Publications

Publications HAL du labo/EPI modemic

2017

Journal articles

titre
Experimental validation of a simple dynamic model of a laboratory scale recirculating aquaculture system fitted with submerged membrane bioreactor
auteur
Guilherme Araujo Pimentel, Pedro Miranda Almeida, Anne-Lise Hantson, Alain Rapaport, Alain Vande Wouwer
article
Biochemical Engineering Journal, Elsevier, 2017, 122, pp.1-12. ⟨10.1016/j.bej.2017.02.005⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01465570/file/sMBR_Pilot_14.pdf BibTex

Books

titre
Le Chemostat. Théorie mathématique de la culture continue de micro-organismes
auteur
Jérôme Harmand, Claude Lobry, Alain Rapaport, Tewfik Sari
article
ISTE, pp.240, 2017, 978-1-78405-218-8
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2016

Journal articles

titre
Corrigendum to “Design, analysis and validation of a simple dynamic model of a submerged membrane bioreactor”
auteur
Guilherme Araujo Pimentel, Alain Vande Wouver, Jérôme Harmand, Alain Rapaport
article
Water Research, IWA Publishing, 2016, 89, pp.384-385. ⟨10.1016/j.watres.2015.10.044⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02638986/file/Publis15-mistea-017_pimentel_corrigendum_1.pdf BibTex
titre
Modelling of biological decontamination of a water resource in natural environment and related feedback strategies
auteur
Sébastien Barbier, Alain Rapaport, Antoine Rousseau
article
Journal of Scientific Computing, Springer Verlag, 2016, 68 (3), pp.1267-1280. ⟨10.1007/s10915-016-0178-9⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01138335/file/BRR-JSC.pdf BibTex
titre
Quantitative results for the Fleming–Viot particle system and quasi-stationary distributions in discrete space
auteur
Bertrand Cloez, Marie-Noémie Thai
article
Stochastic Processes and their Applications, Elsevier, 2016, 126 (3), pp.680-702. ⟨10.1016/j.spa.2015.09.016⟩
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https://arxiv.org/pdf/1312.2444 BibTex
titre
Emergence of coexistence and limit cycles in the chemostat model with flocculation for a general class of functional responses
auteur
R. Fekih-Salem, Alain Rapaport, T. Sari
article
Applied Mathematical Modelling, Elsevier, 2016, 40 (17-18), pp.7656-7677. ⟨10.1016/j.apm.2016.03.028⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01294253/file/AMM-FRS-2016Mars28-Final.pdf BibTex
titre
Optimal feedback synthesis and minimal time function for the bioremediation of water resources with two patches
auteur
Hector Ramirez Cabrera, Alain Rapaport, Victor Riquelme
article
SIAM Journal on Control and Optimization, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2016, 54 (3), pp.1697-1718. ⟨10.1137/140989443⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01300953/file/twozones_final.pdf BibTex
titre
Dynamical modelling and optimal control of landfills
auteur
Alain Rapaport, Térence Bayen, Matthieu Sebbah, Andres Donoso-Bravo, Alfredo Torrico
article
Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, World Scientific Publishing, 2016, 26 (5), pp.901-929. ⟨10.1142/S0218202516500214⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01087946/file/Publis15-mistea-028_rapaport_dynamical_1.pdf BibTex
titre
Perspectives in Mathematical Modelling for Microbial Ecology
auteur
Matthew J. Wade, Jérôme Harmand, Boumediene Benyahia, Théodore Bouchez, Stephane Chaillou, Bertrand Cloez, Jean-Jacques Godon, Claude Lobry, Boumédiène Moussa Boubjemaa, Alain Rapaport, Tewfik Sari, Roger Arditi
article
Ecological Modelling, Elsevier, 2016, 321 (64-74), pp.64-74. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2015.11.002⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01227423/file/EcologicalModelling2016.pdf BibTex

Conference papers

titre
About minimal time crisis problems and population dynamics examples
auteur
Alain Rapaport
article
International Workshop on Decision Models and Population Management, Feb 2016, Paris, France
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Preprints, Working Papers, …

titre
No-regret optimal control redefinition and consequences
auteur
Hafdallah Abdelhak, Ayadi Abdelhamid
article
2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01312321/file/No-regret%20optimal%20control%20redefinition%20and.pdf BibTex
titre
Modeling and optimization of activated sludge bioreactors for wastewater treatment taking into account spatial inhomogeneities.
auteur
Maria Crespo, Benjamin Ivorra, Angel M. Ramos, Alain Rapaport
article
2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01171033/file/HAL_Modeling%20and%20optimization%20of%20activated%20sludge%20bioreactors%20for%20wastewater%20treatment%20taking%20into%20account%20spatial%20inhomogeneities.pdf BibTex

2015

Journal articles

titre
Design, Analysis and Validation of a Simple Dynamic Model of a Submerged Membrane Bioreactor
auteur
Guilherme Araujo Pimentel, Alain Vande Wouwer, Jerome Harmand, Alain Rapaport
article
Water Research, IWA Publishing, 2015, 70, pp.97-108. ⟨10.1016/j.watres.2014.11.043⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01087630/file/Publis14-mistea-021_1.pdf BibTex
titre
Is dispersal always beneficial to carrying capacity? New insights from the multi-patch logistic equation
auteur
Roger Arditi, Claude Lobry, Tewfik Sari
article
Theoretical Population Biology, Elsevier, 2015, 106, pp.45-59. ⟨10.1016/j.tpb.2015.10.001⟩
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BibTex
titre
Multi-Rate Mass Transfer (MRMT) models for general diffusive porosity structures
auteur
Tristan Babey, Jean-Raynald de Dreuzy, Céline Casenave
article
Advances in Water Resources, Elsevier, 2015, 76, pp.146-156. ⟨10.1016/j.advwatres.2014.12.006⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01102049/file/Babey%20et%20al.%20-%202014%20-%20Multi-Rate%20Mass%20Transfer%20%28MRMT%29%20models%20for%20general_preprint.pdf BibTex
titre
Optimal feeding strategy for the minimal time problem of a fed-batch bioreactor with mortality rate
auteur
Térence Bayen, Francis Mairet, Marc Mazade
article
Optimal Control Applications and Methods, Wiley, 2015, 36 (1), pp.77-92. ⟨10.1002/oca.2102⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00759058/file/manuscript-rev2-hal.pdf BibTex
titre
Analysis of an optimal control problem connected to bioprocesses involving a saturated singular arc
auteur
Térence Bayen, Marc Mazade, Francis Mairet
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, American Institute of Mathematical Sciences, 2015, 20 (1), pp.39-58. ⟨10.3934/dcdsb.2015.20.39⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00879385/file/dcds-b-3.pdf BibTex
titre
Analysis of a periodic optimal control problem connected to microalgae anaerobic digestion
auteur
Térence Bayen, Francis Mairet, Pierre Martinon, Matthieu Sebbah
article
Optimal Control Applications and Methods, Wiley, 2015, 36 (6), pp.750-773. ⟨10.1002/oca.2127⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00860570/file/BMMS-HAL.pdf BibTex
titre
A stochastic approximation approach to quasi-stationary distributions on finite spaces
auteur
Michel Benaïm, Bertrand Cloez
article
Electronic Communications in Probability, Institute of Mathematical Statistics (IMS), 2015, 20 (37), pp.1-14. ⟨10.1214/ECP.v20-3956⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01185942/file/Publis15-mistea-008_1.pdf BibTex
titre
Weak Convergence of a Mass-Structured Individual-Based Model
auteur
Fabien Campillo, Coralie Fritsch
article
Applied Mathematics and Optimization, Springer Verlag (Germany), 2015, 72 (1), pp.37-73. ⟨10.1007/s00245-014-9271-3⟩
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BibTex
titre
Soluble microbial products and suspended solids influence in membrane fouling dynamics and interest of punctual relaxation and/or backwashing
auteur
Amine Charfi, yesican yang, Jérôme Harmand, Nihel Ben Amar, Marc Heran, Alain Grasmick
article
Journal of Membrane Science, Elsevier, 2015, 475, pp.156-166. ⟨10.1016/j.memsci.2014.09.059⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01159247/file/CharfiYang-JMS2015-postprint_%7B765D19E8-408C-4145-945C-3680C77391B0%7D.pdf BibTex
titre
Light-driven increase in carbon yield is linked to maintenance in the proteorhodopsin-containing Photobacterium angustum S14
auteur
Alicia Courties, Thomas Riedel, Alain Rapaport, Philippe Lebaron, Marcelino Suzuki
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2015, 6, pp.688. ⟨10.3389/fmicb.2015.00688⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01228516/file/fmicb-06-00688.pdf BibTex
titre
A generic and systematic procedure to derive a simplified model from the anaerobic digestion model No. 1 (ADM1)
auteur
Sonia Hassam, Elena Ficara, Alberto Leva, Jérôme Harmand
article
Biochemical Engineering Journal, Elsevier, 2015, 99, pp.193-203. ⟨10.1016/j.bej.2015.03.007⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01243661/file/accepted_manuscript__hassam_generic_1.pdf BibTex
titre
Migrations in the Rosenzweig-MacArthur model and the “atto-fox” problem
auteur
Claude Lobry, Tewfik Sari
article
Revue Africaine de la Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées, INRIA, 2015, Volume 20 – 2015 – Special issue – Colloquium in Honor of Éric Benoît, pp.95-125. ⟨10.46298/arima.1990⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01235211/file/vol.20.pp.95-125.pdf BibTex
titre
Analysis, simulation and impedance operator of a nonlocal model of porous medium for acoustic control
auteur
Emmanuel Montseny, Céline Casenave
article
Journal of Vibration and Control, SAGE Publications, 2015, 21 (5), pp. 1012-1028. ⟨10.1177/1077546313493815⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00854312/file/Montseny_et_al._-_2013_-_Analysis_simulation_and_impedance_operator_of_a_non_local_model_of_porous_medium_for_acoustic_control.pdf BibTex
titre
Global dynamics of the buffered chemostat for a general class of response functions
auteur
Alain Rapaport, Ihab Haidar, Jérôme Harmand
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2015, 71 (1), pp.69-98. ⟨10.1007/s00285-014-0814-7⟩
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Conference papers

titre
Nonlinear Model Predictive Control of a Wastewater Treatment Process Fitted with a Submerged Membrane Bioreactor
auteur
Guilherme Araujo Pimentel, Alain Rapaport, Alain Vande Wouwer
article
IFAC International Symposium on Advanced Control of Chemical Processes (ADCHEM 2015), International Federation of Automatic Control (IFAC). AUT., Jun 2015, Whistler, British Columbia, Canada. pp.1246-1251, ⟨10.1016/j.ifacol.2015.09.139⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01154418/file/PimentelRapaportVandeWouverADCHEM2015.pdf BibTex
titre
Necessary Optimality Conditions for the Time of Crisis Control Problem
auteur
Térence Bayen, Alain Rapaport
article
SIAM Conference on Control & Applications CT15, Jul 2015, Paris, France
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BibTex
titre
Analyse mathématiques de modèles de digestion anaérobie avec phase d’hydrolyse
auteur
yessmine Daoud, Nahla Abdellatif, Jerome Harmand
article
TAMTAM’15, May 2015, Tanger, Maroc
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BibTex
titre
Multi-objective optimization of large-size wastewater treatment plants operation and design
auteur
Rainier Hreiz, Nicolas Roche, Brahim Benyahia, Abderrazak M. Latifi.
article
ECCE 10, Sep 2015, Nice, France
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BibTex
titre
Anaerobic digestion models for control purposes: a short survey
auteur
Zeyneb Khedim, Sonia Hassam, Jérôme Harmand, Boumediene Benyahia
article
14. World Congress on Anaerobic Digestion (AD14), International Water Association (IWA). INT., Nov 2015, Viña del Mar, Chile
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https://hal.inrae.fr/hal-02739672/file/khedim_1.pdf BibTex
titre
Images mathématiques ou Vérité mathématique ?
auteur
Claude Lobry
article
Séminaire IVI : Idée, Vérité, Image, Jan 2015, Nice, France
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https://halshs.archives-ouvertes.fr/halshs-01167427/file/Lobry.pdf BibTex
titre
Optimal Control of Landfills
auteur
Alain Rapaport, Térence Bayen, Matthieu Sebbah, Andres Donoso-Bravo, A Torrico
article
SIAM Conference on Control & Applications CT15, Society for Industrial and Applied Mathematics (SIAM). USA. Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (INRIA)., Jul 2015, Paris, France
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BibTex
titre
Minimal-Time Bioremediation of Water Resources with Two Patches
auteur
Victor Riquelme, Hector Ramirez, Alain Rapaport
article
SIAM Conference on Control & Applications CT15, Jul 2015, Paris, France
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BibTex
titre
Comparison between the MINC and MRMT Configurations: The n-dimensional Case
auteur
Alejandro Rojas-Palma, Alain Rapaport, Jean-Raynald de Dreuzy, Hector Ramirez
article
SIAM Conference on Control & Applications CT15, Jul 2015, Paris, France
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Book sections

titre
Dynamics of Nonautonomous Chemostat Models
auteur
Tomas Caraballo, Xiaoying Han, Peter Kloeden, Alain Rapaport
article
Sadovnichiy, Viktor A.; Zgurovsky, Mikhail Z. Continuous and Distributed Systems Theory and Applications Part II, 30, Springer, pp.103-120, 2015, Studies in Systems, Decision and Control, 978-3-319-19074-7. ⟨10.1007/978-3-319-19075-4_6⟩
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BibTex

Lectures

titre
Ecole chercheurs Modèles ressources-consommateurs
auteur
Bertrand Cloez, Tanguy Daufresne, Thomas Koffel, Jérôme Harmand, Claude Lobry, Alain Rapaport, Tewfik Sari, Claude Plassard
article
École thématique. Modèles Ressources-Consommateurs, Montpellier, France. 2015
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https://hal.inria.fr/cel-01206385/file/Ecole%20chercheurs%20Mod%C3%A8les%20ressources-consommateurs-3.pdf BibTex

Master thesis

titre
Etude mathématique et numérique du sur-rendement dans les modèles d’écologie microbienne
auteur
Aymen Abdelhamid
article
Biotechnologies. 2015
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https://hal.inria.fr/hal-01213904/file/Rapport-stage%5BAbdelhamid_Aymen%5D.pdf BibTex

Other publications

titre
Apport de la modélisation et des simulations numériques pour l’écologie microbienne
auteur
Alain Rapaport
article
Septième École Interdisciplinaire de Rennes sur les Systèmes Complexes, Rennes, France, 2015
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BibTex

Theses

titre
Réduction de modèles de procédés biotechnologiques : Applications à l’ADM1
auteur
Sonia Hassam
article
Automatique / Robotique. Université de Tlemcen, 2015. Français
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01249831/file/These_Hassam_Sonia%20%281%29.pdf https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01249831/file/These_Hassam_Sonia.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
Is dispersal always beneficial to carrying capacity? New insights from the multi-patch logistic equation
auteur
Roger Arditi, Claude Lobry, Tewfik Sari
article
2015
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01153368/file/ArditiLobrySariDispersal.pdf BibTex
titre
Lotka Volterra in fluctuating environment or “how good can be bad
auteur
Michel Benaïm, Claude Lobry
article
2015
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https://arxiv.org/pdf/1412.1107 BibTex
titre
Emergence of coexistence and limit cycles in the chemostat model with flocculation for a general class of functional responses
auteur
Radhouane Fekih-Salem, Alain Rapaport, Tewfik Sari
article
2015
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https://hal.inria.fr/hal-01121201/file/Elsarticle-FRS-HAL.pdf BibTex
titre
A model of a syntrophic relationship between two microbial species in a chemostat including maintenance
auteur
Tewfik Sari, Jérôme Harmand
article
2015
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01026149/file/SariHarmandSynthropy2015.pdf BibTex

2014

Journal articles

titre
Optimization of the separation of two species in a chemostat
auteur
Térence Bayen, Francis Mairet
article
Automatica, Elsevier, 2014, 50 (4), pp.1243-1248. ⟨10.1016/j.automatica.2014.02.024⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00817147/file/preprint-HAL.pdf BibTex
titre
Minimal Time Control of the Two Tanks Gradostat Model Under a Cascade Input Constraint
auteur
Térence Bayen, Alain Rapaport, Matthieu Sebbah
article
SIAM Journal on Control and Optimization, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2014, 52 (4), pp.2568-2594. ⟨10.1137/130950379⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00798651/file/Final-version.pdf BibTex
titre
Commande optimale en temps minimal d’un procédé biologique d’épuration de l’eau
auteur
Walid Bouafs, Nahla Abdellatif, Frédéric Jean, Harmand Jérôme
article
Revue Africaine de la Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées, INRIA, 2014, Volume 18, 2014, pp.35-51. ⟨10.46298/arima.1978⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01300091/file/Vol.18.pp.37-51.pdf BibTex
titre
Modélisation en dynamique des populations
auteur
Fabien Campillo
article
Interstices, INRIA, 2014
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BibTex
titre
Markov analysis of land use dynamics – A Case Study in Madagascar
auteur
Fabien Campillo, Dominique Hervé, Angelo Raherinirina, Rivo Rakotozafy
article
Revue Africaine de la Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées, INRIA, 2014, Volume 17 – 2014 – Special issue CARI’12, pp.1-22. ⟨10.46298/arima.1964⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00924077/file/Vol.17.pp.1-22.pdf BibTex
titre
Approximation of the Fokker-Planck equation of the stochastic chemostat
auteur
Fabien Campillo, Marc Joannides, Irène Larramendy-Valverde
article
Mathematics and Computers in Simulation, Elsevier, 2014, 99, pp.37-53. ⟨10.1016/j.matcom.2013.04.012⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00644250/file/paper-chemostat-DF.pdf BibTex
titre
Model identification and reduction for the control of an ice cream crystallization process
auteur
Céline Casenave, Denis Dochain, Graciela Alvarez, Marcela Arellano, Hayat Benkhelifa, Denis Leducq
article
Chemical Engineering Science, Elsevier, 2014, 119, pp.274-287. ⟨10.1016/j.ces.2014.08.030⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01063877/file/Casenave_et_al._-_2014_-_Model_identification_and_reduction_for_the_control.pdf BibTex
titre
Deposit membrane fouling: influence of specific cake layer resistance and tangential shear stresses
auteur
Amine Charfi, Jérôme Harmand, Nihel Benamar, Alain Grasmick, Marc Héran
article
Water Science and Technology, IWA Publishing, 2014, 70 (1), pp.40-46. ⟨10.2166/wst.2014.186⟩
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BibTex
titre
Analyse mathématique d’un modèle de digestion anaérobie à trois étapes
auteur
Radhouane Fekih-Salem, Nahla Abdellatif, Tewfik Sari, Harmand Jérôme
article
Revue Africaine de la Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées, INRIA, 2014, Volume 17 – 2014 – Special issue CARI’12, pp.53-71. ⟨10.46298/arima.1967⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01300059/file/Vol.17.pp.53-71.pdf BibTex
titre
Community assembly effects shape the biodiversity ecosystem functioning relationships
auteur
Benoit Jaillard, Alain Rapaport, Jérôme Harmand, Alain Brauman, Naoise Nunan
article
Functional Ecology, Wiley, 2014, 28 (6), pp.1523-1533. ⟨10.1111/1365-2435.12267⟩
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BibTex
titre
Priming effect and microbial diversity in ecosystem functioning and response to global change: a modeling approach using the SYMPHONY model
auteur
Nazia Perveen, Sébastien Barot, Gaël Alvarez, Katja Klumpp, Alain Rapaport, Sébastien Fontaine
article
Global Change Biology, Wiley, 2014, 20 (4), pp.1174-1190. ⟨10.1111/gcb.12493⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00914045/file/Symphony%20GCB_1.pdf BibTex
titre
Corrigendum to “Microbial food web dynamics in response to a Saharan dust event: results from a mesocosm study in the oligotrophic Mediterranean Sea” published in Biogeosciences
auteur
Elvira Pulido-Villena, Anne-Claire Baudoux, I Obernosterer, M Landa, J Caparros, P Catala, C Georges, Jérome Harmand, C Guieu
article
Biogeosciences, European Geosciences Union, 2014, 11 (22), pp.6355 – 6356. ⟨10.5194/bg-11-6355-2014⟩
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https://hal.univ-brest.fr/hal-01104305/file/bg-corrigendum-Pulido-Villena.pdf BibTex
titre
Microbial food web dynamics in response to a Saharan dust event: results from a mesocosm study in the oligotrophic Mediterranean Sea
auteur
Elvira Pulido-Villena, Anne-Claire Baudoux, I Obernosterer, M Landa, J Caparros, P Catala, C Georges, Jérôme Harmand, C Guieu
article
Biogeosciences, European Geosciences Union, 2014, 11 (19), pp.5607 – 5619. ⟨10.5194/bg-11-5607-2014⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01090615/file/2014-biogeosciences-bg-11-5607.pdf BibTex
titre
Optimality of affine control system of several species in competition on a Sequential Batch Reactor
auteur
J.C. Rodriguez, Hector Ramirez, Pedro Gajardo, Alain Rapaport
article
International Journal of Control, Taylor & Francis, 2014, 87 (9), pp.1877-1885. ⟨10.1080/00207179.2014.891360⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01088224/file/Optimality%20of%20affine%20control%20system%20of%20several%20species%20in%20competition%20on%20a%20Sequential%20Batch%20Reactor_F.pdf BibTex

Conference papers

titre
Minimal time problem for a fed-batch bioreactor with a non admissible singular arc
auteur
Térence Bayen, Francis Mairet, Marc Mazade
article
European Control Conference (ECC), Université de Strasbourg (Unistra). Strasbourg, FRA. IEEE Control Systems Society., Jun 2014, Strasbourg, France. pp.165-170, ⟨10.1109/ECC.2014.6862444⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01095694/file/ecc-bayen-mairet-mazade_vf.pdf BibTex
titre
Minimal time problem for a chemostat model with growth rate of Haldane type
auteur
Terence Bayen, Jérome Harmand
article
ECC 2014 : European Control Conference, Université de Strasbourg (Unistra). France, FRA. IEEE Control Systems Society., Jun 2014, Strasbourg, France. pp.1562-1567, ⟨10.1109/ECC.2014.6862401⟩
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titre
Minimal time control of the two tanks gradostat model under cascade inputs constraint
auteur
Terence Bayen, Alain Rapaport, Matthieu Sebbah
article
European Control Conference ECC2014, Université de Strasbourg (Unistra). France, FRA. IEEE Control Systems Society., Jun 2014, Strasbourg, France. pp.1256 – 1261, ⟨10.1109/ECC.2014.6862148⟩
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titre
Control of a Multi-Stage Continuous Fermentor for the study of the wine fermentation
auteur
Céline Casenave, Denis Dochain, Jérôme Harmand, Marc Perez, Alain Rapaport, Jean-Marie Sablayrolles
article
19th IFAC World Congress 2014, Aug 2014, Cap Town, South Africa. ⟨10.3182/20140824-6-ZA-1003.00627⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01064704/file/Preprint_Casenave_et_al._-_2014_-_Control_of_a_Multi-Stage_Continuous_Fermentor_for_.pdf BibTex
titre
Contrôle de paramètres dans un chémostat
auteur
Jérôme Harmand
article
Colloque National d’Assimilation de Données, Dec 2014, Toulouse, France
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https://hal.inria.fr/hal-01090655/file/Publis14-mistea-040_1.pdf BibTex
titre
Inferring land use dynamics by semi-Markov model
auteur
Angelo Raherinirina, Dominique Hervé, Fabien Campillo
article
12th African Conference on Research in Computer Science and Applied Mathematics, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (INRIA). Sophia Antipolis, FRA., Oct 2014, Université Gaston Berger Saint-Louis, Sénégal, Senegal. pp.1-8
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https://hal.inria.fr/hal-01100087/file/raherinirina2014a.pdf BibTex

Master thesis

titre
Un modèle du chémostat. Compétition entre espèces au sein d’un bioréacteur
auteur
Kevin Cauvin, Romaric Condé
article
Autre. 2014
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https://hal.inrae.fr/hal-02795511/file/RapportCAUVIN-CONDE_1.pdf BibTex
titre
Conception d’un simulateur de traitement d’une ressource hydrique à destination du grand public
auteur
Alexis Pacholik
article
Milieux fluides et réactifs. 2014
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BibTex
titre
Détermination de la meilleure partition d’un pool régional d’espèces sous les règles d’interactions de diversité et de dominance
auteur
Camille Richon
article
Probabilités [math.PR]. 2014
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BibTex
titre
Etude mathématique et numérique de modèles dynamiques de croissance de micro-algues
auteur
Mario Veruete
article
Biotechnologies. 2014
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https://hal.inrae.fr/hal-02794155/file/Rapport_Stage_Chile_Mario_Veruete_2014ver2_1.pdf BibTex

Other publications

titre
Mieux gérer les ressources naturelles
auteur
Jean-Raynald de Dreuzy, Alain Rapaport
article
2014
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BibTex
titre
About dynamical system modelling: illustration in micro-biology
auteur
Alain Rapaport
article
AgreenSkills’ Research School “Predictive modelling: from data to models, 2014
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Reports

titre
A modeling approach of the chemostat
auteur
Coralie Fritsch, Jérôme Harmand, Fabien Campillo
article
[Research Report] 2014
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https://hal.inria.fr/hal-00998194/file/paper.pdf BibTex

Software

titre
Action Dépollution
auteur
Antoine Rousseau, Alain Rapaport, Alexis Pacholik, Christine Leininger
article
2014
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Theses

titre
Etude d’un procédé membranaire de traitement des eaux usées : effet des paramètres biotiques et abiotiques sur le colmatage de la membrane
auteur
Amine Charfi
article
Sciences de l’ingénieur [physics]. Université de Carthage, 2014. Français
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01098726/file/Final_Amine_Charfi.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, …

titre
A stochastic approximation approach to quasi-stationary distributions on finite spaces
auteur
Michel Benaïm, Bertrand Cloez
article
2014
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00986430/file/version_hal.pdf BibTex

2013

Journal articles

titre
Minimal time control of fed-batch bioreactor with product inhibition
auteur
Térence Bayen, Francis Mairet
article
Bioprocess and Biosystems Engineering, Springer Verlag, 2013, 36 (10), pp.1485-1496. ⟨10.1007/s00449-013-0911-9⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00734225/file/InhibitionHal.pdf BibTex
titre
Anaerobic Membrane BioReactor modeling in the presence of Soluble Microbial Products (SMP) – the Anaerobic Model AM2b
auteur
Boumediene Benyahia, Tewfik Sari, Brahim Cherki, Jérôme Harmand
article
Chemical Engineering Journal, Elsevier, 2013, 228, pp.1011-1022. ⟨10.1016/j.cej.2013.05.073⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00859541/file/pub00038640.pdf BibTex
titre
Influence of porosity structures on mixing-induced reactivity at chemical equilibrium in mobile/immobile Multi-Rate Mass Transfer (MRMT) and Multiple INteracting Continua (MINC) models
auteur
Jean-Raynald de Dreuzy, Alain Rapaport, Tristan Babey, Jérôme Harmand
article
Water Resources Research, American Geophysical Union, 2013, 49 (12), pp.8511-8530. ⟨10.1002/2013WR013808⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00914049/file/dreuzy.pdf BibTex
titre
Homogenised model linking microscopic and macroscopic dynamics of a biofilm: Application to growth in a plug flow reactor
auteur
Chloé Deygout, Annick Lesne, Fabien Campillo, Alain Rapaport
article
Ecological Modelling, Elsevier, 2013, 250, pp.15-24. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2012.10.020⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00604377/file/110629_papier_DISCO.pdf BibTex
titre
Extension of the chemostat model with flocculation
auteur
Radhouane Fekih-Salem, Jérôme Harmand, Claude Lobry, Alain Rapaport, Tewfik Sari
article
Journal of Mathematical Analysis and Applications, Elsevier, 2013, 397 (1), pp.292-306. ⟨10.1016/j.jmaa.2012.07.055⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00777539/file/mo2013-pub00036453.pdf BibTex
titre
A method for the reconstruction of unkwnown non-monotonic growth functions in the chemostat
auteur
Jan Sieber, Alain Rapaport, Serafim Rodrigues, Mathieu Desroches
article
Bioprocess and Biosystems Engineering, Springer Verlag, 2013, 36 (10), pp.1496-1507. ⟨10.1007/s00449-013-0912-8⟩
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BibTex

Conference papers

titre
Weak and strong minima : from calculus of variation toward PDE optimization
auteur
Terence Bayen, Francisco Silva
article
1st FAC Workshop on Control of Systems Modeled by Partial Differential Equations : CPDE 2013, Sep 2013, Paris, France
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BibTex
titre
Fed-batch bioreactor with mortality rate
auteur
Térence Bayen, Francis Mairet, Marc Mazade
article
9th IFAC Symposium on Nonlinear Control Systems (NOLCOS), Sep 2013, Toulouse, France. pp.158-163, ⟨10.3182/20130904-3-FR-2041.00024⟩
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titre
Optimizing the anaerobic digestion of microalgae in a coupled process
auteur
Térence Bayen, Francis Mairet, Pierre Martinon, Matthieu Sebbah
article
13th European Control Conference, Jul 2013, Zurich, Switzerland. pp.6
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https://hal.inria.fr/hal-00754971/file/ecc.pdf BibTex
titre
A geometrical approach for the resolution of an optimal control problem
auteur
Walid Bouhafs, Nahla Abdellatif, Frédéric Jean, Jérôme Harmand
article
International Conference on Advances in Applied Mathematics ICAAM-2013, Dec 2013, Hammamet, Tunisia
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BibTex
titre
Commande optimale en temps minimal d’un procédé biologique d’épuration de l’eau
auteur
Walid Bouhafs, Nahla Abdellatif, Frédéric Jean, Jérôme Harmand
article
Proceedings of the International Joint Conference CB-WR-MED Conference/ 2nd AOP’ Tunisia Conference for Sustainable Water Management. Tunis: April, 24―27,, 2013, Tunis, Tunisie. pp.225-226
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titre
Stochastic models for the chemostat at different scales
auteur
Fabien Campillo, Marc Joannides, Irène Larramendy
article
15th Applied Stochastic Models and Data Analysis International Conference (ASMDA 2013), June 25–28, Jun 2013, Barcelona, Spain. 240 p
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BibTex
titre
Control of a nonlinear ice cream crystallization process
auteur
Céline Casenave, Denis Dochain, Graciela Alvarez, Marcela Arellano, Hayat Benkhelifa, Denis Leducq
article
9th IFAC Symposium on Nonlinear Control Systems (NOLCOS), Sep 2013, Toulouse, France. pp.717-722, ⟨10.3182/20130904-3-FR-2041.00045⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00859552/file/Preprint_Casenave_et_al._-_2013_-_Control_of_a_Nonlinear_Ice_Cream_Crystallization_P.pdf BibTex
titre
Fouling models for Membrane BioReactors (MBR)
auteur
Amine Charfi, Jérôme Harmand, Nihel Benamar, Alain Grasmick, Marc Héran
article
Membranes for liquid separation and water treatment: Environmental Applications and Future Perspectives, Oct 2013, Torino, Italy
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BibTex
titre
Membrane fouling models for Membrane BioReactors (MBR)
auteur
Amine Charfi, Marc Héran, Jérôme Harmand, Nihel Benamar, Alain Grasmick
article
7th IWA Specialised Conference and Exhibition on Membrane Technology in Water and Wastewater Treatment, Aug 2013, Toronto, Canada
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BibTex
titre
Fouling in Anaerobic Membrane BioReactors
auteur
Amine Charfi, Nihel Benamar, Jérôme Harmand
article
International workshop on modeling membrane bioreactors for wastewater reuse: fundamental design and operation, Nov 2013, Tunis, Tunisia
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BibTex
titre
Qualitative properties of 3-step model of anaerobic digestion including hydrolysis of particulate matter
auteur
Radhouane Fekih-Salem, Nahla Abdellatif, Tewfik Sari, Jérôme Harmand
article
International Joint Conference CB-WR-MED Conference/ 2nd AOP’ Tunisia Conference for Sustainable Water Management. Tunis, 2013, Tunis, Tunisia. pp.93–94
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titre
Stabilization of the chemostat with delayed sampled measurements
auteur
Jérôme Harmand, Frédéric Mazenc
article
SIAM Conference on Control and Its Applications, Jul 2013, San Diego, United States
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BibTex
titre
Global stabilization of the chemostat with delayed and sampled measurements and control
auteur
Frédéric Mazenc, Jérôme Harmand, Hugues Mounier
article
9th IFAC Symposium on Nonlinear Control Systems (NOLCOS 2013), Sep 2013, Toulouse, France
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https://hal.inria.fr/hal-00823970/file/ifacafterrev.pdf BibTex
titre
Global stabilization of the chemostat with elayed and sampled measurements and control
auteur
Frédéric Mazenc, Jérôme Harmand, Hugues Mounier
article
9. IFAC Symposium on Nonlinear Control Systems, Sep 2013, Toulouse, France. pp.170-174, ⟨10.3182/20130904-3-FR-2041.00049⟩
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titre
Analysis of two recirculating aquaculture systems (RAS): Submerged membrane bioreactor and fixed bed biofilter technologies
auteur
Pedro Miranda Almeida,, Guilherme Araujo Pimentel, Jean-Luc Vasel, Anne-Lise Hantson, Alain Rapaport, Jérôme Harmand, Alain Vande Wouwer
article
3rd IWA Benelux Young Water Professional Regional Conference, Oct 2013, Belval, Luxembourg
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BibTex
titre
The buffered chemostat with non-monotonic response functions
auteur
Alain Rapaport, Ihab Haidar, Jérôme Harmand
article
9th IFAC Symposium on Nonlinear Control Systems (NOLCOS 2013), Sep 2013, Toulouse, France. pp.181-186, ⟨10.3182/20130904-3-FR-2041.00039⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00766243/file/buffered_chemostat-hal2.pdf BibTex
titre
Chemostat stabilisation through delayed buffering
auteur
Alain Rapaport
article
The SIAM Conference on Control and Applications (CT13), Jul 2013, San Diego, United States
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BibTex
titre
Extremum seeking via continuation techniques for optimizing biogas production in the chemostat
auteur
Alain Rapaport, Jan Sieber, Serafim Rodrigues, Mathieu Desroches
article
9th IFAC Symposium on Nonlinear Control Systems (NOLCOS 2013), Sep 2013, Toulouse, France. pp.152-157, ⟨10.3182/20130904-3-FR-2041.00053⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00787510/file/EShal2.pdf BibTex

Book sections

titre
Mieux gérer les ressources naturelles
auteur
Jean-Raynald de Dreuzy, Alain Rapaport
article
TDC – Textes et documents pour la classe, Les Mathématiques de la Terre (1062), Editions Canopé – CNDP, pp.20-23, 2013, 555-4-560-00144-1
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BibTex
titre
La compétition dans le chémostat
auteur
Claude Lobry
article
Benoit, Eric and Furter, Jean-Philippe. TVC 81 : Des Nombres et des Mondes, édition Herman, pp.119-187, 2013, 9782705683757
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https://hal.inria.fr/hal-00711218/file/LaRochelle.pdf BibTex
titre
Cigale ou fourmi ? Quand la programmation dynamique guide nos décisions
auteur
Alain Rapaport, Jean-Philippe Terreaux
article
Brèves de Maths – Mathématiques de la Planète Terre, Nouveau Monde Editions, 2013, 2365838960
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BibTex

Master thesis

titre
Le filtre non linéaire pour le chemostat
auteur
Amine Boutoub
article
2013
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BibTex
titre
Modélisation d’un écosystème de sol
auteur
Colas Droin
article
2013
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BibTex
titre
Modélisation d’un fermenteur continu multi-étagé pour l’étude de la fermentation alcoolique du vin
auteur
Souad Sekkat
article
2013
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BibTex

Other publications

titre
Time Scaling Study Using Tikhonov’s Theorem in a Submerged Membrane Bioreactor
auteur
Guilherme Araujo Pimentel, Jérôme Harmand, Alain Vande Wouwer, Alain Rapaport
article
IAP DYSCO Study Day : Dynamical systems, control and optimization, Bruxelles, Belgium, 2013
Accès au bibtex
BibTex
titre
Modélisation en dynamique des populations
auteur
Fabien Campillo
article
2013, pp.26-27
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BibTex
titre
Recycler les eaux usées pour l’irrigation
auteur
Jérôme Harmand, Fabien Campillo, Brahim Cherki
article
2013
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BibTex
titre
A propos de commande de systèmes dynamiques vers un extremum d’une fonction de sortie mal connue et applications
auteur
Alain Rapaport
article
Séminaire Avignon-Montpellier d’Optimisation, Contrôle et Dynamique (SAMOCOD), Montpellier, France, 2013
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BibTex
titre
Some Control and Optimization Problems for the Biological Wastewater treatment
auteur
Alain Rapaport
article
GDRE ConEDP Meeting : Modeling and control of systems: applications to nano-sciences, environment and energy, Grenoble, France, 2013
Accès au bibtex
BibTex
titre
Biophysique : le sol est-il un bioréacteur?
auteur
Alain Rapaport
article
Lettre d’information INRA: La modélisation omniprésente, 2013
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BibTex
titre
A propos de l’effet d’échantillonnage dans l’étude d’écosystèmes microbiens complexes
auteur
Alain Rapaport
article
Rencontres du Réseau National des Systèmes Complexes (RNSC), Evian, France, 2013
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BibTex

Patents

titre
Procédé et système de traitement biologique pour bioprocédés continus susceptibles de présenter une inhibition
auteur
Alain Rapaport, Jerome J. Harmand, Ihab Haidar
article
France, N° de brevet: FR 2 986 522 – 12 51140. 2013
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https://hal.inria.fr/hal-01095712/file/BrevetFR_2986522_A1_1.pdf BibTex

Poster communications

titre
Impact of immobile porosity architecture on reactive transport in mobile/immobile models
auteur
Tristan Babey, Jean-Raynald de Dreuzy, Alain Rapaport, Céline Casenave
article
American Geophysical Union Fall Meeting (AGU 2013), Dec 2013, San Francisco, United States
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BibTex
titre
A simple model of anaerobic membrane bioreactor for control design: coupling the “AM2b” model with a simple membrane fouling dynamics
auteur
Boumediene Benyahia, Amine Charfi, Nihel Benamar, Marc Héran, Alain Grasmick, Brahim Cherki, Jérôme Harmand
article
13. World Congress on Anaerobic Digestion: Recovering (bio) Resources for the World. AD13, Jun 2013, Santiago de Compostela, Spain. Juan M. Lema, Fernando Fdez-Polanco, Marta Carballa, Jorge Rodriguez, Sonia Suarez 2013, 171 p., 2013, Proceedings of 13th World Congress on Anaerobic Digestion
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BibTex
titre
Modified AM2 with the hydrolysis step and the ammonium consideration
auteur
Sonia Hassam, A. Allegrini, Elena Ficara, B. Cherki, Jérôme Harmand
article
13. World Congress on Anaerobic Digestion: Recovering (bio) Resources for the World. AD13, Jun 2013, Santiago de Compostela, Spain. Juan M. Lema, Fernando Fdez-Polanco, Marta Carballa, Jorge Rodriguez, Sonia Suarez 2013, 171 p., 2013, Proceedings of 13th World Congress on Anaerobic Digestion
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BibTex

Reports

titre
Study of a controlled Kolmogorov periodic equation connected to the optimization of periodic bioprocess
auteur
Térence Bayen, Francis Mairet, Matthieu Sebbah
article
[Research Report] INRIA Sophia Antipolis. 2013
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00855054/file/BMS-HAL.pdf BibTex
titre
Estimation of the parameters of a stochastic logistic growth model
auteur
Fabien Campillo, Marc Joannides, Irène Larramendy-Valverde
article
2013
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00842291/file/hal.pdf BibTex
titre
A mass-structured individual-based model of the chemostat: convergence and simulation
auteur
Fabien Campillo, Coralie Fritsch
article
[Research Report] 2013
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00850959/file/chemostat_ibm.pdf BibTex
titre
L’effet de la migration dans la relation ressource-consommateur du point de vue de “l’atto-fox problem
auteur
Fabien Campillo, Claude Lobry
article
[Rapport de recherche] 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00800370/file/Migrations_dans_RmacACampLob.pdf BibTex
titre
European project CAFE WP7: Process monitoring and control – Deliverable 7.2: Full-scale performance of the control laws in different product manufacturing end users
auteur
Céline Casenave, Denis Dochain
article
[Contract] 2013
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BibTex
titre
European project CAFE WP3: Process experiments – Deliverable 3.3: Test of optimal control strategies
auteur
Céline Casenave, Cristian Trelea, Jean-Roch Mouret, Jean-Marie Sablayrolles, Stéphanie Passot, Bruno Perret, Fernanda Fonseca, Carlos Vilas, Hayat Benkhelifa, Denis Leducq, Graciela Alvarez, Verena Eisner-Schadler, Janneke de Kramer, Arnoud Togtema, youri Grushkin, Ruud van Der Sman, Martijntje Vollebregt
article
[Research Report] inria. 2013
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Theses

titre
Modèles Mathématiques pour la compétition et la coexistence des espèces microbiennes dans un chémostat
auteur
Radhouane Fekih-Salem
article
Systèmes dynamiques [math.DS]. Université Montpellier II – Sciences et Techniques du Languedoc, 2013. Français
Accès au texte intégral et bibtex
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00940100/file/These-Finale-22-7-2013.pdf BibTex
titre
Modélisation markovienne des dynamiques d’usage des sols. Cas des parcelles situées sur le bord du corridor forestier Ranomafana-Andringitra
auteur
Angelo Raherinirina
article
Modélisation et simulation. Université de Fianarantsoa, 2013. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00870679/file/these.pdf BibTex

2012

Journal articles

titre
Bifurcation and stability analysis of a two step model for monitoring anaerobic digestion processes
auteur
Brahim Benyahia, T. Sari, B. Cherki, Jérôme Harmand
article
Journal of Process Control, Elsevier, 2012, 22 (6), p. 1008 – p. 1019. ⟨10.1016/j.jprocont.2012.04.012⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00777051/file/mo2012-pub00036452.pdf BibTex
titre
Simulation and analysis of an individual-based model for graph-structured plant dynamics
auteur
Fabien Campillo, Nicolas Champagnat
article
Ecological Modelling, Elsevier, 2012, 234 (10), pp.93-105. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2012.03.017⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00526379/file/p.pdf BibTex
titre
Effect of population size in a predator-prey model
auteur
Fabien Campillo, Claude Lobry
article
Ecological Modelling, Elsevier, 2012, 246, pp.1-10. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2012.07.015⟩
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BibTex
titre
Analysis of fouling mechanisms in anaerobic membrane bioreactors
auteur
Amine Charfi, Nihel Benamar, Jérôme Harmand
article
Water Research, IWA Publishing, 2012, 46 (8), pp.2637-2650. ⟨10.1016/j.watres.2012.02.021⟩
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BibTex
titre
A conceptual and statistical framework for adaptive radiations with a key role for diversity dependence
auteur
Rampal S. Etienne, Bart Haegeman
article
American Naturalist, University of Chicago Press, 2012, 180 (4), pp.E75-E89. ⟨10.1086/667574⟩
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BibTex
titre
A neutral theory of genome evolution and the frequency distribution of genes
auteur
Bart Haegeman, Joshua Weitz
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2012, pp.art 196. ⟨10.1186/1471-2164-13-196⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00784405/file/1471-2164-13-196.pdf BibTex
titre
As many antipodes as vertices on convex polyhedra
auteur
J. Rouyer, Tewfik Sari
article
Advances in Geometry, De Gruyter, 2012, 12 (1), pp.43 -61. ⟨10.1515/advgeom.2011.030⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00777554/file/mo2012-pub00036464.pdf BibTex
titre
The mathematical analysis of a syntrophic relationship between two microbial species in a chemostat
auteur
T. Sari, M. El Hajji, Jérôme Harmand
article
Mathematical Biosciences and Engineering, AIMS Press, 2012, 9 (3), p. 627 – p. 645. ⟨10.3934/mbe.2012.9.627⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00765311/file/mo2012-pub00036460.pdf BibTex
titre
Competitive Exclusion for Chemostat Equations with Variable Yields
auteur
Tewfik Sari
article
Acta Applicandae Mathematicae, Springer Verlag, 2012, 123 (1), p. 201 – p. 219. ⟨10.1007/s10440-012-9761-8⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00780065/file/mo2012-pub00036463.pdf BibTex
titre
Introduction to the special issue of Ecological Modelling: “Modelling clonal plant growth: From ecological concepts to mathematics
auteur
J. M. van Groenendael, Cendrine Mony, Marc Garbey, Fabien Campillo, Abdallah El Hamidi
article
Ecological Modelling, Elsevier, 2012, 234, pp.1-2. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2012.03.013⟩
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BibTex

Conference papers

titre
Particle filtering for the chemostat
auteur
Boumédiène Benyahia, Fabien Campillo, Cherki Brahim, Jérôme Harmand
article
20th Mediterranean Conference on Control and Automation (MED 2012), Barcelona, Spain, July 3-6, IEEE Control Systems Society. FRA., Jul 2012, Barcelona, Spain. pp.364-371, ⟨10.1109/MED.2012.6265665⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
Commande optimale en temps minimal d’un procédé biologique d’épuration de l’eau
auteur
Walid Bouhafs, Nahla Abdellatif, Frédéric Jean, Jérôme Harmand
article
11. Colloque Africain sur la Recherche en Informatique et en Mathématiques Appliquées (CARI’2012), Oct 2012, Alger, Algérie
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titre
Markov analysis of land use dynamics: A Case Study in Madagascar
auteur
Fabien Campillo, Dominique Hervé, Rivo Rakotozafy
article
11. Colloque Africain sur la Recherche en Informatique et en Mathématiques Appliquées (CARI’2012), Oct 2012, Alger, Algeria
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titre
Stochastic modeling: a simulation (and analytical) approach
auteur
Fabien Campillo
article
2nd French-Chilean Workshop on Bioprocess Modeling Pucón, January 16-17, Jan 2012, Pucon, Chile
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titre
About Transgressive Over-Yielding in the Chemostat
auteur
Denis Dochain, Patrick de Leenheer, Alain Rapaport
article
IFAC MATHMOD 2012 – 7th Vienna International Conference on Mathematical Modelling, Feb 2012, Vienna, Austria. pp.653-658, ⟨10.3182/20120215-3-AT-3016.00116⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00726364/file/overyield.pdf BibTex
titre
On a three step model of anaerobic digestion including the hydrolysis of particulate matter
auteur
R. Fekih-Salem, Nahla Abdellatif, T. Sari, Jérôme Harmand
article
MATHMOD 2012 – 7th Vienna International Conference on Mathematical Modelling, Jan 2012, Vienne, Austria. 6 p
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00777559/file/mo2012-pub00036469.pdf BibTex
titre
Extensions of the chemostat model with flocculation
auteur
Radhouane Fekih-Salem, Jérôme Harmand, Claude Lobry, Alain Rapaport, Tewfik Sari
article
LAWOC 2012 – III Latin American Workshop on Optimization and Control, Jan 2012, Valparaiso, Chile
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titre
Analyse mathématique d’un modèle de digestion anaérobie à trois étapes
auteur
Radhouane Fekih-Salem, Nahla Abdellatif, Tewfik Sari, Jérôme Harmand
article
11. African Conference on Research in Computer Science and Applied Mathematics. CARI’12, Oct 2012, Alger, Algérie. pp.7
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titre
Extensions du modèle du chemostat en présence d’attachement
auteur
Radhouane Fekih-Salem, Alain Rapaport, Tewfik Sari, Claude Lobry, Jérôme Harmand
article
Les biofilms au service des biotechnologies – Bioénergies, Agro-alimentaire, Environnement, Jan 2012, Narbonne, France
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titre
Analyse bayésienne de courbes de croissance de poulets par un modèle hiérarchique défini à partir d’une équation différentielle stochastique à processus d’erreur autocorrélée
auteur
Bénédicte Fontez Nguyen The, Dolores Batonon, Fabien Campillo, Philippe Lescoat
article
44. Journées de la Société Française de Statistique (SFdS 2012), May 2012, Bruxelles, Belgique. 6 p
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titre
Analyse et contrôle optimal d’un bioréacteur de dépollution des eaux usées
auteur
Amel Ghouali, Tewfik Sari, Jérôme Harmand, Alain Rapaport, Ali Moussaoui, Brahim Cherki
article
11ème Colloque Africain pour la Recherche en Informatique et en Mathématiques Appliquées (CARI 2012), Oct 2012, Alger, Algeria. pp.404-411
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titre
Rarity and the problem of measuring diversity
auteur
Bart Haegeman, Jérôme Hamelin, John Moriarty, Peter Neal, Jonathan Dushoff, Joshua S. Weitz
article
14. International Symposium of Microbial Ecology (ISME14) “The Power of the Small”, International Society for Microbial Ecology (ISME). INT., Aug 2012, Copenhague, Denmark
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titre
Towards a systematic approach to reduce complex bioprocess models – Application to the ADM1
auteur
Sonia Hassam, Brahim Cherki, Elena Ficara, Jérôme Harmand
article
20. IEEE Mediterranean Conference on Control and Automation (MED ’12), IEEE Control Systems Society. FRA., Jul 2012, Barcelona, Spain. pp.573-578
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titre
Minimal time control of fed-batch processes for growth functions having several maxima
auteur
Alain Rapaport, Denis Dochain
article
LAWOC 2012 – III Latin American Workshop on Optimization and Control, Jan 2012, Valparaiso, Chile
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titre
Extension of the Chemostat model with flocculation
auteur
Tewfik Sari
article
3th Latin American Workshop on Optimization and Control (LAWOC2012), 2012, Valparaiso, Chile
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titre
A new method for the reconstruction of unknown non-monotonic growth function in the chemostat
auteur
Jan Sieber, Alain Rapaport, Serafim Rodrigues, Mathieu Desroches
article
20th IEEE Mediterranean Conference on Control and Automation (MED ’12), Jul 2012, Barcelona, Spain. pp.169 – 175, ⟨10.1109/MED.2012.6265633⟩
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Book sections

titre
Bioremediation of natural water resources via optimal control techniques
auteur
Pedro Gajardo, Hector Ramirez, Alain Rapaport, Victor Riquelme
article
Rubem P. Mondaini. BIOMAT 2011, World Scientific Publishing, pp.178-190, 2012, International Symposium on Mathematical and Computational Biology, ⟨10.1142/9789814397711_0012⟩
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Reports

titre
Rapport T0+30 ANR SYSCOMM DISCO
auteur
Alain Rapaport
article
[Autre] Rapport. 2012
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titre
Modèles, systèmes d’information et gestion viable De l’environnement (MOTIVE) d’IRSTEA
auteur
Alain Rapaport, Pierre Auger, Jérôme Gensel, Houda Labiod, Michèle Sebag
article
[Autre] AERES. 2012
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Preprints, Working Papers, …

titre
A new method for the reconstruction of unknown non-monotonic growth functions in the chemostat
auteur
Jan Sieber, Alain Rapaport, Mathieu Desroches, Serafim Rodrigues
article
2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00723246/file/srrd.pdf BibTex

2011

Journal articles

titre
Stochastic modeling of the chemostat
auteur
Fabien Campillo, Marc Joannides, Irène Larramendy
article
Ecological Modelling, Elsevier, 2011, 222 (15), pp.2676-2689. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2011.04.027⟩
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titre
Sur un modèle de compétition et de coexistence dans le chémostat
auteur
Radhouane Fekih-Salem, Tewfik Sari, Nahla Abdellatif
article
Revue Africaine de la Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées, INRIA, 2011, Volume 14 – 2011 – Special issue CARI’10, pp.15-30. ⟨10.46298/arima.1953⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00777548/file/Vol.14.pp.15-30.pdf BibTex
titre
Minimal-time bioremediation of natural water resources
auteur
Pedro Gajardo, Jérôme Harmand, Hector Ramirez Cabrera, Alain Rapaport
article
Automatica, Elsevier, 2011, 47 (8), pp.1764-1769. ⟨10.1016/j.automatica.2011.03.001⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00521118/file/halGHRR1.pdf BibTex
titre
Comparison of numerical simulations of reactive transport and chemostat-like models
auteur
Ihab Haidar, Frédéric Gérard, Alain Rapaport
article
Computational Ecology and Software, International Society of Computational Ecology, 2011, 1 (4), pp.224-239
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00613616/file/HaidarGerardRapaport2.pdf BibTex
titre
A viability analysis for an explicit inshore-offshore model
auteur
Mounir Jerry, Nadia Raissi, Alain Rapaport
article
JP Journal of Applied Mathematics, Ishaan Publishing House, 2011, 1 (1), pp.41-60
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BibTex
titre
Effects of spatial structure and diffusion on the performances of the chemostat
auteur
Alain Rapaport, Ihab Haidar, Frédéric Gérard
article
Mathematical Biosciences and Engineering, AIMS Press, 2011, 8 (4), pp.953-971. ⟨10.3934/mbe.2011.8.953⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00536647/file/halHR.pdf BibTex
titre
Minimal time control of fed-batch processes with growth functions having several maxima
auteur
Alain Rapaport, Denis Dochain
article
IEEE Transactions on Automatic Control, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 56 (11), pp.2671 – 2676. ⟨10.1109/TAC.2011.2159424⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00529001/file/halRD.pdf BibTex
titre
Global dynamics of the chemostat with different removal rates and variable yields
auteur
Tewfik Sari, Frédéric Mazenc
article
Mathematical Biosciences and Engineering, AIMS Press, 2011, 8 (3), pp.827-840. ⟨10.3934/mbe.2011.8.827⟩
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Conference papers

titre
Bioreactor shape optimisation. Modeling, simulation, and shape optimization of a simple bioreactor for water treatment
auteur
Juan Manuel Bello Rivas, Jerome Harmand, Benjamin Ivorra, Angel M. Ramos del Olmo, Alain Rapaport
article
STIC & Environnement 2011, May 2011, Saint-Etienne, France. pp.125-141
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titre
Modeling of the Soluble Microbial Products (SMP) in Anaerobic Membrane BioReactors (AMBR) : Equilibria and stability of the AM2b model ?
auteur
Boumediene Benyahia, Tewfik Sari, Jérôme Harmand, Brahim Cherki
article
18th IFAC World Congress, International Federation of Automatic Control (IFAC). Laxenburg, AUT., Aug 2011, Milan, Italy. pp.3789-3794, ⟨10.3182/20110828-6-IT-1002.01195⟩
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titre
Modélisation mathématique d’un bioréacteur membranaire anaérobie
auteur
Boumediene Benyahia, Tewfik Sari, Brahim Cherki, Jérôme Harmand
article
5ème Colloque sur les Tendances dans les Applications Mathématiques en Tunisie, Algérie, Maroc, 2011, Sousse, Tunisie. pp.465-470
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titre
An individual-based model for clonal plant dynamics
auteur
Fabien Campillo, Nicolas Champagnat
article
4th International Conference on Approximation Methods and Numerical Modelling in Environment and Natural Resources (MAMERN11), May 2011, Saidia, Morocco. 4 p
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https://hal.inria.fr/hal-00651837/file/campillo2011f.pdf BibTex
titre
Stochastic models for the chemostat
auteur
Fabien Campillo, Marc Joannides, Irène Larramendy-Valverde
article
4th International Conference on Approximation Methods and Numerical Modelling in Environment and Natural Resources (MAMERN11), May 2011, Saidia, Morocco
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https://hal.inria.fr/hal-00651846/file/mamern11-campillo2.pdf BibTex
titre
Simulation and Analysis of a Markovian Individual-Based Model for Clonal Plant Dynamics
auteur
Fabien Campillo, Nicolas Champagnat
article
7th International Congress on Industrial and Applied Mathematics, Jul 2011, Vancouver, Canada. n.p
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titre
Monte Carlo simulation and mathematical analysis of an individual-based model for clonal plant dynamics
auteur
Fabien Campillo, Nicolas Champagnat, Cendrine Mony
article
54th Symposium of the International Association for Vegetation Science (IAVS), Jun 2011, Lyon, France. n. p
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BibTex
titre
Stochastic Models for the Chemostat
auteur
Fabien Campillo, Marc Joannides, Irène Larramendy
article
7th International Congress on Industrial and Applied Mathematics, Jul 2011, Vancouver, Canada
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titre
La floculation et la coexistence dans le chemostat
auteur
Radhouane Fekih-Salem, Tewfik Sari, Alain Rapaport
article
5ème Colloque sur les Tendances dans les Applications Mathématiques en Tunisie, Algérie, Maroc (TAMTAM), Apr 2011, Sousse, Tunisie
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titre
Bioremediation of natural water resources via optimal control techniques
auteur
Pedro P. Gajardo, Hector H. Ramirez, Victor V. Riquelme, Alain Rapaport
article
BIOMAT 2011 – International Symposium on Mathematical and Computational Biology, Nov 2011, Santiago, Chile. pp.178-190, ⟨10.1142/9789814397711_0012⟩
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titre
Modélisation mathématique en biologie : compétition, coexistence et croissance
auteur
Tewfik Sari, Nahla Abdellatif, Boumediene Benyahia, Mamadou Lamine Diagne, Miled El Hajji, Radhouane Fekih-Salem
article
5ème Colloque sur les Tendances dans les Applications Mathématiques en Tunisie, Algérie, Maroc, 2011, Sousse, Tunisie. pp.19-25
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Reports

titre
A Markov model of land use dynamics
auteur
Fabien Campillo, Dominique Hervé, Angelo Raherinirina, Rivo Rakotozafy
article
[Research Report] RR-7670, INRIA. 2011, pp.21
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https://hal.inria.fr/inria-00605925/file/RR-7670.pdf BibTex
titre
Livrable 2.1 du projet DISCO : Modèles individus-centrés et simulations Monte-Carlo
auteur
Guillaume Deffuant, Nabil Mabrouk, Jean-Denis Mathias, Chloé Deygout, Fabien Campillo, A. Lesne
article
[Rapport de recherche] irstea. 2011, pp.6
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titre
Rapport mi-parcours ANR SYSCOMM DISCO
auteur
Alain Rapaport
article
[Autre] rapport ANR. 2011
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titre
Proposal of INRIA team MODEMIC Modelling and Optimisation of the Dynamics of Ecosystems with MICro-organisms
auteur
Alain Rapaport
article
[Intern report] Rapport Modemic. 2011, pp.55
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Preprints, Working Papers, …

titre
Effect of population size in a Prey-Predator model
auteur
Fabien Campillo, Claude Lobry
article
2011
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https://hal.inria.fr/hal-00645619/file/PopSizeEcoMod1.pdf BibTex
titre
Extensions of the chemostat model with flocculation
auteur
Radhouane Fekih-Salem, Jérôme Harmand, Claude Lobry, Alain Rapaport, Tewfik Sari
article
2011
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00604633/file/FHLRSfinal.pdf BibTex

2010

Preprints, Working Papers, …

titre
Le chémostat IBM
auteur
Fabien Campillo, Claude Lobry
article
2010
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https://hal.inria.fr/hal-00841986/file/Chemostat_IBM-CampLob.pdf BibTex
titre
Analysis of a mathematical model of syntrophic bacteria in a chemostat
auteur
Tewfik Sari, Miled El Hajji, Jérôme Harmand
article
2010
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00487189/file/SariElHajjiHarmand2011.pdf BibTex

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