi Alaya, Aurélie Boisbunon, Stanislas Chambon, Laetitia Chapel, Adrien Corenflos, Kilian Fatras, Nemo Fournier, Léo Gautheron, Nathalie T H Gayraud, Hicham Janati, Alain Rakotomamonjy, Ievgen Redko, Antoine Rolet, Antony Schutz, Vivien Seguy, Danica J Sutherland, Romain Tavenard, Alexander Tong, Titouan Vayer
- article
- Journal of Machine Learning Research, 2021
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Brainhack: Developing a culture of open, inclusive, community-driven neuroscience
- auteur
- Rémi Gau, Stephanie Noble, Katja Heuer, Katherine Bottenhorn, Isil Bilgin, Yu-Fang Yang, Julia Huntenburg, Johanna M.M. Bayer, Richard A.I. Bethlehem, Shawn Rhoads, Christoph Vogelbacher, Valentina Borghesani, Elizabeth Levitis, Hao-Ting Wang, Sofie van den Bossche, Xenia Kobeleva, Jon Haitz Legarreta, Samuel Guay, Selim Melvin Atay, Gael Varoquaux, Dorien Huijser, Malin Sandström, Peer Herholz, Samuel Nastase, Amanpreet Badhwar, Guillaume Dumas, Simon Schwab, Stefano Moia, Michael Dayan, Yasmine Bassil, Paula Brooks, Matteo Mancini, James Shine, David O’connor, Xihe Xie, Davide Poggiali, Patrick Friedrich, Anibal Heinsfeld, Lydia Riedl, Roberto Toro, César Caballero-Gaudes, Anders Eklund, Kelly Garner, Christopher Nolan, Damion Demeter, Fernando Barrios, Junaid Merchant, Elizabeth Mcdevitt, Robert Oostenveld, R. Cameron Craddock, Ariel Rokem, Andrew Doyle, Satrajit Ghosh, Aki Nikolaidis, Olivia Stanley, Eneko Uruñuela, Nasim Anousheh, Aurina Arnatkeviciute, Guillaume Auzias, Dipankar Bachar, Elise Bannier, Ruggero Basanisi, Arshitha Basavaraj, Marco Bedini, Pierre Bellec, R. Austin Benn, Kathryn Berluti, Steffen Bollmann, Saskia Bollmann, Claire Bradley, Jesse Brown, Augusto Buchweitz, Patrick Callahan, Micaela Chan, Bramsh Chandio, Theresa Cheng, Sidhant Chopra, Ai Wern Chung, Thomas Close, Etienne Combrisson, Giorgia Cona, R. Todd Constable, Claire Cury, Kamalaker Dadi, Pablo Damasceno, Samir Das, Fabrizio de Vico Fallani, Krista Destasio, Erin Dickie, Lena Dorfschmidt, Eugene Duff, Elizabeth Dupre, Sarah Dziura, Nathalia Esper, Oscar Esteban, Shreyas Fadnavis, Guillaume Flandin, Jessica Flannery, John Flournoy, Stephanie Forkel, Alexandre Franco, Saampras Ganesan, Siyuan Gao, José García Alanis, Eleftherios Garyfallidis, Tristan Glatard, Enrico Glerean, Javier Gonzalez-Castillo, Cassandra Gould van Praag, Abigail Greene, Geetika Gupta, Catherine Alice Hahn, Yaroslav Halchenko, Daniel Handwerker, Thomas Hartmann, Valérie Hayot-Sasson, Stephan Heunis, Felix Hoffstaedter, Daniela Hohmann, Corey Horien, Horea-Ioan Ioanas, Alexandru Iordan, Chao Jiang, Michael Joseph, Jason Kai, Agah Karakuzu, David Kennedy, Anisha Keshavan, Ali Khan, Gregory Kiar, P. Christiaan Klink, Vincent Koppelmans, Serge Koudoro, Angela Laird, Georg Langs, Marissa Laws, Roxane Licandro, Sook-Lei Liew, Tomislav Lipic, Krisanne Litinas, Daniel Lurie, Désirée Lussier, Christopher Madan, Lea-Theresa Mais, Sina Mansour L, Jose Pedro Manzano-Patron, Dimitra Maoutsa, Matheus Marcon, Daniel Margulies, Giorgio Marinato, Daniele Marinazzo, Christopher Markiewicz, Camille Maumet, Felipe Meneguzzi, David Meunier, Michael Milham, Kathryn Mills, Davide Momi, Clara Moreau, Aysha Motala, Iska Moxon-Emre, Thomas Nichols, Dylan Nielson, Gustav Nilsonne, Lisa Novello, Caroline O’brien, Emily Olafson, Lindsay Oliver, John Onofrey, Edwina Orchard, Kendra Oudyk, Patrick Park, Mahboobeh Parsapoor, Lorenzo Pasquini, Scott Peltier, Cyril Pernet, Rudolph Pienaar, Pedro Pinheiro-Chagas, Jean-Baptiste Poline, Anqi Qiu, Tiago Quendera, Laura Rice, Joscelin Rocha-Hidalgo, Saige Rutherford, Mathias Scharinger, Dustin Scheinost, Deena Shariq, Thomas Shaw, Viviana Siless, Molly Simmonite, Nikoloz Sirmpilatze, Hayli Spence, Julia Sprenger, Andrija Stajduhar, Martin Szinte, Sylvain Takerkart, Angela Tam, Link Tejavibulya, Michel Thiebaut de Schotten, Ina Thome, Laura Tomaz da Silva, Nicolas Traut, Lucina Uddin, Antonino Vallesi, John Vanmeter, Nandita Vijayakumar, Matteo Visconti Di Oleggio Castello, Jakub Vohryzek, Jakša Vukojević, Kirstie Jane Whitaker, Lucy Whitmore, Steve Wideman, Suzanne Witt, Hua Xie, Ting Xu, Chao-Gan Yan, Fang-Cheng Yeh, B.T. Thomas Yeo, Xi-Nian Zuo
- article
- Neuron, 2021, 109 (11), pp.1769-1775. ⟨10.1016/j.neuron.2021.04.001⟩
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-
- titre
- Uncovering the structure of clinical EEG signals with self-supervised learning
- auteur
- Hubert Banville, Omar Chehab, Aapo Hyvärinen, Denis-Alexander Engemann, Alexandre Gramfort
- article
- Journal of Neural Engineering, 2021, 18 (4), ⟨10.1088/1741-2552/abca18⟩
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-
- titre
- Calibration-Less Multi-Coil Compressed Sensing Magnetic Resonance Image Reconstruction Based on OSCAR Regularization
- auteur
- Loubna El Gueddari, Chaithya Giliyar Radhakrishna, Emilie Chouzenoux, Philippe Ciuciu
- article
- Journal of Imaging, 2021, 7 (3), pp.58. ⟨10.3390/jimaging7030058⟩
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-
- titre
- Decoding with Confidence: Statistical Control on Decoder Maps
- auteur
- Jérôme-Alexis Chevalier, Tuan-Binh Nguyen, Joseph Salmon, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- NeuroImage, 2021, pp.117921. ⟨10.1016/j.neuroimage.2021.117921⟩
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-
- titre
- Observational study of haloperidol in hospitalized patients with COVID-19
- auteur
- Nicolas Hoertel, Marina Sánchez-Rico, Raphaël Vernet, Anne-Sophie Jannot, Antoine Neuraz, Carlos Blanco, Cédric Lemogne, Guillaume Airagnes, Nicolas Paris, Christel Daniel, Alexandre Gramfort, Guillaume Lemaître, Mélodie Bernaux, Ali Bellamine, Nathanaël Beeker, Frédéric Limosin
- article
- PLoS ONE, 2021, 16 (2), pp.e0247122. ⟨10.1371/journal.pone.0247122⟩
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-
- titre
- Prediction, Not Association, Paves the Road to Precision Medicine
- auteur
- Danilo Bzdok, Gael Varoquaux, Ewout Steyerberg
- article
- JAMA Psychiatry, 2021, 78 (2), pp.127. ⟨10.1001/jamapsychiatry.2020.2549⟩
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-
- titre
- Brain topography beyond parcellations: local gradients of functional maps
- auteur
- Elvis Dohmatob, Hugo Richard, Ana Luísa Pinho, Bertrand Thirion
- article
- NeuroImage, 2021, pp.117706. ⟨10.1016/j.neuroimage.2020.117706⟩
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-
- titre
- Revisiting Functional Connectivity for Infraslow Scale-Free Brain Dynamics using Complex Wavelet
- auteur
- Daria La Rocca, Herwig Wendt, Virginie van Wassenhove, Philippe Ciuciu, Patrice Abry
- article
- Frontiers in Physiology, 2021, 11, pp.1651. ⟨10.3389/fphys.2020.578537⟩
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-
- titre
- Machine learning based white matter models with permeability: An experimental study in cuprizone treated in-vivo mouse model of axonal demyelination
- auteur
- Ioana Hill, Marco Palombo, Mathieu D Santin, Francesca Branzoli, Anne-Charlotte Philippe, Demian Wassermann, Marie-Stéphane Aigrot, Bruno Stankoff, Anne Baron-van Evercooren, Mehdi Felfli, Dominique Langui, Hui Zhang, Stephane Lehericy, Alexandra Petiet, Daniel C Alexander, Olga Ciccarelli, Ivana Drobnjak
- article
- NeuroImage, 2021, 224, pp.117425. ⟨10.1016/j.neuroimage.2020.117425⟩
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-
- titre
- Population modeling with machine learning can enhance measures of mental health
- auteur
- Kamalaker Dadi, Gaël Varoquaux, Josselin Houenou, Danilo Bzdok, Bertrand Thirion, Denis Engemann
- article
- GigaScience, 2021, ⟨10.1101/2020.08.25.266536⟩
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-
- titre
- Results of the 2020 fastMRI Challenge for Machine Learning MR Image Reconstruction
- auteur
- Matthew J. Muckley, Bruno Riemenschneider, Alireza Radmanesh, Sunwoo Kim, Geunu Jeong, Jingyu Ko, Yohan Jun, Hyungseob Shin, Dosik Hwang, Mahmoud Mostapha, Simon Arberet, Dominik Nickel, Zaccharie Ramzi, Philippe Ciuciu, Jean-Luc Starck, Jonas Teuwen, Dimitrios Karkalousos, Chaoping Zhang, Anuroop Sriram, Zhengnan Huang, Nafissa Yakubova, Yvonne Lui, Florian Knoll
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, In press, ⟨10.1109/TMI.2021.3075856⟩
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-
- titre
- Preventing dataset shift from breaking machine-learning biomarkers
- auteur
- Jérôme Dockès, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline
- article
- GigaScience, In press, ⟨10.1093/gigascience/giab055⟩
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-
Conference papers
- titre
- Electromagnetic neural source imaging under sparsity constraints with SURE-based hyperparameter tuning
- auteur
- Pierre-Antoine Bannier, Quentin Bertrand, Joseph Salmon, Alexandre Gramfort
- article
- Medical imaging meets NeurIPS 2021, Dec 2021, Sydney, Australia
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-
- titre
- HNPE: Leveraging Global Parameters for Neural Posterior Estimation
- auteur
- Pedro Luiz Coelho Rodrigues, Thomas Moreau, Gilles Louppe, Alexandre Gramfort
- article
- NeurIPS 2021, Dec 2021, Sydney (Online), Australia
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-
- titre
- AI as statistical methods for imperfect theories
- auteur
- Gaël Varoquaux
- article
- NeurIPS 2021 – 35th Conference on Neural Information Processing Systems. Workshop: AI for Science, Dec 2021, Virtual, France
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-
- titre
- Shared Independent Component Analysis for Multi-Subject Neuroimaging
- auteur
- Hugo Richard, Pierre Ablin, Bertrand Thirion, Alexandre Gramfort, Aapo Hyvärinen
- article
- 35th Conference on Neural Information Processing Systems NeurIPS 2021, Dec 2021, Sydney (Virtual Conference), Australia
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-
- titre
- What’s a good imputation to predict with missing values?
- auteur
- Marine Le Morvan, Julie Josse, Erwan Scornet, Gaël Varoquaux
- article
- NeurIPS 2021 – 35th Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2021, Virtual, France
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-
- titre
- Model-based analysis of brain activity reveals the hierarchy of language in 305 subjects
- auteur
- Charlotte Caucheteux, Alexandre Gramfort, Jean-Rémi King
- article
- EMNLP 2021 – Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing, Nov 2021, Punta Cana (and Online), Dominican Republic
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-
- titre
- Functional Magnetic Resonance Imaging data augmentation through conditional ICA
- auteur
- Badr Tajini, Hugo Richard, Bertrand Thirion
- article
- MICCAI 2021 – 24th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2021, Strasbourg, France
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-
- titre
- Learning the sampling density in 2D SPARKLING MRI acquisition for optimized image reconstruction
- auteur
- Chaithya Giliyar Radhakrishna, Zaccharie Ramzi, Philippe Ciuciu
- article
- 2021 29th European Signal Processing Conference (EUSIPCO), IEEE, Aug 2021, Dublin, Ireland
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-
- titre
- Disentangling Syntax and Semantics in the Brain with Deep Networks
- auteur
- Charlotte Caucheteux, Alexandre Gramfort, Jean-Remi King
- article
- ICML 2021 – 38th International Conference on Machine Learning, Jul 2021, Online conference, France
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-
- titre
- Cytoarchitecture Measurements in Brain Gray Matter using Likelihood-Free Inference
- auteur
- Maëliss Jallais, Pedro Luiz Coelho Rodrigues, Alexandre Gramfort, Demian Wassermann
- article
- IPMI 2021 – 27th international conference on Information Processing in Medical Imaging, Jun 2021, Rønne, Denmark. ⟨10.1007/978-3-030-78191-0_15⟩
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-
- titre
- Probabilistic Logic for Coordinate-Based Meta-Analysis of Functional Segregation in the Brain
- auteur
- Majd Abdallah, Valentin Iovene, Demian Wassermann
- article
- OHBM 2021 – Organization of Human Brain Mapping, Jun 2021, Virtual, France
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-
- titre
- Verifying ontological knowledge through meta-analysis: Study cases of Pain and Consciousness
- auteur
- Gaston Zanitti, Valentin Iovene, Demian Wassermann
- article
- OHBM 2021 – Organization for Human Brain Mapping, Jun 2021, Virtual, France
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-
- titre
- Diffusion MRI-Based Cytoarchitecture Measurements in Brain Gray Matter using Likelihood-Free Inference
- auteur
- Maëliss Jallais, Pedro L C Rodrigues, Alexandre Gramfort, Demian Wassermann
- article
- ISMRM 2021 – Annual Meeting of the International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2021, Vancouver / Virtual, Canada
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-
- titre
- Off-resonance correction of non-Cartesian SWI using internal field map estimation
- auteur
- Guillaume Daval-Frérot, Aurélien Massire, Mathilde Ripart, Boris Mailhé, Mariappan S. Nadar, Alexandre Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2021, Online, United States
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-
- titre
- Is good old GRAPPA dead?
- auteur
- Zaccharie Ramzi, Alexandre Vignaud, Jean-Luc Starck, Philippe Ciuciu
- article
- ISMRM 2021 – Annual Meeting of the International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2021, Vancouver / Virtual, Canada
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-
- titre
- An Open Experimental Platform for Ranging, Proximity and Contact Event Tracking using Ultra-Wide-Band and Bluetooth Low-Energy
- auteur
- Roudy Dagher, Francois-Xavier Molina, Alexandre Abadie, Nathalie Mitton, Emmanuel Baccelli
- article
- CNERT 2021 – IEEE INFOCOM Workshop on Computer and Networking Experimental Research using Testbeds, May 2021, Virtual, France
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-
- titre
- Guidelines to use Transfer Learning for Motor Imagery Detection: an experimental study
- auteur
- Laurent Bougrain, Sébastien Rimbert, Pedro Luiz Coelho Rodrigues, Geoffrey Canron, Fabien Lotte
- article
- NER 2021 – 10th International IEEE/EMBS Conference on Neural Engineering, May 2021, Virtual, United States
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-
- titre
- Anderson acceleration of coordinate descent
- auteur
- Quentin Bertrand, Mathurin Massias
- article
- AISTATS 2021 – 24th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics, Apr 2021, San Diego / Virtual, United States
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-
- titre
- Accounting for variance in machine learning benchmarks
- auteur
- Xavier Bouthillier, Pierre Delaunay, Mirko Bronzi, Assya Trofimov, Brennan Nichyporuk, Justin Szeto, Naz Sepah, Edward Raff, Kanika Madan, Vikram Voleti, Samira Ebrahimi Kahou, Vincent Michalski, Dmitriy Serdyuk, Tal Arbel, Chris Pal, Gaël Varoquaux, Pascal Vincent
- article
- MLsys 2021 – 4th Conference on Machine Learning and Systems, Apr 2021, San Francisco (virtual), United States
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-
- titre
- Complex Coordinate-Based Meta-Analysis with Probabilistic Programming
- auteur
- Valentin Iovene, Gaston Zanitti, Demian Wassermann
- article
- Association for the Advancement of Artificial Intelligence, Feb 2021, Online, France
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-
- titre
- A lightweight neural model for biomedical entity linking
- auteur
- Lihu Chen, Gaël Varoquaux, Fabian Suchanek
- article
- AAAI 2021 – The Thirty-Fifth Conference on Artificial Intelligence, Association for the Advancement of Artificial Intelligence, Feb 2021, Palo Alto (virtual), United States. pp.12657-12665
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-
- titre
- Wavelets in the Deep Learning ERA
- auteur
- Zaccharie Ramzi, Jean-Luc Starck, Thomas Moreau, Philippe Ciuciu
- article
- EUSIPCO 2020 – 28th European Signal Processing Conference, Jan 2021, Amsterdam, Netherlands
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-
Book sections
- titre
- Single Encoding Diffusion MRI: a Probe to Brain Anisotropy
- auteur
- Maëliss Jallais, Demian Wassermann
- article
- Anisotropy Across Fields and Scales, 2021
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-
Theses
- titre
- Hyperparameter selection for high dimensional sparse learning : application to neuroimaging
- auteur
- Quentin Bertrand
- article
- Statistics [math.ST]. Université Paris-Saclay, 2021. English. ⟨NNT : 2021UPASG054⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Variable Importance on Medical Images and Socio-Demographic Data
- auteur
- Ahmad Chamma, Denis Engemann, Bertrand Thirion
- article
- 2021
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-
- titre
- Inferring the Localization of White-Matter Tracts using Diffusion Driven Label Fusion
- auteur
- Guillermo Gallardo, Gaston Zanitti, Mat Higger, Sylvain Bouix, Demian Wassermann
- article
- 2021
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Equitable and Optimal Transport with Multiple Agents
- auteur
- Meyer Scetbon, Laurent Meunier, Jamal Atif, Marco Cuturi
- article
- 2021
- Accès au bibtex
-
2020
Journal articles
- titre
- Subject‐specific segregation of functional territories based on deep phenotyping
- auteur
- Ana Luísa Pinho, Alexis Amadon, Murielle Fabre, Elvis Dohmatob, Isabelle Denghien, Juan Jesús Torres, Chantal Ginisty, Séverine Becuwe-Desmidt, Séverine Roger, Laurence Laurier, Véronique Joly-Testault, Gaëlle Médiouni-Cloarec, Christine Doublé, Bernadette Martins, Philippe Pinel, Evelyn Eger, Gaël Varoquaux, Christophe C Pallier, Stanislas Dehaene, Lucie Hertz‐pannier, Bertrand Thirion
- article
- Human Brain Mapping, 2020, ⟨10.1002/hbm.25189⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- International electronic health record-derived COVID-19 clinical course profiles: the 4CE consortium
- auteur
- Gabriel A. Brat, Griffin M. Weber, Nils Gehlenborg, Paul Avillach, Nathan P. Palmer, Luca Chiovato, James Cimino, Brett K. Beaulieu-Jones, Sehi L’Yi, Mark S. Keller, Douglas S. Bell, Robert W. Follett, Lav P. Patel, Anne Sophie Jannot, Lemuel R. Waitman, Gilbert Omenn, Alberto Malovini, Jason H. Moore, Valentina Tibollo, Shawn N Murphy, Riccardo Bellazzi, David A Hanauer, Arnaud Serret-Larmande, Alba Gutierrez-Sacristan, John J Holmes, Douglas Bell, Kenneth D. Mandl, Jeffrey G Klann, Douglas A Murad, Luigia Scudeller, Mauro Bucalo, Katie Kirchoff, Jean Craig, Jihad Obeid, Vianney Jouhet, Romain Griffier, Sébastien Cossin, Bertrand Moal, Antonio Bellasi, Hans U Prokosch, Detlef Kraska, Piotr Sliz, Amelia L.M. Tan, Kee Yuan Ngiam, Alberto Zambelli, Danielle L Mowery, Emily Schiver, Batsal Devkota, Robert Bradford, Mohamad Daniar, Christel Daniel, Vincent Benoit, Romain Bey, Nicolas Paris, Patricia Serre, Nina Orlova, Julien Dubiel, Martin Hilka, Stephane Breant, Judith Leblanc, Nicolas Griffon, Anita Burgun, Melodie Bernaux, Arnaud Sandrin, Elisa Salamanca, Sylvie Cormont, Thomas Ganslandt, Tobias Gradinger, Julien Champ, Martin Boeker, Patricia Martel, Loïc Estève, Alexandre Gramfort, Olivier Grisel, Damien Leprovost, Thomas Moreau, Gael Varoquaux, Jill-Jênn Vie, Demian Wassermann, Arthur Mensch, Charlotte Caucheteux, Christian Haverkamp, Guillaume Lemaître, Silvano Bosari, Andrew South, Tianxi Cai, Isaac Kohane
- article
- npj Digital Medicine, 2020, 3 (1), pp.#109. ⟨10.1038/s41746-020-00308-0⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Propofol Requirement and EEG Alpha Band Power During General Anesthesia Provide Complementary Views on Preoperative Cognitive Decline
- auteur
- Cyril Touchard, Jérôme Cartailler, Charlotte Levé, José Serrano, David Sabbagh, Elsa Manquat, Jona Joachim, Joaquim Mateo, Etienne Gayat, Denis Engemann, Fabrice Vallée
- article
- Frontiers in Aging Neuroscience, 2020, ⟨10.3389/fnagi.2020.593320⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Diffusion MRI simulation of realistic neurons with SpinDoctor and the Neuron Module
- auteur
- Chengran Fang, Van-Dang Nguyen, Demian Wassermann, Jing-Rebecca Li
- article
- NeuroImage, 2020, 222, pp.117198. ⟨10.1016/j.neuroimage.2020.117198⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dual Extrapolation for Sparse Generalized Linear Models
- auteur
- Mathurin Massias, Samuel Vaiter, Alexandre Gramfort, Joseph Salmon
- article
- Journal of Machine Learning Research, 2020, 21 (234), pp.1-33
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Nonlinear ICA of fMRI reveals primitive temporal structures linked to rest, task, and behavioral traits
- auteur
- Hiroshi Morioka, Vince Calhoun, Aapo Hyvärinen
- article
- NeuroImage, 2020, 218, pp.116989. ⟨10.1016/j.neuroimage.2020.116989⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Comparison of beamformer implementations for MEG source localization
- auteur
- Amit Jaiswal, Jukka Nenonen, Matti Stenroos, Alexandre Gramfort, Sarang S. Dalal, Britta U Westner, Vladimir Litvak, John C. Mosher, Jan-Mathijs Schoffelen, Caroline Witton, Robert Oostenveld, Lauri Parkkonen
- article
- NeuroImage, 2020, 216, ⟨10.1016/j.neuroimage.2020.116797⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dark Control: The Default Mode Network as a Reinforcement Learning Agent
- auteur
- Elvis Dohmatob, Guillaume Dumas, Danilo Bzdok
- article
- Human Brain Mapping, 2020, 41 (12), pp.3318-3341. ⟨10.1002/hbm.25019⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Inferring disease subtypes from clusters in explanation space
- auteur
- Marc-Andre Schulz, Matt Chapman-Rounds, Manisha Verma, Danilo Bzdok, Konstantinos Georgatzis
- article
- Scientific Reports, 2020, ⟨10.1038/s41598-020-68858-7⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fine-grain atlases of functional modes for fMRI analysis
- auteur
- Kamalaker Dadi, Gaël Varoquaux, Antonia Machlouzarides-Shalit, Krzysztof J. Gorgolewski, Demian Wassermann, Bertrand Thirion, Arthur Mensch
- article
- NeuroImage, 2020, 221, pp.117126
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- New insights into the neural foundations mediating movement/language interactions gained from intrasurgical direct electrostimulations
- auteur
- Fabien Rech, Demian Wassermann, Hugues Duffau
- article
- Brain and Cognition, 2020, 142, pp.105583. ⟨10.1016/j.bandc.2020.105583⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Interpretable brain age prediction using linear latent variable models of functional connectivity
- auteur
- Ricardo Pio Monti, Alex Gibberd, Sandipan Roy, Matthew Nunes, Romy Lorenz, Robert Leech, Takeshi Ogawa, Motoaki Kawanabe, Aapo Hyvärinen
- article
- PLoS ONE, 2020, 15 (6), pp.e0232296. ⟨10.1371/journal.pone.0232296⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Population variability in social brain morphology for social support, household size, and friendship satisfaction
- auteur
- Arezoo Taebi, Hannah Kiesow, Kai Vogeley, Leonhard Schilbach, Boris C Bernhardt, Danilo Bzdok
- article
- Social Cognitive and Affective Neuroscience, 2020, ⟨10.1093/scan/nsaa075⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Microstructural organization of human insula is linked to its macrofunctional circuitry and predicts cognitive control
- auteur
- Vinod Menon, Guillermo Gallardo, Mark Pinsk, Van-Dang Nguyen, Jing-Rebecca Li, Weidong Cai, Demian Wassermann
- article
- eLife, 2020, 9, ⟨10.7554/eLife.53470⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Variability in the analysis of a single neuroimaging dataset by many teams
- auteur
- Rotem Botvinik-Nezer, Felix Holzmeister, Colin F Camerer, Anna Dreber, Juergen Huber, Magnus Johannesson, Michael Kirchler, Roni Iwanir, Jeanette A Mumford, R. Alison Adcock, Paolo Avesani, Blazej M Baczkowski, Aahana Bajracharya, Leah Bakst, Sheryl Ball, Marco Barilari, Nadège Bault, Derek Beaton, Julia Beitner, Roland G Benoit, Ruud M.W.J. Berkers, Jamil P Bhanji, Bharat B Biswal, Sebastian Bobadilla-Suarez, Tiago Bortolini, Katherine L Bottenhorn, Alexander Bowring, Senne Braem, Hayley R Brooks, Emily G Brudner, Cristian B Calderon, Julia A Camilleri, Jaime J Castrellon, Luca Cecchetti, Edna C Cieslik, Zachary J Cole, Olivier Collignon, Robert W Cox, William A Cunningham, Stefan Czoschke, Kamalaker Dadi, Charles P Davis, Alberto De Luca, Mauricio R Delgado, Lysia Demetriou, Jeffrey B Dennison, Xin Di, Erin W Dickie, Ekaterina Dobryakova, Claire L Donnat, Juergen Dukart, Niall W Duncan, Joke Durnez, Amr Eed, Simon B. Eickhoff, Andrew Erhart, Laura Fontanesi, G. Matthew Fricke, Shiguang Fu, Adriana Galván, Remi Gau, Sarah Genon, Tristan Glatard, Enrico Glerean, Jelle J Goeman, Sergej A.E. Golowin, Carlos González-García, Krzysztof J Gorgolewski, Cheryl L Grady, Mikella A Green, João F Guassi Moreira, Olivia Guest, Shabnam Hakimi, J. Paul Hamilton, Roeland Hancock, Giacomo Handjaras, Bronson B Harry, Colin Hawco, Peer Herholz, Gabrielle Herman, Stephan Heunis, Felix Hoffstaedter, Jeremy Hogeveen, Susan Holmes, Chuan-Peng Hu, Scott A Huettel, Matthew E Hughes, Vittorio Iacovella, Alexandru D Iordan, Peder M Isager, Ayse I Isik, Andrew Jahn, Matthew R Johnson, Tom Johnstone, Michael J.E. Joseph, Anthony C Juliano, Joseph W Kable, Michalis Kassinopoulos, Cemal Koba, Xiang-Zhen Kong, Timothy R Koscik, Nuri Erkut Kucukboyaci, Brice A Kuhl, Sebastian Kupek, Angela R Laird, Claus Lamm, Robert Langner, Nina Lauharatanahirun, Hongmi Lee, Sangil Lee, Alexander Leemans, Andrea Leo, Elise Lesage, Flora Li, Monica Y.C. Li, Phui Cheng Lim, Evan N Lintz, Schuyler W Liphardt, Annabel B Losecaat Vermeer, Bradley C Love, Michael L Mack, Norberto Malpica, Theo Marins, Camille Maumet, Kelsey Mcdonald, Joseph T Mcguire, Helena Melero, Adriana S Méndez Leal, Benjamin Meyer, Kristin N Meyer, Glad Mihai, Georgios D. Mitsis, Jorge Moll, Dylan M Nielson, Gustav Nilsonne, Michael P Notter, Emanuele Olivetti, Adrian I Onicas, Paolo Papale, Kaustubh R Patil, Jonathan E Peelle, Alexandre Pérez, Doris Pischedda, Jean-Baptiste Poline, Yanina Prystauka, Shruti Ray, Patricia A Reuter-Lorenz, Richard C Reynolds, Emiliano Ricciardi, Jenny R Rieck, Anais M Rodriguez-Thompson, Anthony Romyn, Taylor Salo, Gregory R Samanez-Larkin, Emilio Sanz-Morales, Margaret L Schlichting, Douglas H Schultz, Qiang Shen, Margaret A Sheridan, Jennifer A Silvers, Kenny Skagerlund, Alec Smith, David V Smith, Peter Sokol-Hessner, Simon R Steinkamp, Sarah M Tashjian, Bertrand Thirion, John N Thorp, Gustav Tinghög, Loreen Tisdall, Steven H Tompson, Claudio Toro-Serey, Juan Jesus Torre Tresols, Leonardo Tozzi, Vuong Truong, Luca Turella, Anna E van ‘t Veer, Tom Verguts, Jean M Vettel, Sagana Vijayarajah, Khoi Vo, Matthew B Wall, Wouter D Weeda, Susanne Weis, David J White, David Wisniewski, Alba Xifra-Porxas, Emily A Yearling, Sangsuk Yoon, Rui Yuan, Kenneth S.L. Yuen, Lei Zhang, Xu Zhang, Joshua E Zosky, Thomas E. Nichols, Russell A Poldrack, Tom Schonberg
- article
- Nature, 2020, 582 (7810), pp.84-88. ⟨10.1038/s41586-020-2314-9⟩
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-
- titre
- 3D variable-density SPARKLING trajectories for high-resolution T2*-weighted Magnetic Resonance imaging
- auteur
- Carole Lazarus, Pierre Weiss, Loubna El Gueddari, Franck Mauconduit, Aurélien Massire, Mathile Ripart, Alexandre Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- NMR in Biomedicine, In press
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-
- titre
- Combining magnetoencephalography with magnetic resonance imaging enhances learning of surrogate-biomarkers
- auteur
- Denis Engemann, Oleh Kozynets, David Sabbagh, Guillaume Lemaître, Gaël Varoquaux, Franziskus Liem, Alexandre Gramfort
- article
- eLife, 2020, ⟨10.7554/eLife.54055⟩
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-
- titre
- Predictive regression modeling with MEG/EEG: from source power to signals and cognitive states
- auteur
- David Sabbagh, Pierre Ablin, Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Denis Engemann
- article
- NeuroImage, 2020, ⟨10.1016/j.neuroimage.2020.116893⟩
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-
- titre
- Finding the needle in a high-dimensional haystack: Canonical correlation analysis for neuroscientists
- auteur
- Hao-Ting Wang, Jonathan Smallwood, Janaina Mourao-Miranda, Cedric Huchuan Xia, Theodore D Satterthwaite, Danielle Bassett, Danilo Bzdok
- article
- NeuroImage, 2020
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-
- titre
- 10,000 Social Brains: Sex Differentiation in Human Brain Anatomy
- auteur
- Hannah Kiesow, Robin I M Dunbar, Joseph W Kable, Tobias Kalenscher, Kai Vogeley, Leonhard Schilbach, Andre F Marquand, Thomas V Wiecki, Danilo Bzdok
- article
- Annales Archéologiques Arabes Syriennes, 2020
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-
- titre
- Combined behavioral and electrophysiological evidence for a direct cortical effect of prefrontal tDCS on disorders of consciousness
- auteur
- Bertrand Hermann, Federico Raimondo, Lukas Hirsch, Yu Huang, Mélanie Valente, Pauline Pérez, Denis Engemann, Frédéric Faugeras, Nicolas Weiss, Sophie Demeret, Benjamin Rohaut, Lucas Parra, Jacobo Diego Sitt, Lionel Naccache
- article
- Scientific Reports, 2020, ⟨10.1101/612309⟩
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-
- titre
- Benchmarking MRI Reconstruction Neural Networks on Large Public Datasets
- auteur
- Zaccharie Ramzi, Philippe Ciuciu, Jean-Luc Starck
- article
- Applied Sciences, 2020
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-
- titre
- NeuroQuery, comprehensive meta-analysis of human brain mapping
- auteur
- Jérôme Dockès, Russell Poldrack, Romain Primet, Hande Gözükan, Tal Yarkoni, Fabian M Suchanek, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- eLife, 2020
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-
- titre
- Predictive pattern classification can distinguish gender identity subtypes from behavior and brain imaging
- auteur
- Benjamin Clemens, Birgit Derntl, Elke Smith, Jessica Junger, Josef Neulen, Gianluca Mingoia, Frank Schneider, Ted Abel, Danilo Bzdok, Ute Habel
- article
- Cerebral Cortex, 2020
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-
- titre
- Analyzing Brain Networks in Population Neuroscience: A Case for the Bayesian Philosophy
- auteur
- Danilo Bzdok, Dorothea Floris, Andre Marquand
- article
- Philosophical Transactions of the Royal Society of London. B (1887–1895), 2020
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-
- titre
- Individual Brain Charting dataset extension, second release of high-resolution fMRI data for cognitive mapping
- auteur
- Ana Luísa Pinho, Alexis Amadon, Baptiste Gauthier, Nicolas Clairis, André Knops, Sarah Genon, Elvis Dohmatob, Juan Jesús Torre, Chantal Ginisty, Séverine Becuwe-Desmidt, Séverine Roger, Yann Lecomte, Valérie Berland, Laurence Laurier, Véronique Joly-Testault, Gaëlle Médiouni-Cloarec, Christine Doublé, Bernadette Martins, Eric Salmon, Manuela Piazza, David Melcher, Mathias Pessiglione, Virginie van Wassenhove, Evelyn Eger, Gaël Varoquaux, Stanislas Dehaene, Lucie Hertz-Pannier, Bertrand Thirion
- article
- Scientific Data , 2020, ⟨10.1038/s41597-020-00670-4⟩
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-
- titre
- Encoding high-cardinality string categorical variables
- auteur
- Patricio Cerda, Gaël Varoquaux
- article
- IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering, In press, ⟨10.1109/TKDE.2020.2992529⟩
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-
- titre
- pyts: A Python Package for Time Series Classification
- auteur
- Johann Faouzi, Hicham Janati
- article
- Journal of Machine Learning Research, 2020, 21, pp.1 – 6
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-
- titre
- DiCoDiLe: Distributed Convolutional Dictionary Learning
- auteur
- Thomas Moreau, Alexandre Gramfort
- article
- IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, In press
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-
- titre
- Multi-Scale Network Regression for Brain-Phenotype Associations
- auteur
- Cedric Huchuan Xia, Zongming Ma, Zaixu Cui, Danilo Bzdok, Bertrand Thirion, Danielle Bassett, Theodore D Satterthwaite, Russell T Shinohara, Daniela M Witten
- article
- Human Brain Mapping, In press, ⟨10.1002/hbm.24982⟩
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-
Conference papers
- titre
- Acoustic characteristics predicting the annoyance of interior train background noise
- auteur
- Guillaume Lemaitre, Fabrice Aubin, Christophe Lambourg
- article
- Forum Acusticum, Dec 2020, Lyon, France. pp.2385-2389, ⟨10.48465/fa.2020.1030⟩
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-
- titre
- Statistical control for spatio-temporal MEG/EEG source imaging with desparsified multi-task Lasso
- auteur
- Jérôme-Alexis Chevalier, Alexandre Gramfort, Joseph Salmon, Bertrand Thirion
- article
- NeurIPS 2020 – 34h Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2020, Vancouver /Virtual, Canada
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-
- titre
- ICE-BeeM: Identifiable Conditional Energy-Based Deep Models Based on Nonlinear ICA
- auteur
- Ilyes Khemakhem, Ricardo Pio Monti, Diederik P. Kingma, Aapo Hyvärinen
- article
- NeurIPS 2020 – 34th Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2020, Vancouver / Virtuel, Canada
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-
- titre
- Learning to solve TV regularized problems with unrolled algorithms
- auteur
- Hamza Cherkaoui, Jeremias Sulam, Thomas Moreau
- article
- NeurIPS 2020 – 34th Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2020, Vancouver / Virtuel, Canada
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-
- titre
- Denoising Score-Matching for Uncertainty Quantification in Inverse Problems
- auteur
- Zaccharie Ramzi, Benjamin Rémy, Francois Lanusse, Jean-Luc Starck, Philippe Ciuciu
- article
- NeurIPS 2020 – 34th Conference on Neural Information Processing Systems / Workshop on Deep Learning and Inverse Problems, Dec 2020, Vancouver / Virtuel, Canada
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-
- titre
- Modeling Shared Responses in Neuroimaging Studies through MultiView ICA
- auteur
- Hugo Richard, Luigi Gresele, Aapo Hyvärinen, Bertrand Thirion, Alexandre Gramfort, Pierre Ablin
- article
- NeurIPS 2020 – Advances in Neural Information Processing Systems, Dec 2020, Vancouver, Canada. pp.19149–19162
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-
- titre
- NeuMiss networks: differentiable programming for supervised learning with missing values
- auteur
- Marine Le Morvan, Julie Josse, Thomas Moreau, Erwan Scornet, Gaël Varoquaux
- article
- NeurIPS 2020 – 34th Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2020, Vancouver / Virtual, Canada
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- titre
- Probabilistic Mapping of Dark Matter by Neural Score Matching
- auteur
- Benjamin Rémy, Francois Lanusse, Zaccharie Ramzi, Jia Liu, Niall Jeffrey, Jean-Luc Starck
- article
- NeurIPS 2020 – 3rd Workshop on Machine Learning and the Physical Sciences, Dec 2020, Vancouver / Virtuel, Canada
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-
- titre
- Entropic Optimal Transport between Unbalanced Gaussian Measures has a Closed Form
- auteur
- Hicham Janati, Boris Muzellec, Gabriel Peyré, Marco Cuturi
- article
- NeurIPS 2020 – 34th Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2020, Vancouver / Virtuel, Canada
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-
- titre
- Multivariate analysis is sufficient for lesion-behaviour mapping
- auteur
- Lucas Martin, Julie Josse, Bertrand Thirion
- article
- MICCAI BrainLes 2020 workshop, Oct 2020, Lima, Peru
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- titre
- Linear predictor on linearly-generated data with missing values: non consistency and solutions
- auteur
- Marine Le Morvan, Nicolas Prost, Julie Josse, Erwan Scornet, Gaël Varoquaux
- article
- AISTATS 2020 – International Conference on Artificial Intelligence and Statistics, Aug 2020, Online, France. pp.3165-3174
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-
- titre
- Support recovery and sup-norm convergence rates for sparse pivotal estimation
- auteur
- Mathurin Massias, Quentin Bertrand, Alexandre Gramfort, Joseph Salmon
- article
- AISTATS2020, Aug 2020, Virtual, Italy
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-
- titre
- Lesion-Robust White-Matter Bundle Identification through Diffusion Driven Label Fusion
- auteur
- Guillermo Gallardo, Gaston Zanitti, Alfred Anwander, Mat Higger, Sylvain Bouix, Samuel Deslauriers-Gauthier, Demian Wassermann
- article
- ISMRM 2020 – 28th Annual Meeting & Exhibition, Aug 2020, Sydney / Virtual, Australia
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-
- titre
- Indetermination-free cytoarchitecture measurements in brain gray matter via a forward diffusion MRI signal separation method
- auteur
- Maëliss Jallais, Demian Wassermann
- article
- ISMRM 2020 – 28th Annual Meeting & Exhibition, Aug 2020, Sydney / Virtual, Australia
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-
- titre
- Diffusion MRI-based Connectivity Enriched with Microstructure Information Predicts the Propagation of Cortico-Cortical Evoked Potentials
- auteur
- Patryk Filipiak, Fabien Almairac, Théodore Papadopoulo, Denys Fontaine, Lydiane Mondot, Stéphane Chanalet, Rachid Deriche, Maureen Clerc, Demian Wassermann
- article
- ISMRM 2020 – 28th Annual Meeting & Exhibition of the International Society for Magnetic Resonance in Medicine, Aug 2020, Sydney / Virtual, Australia
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-
- titre
- Robust contrastive learning and nonlinear ICA in the presence of outliers
- auteur
- Hiroaki Sasaki, Takashi Takenouchi, Ricardo Monti, Aapo Hyvärinen
- article
- UAI 2020 – Conference on Uncertainty in Artificial Intelligence, Aug 2020, Toronto, Canada
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-
- titre
- Hidden Markov Nonlinear ICA: Unsupervised Learning from Nonstationary Time Series
- auteur
- Hermanni Hälvä, Aapo Hyvärinen
- article
- UAI 2020 – Conference on Uncertainty in Artificial Intelligence, Aug 2020, Toronto / Virtual, Canada
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-
- titre
- Extraction of Nystagmus Patterns from Eye-Tracker Data with Convolutional Sparse Coding
- auteur
- Clément Lalanne, Maxence Rateaux, Laurent Oudre, Matthieu Robert, Thomas Moreau
- article
- EMBC 2020 – 42nd Annual International Conferences of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society in conjunction with the 43rd Annual Conference of the Canadian Medical and Biological Engineering Society, Jul 2020, Montreal / Virtuel, Canada. pp.928-931, ⟨10.1109/EMBC44109.2020.9175621⟩
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-
- titre
- Debiased Sinkhorn barycenters
- auteur
- Hicham Janati, Marco Cuturi, Alexandre Gramfort
- article
- ICML 2020 – 37th International Conference on Machine Learning, Jul 2020, Vienna / Virtuel, Austria
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-
- titre
- Aggregation of Multiple Knockoffs
- auteur
- Tuan-Binh Nguyen, Jérôme-Alexis Chevalier, Bertrand Thirion, Sylvain Arlot
- article
- ICML 2020 – 37th International Conference on Machine Learning, Jul 2020, Vienne / Virtual, Austria
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-
- titre
- Implicit differentiation of Lasso-type models for hyperparameter optimization
- auteur
- Quentin Bertrand, Quentin Klopfenstein, Mathieu Blondel, Samuel Vaiter, Alexandre Gramfort, Joseph Salmon
- article
- ICML 2020 – 37th International Conference on Machine Learning, Jul 2020, Vienna / Virtuel, Austria
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-
- titre
- Probabilistic Programming in neurolang: Bridging the Gap Between Cognitive Science and Statistical Modeling
- auteur
- Valentin Iovene, Demian Wassermann
- article
- 2020 OHBM – Annual Meeting of Organization for Human Brain Mapping, Jun 2020, Remote due to Covid-19, France
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-
- titre
- Variational Autoencoders and Nonlinear ICA: A Unifying Framework
- auteur
- Ilyes Khemakhem, Diederik P. Kingma, Ricardo Pio Monti, Aapo Hyvärinen
- article
- AISTATS 2020 – 23rd International Conference on Artificial Intelligence and Statistics, Jun 2020, Palermo / Virtual, Italy
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-
- titre
- Benchmarking Deep Nets MRI Reconstruction Models on the FastMRI Publicly Available Dataset
- auteur
- Zaccharie Ramzi, Philippe Ciuciu, Jean-Luc Starck
- article
- ISBI 2020 – International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2020, Iowa City, United States
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-
- titre
- PySAP-MRI: a Python Package for MR Image Reconstruction
- auteur
- Loubna El Gueddari, Chaithya Giliyar Radhakrishna, Zaccharie Ramzi, Samuel Farrens, Sophie Starck, Antoine Grigis, Jean-Luc Starck, Philippe Ciuciu
- article
- ISMRM workshop on Data Sampling and Image Reconstruction, Jan 2020, Sedona, AZ, United States
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-
Poster communications
- titre
- Indetermination-free cytoarchitecture measurements in brain gray matter via an inverse diffusion MRI signal separation method
- auteur
- Maëliss Jallais, Demian Wassermann
- article
- ISMRM 2020 – International Society for Magnetic Resonance in Medicine, Aug 2020, Sydney / virtual, Australia
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-
- titre
- NeuroLang: Representing Neuroanatomy with Sulcus-Specific Queries
- auteur
- Antonia Machlouzarides-Shalit, Nikos Makris, Gaston Zanitti, Valentin Iovene, Guillaume M Lemaitre, Guillaume Favelier, Demian Wassermann
- article
- Organization of Human Brain Mapping, Jun 2020, Montreal, Canada
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-
- titre
- Diffusion MRI simulation of realistic neurons with SpinDoctor and the Neuron Module, ISMRM poster
- auteur
- Van-Dang Nguyen, Chengran Fang, Demian Wassermann, Jing-Rebecca Li
- article
- ISMRM 2020 – 28th Annual Meeting & Exhibition, Apr 2020, Sydney, Australia
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-
Theses
- titre
- Development of subject-specific representations of neuroanatomy via a domain-specific language
- auteur
- Antonia Machlouzarides-Shalit
- article
- Cognitive Sciences. Université Paris-Saclay, 2020. English. ⟨NNT : 2020UPASG041⟩
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-
- titre
- Statistical control of sparse models in high dimension
- auteur
- Jérôme-Alexis Chevalier
- article
- Machine Learning [stat.ML]. Université Paris-Saclay, 2020. English. ⟨NNT : 2020UPASG051⟩
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-
- titre
- Machine Learning on Population Imaging for Mental Health
- auteur
- Kamalaker Dadi
- article
- Medical Imaging. Université Paris-Saclay, 2020. English. ⟨NNT : 2020UPASG001⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Model identification and local linear convergence of coordinate descent
- auteur
- Quentin Klopfenstein, Quentin Bertrand, Alexandre Gramfort, Joseph Salmon, Samuel Vaiter
- article
- 2020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- XPDNet for MRI Reconstruction: an Application to the fastMRI 2020 Brain Challenge
- auteur
- Zaccharie Ramzi, Philippe Ciuciu, Jean-Luc Starck
- article
- 2020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Hydroxychloroquine with or without azithromycin and in-hospital mortality or discharge in patients hospitalized for COVID-19 infection: a cohort study of 4,642 in-patients in France
- auteur
- Emilie Sbidian, Julie Josse, Guillaume Lemaître, Imke Mayer, Melodie Bernaux, Alexandre Gramfort, Nathanaël Lapidus, Nicolas Paris, Antoine Neuraz, Ivan Lerner, Nicolas Garcelon, Bastien Rance, Olivier Grisel, Thomas Moreau, Ali Bellamine, Pierre Wolkenstein, Gaël Varoquaux, Eric Caumes, Marc Lavielle, Armand Mekontso Dessap, Etienne Audureau
- article
- 2020
- Accès au bibtex
-
- titre
- Beyond brain age: Empirically-derived proxy measures of mental health
- auteur
- Kamalaker Dadi, Gael Varoquaux, Josselin Houenou, Danilo Bzdok, Bertrand Thirion, Denis Engemann
- article
- 2020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fine-grain atlases of functional modes for fMRI analysis
- auteur
- Kamalaker Dadi, Gaël Varoquaux, Antonia Machlouzarides-Shalit, Krzysztof Jacek Gorgolewski, Demian Wassermann, Bertrand Thirion, Arthur Mensch
- article
- 2020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Interactive Psychometrics for Autism with the Human Dynamic Clamp: Interpersonal Synchrony from Sensory-motor to Socio-cognitive Domains
- auteur
- Florence Baillin, Aline Lefebvre, Amandine Pedoux, Yann Beauxis, Denis Engemann, Anna Maruani, Frederique Amsellem, Thomas Bourgeron, Richard Delorme, Guillaume Dumas
- article
- 2020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Quantitative modeling links in vivo microstructural and macrofunctional organization of human and macaque insular cortex, and predicts cognitive control abilities
- auteur
- Vinod Menon, Guillermo Gallardo, Mark Pinsk, Van-Dang Nguyen, Jing-Rebecca Li, Weidong Cai, Demian Wassermann
- article
- 2020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2019
Journal articles
- titre
- Distinguishing Social From Private Intentions Through the Passive Observation of Gaze Cues
- auteur
- Mathis Jording, Denis Engemann, Hannah Eckert, Gary Bente, Kai Vogeley
- article
- Frontiers in Human Neuroscience, 2019, 13, ⟨10.3389/fnhum.2019.00442⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Portable simulation framework for diffusion MRI
- auteur
- Van-Dang Nguyen, Massimiliano de Leoni, Tamara Dancheva, Johan Jansson, Johan Hoffman, Demian Wassermann, Jing-Rebecca Li
- article
- Journal of Magnetic Resonance, 2019, 309, pp.106611. ⟨10.1016/j.jmr.2019.106611⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- The visual word form area (VWFA) is part of both language and attention circuitry
- auteur
- Lang Chen, Demian Wassermann, Daniel Abrams, John Kochalka, Guillermo Gallardo-Diez, Vinod Menon
- article
- Nature Communications, 2019, 10 (1), ⟨10.1038/s41467-019-13634-z⟩
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-
- titre
- The Dmipy Toolbox: Diffusion MRI Multi-Compartment Modeling and Microstructure Recovery Made Easy
- auteur
- Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Rachid Deriche
- article
- Frontiers in Neuroinformatics, 2019, 13, ⟨10.3389/fninf.2019.00064⟩
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-
- titre
- Topography and Behavioral Relevance of the Global Signal in the Human Brain
- auteur
- Jingwei Li, Taylor Bolt, Danilo Bzdok, Jason S Nomi, B T Thomas Yeo, R Nathan Spreng, Lucina Q Uddin
- article
- Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-50750-8⟩
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-
- titre
- Deep learning-based electroencephalography analysis: a systematic review
- auteur
- Yannick Roy, Hubert Banville, Isabela Albuquerque, Alexandre Gramfort, Tiago Falk, Jocelyn Faubert
- article
- Journal of Neural Engineering, 2019, 16 (5), pp.051001. ⟨10.1088/1741-2552/ab260c⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Deep neural networks and kernel regression achieve comparable accuracies for functional connectivity prediction of behavior and demographics
- auteur
- Tong He, Ru Kong, Avram J Holmes, Minh Quang Nguyen, Mert Sabuncu, Simon B. Eickhoff, Danilo Bzdok, Jiashi Feng, B T Thomas Yeo
- article
- NeuroImage, 2019, pp.116276. ⟨10.1016/j.neuroimage.2019.116276⟩
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-
- titre
- Building blocks of social cognition: Mirror, mentalize, share?
- auteur
- Daniel Alcalá-López, Kai Vogeley, Ferdinand Binkofski, Danilo Bzdok
- article
- Cortex, 2019, 118, pp.4 – 18. ⟨10.1016/j.cortex.2018.05.006⟩
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-
- titre
- Brain-based ranking of cognitive domains to predict schizophrenia
- auteur
- Teresa M Karrer, Danielle S. Bassett, Birgit Derntl, Oliver Gruber, Andre Aleman, Renaud Jardri, Angela R Laird, Peter Fox, Simon B. Eickhoff, Olivier Grisel, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, Danilo Bzdok
- article
- Human Brain Mapping, 2019, 40, pp.4487-4507. ⟨10.1002/hbm.24716⟩
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-
- titre
- Towards Algorithmic Analytics for Large-scale Datasets
- auteur
- Danilo Bzdok, Thomas E. Nichols, Stephen Smith
- article
- Nature Machine Intelligence, 2019, ⟨10.1038/s42256-019-0069-5⟩
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-
- titre
- SmartPulse, a machine learning approach for calibration-free dynamic RF shimming: preliminary study in a clinical environment
- auteur
- Raphael Tomi-Tricot, Vincent Gras, Bertrand Thirion, Franck Mauconduit, Nicolas Boulant, Hamza Cherkaoui, Pierre Zerbib, Alexandre Vignaud, Alain Luciani, Alexis Amadon
- article
- Magnetic Resonance in Medicine, 2019, 82, pp.2016-2031. ⟨10.1002/mrm.27870⟩
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-
- titre
- DOSED: A deep learning approach to detect multiple sleep micro-events in EEG signal
- auteur
- Stanislas Chambon, Valentin Thorey, Pierrick J. Arnal, Emmanuel Jean Marie Mignot, Alexandre Gramfort
- article
- Journal of Neuroscience Methods, 2019, 321, pp.64-78. ⟨10.1016/j.jneumeth.2019.03.017⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- SPARKLING: variable-density k-space filling curves for accelerated T 2 * -weighted MRI
- auteur
- Carole Lazarus, Pierre Weiss, Nicolas Chauffert, Franck Mauconduit, Loubna El Gueddari, Christophe Destrieux, Ilyess Zemmoura, Alexandre Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- Magnetic Resonance in Medicine, 2019, 81 (6), pp.3643-3661. ⟨10.1002/mrm.27678⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Benchmarking functional connectome-based predictive models for resting-state fMRI
- auteur
- Kamalaker Dadi, Mehdi Rahim, Alexandre Abraham, Darya Chyzhyk, Michael Milham, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- NeuroImage, 2019, 192, pp.115-134. ⟨10.1016/j.neuroimage.2019.02.062⟩
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-
- titre
- The functional database of the ARCHI project: Potential and perspectives
- auteur
- Philippe Pinel, Baudouin Forgeot d’Arc, Stanislas Dehaene, Thomas Bourgeron, Bertrand Thirion, Denis Le Bihan, Cyril Poupon
- article
- NeuroImage, 2019, 197, pp.527-543. ⟨10.1016/j.neuroimage.2019.04.056⟩
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-
- titre
- Automatic Detection of Interplanetary Coronal Mass Ejections from In Situ Data: A Deep Learning Approach
- auteur
- Gautier Nguyen, Nicolas Aunai, Dominique Fontaine, Erwan Le Pennec, Joris van den Bossche, Alexis Jeandet, Brice Bakkali, Louis Vignoli, Bruno Regaldo-Saint Blancard
- article
- The Astrophysical Journal, 2019, 874 (2), pp.145. ⟨10.3847/1538-4357/ab0d24⟩
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-
- titre
- Predictive models avoid excessive reductionism in cognitive neuroimaging
- auteur
- Gaël Varoquaux, Russell Poldrack
- article
- Current Opinion in Neurobiology, In press, 55, ⟨10.1016/j.conb.2018.11.002⟩
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-
- titre
- Population shrinkage of covariance (PoSCE) for better individual brain functional-connectivity estimation
- auteur
- Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- Medical Image Analysis, 2019, ⟨10.1016/j.media.2019.03.001⟩
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-
- titre
- Exploration, inference and prediction in neuroscience and biomedicine
- auteur
- Danilo Bzdok, John P. A. Ioannidis
- article
- Trends in Neurosciences, 2019, ⟨10.1016/j.tins.2019.02.001⟩
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- titre
- Mapping the asynchrony of cortical maturation in the infant brain: a MRI multi-parametric clustering approach
- auteur
- Jessica Lebenberg, Jean-François Mangin, Bertrand Thirion, Cyril Poupon, Lucie Hertz-Pannier, François Leroy, Parvaneh Adibpour, Ghislaine Dehaene-Lambertz, Jessica Dubois
- article
- NeuroImage, 2019, 185, pp.641-653. ⟨10.1016/j.neuroimage.2018.07.022⟩
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-
- titre
- Reducing the number of samples in spatiotemporal dMRI acquisition design
- auteur
- Patryk Filipiak, Rutger H.J. Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, Philippe Ciuciu, Rachid Deriche, Demian Wassermann
- article
- Magnetic Resonance in Medicine, 2019, ⟨10.1002/mrm.27601⟩
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-
- titre
- Advances in computational and statistical diffusion MRI
- auteur
- Lauren J. O’Donnell, Alessandro Daducci, Demian Wassermann, Christophe Lenglet
- article
- NMR in Biomedicine, 2019, 32 (4), pp.e3805. ⟨10.1002/nbm.3805⟩
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-
- titre
- Neural Empirical Bayes
- auteur
- Saeed Saremi, Aapo Hyvärinen
- article
- Journal of Machine Learning Research, 2019, 20, pp.1 – 23
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-
Conference papers
- titre
- Fast adaptive scene sampling for single-photon 3D lidar images
- auteur
- Abderrahim Halimi, Philippe Ciuciu, Aongus Mccarthy, Stephen Mclaughlin, Gerald S Buller
- article
- IEEE CAMSAP 2019 – International Workshop on Computational Advances in Multi-Sensor Adaptive Processing, Dec 2019, Le Gosier (Guadeloupe), France
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- titre
- Manifold-regression to predict from MEG/EEG brain signals without source modeling
- auteur
- David Sabbagh, Pierre Ablin, Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Denis Engemann
- article
- NeurIPS 2019 – 33th Annual Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2019, Vancouver, Canada
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-
- titre
- Feature Grouping as a Stochastic Regularizer for High-Dimensional Structured Data
- auteur
- Sergül Aydöre, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- NeurIPS 2019 – 33th Annual Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2019, Vancouver, Canada
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-
- titre
- Comparing distributions: $l1$ geometry improves kernel two-sample testing
- auteur
- Meyer Scetbon, Gaël Varoquaux
- article
- NeurIPS 2019 – 33th Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2019, Vancouver, Canada
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-
- titre
- Handling correlated and repeated measurements with the smoothed multivariate square-root Lasso
- auteur
- Quentin Bertrand, Mathurin Massias, Alexandre Gramfort, Joseph Salmon
- article
- NeurIPS 2019 – Neural Information Processing Systems, Dec 2019, Vancouver, Canada
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-
- titre
- Learning step sizes for unfolded sparse coding
- auteur
- Pierre Ablin, Thomas Moreau, Mathurin Massias, Alexandre Gramfort
- article
- NeurIPS 2019 – Advances in Neural Information Processing Systems, Dec 2019, Vancouver, Canada
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-
- titre
- Self-supervised representation learning from electroencephalography signals
- auteur
- Hubert Banville, Isabela Albuquerque, Aapo Hyvärinen, Graeme Moffat, Denis-Alexander Engemann, Alexandre Gramfort
- article
- MLSP 2019 – IEEE 29th International Workshop on Machine Learning for Signal Processing, Oct 2019, Pittsburgh, United States
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-
- titre
- DAS3H: Modeling Student Learning and Forgetting for Optimally Scheduling Distributed Practice of Skills
- auteur
- Benoît Choffin, Fabrice Popineau, Yolaine Bourda, Jill-Jênn Vie
- article
- JDSE 2019 – Paris-Saclay Junior Conference on Data Science and Engineering, Sep 2019, Gif-sur-Yvette, France
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-
- titre
- fMRI BOLD signal decomposition using a multivariate low-rank model
- auteur
- Hamza Cherkaoui, Thomas Moreau, Abderrahim Halimi, Philippe Ciuciu
- article
- Eusipco 2019 – 27th European Signal Processing Conference, Sep 2019, Corunna, Spain
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- titre
- Online MR image reconstruction for compressed sensing acquisition in T2* imaging
- auteur
- Loubna El Gueddari, Emilie Chouzenoux, Alexandre Vignaud, Jean-Christophe Pesquet, Philippe Ciuciu
- article
- SPIE Conference – Wavelets and Sparsity XVIII, Aug 2019, San Diego, United States
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-
- titre
- Benchmarking proximal methods acceleration enhancements for CS-acquired MR image analysis reconstruction
- auteur
- Zaccharie Ramzi, Philippe Ciuciu, Jean-Luc Starck
- article
- SPARS 2019 – Signal Processing with Adaptive Sparse Structured Representations Workshop, Jul 2019, Toulouse, France
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-
- titre
- Exploiting regularity in sparse Generalized Linear Models
- auteur
- Mathurin Massias, Samuel Vaiter, Alexandre Gramfort, Joseph Salmon
- article
- SPARS 2019 – Signal Processing with Adaptive Sparse Structured Representations, Jul 2019, Toulouse, France
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-
- titre
- An Overview of the Topology ToolKit
- auteur
- Talha Bin Masood, Joseph Budin, Martin Falk, Guillaume Favelier, Christoph Garth, Charles Gueunet, Pierre Guillou, Lutz Hofmann, Petar Hristov, Adhitya Kamakshidasan, Christopher Kappe, Pavol Klacansky, Patrick Laurin, Joshua A Levine, Jonas Lukasczyk, Daisuke Sakurai, Maxime Soler, Peter Steneteg, Julien Tierny, Will Usher, Jules Vidal, Michal Wozniak
- article
- TopoInVis 2019 – Topological Methods in Data Analysis and Visualization, Jun 2019, Nykoping, Sweden
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-
- titre
- Group level MEG/EEG source imaging via optimal transport: minimum Wasserstein estimates
- auteur
- Hicham Janati, Thomas Bazeille, Bertrand Thirion, Marco Cuturi, Alexandre Gramfort
- article
- IPMI 2019 – 26th international conference on Information Processing in Medical Imaging, Jun 2019, Hong Kong, Hong Kong SAR China
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-
- titre
- ECKO: Ensemble of Clustered Knockoffs for robust multivariate inference on MRI data
- auteur
- Tuan-Binh Nguyen, Jérôme-Alexis Chevalier, Bertrand Thirion
- article
- IPMI 2019 – International Conference on Information Processing in Medical Imaging, Jun 2019, Hong Kong, Hong Kong SAR China. ⟨10.1007/978-3-030-20351-1_35⟩
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-
- titre
- Local Optimal Transport for Functional Brain Template Estimation
- auteur
- Thomas Bazeille, Hugo Richard, Hicham Janati, Bertrand Thirion
- article
- IPMI 2019 – 26th International Conference on Information Processing in Medical Imaging, Jun 2019, Hong Kong, China. ⟨10.1007/978-3-030-20351-1_18⟩
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-
- titre
- Sparsity-based blind deconvolution of neural activation signal in fMRI
- auteur
- Hamza Cherkaoui, Thomas Moreau, Abderrahim Halimi, Philippe Ciuciu
- article
- IEEE-ICASSP 2019 – International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing, May 2019, Brighton, United Kingdom
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-
- titre
- Online compressed sensing MR image reconstruction for high resolution T2* imaging
- auteur
- Loubna El Gueddari, Philippe Ciuciu, Emilie Chouzenoux, Alexandre Vignaud, Jean-Christophe Pesquet
- article
- ISMRM 2019 – 27th Annual Meeting and Exhibition, May 2019, Montréal, Canada
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-
- titre
- 3D SPARKLING for accelerated ex vivo T2*-weighted MRI with compressed sensing
- auteur
- Carole Lazarus, Pierre Weiss, Franck Mauconduit, Alexandre Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- ISMRM 2019 – 27th Annual Meeting & Exhibition, May 2019, Montréal, France
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-
- titre
- OSCAR-based reconstruction for compressed sensing and parallel MR imaging
- auteur
- Loubna El Gueddari, Philippe Ciuciu, Emilie Chouzenoux, Alexandre Vignaud, Jean-Christophe Pesquet
- article
- ISMRM 2019 – 27th Annual Meeting and Exhibition, May 2019, Montréal, Canada
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-
- titre
- A quasi-Newton algorithm on the orthogonal manifold for NMF with transform learning
- auteur
- Pierre Ablin, Dylan Fagot, Herwig Wendt, Alexandre Gramfort, Cédric Févotte
- article
- IEEE-ICASSP 2019 – International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing, May 2019, Brighton, United Kingdom
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-
- titre
- Beyond Pham’s algorithm for joint diagonalization
- auteur
- Pierre A Ablin, Jean-François Cardoso, Alexandre Gramfort
- article
- ESSAN 2019 – 27th European symposium on artificial neural networks, Apr 2019, Bruges, Belgium
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Wasserstein regularization for sparse multi-task regression
- auteur
- Hicham Janati, Marco Cuturi, Alexandre Gramfort
- article
- AISTATS 2019 – 22nd International Conference on Artificial Intelligence and Statistics, Apr 2019, Naha, Japan
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-
- titre
- Stochastic algorithms with descent guarantees for ICA
- auteur
- Pierre Ablin, Alexandre Gramfort, Jean-François Cardoso, Francis Bach
- article
- AISTATS 2019 – 22nd International Conference on Artificial Intelligence and Statistics, Apr 2019, Naha, Japan
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Multifractal analysis for cumulant-based epileptic seizure detection in eeg time series
- auteur
- Omar D Domingues, Philippe Ciuciu, Daria La Rocca, Patrice Abry, Herwig Wendt
- article
- ISBI 2019 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venise, Italy
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Coarse-Grained Spatiotemporal Acquisition Design for Diffusion MRI
- auteur
- Patryk Filipiak, Rutger Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, Rachid Deriche, Demian Wassermann
- article
- ISBI 2019 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Calibrationless oscar-based image reconstruction in compressed sensing parallel MRI
- auteur
- Loubna El Gueddari, Philippe Ciuciu, Emilie Chouzenoux, Alexandre Vignaud, Jean-Christophe Pesquet
- article
- ISBI 2019 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venise, Italy. ⟨10.1109/isbi.2019.8759393⟩
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-
Book sections
- titre
- MNE: Software for Acquiring, Processing, and Visualizing MEG/EEG Data
- auteur
- Lorenz Esch, Christoph Dinh, Eric Larson, Denis Engemann, Mainak Jas, Sheraz Khan, Alexandre Gramfort, Matti Hämäläinen
- article
- Magnetoencephalography, Springer International Publishing, pp.355-371, 2019, ⟨10.1007/978-3-030-00087-5_59⟩
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-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Microstructure, Macrostructure, and Cognition. A walk in Diffusion MRI
- auteur
- Demian Wassermann
- article
- Biological Physics [physics.bio-ph]. Sorbonne Université, 2019
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-
Poster communications
- titre
- A Novel Sulcal Hierarchy Based on Manually Labelled Sulci
- auteur
- Antonia Machlouzarides-Shalit, Valentin Iovene, Nikos Makris, Demian Wassermann
- article
- Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy
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-
Reports
- titre
- Anisotropic compressed sensing for non-Cartesian MRI acquisitions
- auteur
- Philippe Ciuciu, Anna Kazeykina
- article
- [Research Report] CEA Paris Saclay; INRIA; Université Paris Sud, Université Paris Saclay. 2019
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-
Theses
- titre
- Sparse high dimensional regression in the presence of colored heteroscedastic noise: application to M/EEG source imaging
- auteur
- Mathurin Massias
- article
- Machine Learning [stat.ML]. Telecom Paristech, 2019. English. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- Statistical learning with high-cardinality string categorical variables
- auteur
- Patricio Cerda Reyes
- article
- Machine Learning [cs.LG]. Université Paris-Saclay, 2019. English. ⟨NNT : 2019SACLS470⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Exploration of multivariate EEG /MEG signals using non-stationary models
- auteur
- Pierre Ablin
- article
- Machine Learning [stat.ML]. Université Paris Saclay (COmUE), 2019. English. ⟨NNT : 2019SACLT051⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Statistical models for comprehensive meta-analyses of neuroimaging studies
- auteur
- Jérôme Dockès
- article
- Machine Learning [stat.ML]. Télécom ParisTech, 2019. English. ⟨NNT : ⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Spatio-Temporal Alignments: Optimal transport through space and time
- auteur
- Hicham Janati, Marco Cuturi, Alexandre Gramfort
- article
- 2019
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Multi-subject MEG/EEG source imaging with sparse multi-task regression
- auteur
- Hicham Janati, Thomas Bazeille, Bertrand Thirion, Marco Cuturi, Alexandre Gramfort
- article
- 2019
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Calibration-less parallel imaging compressed sensing reconstruction based on OSCAR regularization
- auteur
- Loubna El Gueddari, Emilie Chouzenoux, Alexandre Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- 2019
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Deep learning for brains?: Different linear and nonlinear scaling in UK Biobank brain images vs. machine-learning datasets
- auteur
- Marc-Andre Schulz, B T Thomas Yeo, Joshua T Vogelstein, Janaina Mourao-Miranada, Jakob N. Kather, Konrad Kording, Blake Aaron Richards, Danilo Bzdok
- article
- 2019
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- 3D SPARKLING trajectories for high-resolution T2*-weighted Magnetic Resonance imaging
- auteur
- Carole Lazarus, Pierre Weiss, Loubna El Gueddari, Franck Mauconduit, Alexandre Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- 2019
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Semantic coding in the occipital cortex of early blind individuals
- auteur
- Sami Abboud, Denis Engemann, Laurent Cohen
- article
- 2019
- Accès au bibtex
-
2018
Journal articles
- titre
- Atlases of cognition with large-scale human brain mapping
- auteur
- Gaël Varoquaux, Yannick Schwartz, Russell A Poldrack, Baptiste Gauthier, Danilo Bzdok, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- PLoS Computational Biology, 2018, 14 (11), pp.e1006565. ⟨10.1371/journal.pcbi.1006565⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Subspecialization within default mode nodes characterized in 10,000 UK Biobank participants
- auteur
- Julius M Kernbach, B T Thomas Yeo, Jonathan Smallwood, Daniel Margulies, Michel Thiebaut de Schotten, Henrik Walter, Mert Sabuncu, Avram J Holmes, Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, Danilo Bzdok
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2018, ⟨10.1073/pnas.1804876115⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Time-accurate multi-scale anisotropic mesh adaptation for unsteady flows in CFD
- auteur
- Frédéric Alauzet, A. Loseille, G. Olivier
- article
- Journal of Computational Physics, 2018, 373, pp.28-63. ⟨10.1016/j.jcp.2018.06.043⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Robust EEG-based cross-site and cross-protocol classification of states of consciousness
- auteur
- Denis Engemann, Federico Raimondo, Jean-Remi King, Benjamin Rohaut, Gilles Louppe, Frédéric Faugeras, Jitka Annen, Helena Cassol, Olivia Gosseries, Diego Fernandez-Slezak, Steven Laureys, Lionel Naccache, Stanislas Dehaene, Jacobo Sitt
- article
- Brain – A Journal of Neurology , 2018, 141 (11), pp.3179-3192. ⟨10.1093/brain/awy251⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- A Reproducible MEG/EEG Group Study With the MNE Software: Recommendations, Quality Assessments, and Good Practices
- auteur
- Mainak Jas, Eric Larson, Denis Engemann, Jaakko Leppäkangas, Samu Taulu, Matti Hämäläinen, Alexandre Gramfort
- article
- Frontiers in Neuroscience, 2018, 12, ⟨10.3389/fnins.2018.00530⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Faster Independent Component Analysis by Preconditioning With Hessian Approximations
- auteur
- Pierre A Ablin, Jean-François Cardoso, Alexandre Gramfort
- article
- IEEE Transactions on Signal Processing, 2018, 66 (15), pp.4040-4049
- Accès au bibtex
-
- titre
- A hierarchical Bayesian perspective on majorization-minimization for non-convex sparse regression: application to M/EEG source imaging
- auteur
- Yousra Bekhti, Felix Lucka, Joseph Salmon, Alexandre Gramfort
- article
- Inverse Problems, 2018, 34 (8), pp.085010
- Accès au bibtex
-
- titre
- Multivariate single-subject analysis of short-term reorganization in the language network
- auteur
- Gesa Hartwigsen, Danilo Bzdok
- article
- Cortex, 2018, pp.4. ⟨10.1016/j.cortex.2018.06.013⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Shared Endo-phenotypes of Default Mode Dysfunction in Attention Deficit/Hyperactivity Disorder and Autism Spectrum Disorder
- auteur
- Julius M Kernbach, Theodore D Satterthwaite, Danielle S. Bassett, Jonathan Smallwood, Daniel Margulies, Sarah Krall, Philip Shaw, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, Kerstin Konrad, Danilo Bzdok
- article
- Translational Psychiatry, 2018, 8 (1), pp.133. ⟨10.1038/s41398-018-0179-6⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Individual Brain Charting, a high-resolution fMRI dataset for cognitive mapping
- auteur
- Ana Luísa Pinho, Alexis Amadon, Torsten Ruest, Murielle Fabre, Elvis Dohmatob, Isabelle Denghien, Chantal Ginisty, Séverine Becuwe-Desmidt, Séverine Roger, Laurence Laurier, Véronique Joly-Testault, Gaëlle Médiouni-Cloarec, Christine Doublé, Bernadette Martins, Philippe Pinel, Evelyn Eger, Gael Varoquaux, Christophe Pallier, Stanislas Dehaene, Lucie Hertz-Pannier, Bertrand Thirion
- article
- Scientific Data , 2018, 5, pp.180105. ⟨10.1038/sdata.2018.105⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Similarity encoding for learning with dirty categorical variables
- auteur
- Patricio Cerda, Gaël Varoquaux, Balázs Kégl
- article
- Machine Learning, 2018, ⟨10.1007/s10994-018-5724-2⟩
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-
- titre
- Patterns of thought: population variation in the associations between large-scale network organisation and self-reported experiences at rest
- auteur
- Hao-Ting Wang, Danilo Bzdok, Daniel Margulies, Cameron Craddock, Michael Milham, Elizabeth Jefferies, Jonathan Smallwood
- article
- NeuroImage, 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A comparison of three fiber tract delineation methods and their impact on white matter analysis
- auteur
- Valerie Sydnor, Ana María Rivas-Grajales, Amanda Lyall, Fan Zhang, Sylvain Bouix, Sarina Karmacharya, Martha Shenton, Carl-Fredrik Westin, Nikos Makris, Demian Wassermann, Lauren J. O’Donnell, Marek Kubicki
- article
- NeuroImage, 2018, 178, pp.318-331. ⟨10.1016/j.neuroimage.2018.05.044⟩
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-
- titre
- Statistics versus Machine Learning
- auteur
- Danilo Bzdok, Naomi Altman, Martin Krzywinski
- article
- Nature Methods, 2018, 15, pp.233-234
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Prediction of activation patterns preceding hallucinations in patients with schizophrenia using machine learning with structured sparsity
- auteur
- Amicie de Pierrefeu, Thomas Fovet, Fouad Hadj-Selem, Tommy Lofstedt, Philippe Ciuciu, Stephanie Lefebvre, Pierre Thomas, Renaud Lopes, Renaud Jardri, Edouard Duchesnay
- article
- Human Brain Mapping, 2018, 39 (4), pp.1777 – 1788. ⟨10.1002/hbm.23953⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Inter-subject registration of functional images: do we need anatomical images ?
- auteur
- Elvis Dohmatob, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- Frontiers in Neuroscience, In press
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A deep learning architecture for temporal sleep stage classification using multivariate and multimodal time series
- auteur
- Stanislas Chambon, Mathieu Galtier, Pierrick J Arnal, Gilles Wainrib, Alexandre Gramfort
- article
- IEEE Transactions on Neural Systems and Rehabilitation Engineering, 2018, 26 (4), pp.17683810. ⟨10.1109/TNSRE.2018.2813138⟩
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-
- titre
- Machine learning for precision psychiatry: Opportunites and challenges
- auteur
- Danilo Bzdok, Andreas Meyer-Lindenberg
- article
- Biological Psychiatry: Cognitive Neuroscience and Neuroimaging, 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Structured Sparse Principal Components Analysis With the TV-Elastic Net Penalty
- auteur
- Amicie de Pierrefeu, Tommy Lofstedt, Fouad Hadj-Selem, Mathieu Dubois, Renaud Jardri, Thomas Fovet, Philippe Ciuciu, Vincent Frouin, Edouard Duchesnay
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2018, 37 (2), pp.396 – 407. ⟨10.1109/tmi.2017.2749140⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- GraphVar 2.0: a user-friendly toolbox for machine learning on functional connectivity measures
- auteur
- Lea Waller, A Brovkin, L Dorfschmidt, Danilo Bzdok, H Walter, J D Kruschwitz
- article
- Journal of Neuroscience Methods, 2018, pp.40
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Machine learning: Supervised methods, SVM and kNN
- auteur
- Danilo Bzdok, Martin Krzywinski, Naomi Altman
- article
- Nature Methods, 2018, pp.1-6
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Different shades of default mode disturbance in schizophrenia: Subnodal covariance estimation in structure and function
- auteur
- Jeremy Lefort-Besnard, Danielle S Bassett, Jonathan Smallwood, Daniel S. Margulies, Birgit Derntl, Oliver Gruber, Andre Aleman, Renaud Jardri, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, Simon B. Eickhoff, Danilo Bzdok
- article
- Human Brain Mapping, 2018, pp.1-52
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Convex Optimization approach to signals with fast varying instantaneous frequency
- auteur
- Matthieu Kowalski, Adrien Meynard, Hau-Tieng Wu
- article
- Applied and Computational Harmonic Analysis, 2018, 44 (1), pp.89 – 122. ⟨10.1016/j.acha.2016.03.008⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Stochastic Subsampling for Factorizing Huge Matrices
- auteur
- Arthur Mensch, Julien Mairal, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- IEEE Transactions on Signal Processing, 2018, 66 (1), pp.113-128. ⟨10.1109/TSP.2017.2752697⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Atlases of cognition with large-scale brain mapping
- auteur
- Gaël Varoquaux, Yannick Schwartz, Russell Poldrack, Baptiste Gauthier, Danilo Bzdok, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- PLoS Computational Biology, In press
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Identifying a neuroanatomical signature of schizophrenia, reproducible across sites and stages, using machine learning with structured sparsity
- auteur
- Amicie de Pierrefeu, Tommy Löfstedt, Charles Laidi, Fouad Hadj-Selem, J. Bourgin, Tomas Hajek, Filip Spaniel, Marian Kolenic, Philippe Ciuciu, Nora Hamdani, Marion Leboyer, Thomas Fovet, Renaud Jardri, Josselin Houenou, Edouard Duchesnay
- article
- Acta Psychiatrica Scandinavica, 2018, 2018, pp.1 – 10. ⟨10.1111/acps.12964⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Genetic load determines atrophy in hand cortico-striatal pathways in presymptomatic Huntington’s disease
- auteur
- Yi Hong, Lauren J O’Donnell, Peter Savadjiev, Fan Zhang, Demian Wassermann, Ofer Pasternak, Hans J Johnson, Jane Paulsen, Jean-Paul Vonsattel, Nikolaos Makris, Carl-Fredrik Westin, Yogesh Rathi
- article
- Human Brain Mapping, In press, ⟨10.1002/hbm.24217⟩
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-
- titre
- Patterns of Schizophrenia Symptoms: Hidden Structure in the PANSS Questionnaire
- auteur
- Jeremy Lefort-Besnard, Gaël Varoquaux, Birgit Derntl, Oliver Gruber, Andre Aleman, Renaud Jardri, Iris Sommer, Bertrand Thirion, Danilo Bzdok
- article
- Translational Psychiatry, In press, ⟨10.1038/s41398-018-0294-4⟩
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-
- titre
- Optimization of classification and regression analysis of four monoclonal antibodies from Raman spectra using collaborative machine learning approach
- auteur
- Laetitia Minh Maï Le, Balázs Kégl, Alexandre Gramfort, Camille Marini, David Nguyen, Mehdi Cherti, Sana Tfaili, Ali Tfayli, Arlette Baillet-Guffroy, Patrice Prognon, Pierre Chaminade, Eric Caudron
- article
- Talanta, 2018, 184, pp.260-265. ⟨10.1016/j.talanta.2018.02.109⟩
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-
- titre
- An Empirical Study of the Maximum Degree of Undersampling in Compressed Sensing for T2*-weighted MRI
- auteur
- Carole Lazarus, Pierre Weiss, Alexandre Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- Magnetic Resonance Imaging, In press, pp.1-31
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-
- titre
- Continuation of Nesterov’s Smoothing for Regression with Structured Sparsity in High-Dimensional Neuroimaging
- auteur
- Fouad Hadj-Selem, Tommy Lofstedt, Elvis Dohmatob, Vincent Frouin, Mathieu Dubois, Vincent Guillemot, Edouard Duchesnay
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, In press, 2018, ⟨10.1109/TMI.2018.2829802⟩
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-
Conference papers
- titre
- Multivariate Convolutional Sparse Coding for Electromagnetic Brain Signals
- auteur
- Tom Dupré La Tour, Thomas Moreau, Mainak Jas, Alexandre Gramfort
- article
- Advances in Neural Information Processing Systems (NeurIPS), Dec 2018, Montréal, Canada
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-
- titre
- Dmipy, a Diffusion Microstructure Imaging toolbox in Python to improve research reproducibility
- auteur
- Abib Alimi, Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Rachid Deriche
- article
- MICCAI 2018 – Workshop on Computational Diffusion MRI, Sep 2018, Granada, Spain
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-
- titre
- A deep learning architecture to detect events in EEG signals during sleep
- auteur
- Stanislas Chambon, Valentin Thorey, Pierrick J Arnal, Emmanuel Mignot, Alexandre Gramfort
- article
- MLSP 2018 – IEEE International Workshop on Machine Learning for Signal Processing, Sep 2018, Aalborg, Denmark
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-
- titre
- Solving the Cross-Subject Parcel Matching Problem using Optimal Transport
- auteur
- Guillermo Gallardo, Nathalie Gayraud, Rachid Deriche, Maureen Clerc, Samuel Deslauriers-Gauthier, Demian Wassermann
- article
- International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention 2018, Sep 2018, Granada, Spain
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- titre
- Text to brain: predicting the spatial distribution of neuroimaging observations from text reports
- auteur
- Jérôme Dockès, Demian Wassermann, Russell Poldrack, Fabian M. Suchanek, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- MICCAI 2018 – 21st International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2018, Granada, Spain. pp.1-18
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-
- titre
- Optimizing deep video representation to match brain activity
- auteur
- Hugo Richard, Ana Pinho, Bertrand Thirion, Guillaume Charpiat
- article
- CCN 2018 – Conference on Cognitive Computational Neuroscience, Sep 2018, Philadelphia, United States
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-
- titre
- Scale-free functional connectivity analysis from source reconstructed MEG data
- auteur
- Daria La Rocca, Philippe Ciuciu, V van Wassenhove, H Wendt, Patrice Abry, R Leonarduzzi
- article
- EUSIPCO 2018 – 26th European Signal Processing Conference, Sep 2018, Roma, Italy. pp.1-5
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-
- titre
- Analysis vs Synthesis-based Regularization for combined Compressed Sensing and Parallel MRI Reconstruction at 7 Tesla
- auteur
- H. Cherkaoui, L. El Gueddari, C. Lazarus, A. Grigis, F. Poupon, A. Vignaud, S. Farrens, J.-L. Starck, Philippe Ciuciu
- article
- 26th European Signal Processing Conference (EUSIPCO 2018), Sep 2018, Roma, Italy
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-
- titre
- Celer: a Fast Solver for the Lasso with Dual Extrapolation
- auteur
- Mathurin Massias, Alexandre Gramfort, Joseph Salmon
- article
- ICML 2018 – 35th International Conference on Machine Learning, Jul 2018, Stockholm, Sweden. pp.3321-3330
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-
- titre
- Frank-Wolfe with Subsampling Oracle
- auteur
- Thomas Kerdreux, Fabian Pedregosa, Alexandre d’Aspremont
- article
- ICML 2018 – 35th International Conference on Machine Learning, Jul 2018, Stockholm, Sweden
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-
- titre
- Self-calibrating nonlinear reconstruction algorithms for variable density sampling and parallel reception MRI
- auteur
- Loubna El Gueddari, C. Lazarus, H Carrié, A. Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- 10th IEEE Sensor Array and Multichannel Signal Processing workshop, Jul 2018, Sheffield, United Kingdom. pp.1-5
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-
- titre
- Accelerating likelihood optimization for ICA on real signals
- auteur
- Pierre A Ablin, Jean-François Cardoso, Alexandre Gramfort
- article
- LVA-ICA 2018, Jul 2018, Guildford, United Kingdom
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-
- titre
- Differentiable Dynamic Programming for Structured Prediction and Attention
- auteur
- Arthur Mensch, Mathieu Blondel
- article
- 35th International Conference on Machine Learning, Jul 2018, Stockholm, Sweden
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-
- titre
- Sulcal Neuroanatomy and Relative Relationships using Spatial Gradients
- auteur
- Antonia Machlouzarides-Shalit, Guillermo Gallardo, Demian Wassermann
- article
- Organization of Human Brain Mapping, Jun 2018, Singapore, Singapore
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-
- titre
- Reducing false positive connection in tractograms using joint structure-function filtering
- auteur
- Matteo Frigo, Guillermo Gallardo, Isa Costantini, Alessandro Daducci, Demian Wassermann, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier
- article
- OHBM 2018 – Organization for Human Brain Mapping, Jun 2018, Singapore, Singapore. pp.1-3
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-
- titre
- A standardised representation for non-parametric fMRI results
- auteur
- Camille Maumet, Guillaume Flandin, Martin Perez-Guevara, Jean-Baptiste Poline, Justin Rajendra, Richard Reynolds, Bertrand Thirion, Thomas E. Nichols
- article
- OHBM 2018 – Annual meeting of the Organization of Human Brain Mapping, Jun 2018, Singapore, Singapore. pp.1-4
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- titre
- Diffusion Driven Label Fusion for White Matter Multi-Atlas Segmentation
- auteur
- Guillermo Gallardo, Sylvain Bouix, Demian Wassermann
- article
- OHBM 2018 – Organization for Human Brain Mapping, Jun 2018, Singapore, Singapore. pp.1-2
- Accès au texte intégral et bibtex
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- titre
- Solving the Cross-Subject Parcel Matching Problem: Comparing Four Methods Using Extrinsic Connectivity
- auteur
- Nathalie T H Gayraud, Guillermo Gallardo, Maureen Clerc, Demian Wassermann
- article
- OHBM 2018, Jun 2018, Singapore, Singapore
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- titre
- Controlling a confound in predictive models with a test set minimizing its effect
- auteur
- Darya Chyzhyk, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, Michael Milham
- article
- PRNI 2018 – 8th International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging, Jun 2018, Singapore, Singapore. pp.1-4
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- titre
- Interpretable and stable prediction of schizophrenia on a large multisite dataset using machine learning with structured sparsity
- auteur
- Amicie de Pierrefeu, Tommy Lofstedt, Charles Laidi, Fouad Hadj-Selem, Marion Leboyer, Philippe Ciuciu, Josselin Houenou, Edouard Duchesnay
- article
- 2018 International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging (PRNI), Jun 2018, Singapore, Singapore. ⟨10.1109/PRNI.2018.8423946⟩
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-
- titre
- Driver estimation in non-linear autoregressive models
- auteur
- Tom Dupré La Tour, Yves Grenier, Alexandre Gramfort
- article
- 43nd IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing (ICASSP 2018), Apr 2018, Calgary, Canada
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-
- titre
- An ensemble learning approach to detect epileptic seizures from long intracranial EEG recordings
- auteur
- Jean-Baptiste Schiratti, Jean-Eudes Le Douget, Michel Le van Quyen, Slim Essid, Alexandre Gramfort
- article
- ICASSP 2018 – 2018 IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing (ICASSP, Apr 2018, Calgary, Canada
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-
- titre
- Generalized Concomitant Multi-Task Lasso for Sparse Multimodal Regression
- auteur
- Mathurin Massias, Olivier Fercoq, Alexandre Gramfort, Joseph Salmon
- article
- 21st International Conference on Artificial Intelligence and Statistics (AISTATS 2018), Apr 2018, Lanzarote, Spain
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-
- titre
- Spatially regularized wavelet leader scale-free analysis of fMRI data
- auteur
- Herwig Wendt, Patrice Abry, Philippe Ciuciu
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington, DC, United States
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-
- titre
- Faster ICA under orthogonal constraint
- auteur
- Pierre Ablin, Jean-François Cardoso, Alexandre Gramfort
- article
- International Conference on Acoustics, Speech, & Signal Processing, 2018, Calgary, Canada
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-
- titre
- Statistical Inference with Ensemble of Clustered Desparsified Lasso
- auteur
- Jérôme-Alexis Chevalier, Joseph Salmon, Bertrand Thirion
- article
- MICCAI, 2018, Grenade, Spain
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-
Poster communications
- titre
- OpenMEEG software for forward problems, coping with non-nested geometries
- auteur
- Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo
- article
- International Conference on Biomagnetism, Aug 2018, Philadelphia, United States
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-
- titre
- The RAMP framework: from reproducibility to transparency in the design and optimization of scientific workflows
- auteur
- Balázs Kégl, Alexandre Boucaud, Mehdi Cherti, Akin Osman Kazakci, Alexandre Gramfort, Guillaume M Lemaitre, Joris van den Bossche, Djalel Benbouzid, Camille Marini
- article
- International Conference On Machine Learning, Jul 2018, Stockholm, Sweden
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-
- titre
- Bridging Brain Structure and Function by Correlating Structural Connectivity and Cortico-Cortical Transmission
- auteur
- Fabien Almairac, Patryk Filipiak, Lavinia Slabu, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Denys Fontaine, Lydiane Mondot, Stéphan Chanelet, Demian Wassermann, Rachid Deriche
- article
- 2nd C@UCA meeting, Jun 2018, Frejus, France
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-
- titre
- Sensing Von Economo Neurons in the Insula with Multi-shell Diffusion MRI
- auteur
- Demian Wassermann, Dang Van Nguyen, Guillermo Gallardo, Jing-Rebecca Li, Weidong Cai, Vinod Menon
- article
- International Society for Magnetic Resonance in Medicine, 2018, Paris, France
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-
Theses
- titre
- Learning representations from functional MRI data
- auteur
- Arthur Mensch
- article
- Machine Learning [stat.ML]. Université Paris Saclay (COmUE), 2018. English. ⟨NNT : 2018SACLS300⟩
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-
- titre
- Compressed Sensing in MRI : optimization-based design of k-space filling curves for accelerated MRI
- auteur
- Carole Lazarus
- article
- Signal and Image processing. Université Paris Saclay (COmUE), 2018. English. ⟨NNT : 2018SACLS309⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Approximate message-passing for convex optimization with non-separable penalties
- auteur
- Andre Manoel, Florent Krzakala, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux, Lenka Zdeborová
- article
- 2018
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-
- titre
- Variable-density k-space filling curves for accelerated Magnetic Resonance Imaging
- auteur
- Carole Lazarus, Pierre Weiss, N. Chauffert, F. Mauconduit, Loubna El Gueddari, Christophe Destrieux, I. Zemmoura, A. Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- 2018
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-
- titre
- Encoding and Decoding Neuronal Dynamics: Methodological Framework to Uncover the Algorithms of Cognition
- auteur
- Jean-Rémi King, Laura Gwilliams, Chris Holdgraf, Jona Sassenhagen, Alexandre Barachant, Denis Engemann, Eric Larson, Alexandre Gramfort
- article
- 2018
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-
- titre
- Prediction and inference diverge in biomedicine: Simulations and real-world data
- auteur
- Danilo Bzdok, Denis Engemann, Olivier Grisel, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- 2018
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-
- titre
- Single-Subject Prediction: A Statistical Paradigm for Precision Psychiatry
- auteur
- Danilo Bzdok, Teresa M Karrer
- article
- 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2017
Journal articles
- titre
- Non-linear auto-regressive models for cross-frequency coupling in neural time series
- auteur
- Tom Dupré La Tour, Lucille Tallot, Laetitia Grabot, Valérie Doyère, Virginie van Wassenhove, Yves Grenier, Alexandre Gramfort
- article
- PLoS Computational Biology, 2017, 13 (12), pp.e1005893. ⟨10.1371/journal.pcbi.1005893⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Survival and consciousness recovery are better in the minimally conscious state than in the vegetative state
- auteur
- Frédéric Faugeras, Benjamin Rohaut, Mélanie Valente, Jacobo Sitt, Sophie Demeret, Francis Bolgert, Nicolas Weiss, Alexandra Grinea, Clémence Marois, Marion Quirins, Athena Demertzi, Federico Raimondo, Damien Galanaud, Marie-Odile Habert, Denis Engemann, Louis Puybasset, Lionel Naccache
- article
- Brain Injury, 2017, 32 (1), pp.72 – 77. ⟨10.1080/02699052.2017.1364421⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Machine learning: A primer
- auteur
- Danilo Bzdok, Martin Krzywinski, Naomi Altman
- article
- Nature Methods, 2017, 14 (12), pp.1119-1120
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Classical Statistics and Statistical Learning in Imaging Neuroscience
- auteur
- Danilo Bzdok
- article
- Frontiers in Human Neuroscience, 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Brain-heart interactions reveal consciousness in noncommunicating patients
- auteur
- Federico Raimondo, Benjamin Rohaut, Athena Demertzi, Mélanie Valente, Denis Engemann, Moti Salti, Diego Fernández Slezak, Lionel Naccache, Jacobo Sitt
- article
- Annals of Neurology, 2017, 82 (4), pp.578 – 591. ⟨10.1002/ana.25045⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Decoding fMRI activity in the time domain improves classification performance
- auteur
- João Loula, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- NeuroImage, 2017, ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.08.018⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dopamine Transporter and Reward Anticipation in a Dimensional Perspective: A Multimodal Brain Imaging Study
- auteur
- Manon Dubol, Christian Trichard, Claire Leroy, Anca-Larisa Sandu, Mehdi Rahim, Bernard Granger, Eleni T Tzavara, Laurent Karila, Jean-Luc Martinot, Eric Artiges
- article
- Neuropsychopharmacology, 2017, ⟨10.1038/npp.2017.183⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Dimensions of Experience: Exploring the Heterogeneity of the Wandering Mind
- auteur
- Hao-Ting Wang, Poerio Guilia, Charlotte Murphy, Danilo Bzdok, Elizabeth Jefferies, Jonathan Smallwood
- article
- Psychological Science, 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Varieties of semantic cognition revealed through simultaneous decomposition of intrinsic brain connectivity and behaviour
- auteur
- Deniz Vatansever, Danilo Bzdok, Hao-Ting Wang, Giovanna Mollo, Mladen Sormaz, Charlotte Murphy, Theodoros Karapanagiotidis, Jonathan Smallwood, Elizabeth Jefferies
- article
- NeuroImage, 2017, pp.34. ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.06.067⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Joint prediction of multiple scores captures better individual traits from brain images
- auteur
- Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Danilo Bzdok, Irène Buvat, Gaël Varoquaux
- article
- NeuroImage, 2017, ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.06.072⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Cross-validation failure: small sample sizes lead to large error bars
- auteur
- Gaël Varoquaux
- article
- NeuroImage, 2017, ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.06.061⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Bayesian Non-Parametric Hidden Markov Random Model for Hemodynamic Brain Parcellation
- auteur
- Mohanad Albughdadi, Lotfi Chaari, Jean-Yves Tourneret, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
- article
- Signal Processing, 2017, 135, pp.132-146. ⟨10.1016/j.sigpro.2017.01.005⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- 286. Dopamine Transporter and Reward Anticipation in Psychiatric Patients: A Positron Emission Tomography and Functional Magnetic Resonance Imaging Study
- auteur
- Manon Dubol, Christian Trichard, Anca Larisa Sandu, Claire Leroy, Mehdi Rahim, Jean-Luc Martinot, Eric Artiges
- article
- Biological Psychiatry, 2017, 81 (10), pp.S117 – S118. ⟨10.1016/j.biopsych.2017.02.300⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Inference in the age of big data: Future perspectives on neuroscience
- auteur
- Danilo Bzdok, B T Thomas Yeo
- article
- NeuroImage, 2017, ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.04.061⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Best Practices in Data Analysis and Sharing in Neuroimaging using MRI
- auteur
- Thomas E Nichols, Samir Das, Simon B. Eickhoff 3, Alan C Evans, Tristan Glatard, Michael Hanke, Nikolaus Kriegeskorte, Michael P Milham, Russell A Poldrack, Jean-Baptiste P Poline, Erika P Proal, Bertrand Thirion, David van Essen, Tonya White, B.T. Thomas Yeo
- article
- Nature Neuroscience, 2017, 20, pp.299-303. ⟨10.1038/nn.4500⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Projection Method on Measures Sets
- auteur
- Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Jonas Kahn, Pierre Weiss
- article
- Constructive Approximation, 2017, 45 (1), pp.83 – 111. ⟨10.1007/s00365-016-9346-2⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Computing the social brain connectome across systems and states
- auteur
- Daniel T Alcalá-López, Jonathan Smallwood, Elizabeth Jefferies, Frank B van Overwalle, Kai Vogeley, Rogier B Mars, Bruce B Turetsky, Angela R Laird, Peter T Fox, Simon B Eickhoff, Danilo Bzdok
- article
- Cerebral Cortex, 2017, 28 (7), pp.2207-2232. ⟨10.1093/cercor/bhx121⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Imbalanced-learn: A Python Toolbox to Tackle the Curse of Imbalanced Datasets in Machine Learning
- auteur
- Guillaume Lemaitre, Fernando Nogueira, Christos K Aridas
- article
- Journal of Machine Learning Research, 2017, 18, pp.1 – 5
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- On the Consistency of Ordinal Regression Methods
- auteur
- Fabian Pedregosa, Francis Bach, Alexandre Gramfort
- article
- Journal of Machine Learning Research, 2017, 18, pp.1 – 35
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Autoreject: Automated artifact rejection for MEG and EEG data
- auteur
- Mainak Jas, Denis A Engemann, Yousra Bekhti, Federico A Raimondo, Alexandre Gramfort
- article
- NeuroImage, 2017, ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.06.030⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Distinct alterations in Parkinson’s Medication-state and Disease-state Connectivity Running Title: PD altered connectivity
- auteur
- Bernard Ng, Gaël Varoquaux, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion, Michael D. Greicius, Kathleen L Poston
- article
- Neuroimage-Clinical, 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- FReM – scalable and stable decoding with fast regularized ensemble of models
- auteur
- Andrés A Hoyos-Idrobo, Gaël Varoquaux, Yannick Schwartz, Bertrand Thirion
- article
- NeuroImage, 2017, pp.1-16. ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.10.005⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Learning the Morphology of Brain Signals Using Alpha-Stable Convolutional Sparse Coding
- auteur
- Mainak Jas, Tom Dupré La Tour, Umut Şimşekli, Alexandre Gramfort
- article
- Advances in neural information processing systems, Dec 2017, Long Beach, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Learning Neural Representations of Human Cognition across Many fMRI Studies
- auteur
- Arthur Mensch, Julien Mairal, Danilo Bzdok, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- Neural Information Processing Systems, Dec 2017, Long Beach, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Label scarcity in biomedicine: Data-rich latent factor discovery enhances phenotype prediction
- auteur
- Marc-Andre Schulz, Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion, Danilo Bzdok
- article
- Neural Information Processing Systems, Machine Learning in Health Workshop, Dec 2017, Long Beach, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Population-shrinkage of covariance to estimate better brain functional connectivity
- auteur
- Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- Medical Image Computing and Computer Assisted Interventions, Sep 2017, Quebec city, Canada
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- SPARKLING: nouveaux schémas d’échantillonnage compressif prospectif pour l’IRM haute résolution
- auteur
- Carole Lazarus, Pierre Weiss, Nicolas Chauffert, Alexandre Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- GRETSI, Sep 2017, Juan les Pins, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- OpenMEEG software for forward problems handling non-nested geometries
- auteur
- Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Emmanuel Olivi, Théodore Papadopoulo
- article
- BaCI Conference 2017: International Conference on Basic and Clinical Multimodal Imaging, Aug 2017, Bern, Switzerland
- Accès au bibtex
-
- titre
- Learning to Discover Sparse Graphical Models
- auteur
- Eugene B Belilovsky, Kyle Kastner, Gaël Varoquaux, Matthew B Blaschko
- article
- International Conference on Machine Learning , Aug 2017, Sydney, Australia
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Spatially regularized multifractal analysis for fMRI Data
- auteur
- Philippe Ciuciu, Herwig Wendt, Sébastien Combrexelle, Patrice Abry
- article
- EMBC’17 – 39th International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, Kwang Suk Park, Jul 2017, Jeju, South Korea. pp.4
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Computer-Aided Detection for Prostate Cancer Detection based on Multi-Parametric Magnetic Resonance Imaging
- auteur
- Guillaume Lemaitre, Robert Martí, Mojdeh Rastgoo, Fabrice Mériaudeau
- article
- EMBC 2017 : 39th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, Jul 2017, Jeju Island, South Korea
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- PyHRF: A Python Library for the Analysis of fMRI Data Based on Local Estimation of the Hemodynamic Response Function
- auteur
- Jaime Arias, Philippe Ciuciu, Michel Dojat, Florence Forbes, Aina Frau-Pascual, Thomas Perret, Jan M Warnking
- article
- 16th Python in Science Conference (SciPy 2017), Jul 2017, Austin, TX, United States. pp.34-40, ⟨10.25080/shinma-7f4c6e7-006⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Hierarchical Region-Network Sparsity for High-Dimensional Inference in Brain Imaging
- auteur
- Danilo Bzdok, Michael Eickenberg, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- International conference on Information Processing in Medical Imaging (IPMI) 2017, Jun 2017, Boone, North Carolina, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Novel Atlas of Human Cerebral Cortex based on Extrinsic Connectivity
- auteur
- Guillermo Gallardo, Rachid Deriche, Demian Wassermann
- article
- OHBM 2017 – Organization for Human Brain Mapping 2017 Annual Meeting, Jun 2017, Vancouver, Canada
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Towards a Faster Randomized Parcellation Based Inference
- auteur
- Andrés Hoyos-Idrobo, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- PRNI 2017 – 7th International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2017, Toronto, Canada
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Multi-output predictions from neuroimaging: assessing reduced-rank linear models
- auteur
- Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- PRNI 2017 – The 7th International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.1 – 4, ⟨10.1109/PRNI.2017.7981504⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- SPARKLING: Novel Non-Cartesian Sampling Schemes for Accelerated 2D Anatomical Imaging at 7T Using Compressed Sensing
- auteur
- Carole Lazarus, Pierre Weiss, Nicolas Chauffert, Franck Mauconduit, Michel Bottlaender, Alexandre Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- 25th annua meeting of the International Society for Magnetic Resonance Imaging, Apr 2017, Honolulu, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Drum extraction in single channel audio signals using multi-layer non negative matrix factor deconvolution
- auteur
- Clément Laroche, Hélène Papadopoulos, Matthieu Kowalski, Gael Richard
- article
- The 42nd IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing (ICASSP 2017), Mar 2017, Nouvelle Orleans, United States. ⟨10.1109/icassp.2017.7952115⟩
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-
Poster communications
- titre
- Relating Brain Structures To Open-Ended Descriptions Of Cognition
- auteur
- Jérôme Dockès, Olivier Grisel, Joan Massich, Fabian Suchanek, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- CCN 2017 – Conference on Cognitive Computational Neuroscience, Sep 2017, New York, United States. , 10 (2), pp.59 – 63, 2017, ⟨10.1016/j.tics.2005.12.004⟩
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-
Theses
- titre
- Ensembles of models in fMRI : stable learning in large-scale settings
- auteur
- Andrés Hoyos-Idrobo
- article
- Medical Imaging. Université Paris Saclay (COmUE), 2017. English. ⟨NNT : 2017SACLS029⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- MEG-BIDS: an extension to the Brain Imaging Data Structure for magnetoencephalography
- auteur
- Galan Julia Guiomar Niso, Krzysztof J. Gorgolewski, Elizabeth Bock, Teon Brooks, Guillaume Flandin, Alexandre Gramfort, Richard N. Henson, Mainak Jas, Vladimir Litvak, Jeremy Moreau, Robert Oostenveld, Jan-Mathijs Schoffelen, François Tadel, Joseph Wexler, Sylvain Baillet
- article
- 2017
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-
- titre
- Faster independent component analysis by preconditioning with Hessian approximations
- auteur
- Pierre Ablin, Jean-François Cardoso, Alexandre Gramfort
- article
- 2017
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-
2016
Journal articles
- titre
- On the generation of sampling schemes for Magnetic Resonance Imaging
- auteur
- Claire Boyer, Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Jonas Kahn, Pierre Weiss
- article
- SIAM Journal on Imaging Sciences, 2016, 9 (4), pp.2039-20972
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-
- titre
- Deriving reproducible biomarkers from multi-site resting-state data: An Autism-based example
- auteur
- Alexandre Abraham, Michael Milham, Adriana Di Martino, R. Cameron Craddock, Dimitris Samaras, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- NeuroImage, 2016, ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.10.045⟩
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-
- titre
- Exploring the anatomical encoding of voice with a mathematical model of the vocal system.
- auteur
- M Florencia Assaneo, Jacobo Sitt, Gaël Varoquaux, Mariano Sigman, Laurent Cohen, Marcos A Trevisan
- article
- NeuroImage, 2016, 141, pp.31-9. ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.07.033⟩
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-
- titre
- Predicting brain-age from multimodal imaging data captures cognitive impairment
- auteur
- Franziskus Liem, Gaël Varoquaux, Jana Kynast, Frauke Beyer, Shahrzad Kharabian Masouleh, Julia M. Huntenburg, Leonie Lampe, Mehdi Rahim, Alexandre Abraham, R. Cameron Craddock, Steffi Riedel-Heller, Tobias Luck, Markus Loeffler, Matthias L. Schroeter, Anja Veronica Witte, Daniel S. Margulies
- article
- NeuroImage, 2016, ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.11.005⟩
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-
- titre
- Transmodal Learning of Functional Networks for Alzheimer’s Disease Prediction
- auteur
- Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Claude Comtat, Gaël Varoquaux
- article
- IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing, 2016, 10 (7), pp.1204 – 1213. ⟨10.1109/JSTSP.2016.2600400⟩
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-
- titre
- Word meaning in the ventral visual path: a perceptual to conceptual gradient of semantic coding
- auteur
- Valentina Borghesani, Fabian Pedregosa, Marco Buiatti, Alexis Amadon, Evelyn Eger, Manuela Piazza
- article
- NeuroImage, 2016, ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.08.068⟩
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-
- titre
- Recursive nearest agglomeration (ReNA): fast clustering for approximation of structured signals
- auteur
- Andrés Hoyos-Idrobo, Gaël Varoquaux, Jonas Kahn, Bertrand Thirion
- article
- IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, In press, XX, ⟨10.1109/TPAMI.2018.2815524⟩
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-
- titre
- Neuroimaging Research: From Null-Hypothesis Falsification to Out-of-sample Generalization
- auteur
- Danilo Bzdok, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- Educational and Psychological Measurement, 2016
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-
- titre
- The brain imaging data structure, a format for organizing and describing outputs of neuroimaging experiments
- auteur
- Krzysztof J. Gorgolewski, Tibor Auer, Vince D. Calhoun, Cameron R. Craddock, Samir Das, Eugene P. Duff, Guillaume Flandin, Satrajit S. Ghosh, Tristan Glatard, Yaroslav O. Halchenko, Daniel A. Handwerker, Michael Hanke, David Keator, Xiangrui Li, Zachary Michael, Camille Maumet, Nolan B. Nichols, Thomas E. Nichols, John Pellman, Jean-Baptiste Poline, Ariel Rokem, Gunnar Schaefer, Vanessa Sochat, William Triplett, Jessica A. Turner, Gaël Varoquaux, Russell A. Poldrack
- article
- Scientific Data , 2016, 3, pp.160044. ⟨10.1038/sdata.2016.44⟩
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-
- titre
- Formal Models of the Network Co-occurrence Underlying Mental Operations
- auteur
- Danilo Bzdok, Gaël Varoquaux, Olivier Grisel, Michael Eickenberg, Cyril Poupon, Bertrand Thirion
- article
- PLoS Computational Biology, 2016, ⟨10.1371/journal.pcbi.1004994⟩
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-
- titre
- Exploring the early organization and maturation of linguistic pathways in the human infant brain
- auteur
- Jessica Dubois, Cyril Poupon, Bertrand Thirion, Hina Simonnet, Sofya Kulikova, François Leroy, Lucie Hertz-Pannier, Ghislaine Dehaene-Lambertz
- article
- Cerebral Cortex, 2016, 26 (5), pp.2283-2298. ⟨10.1093/cercor/bhv082⟩
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-
- titre
- Left inferior parietal lobe engagement in social cognition and language
- auteur
- Danilo Bzdok, Gesa Hartwigsen, Andrew Reid, Angela R. Laird, Peter T. Fox, Simon B. Eickhoff
- article
- Neuroscience and Biobehavioral Reviews, 2016, 68, pp.319-334. ⟨10.1016/j.neubiorev.2016.02.024⟩
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-
- titre
- Connectivity-Based Parcellation: Critique and Implications
- auteur
- Simon B. Eickhoff, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux, Danilo Bzdok
- article
- Human Brain Mapping, 2016, pp.22. ⟨10.1002/hbm.22933⟩
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-
- titre
- Beyond computational reproducibility, let us aim for reusability
- auteur
- Gaël Varoquaux
- article
- IEEE CIS Newsletter on Cognitive and Developmental Systems, 2016, What is Computational Reproducibility?, 13 (2)
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-
- titre
- Assessing and tuning brain decoders: cross-validation, caveats, and guidelines
- auteur
- Gaël Varoquaux, Pradeep A Reddy Raamana, Denis A Engemann, Andrés A Hoyos-Idrobo, Yannick A Schwartz, Bertrand A Thirion
- article
- NeuroImage, 2016, ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.10.038⟩
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-
- titre
- Seeing it all: Convolutional network layers map the function of the human visual system
- auteur
- Michael Eickenberg, Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- NeuroImage, 2016, ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.10.001⟩
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-
- titre
- A projection algorithm for gradient waveforms design in Magnetic Resonance Imaging
- auteur
- Nicolas Chauffert, Pierre Weiss, Jonas Kahn, Philippe Ciuciu
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2016, 35 (9), pp.2026-2039. ⟨10.1109/TMI.2016.2544251⟩
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-
Conference papers
- titre
- Subsampled online matrix factorization with convergence guarantees
- auteur
- Arthur Mensch, Julien Mairal, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- NIPS Workshop on Optimization for Machine Learning, Dec 2016, Barcelone, Spain
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-
- titre
- A simple algorithm for computing Nash-equilibria in incomplete information games
- auteur
- Elvis Dohmatob
- article
- OPT2016 — NIPS workshop on optimization for machine learning, Dec 2016, Barcelona, Spain
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-
- titre
- Learning brain regions via large-scale online structured sparse dictionary-learning
- auteur
- Elvis Dohmatob, Arthur Mensch, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- Neural Information Processing Systems (NIPS), Dec 2016, Barcelona, Spain
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-
- titre
- Testing for Differences in Gaussian Graphical Models: Applications to Brain Connectivity
- auteur
- Eugene Belilovsky, Gaël Varoquaux, Matthew B. Blaschko
- article
- Neural Information Processing Systems (NIPS) 2016, Dec 2016, Barcelona, Spain
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-
- titre
- Impact of perceptual learning on resting-state fMRI connectivity: A supervised classification study
- auteur
- Mehdi Rahim, Philippe Ciuciu, Salma Bougacha
- article
- Eusipco 2016, Aug 2016, Budapest, Hungary
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-
- titre
- Genre specific dictionaries for harmonic/percussive source separation
- auteur
- Clément Laroche, Hélène Papadopoulos, Matthieu Kowalski, Gael Richard
- article
- ISMIR 2016 – The 17th International Society for Music Information Retrieval Conference, Aug 2016, New York, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Brain Imaging Data Structure: a format for organizing and describing neuroimaging data
- auteur
- Krzysztof Gorgolewski, Tibor Auer, Vince D Calhoun, Cameron Craddock, Samir Das, Eugene P. Duff, Guillaume Flandin, Satrajit Ghosh, Tristan Glatard, Yaroslav Halchenko, Daniel A. Handwerker, Michael Hanke, David Keator, Xiangrui Li, Zachary Michael, Camille Maumet, B. Nolan Nichols, Thomas E Nichols, Jean-Baptiste Poline, Ariel Rokem, Gunnar Schaefer, Vanessa Sochat, Jessica Turner, Gaël Varoquaux, Russell Poldrack
- article
- 22nd Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2016), Jun 2016, Geneva, Switzerland
- Accès au bibtex
-
- titre
- M/EEG source localization with multi-scale time-frequency dictionaries
- auteur
- Yousra Bekhti, Daniel Strohmeier, Mainak Jas, Roland Badeau, Alexandre Gramfort
- article
- 6th International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging (PRNI), Jun 2016, Trento, Italy. ⟨10.1109/PRNI.2016.7552337⟩
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-
- titre
- Fast brain decoding with random sampling and random projections
- auteur
- Andrés Hoyos-Idrobo, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- PRNI 2016: the 6th International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging, Jun 2016, Trento, Italy
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Comparing functional connectivity based predictive models across datasets
- auteur
- Kamalaker Dadi, Alexandre Abraham, Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- PRNI 2016: 6th International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging, Jun 2016, Trento, Italy
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Social-sparsity brain decoders: faster spatial sparsity
- auteur
- Gaël Varoquaux, Matthieu Kowalski, Bertrand Thirion
- article
- Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2016, Trento, Italy
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dictionary Learning for Massive Matrix Factorization
- auteur
- Arthur Mensch, Julien Mairal, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- International Conference on Machine Learning, Jun 2016, New York, United States. pp.1737-1746
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Multi-subject joint parcellation detection estimation in functional MRI
- auteur
- Mohanad Albughdadi, Lotfi Chaari, Florence Forbes, Jean-Yves Tourneret, Philippe Ciuciu
- article
- 13th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2016, Prague, Czech Republic. pp.74-77, ⟨10.1109/ISBI.2016.7493214⟩
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-
- titre
- Multivariate Hurst Exponent Estimation in FMRI. Application to Brain Decoding of Perceptual Learning
- auteur
- Hubert Pellé, Philippe Ciuciu, Mehdi Rahim, Elvis Dohmatob, Patrice Abry, Virginie van Wassenhove
- article
- 13th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2016, Prague, Czech Republic
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Compressed Online Dictionary Learning for Fast Resting-State fMRI Decomposition
- auteur
- Arthur Mensch, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- International Symposium on Biomedical Imaging, IEEE, Apr 2016, Prague, Czech Republic. pp.1282-1285, ⟨10.1109/ISBI.2016.7493501⟩
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-
- titre
- Local Q-Linear Convergence and Finite-time Active Set Identification of ADMM on a Class of Penalized Regression Problems
- auteur
- Elvis Dohmatob, Michael Eickenberg, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- ICASSP, International Conference on Acoustics, Speach, and Signal Processing, Mar 2016, http://icassp2016.org/default.asp, China
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- Functional Neuroimaging Group Studies
- auteur
- Bertrand Thirion
- article
- Hernando Ombao; Martin Lindquist; Wesley Thompson; John Aston. Handbook of Neuroimaging Data Analysis, Chapman & Hall / CRC, 2016, Handbook of Modern Statistical methods, 9781482220971
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-
Poster communications
- titre
- Physically plausible K-space trajectories for Compressed Sensing in MRI: From simulations to real acquisitions
- auteur
- C Lazarus, N Chauffert, J Kahn, Pierre Weiss, A Vignaud, Philippe Ciuciu
- article
- CEA Visiting committee on High Performance Computing, Mar 2016, Saclay, France. 2016
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- The Future of Data Analysis in the Neurosciences
- auteur
- Danilo Bzdok, B.T. Thomas Yeo
- article
- 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Supplementary material: Continuation of Nesterov’s Smoothing for Regression with Structured Sparsity in High-Dimensional Neuroimaging
- auteur
- Fouad Hadj-Selem, Tommy Löfstedt, Elvis Dohmatob, Vincent Frouin, Mathieu Dubois, Vincent Guillemot, Edouard Duchesnay, Tommy Lofstedt
- article
- 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Functional connectivity outperforms scale-free brain dynamics as fMRI predictive feature of perceptual learning underwent in MEG
- auteur
- Mehdi Rahim, Philippe Ciuciu, Salma Bougacha
- article
- 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Hemodynamic Brain Parcellation Using A Non-Parametric Bayesian Approach
- auteur
- Mohanad Albughdadi, Lotfi Chaari, Jean-Yves Tourneret, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
- article
- 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Subject-level Joint Parcellation-Detection-Estimation in fMRI
- auteur
- Lotfi Chaari, Solveig Badillo, Thomas Vincent, Ghislaine Dehaene-Lambertz, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
- article
- 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2015
Journal articles
- titre
- Medial prefrontal aberrations in major depressive disorder revealed by cytoarchitectonically informed voxel-based morphometry
- auteur
- Sebastian Bludau, Danilo Bzdok, Oliver Gruber, Nils Kohn, Valentin Riedl, Christian Sorg, Nicola Palomero-Gallagher, Mueller Veronika, Felix Hoffstaedter, Katrin Amunts, B Simon, M. D. Eickhoff
- article
- The American Journal of Psychiatry, 2015, 173 (3), pp.291-298. ⟨10.1176/appi.ajp.2015.15030349⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Neural detection of complex sound sequences or of statistical regularities in the absence of consciousness?
- auteur
- Lionel Naccache, Jean-Rémi King, Jacobo D Sitt, Denis Engemann, Imen El Karoui, Benjamin Rohaut, Frédéric Faugeras, Srivas Chennu, Mélanie Strauss, Tristan Bekinschtein, Stanislas Dehaene
- article
- Brain – A Journal of Neurology , 2015, 138 (12), pp.e395 – e395. ⟨10.1093/brain/awv190⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- The Brainomics/Localizer database
- auteur
- Dimitri Papadopoulos-Orfanos, Michel Vittot, Yannick Schwartz, Philippe Pinel, Antonio Moreno, Denis Le Bihan, Vincent Frouin
- article
- NeuroImage, 2015, Data Sharing, ⟨10.1016/j.neuroimage.2015.09.052⟩
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-
- titre
- Convex relaxations of penalties for sparse correlated variables with bounded total variation
- auteur
- Eugene Belilovsky, Andreas Argyriou, Gaël Varoquaux, Matthew B. Blaschko
- article
- Machine Learning, 2015, pp.1-21. ⟨10.1007/s10994-015-5511-2⟩
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-
- titre
- NeuroVault.org: a web-based repository for collecting and sharing unthresholded statistical maps of the human brain
- auteur
- Krzysztof J. Gorgolewski, Gael Varoquaux, Gabriel Rivera, Yannick Schwarz, Satrajit S. Ghosh, Camille Maumet, Vanessa V. Sochat, Thomas E. Nichols, Russell A. Poldrack, Jean-Baptiste Poline, Tal Yarkoni, Daniel S. Margulies
- article
- Frontiers in Neuroinformatics, 2015, 9 (8), ⟨10.3389/fninf.2015.00008⟩
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-
- titre
- NeuroVault.org: A repository for sharing unthresholded statistical maps, parcellations, and atlases of the human brain
- auteur
- Krzysztof J. Gorgolewski, Gael Varoquaux, Gabriel Rivera, Yannick Schwartz, Vanessa V. Sochat, Satrajit S. Ghosh, Camille Maumet, Thomas E. Nichols, Jean-Baptiste Poline, Tal Yarkoni, Daniel S. Margulies, Russell A. Poldrack
- article
- NeuroImage, 2015, 124 (Pt B), pp.1242-1244. ⟨10.1016/j.neuroimage.2015.04.016⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Data-driven HRF estimation for encoding and decoding models
- auteur
- Fabian Pedregosa, Michael Eickenberg, Philippe Ciuciu, Bertrand Thirion, Alexandre Gramfort
- article
- NeuroImage, 2015, pp.209–220. ⟨10.1016/j.neuroimage.2014.09.060⟩
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-
- titre
- Transport on Riemannian Manifold for Connectivity-based Brain Decoding
- auteur
- Bernard Ng, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Michael D Greicius, Bertrand Thirion
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2015, PP (99), pp.9. ⟨10.1109/TMI.2015.2463723⟩
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-
Conference papers
- titre
- Semi-Supervised Factored Logistic Regression for High-Dimensional Neuroimaging Data
- auteur
- Danilo Bzdok, Michael Eickenberg, Olivier Grisel, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- NIPS’15: 28th International Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2015, Montreal, Canada
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-
- titre
- Comparison of Stochastic and Variational Solutions to ASL fMRI Data Analysis
- auteur
- Aina Frau-Pascual, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
- article
- Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2015, Oct 2015, Munich, Germany. pp.85-92, ⟨10.1007/978-3-319-24553-9_11⟩
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-
- titre
- Total Variation meets Sparsity: statistical learning with segmenting penalties
- auteur
- Michael Eickenberg, Elvis Dohmatob, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- Medical Image Computing and Computer Aided Intervention (MICCAI), Oct 2015, München, Germany
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Integrating Multimodal Priors in Predictive Models for the Functional Characterization of Alzheimer’s Disease
- auteur
- Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Alexandre Abraham, Michael Eickenberg, Elvis Dohmatob, Claude Comtat, Gael Varoquaux
- article
- Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2015, Munich, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-24553-9_26⟩
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-
- titre
- Sur la génération de schémas d’échantillonnage compressé en IRM
- auteur
- Pierre Weiss, Nicolas Chauffert, Claire Boyer, Jonas Kahn, Philippe Ciuciu
- article
- GRETSI, Patrice Abry; Paulo Gonçalves, Sep 2015, Lyon, France. pp.4
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Méthode Structurée de décomposition en matrices non- négatives appliquéè a la séparation de sources audio
- auteur
- Clément Laroche, Matthieu Kowalski, Hélène Papadopoulos, Gael Richard
- article
- 25eme Colloque GRETSI 2015, Sep 2015, Lyon, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- FAASTA: A fast solver for total-variation regularization of ill-conditioned problems with application to brain imaging
- auteur
- Gaël Varoquaux, Michael Eickenberg, Elvis Dohmatob, Bertand Thirion
- article
- Colloque GRETSI, P. Gonçalves, P. Abry, Sep 2015, Lyon, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Vers une approche unifiée pour la séparation aveugle de sources en sur et sous-déterminé, basée sur la parcimonie et la décorrélation
- auteur
- Fangchen Feng, Matthieu Kowalski
- article
- 25eme Colloque GRETSI 2015, Sep 2015, Lyon, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Problèmes inverses avec dictionnaires temps-fréquences en présence de bruit Gaussien non blanc
- auteur
- Matthieu Kowalski, Alexandre Gramfort
- article
- 25eme Colloque GRETSI 2015, Sep 2015, Lyon, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- La convergence de l’activité neurale vers des attracteurs multifractals localisés prédit la capacité d’apprentissage
- auteur
- Philippe Ciuciu, Nicolas Zilber, Patrice Abry, Virginie van Wassenhove
- article
- GRETSI, Sep 2015, Lyon, France
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-
- titre
- Comment représenter une image avec un spaghetti ?
- auteur
- Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Jonas Kahn, Pierre Weiss
- article
- GRETSI, Sep 2015, Lyon, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Méthode d’approximation variationnelle pour l’analyse de données d’IRM fonctionnelle acquise par Arterial Spin Labelling
- auteur
- Florence Forbes, Aina Frau-Pascual, Philippe Ciuciu
- article
- GRETSI, Sep 2015, Lyon, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- An Unified Approach for Blind Source Separation Using Sparsity and Decorrelation
- auteur
- Fangchen Feng, Matthieu Kowalski
- article
- 23rd European Signal Processing Conference (EUSIPCO 2015), Aug 2015, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A structured nonnegative matrix factorization for source separation
- auteur
- Clément Laroche, Matthieu Kowalski, Hélène Papadopoulos, Gael Richard
- article
- 23rd European Signal Processing Conference (EUSIPCO 2015), Aug 2015, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Inverse Problems with Time-frequency Dictionaries and non-white Gaussian Noise
- auteur
- Matthieu Kowalski, Alexandre Gramfort
- article
- 23rd European Signal Processing Conference (EUSIPCO 2015), Aug 2015, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Hybrid sparse and low-rank time-frequency signal decomposition
- auteur
- Cédric Févotte, Matthieu Kowalski
- article
- 23rd European Signal Processing Conference (EUSIPCO 2015), Aug 2015, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Correlations of correlations are not reliable statistics: implications for multivariate pattern analysis.
- auteur
- Bertrand Thirion, Fabian Pedregosa, Michael Eickenberg, Gaël Varoquaux
- article
- ICML Workshop on Statistics, Machine Learning and Neuroscience (Stamlins 2015), Bertrand Thirion, Lars Kai Hansen, Sanmi Koyejo, Jul 2015, Lille, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fast clustering for scalable statistical analysis on structured images
- auteur
- Bertrand Thirion, Andrés Hoyos-Idrobo, Jonas Kahn, Gaël Varoquaux
- article
- ICML Workshop on Statistics, Machine Learning and Neuroscience (Stamlins 2015), Bertrand Thirion, Lars Kai Hansen, Sanmi Koyejo, Jul 2015, Lille, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Big data in practice: the example of nilearn for mining brain imaging data
- auteur
- Loïc Estève
- article
- Scipy 2015, Jul 2015, Austin, Texas, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bootstrapped Permutation Test for Multiresponse Inference on Brain Behavior Associations
- auteur
- Bernard Ng, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion, Michael D. Greicius
- article
- Information Processing in Medical Imaging 2015, Sebastien Ourselin, University College London, UK; Daniel Alexander, University College London, UK; Carl-Fredrik Westin, Harvard University, USA, Jun 2015, Sabhal Mor Ostaig, Isle of Skye, United Kingdom. pp.12
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- NeuroVault.org: new features and a proof of concept analysis
- auteur
- Krzysztof Gorgolewski, Gaël Varoquaux, Gabriel Rivera, Joseph Wexler, Yannick Schwartz, Satrajit Ghosh, Camille Maumet, Thomas E Nichols, Jean Baptiste Poline, Tal Yarkoni, Daniel Margulies, Russell Poldrack
- article
- 21st Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2015), Jun 2015, Honolulu, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Improving sparse recovery on structured images with bagged clustering
- auteur
- Andrés Hoyos-Idrobo, Yannick Schwartz, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- International Workshop On Pattern Recognition In Neuroimaging (PRNI), 2015, Jun 2015, Palo alto, United States
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-
- titre
- Speeding-up model-selection in GraphNet via early-stopping and univariate feature-screening
- auteur
- Elvis Dohmatob, Michael Eickenberg, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- PRNI, Jun 2015, Stanford, United States
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-
- titre
- Variational Physiologically Informed Solution to Hemodynamic and Perfusion Response Estimation from ASL fMRI Data
- auteur
- Aina Frau-Pascual, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
- article
- 2015 International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2015, Stanford, CA, United States. pp.57-60, ⟨10.1109/PRNI.2015.12⟩
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-
- titre
- Variable density sampling based on physically plausible gradient waveform. Application to 3D MRI angiography
- auteur
- Nicolas Chauffert, Pierre Weiss, Marianne Boucher, Sébastien Mériaux, Philippe Ciuciu
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, New-York, United States
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-
- titre
- Physiological models comparison for the analysis of ASL FMRI data
- auteur
- Aina Frau-Pascual, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
- article
- 12th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, ISBI 2015, Apr 2015, New York, United States. pp.1348-1351, ⟨10.1109/ISBI.2015.7164125⟩
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-
Book sections
- titre
- Statistical Computing on Non-Linear Spaces for Computational Anatomy
- auteur
- Xavier Pennec, Pierre Fillard
- article
- Paragios, Nikos and Duncan, Jim and Ayache, Nicholas. Handbook of Biomedical Imaging: Methodologies and Clinical Research, Springer, pp.147-168, 2015, 978-0-387-09748-0. ⟨10.1007/978-0-387-09749-7_8⟩
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-
- titre
- Joint Detection-Estimation in Functional MRI
- auteur
- Philippe Ciuciu, Florence Forbes, Thomas Vincent, Lotfi Chaari
- article
- Jean-François Giovannelli and Jérôme Idier. Regularization and Bayesian Methods for Inverse Problems in Signal and Image Processing, John Wiley and Sons, pp.169-200, 2015, 978-1-84821-637-2
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-
Books
- titre
- Scipy Lecture Notes
- auteur
- Gaël Varoquaux, Emmanuelle Gouillart, Olav Vahtras, Valentin Haenel, Nicolas P. Rougier, Ralf Gommers, Fabian Pedregosa, Zbigniew Jędrzejewski-Szmek, Pauli Virtanen, Christophe Combelles, Didrik Pinte, Robert Cimrman, André Espaze, Adrien Chauve, Christopher Burns
- article
- Zenodo, 2015, ⟨10.5281/zenodo.31736⟩
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-
Poster communications
- titre
- SpaceNet: Multivariate brain decoding and segmentation
- auteur
- Elvis Dohmatob, Michael Eickenberg, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- OHBM, Jun 2015, Honolulu, Hawaii, United States
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-
Theses
- titre
- Learning functional brain atlases modeling inter-subject variability
- auteur
- Alexandre Abraham
- article
- Machine Learning [cs.LG]. Université Paris-Saclay, 2015. English. ⟨NNT : 2015SACLS159⟩
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-
- titre
- Echantillonnage compressé le long de trajectoires physiquement plausibles en IRM
- auteur
- Nicolas Chauffert
- article
- Traitement du signal et de l’image [eess.SP]. Université Paris Sud – Paris XI, 2015. Français. ⟨NNT : 2015PA112234⟩
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-
- titre
- Échantillonnage compressé le long de trajectoires physiquement plausibles en IRM
- auteur
- Nicolas Chauffert
- article
- Traitement du signal et de l’image [eess.SP]. université paris XI, 2015. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- Evaluating Computational Models of Vision with Functional Magnetic Resonance Imaging
- auteur
- Michael Eickenberg
- article
- Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV]. Université Paris Sud – Paris XI, 2015. English. ⟨NNT : 2015PA112206⟩
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-
- titre
- Large-scale functional MRI analysis to accumulate knowledge on brain functions
- auteur
- Yannick Schwartz
- article
- Medical Imaging. Université Paris Sud – Paris XI, 2015. English. ⟨NNT : 2015PA112056⟩
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-
- titre
- Feature extraction and supervised learning on fMRI : from practice to theory
- auteur
- Fabian Pedregosa-Izquierdo
- article
- Medical Imaging. Université Pierre et Marie Curie – Paris VI, 2015. English. ⟨NNT : 2015PA066015⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Hemodynamic-Informed Parcellation of fMRI Data in a Joint Detection Estimation Framework
- auteur
- Lotfi Chaari, Solveig Badillo, Thomas Vincent, Ghislaine Dehaene-Lambertz, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
- article
- 2015
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-
- titre
- In theory, You crack under pressure!
- auteur
- Elvis Dohmatob
- article
- 2015
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-
- titre
- A projection method on measures sets
- auteur
- Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Jonas Kahn, Pierre Weiss
- article
- 2015
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-
- titre
- A projection algorithm on measures sets
- auteur
- Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Jonas Kahn, Pierre Weiss
- article
- 2015
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-
2014
Journal articles
- titre
- Identification of Mood-Relevant Brain Connections Using a Continuous, Subject-Driven Rumination Paradigm.
- auteur
- Anna-Clare Milazzo, Bernard Ng, Heidi Jiang, William Shirer, Gael Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion, Michael D Greicius
- article
- Cerebral Cortex, 2014, pp.12
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-
- titre
- Large scale screening of neural signatures of consciousness in patients in a vegetative or minimally conscious state
- auteur
- Jacobo Diego Sitt, Jean-Rémi King, Imen El Karoui, Benjamin Rohaut, Frédéric Faugeras, Alexandre Gramfort, Laurent D. Cohen, Mariano Sigman, Stanislas Dehaene, Lionel Naccache
- article
- Brain – A Journal of Neurology , 2014, 137 (8), pp.2258 – 2270. ⟨10.1093/brain/awu141⟩
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-
- titre
- Interplay between functional connectivity and scale-free dynamics in intrinsic fMRI networks
- auteur
- Philippe Ciuciu, Patrice Abry, Biyu Jade He
- article
- NeuroImage, 2014, 95, pp.248 – 263. ⟨10.1016/j.neuroimage.2014.03.047⟩
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-
- titre
- Graph-based inter-subject pattern analysis of fMRI data
- auteur
- Sylvain Takerkart, Guillaume Auzias, Bertrand Thirion, Liva Ralaivola
- article
- PLoS ONE, 2014, 10.1371/journal.pone.0104586. ⟨10.1371/journal.pone.0104586⟩
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-
- titre
- Touchless User Interface for Intraoperative Image Control: Almost There
- auteur
- Antoine Iannessi, Pierre Yves Marcy, Olivier Clatz, Nicholas Ayache, Pierre Fillard
- article
- Radiographics, 2014, 34 (4), ⟨10.1148/rg.344135158⟩
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-
- titre
- Interoperable atlases of the human brain
- auteur
- K Amunts, M.J. Hawrylycz, David C. van Essen, Jd van Horn., N Harel, Jean-Baptiste Poline, F de Martino, J. G. Bjaalie, Ghislaine Dehaene-Lambertz, Stanislas Dehaene, P Valdes-Sosa, Bertrand Thirion, K Zilles, S.L. Hill, M.B. Abrams, P.A. Tass, W Vanduffel, Alan Evans, S.B. Eickhoff
- article
- NeuroImage, 2014, 99 (1), pp.8. ⟨10.1016/j.neuroimage.2014.06.010⟩
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-
- titre
- Supramodal processing optimizes visual perceptual learning and plasticity
- auteur
- Nicolas Zilber, Philippe Ciuciu, Alexandre Gramfort, Leila Azizi, Virginie van Wassenhove
- article
- NeuroImage, 2014, 93, pp.32 – 46. ⟨10.1016/j.neuroimage.2014.02.017⟩
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-
- titre
- The ENIGMA Consortium : large-scale collaborative analyses of neuroimaging and genetic data
- auteur
- Paul M. Thompson, Jason L. Stein, Sarah Medland, Derrek D Hibar, Alejandro Arias Vasquez, Miguel E. Renteria, Roberto Toro, Neda Jahanshad, Gunter Schumann, Barbara Franke, Margaret J. Wright, Nicholas G. Martin, Ingrid Agartz, Martin Alda, Saud Alhusaini, Laura Almasy, Jorge Almeida, Kathryn Alpert, Nancy C. Andreasen, Ole A. Andreassen, Liana G. Apostolova, Katja Appel, Nicola J. Armstrong, Benjamin Aribisala, Mark E. Bastin, Michael Bauer, Carrie E. Bearden, Ørjan Bergmann, Elisabeth B. Binder, John Blangero, Henry J. Bockholt, Erlend Bøen, Catherine Bois, Dorret I. Boomsma, Tom Booth, Ian J. Bowman, Janita Bralten, Rachel M. Brouwer, Han G. Brunner, David G. Brohawn, Randy L. Buckner, Jan Buitelaar, Kazima M Bulayeva, Juan R. Bustillo, Vince D. Calhoun, Dara M. Cannon, Rita M. Cantor, Melanie A. Carless, Xavier Caseras, Gianpiero L. Cavalleri, M. Mallar Chakravarty, Kiki D. Chang, Christopher R. K. Ching, Andrea Christoforou, Sven Cichon, Vincent P. Clark, Patricia Conrod, Giovanni Coppola, Benedicto Crespo-Facorro, Joanne E Curran, Michael Czisch, Ian J. Deary, Eco J. C. de Geus, Anouk den Braber, Giuseppe Delvecchio, Chantal Depondt, Lieuwe de Haan, Greig I. de Zubicaray, Danai Dima, Rali Dimitrova, Srdjan Djurovic, Hongwei Dong, Gary Donohoe, Ravindranath Duggirala, Thomas D. Dyer, Stefan Ehrlich, Carl Johan Ekman, Torbjørn Elvsåshagen, Louise Emsell, Susanne Erk, Thomas Espeseth, Jesen Fagerness, Scott Fears, Iryna Fedko, Guillén Fernández, Simon E. Fisher, Tatiana Foroud, Peter T. Fox, Clyde Francks, Sophia D Frangou, Eva Maria Frey, Thomas Frodl, Vincent Frouin, Hugh Garavan, Sudheer Giddaluru, David C. Glahn, Beata Godlewska, Rita Z. Goldstein, Randy L. Gollub, Hans J. Grabe, Oliver Grimm, Oliver Gruber, Tulio Guadalupe, Raquel E. Gur, Ruben C. Gur, Harald H. H. Göring, Saskia Hagenaars, Tomas Hajek, Geoffrey B. Hall, Jérémy Hall, John Hardy, Catharina A. Hartman, Johanna Hass, Sean N. Hatton, Unn K. Haukvik, Katrin Hegenscheid, Andreas Heinz, Ian B. Hickie, Beng-Choon Ho, David Hoehn, Pieter J. Hoekstra, Marisa Hollinshead, Avram J. Holmes, Georg Homuth, Martine Hoogman, L. Elliot Hong, Norbert Hosten, Jouke-Jan Hottenga, Hilleke E. Hulshoff Pol, Kristy S. Hwang, Clifford R. Jack Jr, Mark Jenkinson, Caroline Johnston, Erik G. Jönsson, René S. Kahn, Dalia Kasperaviciute, Sinead Kelly, Sungeun Kim, Peter M. Kochunov, Laura Koenders, Bernd Krämer, John B. J. Kwok, Jim Lagopoulos, Gonzalo Laje, Mikael Landén, Bennett A. Landman, John Lauriello, Stephen M. Lawrie, Phil H. Lee, Stephanie Le Hellard, Hervé Lemaître, Cassandra D. Leonardo, Chiang-Shan Li, Benny Liberg, David C. Liewald, Xinmin Liu, Lorna M. Lopez, Eva Loth, Anbarasu Lourdusamy, Michelle Luciano, Fabio Macciardi, Marise W. J. Machielsen, Glenda M. MacQueen, Ulrik F. Malt, René Mandl, Dara S. Manoach, Jean-Luc Martinot, Mar Matarin, Karen Mather, Manuel Mattheisen, Morten Mattingsdal, Andreas Meyer-Lindenberg, Colm McDonald, Andrew McIntosh, Francis J. McMahon, Katie L. McMahon, Eva Meisenzahl, Ingrid Melle, Yuri Milaneschi, Sebastian Mohnke, Grant W. Montgomery, Derek W. Morris, Eric K. Moses, Bryon A. Mueller, Susana Muñoz Maniega, Thomas W. Mühleisen, Bertram Müller-Myhsok, Benson Mwangi, Matthias Nauck, Kwangsik Nho, Thomas E. Nichols, Lars-Göran Nilsson, Allison C. Nugent, Lars Nyberg, Rene L. Olvera, Jaap Oosterlaan, Roel A. Ophoff, Massimo Pandolfo, Melina Papalampropoulou-Tsiridou, Martina Papmeyer, Tomas Paus, Zdenka Pausova, Godfrey D. Pearlson, Brenda W. Penninx, Charles P. Peterson, Andrea Pfennig, Mary Phillips, G. Bruce Pike, Jean-Baptiste Poline, Steven G. Potkin, Benno Pütz, Adaikalavan Ramasamy, Jerod Rasmussen, Marcella Rietschel, Mark Rijpkema, Shannon L. Risacher, Joshua L. Roffman, Roberto Roiz-Santiañez, Nina Romanczuk-Seiferth, Emma J. Rose, Natalie A. Royle, Dan Rujescu, Mina Ryten, Perminder Sachdev, Alireza Salami, Theodore D. Satterthwaite, Jonathan Savitz, Andrew J. Saykin, Cathy Scanlon, Lianne Schmaal, Hugo G. Schnack, Andrew J. Schork, S. Charles Schulz, Remmelt Schür, Larry Seidman, Li Shen, Jody M. Shoemaker, Andrew Simmons, Sanjay Sisodiya, Colin Smith, Jordan W. Smoller, Jair C. Soares, Scott R. Sponheim, Emma Sprooten, John M. Starr, Vidar M. Steen, Stephen Strakowski, Lachlan Strike, Jessika Sussmann, Philipp G. Sämann, Alexander Teumer, Arthur W. Toga, Diana Tordesillas-Gutierrez, Daniah Trabzuni, Sarah Trost, Jessica Turner, Martijn D. van den Heuvel, Nic J. van Der Wee, Kristel van Eijk, Theo G. M. van Erp, Neeltje E. M. van Haren, Dennis van’t Ent, Marie-Jose van Tol, Maria C. Valdés Hernández, Dick J. Veltman, Amelia Versace, Henry Völzke, Robert Walker, Henrik Walter, Lei Wang, Joanna Wardlaw, Michael E. Weale, Michael W. Weiner, Wei Wen, Lars T. Westlye, Heather C. Whalley, Christopher D. Whelan, Tonya White, Anderson M. Winkler, Katharina Wittfeld, Girma Woldehawariat, Christiane Wolf, David Zilles, Marcel P. Zwiers, Anbupalam Thalamuthu, Peter R. Schofield, Nelson B. Freimer, Natalia S. Lawrence, Wayne Drevets
- article
- Brain imaging and behavior (Brain Imaging Behav), 2014, 8 (2), pp.152-182. ⟨10.1007/s11682-013-9269-5⟩
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-
- titre
- Which fMRI clustering gives good brain parcellations?
- auteur
- Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux, Elvis Dohmatob, Jean-Baptiste Poline
- article
- Frontiers in Neuroscience, 2014, 8 (167), pp.13. ⟨10.3389/fnins.2014.00167⟩
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-
- titre
- Encoding of event timing in the phase of neural oscillations
- auteur
- Anne Kösem, Alexandre Gramfort, Virginie van Wassenhove
- article
- NeuroImage, 2014, 92, pp.274-284. ⟨10.1016/j.neuroimage.2014.02.010⟩
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-
- titre
- Flexible multivariate hemodynamics fMRI data analyses and simulations with PyHRF
- auteur
- Thomas Vincent, Solveig Badillo, Laurent Risser, Lotfi Chaari, Christine Bakhous, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
- article
- Frontiers in Neuroscience, 2014, Brain Imaging methods (eCollection 2014), 8 (Article 67), pp.23. ⟨10.3389/fnins.2014.00067⟩
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-
- titre
- Machine Learning Patterns for Neuroimaging-Genetic Studies in the Cloud
- auteur
- Benoit da Mota, Radu Tudoran, Alexandru Costan, Gaël Varoquaux, Goetz Brasche, Patricia J. Conrod, Hervé Lemaitre, Tomáš Paus, Marcella Rietschel, Vincent Frouin, Jean-Baptiste Poline, Gabriel Antoniu, Bertrand Thirion
- article
- Frontiers in Neuroinformatics, 2014, Recent advances and the future generation of neuroinformatics infrastructure, 8, ⟨10.3389/fninf.2014.00031⟩
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-
- titre
- Probabilistic Atlas and Geometric Variability Estimation to Drive Tissue Segmentation
- auteur
- Hao Xu, Bertrand Thirion, Stéphanie Allassonnière
- article
- Statistics in Medicine, 2014, 33 (20), pp.24. ⟨10.1002/sim.6156⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Spatio-temporal wavelet regularization for parallel MRI reconstruction: application to functional MRI
- auteur
- Lotfi Chaari, Philippe Ciuciu, Sébastien Mériaux, Jean-Christophe Pesquet
- article
- Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology and Medicine, 2014, 27 (6), pp.41. ⟨10.1007/s10334-014-0436-5⟩
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-
- titre
- MNE software for processing MEG and EEG data
- auteur
- Alexandre Gramfort, Martin Luessi, Eric Larson, Denis Engemann, Daniel Strohmeier, Christian Brodbeck, Lauri Parkkonen, Matti Hämäläinen
- article
- NeuroImage, 2014, 86, pp.446-460. ⟨10.1016/j.neuroimage.2013.10.027⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Two Distinct Dynamic Modes Subtend the Detection of Unexpected Sounds
- auteur
- Jean-Rémi King, Alexandre Gramfort, Aaron Schurger, Lionel Naccache, Stanislas Dehaene
- article
- PLoS ONE, 2014, 9 (1), pp.e85791. ⟨10.1371/journal.pone.0085791⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- How machine learning is shaping cognitive neuroimaging
- auteur
- Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- GigaScience, 2014, 3, pp.28. ⟨10.1186/2047-217X-3-28⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Touchless intra-operative display for interventional radiologist
- auteur
- A Iannessi, P.-y Marcy, O Clatz, P Fillard, N Ayache
- article
- Diagnostic and Interventional Imaging, 2014, ⟨10.1016/j.diii.2013.09.007⟩
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-
- titre
- Variable density sampling with continuous trajectories. Application to MRI.
- auteur
- Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Jonas Kahn, Pierre Weiss
- article
- SIAM Journal on Imaging Sciences, 2014, 7 (4), pp.1962-1992
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Extracting Brain PET-MRI Joint Structures for Statistical Analysis
- auteur
- Mehdi Rahim
- article
- Séminaire imagerie TEP/IRM, Dec 2014, Lyon, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Physiologically Informed Bayesian Analysis of ASL fMRI Data
- auteur
- Aina Frau-Pascual, Thomas Vincent, Jennifer Sloboda, Philippe Ciuciu, Florence Forbes
- article
- BAMBI 2014 – First International Workshop on Bayesian and grAphical Models for Biomedical Imaging, Sep 2014, Boston, United States. pp.37 – 48, ⟨10.1007/978-3-319-12289-2_4⟩
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-
- titre
- Principal Component Regression predicts functional responses across individuals
- auteur
- Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux, Olivier Grisel, Cyril Poupon, Philippe Pinel
- article
- MICCAI, Sep 2014, Boston, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Deriving a multi-subject functional-connectivity atlas to inform connectome estimation
- auteur
- Ronald Phlypo, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2014, Boston, United States. pp.185-192, ⟨10.1007/978-3-319-10443-0_24⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Transport on Riemannian Manifold for Functional Connectivity-based Classification
- auteur
- Bernard Ng, Martin Dressler, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Michael D. Greicius, Bertrand Thirion
- article
- MICCAI – 17th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Polina Golland, Sep 2014, Boston, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Physiologically informed Bayesian analysis of ASL fMRI data
- auteur
- Florence Forbes, Aina Frau-Pascual, Thomas Vincent, Jennifer Sloboda, Philippe Ciuciu
- article
- Statistical Challenges in Neuroscience workshop, Sep 2014, Warwick, United Kingdom
- Accès au bibtex
-
- titre
- Model Selection for Hemodynamic Brain Parcellation in fMRI
- auteur
- Mohanad Albughdadi, Lotfi Chaari, Florence Forbes, Jean-Yves Tourneret, Philippe Ciuciu
- article
- EUSIPCO – 22nd European Signal Processing Conference, Sep 2014, Lisbon, Portugal. pp.31 – 35
- Accès au bibtex
-
- titre
- NeuroVault: a web repository for sharing statistical parametric maps
- auteur
- Krzysztof J. Gorgolewski, Tal Yarkoni, Satrajit Ghosh, Russel A. Poldrack, Jean-Baptiste Poline, Yannick Schwartz, Thomas E. Nichols, Camille Maumet, Daniel S. Margulies
- article
- 20th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2014, Hamburg, Germany
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Developing and using the Neuroimaging and Data Sharing Data Model: the NIDASH Working Group
- auteur
- David Keator, Satrajit Ghosh, Camille Maumet, Guillaume Flandin, B. Nolan Nichols, Thomas E. Nichols, Gully Burns, Ruediger Bruehl, Cameron Craddock, Blaise Frederick, Krysztof Gorgolewski, Daniel Marcus, Michael Hanke, Christian Haselgrove, Karl Helmer, Arno Klein, Michael Milham, Russel Poldrack, Franck Michel, Jason Steffener, Yannick Schwartz, Rich Stoner, Jessica Turner, David N. Kennedy, Jean-Baptiste Poline
- article
- 20th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2014), Jun 2014, Hamburg, Germany
- Accès au bibtex
-
- titre
- A perceptual-to-conceptual gradient of word coding along the ventral path
- auteur
- Valentina Borghesani, Fabian Pedregosa, Evelyn Eger, Marco Buiatti, Manuela Piazza
- article
- PRNI 2014 – 4th International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2014, Tubingen, Germany
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Decoding perceptual thresholds from MEG/EEG
- auteur
- Yousra Bekhti, Nicolas Zilber, Fabian Pedregosa, Philippe Ciuciu, Virginie van Wassenhove, Alexandre Gramfort
- article
- Pattern Recoginition in Neuroimaging (PRNI) (2014), Jun 2014, Tubingen, Germany. p00
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Benchmarking solvers for TV-l1 least-squares and logistic regression in brain imaging
- auteur
- Elvis Dohmatob, Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- PRNI 2014 – 4th International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2014, Tübingen, Germany
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Hemodynamically informed parcellation of cerebral FMRI data
- auteur
- Aina Frau-Pascual, Thomas Vincent, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
- article
- ICASSP 2014 – 2014 IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing, May 2014, Florence, Italy. pp.2079-2083, ⟨10.1109/ICASSP.2014.6853965⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Automatic pathology classification using a single feature machine learning – support vector machines
- auteur
- Fernando Yepes, Fabian Pedregosa, Bertrand Thirion, Yalin Wang, Natasha Lepore
- article
- SPIE Medical Imaging 2014, Feb 2014, San Diego, United States. pp.24, ⟨10.1117/12.2043943⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- Shape Analysis for Brain Structures: A Review
- auteur
- Bernard Ng, Matthew Toews, Stanley Durrleman, Yonggang Shi
- article
- Li, Shuo and Tavares, João Manuel R. S. Shape Analysis in Medical Image Analysis, 14, Springer, 2014, Lecture Notes in Computational Vision and Biomechanics, 978-3-319-03813-1
- Accès au bibtex
-
Master thesis
- titre
- Unsupervised Clustering of Neural Pathways
- auteur
- Sergio Medina
- article
- Machine Learning [cs.LG]. 2014
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Documents associated with scientific events
- titre
- Region segmentation for sparse decompositions: better brain parcellations from rest fMRI
- auteur
- Alexandre Abraham, Elvis Dohmatob, Bertrand Thirion, Dimitris Samaras, Gael Varoquaux
- article
- Sparsity Techniques in Medical Imaging, Sep 2014, Boston, United States. pp.8
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Theses
- titre
- Multi-modal registration of T1 brain image and geometric descriptors of white matter tracts
- auteur
- Viviana Siless
- article
- Medical Imaging. Université Paris Sud – Paris XI, 2014. English. ⟨NNT : 2014PA112147⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- ERF and scale-free analyses of source-reconstructed MEG brain signals during a multisensory learning paradigm
- auteur
- Nicolas Zilber
- article
- Other [cond-mat.other]. Université Paris Sud – Paris XI, 2014. English. ⟨NNT : 2014PA112040⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Gradient waveform design for variable density sampling in Magnetic Resonance Imaging
- auteur
- Nicolas Chauffert, Pierre Weiss, Jonas Kahn, Philippe Ciuciu
- article
- 2014
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2013
Journal articles
- titre
- Machine Learning for Neuroimaging with Scikit-Learn
- auteur
- Alexandre Abraham, Fabian Pedregosa, Michael Eickenberg, Philippe Gervais, Andreas Muller, Jean Kossaifi, Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- Frontiers in Neuroscience, 2013, pp.15. ⟨10.3389/fninf.2014.00014⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Single-trial decoding of auditory novelty responses facilitates the detection of residual consciousness
- auteur
- Jean-Rémi King, Frédéric Faugeras, Alexandre Gramfort, A. Schurger, Imen El Karoui, J.D. Sitt, Benjamin Rohaut, C. Wacongne, E. Labyt, Tristan Bekinschtein, Laurent D. Cohen, Lionel Naccache, Stanislas Dehaene
- article
- NeuroImage, 2013, 83 (3), pp.726 – 738. ⟨10.1016/j.neuroimage.2013.07.013⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Randomized parcellation based inference.
- auteur
- Benoit da Mota, Virgile Fritsch, Gaël Varoquaux, Tobias Banaschewski, Gareth J. Barker, Arun L. W. Bokde, Uli Bromberg, Patricia J. Conrod, Jürgen Gallinat, Hugh Garavan, Jean-Luc Martinot, Frauke Nees, Tomáš Paus, Zdenka Pausova, Marcella Rietschel, Michael N. Smolka, Andreas Ströhle, Vincent Frouin, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- NeuroImage, 2013, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.neuroimage.2013.11.012⟩
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-
- titre
- Toward global tractography.
- auteur
- Jean-François Mangin, Pierre Fillard, Yann Cointepas, Denis Le Bihan, Vincent Frouin, Cyril Poupon
- article
- NeuroImage, 2013, 80, pp.290-6. ⟨10.1016/j.neuroimage.2013.04.009⟩
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-
- titre
- Oxytocin Receptor Genotype Modulates Ventral Striatal Activity to Social Cues and Response to Stressful Life Events.
- auteur
- Eva Loth, Jean-Baptiste Poline, Benjamin Thyreau, Tianye Jia, Chenyang Tao, Anbarasu Lourdusamy, David Stacey, Anna Cattrell, Sylvane Desrivières, Barbara Ruggeri, Virgile Fritsch, Tobias Banaschewski, Gareth J. Barker, Arun L. W. Bokde, Christian Büchel, Fabiana M. Carvalho, Patricia J. Conrod, Mira Fauth-Buehler, Herta Flor, Jürgen Gallinat, Hugh Garavan, Andreas Heinz, Ruediger Bruehl, Claire Lawrence, Karl Mann, Jean-Luc Martinot, Frauke Nees, Tomáš Paus, Zdenka Pausova, Luise Poustka, Marcella Rietschel, Michael N. Smolka, Maren Struve, Jianfeng Feng, Gunter Schumann
- article
- Biological Psychiatry, 2013, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.biopsych.2013.07.043⟩
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-
- titre
- Learning and comparing functional connectomes across subjects
- auteur
- Gaël Varoquaux, R. Cameron Craddock
- article
- NeuroImage, 2013, 80, pp.405-415. ⟨10.1016/j.neuroimage.2013.04.007⟩
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-
- titre
- Denoising and fast diffusion imaging with physically constrained sparse dictionary learning
- auteur
- Alexandre Gramfort, Cyril Poupon, Maxime Descoteaux
- article
- Medical Image Analysis, 2013, 18 (1), pp.36-49. ⟨10.1016/j.media.2013.08.006⟩
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-
- titre
- A framework for inter-subject prediction of functional connectivity from structural networks
- auteur
- Fani Deligianni, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, David J. Sharp, Christian Ledig, Robert Leech, Daniel Rueckert
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2013, epub ahead of print, ⟨10.1109/TMI.2013.2276916⟩
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-
- titre
- Spatial vs. Temporal Features in ICA of Resting-State fMRI – A Quantitative and Qualitative Investigation in the Context of Response Inhibition
- auteur
- Lixia Tian, Yazhuo Kong, Juejing Ren, Gaël Varoquaux, Yufeng Zang, Stephen M. Smith
- article
- PLoS ONE, 2013, ⟨10.1371/journal.pone.0066572⟩
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-
- titre
- Group-level impacts of within- and between-subject hemodynamic variability in fMRI
- auteur
- Solveig Badillo, Thomas Vincent, Philippe Ciuciu
- article
- NeuroImage, 2013, 82C, pp.433-448. ⟨10.1016/j.neuroimage.2013.05.100⟩
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-
- titre
- A neural marker of perceptual consciousness in infants.
- auteur
- Sid Kouider, Carsten Stahlhut, Sofie V Gelskov, Leonardo S Barbosa, Michel Dutat, Vincent de Gardelle, Anne Christophe, Stanislas Dehaene, Ghislaine Dehaene-Lambertz
- article
- Science, 2013, 340 (6130), pp.376-380. ⟨10.1126/science.1232509⟩
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-
- titre
- Time-Frequency Mixed-Norm Estimates: Sparse M/EEG imaging with non-stationary source activations
- auteur
- Alexandre Gramfort, Daniel Strohmeier, Jens Haueisen, Matti Hämäläinen, Matthieu Kowalski
- article
- NeuroImage, 2013, 70, pp.410-422. ⟨10.1016/j.neuroimage.2012.12.051⟩
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-
- titre
- MEG and EEG data analysis with MNE-Python
- auteur
- Alexandre Gramfort
- article
- Frontiers in Neuroscience, 2013, 7, ⟨10.3389/fnins.2013.00267⟩
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-
- titre
- Mapping Cortico-Striatal Connectivity onto the Cortical Surface: A New Tractography-Based Approach to Study Huntington Disease.
- auteur
- Linda Marrakchi-Kacem, Christine Delmaire, Pamela Guevara, Fabrice Poupon, Sophie Lecomte, Alan Tucholka, Pauline Roca, Jérôme Yelnik, Alexandra Durr, Jean-François Mangin, Cyril Poupon
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (2), pp.e53135. ⟨10.1371/journal.pone.0053135⟩
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-
- titre
- Publishing scientific software matters
- auteur
- Christophe Pradal, Gaël Varoquaux, Hans Peter Langtangen
- article
- Journal of computational science, 2013, 4 (5), pp.311 – 312. ⟨10.1016/j.jocs.2013.08.001⟩
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-
Conference papers
- titre
- Mapping cognitive ontologies to and from the brain
- auteur
- Yannick Schwartz, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- NIPS (Neural Information Processing Systems), Dec 2013, United States
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-
- titre
- API design for machine learning software: experiences from the scikit-learn project
- auteur
- Lars Buitinck, Gilles Louppe, Mathieu Blondel, Fabian Pedregosa, Andreas Mueller, Olivier Grisel, Vlad Niculae, Peter Prettenhofer, Alexandre Gramfort, Jaques Grobler, Robert Layton, Jake Vanderplas, Arnaud Joly, Brian Holt, Gaël Varoquaux
- article
- European Conference on Machine Learning and Principles and Practices of Knowledge Discovery in Databases, Sep 2013, Prague, Czech Republic
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-
- titre
- Bayesian Estimation of Probabilistic Atlas for Anatomically-Informed Functional MRI Group Analyses
- auteur
- Hao Xu, Bertrand Thirion, Stéphanie Allassonnière
- article
- MICCAI – 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – 2013, Sep 2013, Nagoya, Japan
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-
- titre
- Extracting brain regions from rest fMRI with Total-Variation constrained dictionary learning
- auteur
- Alexandre Abraham, Elvis Dohmatob, Bertrand Thirion, Dimitris Samaras, Gaël Varoquaux
- article
- MICCAI – 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – 2013, Sep 2013, Nagoya, Japan
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-
- titre
- Implications of Inconsistencies between fMRI and dMRI on Multimodal Connectivity Estimation
- auteur
- Bernard Ng, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- MICCAI – 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – 2013, Kensaku Mori, Sep 2013, Nagoya, Japan
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-
- titre
- Enhancing the Reproducibility of Group Analysis with Randomized Brain Parcellations
- auteur
- Benoit da Mota, Virgile Fritsch, Gaël Varoquaux, Vincent Frouin, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- MICCAI – 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – 2013, Sep 2013, Nagoya, Japan
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-
- titre
- Bayesian Joint Detection-Estimation of cerebral vasoreactivity from ASL fMRI data
- auteur
- Thomas Vincent, Jan Warnking, Marjorie Villien, Alexandre Krainik, Philippe Ciuciu, Florence Forbes
- article
- MICCAI 2013 – 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Scientific Council of Japan, Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.616-623, ⟨10.1007/978-3-642-40763-5_76⟩
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-
- titre
- Unsupervised Fiber Bundles Registration using Weighted Measures Geometric Demons
- auteur
- Viviana Siless, Sergio Medina, Pierre Fillard, Bertrand Thirion
- article
- Workshop on Multi Modal Brain Image Analysis, Li Shen – Tianming Liu – Pew-Thian Yap – Heng Huang – Dinggang Shen -Carl-Fredrik Westin, Sep 2013, Nagoya, Japan
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-
- titre
- A complex-valued majorize-minimize memory gradient method with application to parallel MRI
- auteur
- Anisia Florescu, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet, Philippe Ciuciu, Silviu Ciochina
- article
- 21st European Signal Processing Conference (EUSIPCO 2013), Sep 2013, Marrakech, Morocco. pp.14283743.1-14283743.5
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-
- titre
- From variable density sampling to continuous sampling using Markov chains
- auteur
- Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Pierre Weiss, Fabrice Gamboa
- article
- SampTA – 10th Conference International Conference on Sampling Theory and Applications, Jul 2013, Bremen, Germany. pp.200-203
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-
- titre
- Travelling salesman-based variable density sampling
- auteur
- Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Jonas Kahn, Pierre Weiss
- article
- SampTA – 10th Conference International Conference on Sampling Theory and Applications, Jul 2013, Bremen, Germany. pp.509-512
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-
- titre
- Cohort-level brain mapping: learning cognitive atoms to single out specialized regions
- auteur
- Gaël Varoquaux, Yannick Schwartz, Philippe Pinel, Bertrand Thirion
- article
- IPMI – Information Processing in Medical Imaging – 2013, William M. Wells, Sarang Joshi, Kilian M. Pohl, Jun 2013, Asilomar, United States. pp.438-449, ⟨10.1007/978-3-642-38868-2_37⟩
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-
- titre
- A Novel Sparse Group Gaussian Graphical Model for Functional Connectivity Estimation
- auteur
- Bernard Ng, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Information Processing in Medical Imaging, Jun 2013, Asilomar, United States
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-
- titre
- Robust Group-Level Inference in Neuroimaging Genetic Studies
- auteur
- Virgile Fritsch, Benoit da Mota, Gaël Varoquaux, Vincent Frouin, Eva Loth, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Pattern Recognition in Neuroimaging, Jun 2013, Philadelphie, United States
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-
- titre
- HRF estimation improves sensitivity of fMRI encoding and decoding models
- auteur
- Fabian Pedregosa, Michael Eickenberg, Bertrand Thirion, Alexandre Gramfort
- article
- 3nd International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2013, Philadelphia, United States
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-
- titre
- Hemodynamic estimation based on Consensus Clustering
- auteur
- Solveig Badillo, Gaël Varoquaux, Philippe Ciuciu
- article
- PRNI 2013 — 3rd International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2013, Philadelphia, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Comparison of Metrics and Algorithms for Fiber Clustering
- auteur
- Viviana Siless, Sergio Medina, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2013, Philadelphia, United States
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-
- titre
- Identifying predictive regions from fMRI with TV-L1 prior
- auteur
- Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- Pattern Recognition in Neuroimaging (PRNI), Jun 2013, Philadelphia, United States
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-
- titre
- Second order scattering descriptors predict fMRI activity due to visual textures
- auteur
- Michael Eickenberg, Fabian Pedregosa, Senoussi Mehdi, Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion
- article
- PRNI 2013 – 3nd International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2013, Philadelphia, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Asymmetry of the Superior Temporal Sulcus: a Robust Human Landmark
- auteur
- Francois Leroy, Stéphanie L. Bogart, William Hopkins, Olivier Coulon, Qing Cai, Roberto Toro, Jean-François Mangin, Ghislaine Dehaene-Lambertz
- article
- OHBM 2013 – International Conference on Human Brain Mapping, Jun 2013, Seattle, WA, USA, États-Unis
- Accès au bibtex
-
- titre
- Brainomics: A management system for exploring and merging heterogeneous brain mapping data
- auteur
- Vincent Michel, Yannick Schwartz, Philippe Pinel, Olivier Cayrol, Antonio Moreno, Jean-Baptiste Poline, Vincent Frouin, Dimitri Papadopoulos-Orfanos
- article
- OHBM 2013 19th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2013, Seattle, United States
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-
- titre
- L’évaluation automatique des déplacements et des déformations des organes pelviens est faisable et reproductible.
- auteur
- Silvia Cresti, E. Di Crocco, Mehdi Rahim, Diane Mege, Marc-Emmanuel Bellemare, Nicolas Pirro
- article
- 2013 – 36eme Congrès de la SIFUD-PP, Jun 2013, Nice, France
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-
- titre
- Analyse parcimonieuse des données d’IRM fonctionnelle dans un cadre bayésien variationnel
- auteur
- Christine Bakhous, Florence Forbes, Farida Enikeeva, Thomas Vincent, Michel Dojat, Philippe Ciuciu
- article
- 45èmes Journées de Statistique, Société Française de Statistique, May 2013, Toulouse, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bayesian BOLD and perfusion source separation and deconvolution from functional ASL imaging
- auteur
- Thomas Vincent, Florence Forbes, Philippe Ciuciu
- article
- ICASSP 2013 – IEEE International Conference on Acoustics, Speech, and Signal Processing, May 2013, Vancouver, Canada. pp.1003-1007, ⟨10.1109/ICASSP.2013.6637800⟩
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-
- titre
- Learning-induced modulation of scale-free properties of brain activity measured with MEG
- auteur
- Nicolas Zilber, Philippe Ciuciu, Patrice Abry, Virginie van Wassenhove
- article
- 10th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, IEEE, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.998-1001, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556645⟩
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-
- titre
- Multi-session extension of the joint-detection framework in fMRI
- auteur
- Solveig Badillo, Thomas Vincent, Philippe Ciuciu
- article
- ISBI 2013 – International Symposium on BIomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2013, San Fransisco, United States. pp.1512-1515, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556822⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Variational Variable Selection To Assess Experimental Condition Relevance In Event-Related fMRI
- auteur
- Christine Bakhous, Florence Forbes, Thomas Vincent, Michel Dojat, Philippe Ciuciu
- article
- ISBI 2013 – 10th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.1508-1511, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556821⟩
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-
- titre
- Variable Density Compressed Sensing In MRI. Theoretical vs Heuristic Sampling Strategies
- auteur
- Nicolas Chauffert, Philippe Ciuciu, Pierre Weiss
- article
- ISBI – 10th International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San Francisco, United States
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-
Theses
- titre
- Etude de la variabilité hémodynamique chez l’enfant et l’adulte sains en IRMf
- auteur
- Solveig Badillo
- article
- Autre [cond-mat.other]. Université Paris Sud – Paris XI, 2013. Français. ⟨NNT : 2013PA112279⟩
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-
2012
Journal articles
- titre
- An empirical comparison of surface-based and volume-based group studies in neuroimaging
- auteur
- Alan Tucholka, Virgile Fritsch, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- NeuroImage, 2012, 63 (3), pp.1443-53. ⟨10.1016/j.neuroimage.2012.06.019⟩
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-
- titre
- Hyperfrontality and hypoconnectivity during refreshing in schizophrenia.
- auteur
- Marie-Laure Grillon, Catherine Oppenheim, Gaël Varoquaux, Frédérique Charbonneau, Anne-Dominique Devauchelle, Marie-Odile Krebs, Franck Bayle, Bertrand Thirion, Caroline Huron
- article
- Psychiatry Research: Neuroimaging, 2012, 211 (3), pp.226-233. ⟨10.1016/j.pscychresns.2012.09.001⟩
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-
- titre
- Significant correlation between a set of genetic polymorphisms and a functional brain network revealed by feature selection and sparse Partial Least Squares.
- auteur
- Vincent Guillemot, Vincent Frouin, Philippe Pinel, Christophe Lalanne, Laura Trinchera, Arthur Tenenhaus, Antonio Moreno, Monica Zilbovicius, Thomas Bourgeron, Stanislas Dehaene, Bertrand Thirion, Jean-Baptiste Poline
- article
- NeuroImage, 2012, 63 (1), pp.11-24. ⟨10.1016/j.neuroimage.2012.06.061⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Automatic fiber bundle segmentation in massive tractography datasets using a multi-subject bundle atlas.
- auteur
- P. Guevara, D. Duclap, C. Poupon, L. Marrakchi-Kacem, P. Fillard, D. Lebihan, M. Leboyer, J. Houenou, J.-F. Mangin
- article
- NeuroImage, 2012, 61 (4), pp.1083-1099. ⟨10.1016/j.neuroimage.2012.02.071⟩
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-
- titre
- Multi-scale Mining of fMRI data with Hierarchical Structured Sparsity
- auteur
- Rodolphe Jenatton, Alexandre Gramfort, Vincent Michel, Guillaume Obozinski, Evelyn Eger, Francis Bach, Bertrand Thirion
- article
- SIAM Journal on Imaging Sciences, 2012, 5 (3), pp.835-856. ⟨10.1137/110832380⟩
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-
- titre
- PyXNAT: XNAT in Python
- auteur
- Yannick Schwartz, Alexis Barbot, Benjamin Thyreau, Vincent Frouin, Gaël Varoquaux, Aditya Siram, Daniel Marcus, Jean-Baptiste Poline
- article
- Frontiers in Neuroinformatics, 2012, 6 (12), pp.1-14. ⟨10.3389/fninf.2012.00012⟩
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-
- titre
- Detecting Outliers in High-Dimensional Neuroimaging Datasets with Robust Covariance Estimators
- auteur
- Virgile Fritsch, Gaël Varoquaux, Benjamin Thyreau, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Medical Image Analysis, 2012, 16, pp.1359-1370. ⟨10.1016/j.media.2012.05.002⟩
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-
- titre
- A-Brain: Using the Cloud to Understand the Impact of Genetic Variability on the Brain
- auteur
- Gabriel Antoniu, Alexandru Costan, Benoit da Mota, Bertrand Thirion, Radu Tudoran
- article
- ERCIM News, 2012, pp.21-22
- Accès au bibtex
-
- titre
- Mixed-norm estimates for the M/EEG inverse problem using accelerated gradient methods
- auteur
- Alexandre Gramfort, Matthieu Kowalski, Matti Hämäläinen
- article
- Physics in Medicine and Biology, 2012, 57 (7), pp.1937-1961. ⟨10.1088/0031-9155/57/7/1937⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Markov models for fMRI correlation structure: is brain functional connectivity small world, or decomposable into networks?
- auteur
- Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Journal of Physiology – Paris, 2012, 106, pp.212-221. ⟨10.1016/j.jphysparis.2012.01.001⟩
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-
- titre
- Genetic Variants of FOXP2 and KIAA0319/TTRAP/THEM2 Locus Are Associated with Altered Brain Activation in Distinct Language-Related Regions
- auteur
- P. Pinel, F. Fauchereau, A. Moreno, A. Barbot, M. Lathrop, D. Zelenika, D. Le Bihan, J.-B. Poline, T. Bourgeron, Stanislas Dehaene
- article
- Journal of Neuroscience, 2012, 32 (3), pp.817 – 825. ⟨10.1523/JNEUROSCI.5996-10.2012⟩
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-
- titre
- In Situ Synchrotron Microtomography Reveals Multiple Reaction Pathways During Soda-Lime Glass Synthesis
- auteur
- Emmanuelle Gouillart, Michael-J. Toplis, Julien Grynberg, Marie-Hélène Chopinet, Elin Sondergard, Luc Salvo, Michel Suéry, Marco Di Michiel, Gaël Varoquaux
- article
- Journal of the American Ceramic Society, 2012, 95 (5), pp.1504-1507. ⟨10.1111/j.1551-2916.2012.05151.x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Unsupervised spatio-functional clustering of fMRI data based on new functional feature
- auteur
- Samuel Emeriau, Frédéric Blanchard, Jean-Baptiste Poline, Laurent Pierot, Éric Bittar
- article
- International Journal of Signal and Imaging Systems Engineering, 2012, 5 (2), pp.93–100
- Accès au bibtex
-
- titre
- Changing computational research. The challenges ahead.
- auteur
- Cameron Neylon, Jan Aerts, C Titus Brown, Simon J Coles, Les Hatton, Daniel Lemire, K Jarrod Millman, Peter Murray-Rust, Fernando Perez, Neil Saunders, Nigam Shah, Arfon Smith, Gaël Varoquaux, Egon Willighagen
- article
- Source Code for Biology and Medicine, 2012, 7 (2), pp.2. ⟨10.1186/1751-0473-7-2⟩
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- A MapReduce Approach for Ridge Regression in Neuroimaging-Genetic Studies
- auteur
- Benoit da Mota, Michael Eickenberg, Soizic Laguitton, Vincent Frouin, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- DCICTIA-MICCAI – Data- and Compute-Intensive Clinical and Translational Imaging Applications in conjonction with the 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – 2012, Oct 2012, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Improving accuracy and power with transfer learning using a meta-analytic database
- auteur
- Yannick Schwartz, Gaël Varoquaux, Christophe Pallier, Philippe Pinel, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- MICCAI, Oct 2012, Nice, France. pp.1-8
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Sparse DSI: Learning DSI structure for denoising and fast imaging
- auteur
- Alexandre Gramfort, Poupon Cyril, Maxime Descoteaux
- article
- MICCAI, Oct 2012, Nice, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Joint T1 and Brain Fiber Log-Demons Registration Using Currents to Model Geometry
- auteur
- Viviana Siless, Joan Glaunès, Pamela Guevara, Jean-François Mangin, Cyril Poupon, Denis Le Bihan, Bertrand Thirion, Pierre Fillard
- article
- MICCAI, Oct 2012, Nice, France, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Graph-based inter-subject classification of local fMRI patterns
- auteur
- Sylvain Takerkart, Guillaume Auzias, Bertrand Thirion, Daniele Schön, Liva Ralaivola
- article
- Third International Workshop Machine Learning in Medical Imaging – MLMI 2012 (Held in Conjunction with MICCAI 2012), Oct 2012, Nice, France. pp 184-192, ⟨10.1007/978-3-642-35428-1_23⟩
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-
- titre
- A Novel Sparse Graphical Approach for Multimodal Brain Connectivity Inference
- auteur
- Bernard Ng, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Non-parametric Density Modeling and Outlier Detection in Medical Imaging Datasets
- auteur
- Virgile Fritsch, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Machine Learning in Medical Imaging – Miccai 2012 workshop, Oct 2012, Nice, France. pp.207-214
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Hemodynamic-informed parcellation of fMRI data in a Joint Detection Estimation framework
- auteur
- Lotfi Chaari, Florence Forbes, Thomas Vincent, Philippe Ciuciu
- article
- MICCAI 2012 – 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.180-188, ⟨10.1007/978-3-642-33454-2_23⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Learning to rank from medical imaging data
- auteur
- Fabian Pedregosa, Elodie Cauvet, Gaël Varoquaux, Christophe Pallier, Bertrand Thirion, Alexandre Gramfort
- article
- Third International Workshop on Machine Learning in Medical Imaging – MLMI 2012, INRIA, Oct 2012, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Robust voxel-wise Joint Detection Estimation of Brain Activity in fMRI
- auteur
- Lotfi Chaari, Florence Forbes, Thomas Vincent, Philippe Ciuciu
- article
- ICIP 2012 – 19th IEEE International Conference on Image Processing, Sep 2012, Orlando, United States. pp.1273-1276, ⟨10.1109/ICIP.2012.6467099⟩
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-
- titre
- A fast computational framework for genome-wide association studies with neuroimaging data
- auteur
- Benoit da Mota, Vincent Frouin, Edouard Duchesnay, Soizic Laguitton, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- 20th International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT 2012), Aug 2012, Limassol, Cyprus
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Improved brain pattern recovery through ranking approaches
- auteur
- Fabian Pedregosa, Elodie Cauvet, Gaël Varoquaux, Christophe Pallier, Bertrand Thirion, Alexandre Gramfort
- article
- PRNI 2012 : 2nd International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jul 2012, London, United Kingdom
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Connectivity-informed Sparse Classifiers for fMRI Brain Decoding
- auteur
- Bernard Ng, Viviana Siless, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion, Rafeef Abugharbieh
- article
- Pattern Recognition in Neuroimaging, Christos Davatzikos, Moritz Grosse-Wentrup, Janaina Mourao-Miranda, Dimitri Van De Ville, Jul 2012, London, United Kingdom
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-
- titre
- Decoding Visual Percepts Induced by Word Reading with fMRI
- auteur
- Alexandre Gramfort, Christophe Pallier, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- Pattern Recognition in NeuroImaging (PRNI), 2012 International Workshop on, Jul 2012, Londres, United Kingdom. pp.13-16, ⟨10.1109/PRNI.2012.20⟩
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-
- titre
- Multilayer Scattering Image Analysis Fits fMRI Activity in Visual Areas
- auteur
- Michael Eickenberg, Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion
- article
- International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jul 2012, London, United Kingdom
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-
- titre
- On spatial selectivity and prediction across conditions with fMRI
- auteur
- Yannick Schwartz, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- PRNI 2012 : 2nd International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jul 2012, London, United Kingdom. pp.53-56
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-
- titre
- Small-sample brain mapping: sparse recovery on spatially correlated designs with randomization and clustering
- auteur
- Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion
- article
- International Conference on Machine Learning, Andrew McCallum, Jun 2012, Edimbourg, United Kingdom
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-
- titre
- Template-Based Tractography for Clinical Neonatal Diffusion Imaging Data
- auteur
- Natasha Lepore, Fernando Yepes, Yi Lao, Ashok Panigraphy, Rafael Cheschin, Subhashree Ravichandran, Marvin D. Nelson, Pierre Fillard
- article
- Template-Based Tractography for Clinical Neonatal Diffusion Imaging Data, SPIE, Feb 2012, San Francisco CA, United States
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-
Poster communications
- titre
- Joint T1 and brain fiber diffeomorphic registration using the demons
- auteur
- Viviana Siless, Pamela Guevara, Xavier Pennec, Bertrand Thirion, Pierre Fillard
- article
- Organization for the Human Brain Mapping, Jun 2012, Beijing, China
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-
Documents associated with scientific events
- titre
- The adjoint method of OpenMEEG for EEG and MEG with large source space
- auteur
- Emmanuel Olivi, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc
- article
- Proceedings of Biomag, 2012, Paris, France. 2012
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-
2011
Journal articles
- titre
- Scikit-learn: Machine Learning in Python
- auteur
- Fabian Pedregosa, Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Vincent Michel, Bertrand Thirion, Olivier Grisel, Mathieu Blondel, Peter Prettenhofer, Ron Weiss, Vincent Dubourg, Jake Vanderplas, Alexandre Passos, David Cournapeau, Matthieu Brucher, Matthieu Perrot, Edouard Duchesnay
- article
- Journal of Machine Learning Research, 2011
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-
- titre
- Quantitative evaluation of 10 tractography algorithms on a realistic diffusion MR phantom.
- auteur
- Pierre Fillard, Maxime Descoteaux, Alvina Goh, Sylvain Gouttard, Ben Jeurissen, James Malcolm, Alonso Ramirez-Manzanares, Marco Reisert, Ken Sakaie, Fatima Tensaouti, Ting Yo, Jean-François Mangin, Cyril Poupon
- article
- NeuroImage, 2011, 56 (1), pp.220-34. ⟨10.1016/j.neuroimage.2011.01.032⟩
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-
- titre
- A supervised clustering approach for fMRI-based inference of brain states
- auteur
- Vincent Michel, Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Evelyn Eger, Christine Keribin, Bertrand Thirion
- article
- Pattern Recognition, 2011, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.patcog.2011.04.006⟩
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-
- titre
- Multiclass Sparse Bayesian Regression for fMRI-Based Prediction
- auteur
- Vincent Michel, Evelyn Eger, Christine Keribin, Bertrand Thirion
- article
- International Journal of Biomedical Imaging, 2011, 2011, ⟨10.1155/2011/350838⟩
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-
- titre
- Registration, atlas estimation and variability analysis of white matter fiber bundles modeled as currents.
- auteur
- Stanley Durrleman, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
- article
- NeuroImage, 2011, 55 (3), pp.1073-90. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.11.056⟩
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-
- titre
- The NumPy array: a structure for efficient numerical computation
- auteur
- Stefan van Der Walt, S. Chris Colbert, Gaël Varoquaux
- article
- Computing in Science and Engineering, 2011, 13 (2), pp.22-30. ⟨10.1109/MCSE.2011.37⟩
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-
- titre
- Total variation regularization for fMRI-based prediction of behaviour.
- auteur
- Vincent Michel, Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Evelyn Eger, Bertrand Thirion
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2011, 30 (7), pp.1328 – 1340. ⟨10.1109/TMI.2011.2113378⟩
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-
- titre
- Mayavi: 3D visualization of scientific data
- auteur
- Prabhu Ramachandran, Gaël Varoquaux
- article
- Computing in Science and Engineering, 2011, 13 (2), pp.40-51. ⟨10.1109/MCSE.2011.35⟩
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-
- titre
- DTI registration in atlas based fiber analysis of infantile Krabbe disease.
- auteur
- Yi Wang, Aditya Gupta, Zhexing Liu, Hui Zhang, Maria L Escolar, John H Gilmore, Sylvain Gouttard, Pierre Fillard, Eric Maltbie, Guido Gerig, Martin Styner
- article
- NeuroImage, 2011, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.neuroimage.2011.01.038⟩
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-
- titre
- Voxelwise multivariate statistics and brain-wide machine learning using the full diffusion tensor.
- auteur
- Anne-Laure Fouque, Pierre Fillard, Anne Bargiacchi, Arnaud Cachia, Monica Zilbovicius, Benjamin Thyreau, Edith Le Floch, Philippe Ciuciu, Edouard Duchesnay
- article
- Med Image Comput Comput Assist Interv, 2011, 14 (Pt 2), pp.9-16
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-
- titre
- Forward Field Computation with OpenMEEG.
- auteur
- Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc
- article
- Computational Intelligence and Neuroscience, 2011, 2011, pp.923703. ⟨10.1155/2011/923703⟩
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-
Conference papers
- titre
- A Comparative Study of Algorithms for Intra- and Inter-subjects fMRI Decoding
- auteur
- Vincent Michel, Alexandre Gramfort, Evelyn Eger, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- MLINI – Machine Learning and Interpretation in Neuroimaging – 2011, Dec 2011, Sierra Nevada, Spain. pp.1-8, ⟨10.1007/978-3-642-34713-9_1⟩
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-
- titre
- Statistical Learning for Resting-State fMRI: Successes and Challenges
- auteur
- Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- Machine Learning and Interpretation in Neuroimaging, NIPS workshop, Dec 2011, Sierra Nevada, Spain. pp.172-177, ⟨10.1007/978-3-642-34713-9_22⟩
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-
- titre
- Beyond brain reading: randomized sparsity and clustering to simultaneously predict and identify
- auteur
- Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- NIPS 2011 MLINI Workshop, Dec 2011, Granada, Spain. pp.9-16, ⟨10.1007/978-3-642-34713-9_2⟩
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-
- titre
- Detecting Outlying Subjects in High-Dimensional Neuroimaging Datasets with Regularized Minimum Covariance Determinant
- auteur
- Virgile Fritsch, Gaël Varoquaux, Thyreau Benjamin, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2011, Toronto, Canada. pp. 264-271, ⟨10.1007/978-3-642-23626-6_33⟩
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-
- titre
- Connectivity-informed fMRI Activation Detection
- auteur
- Bernard Ng, Abugharbieh Rafeef, Gaël Varoquaux, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Medical Image Computing and Computed Aided Intervention, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.285-292, ⟨10.1007/978-3-642-23629-7_35⟩
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-
- titre
- Joint T1 and Brain Fiber Diffeomorphic Registration Using the Demons
- auteur
- Viviana Siless, Pamela Guevara, Xavier Pennec, Pierre Fillard
- article
- Multimodal Brain Image Analysis First International Workshop, MBIA 2011, Held in Conjunction with MICCAI 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.10-18, ⟨10.1007/978-3-642-24446-9_2⟩
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-
- titre
- Apport des dictionnaires temps-fréquence, de la parcimonie et des structures pour l’imagerie cérébrale fonctionnelle M/EEG
- auteur
- Alexandre Gramfort, Daniel Strohmeier, Jens Haueisen, Matti Hämäläinen, Matthieu Kowalski
- article
- GRETSI 2011, Sep 2011, Bordeaux, France. pp.ID45
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-
- titre
- Functional brain imaging with M/EEG using structured sparsity in time-frequency dictionaries
- auteur
- Alexandre Gramfort, Daniel Strohmeier, Jens Haueisen, Matti Hamalainen, Matthieu Kowalski
- article
- International Conference on Information Processing in Medical Imaging (IPMI ’11), Jul 2011, Irsee, Germany. pp.600-611, ⟨10.1007/978-3-642-22092-0_49⟩
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-
- titre
- A probabilistic framework to infer brain functional connectivity from anatomical connections
- auteur
- Fani Deligianni, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, Emma Robinson, David J. Sharp, David A. Edwards, Daniel Rueckert
- article
- Information Processing in Medical Imaging, Gábor Székely, Horst Hahn, Jul 2011, Kaufbeuren, Germany. pp.296-307, ⟨10.1007/978-3-642-22092-0_25⟩
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-
- titre
- Multi-subject dictionary learning to segment an atlas of brain spontaneous activity
- auteur
- Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Fabian Pedregosa, Vincent Michel, Bertrand Thirion
- article
- Information Processing in Medical Imaging, Gábor Székely, Horst Hahn, Jul 2011, Kaufbeuren, Germany. pp.562-573, ⟨10.1007/978-3-642-22092-0_46⟩
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-
- titre
- Multi-scale Mining of fMRI Data with Hierarchical Structured Sparsity
- auteur
- Rodolphe Jenatton, Alexandre Gramfort, Vincent Michel, Guillaume Obozinski, Francis Bach, Bertrand Thirion
- article
- PRNI 2011 – IEEE International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, May 2011, Seoul, South Korea. ⟨10.1109/PRNI.2011.15⟩
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-
- titre
- M/EEG source reconstruction based on Gabor thresholding in the source space
- auteur
- Daniel Strohmeier, Alexandre Gramfort, Jens Haueisen, Matti Hämäläinen, Matthieu Kowalski
- article
- NFSI 2011, May 2011, Banff, Canada
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-
- titre
- Impact of the joint detection-estimation approach on random effects group studies in fMRI
- auteur
- Solveig Badillo, Thomas Vincent, Philippe Ciuciu
- article
- ISBI 2011 – IEEE Computer Society International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Mar 2011, Chicago, United States. pp.376-380, ⟨10.1109/ISBI.2011.5872427⟩
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- titre
- MULTIFRACTAL ANALYSIS OF RESTING STATE NETWORKS IN FUNCTIONAL MRI
- auteur
- Philippe Ciuciu, Gaël Varoquaux, Patrice Abry, Moty Almog
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2011, Chicago, United States. paper ID 1544
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-
- titre
- OpenMEEG for calibrating the conductivity of nested compartment models
- auteur
- Maureen Clerc, Jean-Michel Badier, Emmanuel Olivi, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo
- article
- EIT conference, 2011, Bath, United Kingdom
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-
Poster communications
- titre
- Adjoint method for lead-fields computation in MEEG.
- auteur
- Emmanuel Olivi, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc
- article
- HBM’2011, Jun 2011, Québec City, Canada
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-
2010
Journal articles
- titre
- Phase delays within visual cortex shape the response to steady-state visual stimulation.
- auteur
- Benoit Cottereau, Jean Lorenceau, Alexandre Gramfort, Maureen Clerc, Bertrand Thirion, Sylvain Baillet
- article
- NeuroImage, 2010, 54 (3), pp.1919-1929. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.10.004⟩
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-
- titre
- Tracking cortical activity from M/EEG using graph-cuts with spatiotemporal constraints.
- auteur
- Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Sylvain Baillet, Maureen Clerc
- article
- NeuroImage, 2010, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.09.087⟩
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-
- titre
- OpenMEEG: opensource software for quasistatic bioelectromagnetics
- auteur
- Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc
- article
- BioMedical Engineering OnLine, 2010, 9 (1), pp.45. ⟨10.1186/1475-925X-9-45⟩
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-
- titre
- A priori par normes mixtes pour les problèmes inverses: Application à la localisation de sources en M/EEG
- auteur
- Matthieu Kowalski, Alexandre Gramfort
- article
- Traitement du Signal, 2010, 27 (1), pp.51-76. ⟨10.3166/TraitementduSignal.vol(27)51-76⟩
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-
- titre
- A group model for stable multi-subject ICA on fMRI datasets.
- auteur
- Gaël Varoquaux, Sepideh Sadaghiani, Philippe Pinel, Andreas Kleinschmidt, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- NeuroImage, 2010, 51 (1), pp.288-99. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.02.010⟩
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-
- titre
- Inference of a HARDI fiber bundle atlas using a two-level clustering strategy.
- auteur
- Pamela Guevara, Cyril Poupon, Denis Rivière, Yann Cointepas, Linda Marrakchi, Maxime Descoteaux, Pierre Fillard, Bertrand Thirion, Jean-François Mangin
- article
- Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI .. International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, 2010, 13 (Pt 1), pp.550-7
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-
Conference papers
- titre
- Brain covariance selection: better individual functional connectivity models using population prior
- auteur
- Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Advances in Neural Information Processing Systems, John Lafferty, Dec 2010, Vancouver, Canada
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-
- titre
- Detection of brain functional-connectivity difference in post-stroke patients using group-level covariance modeling
- auteur
- Gaël Varoquaux, Flore Baronnet, Andreas Kleinschmidt, Pierre Fillard, Bertrand Thirion
- article
- Medical Image Computing and Computer Added Intervention, Tianzi Jiang, Sep 2010, Beijing, China. ⟨10.1007/978-3-642-15705-9_25⟩
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-
- titre
- Multi-Class Sparse Bayesian Regression for Neuroimaging data analysis
- auteur
- Vincent Michel, Evelyn Eger, Christine Keribin, Bertrand Thirion
- article
- International Workshop on Machine Learning in Medical Imaging (MLMI) In conjunction with MICCAI 2010, Sep 2010, Beijing, China. pp.50-58, ⟨10.1007/978-3-642-15948-0⟩
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-
- titre
- Accurate Definition of Brain Regions Position Through the Functional Landmark Approach
- auteur
- Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline
- article
- 13th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2010, Beijing, China
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-
- titre
- Parcellation Schemes and Statistical Tests to Detect Active Regions on the Cortical Surface
- auteur
- Bertrand Thirion, Alan Tucholka, Jean-Baptiste Poline
- article
- 19th International Conference on Computational Statistics, Aug 2010, Paris, France. pp.565–572
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-
- titre
- Imaging genetics: bio-informatics and bio-statistics challenges
- auteur
- Jean-Baptiste Poline, Christophe Lalanne, Arthur Tenenhaus, Edouard Duchesnay, Bertrand Thirion, Vincent Frouin
- article
- 19th International Conference on Computational Statistics, Aug 2010, Paris, France
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-
- titre
- Random Forests based feature selection for decoding fMRI data
- auteur
- Robin Genuer, Vincent Michel, Evelyn Eger, Bertrand Thirion
- article
- COMPSTAT 2010 – 19th International Conference on Computational Statistics, Aug 2010, Paris, France. pp.1071-1078
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-
- titre
- Total Variation regularization enhances regression-based brain activity prediction
- auteur
- Vincent Michel, Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- 1st ICPR Workshop on Brain Decoding – Pattern recognition challenges in neuroimaging – 20th International Conference on Pattern Recognition, Aug 2010, Istanbul, Turkey. pp.9-12, ⟨10.1109/WBD.2010.13⟩
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-
- titre
- A supervised clustering approach for extracting predictive information from brain activation images
- auteur
- Vincent Michel, Evelyn Eger, Christine Keribin, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Workshop on Mathematical Methods in Biomedical Image Analysis – IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2010, San Francisco, United States. pp.08
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-
- titre
- The symmetric BEM: bringing in more variables for better accuracy
- auteur
- Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Emmanuel Olivi, Théodore Papadopoulo
- article
- Biomag 2010, S. Supek, May 2010, Dubrovnik, Croatia. pp.109-112, ⟨10.1007/978-3-642-12197-5_21⟩
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-
- titre
- ICA-based sparse feature recovery from fMRI datasets
- auteur
- Gaël Varoquaux, Merlin Keller, Jean Baptiste Poline, Philippe Ciuciu, Bertrand Thirion
- article
- Biomedical Imaging, IEEE International Symposium on, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.1177
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-
- titre
- Multi-condition M/EEG inverse modeling with sparsity assumptions: how to estimate what is common and what is specific in multiple experimental conditions
- auteur
- Alexandre Gramfort
- article
- Biomag: International Conference on Biomagnetism, Mar 2010, Dubrovnik, Croatia
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-
- titre
- A hierarchical Bayesian model for frame representation
- auteur
- Lotfi Chaari, Jean-Christophe Pesquet, Jean-Yves Tourneret, Philippe Ciuciu, Amel Benazza-Benyahia
- article
- IEEE International Conference Acoustics, Speech, and Signal (ICASSP), Mar 2010, Dallas, USA, France. pp.4086-4089
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-
- titre
- Connectivity feature extraction for spatio-functional clustering of fMRI data
- auteur
- Samuel Emeriau, Frédéric Blanchard, Jean-Baptiste Poline, Laurent Pierot, Éric Bittar
- article
- International Conference on Image Processing Theory, Tools and Applications, 2010, Paris, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Probabilistic atlas of the connections between the basal ganglia and the cortex
- auteur
- L. Marrakchi-Kacem, F Poupon, P Roca, A Tucholka, C Delmaire, E Bardinet, M Sharman, R Valabregue, Arnaud Messé, Caroline Malherbe, Habib Benali, A Durr, J F Mangin, Stéphane Lehéricy, C. Poupon
- article
- Proceedings of the ISMRM 18th Annual Scientific Meeting and Exhibition, 2010, Stockholm, Sweden, Sweden
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-
Other publications
- titre
- Horizontal Data Fusion for Integrative Modelling: the MedINRIA Fusion Toolbox
- auteur
- Benoît Bleuzé, Olivier Clatz, Pierre Fillard, Maxime Sermesant, Nicolas Toussaint, Julien Wintz
- article
- 2010
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Poster communications
- titre
- OpenMEEG for M/EEG forward modeling: a comparison study
- auteur
- Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc
- article
- Human Brain Mapping, Jun 2010, Barcelone, Spain
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An empirical evaluation of free BEM solvers for M/EEG forward modeling
- auteur
- Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc
- article
- Biomag, May 2010, Dubrovnik, Croatia. 2010
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-
Theses
- titre
- Understanding the visual cortex by using classification techniques
- auteur
- Vincent Michel
- article
- Human-Computer Interaction [cs.HC]. Université Paris Sud – Paris XI, 2010. English. ⟨NNT : ⟩
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-
2009
Journal articles
- titre
- An automatic valuation system in the human brain: evidence from functional neuroimaging.
- auteur
- Maël Lebreton, Soledad Jorge, Vincent Michel, Bertrand Thirion, Mathias Pessiglione
- article
- Neuron, 2009, 64 (3), pp.431-9. ⟨10.1016/j.neuron.2009.09.040⟩
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-
- titre
- Deciphering cortical number coding from human brain activity patterns.
- auteur
- Evelyn Eger, Vincent Michel, Bertrand Thirion, Alexis Amadon, Stanislas Dehaene, Andreas Kleinschmidt
- article
- Current Biology – CB, 2009, 19 (19), pp.1608-15. ⟨10.1016/j.cub.2009.08.047⟩
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-
- titre
- Recruitment of an area involved in eye movements during mental arithmetic.
- auteur
- André Knops, Bertrand Thirion, Edward M Hubbard, Vincent Michel, Stanislas Dehaene
- article
- Science, 2009, 324 (5934), pp.1583-5. ⟨10.1126/science.1171599⟩
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-
- titre
- Python comme langage scientifique
- auteur
- Gaël Varoquaux
- article
- Linux Magazine France, 2009, Explorer les richesses du langage Python, 40
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Brain classification reveals the right cerebellum as the best biomarker of dyslexia.
- auteur
- Cyril R Pernet, Jean Baptiste Poline, Jean François Demonet, Guillaume A. Rousselet
- article
- BMC Neuroscience, 2009, 10, pp.67. ⟨10.1186/1471-2202-10-67⟩
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-
- titre
- Joint Bayesian cortical sulci recognition and spatial normalization.
- auteur
- Matthieu Perrot, Denis Rivière, Alan Tucholka, Jean-François Mangin
- article
- Information processing in medical imaging : proceedings of the .. conference., 2009, 21, pp.176-87
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Discriminative network models of Schizophrenia
- auteur
- Guillermo A. Cecchi, Irina Rish, Benjamin Thyreau, Bertrand Thirion, Marion Plaze, Jean-Luc Martinot, Marie-Laure Pallière-Martinot, Jean-Baptiste Poline
- article
- NIPS 2009 – 23rd Annual Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2009, Vancouver, Canada. pp.252-260
- Accès au bibtex
-
- titre
- Surface-based versus volume-based fMRI group analysis: a case study
- auteur
- Alan Tucholka, Merlin Keller, Jean-Baptiste Poline, Alexis Roche, Bertrand Thirion
- article
- MICCAI 2009 Functional NeuroImaging Workshop, Bertrand Thirion, Alexis Roche, Philippe Ciuciu, Sep 2009, Londres, United Kingdom
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Constructing a dictionary of human brain folding patterns
- auteur
- Zhong Yi Sun, Matthieu Perrot, Alan Tucholka, Denis Rivière, Jean-François Mangin
- article
- Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2009, Sep 2009, London, United Kingdom. pp.117-24
- Accès au bibtex
-
- titre
- CanICA: Model-based extraction of reproducible group-level ICA patterns from fMRI time series
- auteur
- Gaël Varoquaux, Sepideh Sadaghiani, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Medical Image Computing and Computer Aided Intervention, Sep 2009, London, United Kingdom. pp.1
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Adaptive multi-class Bayesian sparse regression – An application to brain activity classification
- auteur
- Vincent Michel, Evelyn Eger, Christine Keribin, Bertrand Thirion
- article
- MICCAI 2009: fMRI data analysis workshop – Medical Image Computing and Computer Aided Intervention, Sep 2009, London, United Kingdom. pp.1
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Proceedings of the 8th Python in Science conference
- auteur
- Gaël Varoquaux, Stefan van Der Walt, Jarrod Millman
- article
- SciPy 2009: 8th Python in Science Conference, Aug 2009, Pasadena, United States. pp.1-78
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-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Structural and probabilistic methods for group analysis in functional neuroimaging
- auteur
- Bertrand Thirion
- article
- Life Sciences [q-bio]. École normale supérieure de Cachan – ENS Cachan, 2009
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-
2008
Journal articles
- titre
- A fully Bayesian approach to the parcel-based detection-estimation of brain activity in fMRI.
- auteur
- Salima Makni, Jérôme Idier, Thomas Vincent, Bertrand Thirion, Ghislaine Dehaene-Lambertz, Philippe Ciuciu
- article
- NeuroImage, 2008, 41 (3), pp.941-69. ⟨10.1016/j.neuroimage.2008.02.017⟩
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-
- titre
- Agile Computer Control of a Complex Experiment
- auteur
- Gaël Varoquaux
- article
- Computing in Science and Engineering, 2008, 10 (2), pp.55-59. ⟨10.1109/MCSE.2008.47⟩
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- titre
- Connectivity-Based Parcellation of the Cortical Mantle Using q-Ball Diffusion Imaging
- auteur
- Muriel Perrin, Yann Cointepas, Arnaud Cachia, Cyril Poupon, Bertrand Thirion, Denis Rivière, Pascal Cathier, Vincent El Kouby, André Constantinesco, Denis Le Bihan, Jean-François Mangin
- article
- International Journal of Biomedical Imaging, 2008, 2008, pp.368406. ⟨10.1155/2008/368406⟩
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- titre
- Probabilistic anatomo-functional parcellation of the cortex: how many regions?
- auteur
- Alan Tucholka, Bertrand Thirion, Matthieu Perrot, Philippe Pinel, Jean-François Mangin, Jean-Baptiste Poline
- article
- Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI .. International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, 2008, 11 (Pt 2), pp.399-406. ⟨10.1007/978-3-540-85990-1_48⟩
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Conference papers
- titre
- Proceedings of the 7th Python in Science conference
- auteur
- Gaël Varoquaux, Travis Vaught, Jarrod Millman
- article
- SciPy 2008: 7th Python in Science Conference, Aug 2008, Pasadena, United States. pp.1-78
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- titre
- Mayavi: Making 3D Data Visualization Reusable
- auteur
- Gaël Varoquaux, Prabhu Ramachandran
- article
- SciPy 2008: 7th Python in Science Conference, Aug 2008, Pasadena, United States. pp.51
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- titre
- Mutual information-based feature selection enhances fMRI brain activity classification
- auteur
- Vincent Michel, Cécilia Damon, Bertrand Thirion
- article
- 2008 5th IEEE international symposium on biomedical imaging: From nano to macro, May 2008, Paris, France. pp.592 – 595, ⟨10.1109/ISBI.2008.4541065⟩
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2007
Journal articles
- titre
- Analysis of a large fMRI cohort: Statistical and methodological issues for group analyses.
- auteur
- Bertrand Thirion, Philippe Pinel, Sébastien Mériaux, Alexis Roche, Stanislas Dehaene, Jean-Baptiste Poline
- article
- NeuroImage, 2007, 35 (1), pp.105-20. ⟨10.1016/j.neuroimage.2006.11.054⟩
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- titre
- Challenging the estimation of cortical activity from MEG with simulated fMRI-constrained retinotopic maps.
- auteur
- Alexandre Gramfort, Benoit Cottereau, Maureen Clerc, Bertrand Thirion, Sylvain Baillet
- article
- Conference proceedings : .. Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual Conference, 2007, 2007, pp.4945-8. ⟨10.1109/IEMBS.2007.4353450⟩
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-
- titre
- Geometric Means in a Novel Vector Space Structure on Symmetric Positive-Definite Matrices
- auteur
- Vincent Arsigny, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
- article
- SIAM Journal on Matrix Analysis and Applications, 2007, 29 (1), pp.328–347. ⟨10.1137/050637996⟩
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-
- titre
- Fast reproducible identification and large-scale databasing of individual functional cognitive networks
- auteur
- Philippe Pinel, Bertrand Thirion, Sébastien Meriaux, Antoinette Jobert, Julien Serres, Denis Le Bihan, Jean-Baptiste Poline, Stanislas Dehaene
- article
- BMC Neuroscience, 2007, 8 (1), pp.91. ⟨10.1186/1471-2202-8-91⟩
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Conference papers
- titre
- vtkINRIA3D: A VTK Extension for Spatiotemporal Data Synchronization, Visualization and Management
- auteur
- Nicolas Toussaint, Maxime Sermesant, Pierre Fillard
- article
- Proc. of Workshop on Open Source and Open Data for MICCAI, 2007, Brisbane, Australia, Australia
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- titre
- MedINRIA: Medical Image Navigation and Research Tool by INRIA
- auteur
- Nicolas Toussaint, Jean-Christophe Souplet, Pierre Fillard
- article
- Proc. of MICCAI’07 Workshop on Interaction in medical image analysis and visualization, 2007, Brisbane, Australia, Australia
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2006
Conference papers
- titre
- Clinical DT-MRI estimation, smoothing and fiber tracking with log-Euclidean metrics
- auteur
- Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
- article
- Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.786-789, ⟨10.1109/ISBI.2006.1625034⟩
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