Ingénieure en Chef des Ponts et Forêts
Coordinator of MAMBA project-team (Inria, CNRS and Sorbonne Université)
2016-2018: sabbatical stay at Wolfgang Pauli, University of Vienna, Austria
2012-2018: principal investigator of the ERC Starting Grant SKIPPERAD
CONTACT
marie [dot] doumic [at] inria [dot] fr
Laboratoire Jacques-Louis Lions, 4 place Jussieu, couloir 16-26, bureau 303 (3è étage)
PH.D STUDENTS
Pierre Gabriel (2008-2011) co-supervised with Benoît Perthame, now assistant professor at the University of Versailles -Saint-Quentin
Hadjer Wafaâ Haffaf (2011-2014), co-supervised with Benoît Perthame, now assistant professor at the University of Tlemcen
Thibault Bourgeron (2012-2015), co-supervised with Benoît Perthame
Adélaïde Olivier (2012-2015), co-supervised with Marc Hoffmann, now assistant professor at the University of Orsay Paris Sud
Aurora Armiento (2013-2016), co-supervised with Philippe Moireau, now consultant at Synechron
Sarah Eugène (2013-2016), co-supervised with Philippe Robert, now vice president at Goldman Sachs
Hugo Martin (2016-2019), co-supervised with Pierre Gabriel
Mathieu Mezache (2016-2019), co-supervised with Human Rezaei
Delacour Julia (2017-2020), co-supervised with Christian Schmeiser
Anaïs Rat (2018-…), co (and mainly) supervised by Magali Tournus
PUBLICATIONS
2023
Preprints, Working Papers, …
- titre
- An inverse problem: recovering the fragmentation kernel from the short-time behaviour of the fragmentation equation
- auteur
- Marie Doumic, Miguel Escobedo, Magali Tournus
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Multispecies cross-diffusions: from a nonlocal mean-field to a porous medium system without self-diffusion
- auteur
- Marie Doumic, Sophie Hecht, Benoit Perthame, Diane Peurichard
- article
- 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2022
Journal articles
- titre
- A mathematical model of p62-ubiquitin aggregates in autophagy
- auteur
- Julia Delacour, Marie Doumic, Sascha Martens, Christian Schmeiser, Gabriele Zaffagnini
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2022, 84 (3), ⟨10.1007/s00285-021-01659-2⟩
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-
Conference papers
- titre
- How the shortest telomere in the cell signals senescence
- auteur
- Prisca Berardi, Stefano Mattarocci, Rachel Langston, Pascale Jolivet, Gilles Charvin, Marie Doumic, Zhou Xu, Maria Teresa Teixeira
- article
- EMBO Workshop on Telomere function and evolution in health and disease, EMBO, Sep 2022, Troia, Portugal
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Individual and population approaches for calibrating division rates in population dynamics: Application to the bacterial cell cycle
- auteur
- Marie Doumic, Marc Hoffmann
- article
- 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2021
Journal articles
- titre
- Telomere shortening causes distinct cell division regimes during replicative senescence in Saccharomyces cerevisiae
- auteur
- Hugo Martin, Marie Doumic, Maria Teresa Teixeira, Zhou Xu
- article
- Cell & Bioscience, 2021, 11 (1), ⟨10.1186/s13578-021-00693-3⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Insights into the dynamic trajectories of protein filament division revealed by numerical investigation into the mathematical model of pure fragmentation
- auteur
- Magali Tournus, Miguel Escobedo, Wei-Feng Xue, Marie Doumic
- article
- PLoS Computational Biology, 2021, 17 (9), pp.e1008964. ⟨10.1371/journal.pcbi.1008964⟩
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-
Conference papers
- titre
- The effect of the shortest telomere on cell proliferation
- auteur
- Stefano Mattarocci, Prisca Berardi, Rachel Langston, Stéphane Marcand, Marie Doumic, Zhou Xu, Maria Teresa Teixeira
- article
- Telomeres & Telomerase, Cold Spring Habor Laboratory, Dec 2021, Cold Spring Harbor, United States
- Accès au bibtex
-
Poster communications
- titre
- How the shortest telomere in the cell signals senescence
- auteur
- Stefano Mattarocci, Prisca Berardi, Rachel Langston, Stéphane Marcand, Marie Doumic, Zhou Xu, Maria Teresa Teixeira
- article
- Telomeres & Telomerase, Dec 2021, Cold Spring Harbor (New York), United States
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-
2020
Journal articles
- titre
- Estimating the division rate from indirect measurements of single cells
- auteur
- Marie Doumic, Adélaïde Olivier, Lydia Robert
- article
- Discrete and Continuous Dynamical Systems – Series B, 2020, 25 (10), pp.3931–3961. ⟨10.3934/dcdsb.2020078⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A purely mechanical model with asymmetric features for early morphogenesis of rod-shaped bacteria micro-colony
- auteur
- Marie Doumic, Sophie Hecht, Diane Peurichard
- article
- Mathematical Biosciences and Engineering, 2020, 17 (6), http://aimspress.com/article/doi/10.3934/mbe.2020356. ⟨10.3934/mbe.2020356⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Division of Amyloid Fibrils: Systematic Comparison of Fibril Fragmentation Stability by Linking Theory with Experiments
- auteur
- David Béal, Magali Tournus, Ricardo Marchante, Tracey Purton, David Smith, Mick F Tuite, Marie Doumic, Wei-Feng Xue
- article
- iScience, 2020, 23 (9), ⟨10.1016/j.isci.2020.101512⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2019
Journal articles
- titre
- Early stage prion assembly involves two subpopulations with different quaternary structures and a secondary templating pathway
- auteur
- Angélique Igel-Egalon, Florent Laferrière, Mohammed Moudjou, Jan Bohl, Mathieu Mezache, Tina Knäpple, Laetitia Herzog, Fabienne Reine, Christelle Jas-Duval, Marie Doumic, Human Rezaei, Vincent Béringue
- article
- Communications Biology, 2019, 2 (1), pp.1-13. ⟨10.1038/s42003-019-0608-y⟩
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-
- titre
- A bi-monomeric, nonlinear Becker-Döring-type system to capture oscillatory aggregation kinetics in prion dynamics
- auteur
- Marie Doumic, Klemens Fellner, Mathieu Mezache, Human Rezaei
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2019, 480, pp.241–261. ⟨10.1016/j.jtbi.2019.08.007⟩
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-
- titre
- Cyclic asymptotic behaviour of a population reproducing by fission into two equal parts
- auteur
- Etienne Bernard, Marie Doumic, Pierre Gabriel
- article
- Kinetic and Related Models , 2019, 12 (3), pp.551-571. ⟨10.3934/krm.2019022⟩
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-
- titre
- Bidirectional sliding of two parallel microtubules generated by multiple identical motors
- auteur
- Jun Allard, Marie Doumic, Alex Mogilner, Dietmar Oelz
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2019, ⟨10.1007/s00285-019-01369-w⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Pressure Reveals Unique Conformational Features in Prion Protein Fibril Diversity
- auteur
- Joan Torrent, Davy Martin, Sylvie Noinville, Yi Yin, Marie Doumic, Mohammed Moudjou, Vincent Béringue, Human Rezaei
- article
- Scientific Reports, 2019, 9, pp.2802. ⟨10.1038/s41598-019-39261-8⟩
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-
Conference papers
- titre
- Automated Quantification of Amyloid Fibrils Morphological Features by Image Processing Techniques
- auteur
- Yi Yin, Stephanie Prigent, Joan Torrent, Human Rezaei, Dirk Drasdo, Marie Doumic
- article
- 2019 IEEE 16th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2019, Venice, France. pp.534-537, ⟨10.1109/ISBI.2019.8759597⟩
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Testing for high frequency features in a noisy signal
- auteur
- Mathieu Mezache, Marc Hoffmann, Human Rezaei, Marie Doumic
- article
- 2019
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-
2018
Journal articles
- titre
- Relative Entropy Method for Measure Solutions of the Growth-Fragmentation Equation
- auteur
- Tomasz Dębiec, Marie Doumic, Piotr Gwiazda, Emil Wiedemann
- article
- SIAM Journal on Applied Mathematics, 2018, 50 (6), pp.5811-5824
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Estimating the division rate and kernel in the fragmentation equation
- auteur
- Marie Doumic, Miguel Escobedo, Magali Tournus
- article
- Annales de l’Institut Henri Poincaré C, Analyse non linéaire, 2018, 35 (7), pp.1847-1884. ⟨10.1016/j.anihpc.2018.03.004⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Long-time asymptotics for polymerization models
- auteur
- Juan Calvo, Marie Doumic, Benoît Perthame
- article
- Communications in Mathematical Physics, 2018, 363 (1), pp.111-137. ⟨10.1007/s00220-018-3218-5⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Special issue
- titre
- Explicit Solution and Fine Asymptotics for a Critical Growth-Fragmentation Equation
- auteur
- Marie Doumic, Bruce van Brunt
- article
- ESAIM: Proceedings and Surveys, 62, , pp.30-42, 2018, ⟨10.1051/proc/201862030⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2017
Journal articles
- titre
- The mechanism of monomer transfer between two structurally distinct PrP oligomers
- auteur
- Aurora Armiento, Philippe Moireau, Davy Martin, Nad’a Lepejova, Marie Doumic, Human Rezaei
- article
- PLoS ONE, 2017, 12 (7), ⟨10.1371/journal.pone.0180538⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Toward an integrated workforce planning framework using structured equations
- auteur
- Marie Doumic, Benoît Perthame, Edouard Ribes, Delphine Salort, Nathan Toubiana
- article
- European Journal of Operational Research, 2017, 262, ⟨10.1016/j.ejor.2017.03.076⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A numerical scheme for the early steps of nucleation-aggregation Models
- auteur
- Harvey Thomas Banks, Marie Doumic, Carola Kruse
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2017, 74 (1-2), pp.259-287. ⟨10.1007/s00285-016-1026-0⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- Strategic Workforce Planning and sales force : a demographic approach to productivity
- auteur
- Marie Doumic, Mathieu Mezache, Benoît Perthame, Edouard Ribes, Delphine Salort
- article
- 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Videos
- titre
- Simulation of the critical fragmentation equation with binary fission
- auteur
- Marie Doumic
- article
- 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2016
Journal articles
- titre
- Asymptotics of Stochastic Protein Assembly Models
- auteur
- Marie Doumic, Sarah Eugene, Philippe Robert
- article
- SIAM Journal on Applied Mathematics, 2016, 76 (6), pp.20. ⟨10.1137/16M1066920⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Time Asymptotics for a Critical Case in Fragmentation and Growth-Fragmentation Equations
- auteur
- Marie Doumic, Miguel Escobedo
- article
- Kinetic and Related Models , 2016, 9 (2), pp.47. ⟨10.3934/krm.2016.9.251⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Insights into the variability of nucleated amyloid polymerization by a minimalistic model of stochastic protein assembly
- auteur
- Sarah Eugene, Wei-Feng Xue, Philippe Robert, Marie Doumic
- article
- Journal of Chemical Physics, 2016, 144 (17), pp.12. ⟨10.1063/1.4947472⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Estimation from Moments Measurements for Amyloid Depolymerisation
- auteur
- Aurora Armiento, Marie Doumic, Philippe Moireau, Human Rezaei
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2016, 397, pp.68 – 88. ⟨10.1016/j.jtbi.2016.02.037⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Videos
- titre
- Simulation of the growth-fragmentation equation in a periodic case – Non-dissipative numerical scheme
- auteur
- Marie Doumic
- article
- 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2015
Journal articles
- titre
- Microscopic approach of a time elapsed neural model
- auteur
- Julien Chevallier, Maria J. Caceres, Marie Doumic, Patricia Reynaud-Bouret
- article
- Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2015, http://www.worldscientific.com/doi/10.1142/S021820251550058X. ⟨10.1142/S021820251550058X⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The asymmetry of telomere replication contributes to replicative senescence heterogeneity
- auteur
- Thibault Bourgeron, Zhou Xu, Marie Doumic, Maria Teresa Teixeira
- article
- Scientific Reports, 2015, 5, pp.15326. ⟨10.1038/srep15326⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Information Content in Data Sets for a Nucleated-Polymerization Model
- auteur
- H. T. Banks, Marie Doumic, Carola Kruse, Stephanie Prigent, H Rezaei
- article
- Journal of Biological Dynamics, 2015, 9 (1), pp.26. ⟨10.1080/17513758.2015.1050465⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Statistical estimation of a growth-fragmentation model observed on a genealogical tree
- auteur
- Marie Doumic, Marc Hoffmann, Nathalie Krell, Lydia Robert
- article
- Bernoulli, 2015, 21 (3), pp.1760-1799. ⟨10.3150/14-BEJ623⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2014
Journal articles
- titre
- Size distribution of amyloid brils. Mathematical models and experimental data.
- auteur
- Stephanie Prigent, Hadjer Wafaa Haffaf, H. T. Banks, M. Hoffmann, Human Rezaei, Marie Doumic
- article
- International Journal of Pure and Applied Mathematics, 2014, 93 (6), pp.845-878. ⟨10.12732/ijpam.v93i6.10⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Estimating the Division Rate of the Self-Similar Growth-Fragmentation Equation
- auteur
- Thibault Bourgeron, Marie Doumic, Miguel Escobedo
- article
- Inverse Problems, 2014, 30 (2), pp.025007, 28
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Division in Escherichia coli is triggered by a size-sensing rather than a timing mechanism
- auteur
- Lydia Robert, Marc Hoffmann, Nathalie Krell, Stéphane Aymerich, Jérôme Robert, Marie Doumic
- article
- BMC Biology, 2014, 12 (1), pp.17. ⟨10.1186/1741-7007-12-17⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2013
Journal articles
- titre
- Estimating the Division Rate for the Growth-Fragmentation Equation
- auteur
- Marie Doumic-Jauffret, Leon M. Tine
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2013, 67 (1), pp.69-103. ⟨10.1007/s00285-012-0553-6⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Data-driven modeling of SRC control on the mitochondrial pathway of apoptosis: implication for anticancer therapy optimization.
- auteur
- Annabelle Ballesta, Jonathan Lopez, Nikolay Popgeorgiev, Philippe Gonzalo, Marie Doumic, Germain Gillet
- article
- PLoS Computational Biology, 2013, 9 (4), pp.e1003011. ⟨10.1371/journal.pcbi.1003011⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Growth-fragmentation equations in biology
- auteur
- Marie Doumic
- article
- Analysis of PDEs [math.AP]. Université Pierre et Marie Curie – Paris VI, 2013
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2012
Journal articles
- titre
- Nonparametric estimation of the division rate of a size-structured population
- auteur
- Marie Doumic-Jauffret, Marc Hoffmann, Patricia Reynaud-Bouret, Vincent Rivoirard
- article
- SIAM Journal on Numerical Analysis, 2012, 50 (2), pp.925–950. ⟨10.1137/110828344⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An efficient kinetic model for assemblies of amyloid fibrils and its application to polyglutamine aggregation.
- auteur
- Stephanie Prigent, Annabelle Ballesta, Frédérique Charles, Natacha Lenuzza, Pierre Gabriel, Léon Matar Tine, Human Rezaei, Marie Doumic
- article
- PLoS ONE, 2012, 7 (11), pp.e43273. ⟨10.1371/journal.pone.0043273⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Self-similarity in a General Aggregation-Fragmentation Problem ; Application to Fitness Analysis
- auteur
- Vincent Calvez, Marie Doumic-Jauffret, Pierre Gabriel
- article
- Journal de Mathématiques Pures et Appliquées, 2012, 98 (1), pp.1-27. ⟨10.1016/j.matpur.2012.01.004⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2011
Journal articles
- titre
- A Structured Population Model of Cell Differentiation
- auteur
- Marie Doumic, Anna Marciniak-Czochra, Benoît Perthame, Jorge Zubelli
- article
- SIAM Journal on Applied Mathematics, 2011, 71 (6), pp.1918-1940. ⟨10.1137/100816584⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A new model for the estimation of cell proliferation dynamics using CFSE data.
- auteur
- H. T. Banks, Karyn L Sutton, W Clayton Thompson, Gennady Bocharov, Marie Doumic, Tim Schenkel, Jordi Argilaguet, Sandra Giest, Cristina Peligero, Andreas Meyerhans
- article
- Journal of Immunological Methods, 2011, 373 (1-2), pp.143-60. ⟨10.1016/j.jim.2011.08.014⟩
- Accès au bibtex
-
2010
Journal articles
- titre
- Label Structured Cell Proliferation Models.
- auteur
- H. T. Banks, Frédérique Charles, Marie Doumic-Jauffret, Karyn L Sutton, W Clayton Thompson
- article
- Applied Mathematics Letters, 2010, 23 (12), pp.1412-1415. ⟨10.1016/j.aml.2010.07.009⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- On the Calibration of a Size-Structured Population Model from Experimental Data
- auteur
- Marie Doumic-Jauffret, Pedro Maia, Jorge Zubelli
- article
- Acta Biotheoretica, 2010, 58 (4), pp.405-413. ⟨10.1007/s10441-010-9114-9⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Stability Analysis of a Simplified Yet Complete Model for Chronic Myelegenous Leukemia
- auteur
- Marie Doumic-Jauffret, Peter S. Kim, Benoît Perthame
- article
- Bulletin of Mathematical Biology, 2010, 72 (7), pp.1732-1759. ⟨10.1007/s11538-009-9500-0⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Eigenelements of a General Aggregation-Fragmentation Model
- auteur
- Marie Doumic-Jauffret, Pierre Gabriel
- article
- Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2010, 20 (5), pp.757-783. ⟨10.1142/S021820251000443X⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Prion dynamics with size dependency-strain phenomena
- auteur
- Vincent Calvez, Natacha Lenuzza, Marie Doumic, Jean-Philippe Deslys, Franck Mouthon, Benoît Perthame
- article
- Journal of Biological Dynamics, 2010, 4 (1), pp.28-42. ⟨10.1080/17513750902935208⟩
- Accès au bibtex
-
2009
Journal articles
- titre
- Boundary Value Problem for an Oblique Paraxial Model of Light Propagation
- auteur
- Marie Doumic-Jauffret
- article
- Methods and Applications of Analysis, 2009, 16 (1), pp.119-138
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Simulation of Laser Beam Propagation With a Paraxial Model in a Tilted Frame
- auteur
- Marie Doumic, Frédéric Duboc, François Golse, Rémi Sentis
- article
- Journal of Computational Physics, 2009, 228 (3), pp.861–880. ⟨10.1016/j.jcp.2008.10.009⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Numerical Solution of an Inverse Problem in Size-Structured Population Dynamics
- auteur
- Marie Doumic-Jauffret, Benoît Perthame, Jorge Zubelli
- article
- Inverse Problems, 2009, 25 (4), pp.045008. ⟨10.1088/0266-5611/25/4/045008⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Scaling limit of a discrete prion dynamics model
- auteur
- Marie Doumic, Thierry Goudon, Thomas Lepoutre
- article
- Communications in Mathematical Sciences, 2009, 7 (4), ⟨10.4310/CMS.2009.v7.n4.a3⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2007
Journal articles
- titre
- Analysis of a Population Model Structured by the Cells Molecular Content
- auteur
- Marie Doumic-Jauffret
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2007, 2 (3), pp.121-152. ⟨10.1051/mmnp:2007006⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2005
Theses
- titre
- Etude asymptotique et simulation numérique de la propagation Laser en milieu inhomogène
- auteur
- Marie Doumic
- article
- Mathématiques [math]. Université Paris-Diderot – Paris VII, 2005. Français. ⟨NNT : ⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
