Publications

Publications HAL du labo/EPI athena

2024

Communication dans un congrès

titre
The computational complexity of finding second-order stationary points
auteur
Andreas Kontogiannis, Vasilis Pollatos, Sotiris Kanellopoulos, Panayotis Mertikopoulos, Aris Pagourtzis, Ioannis Panageas
article
ICML 2024 – 41st International Conference on Machine Learning, Jul 2024, Vienna, Austria
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https://hal.science/hal-04629307/file/Main.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Directed Metric Structures arising in Large Language Models
auteur
Stéphane Gaubert, Yiannis Vlassopoulos
article
2024
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https://inria.hal.science/hal-04582412/file/LLMmathematicalstructure.pdf BibTex

2023

Article dans une revue

titre
Identifying and profiling structural similarities between Spike of SARS-CoV-2 and other viral or host proteins with Machaon
auteur
Panos Kakoulidis, Ioannis Vlachos, Dimitris Thanos, Gregory Blatch, Ioannis Z. Emiris, Ema Anastasiadou
article
Communications Biology, 2023, 6 (1), pp.752. ⟨10.1038/s42003-023-05076-7⟩
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BibTex
titre
Tractography passes the test: Results from the diffusion-simulated connectivity (disco) challenge
auteur
Gabriel Girard, Jonathan Rafael-Patiño, Raphaël Truffet, Dogu Baran Aydogan, Nagesh Adluru, Veena A Nair, Vivek Prabhakaran, Barbara B Bendlin, Andrew L Alexander, Sara Bosticardo, Ilaria Gabusi, Mario Ocampo-Pineda, Matteo Battocchio, Zuzana Piskorova, Pietro Bontempi, Simona Schiavi, Alessandro Daducci, Aleksandra Stafiej, Dominika Ciupek, Fabian Bogusz, Tomasz Pieciak, Matteo Frigo, Sara Sedlar, Samuel Deslauriers-Gauthier, Ivana Kojčić, Mauro Zucchelli, Hiba Laghrissi, Yang Ji, Rachid Deriche, Kurt G Schilling, Bennett A Landman, Alberto Cacciola, Gianpaolo Antonio Basile, Salvatore Bertino, Nancy Newlin, Praitayini Kanakaraj, Francois Rheault, Patryk Filipiak, Timothy M Shepherd, Ying-Chia Lin, Dimitris G Placantonakis, Fernando E Boada, Steven H Baete, Erick Hernández-Gutiérrez, Alonso Ramírez-Manzanares, Ricardo Coronado-Leija, Pablo Stack-Sánchez, Luis Concha, Maxime Descoteaux, Caio Seguin, Andrew Zalesky, Kenji Marshall, Erick J Canales-Rodríguez, Ye Wu, Sahar Ahmad, Pew-Thian Yap, Antoine Théberge, Florence Gagnon, Frédéric Massi, Elda Fischi-Gomez, Rémy Gardier, Juan Luis Villarreal Haro, Marco Pizzolato, Emmanuel Caruyer, Jean-Philippe Thiran
article
NeuroImage, 2023, 277, pp.1-11. ⟨10.1016/j.neuroimage.2023.120231⟩
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https://inria.hal.science/hal-04390592/file/1-s2.0-S1053811923003828-main.pdf BibTex
titre
A Practical Algorithm for Volume Estimation based on Billiard Trajectories and Simulated Annealing
auteur
Apostolos Chalkis, Ioannis Z. Emiris, Vissarion Fisikopoulos
article
ACM Journal of Experimental Algorithmics, 2023, 28, pp.1-34. ⟨10.1145/3584182⟩
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https://arxiv.org/pdf/1905.05494 BibTex
titre
Identifying subcortical connectivity during brain tumor surgery: a multimodal study
auteur
Fabien Almairac, Petru Isan, Marie Onno, Théodore Papadopoulo, Lydiane Mondot, Stéphane Chanalet, Charlotte Fernandez, Maureen Clerc, Rachid Deriche, Denys Fontaine, Patryk Filipiak
article
Brain Structure and Function, 2023, 228 (3-4), pp.815-830. ⟨10.1007/s00429-023-02623-0⟩
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BibTex
titre
Practical volume approximation of high-dimensional convex bodies, applied to modeling portfolio dependencies and financial crises
auteur
Ludovic Calès, Apostolos Chalkis, Ioannis Z. Emiris, Vissarion Fisikopoulos
article
Computational Geometry, 2023, 109, pp.101916. ⟨10.1016/j.comgeo.2022.101916⟩
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https://hal.science/hal-04294307/file/CalChaEFis-journal-draft.pdf BibTex
titre
Geometric algorithms for sampling the flux space of metabolic networks
auteur
Apostolos Chalkis, Ioannis Z. Emiris, Vissarion Fisikopoulos, Elias Tsigaridas, Haris Zafeiropoulos
article
Journal of Computational Geometry, 2023, 14 (1), ⟨10.20382/jocg.v14i1a8⟩
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https://inria.hal.science/hal-04310109/file/chalkis-numbered.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Fairness Aware Counterfactuals for Subgroups
auteur
Loukas Kavouras, Konstantinos Tsopelas, Giorgos Giannopoulos, Dimitris Sacharidis, Eleni Psaroudaki, Nikolaos Theologitis, Dimitrios Rontogiannis, Dimitris Fotakis, Ioannis Z. Emiris
article
NeurIPS 2023 – 37th Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2023, New-Orleans, Lousiane, United States
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https://hal.science/hal-04294292/file/2306.14978.pdf BibTex
titre
PartNeRF: Generating Part-Aware Editable 3D Shapes without 3D Supervision
auteur
Konstantinos Tertikas, Despoina Paschalidou, Boxiao Pan, Jeong Joon Park, Mikaela Angelina Uy, Ioannis Z. Emiris, Yannis Avrithis, Leonidas Guibas
article
CVPR 2023 – IEEE/CVF Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2023, Vancouver, Canada. pp.4466-4478, ⟨10.1109/CVPR52729.2023.00434⟩
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https://hal.science/hal-04294277/file/2303.09554.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Pilot analysis – Computer Science
auteur
Angelo Di Iorio, Kumar Guha, Silvio Peroni, Laurent Romary, Thanasis Vergoulis
article
2023
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https://inria.hal.science/hal-04362464/file/Pilot%20analysis%20-%20Computer%20Science-2.pdf BibTex

2022

Article dans une revue

titre
Current distribution of distributed all-polar cochlear implant stimulation mode measured in-situ
auteur
Pierre Stahl, Kai Dang, Clair Vandersteen, Nicolas Guevara, Maureen Clerc, Dan Gnansia
article
PLoS ONE, 2022, 17 (10), pp.e0275961. ⟨10.1371/journal.pone.0275961⟩
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BibTex
titre
Investigating the Bioactive Conformation of Angiotensin II Using Markov State Modeling Revisited with Web-Scale Clustering
auteur
Emmanouil Christoforou, Hari Leontiadou, Frank Noé, Jannis Samios, Ioannis Z. Emiris, Zoe Cournia
article
Journal of Chemical Theory and Computation, 2022, 18 (9), pp.5636-5648. ⟨10.1021/acs.jctc.1c00881⟩
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https://hal.science/hal-03895590/file/EmirisChristoforouCourniaEtal2022open.pdf BibTex
titre
Efficient sampling in spectrahedra and volume approximation
auteur
Apostolos Chalkis, Ioannis Z. Emiris, Vissarion Fisikopoulos, Panagiotis Repouskos, Elias Tsigaridas
article
Linear Algebra and its Applications, 2022, 648, pp.205-232. ⟨10.1016/j.laa.2022.04.002⟩
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https://inria.hal.science/hal-03659476/file/spectra-vol-j.pdf BibTex
titre
DORIS: a diffusion MRI-based 10 tissue class deep learning segmentation algorithm tailored to improve anatomically-constrained tractography
auteur
Guillaume Theaud, Manon Edde, Matthieu Dumont, Clément Zotti, Mauro Zucchelli, Samuel Deslauriers-Gauthier, Pierre-Marc Jodoin, Maxime Descoteaux, Rachid Deriche
article
Frontiers in Neuroimaging, 2022
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https://inria.hal.science/hal-03694817/file/fnimg-01-917806.pdf BibTex
titre
A Riemannian Revisiting of Structure–Function Mapping Based on Eigenmodes
auteur
Samuel Deslauriers-Gauthier, Mauro Zucchelli, Hiba Laghrissi, Rachid Deriche
article
Frontiers in Neuroimaging, 2022, 1, ⟨10.3389/fnimg.2022.850266⟩
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https://inria.hal.science/hal-03677975/file/A%20Riemannian%20Revisiting%20of%20Structure%E2%80%93Function%20Mapping%20Based%20on%20Eigenmodes.pdf BibTex
titre
New upper bounds for the number of embeddings of minimally rigid graphs
auteur
Evangelos Bartzos, Ioannis Z. Emiris, Raimundas Vidunas
article
Discrete and Computational Geometry, 2022, 68 (3), pp.796. ⟨10.1007/s00454-022-00370-3⟩
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https://arxiv.org/pdf/2010.10578 BibTex
titre
Une approche de filtrage anisotrope 4D pour récupérer les activations cérébrales à partir de données d’IRM fonctionnelle sans connaissance du paradigme expérimental
auteur
Isa Costantini, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier
article
Frontiers in Neuroimaging, 2022, 1, pp.815423. ⟨10.3389/fnimg.2022.815423⟩
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https://hal.science/hal-03629113/file/fnimg-01-815423.pdf BibTex
titre
Near-neighbor preserving dimension reduction via coverings for doubling subsets of ℓ1
auteur
Ioannis Z. Emiris, Vasilis Margonis, Ioannis Psarros
article
Theoretical Computer Science, 2022, 942, pp.169-179. ⟨10.1016/j.tcs.2022.11.031⟩
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https://hal.science/hal-04294296/file/EmMaPs-journal.pdf BibTex
titre
Transcriptomic and cellular decoding of functional brain connectivity changes reveal regional brain vulnerability to pro- and anti-inflammatory therapies
auteur
Daniel Martins, O. Dipasquale, K. Davies, E. Cooper, J. Tibble, M. Veronese, Matteo Frigo, S.C.R. Williams, F. Turkheimer, M. Cercignani, Neil Harrison
article
Brain, Behavior, and Immunity, 2022, 102, pp.312-323. ⟨10.1016/j.bbi.2022.03.004⟩
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https://hal.science/hal-03608740/file/main_manuscript_final.pdf BibTex
titre
An asymptotic upper bound for graph embeddings
auteur
Evangelos Bartzos, Ioannis Z. Emiris, Charalambos Tzamos
article
Discrete Applied Mathematics, 2022, 327, pp.157-177. ⟨10.1016/j.dam.2022.12.010⟩
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https://hal.science/hal-04294304/file/BaEmiTzam22.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Embedding neurophysiological signals
auteur
Pierre Guetschel, Théodore Papadopoulo, Michael Tangermann
article
Proceedings of the IEEE MetroXRAINE conference, Oct 2022, Roma, Italy
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https://inria.hal.science/hal-03878615/file/MetroXRAINE_2022_GuePapTan.pdf BibTex
titre
CNN and diffusion MRI’s 4th degree rotational invariants for Alzheimer’s disease identification
auteur
Aymene Mohammed Bouayed, Samuel Deslauriers-Gauthier, Mauro Zucchelli, Rachid Deriche
article
International Workshop on Learning with Imbalanced Domains: Theory and Applications, Sep 2022, Grenoble, France
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https://hal.science/hal-03740103/file/main.pdf BibTex
titre
Bounding the Number of Roots of Multi-Homogeneous Systems
auteur
Evangelos Bartzos, Ioannis Z. Emiris, Ilias Kotsireas, Charalambos Tzamos
article
ISSAC 2022 – International Symposium on Symbolic and Algebraic Computation, Jul 2022, Villeneuve-d’Ascq France, France. pp.255-262, ⟨10.1145/3476446.3536189⟩
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BibTex
titre
On the use of augmented autocorrelation matrix for the classification of BCI-EEG
auteur
Igor Carrara, Theodore Papadopoulo
article
Neuromod Meeting 2022, Jun 2022, Nice, France
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https://hal.science/hal-03952649/file/Abstract_Neuromod_2022.pdf BibTex
titre
It Takes Two to Tango: Mixup for Deep Metric Learning
auteur
Shashanka Venkataramanan, Bill Psomas, Ewa Kijak, Laurent Amsaleg, Konstantinos Karantzalos, Yannis Avrithis
article
ICLR 2022 – 10th International Conference on Learning Representations, Apr 2022, Virtual, France. pp.1-21
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https://inria.hal.science/hal-03577949/file/Metrix_ICLR22.pdf BibTex

Poster de conférence

titre
Shallow convolutional neural network with rank-1 Fourier domain weights for brain signal classification
auteur
Sara Sedlar, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche, Théodore Papadopoulo
article
Proceedings of SophIA 2022, Nov 2022, Sophia Antipolis, France
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https://inria.hal.science/hal-03878709/file/poster_rank1CNN.pdf BibTex
titre
Localization of Brain Microstructure Changes Associated with Alzheimer’s Disease using Class Activation Maps
auteur
Aymene Mohammed Bouayed, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
Soph.I.A Summit 2022 : fifth edition of the international AI conference, Nov 2022, Sophia Antipolis, France. Proceedings of SophIA 2022
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https://inria.hal.science/hal-03879975/file/bouayed_SophIA2022.pdf BibTex
titre
Forward modelling of M/EEG: Towards a new automatic head and brain tissue segmentation system
auteur
Ludovic Corcos, Théodore Papadopoulo, Samuel Deslauriers-Gauthier
article
SophI.A 2022 : fifth international AI conference, Nov 2022, Sophia Antipolis, France. Proceedings of SophIA 2022
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https://inria.hal.science/hal-03879971/file/corcos_SophIA2022.pdf BibTex
titre
Hyperbolic Model Captures Temporal Small Worldness of Brain Dynamics
auteur
Aurora Rossi, Pierluigi Crescenzi, Samuel Deslauriers-Gauthier, Emanuele Natale
article
NeuroMod meeting 2022, Jun 2022, Antibes, France.
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03685173/file/NeuroMod_poster.pdf BibTex
titre
Investigating the origin of phase delays in the alpha band
auteur
Côme Le Breton, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc
article
NeuroMod Meeting 2022, Jun 2022, Antibes, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03878789/file/neuromod_poster.pdf BibTex
titre
Rotation invariant features for Alzheimer’s disease identification using convolutional neural networks
auteur
Aymene Mohammed Bouayed, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
NeuroMod Meeting 2022, Jun 2022, Antibes, France. pp.1-1
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https://hal.science/hal-03691436/file/NeuroMod-poster.pdf BibTex
titre
On the use of the « Augmented » autocovariance matrix for the classification of BCI-EEG
auteur
Igor Carrara, Senellart Agathe Senellart, Théodore Papadopoulo
article
Proceedings of Cortico Days, Mar 2022, Autrans, France
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https://inria.hal.science/hal-03878705/file/Grenoble2022_Vertical_FINAL.pdf BibTex

Thèse

titre
Réseaux de neurones convolutifs adaptés au domaine pour l’analyse des signaux IRMd et M/EEG
auteur
Sara Sedlar
article
Medical Imaging. Université Côte d’Azur, 2022. English. ⟨NNT : 2022COAZ4106⟩
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https://theses.hal.science/tel-03946862/file/2022COAZ4106.pdf BibTex
titre
Analyse de l’attention auditive lors de l’écoute musicale : établir le lien entre machine learning, électrophysiologie et cognition
auteur
Joan Belo
article
Computer science. Université Côte d’Azur, 2022. English. ⟨NNT : 2022COAZ4086⟩
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https://theses.hal.science/tel-03957453/file/2022COAZ4086.pdf BibTex
titre
Reconstruction de l’activité corticale à partir de données MEG à l’aide de réseaux cérébraux et de délais de transmission estimés à partir d’IRMd
auteur
Ivana Kojčić
article
Medical Imaging. Université Côte d’Azur, 2022. English. ⟨NNT : 2022COAZ4070⟩
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https://inria.hal.science/tel-03944354/file/2022COAZ4070.pdf BibTex
titre
Utilisabilité des marqueurs de synchronie de phase dans les protocoles de neurofeedback EEG pour la réduction des crises épileptiques
auteur
Côme Le Breton
article
Signal and Image Processing. Université Côte d’Azur, 2022. English. ⟨NNT : 2022COAZ4058⟩
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https://theses.hal.science/tel-03946762/file/2022COAZ4058.pdf BibTex
titre
Bornes sur le nombre maximal de plongements de graphes.
auteur
Evangelos Bartzos
article
Mathematics [math]. National and Kapodistrian University of Athens, 2022. English. ⟨NNT : ⟩
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https://hal.science/tel-04307206/file/52067.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
A revisiting of structure-function mapping using Graph Convolutional Networks
auteur
Sarah Mouffok
article
2022
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https://hal.science/hal-03766992/file/Report_Sarah_Mouffok.pdf BibTex

2021

Article dans une revue

titre
Modeling asset allocations and a new portfolio performance score
auteur
Ioannis Z. Emiris, Apostolos Chalkis, Emmanouil Christoforou, Theodore Dalamagas
article
Digital Finance, 2021, 3 (3-4), pp.333-371. ⟨10.1007/s42521-021-00040-8⟩
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BibTex
titre
On the generalizability of diffusion MRI signal representations across acquisition parameters, sequences and tissue types: chronicles of the MEMENTO challenge
auteur
Alberto de Luca, Andrada Ianus, Alexander Leemans, Marco Palombo, Noam Shemesh, Hui Zhang, Daniel C Alexander, Markus Nilsson, Martijn Froeling, Geert-Jan Biessels, Mauro Zucchelli, Matteo Frigo, Enes Albay, Sara Sedlar, Abib Alimi, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche, Rutger H.J. Fick, Maryam Afzali, Tomasz Pieciak, Fabian Bogusz, Santiago Aja-Fernández, Evren Özarslan, Derek Jones, Haoze Chen, Mingwu Jin, Zhijie Zhang, Fengxiang Wang, Vishwesh Nath, Prasanna Parvathaneni, Jan Morez, Jan Sijbers, Ben Jeurissen, Shreyas Fadnavis, Stefan Endres, Ariel Rokem, Eleftherios Garyfallidis, Irina Sanchez, Vesna Prchkovska, Paulo Rodrigues, Bennet Landman, Kurt Schilling
article
NeuroImage, 2021, 240, pp.118367. ⟨10.1016/j.neuroimage.2021.118367⟩
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BibTex
titre
Spatio-Temporal Deep Learning for day-ahead wind speed forecasting relying on WRF predictions
auteur
E Christoforou, Ioannis Z. Emiris, A Florakis, D Rizou, S Zaharia
article
Energy Systems, 2021, ⟨10.1007/s12667-021-00480-6⟩
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https://hal.science/hal-03523828/file/Spatio-Temporal_Deep_Learning_for_windSIMPLE.pdf BibTex
titre
Centering inclusivity in the design of online conferences – An OHBM – Open Science perspective
auteur
Elizabeth Levitis, Cassandra Gould van Praag, Remi Gau, Stephan Heunis, Elizabeth Dupre, Greg Kiar, Katherine Bottenhorn, Tristan Glatard, Aki Nikolaidis, Kirstie Jane Whitaker, Matteo Mancini, Guiomar Niso, Soroosh Afyouni, Eva Alonso Ortiz, Stefan Appelhoff, Aurina Arnatkeviciute, Melvin Selim Atay, Tibor Auer, Giulia Baracchini, Johanna Margarete Marianne Bayer, Michael J. S. Beauvais, Janine Diane Bijsterbosch, Isil Poyraz Bilgin, Saskia Bollmann, Steffen Bollmann, Rotem Botvinik-Nezer, Molly Bright, Vince Calhoun, Xiao Chen, Sidhant Chopra, Hu Chuan-Peng, Thomas Close, Savannah Cookson, Cameron Craddock, Alejandro de La Vega, Benjamin de Leener, Damion Demeter, Paola Di Maio, Erin Dickie, Simon Eickhoff, Oscar Esteban, Karolina Finc, Matteo Frigo, Saampras Ganesan, Melanie Ganz, Kelly Garner, Eduardo Garza-Villarreal, Gabriel Gonzalez-Escamilla, Rohit Goswami, John David Griffiths, Tijl Grootswagers, Samuel Guay, Olivia Guest, Daniel Handwerker, Peer Herholz, Katja Heuer, Dorien Huijser, Vittorio Iacovella, Michael Joseph, Agah Karakuzu, David Keator, Xenia Kobeleva, Manoj Kumar, Angie Laird, Linda Larson-Prior, Alexandra Lautarescu, Alberto Lazari, Jon Haitz Legarreta Gorroño, Xue-Ying Li, Jinglei Lv, Sina Mansour, David Meunier, Dustin Moraczewski, Tulika Nandi, Samuel Nastase, Matthias Nau, Stephanie Noble, Martin Norgaard, Johnes Obungoloch, Robert Oostenveld, Edwina Orchard, Ana Luísa Pinho, Russell Poldrack, Anqi Qiu, Pradeep Reddy Raamana, Ariel Rokem, Saige Rutherford, Malvika Sharan, Thomas Shaw, Warda Syeda, Meghan Testerman, Roberto Toro, Sofie Valk, Sofie van den Bossche, Gael Varoquaux, Frantisek Vasa, Michele Veldsman, Jakub Vohryzek, Adina Svenja Wagner, Reubs Walsh, Tonya White, Fu-Te Wong, Xihe Xie, Chao-Gan Yan, Yu-Fang Yang, Yohan Yee, Gaston Zanitti, Ana van Gulick, Eugene Duff, Camille Maumet
article
GigaScience, 2021, 10 (8), ⟨10.1093/gigascience/giab051⟩
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https://inserm.hal.science/inserm-03221005/file/giab051.pdf BibTex
titre
Interpretable Deep Learning as a mean for decrypting disease signature in Multiple Sclerosis
auteur
Federica Cruciani, Lorenza Brusini, Mauro Zucchelli, Gustavo Retuci Pinheiro, Francesco Setti, Ilaria Boscolo Galazzo, Rachid Deriche​, Leticia Rittner, Massimiliano Calabrese, Gloria Menegaz
article
Journal of Neural Engineering, 2021, ⟨10.1088/1741-2552/ac0f4b⟩
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BibTex
titre
Network alignment and similarity reveal atlas-based topological differences in structural connectomes
auteur
Matteo Frigo, Emilio Cruciani, David Coudert, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier, Emanuele Natale
article
Network Neuroscience, 2021, ⟨10.1162/netn_a_00199⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03033777/file/netn-manuscript.pdf BibTex
titre
EEG-Based Auditory Attention Detection and Its Possible Future Applications for Passive BCI
auteur
Joan Belo, Maureen Clerc, Daniele Schön
article
Frontiers in Computer Science, 2021, 3, ⟨10.3389/fcomp.2021.661178⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03215168/file/fcomp-03-661178.pdf BibTex
titre
Long multi-stage training for a motor-impaired user in a BCI competition
auteur
Federica Turi, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo
article
Frontiers in Human Neuroscience, 2021, 15, ⟨10.3389/fnhum.2021.647908⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03192449/file/cybathlon_paper.pdf BibTex
titre
Towards Linking Diffusion MRI based Macro-and Microstructure Measures with Cortico-Cortical Transmission in Brain Tumor Patients
auteur
Patryk Filipiak, Fabien Almairac, Théodore Papadopoulo, Denys Fontaine, Lydiane Mondot, Stéphane Chanalet, Rachid Deriche, Maureen Clerc, Demian Wassermann
article
NeuroImage, In press, ⟨10.1016/j.neuroimage.2020.117567⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03015641/file/main.pdf BibTex
titre
Multilinear Polynomial Systems: Root Isolation and Bit Complexity
auteur
Ioannis Z. Emiris, Angelos Mantzaflaris, Elias Tsigaridas
article
Journal of Symbolic Computation, 2021, Special Issue on Milestones in Computer Algebra (MICA 2016), 105, pp.145-164. ⟨10.1016/j.jsc.2020.06.005⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02099556/file/emt-bhomo-jsc.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Brain Tissue Microstructure Characterization Using dMRI Based Autoencoder Neural-Networks
auteur
Mauro Zucchelli, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
MICCAI 2021 – 24th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2021, Strasbourg, France. ⟨10.1007/978-3-030-87615-9_5⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03312453/file/CDMRI21_Zucchelli%282%29.pdf BibTex
titre
A spherical convolutional neural network for white matter structure imaging via dMRI
auteur
Sara Sedlar, Abib Alimi, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier
article
MICCAI 2021 – 24th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2021, Strasbourg / Virtual, France. pp.Pages 529-539, ⟨10.1007/978-3-030-87199-4_50⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03307031/file/paper2377.pdf BibTex
titre
Structure-Function Mapping via Graph Neural Networks
auteur
Yang Ji, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
MLCN 2021 – 4th International Workshop on Machine Learning in Clinical Neuroimaging, Sep 2021, Strasbourg, France. pp.135-144, ⟨10.1007/978-3-030-87586-2_14⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03352550/file/Structure_Function_Mapping_via_Graph_Neural_Networks.pdf BibTex
titre
The m-Bézout Bound and Distance Geometry
auteur
Evangelos Bartzos, Ioannis Z. Emiris, Charalampos Tzamos
article
CASC 2021 – 23rd International Workshop Computer Algebra in Scientific Computing, Sep 2021, Sochi, Russia. ⟨10.1007/978-3-030-85165-1_2⟩
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https://hal.science/hal-03523833/file/BaEmTzChapter2021Casc.pdf BibTex
titre
Modeling of Crisis Periods in Stock Markets
auteur
Ioannis Z. Emiris, Apostolos Chalkis, Emmanouil Christoforou, Theodore Dalamagas
article
LION 15 – 15th Learning and Intelligent Optimization, Jun 2021, Athens, France. pp.55-65, ⟨10.1007/978-3-030-92121-7_5⟩
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https://arxiv.org/pdf/2103.13294 BibTex
titre
Geometric algorithms for sampling the flux space of metabolic networks
auteur
Apostolos Chalkis, Vissarion Fisikopoulos, Elias Tsigaridas, Haris Zafeiropoulos
article
The 37th International Symposium on Computational Geometry (SoCG), Jun 2021, Buffalo, United States. ⟨10.4230/LIPIcs.SoCG.2021.21⟩
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https://inria.hal.science/hal-03047049/file/metabolic_networks.pdf BibTex
titre
Autonomous and optimized ship routing
auteur
Ioannis Z. Emiris
article
SNAME 2021 – 7th International Symposium on Ship Operations, Management and Economics, May 2021, Athens, Greece. ⟨10.5957/SOME-2021-017⟩
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https://hal.science/hal-03523845/file/shiproute_Emiris.pdf BibTex
titre
Incorporating transmission delays supported by diffusion MRI in MEG source reconstruction
auteur
Ivana Kojčić, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier
article
ISBI 2021 – 18th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2021, Nice, France. ⟨10.1109/ISBI48211.2021.9433861⟩
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https://inria.hal.science/hal-03143148/file/ISBI_2021_Ivana_Kojcic.pdf BibTex
titre
Investigating the effect of DMRI signal representation on fully-connected neural networks brain tissue microstructure estimation
auteur
Mauro Zucchelli, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
ISBI 2021 – 18th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2021, Nice / Virtual, France. ⟨10.1109/ISBI48211.2021.9434046⟩
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https://inria.hal.science/hal-03174220/file/root.pdf BibTex
titre
Explainable 3D-CNN for Multiple Sclerosis patients stratification
auteur
Federica Cruciani, Lorenza Brusini, Mauro Zucchelli, Gustavo Retuci Pinheiro, Francesco Setti, Ilaria Boscolo Galazzo, Rachid Deriche, Leticia Rittner, Massimiliano Calabrese, Gloria Menegaz
article
ICPR 2020 – 25th International Conference on Pattern Recognition Workshops and Challenges, Jan 2021, Milan, Italy. ⟨10.1007/978-3-030-68796-0_8⟩
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BibTex

Poster de conférence

titre
Tools for convulsive seizures and interictal spikes detection
auteur
Daniel Diaz-Arce, Anis Ghouma, Pierre Guetschel, Théodore Papadopoulo, Massimo Mantegazza, Fabrice Duprat
article
Congrès Labex ICST, Nov 2021, Nantes, France
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https://inria.hal.science/hal-03540822/file/2021_12_presentation_interictal_analysis.pdf BibTex
titre
Un neurofeedback basé sur la synchronie de phase ? Attention !
auteur
Côme Le Breton, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc
article
NEC 2021 – Neuroergonomics Conference, Sep 2021, München, Germany
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https://hal.science/hal-03538875/file/184_poster.pdf BibTex
titre
Rank-1 CNN for mental workload classification from EEG
auteur
Sara Sedlar, Johann Benerradi, Côme Le Breton, Rachid Deriche, Théodore Papadopoulo, Max L Wilson
article
Neuroergonomics conference, Sep 2021, Munich (virtual event), Germany
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https://hal.science/hal-03357020/file/NEC2021_hackathon.pdf BibTex

Logiciel

titre
TALON: Tractograms As Linear Operators in Neuroimaging
auteur
Matteo Frigo, Mauro Zucchelli, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier
article
2021, ⟨swh:1:dir:f25157ad1b13cb20ac3457d4f6756b49ac63d079;origin=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03116143;visit=swh:1:snp:465d89956196578717f4cb5155e456c279aa6a22;anchor=swh:1:rev:10247a14640a280b9140a27ce003d382d70cccac;path=/⟩
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https://hal.science/hal-03116143/file/talon-source.zip BibTex

Thèse

titre
Cartographie computationnelle de la connectivité cérébrale : De la modélisation multi-compartiments à la topologie des réseaux via la tractographie par filtrage
auteur
Matteo Frigo
article
Signal and Image processing. Université Côte d’Azur, 2021. English. ⟨NNT : 2021COAZ4003⟩
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https://theses.hal.science/tel-03273337/file/2021COAZ4003.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Multi-Tissue Multi-Compartment Models of Diffusion MRI
auteur
Matteo Frigo, Rutger H.J. Fick, Mauro Zucchelli, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
2021
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https://hal.science/hal-03125887/file/preprint.pdf BibTex

2020

Article dans une revue

titre
A comprehensive study on electroencephalography and magnetoencephalography sensitivity to cortical and subcortical sources
auteur
Maria Carla Piastra, Andreas Nüssing, Johannes Vorwerk, Maureen Clerc, Christian Engwer, Carsten Wolters
article
Human Brain Mapping, 2020, ⟨10.1002/hbm.25272⟩
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BibTex
titre
Analytical and fast Fiber Orientation Distribution reconstruction in 3D-Polarized Light Imaging
auteur
Abib Alimi, Samuel Deslauriers-Gauthier, Felix Matuschke, Andreas Müller, Sacha Ea Muenzing, Markus Axer, Rachid Deriche
article
Medical Image Analysis, 2020, 65, pp.101760. ⟨10.1016/j.media.2020.101760⟩
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https://inria.hal.science/hal-03078848/file/Alimi_Analytical_FOD_elsevier.pdf BibTex
titre
A Unified Framework for Multimodal Structure-function Mapping Based on Eigenmodes
auteur
Samuel Deslauriers-Gauthier, Mauro Zucchelli, Matteo Frigo, Rachid Deriche
article
Medical Image Analysis, 2020, pp.22. ⟨10.1016/j.media.2020.101799⟩
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https://inria.hal.science/hal-02925913/file/main.pdf BibTex
titre
Non-invasive inference of information flow using diffusion MRI, functional MRI, and MEG
auteur
Samuel Deslauriers-Gauthier, Isa Costantini, Rachid Deriche
article
Journal of Neural Engineering, 2020, 17 (4), pp.19. ⟨10.1088/1741-2552/ab95ec⟩
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https://inria.hal.science/hal-02925937/file/main.pdf BibTex
titre
Microstructural organization of human insula is linked to its macrofunctional circuitry and predicts cognitive control
auteur
Vinod Menon, Guillermo Gallardo, Mark Pinsk, Van-Dang Nguyen, Jing-Rebecca Li, Weidong Cai, Demian Wassermann
article
eLife, 2020, 9, ⟨10.7554/eLife.53470⟩
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BibTex
titre
Structural connectivity to reconstruct brain activation and effective connectivity between brain regions
auteur
Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo
article
Journal of Neural Engineering, 2020, 17 (3), pp.035006. ⟨10.1088/1741-2552/ab8b2b⟩
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https://inria.hal.science/hal-02945585/file/JNE20.pdf BibTex
titre
A Computational Framework For Generating Rotation Invariant Features And Its Application In Diffusion MRI
auteur
Mauro Zucchelli, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
Medical Image Analysis, 2020, ⟨10.1016/j.media.2019.101597⟩
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https://inria.hal.science/hal-02370077/file/media_zucchelli.pdf BibTex
titre
Diffusion MRI Tractography Filtering Techniques Change the Topology of Structural Connectomes
auteur
Matteo Frigo, Samuel Deslauriers-Gauthier, Drew Parker, Abdol Aziz Ould Ismail, Junghoon John Kim, Ragini Verma, Rachid Deriche
article
Journal of Neural Engineering, In press, ⟨10.1088/1741-2552/abc29b⟩
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https://hal.science/hal-02972198/file/paper-jne.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Predicting brain functional connectivity from structural connectivity using fully connected neural networks
auteur
Samuel Deslauriers-Gauthier, Mauro Zucchelli, Rachid Deriche
article
SophIA Summit, Nov 2020, Sophia-Antipolis, France
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BibTex
titre
Fully-Connected Neural Network and Spherical-Harmonics Rotation Invariant Features improve the estimation of brain tissue microstructure in Diffusion MRI
auteur
Mauro Zucchelli, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
SOPHI.A Summit 2020, Nov 2020, Sophia Antipolis, France
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https://inria.hal.science/hal-02933646/file/3IA_Mauro.pdf BibTex
titre
Connectivity-informed M/EEG inverse problem
auteur
Ivana Kojčić, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier
article
GRAIL 2020 – MICCAI Workshop on GRaphs in biomedicAl Image anaLysis, Oct 2020, Lima, Peru
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https://inria.hal.science/hal-02986430/file/Camera_ready_CIMIP_GRAIL.pdf BibTex
titre
Diffusion MRI fiber orientation distribution function estimation using voxel-wise spherical U-net
auteur
Sara Sedlar, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier
article
International MICCAI Workshop 2020 – Computational Diffusion MRI, Oct 2020, Lima, Peru
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https://hal.science/hal-02946371/file/CDMRI_camera_ready_2020.pdf BibTex
titre
Lesion-Robust White-Matter Bundle Identification through Diffusion Driven Label Fusion
auteur
Guillermo Gallardo, Gaston Zanitti, Alfred Anwander, Mat Higger, Sylvain Bouix, Samuel Deslauriers-Gauthier, Demian Wassermann
article
ISMRM 2020 – 28th Annual Meeting & Exhibition, Aug 2020, Sydney / Virtual, Australia
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02478087/file/ISMRM_20.pdf BibTex
titre
A Paradigm Free Regularization Approach to Recover Brain Activations: Validation on Task fMRI
auteur
Isa Costantini, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
ISMRM 2020 – 28th Annual Meeting & Exhibition of the International Society for Magnetic Resonance in Medicine, Aug 2020, Sydney / Virtual, Australia
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03021387/file/Costantini-ISMRM2020.pdf BibTex
titre
Diffusion MRI-based Connectivity Enriched with Microstructure Information Predicts the Propagation of Cortico-Cortical Evoked Potentials
auteur
Patryk Filipiak, Fabien Almairac, Théodore Papadopoulo, Denys Fontaine, Lydiane Mondot, Stéphane Chanalet, Rachid Deriche, Maureen Clerc, Demian Wassermann
article
ISMRM 2020 – 28th Annual Meeting & Exhibition of the International Society for Magnetic Resonance in Medicine, Aug 2020, Sydney / Virtual, Australia
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https://inria.hal.science/hal-03008798/file/main.pdf BibTex
titre
Quantitative assessment of multi-scale tractography: bridging the resolution gap with 3D-PLI
auteur
Abib Alimi, Matteo Frigo, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
ISMRM & SMRT Virtual Conference & Exhibition, Aug 2020, Virtual, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03048832/file/ismrm2020-alimi.pdf BibTex
titre
Multi-compartment modelling of diffusion MRI signal shows TE-based volume fraction bias
auteur
Matteo Frigo, Mauro Zucchelli, Rutger H.J. Fick, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
OHBM 2020 – 26th meeting of the Organization of Human Brain Mapping, Jun 2020, Montreal, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02925963/file/OHBM20%20-%20Multi-compartment%20modelling%20of%20diffusion%20MRI%20signal%20shows%20TE-based%20bias.pdf BibTex
titre
Multi Tissue Modelling of Diffusion MRI Signal Reveals Volume Fraction Bias
auteur
Matteo Frigo, Rutger H.J. Fick, Mauro Zucchelli, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
ISBI 2020 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2020, Iowa City, United States. ⟨10.1109/ISBI45749.2020.9098649⟩
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https://hal.science/hal-02473542/file/Multi_Tissue_Multi_Compartment_Models.pdf BibTex
titre
Big Data Visualization and Analytics: Future Research Challenges and Emerging Applications
auteur
Gennady Andrienko, Natalia Andrienko, Steven M. Drucker, Jean-Daniel Fekete, Danyel Fisher, Stavros Idreos, Tim Kraska, Guoliang Li, Kwan-Liu Ma, Jock D Mackinlay, Antti Oulasvirta, Tobias Schreck, Heidrun Schmann, Michael Stonebraker, David Auber, Nikos Bikakis, Panos K Chrysanthis, George Papastefanatos, Mohamed A Sharaf
article
BigVis 2020: Big Data Visual Exploration and Analytics, Mar 2020, Copenhagen, Denmark
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https://inria.hal.science/hal-02568845/file/BigVis1.pdf BibTex
titre
Edition 1.2 of the PARSEME Shared Task on Semi-supervised Identification of Verbal Multiword Expressions
auteur
Carlos Ramisch, Agata Savary, Bruno Guillaume, Jakub Waszczuk, Marie Candito, Ashwini Vaidya, Verginica Barbu Mititelu, Archna Bhatia, Uxoa Iñurrieta, Voula Giouli, Tunga Güngör, Menghan Jiang Polyu, Timm Lichte, Chaya Liebeskind, Johanna Monti, Renata Ramisch, Sara Stymne, Abigail Walsh, Hongzhi Xu
article
Joint Workshop on Multiword Expressions and Electronic Lexicons (MWE-LEX 2020), 2020, Barcelona, Spain
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https://hal.science/hal-03014927/file/main-print.pdf BibTex

N°spécial de revue/special issue

titre
Educational technology – Special Issue of ERCIM News
auteur
Vassilis Katsouros, Martin Hachet
article
ERCIM News, 120, 2020
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BibTex

Poster de conférence

titre
EEG signal analysis for epileptic seizure genesis study
auteur
Pierre Guetschel, Théodore Papadopoulo, Fabrice Duprat
article
Soph.IA, Nov 2020, Sophia Antipolis, France
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https://inria.hal.science/hal-03381680/file/poster.pdf BibTex
titre
Using Structural Connectivity to Reconstruct Brain Activation and Effective Connectivity
auteur
Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo
article
Organization for Human Brain Mapping annual Meeting, Jun 2020, Montreal, Canada. , 2020
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https://inria.hal.science/hal-02945690/file/poster.pdf BibTex
titre
A Unified Model for Structure–function Mapping Based on Eigenmodes
auteur
Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
OHBM 2020 – Organisation for Humain Brain Mapping, Jun 2020, Montréal, Canada
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https://inria.hal.science/hal-02925986/file/poster-v0.pdf BibTex

Thèse

titre
Interface cerveau-ordinateur adaptée à l’utilisateur
auteur
Federica Turi
article
Human-Computer Interaction [cs.HC]. Université Côte d’Azur, 2020. English. ⟨NNT : 2020COAZ4043⟩
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https://inria.hal.science/tel-03149221/file/2020COAZ4043.pdf BibTex
titre
Reconstruction Régularisée et Sans A-priori de l’Activation Cérébrale par IRMf
auteur
Isa Costantini
article
Signal and Image processing. Inria Sophia Antipolis – Méditerranée, Université Côte d’Azur, 2020. English. ⟨NNT : ⟩
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https://hal.science/tel-03021334/file/2020_Costantini-PhDThesis-Inria.pdf BibTex
titre
Imagerie Tridimensionnelle en Lumière Polarisée: vers une Analyse Multi-échelle et Multimodale avec l’Imagerie par Résonance Magnétique pondérée en Diffusion
auteur
Abib Alimi
article
Medical Imaging. Inria Sophia Antipolis – Méditerranée, Université Côte d’Azur, 2020. English. ⟨NNT : ⟩
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https://inria.hal.science/tel-03078802/file/2020_Alimi_PhD_Thesis.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Improving Auto-Encoders’ self-supervised image classification using pseudo-labelling via data augmentation and the perceptual loss
auteur
Aymene Mohammed Bouayed, Karim Atif, Rachid Deriche, Abdelhakim Saim
article
2020
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03046243/file/pseudo-labelling.pdf BibTex
titre
Efficient Sampling from Feasible Sets of SDPs and Volume Approximation
auteur
Apostolos Chalkis, Ioannis Emiris, Vissarion Fisikopoulos, Panagiotis Repouskos, Elias Tsigaridas
article
2020
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02953124/file/spectra-vol-j.pdf BibTex
titre
Auto-calibration of c-VEP BCI by word prediction
auteur
Federica Turi, Nathalie T.H. Gayraud, Maureen Clerc
article
2020
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https://hal.science/hal-02844024/file/Turi_autocalibtation_cVEP_BCI.pdf BibTex

2019

Article dans une revue

titre
The visual word form area (VWFA) is part of both language and attention circuitry
auteur
Lang Chen, Demian Wassermann, Daniel Abrams, John Kochalka, Guillermo Gallardo-Diez, Vinod Menon
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), ⟨10.1038/s41467-019-13634-z⟩
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https://inria.hal.science/hal-02401938/file/s41467-019-13634-z.pdf BibTex
titre
Augmenting Motor Imagery Learning for Brain–Computer Interfacing Using Electrical Stimulation as Feedback
auteur
Saugat Bhattacharyya, Maureen Clerc, Mitsuhiro Hayashibe
article
IEEE Transactions on Medical Robotics and Bionics, 2019, 1 (4), pp.247-255. ⟨10.1109/TMRB.2019.2949854⟩
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BibTex
titre
The Dmipy Toolbox: Diffusion MRI Multi-Compartment Modeling and Microstructure Recovery Made Easy
auteur
Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Rachid Deriche
article
Frontiers in Neuroinformatics, 2019, 13, ⟨10.3389/fninf.2019.00064⟩
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BibTex
titre
Adaptive phase correction of diffusion-weighted images
auteur
Marco Pizzolato, Guillaume Gilbert, Jean-Philippe Thiran, Maxime Descoteaux, Rachid Deriche
article
NeuroImage, 2019, pp.116274. ⟨10.1016/j.neuroimage.2019.116274⟩
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BibTex
titre
White Matter Information Flow Mapping from Diffusion MRI and EEG
auteur
Samuel Deslauriers-Gauthier, Jean-Marc Lina, Russell Butler, Kevin Whittingstall, Pierre-Michel Bernier, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux
article
NeuroImage, 2019, ⟨10.1016/j.neuroimage.2019.116017⟩
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https://inria.hal.science/hal-02187859/file/inferring-information-flow-submission-0.pdf BibTex
titre
Supervised Classification of Fully PolSAR Images Using Active Contour Models
auteur
Daniel Santana-Cedres, Luis Gomez, Agustin Trujillo, Miguel Aleman-Flores, Rachid Deriche, Luis Alvarez
article
IEEE Geoscience and Remote Sensing Letters, 2019, 16 (7), pp.1165-1169. ⟨10.1109/LGRS.2019.2892524⟩
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BibTex
titre
Median Nerve Stimulation Based BCI: A New Approach to Detect Intraoperative Awareness During General Anesthesia
auteur
Sébastien Rimbert, Pierre Riff, Nathalie Gayraud, Denis Schmartz, Laurent Bougrain
article
Frontiers in Neuroscience, 2019, 13, pp.13. ⟨10.3389/fnins.2019.00622⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02159777/file/fnins-13-00622.pdf BibTex
titre
Can a Subjective Questionnaire Be Used as Brain-Computer Interface Performance Predictor?
auteur
Sébastien Rimbert, Nathalie T H Gayraud, Laurent Bougrain, Maureen Clerc, Stéphanie Fleck
article
Frontiers in Human Neuroscience, 2019, 12, pp.11. ⟨10.3389/fnhum.2018.00529⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01990935/file/fnhum-12-00529.pdf BibTex
titre
Fast Approximation of EEG Forward Problem and Application to Tissue Conductivity Estimation
auteur
Kostiantyn Maksymenko, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, In press, ⟨10.1109/TMI.2019.2936921⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01890242/file/FINAL%20VERSION.pdf BibTex
titre
Rational invariants of even ternary forms under the orthogonal group
auteur
Paul Görlach, Evelyne Hubert, Théo Papadopoulo
article
Foundations of Computational Mathematics, 2019, 19, pp.1315-1361. ⟨10.1007/s10208-018-9404-1⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01570853/file/GoHuPa17.pdf BibTex
titre
Reducing the number of samples in spatiotemporal dMRI acquisition design
auteur
Patryk Filipiak, Rutger H.J. Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, Philippe Ciuciu, Rachid Deriche, Demian Wassermann
article
Magnetic Resonance in Medicine, 2019, ⟨10.1002/mrm.27601⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01928734/file/main.pdf BibTex
titre
On the maximal number of real embeddings of minimally rigid graphs in $\mathbb{R}^2$, $\mathbb{R}^3$ and $S^2$
auteur
Evangelos Bartzos, Ioannis Z. Emiris, Jan Legerský, Elias Tsigaridas
article
Journal of Symbolic Computation, In press, ⟨10.1016/j.jsc.2019.10.015⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02271782/file/maximal_real_belt_HAL.pdf BibTex
titre
Advances in computational and statistical diffusion MRI
auteur
Lauren J. O’Donnell, Alessandro Daducci, Demian Wassermann, Christophe Lenglet
article
NMR in Biomedicine, 2019, 32 (4), pp.e3805. ⟨10.1002/nbm.3805⟩
Accès au bibtex
BibTex

Communication dans un congrès

titre
Spherical convolutional neural network for diffusion MRI analysis
auteur
Sara Sedlar, Abib Alimi, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier
article
SophIA Summit, Nov 2019, Sophia-Antipolis, France
Accès au bibtex
BibTex
titre
Innovative Brain-Computer Interface based on motor cortex activity to detect accidental awareness during general anesthesia
auteur
Sébastien Rimbert, Philippe Guerci, Nathalie Gayraud, Claude Meistelman, Laurent Bougrain
article
IEEE SMC 2019 – IEEE International Conference on Systems, Man, and Cybernetics, Oct 2019, Bari, Italy
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02166934/file/RimbertSMC19.pdf BibTex
titre
Adaptive parameter setting in a code modulated visual evoked potentials BCI
auteur
Federica Turi, Maureen Clerc
article
8th Graz Brain-Computer Interface Conference 2019, Sep 2019, Graz, Austria
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02303562/file/TuriGrazBCI2019.pdf BibTex
titre
Cyber Physical Systems and Internet of Things: Emerging Paradigms on Smart Cities
auteur
Athanasios P. Kalogeras, Hervé Rivano, Luca Ferrarini, Christos Alexakos, Oana Iova, Soroush Rastegarpour, Abdoul Aziz Mbacké
article
SA 2019 – First International Conference on Societal Automation, Sep 2019, Krakow, Poland. pp.1-13, ⟨10.1109/SA47457.2019.8938083⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
Effects of tractography filtering on the topology and interpretability of connectomes
auteur
Matteo Frigo, Samuel Deslauriers-Gauthier, Drew Parker, Abdol Aziz Ould Ismail, Junghoon John Kim, Ragini Verma, Rachid Deriche
article
OHBM 2019 – Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Roma, Italy
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02056641/file/abstract.pdf BibTex
titre
Deconvolution of fMRI Data using a Paradigm Free Iterative Approach based on Partial Differential Equations
auteur
Isa Costantini, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
OHBM 2019 – Organization for Human Brain Mapping Annual Meeting, Jun 2019, Rome, Italy
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02071193/file/ohbm_abstract_HAL.pdf BibTex
titre
Open research: linking the bits and pieces with OpenAIRE-connect
auteur
Camille Maumet, Xavier Rolland, Axel Bonnet, Sorina Camarasu-Pop, Argiro Kokogiannaki, Christian Barillot
article
OHBM 2019 – 25th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy. pp.1-6
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https://inserm.hal.science/inserm-02151177/file/OHBM%202019_%20OpenAIRE-Connect%281%29.pdf BibTex
titre
Novel 4-D Algorithm for Functional MRI Image Regularization using Partial Differential Equations
auteur
Isa Costantini, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
ISMRM 2019 – 27th Annual Meeting of International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2019, Montréal, Canada
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https://hal.science/hal-02074345/file/ISMRM_abstract_HAL.pdf BibTex
titre
Estimation of Axon Conduction Delay, Conduction Speed, and Diameter from Information Flow using Diffusion MRI and MEG
auteur
Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
ISMRM 2019 – 27th Annual Meeting of International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2019, Montreal, Canada
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https://inria.hal.science/hal-02074059/file/main.pdf BibTex
titre
Towards validation of diffusion MRI tractography: bridging the resolution gap with 3D Polarized Light Imaging
auteur
Abib Alimi, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
ISMRM 2019 – 27th Annual Meeting of International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2019, Montréal, Canada
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https://inria.hal.science/hal-02070912/file/ISMRM_2019submitted.pdf BibTex
titre
Towards Validating Structural Connectivity in the Human Language System: An Intraoperative Cortico-Cortical Stimulation Experiment
auteur
Patryk Filipiak, Fabien Almairac, Théodore Papadopoulo, Denys Fontaine, Lydiane Mondot, Stéphane Chanalet, Maxime Descoteaux, Rachid Deriche, Maureen Clerc, Demian Wassermann
article
27th Annual ISMRM 2019 – Meeting & Exhibition of the International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2019, Montreal, Canada
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https://inria.hal.science/hal-02476639/file/main.pdf BibTex
titre
A Novel Characterization of Traumatic Brain Injury in White Matter with Diffusion MRI Spherical-Harmonics Rotation Invariants
auteur
Mauro Zucchelli, Drew Parker​, Samuel Deslauriers-Gauthier, Junghoon John Kim, Ragini Verma​, Rachid Deriche​
article
ISMRM 2019 – 27th Annual Meeting of International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2019, Montreal, Canada
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https://inria.hal.science/hal-02071315/file/ISMRM_2019_print.pdf BibTex
titre
Neural networks for cryptocurrency evaluation and price fluctuation forecasting
auteur
Ioannis Z. Emiris, Emmanouil Christoforou, Apostolos Florakis
article
MARBLE 2019 – The 1st International Conference on Mathematical Research for Blockchain Economy, May 2019, Santorini, Greece
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https://inria.hal.science/hal-03116041/file/marble2020inria.pdf BibTex
titre
Spatially Varying Monte Carlo Sure for the Regularization of Biomedical Images
auteur
Marco Pizzolato, Rachid Deriche, Erick Jorge Canales-Rodriguez, Jean-Philippe Thiran
article
ISBI 2019 – IEEE 16th International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. pp.1639-1642, ⟨10.1109/ISBI.2019.8759338⟩
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https://hal.science/hal-02401132/file/Pizzolato_et_al_ISBI2019_paper_corrected.pdf BibTex
titre
Coarse-Grained Spatiotemporal Acquisition Design for Diffusion MRI
auteur
Patryk Filipiak, Rutger Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, Rachid Deriche, Demian Wassermann
article
ISBI 2019 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy
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https://inria.hal.science/hal-01973588/file/root.pdf BibTex
titre
Analytical Fiber ODF Reconstruction in 3D Polarized Light Imaging: Performance Assessment
auteur
Abib Alimi, Samuel Deslauriers-Gauthier, Felix Matuschke, Daniel Schmitz, Markus Axer, Rachid Deriche
article
ISBI 2019 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy
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https://inria.hal.science/hal-01988262/file/aalimi_isbi19.pdf BibTex
titre
Estimation of Axonal Conduction Speed and the Inter Hemispheric Transfer Time using Connectivity Informed Maximum Entropy on the Mean
auteur
Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
SPIE Medical Imaging 2019, Feb 2019, San Diego, United States
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https://inria.hal.science/hal-02063396/file/main.pdf BibTex

Mémoire d’étudiant

titre
Mesure de l’attention auditive par électroencéphalographie
auteur
Johann Benerradi
article
Informatique [cs]. 2019
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https://inria.hal.science/hal-02285224/file/Rapport_M2_Benerradi.pdf BibTex

Poster de conférence

titre
Connectivity–informed spatio–temporal MEG source reconstruction: Simulation results using a MAR model
auteur
Ivana Kojčić, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier
article
Colloque Line Garnero, Oct 2019, Paris, France
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https://inria.hal.science/hal-02379744/file/CILoreta_poster_colloque_Line_Garnero.pdf BibTex
titre
Technology Brain Computer Interface for Autonomy: Patient-adapted ergonomic headset for dry-EEG P300 speller
auteur
Sofiane Guebba, Violaine Guy, Théodore Papadopoulo, Marianne Bruno, Maureen Clerc, Marie-Hélène Soriani
article
8th Graz Brain-Computer Interface Conference, Sep 2019, Graz, Austria
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https://inria.hal.science/hal-03387284/file/posterGraz.pdf BibTex
titre
Inria Research & Development for the Cybathlon BCI series
auteur
Fabien Lotte, Maureen Clerc, Aurélien Appriou, Amandine Audino, Camille Benaroch, Pierre Giacalone, Camille Jeunet, Jelena Mladenović, Thibaut Monseigne, Théodore Papadopoulo, Léa Pillette, Aline Roc, Khadijeh Sadatnejad, Federica Turi
article
8th Graz Brain-Computer Interface Conference 2019, Sep 2019, Graz, Austria. 2019
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https://univ-rennes.hal.science/hal-02433970/file/CybathlonNITROPoster_final.pdf BibTex
titre
Connectivity-informed solution for spatio-temporal M/EEG source reconstruction
auteur
Ivana Kojčić, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier
article
NeuroMod 2019 – First meeting of the NeuroMod Institute, Jul 2019, Fréjus, France
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https://inria.hal.science/hal-02279612/file/NeuroMod_poster_Ivana_Kojcic.pdf BibTex

Thèse

titre
Nouvelles approches algorithmiques pour les problèmes directs et inverses en M/EEG
auteur
Kostiantyn Maksymenko
article
Medical Imaging. COMUE Université Côte d’Azur (2015 – 2019), 2019. English. ⟨NNT : 2019AZUR4112⟩
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https://inria.hal.science/tel-02404166/file/2019AZUR4112.pdf BibTex

2018

Article dans une revue

titre
Fiber orientation distribution function from non-negative sparse recovery with quantitative analysis of local fiber orientations and tractography using DW-MRI datasets
auteur
Thinhinane Megherbi, Gabriel Girard, Aurobrata Ghosh, Fatima Oulebsir-Boumghar, Rachid Deriche
article
Magnetic Resonance Imaging, 2018, ⟨10.1016/j.mri.2018.10.003⟩
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BibTex
titre
Model based optimal multipolar stimulation without a priori knowledge of nerve structure: application to vagus nerve stimulation
auteur
Mélissa Dali, Olivier Rossel, David Andreu, Laure Laporte, Alfredo Hernández, Jeremy Laforet, Eloi Marijon, Albert A. Hagège, Maureen Clerc, Christine Henry, David Guiraud
article
Journal of Neural Engineering, 2018, 15 (4), pp.046018. ⟨10.1088/1741-2552/aabeb9⟩
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BibTex
titre
A comparison of three fiber tract delineation methods and their impact on white matter analysis
auteur
Valerie Sydnor, Ana María Rivas-Grajales, Amanda Lyall, Fan Zhang, Sylvain Bouix, Sarina Karmacharya, Martha Shenton, Carl-Fredrik Westin, Nikos Makris, Demian Wassermann, Lauren J. O’Donnell, Marek Kubicki
article
NeuroImage, 2018, 178, pp.318-331. ⟨10.1016/j.neuroimage.2018.05.044⟩
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https://inria.hal.science/hal-01807178/file/nihms-1522167.pdf BibTex
titre
Groupwise structural parcellation of the whole cortex: A logistic random effects model based approach
auteur
Guillermo Gallardo, William Wells Iii, Rachid Deriche, Demian Wassermann
article
NeuroImage, 2018, ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.01.070⟩
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https://hal.science/hal-01426625/file/main.pdf BibTex
titre
A Review of Classification Algorithms for EEG-based Brain-Computer Interfaces: A 10-year Update
auteur
Fabien Lotte, Laurent Bougrain, Andrzej Cichocki, Maureen Clerc, Marco Congedo, Alain Rakotomamonjy, Florian Yger
article
Journal of Neural Engineering, 2018, 15 (3), pp.55. ⟨10.1088/1741-2552/aab2f2⟩
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https://inria.hal.science/hal-01846433/file/JNE2017-reviewClassification-RevisedFinal.pdf BibTex
titre
Combining Improved Euler and Runge-Kutta 4th order for Tractography in Diffusion-Weighted MRI
auteur
Dalila Cherifi, Messaoud Boudjada, Abdelatif Morsli, Gabriel Girard, Rachid Deriche
article
Biomedical Signal Processing and Control, 2018, 41, pp.90 – 99. ⟨10.1016/j.bspc.2017.11.008⟩
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BibTex
titre
Non-Parametric GraphNet-Regularized Representation of dMRI in Space and Time
auteur
Rutger H.J. Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, Rachid Deriche, Demian Wassermann
article
Medical Image Analysis, 2018, 43, pp.37–53. ⟨10.1016/j.media.2017.09.002⟩
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https://inria.hal.science/hal-01578296/file/main.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/abstract_v2.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/anisotropic.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/dti_vs_ms.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/EAP.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/graphical_abstract.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/images_acquisitions.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/loglog.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/log_msd.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/log_rtxp.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/mouse_roi_with_qspaceindices.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/noiseless_fitting.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/qindices_allsubs.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/qindices_allsubs_2sub.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/random_subsampling.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/random_subsampling_snr10.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/random_subsampling_snr20.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/random_subsampling_snr30.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/shore_funcs.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/spectrum_density.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/spectrum_density_camino.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/spectrum_density_combined.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/spectrum_density_dti.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/SpinEcho_acquisition_rainbow.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/time_funcs.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/time_msd.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/time_rtap.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/time_rtop.pdf https://inria.hal.science/hal-01578296/file/time_rtpp.pdf BibTex
titre
A Second Order Multi-Stencil Fast Marching Method with a Non-Constant Local Cost Model
auteur
Susana Merino-Caviedes, Lucilio Cordero-Grande, Maria Teresa Perez, Pablo Casaseca-De-La-Higuera, Marcos Martín-Fernández, Rachid Deriche, Carlos Alberola-Lopez
article
IEEE Transactions on Image Processing, In press, pp.1. ⟨10.1109/TIP.2018.2880507⟩
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BibTex
titre
Genetic load determines atrophy in hand cortico-striatal pathways in presymptomatic Huntington’s disease
auteur
Yi Hong, Lauren J O’Donnell, Peter Savadjiev, Fan Zhang, Demian Wassermann, Ofer Pasternak, Hans J Johnson, Jane Paulsen, Jean-Paul Vonsattel, Nikolaos Makris, Carl-Fredrik Westin, Yogesh Rathi
article
Human Brain Mapping, In press, ⟨10.1002/hbm.24217⟩
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https://inria.hal.science/hal-01787886/file/HD-Study-HBM-submission.pdf BibTex
titre
Brain-computer interaction for online enhancement of visuospatial attention performance
auteur
Thomas Brochier, Romain Trachel, Maureen Clerc
article
Journal of Neural Engineering, In press, 15 (4), ⟨10.1088/1741-2552/aabf16⟩
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BibTex

Communication dans un congrès

titre
Data-driven cortical clustering to provide a family of plausible solutions to M/EEG inverse problem
auteur
Kostiantyn Maksymenko, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo
article
iTWIST, Nov 2018, Marseille, France
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https://inria.hal.science/hal-01946876/file/Maksymenko_itwist18.pdf BibTex
titre
Dmipy, a Diffusion Microstructure Imaging toolbox in Python to improve research reproducibility
auteur
Abib Alimi, Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Rachid Deriche
article
MICCAI 2018 – Workshop on Computational Diffusion MRI, Sep 2018, Granada, Spain
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https://inria.hal.science/hal-01873353/file/dmipy-diffusion-microstructure.pdf BibTex
titre
Resolving the crossing/kissing fiber ambiguity using Functionally Informed COMMIT
auteur
Matteo Frigo, Isa Costantini, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier
article
Computational Diffusion MRI 2018, Sep 2018, Granada, Spain. ⟨10.1007/978-3-030-05831-9⟩
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https://inria.hal.science/hal-01864939/file/cdmri2018.pdf BibTex
titre
A Closed-Form Solution of Rotation Invariant Spherical Harmonic Features in Diffusion MRI
auteur
Mauro Zucchelli, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
MICCAI – Computational Diffusion MRI Workshop 2018, Sep 2018, Granada, Spain
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https://inria.hal.science/hal-01912148/file/rif_cdmri.pdf BibTex
titre
Solving the Cross-Subject Parcel Matching Problem using Optimal Transport
auteur
Guillermo Gallardo, Nathalie Gayraud, Rachid Deriche, Maureen Clerc, Samuel Deslauriers-Gauthier, Demian Wassermann
article
International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention 2018, Sep 2018, Granada, Spain
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https://hal.science/hal-01935684/file/GallardoGayraud2018.pdf BibTex
titre
Edema-informed anatomically constrained particle filter tractography
auteur
Samuel Deslauriers-Gauthier, Drew Parker, Francois Rheault, Rachid Deriche, Steven Brem, Maxime Descoteaux, Ragini Verma
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2018, Sep 2018, Granada, Spain
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https://inria.hal.science/hal-01893110/file/final.pdf BibTex
titre
fMRI Deconvolution via Temporal Regularization using a LASSO model and the LARS algorithm
auteur
Isa Costantini, Patryk Filipiak, Kostiantyn Maksymenko, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
EMBC’18 – 40th International Engineering in Medicine and Biology Conference, Jul 2018, Honolulu, United States
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https://inria.hal.science/hal-01855467/file/EMBC18_3334_MS-1.pdf BibTex
titre
Reducing false positive connection in tractograms using joint structure-function filtering
auteur
Matteo Frigo, Guillermo Gallardo, Isa Costantini, Alessandro Daducci, Demian Wassermann, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier
article
OHBM 2018 – Organization for Human Brain Mapping, Jun 2018, Singapore, Singapore. pp.1-3
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01737434/file/abstract_hal.pdf BibTex
titre
Mipy: An Open-Source Framework to improve reproducibility in Brain Microstructure Imaging
auteur
Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Rachid Deriche
article
OHBM 2018 – Human Brain Mapping , Jun 2018, Singapore, Singapore. pp.1-4
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01722146/file/hbm18_mipy.pdf BibTex
titre
Investigating Diffusion-MRI based neurite density estimation model dependency: an in-vivo study on the HCP dataset
auteur
Mauro Zucchelli, Maxime Descoteaux, Gloria Menegaz
article
ISMRM 2018 – International Society for Magnetic Resonance in Medicine, Jun 2018, Paris, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01831823/file/ISMRM2018_eposter%281%29.pdf BibTex
titre
Solving the Cross-Subject Parcel Matching Problem: Comparing Four Methods Using Extrinsic Connectivity
auteur
Nathalie T H Gayraud, Guillermo Gallardo, Maureen Clerc, Demian Wassermann
article
OHBM 2018, Jun 2018, Singapore, Singapore
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https://hal.science/hal-01737366/file/ohbm18_gayraud.pdf BibTex
titre
MAN : Mise en Place d’une Méthode d’Évaluation Croisée de l’Accès aux Ressources Numériques
auteur
Loïc Caroux, Eric Campo, Nadine Vigouroux, Eric Bourreau, Maureen Clerc, Philippe Gorce, Christian Graff, Marianne Huchard, Dan Istrate, Julien Jacquier-Bret, Nicole Lompré, Nathalie Pinède, Liliana Rico Duarte, Mathilde Sacher, Audrey Serna, Antonio Serpa, Adrien van den Bossche, Frédéric Vella
article
HANDICAP, Jun 2018, Paris, France. pp.211-212
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01815554/file/CAROUX_et_al-MAN-Handicap2018_extendedabstract-Final.pdf BibTex
titre
Conductivity models for functional neuroimaging
auteur
Maureen Clerc
article
SIAM Conference on Imaging Science, Jun 2018, Bologna, Italy
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BibTex
titre
Can the MIQ-RS questionnaire be used to estimate the performance of a MI-based BCI?
auteur
Sébastien Rimbert, Nathalie Gayraud, Maureen Clerc, Stéphanie Fleck, Laurent Bougrain
article
2018 Seventh International BCI Meeting, May 2018, Pacific Grove, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01889864/file/Can%20the%20MIQ-RS%20questionnaire%20be%20used%20to%20estimate%20the%20performance%20of%20a%20KMI-based%20BCI.pdf BibTex
titre
Zero-calibration cVEP BCI using word prediction: a proof of concept
auteur
Federica Turi, Nathalie T H Gayraud, Maureen Clerc
article
BCI 2018 – 7th International BCI Meeting, May 2018, Pacific Grove, California, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01878015/file/bcimeeting_last_version.pdf BibTex
titre
Inverse source problems in electro- and magneto- encephalography
auteur
Théodore Papadopoulo
article
Inverse problems: modeling and simulation, May 2018, Paradise Bay, Malta
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BibTex
titre
An Analytical Fiber ODF Reconstruction in 3D Polarized Light Imaging
auteur
Abib Alimi, Yves Usson, Pierre-Simon Jouk, Gabrielle Michalowicz, Rachid Deriche
article
ISBI 2018 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington, D.C., United States. pp.1-4
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01688789/file/aalimi_isbi18.pdf BibTex

Poster de conférence

titre
Clustering cortical pour apporter des solutions plausibles au problème inverse M/EEG
auteur
Kostiantyn Maksymenko, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo
article
BIOMAG 2018, Aug 2018, Philadelphia, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01874281/file/poster_Maksymenko.pdf BibTex
titre
OpenMEEG software for forward problems, coping with non-nested geometries
auteur
Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo
article
International Conference on Biomagnetism, Aug 2018, Philadelphia, United States
Accès au bibtex
BibTex
titre
Spatio-Temporal dMRI Acquisition Design: Reducing the Number of Samples
auteur
Patryk Filipiak, Rutger H.J. Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, Rachid Deriche, Demian Wassermann
article
ISMRM 2018, Jun 2018, Paris, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01719646/file/ismrm2018-abstract.pdf BibTex
titre
Towards the assessment of myelination using time-dependent diffusion MRI indices
auteur
Abib Alimi, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, Rachid Deriche, Demian Wassermann
article
ISMRM 2018 – International Society for Magnetic Resonance in Medicine, Jun 2018, Paris, France. pp.1-4
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01723846/file/abstract_ismrm.pdf BibTex
titre
L1-Norm Regularized Deconvolution of Functional MRI BOLD Signal
auteur
Isa Costantini, Patryk Filipiak, Kostiantyn Maksymenko, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
C@UCA, Jun 2018, Fréjus, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01855505/file/CaUCA_Costantini_poster.pdf BibTex
titre
Bridging Brain Structure and Function by Correlating Structural Connectivity and Cortico-Cortical Transmission
auteur
Fabien Almairac, Patryk Filipiak, Lavinia Slabu, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Denys Fontaine, Lydiane Mondot, Stéphan Chanelet, Demian Wassermann, Rachid Deriche
article
2nd C@UCA meeting, Jun 2018, Frejus, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01852956/file/poster_cauca2018_updated.pdf BibTex
titre
Sensing Von Economo Neurons in the Insula with Multi-shell Diffusion MRI
auteur
Demian Wassermann, Dang Van Nguyen, Guillermo Gallardo, Jing-Rebecca Li, Weidong Cai, Vinod Menon
article
International Society for Magnetic Resonance in Medicine, 2018, Paris, France
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BibTex

Thèse

titre
Construction et comparaison de parcellisations structurelles cérébrale par imagerie de diffusion
auteur
Guillermo Alejandro Gallardo Diez
article
Signal and Image processing. COMUE Université Côte d’Azur (2015 – 2019), 2018. English. ⟨NNT : 2018AZUR4233⟩
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https://theses.hal.science/tel-02272039/file/2018AZUR4233.pdf BibTex
titre
Méthodes adaptatives d’apprentissage pour des interfaces cerveau-ordinateur basées sur les potentiels évoqués
auteur
Nathalie Gayraud
article
Signal and Image processing. COMUE Université Côte d’Azur (2015 – 2019), 2018. English. ⟨NNT : 2018AZUR4231⟩
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https://theses.hal.science/tel-02100593/file/2018AZUR4231.pdf BibTex

2017

Article dans une revue

titre
The challenge of mapping the human connectome based on diffusion tractography
auteur
Klaus H Maier-Hein, Peter F. Neher, Christophe Houde, Marc-Alexandre Côté, Eleftherios Garyfallidis, Jidan Zhong, Maxime Chamberland, Fang-Chen Yeh, Ying-Chia Lin, Qing Ji, Wilburn E. Reddick, John O. Glass, David Qixiang Chen, Yuanjing Feng, Chengfeng Gao, Ye Wu, Jieyan Ma, H. Renjie, Qiang Li, Carl-Fredrik Westin, Samuel Deslauriers-Gauthier, J. Omar Ocegueda González, Michael Paquette, Samuel St-Jean, Gabriel Girard, François Rheault, Jasmeen Sidhu, Chantal M. W. Tax, Fenghua Guo, Hamed Y. Mesri, Szabolcs Dávid, Martijn Froeling, Anneriet M. Heemskerk, Alexander Leemans, Arnaud Boré, Basile Pinsard, Christophe Bedetti, Matthieu Desrosiers, Bram Brambati, Julien Doyon, Alessia Sarica, Roberta Vasta, Antonio Cerasa, Aldo Quattrone, Jason Yeatman, Ali R. Khan, Wes Hodges, Simon Alexander, David Romascano, Muhamed Barakovic, Anna Auría, Oscar Esteban, Alia Lemkaddem, Jean-Philippe Thiran, H. Ertan Cetingul, Benjamin L. Odry, Boris Mailhé, Mariappan S. Nadar, Fabrizio M Pizzagalli, Gautam Prasad, Julio E. Villalon-Reina, Justin Galvis, Paul M. Thompson, Francisco de Santiago Requejo, Pedro Luque Laguna, Luis Miguel Lacerda, Rachel Barrett, Flavio Dell’acqua, Marco Catani, Laurent Petit, Emmanuel Caruyer, Alessandro Daducci, Tim Dyrby, Tim Holland-Letz, Claus C. Hilgetag, Bram Stieltjes, Maxime Descoteaux
article
Nature Communications, 2017, 8 (1), ⟨10.1038/s41467-017-01285-x⟩
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https://inria.hal.science/hal-01631578/file/Maier-Hein_et_al-2017-Nature_Communications.pdf BibTex
titre
Using diffusion MRI to discriminate areas of cortical grey matter
auteur
Tharindu Ganepola, Zoltan K. Nagy, Aurobrata Ghosh, Théodore Papadopoulo, Daniel C Alexander, Martin I Sereno
article
NeuroImage, 2017, pp.1-13. ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.12.046⟩
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https://inria.hal.science/hal-01734650/file/DiffusionInvariatsTesting.pdf BibTex
titre
Diffusion MRI microstructure models with in vivo human brain Connectom data: results from a multi-group comparison
auteur
Uran Ferizi, Benoit Scherrer, Torben Schneider, Mohammad Alipoor, Odin Eufracio, Rutger H.J. Fick, Rachid Deriche, Markus Nilsson, Ana K. Loya-Olivas, Mariano Rivera, Dirk H.J. Poot, Alonso Ramirez-Manzanares, Jose L. Marroquin, Ariel Rokem, Christian Pötter, Robert F. Dougherty, Ken Sakaie, Claudia Wheeler-Kingshott, Simon K. Warfield, Thomas Witzel, Lawrence L. Wald, José G. Raya, Daniel C. Alexander
article
NMR in Biomedicine, 2017, 30 (9), ⟨10.1002/nbm.3734⟩
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https://hal.science/hal-01500472/file/Ferizi-etal-arXiv%3A1604.07287.pdf BibTex
titre
Adaptive Waveform Learning: A Framework for Modeling Variability in Neurophysiological Signals
auteur
Sebastian Hitziger, Maureen Clerc, Sandrine Saillet, Christian Bénar, Théodore Papadopoulo
article
IEEE Transactions on Signal Processing, 2017, 65, pp.4324 – 4338. ⟨10.1109/TSP.2017.2698415⟩
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https://inria.hal.science/hal-01548428/file/AdaptiveWaveformLearning_author_version.pdf BibTex
titre
Strategies for statistical thresholding of source localization maps in magnetoencephalography and estimating source extent
auteur
Kostiantyn Maksymenko, Bernard Giusiano, Nicolas Roehri, Christian G. Bénar, Jean-Michel Badier
article
Journal of Neuroscience Methods, 2017, 290, pp.95-104. ⟨10.1016/j.jneumeth.2017.07.015⟩
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https://hal.science/hal-03577165/file/thresholding_V10_nomark.pdf BibTex
titre
Unimodal Versus Bimodal EEG-fMRI Neurofeedback of a Motor Imagery Task
auteur
Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Marsel Mano, Elise Bannier, Fabien Lotte, Maureen Clerc, Christian Barillot
article
Frontiers in Human Neuroscience, 2017, 11, ⟨10.3389/fnhum.2017.00193⟩
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https://inria.hal.science/hal-01519755/file/fnhum-11-00193%20%281%29.pdf BibTex
titre
Perfusion deconvolution in DSC-MRI with dispersion-compliant bases
auteur
Marco Pizzolato, Timothé Boutelier, Rachid Deriche
article
Medical Image Analysis, 2017, 36, pp.197 – 215. ⟨10.1016/j.media.2016.12.001⟩
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https://inria.hal.science/hal-01536292/file/Pizzolato_et_al_media_2017.pdf BibTex
titre
SlicerDMRI: Open Source Diffusion MRI Software for Brain Cancer Research
auteur
Isaiah Norton, Ibn Essayed, Fan Zhang, Sonia Pujol, Alex Yarmarkovich, Alexandra J Golby, Gordon Kindlmann, Demian Wassermann, Raul San José Estepar, Yogesh Rathi, Steve Pieper, Ron Kikinis, Hans J Johnson, Carl-Fredrik Westin, Lauren J. O’Donnell
article
Cancer Research, 2017, ⟨10.1158/0008-5472.CAN-17-0332⟩
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https://inria.hal.science/hal-01564088/file/178302_3_unknown_upload_4130228_9s9tyd%20copy.pdf BibTex
titre
Brain computer interface with P300-Speller: usability for disabled patients with Amyotrophic Lateral Sclerosis.
auteur
Violaine Guy, M. H. Soriani, Mariane Bruno, Théodore Papadopoulo, Claude Desnuelle, Maureen Clerc
article
Annals of Physical and Rehabilitation Medicine, 2017
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BibTex
titre
AxTract: Toward Microstructure Informed Tractography
auteur
Gabriel Girard, Alessandro Daducci, Laurent Petit, Jean-Philippe Thiran, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Demian Wassermann, Maxime Descoteaux
article
Human Brain Mapping, 2017, 38 (11), pp.5485-5500. ⟨10.1002/hbm.23741⟩
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https://inria.hal.science/hal-01564041/file/axtract_manuscript.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Matching parcellations using Optimal Transport: a proof of concept
auteur
Guillermo Gallardo, Nathalie Thérèse Hélène Gayraud, Maureen Clerc, Demian Wassermann
article
Computational Brain Connectivity Mapping – Winter School Workshop 2017, Nov 2017, Juan-les-Pins, France
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https://inria.hal.science/hal-01713345/file/matching-parcellations-optimal.pdf BibTex
titre
Hierarchical Tractography Optimisation
auteur
Matteo Frigo, Muhamed Barakovic, Jean-Philippe Thiran, Alessandro Daducci
article
CoBCoM 2017 – Computational Brain Connectivity Mapping Winter School Workshop, Nov 2017, Juan les Pins, France. pp.1
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https://inria.hal.science/hal-01712474/file/abstract.pdf BibTex
titre
Optimal Transport Applied to Transfer Learning For P300 Detection
auteur
Nathalie T. H. Gayraud, Alain Rakotomamonjy, Maureen Clerc
article
BCI 2017 – 7th Graz Brain-Computer Interface Conference, Sep 2017, Graz, Austria. pp.6
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https://inria.hal.science/hal-01556603/file/GBCIC_2017_paper_75.pdf BibTex
titre
Inference and Visualization of Information Flow in the Visual Pathway using dMRI and EEG
auteur
Samuel Deslauriers-Gauthier, Jean-Marc Lina, Russell Butler, Pierre-Michel Bernier, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux
article
MICCAI 2017 Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2017, Québec, Canada
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https://hal.science/hal-01556352/file/paper669.pdf BibTex
titre
Spatio-Temporal dMRI Acquisition Design: Reducing the Number of $q\tau$ Samples Through a Relaxed Probabilistic Model
auteur
Patryk Filipiak, Rutger H.J. Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, Rachid Deriche, Demian Wassermann
article
MICCAI 2017 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI 2017), Sep 2017, Québec City, Canada
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https://inria.hal.science/hal-01562617/file/main.pdf BibTex
titre
Dictionary Learning for Multidimensional Data
auteur
Christos Papageorgakis, Sebastian Hitziger, Théodore Papadopoulo
article
Proceedings of GRETSI 2017, Sep 2017, Juan-les-Pins, France
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https://inria.hal.science/hal-01575263/file/DL_for_multidimensional_data_GRETSI2017.pdf BibTex
titre
OpenMEEG software for forward problems handling non-nested geometries
auteur
Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Emmanuel Olivi, Théodore Papadopoulo
article
BaCI Conference 2017: International Conference on Basic and Clinical Multimodal Imaging, Aug 2017, Bern, Switzerland
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BibTex
titre
Spatial regularization based on dMRI to solve EEG/MEG inverse problem
auteur
Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo
article
EMBC 2017 – 39th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society , Jul 2017, Jeju, South Korea
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https://inria.hal.science/hal-01533396/file/Belaoucha_embc17.pdf BibTex
titre
Concordance between white-matter pathways and functional circuits linking the VWFA and IPS
auteur
Lang Chen, Demian Wassermann, John Kochalka, Vinod Menon
article
Organisation for the Human Brain Mapping, Jul 2017, Vancouver, Canada
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https://inria.hal.science/hal-01558273/file/OHBM_2017_Poster_Draft_Final.pdf BibTex
titre
A Novel Atlas of Human Cerebral Cortex based on Extrinsic Connectivity
auteur
Guillermo Gallardo, Rachid Deriche, Demian Wassermann
article
OHBM 2017 – Organization for Human Brain Mapping 2017 Annual Meeting, Jun 2017, Vancouver, Canada
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https://hal.science/hal-01533516/file/gallardo-ohbm2017.pdf BibTex
titre
Information Flow in the White Matter During a Motor Task: A Structural Connectivity Driven Approach
auteur
Guillermo Gallardo, Demian Wassermann, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux, Samuel Deslauriers-Gauthier
article
OHBM 2017 Organization for Human Brain Mapping Annual Meeting, Jun 2017, Vancouver, Canada
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https://hal.science/hal-01534978/file/ohbm-2017.pdf BibTex
titre
Large brain effective network from EEG/MEG data and dMR information
auteur
Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo
article
PRNI 2017 – 7th International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2017, Toronto, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01533445/file/Belaoucha_prni17.pdf BibTex
titre
Inverse conductivity recovery problem in a spherical geometry from EEG data: uniqueness, reconstruction and stability results
auteur
Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Christos Papageorgakis
article
TAMTAM 2017 – 8ème colloque, Tendances dans les Applications Mathématiques en Tunisie Algérie Maroc, May 2017, Hammamet, Tunisia. pp.1
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01526931/file/abstract_TamTam_CPapageorgakis.pdf BibTex
titre
Multi-Spherical Diffusion MRI: An in-vivo Test- Retest Study of Time-Dependent q-space Indices
auteur
Rutger H.J. Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, Rachid Deriche, Demian Wassermann
article
ISMRM: 25th Annual Meeting & Exhibition, Apr 2017, Honolulu, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01468214/file/poster_Fick_ismrm_17.pdf BibTex
titre
Solving the Inclination Sign Ambiguity in Three Dimensional Polarized Light Imaging with a PDE-Based Method
auteur
Abib O. Y. Alimi, Marco Pizzolato, Rutger H.J. Fick, Rachid Deriche
article
ISBI 2017 – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2017, Melbourne, Australia
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01533363/file/aalimi_isbi17.pdf BibTex
titre
Assessing the Feasibility of Estimating Axon Diameter using Diffusion Models and Machine Learning
auteur
Rutger H.J. Fick, Neda Sepasian, Marco Pizzolato, Andrada Ianus, Rachid Deriche
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2017, Melbourne, Australia
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https://hal.science/hal-01451664/file/ISBI17_Fick.pdf BibTex
titre
Extracting the Groupwise Core Structural Connectivity Network: Bridging Statistical and Graph-Theoretical Approaches
auteur
Nahuel Lascano, Guillermo Gallardo, Rachid Deriche, Dorian Mazauric, Demian Wassermann
article
Information Processing in Medical Imaging, 2017, Boone, United States. ⟨10.1007/978-3-319-59050-9_30⟩
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https://inria.hal.science/hal-01426870/file/main.pdf BibTex

Poster de conférence

titre
Utiliser les fibres de matière blanche comme le modèle de sources pour le problème inverse MEG
auteur
Kostiantyn Maksymenko, Théodore Papadopoulo, Samuel Deslauriers-Gauthier
article
COBCOM 2017 – Computational Brain Connectivity Mapping, Winter School Workshop, Nov 2017, Juan-les-Pins, France. 2017
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https://inria.hal.science/hal-01713075/file/poster_Maksymenko.pdf BibTex
titre
Regularizing the ODF estimate with the Laplace-Beltrami operator in 3D Polarized Light Imaging
auteur
Abib O. Y. Alimi, Samuel Deslauriers-Gauthier, Rachid Deriche
article
CoBCoM 2017 – Computational Brain Connectivity Mapping Winter School Workshop, Nov 2017, Juan-les-Pins, France. , pp.1
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01659253/file/CoBCoM2.pdf BibTex
titre
Deconvolution of fMRI BOLD signal in time-domain using an exponential operator and Lasso optimization
auteur
Isa Costantini, Patryk Filipiak, Kostiantyn Maksymenko, Rachid Deriche, Samuel Deslauriers-Gauthier
article
CoBCoM 2017 – Computational Brain Connectivity Mapping Winter School Workshop, Nov 2017, Juan Les Pins, France
Accès au bibtex
BibTex
titre
Inverse source estimation problem in EEG
auteur
Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Théo Papadopoulo
article
BaCI 2017 – Basic and Clinical Multimodal Imaging, Aug 2017, Bern, Switzerland
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03472757/file/poster_JL%20_new.pdf BibTex
titre
Brain correlates of apathy in Kleine Levin syndrome: a mean apparent propagator study
auteur
Anne-Charlotte Philippe, Sophie Lavault, Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Romain Valabregue, Rachid Deriche, Richard Levy, Isabelle Arnulf, Stéphane Lehéricy
article
International Symposium for Magnetic Resonance in Medicine, May 2017, Honolulu, United States
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https://inria.hal.science/hal-01558278/file/ismrm2017.pdf BibTex

Thèse

titre
Modèles de conduction électrique pour la stimulation de l’implant cochléaire
auteur
Kai Dang
article
Other. COMUE Université Côte d’Azur (2015 – 2019), 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4043⟩
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https://inria.hal.science/tel-01562277/file/2017AZUR4043.pdf BibTex
titre
Utilisation de l’IRM de diffusion pour la reconstruction de réseaux d’activations cérébrales à partir de données MEG/EEG
auteur
Brahim Belaoucha
article
Other. COMUE Université Côte d’Azur (2015 – 2019), 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4027⟩
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https://inria.hal.science/tel-01534876/file/2017AZUR4027.pdf BibTex
titre
IRM computationnelle de diffusion et de perfusion en imagerie cérébrale
auteur
Marco Pizzolato
article
Other. COMUE Université Côte d’Azur (2015 – 2019), 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4017⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/tel-01536335/file/2017AZUR4017.pdf BibTex
titre
Modélisation avancée du signal dMRI pour la caractérisation de la microstructure tissulaire
auteur
Rutger Fick
article
Other. COMUE Université Côte d’Azur (2015 – 2019), 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4006⟩
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https://theses.hal.science/tel-01534104/file/2017AZUR4006.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Fast Approximation of EEG Forward Problem and Application to Tissue Conductivity Estimation
auteur
Kostiantyn Maksymenko, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc
article
2017
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BibTex
titre
Diffusion MRI Anisotropy: Modeling, Analysis and Interpretation
auteur
Rutger H.J. Fick, Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Rachid Deriche
article
2017
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https://hal.science/hal-01468675/file/dagstuhl_fick_submitted.pdf BibTex

2016

Article dans une revue

titre
MAPL: Tissue Microstructure Estimation Using Laplacian-Regularized MAP-MRI and its Application to HCP Data
auteur
Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
article
NeuroImage, 2016, 134, pp.365-385. ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.03.046⟩
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https://inria.hal.science/hal-01291929/file/fick-neuroimage16-mapl.pdf BibTex
titre
Computational Brain Connectivity Mapping: A Core Health and Scientific Challenge
auteur
Rachid Deriche
article
Medical Image Analysis, 2016, ⟨10.1016/j.media.2016.06.003⟩
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https://hal.science/hal-01335669/file/Deriche_Media_Hal.pdf BibTex
titre
A study on the effect of electrical stimulation as a user stimuli for motor imagery classification in Brain-Machine Interface
auteur
Saugat Bhattacharyya, Maureen Clerc, Mitsuhiro Hayashibe
article
European Journal of Translational Myology, 2016, 26 (2), pp.165-168. ⟨10.4081/ejtm.2016.6041⟩
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https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-01402537/file/6041-23048-2-PB.pdf BibTex
titre
Interneurons contribute to the hemodynamic/metabolic response to epileptiform discharges
auteur
Sandrine Saillet, Pascale P. Quilichini, Antoine Ghestem, Bernard Giusiano, Anton I. Ivanov, Sebastian Hitziger, Ivo Vanzetta, Christophe Bernard, Christian-G. Bénar
article
Journal of Neurophysiology, 2016, 115 (3), pp.1157-1169. ⟨10.1152/jn.00994.2014⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
Source modeling of ElectroCorticoGraphy (ECoG) data: Stability analysis and spatial filtering
auteur
A. Pascarella, C. Todaro, Maureen Clerc, T. Serre, M. Piana
article
Journal of Neuroscience Methods, 2016, ⟨10.1016/j.jneumeth.2016.02.012⟩
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BibTex
titre
A survey of current trends in diffusion MRI for structural brain connectivity
auteur
Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
article
Journal of Neural Engineering, 2016, 13 (1), pp.011001. ⟨10.1088/1741-2560/13/1/011001⟩
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BibTex
titre
Uniqueness result for an inverse conductivity recovery problem with application to EEG
auteur
Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Christos Papageorgakis
article
Rendiconti dell’Istituto di Matematica dell’Universita di Trieste: an International Journal of Mathematics, 2016, 48
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https://hal.science/hal-01303640/file/articleGA.pdf BibTex
titre
The white matter query language: a novel approach for describing human white matter anatomy
auteur
Demian Wassermann, Nikos Makris, Yogesh Rathi, Martha Shenton, Ron Kikinis, Marek Kubicki, Carl-Fredrik Westin
article
Brain Structure and Function, 2016, ⟨10.1007/s00429-015-1179-4⟩
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https://inria.hal.science/hal-01247061/file/WMQL_wassermann_BSF_HAL_upload.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Groupwise Structural Parcellation of the Cortex: A Sound Approach Based on Logistic Models
auteur
Guillermo Gallardo, Rutger H.J. Fick, William Wells Ill, Rachid Deriche, Demian Wassermann
article
CDMRI 2016, Oct 2016, Athens, Greece. ⟨10.1007/978-3-319-54130-3_8⟩
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https://hal.science/hal-01358436/file/Gallardo.pdf BibTex
titre
Noise Floor Removal via Phase Correction of Complex Diffusion-Weighted Images: Influence on DTI and q-space Metrics
auteur
Marco Pizzolato, Rutger H.J. Fick, Timothé Boutelier, Rachid Deriche
article
Computational Diffusion MRI, Oct 2016, Athens, Greece
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01358770/file/cdmri16_camera_ready.pdf BibTex
titre
Multi-Spherical Diffusion MRI: Exploring Diffusion Time Using Signal Sparsity
auteur
Rutger H.J. Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, Rachid Deriche, Demian Wassermann
article
MICCAI 2016 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI’16), Oct 2016, Athènes, Greece
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01354985/file/multi-spherical-diffusion.pdf BibTex
titre
Comparison of Biomarkers in Transgenic Alzheimer Rats Using Multi-shell Diffusion MRI
auteur
Rutger H.J. Fick, Madelaine Daianu, Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Russel E. Jacobs, Paul M. Thompson, Terrence Town, Rachid Deriche
article
MICCAI 2016 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI’16), Oct 2016, Athènes, Greece
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01354981/file/comparison.pdf BibTex
titre
A Separability Marker Based on High-Dimensional Statistics for Classification Confidence Assessment
auteur
Nathalie T H Gayraud, Nathanael Foy, Maureen Clerc
article
IEEE International Conference on Systems, Man, and Cybernetics , Oct 2016, Budapest, Hungary
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01407759/file/SMC_gayraud_foy_clerc.pdf BibTex
titre
A Study on the Effect of Electrical Stimulation During Motor Imagery Learning in Brain-Computer Interfacing
auteur
Saugat Bhattacharyya, Maureen Clerc, Mitsuhiro Hayashibe
article
SMC: Systems, Man, and Cybernetics, Oct 2016, Budapest, Hungary. pp.2840-2845, ⟨10.1109/SMC.2016.7844670⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01402794/file/1840_smc2016.pdf BibTex
titre
Iterative two-stage approach to estimate sources and their interactions
auteur
Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo
article
20th International Conference on Biomagnetism (BIOMAG2016), Oct 2016, Seoul, South Korea
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01377967/file/poster_biomag16.pdf BibTex
titre
Modelling thin tissue compartiments using the immersed FEM (continuous Galerkin)
auteur
Théo Papadopoulo
article
Biomag 2016 – 20th International Conference on Biomagnetism, Oct 2016, Seoul, South Korea
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01412820/file/slides.pdf BibTex
titre
Reducing Invalid Connections with Microstructure-Driven Tractography
auteur
Gabriel Girard, Alessandro Daducci, Laurent Petit, Jean-Philippe Thiran, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Demian Wassermann, Maxime Descoteaux
article
ISMRM workshops: Breaking the Barriers of Diffusion MRI , Sep 2016, Lisbonne, Portugal
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01408737/file/girard-etal-ismrm-diffusion-workshop16.pdf BibTex
titre
Extracting the Core Structural Connectivity Network: Guaranteeing Network Connectedness Through a Graph-Theoretical Approach
auteur
Demian Wassermann, Dorian Mazauric, Guillermo Gallardo-Diez, Rachid Deriche
article
MICCAI 2016, Sep 2016, Athens, Greece
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01333301/file/main.pdf BibTex
titre
Multivariate Autoregressive Model Constrained by Anatomical Connectivity to Reconstruct Focal Sources
auteur
Brahim Belaoucha, Mouloud Kachouane, Théodore Papadopoulo
article
2016 38th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC), Aug 2016, Orlando, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01357167/file/root.pdf BibTex
titre
Evaluation des méthodes d’extraction des orientations locales des faisceaux de fibres par analyse quantitative de la connectivité
auteur
Thinhinane Megherbi, Gabriel Girard, Maxime Descoteaux, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche
article
Reconnaissance des Formes et l’Intelligence Artificielle (RFIA’16) , Jun 2016, Clermont-Ferrand, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01354106/file/IBM02.pdf BibTex
titre
Microstructure ­driven tractography in the human brain
auteur
Gabriel Girard, Alessandro Daducci, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Demian Wassermann, Maxime Descoteaux
article
Organization for Human Brain Mapping (OHBM)., Jun 2016, Geneva, Switzerland
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01408727/file/girard-etal-hbm16.pdf BibTex
titre
Efficient Population-Representative Whole-Cortex Parcellation Based on Tractography
auteur
Guillermo Gallardo, William Wells Ill, Rachid Deriche, Demian Wassermann
article
Organization for Human Brain Mapping 2016 Annual Meeting, Jun 2016, Genève, Switzerland
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01408881/file/journal.pdf BibTex
titre
Evaluation of the current distribution of the hybrid common ground stimulation in cochlear implants
auteur
Kai Dang, Pierre Stahl, Clair Vandersteen, Nicolas Guevara, Dan Gnansia, Maureen Clerc
article
9th International Symposium on Objective Measures in Auditory Implants (OMAI), Jun 2016, Szeged, Hungary
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01377653/file/OMAI_2016_KD.pdf BibTex
titre
On some inverse conductivity recovery problem in a sphere: Uniqueness and reconstruction results with applications to EEG
auteur
Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Christos Papageorgakis
article
Problèmes Inverses, Contrôle et Optimisation de Formes (PICOF), Jun 2016, Autrans, France
Accès au bibtex
BibTex
titre
Comparison of Hierarchical and Non-Hierarchical Classification for Motor Imagery Based BCI Systems
auteur
Cecilia Lindig-León, Nathalie Gayraud, Laurent Bougrain, Maureen Clerc
article
The Sixth International Brain-Computer Interfaces Meeting, May 2016, Pacific Groove, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01287636/file/Lindig_Gayraud-BCI16-HierarchicalClassification.pdf BibTex
titre
Improved Vascular Transport Function Characterization in DSC-MRI via Deconvolution with Dispersion-Compliant Bases
auteur
Marco Pizzolato, Rutger H.J. Fick, Timothé Boutelier, Rachid Deriche
article
ISMRM 2016, May 2016, Singapore, Singapore
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https://inria.hal.science/hal-01358775/file/Poster_Pizzolato_ISMRM_2016.pdf BibTex
titre
Unveiling the Dispersion Kernel in DSC-MRI by Means of Dispersion-Compliant Bases and Control Point Interpolation Techniques
auteur
Marco Pizzolato, Rutger H.J. Fick, Timothé Boutelier, Rachid Deriche
article
ISMRM 24th Annual Meeting, May 2016, Singapore, Singapore
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https://inria.hal.science/hal-01408170/file/Pizzolato_et_al_ISMRM_abstract_0649_2016.pdf BibTex
titre
Cortical Surface Parcellation via dMRI Using Mutual Nearest Neighbor Condition
auteur
Brahim Belaoucha, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo
article
2016 IEEE 13th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2016, Prague, Czech Republic. pp.903–906
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https://hal.science/hal-01306239/file/root_isbi2016.pdf BibTex
titre
A sensitivity analysis of q-space indices with respect to changes in axonal diameter, dispersion and tissue composition
auteur
Rutger H.J. Fick, Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Mauro Zucchelli, Gloria Menegaz, Rachid Deriche
article
2016 International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2016, Prague, Czech Republic
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https://inria.hal.science/hal-01292013/file/root2.pdf https://inria.hal.science/hal-01292013/file/fig1.pdf https://inria.hal.science/hal-01292013/file/fig2.pdf https://inria.hal.science/hal-01292013/file/fig3.pdf BibTex
titre
Elucidating Dispersion Effects in Perfusion MRI by Means of Dispersion-Compliant Bases
auteur
Marco Pizzolato, Timothé Boutelier, Rutger H.J. Fick, Rachid Deriche
article
International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2016, Prague, Czech Republic. ⟨10.1109/I978-1-4799-2349-6/16⟩
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https://inria.hal.science/hal-01309243/file/root2.pdf BibTex
titre
Interface cerveau-ordinateur (BCI) : un moyen de communication alternative dans la SLA
auteur
M. H. Soriani, Violaine Guy, Mariane Bruno, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc, Claude Desnuelle
article
Jnlf Nantes 2016 – Journées de Neurologie de langue française 2016, Apr 2016, Nantes, France
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titre
Quantifying White Matter Microstructure with a Unified Spatio-Temporal Diffusion Weighted MRI Continuous Representation
auteur
Demian Wassermann, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Rutger H.J. Fick, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehericy, Rachid Deriche
article
International Symposium of Magnetic Resonance in Medicine, 2016, Singapore, Singapore
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Chapitre d’ouvrage

titre
Brain training with neurofeedback
auteur
Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Fabien Lotte, Maureen Clerc, Christian Barillot
article
Brain-Computer Interfaces 1, Wiley-ISTE, 2016
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BibTex
titre
Adaptive Methods in Machine Learning
auteur
Maureen Clerc, Emmanuel Daucé, Jeremie Mattout
article
Brain-Computer Interfaces 1, Wiley-ISTE, 2016, 978-1-84821-826-0
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BibTex
titre
Méthodes adaptatives en apprentissage machine
auteur
Maureen Clerc, Emmanuel Daucé, Jeremie Mattout
article
Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 1, ISTE, 2016, 978-1-78405-147-1
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titre
Conclusion and Perspectives
auteur
Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte
article
Brain-Computer Interfaces 2, Wiley-ISTE, 2016, 978-1-84821-963-2
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BibTex
titre
Introduction
auteur
Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte
article
Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Brain-Computer Interfaces 1, Wiley-ISTE, 2016, 978-1-84821-826-0
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titre
Conclusion et perspectives
auteur
Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte
article
Les interfaces cerveau-ordinateur 2, ISTE, 2016, 978-1-78405-148-8
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titre
OpenViBE Illustration of a P300 Virtual Keyboard
auteur
Nathanael Foy, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc
article
Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Brain-Computer Interfaces 2, Wiley-ISTE, 2016, 978-1-84821-963-2. ⟨10.1002/9781119332428.ch13⟩
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titre
Illustration OpenViBE d’un clavier virtuel P300
auteur
Nathanael Foy, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc
article
Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 2, ISTE, 2016, 978-1-78405-148-8
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titre
Prétraitements de données d’électro-encéphalographie
auteur
Maureen Clerc
article
Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 1, 2016, 978-1-78405-148-8
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BibTex
titre
Entraîner son cerveau avec le neurofeedback
auteur
Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Fabien Lotte, Maureen Clerc, Christian Barillot
article
Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 1, ISTE editions, pp.277-292, 2016, 978-1-78406-147-0
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titre
Electroencephalography Data Preprocessing
auteur
Maureen Clerc
article
Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Brain-Computer Interfaces 1, Wiley-ISTE, 2016, 978-1-84821-826-0. ⟨10.1002/9781119144977.ch6⟩
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BibTex
titre
Introduction
auteur
Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte
article
Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 1, ISTE, 2016, Fondements et méthodes, 978-1-78405-148-8
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Ouvrages

titre
Effect of Phase Correction on DTI and q-space Metrics
auteur
Marco Pizzolato, Timothé Boutelier, Rachid Deriche
article
International Society for Magnetic Resonance in Medicine, 2016
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https://inria.hal.science/hal-01408421/file/Pizzolato_ISMRM_Workshop_Lisbon_2016.pdf BibTex
titre
Brain-Computer Interfaces 1
auteur
Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte
article
Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Wiley-ISTE, 2016, Maureen Clerc, 978-1-84821-826-0
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BibTex
titre
Les interfaces Cerveau-Ordinateur 1
auteur
Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte
article
Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. ISTE, 2016, Maureen Clerc, 978-1-78405-147-1
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https://inria.hal.science/hal-01402539/file/147_Les_interfaces_cerveau-ordinateur_1_Preface.pdf BibTex
titre
Les interfaces cerveau-ordinateur 2
auteur
Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte
article
Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. ISTE, 2016, 978-1-78405-148-8
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BibTex
titre
Brain-Computer Interfaces 2
auteur
Maureen Clerc, Laurent Bougrain, Fabien Lotte
article
Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Wiley-ISTE, 2016, Maureen Clerc
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BibTex

Poster de conférence

titre
Multi-Spherical MRI: Breaking the Boundaries of Diffusion Time
auteur
Rutger H.J. Fick, Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne-Charlotte Philippe, Stéphane Lehéricy, Rachid Deriche, Demian Wassermann
article
ISMRM Workshop on: Breaking the Barriers of Diffusion MRI, Sep 2016, Lisbonne, Portugal.
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https://hal.science/hal-01360440/file/poster_ismrm_workshop_2016.pdf BibTex
titre
EEG-fMRI neurofeedback of a motor imagery task
auteur
Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Marsel Mano, Elise Bannier, Fabien Lotte, Maureen Clerc, Christian Barillot
article
Organization for Human Brain Mapping, Jun 2016, Genève, Switzerland
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https://inria.hal.science/hal-01426182/file/OHBM_poster_4133_lp.pdf BibTex

Thèse

titre
Tractographie de la matière blanche orientée par a priori anatomiques et microstructurels
auteur
Gabriel Girard
article
Human health and pathology. Université Nice Sophia Antipolis; Université de Sherbrooke (Québec, Canada), 2016. English. ⟨NNT : 2016NICE4014⟩
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https://theses.hal.science/tel-01369022/file/2016NICE4014.pdf BibTex

2015

Article dans une revue

titre
Sparse Reconstruction Challenge for diffusion MRI: Validation on a physical phantom to determine which acquisition scheme and analysis method to use?
auteur
Lipeng Ning, Frederik Laun, Yaniv Gur, Edward V.R. Dibella, Samuel Deslauriers-Gauthier, Thinhinane Megherbi, Aurobrata Ghosh, Mauro Zucchelli, Gloria Menegaz, Rutger H.J. Fick, Samuel St-Jean, Michael Paquette, Ramon Aranda, Maxime Descoteaux, Rachid Deriche, Lauren O’donnell, Yogesh Rathi
article
Medical Image Analysis, 2015, 26, pp.316-331. ⟨10.1016/j.media.2015.10.012⟩
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BibTex
titre
Online Extraction and Single Trial Analysis of Regions Contributing to Erroneous Feedback Detection
auteur
Matthew Dyson, Eoin Thomas, Laurence Casini, Boris Burle
article
NeuroImage, 2015, 121, pp.146-158. ⟨10.1016/j.neuroimage.2015.06.041⟩
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https://inria.hal.science/hal-01199206/file/Dyson_et_al_NEUROIMAGE_15_Postprint.pdf BibTex
titre
Improving Fiber Alignment in HARDI by Combining Contextual PDE Flow with Constrained Spherical Deconvolution
auteur
Jorg M. Portegies, Rutger H.J. Fick, Gonzalo R. Sanguinetti, Stephan Meesters, Gabriel Girard, Remco Duits
article
PLoS ONE, 2015, 10 (10), ⟨10.1371/journal.pone.0138122⟩
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BibTex
titre
Prefrontal cortex white matter tracts in prodromal Huntington disease.
auteur
Joy T Matsui, Jatin G Vaidya, Demian Wassermann, Regina Eunyoung Kim, Vincent A Magnotta, Hans J Johnson, Jane S Paulsen
article
Human Brain Mapping, 2015, 36 (10), pp.3717-32. ⟨10.1002/hbm.22835⟩
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BibTex
titre
Decoding covert shifts of attention induced by ambiguous visuospatial cues
auteur
Romain E. Trachel, Maureen Clerc, Thomas G. Brochier
article
Frontiers in Human Neuroscience, 2015, pp.9. ⟨10.3389/fnhum.2015.00358⟩
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https://amu.hal.science/hal-01202766/file/ptpmcrender.pdf BibTex
titre
A Hybrid SaaS/Grid Architecture for Diffusion MRI in Brain Imaging Field: SaaS as a New Access Model for Computation Grids
auteur
Tarik Zakaraia Benmerar, Mouloud Kachouane, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche
article
International Journal of Organizational and Collective Intelligence (IJOCI), 2015, 4 (4), pp.35. ⟨10.4018/ijoci.2014100102⟩
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BibTex
titre
Plasticity of left perisylvian white-matter tracts is associated with individual differences in math learning Brain Structure and Function
auteur
Dietsje Jolles, Demian Wassermann, Ritika Chokhani, Jennifer Richardson, Caitlin Tenison, Roland Bammer, Lynn Fuchs, Kaustubh Supekar, Vinod Menon
article
Brain Structure and Function, 2015, pp.15. ⟨10.1007/s00429-014-0975-6⟩
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BibTex
titre
Robust and efficient linear registration of white-matter fascicles in the space of streamlines
auteur
Eleftherios Garyfallidis, Omar Cepeda, Demian Wassermann, Maxime Descoteaux
article
NeuroImage, 2015, In press. ⟨10.1016/j.neuroimage.2015.05.016⟩
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BibTex

Communication dans un congrès

titre
A Temperature Phantom to Probe the Ensemble Average Propagator Asymmetry: an In-Silico Study
auteur
Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Tanguy Duval, Jennifer S. W. Campbell, Timothé Boutelier, Julien Cohen-Adad, Rachid Deriche
article
Computational Diffusion Magnetic Resonance Imaging, Oct 2015, Munich, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-28588-7_16⟩
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https://inria.hal.science/hal-01218143/file/submission_107.pdf BibTex
titre
Dictionary learning for M/EEG multidimensional data
auteur
Christos Papageorgakis, Sebastian Hitziger, Théodore Papadopoulo
article
International conference on basic and clinical multimodal imaging (BACI), Sep 2015, Utrecht, Netherlands
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https://hal.science/hal-01243284/file/Dictionary%20learning%20for%20MEEG%20multidimensional%20data_HAL.pdf BibTex
titre
MEG/EEG reconstruction in the reduced source space
auteur
Brahim Belaoucha, Théodore Papadopoulo
article
International Conference on Basic and Clinical Multimodal Imaging, Sep 2015, Utrecht, Netherlands
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BibTex
titre
MEM-diffusion MRI framework to solve MEEG inverse problem
auteur
Brahim Belaoucha, Jean-Marc Lina, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo
article
2015 23rd European Signal Processing Conference (EUSIPCO), Aug 2015, Nice, France
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https://inria.hal.science/hal-01207165/file/root.pdf BibTex
titre
AxTract: microstructure-driven tractography based on the ensemble average propagator
auteur
Gabriel Girard, Rutger H.J. Fick, Maxime Descoteaux, Rachid Deriche, Demian Wassermann
article
Information Processing in Medical Imaging, Jun 2015, Isle of Skye, United Kingdom. ⟨10.1007/978-3-319-19992-4_53⟩
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https://inria.hal.science/hal-01152267/file/188.pdf BibTex
titre
A Unifying Framework for Spatial and Temporal Diffusion in Diffusion MRI
auteur
Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Marco Pizzolato, Rachid Deriche
article
Information Processing in Medical Imaging (IPMI), Jun 2015, Sabhal Mor Ostaig, Isle of Skye, United Kingdom
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https://inria.hal.science/hal-01140070/file/IPMI2015_130.pdf BibTex
titre
Structural connectivity reproducibility through multiple acquisitions
auteur
Gabriel Girard, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux
article
Organization for Human Brain Mapping, Jun 2015, Honolulu, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01174327/file/submitted.pdf BibTex
titre
Studying white matter tractography reproducibility through connectivity matrices
auteur
Gabriel Girard, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux
article
International Symposium on Magnetic Resonance in Medicine, May 2015, Toronto, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01174328/file/submitted.pdf BibTex
titre
How to get more out of a clinically feasible 64 Gradient dMRI Acquisition: Multi-Shell versus Single-Shell
auteur
Rutger H.J. Fick, Mauro Zucchelli, Gabriel Girard, Gloria Menegaz, Maxime Descoteaux, Rachid Deriche
article
International Society for Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM), May 2015, Toronto, Ontario, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01140076/file/submitted_ISMRM2015.pdf BibTex
titre
In situ validation of a parametric model of electrical field distribution in an implanted cochlea
auteur
Kai Dang, Maureen Clerc, Clair Vandersteen, Nicolas Guevara, Dan Gnansia
article
7th International IEEE EMBS Conference on Neural Engineering, Apr 2015, Montpellier, France, France. ⟨10.1109/NER.2015.7146711⟩
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https://inria.hal.science/hal-01242020/file/ner_2015.pdf BibTex
titre
Using 3D-SHORE and MAP-MRI to Obtain Both Tractography and Microstructural Constrast from a Clinical DMRI Acquisition
auteur
Rutger H.J. Fick, Mauro Zucchelli, Gabriel Girard, Maxime Descoteaux, Gloria Menegaz, Rachid Deriche
article
International Symposium on BIOMEDICAL IMAGING: From Nano to Macro, Apr 2015, Brooklyn, New York City, United States
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https://inria.hal.science/hal-01140011/file/ISBI2015b.pdf BibTex
titre
Laplacian-Regularized MAP-MRI: Improving Axonal Caliber Estimation
auteur
Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche
article
International Symposium on BIOMEDICAL IMAGING: From Nano to Macro, Apr 2015, Brooklyn, New York City, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01140021/file/ISBI2015a.pdf BibTex
titre
Perfusion MRI Deconvolution with Delay Estimation and Non-Negativity Constraints
auteur
Marco Pizzolato, Aurobrata Ghosh, Timothé Boutelier, Rachid Deriche
article
International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2015, Brooklyn, New York, United States. ⟨10.1109/ISBI.2015.7164057⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01143213/file/root.pdf BibTex
titre
CliqueSquare in Action: Flat Plans for Massively Parallel RDF Queries
auteur
Benjamin Djahandideh, François Goasdoué, Zoi Kaoudi, Ioana Manolescu, Jorge-Arnulfo Quiané-Ruiz, Stamatis Zampetakis
article
International Conference on Data Engineering, Apr 2015, Seoul, South Korea
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01108710/file/main.pdf BibTex
titre
Sahin et al. (2009) en modalité non-invasive : expérience pilote et perspectives
auteur
Tobias Scheer, Fabien Mathy, Demian Wassermann
article
Journée de l’axe MTC-NSC, 2015, Université Nice Sophia antipolis, Nice, France
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BibTex
titre
Exploiting the Phase in Diffusion MRI for Microstructure Recovery: Towards Axonal Tortuosity via Asymmetric Diffusion Processes
auteur
Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Timothé Boutelier, Rachid Deriche
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, 2015, Munich, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-24553-9_14⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01152672/file/Pizzolato%20et%20al%20-%20Exploiting%20the%20Phase%20in%20Diffusion%20MRI%20for%20Microstructure%20Recovery%3A%20Towards%20Axonal%20Tortuosity%20via%20Asymmetric%20Diffusion%20Processes.pdf BibTex

Chapitre d’ouvrage

titre
Electroencephalography (EEG)-based Brain-Computer Interfaces
auteur
Fabien Lotte, Laurent Bougrain, Maureen Clerc
article
Wiley Encyclopedia of Electrical and Electronics Engineering, Wiley, pp.44, 2015, ⟨10.1002/047134608X.W8278⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01167515/file/EEGBasedBCIArt.pdf BibTex

Poster de conférence

titre
Exploiting the Phase in Diffusion MRI for Microstructure Recovery: Towards Axonal Tortuosity via Asymmetric Diffusion Processes
auteur
Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Timothé Boutelier, Rachid Deriche
article
MICCAI 2015, Oct 2015, Munich, Germany
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01358805/file/Poster%20MICCAI-660.pdf BibTex
titre
Influence of skull modelling on conductivity estimation for EEG source analysis
auteur
Christos Papageorgakis, Benjamin Lanfer, Maureen Clerc
article
International conference on basic and clinical multimodal imaging (BACI), Sep 2015, Utrecht, Netherlands.
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01244392/file/Influence%20of%20skull%20modelling%20on%20conductivity%20estimation%20for%20EEG%20source%20analysis_HAL.pdf BibTex
titre
Inverse skull conductivity estimation problems from EEG data
auteur
Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Christos Papageorgakis
article
1st International Conference on Mathematical Neuroscience (ICMNS), Jun 2015, Juan-les-Pins, France.
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01243059/file/Inverse%20skull%20conductivity%20estimation%20problems%20from%20EEG%20data_HAL.pdf BibTex
titre
Realistic Simulation of Electric Potential Distributions of Different Stimulation Modes in an Implanted Cochlea
auteur
Kai Dang, Clair Vandersteen, Nicolas Guevara, Maureen Clerc, Dan Gnansia
article
Association of Research in Otolaryngology 38th MidWinter Meeting, Feb 2015, Baltimore, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01128098/file/poster.pdf BibTex

Thèse

titre
Modélisation de la variabilité de l’activité électrique dans le cerveau
auteur
Sebastian Hitziger
article
Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2015. English. ⟨NNT : 2015NICE4015⟩
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https://theses.hal.science/tel-01175851/file/2015NICE4015.pdf BibTex

Vidéo

titre
Exploiting the Phase in Diffusion MRI for Microstructure Recovery: Towards Axonal Tortuosity via Asymmetric Diffusion Processes
auteur
Marco Pizzolato, Demian Wassermann, Timothé Boutelier, Rachid Deriche
article
2015
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/medihal-01358880/file/0660-file1.mp4 BibTex

2014

Article dans une revue

titre
The ARCOMEM Architecture for Social- and Semantic-Driven Web Archiving
auteur
Bogdan Cautis, Thomas Risse, Elena Demidova, Stefan Dietze, Wim Peters, Nikolaos Papailiou, Katerina Doka, Yannis Stavrakas, Vassilis Plachouras, Pierre Senellart, Florent Carpentier, Amin Mantrach, Patrick Siehndel, Dimitris Spiliotopoulos
article
Future internet, 2014, 6 (4), pp.688-716. ⟨10.3390/fi6040688⟩
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BibTex
titre
Non-Negative Spherical Deconvolution (NNSD) for estimation of fiber Orientation Distribution Function in single-/multi-shell diffusion MRI
auteur
Jian Cheng, Rachid Deriche, Jiang Tianzi, Dinggang Shen, Pew-Thian Yap
article
NeuroImage, 2014, 11 (1), pp.750-764
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BibTex
titre
Crossing Fibers Detection with an Analytical High Order Tensor Decomposition
auteur
Thinhinane Megherbi, Mouloud Kachouane, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche
article
Computational and Mathematical Methods in Medicine, 2014, 2014, pp.1-18
Accès au bibtex
BibTex
titre
RDF in the Clouds: A Survey
auteur
Zoi Kaoudi, Ioana Manolescu
article
The VLDB Journal, 2014
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https://inria.hal.science/hal-01020977/file/paper.pdf BibTex
titre
Towards quantitative connectivity analysis: reducing tractography biases
auteur
Gabriel Girard, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux
article
NeuroImage, 2014, pp.266-278. ⟨10.1016/j.neuroimage.2014.04.074⟩
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BibTex
titre
Quantitative comparison of reconstruction methods for intra-voxel fiber recovery from diffusion MRI
auteur
Alessandro Daducci, Erick Canales Rodgriguez, Maxime Descoteaux, Eleftherios Garyfallidis, Yaniv Gur, Ying Chia Lin, Merry Mani, Sylvain L. Merlet, Michael Paquette, Alonso Ramirez-Manzanares, Marco Reisert, Paulo Reis Rodrigues, Farshid Sepehrband, Emmanuel Caruyer, Jeiran Choupan, Rachid Deriche, Mathews Jacob, Gloria Menegaz, Vesna Prckovska, Mariano Rivera, Yves Wiaux, Jean-Philippe Thiran
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2014, 99, pp.384-399. ⟨10.1109/TMI.2013.2285500⟩
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BibTex
titre
Comparison of sampling strategies and sparsifying transforms to improve compressed sensing diffusion spectrum imaging
auteur
Michael Paquette, Sylvain Merlet, Guillaume Gilbert, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux
article
Magnetic Resonance in Medicine, 2014, Article first published online: 29 JAN 2014. ⟨10.1002/mrm.25093⟩
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BibTex

Communication dans un congrès

titre
ODF’s maxima extraction using Particle Swarm Optimization. Biomedical
auteur
Mouloud Kachouane, Thinhinane Megherbi, Sihem Zeggout, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche
article
Biomedical Engineering International Conference, Oct 2014, Tlemcen, Algeria
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BibTex
titre
A 3D Model-based Simulation of the Electric Field During Cochlear Stimulation
auteur
Kai Dang, Maureen Clerc, Jonathan Laudanski
article
8th International Symposium on Objective Measures in Auditory Implants, Oct 2014, Toronto, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01103374/file/Poster_OM2014.pdf BibTex
titre
Magnitude and complex based diffusion signal reconstruction
auteur
Marco Pizzolato, Aurobrata Ghosh, Timothé Boutelier, Rachid Deriche
article
CDMRI’14, Sep 2014, Boston, United States. ⟨10.1007/978-3-319-⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01095127/file/Pizzolato%20et%20al%20-%20Magnitude%20and%20complex%20based%20diffusion%20signal%20reconstruction.pdf BibTex
titre
An Analytical 3D Laplacian Regularized SHORE Basis and Its Impact on EAP Reconstruction and Microstructure Recovery
auteur
Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche
article
CD-MRI, Sep 2014, Boston, United States
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https://inria.hal.science/hal-01095271/file/MICCAworkshop_CameraReady_2014.pdf BibTex
titre
CoAdapt P300 speller: optimized flashing sequences and online learning
auteur
Eoin Thomas, Emmanuel Daucé, Dieter Devlaminck, Loïc Mahé, Alexandra Carpentier, Rémi Munos, Margaux Perrin, Emmanuel Maby, Jérémie Mattout, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc
article
6th International Brain Computer Interface Conference, Sep 2014, Graz, Austria
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https://inria.hal.science/hal-01103441/file/CoadaptP300.pdf BibTex
titre
Complete Set of Invariants of a 4th Order Tensor: The 12 Tasks of HARDI from Ternary Quartics
auteur
Théodore Papadopoulo, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
article
{Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2014}, Sep 2014, Boston, United States. pp.233 – 240, ⟨10.1007/978-3-319-10443-0_30⟩
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https://hal.science/hal-01092492/file/proof_Final.pdf BibTex
titre
Fiber Orientation Distribution from Non-Negative Sparse Recovery
auteur
Thinhinane Megherbi, Aurobrata Ghosh, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche
article
MICCAI 2014 Workshop on Computational Diffusion MRI, Sep 2014, Boston, United States
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https://hal.science/hal-01104163/file/Poster-Megherbi.pdf BibTex
titre
Using diffusion MRI information in the Maximum Entropy on Mean framework to solve MEG/EEG inverse problem
auteur
Brahim Belaoucha, Jean-Marc Lina, Maureen Clerc, Anne-Charlotte Philippe, Christophe Grova, Théodore Papadopoulo
article
The 19th International Conference on Biomagnetism, Aug 2014, Halifax, Canada
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https://inria.hal.science/hal-01095785/file/BioMag2014Poster2.pdf BibTex
titre
Diffusion Magnetic Resonance information as a regularization term for MEG/EEG inverse problem
auteur
Brahim Belaoucha, Anne-Charlotte Philippe, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo
article
The 19th International Conference on Biomagnetism, Aug 2014, Halifax, Canada
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https://inria.hal.science/hal-01095449/file/BioMag2014poster1.pdf BibTex
titre
Extracting a biomarker for the mean cross-sectional area from the ODF
auteur
Rutger H.J. Fick, Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche
article
Human Brain Mapping, Jul 2014, Hamburg, Germany
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https://inria.hal.science/hal-01095197/file/HBM_2014_abstract.pdf BibTex
titre
Détection des croisements de fibre en IRM de diffusion par décomposition de tenseur : Approche analytique
auteur
Thinhinane Megherbi, Mouloud Kachouane, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche
article
Reconnaissance de Formes et Intelligence Artificielle (RFIA) 2014, Jun 2014, France
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https://hal.science/hal-00989135/file/rfia2014_submission_87.pdf BibTex
titre
Connectivity directionally-encoded color map: a streamline-based color mapping
auteur
Gabriel Girard, Kevin Whittingstall, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux
article
The Organization for Human Brain Mapping (OHBM), Jun 2014, Hambourg, Germany
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https://hal.science/hal-01103640/file/girard-et-al_OHBM.pdf BibTex
titre
Use of Particle Swarm Optimization for ODF Maxima Extraction
auteur
Mouloud Kachouane, Thinhinane Megherbi, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche
article
IEEE EMBS International Student Conference, ISC 2014, IEEE EMBS, Jun 2014, kuala lumpur, Malaysia
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BibTex
titre
Deformable Registration of Feature-Endowed Point Sets Based on Tensor Fields
auteur
Demian Wassermann, James Ross, George Washko, William M Wells, Raul San Jose-Estepar
article
Computer Vision and Pattern Recognition, IEEE, Jun 2014, Columbus, Ohio, United States. pp.2729-2735, ⟨10.1109/CVPR.2014.355⟩
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https://inria.hal.science/hal-01153110/file/Wassermann_Deformable_Registration_of_2014_CVPR_paper.pdf BibTex
titre
Choosing Tractography Parameters to Improve Connectivity Mapping
auteur
Girard Gabriel, Whittingstall Kevin, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux
article
International Symposium on Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM’14), May 2014, Milan, Italy
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https://inria.hal.science/hal-00945992/file/Girard_et_al._-_2014_-_Choosing_Tractography_Parameters_to_Improve_Connectivity_Mapping.pdf BibTex
titre
Comparison between discrete and continuous propagator indices from Cartesian q-space DSI sampling
auteur
Mauro Zucchelli, Eleftherios Garyfallidis, Michael Paquette, Sylvain Merlet, Gloria Menegaz, Maxime Descoteaux
article
ISMRM : Intl. Soc. Mag. Reson. Med., May 2014, Milan, Italy. pp.4294
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BibTex
titre
NMR Characterization of Cylinder Radii Distributions Using a SHORE-Based Regularization Method
auteur
Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche
article
ISMRM : Intl. Soc. Mag. Reson. Med, May 2014, Milan, Italy. pp.4419
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BibTex
titre
Efficient Axon Diameter Distribution Recovery with Long Diffusion Time
auteur
Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche
article
ISMRM : Intl. Soc. Mag. Reson. Med, May 2014, Milan, Italy. pp.0792
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BibTex
titre
Greedy NNLS: Fiber Orientation Distribution from Non-Negatively Constrained Sparse Recovery
auteur
Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
article
ISMRM : Intl. Soc. Mag. Reson. Med., May 2014, Milan, Italy. pp.2610
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BibTex
titre
DSI 101: Better ODFs for Free
auteur
Michael Paquette, Sylvain Merlet, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux
article
ISMRM : Intl. Soc. Mag. Reson. Med. 22, May 2014, Milan, Italy. pp.0802
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BibTex
titre
Mapping Average Axon Diameters under Long Diffusion Time,
auteur
Gonzalo Sanguinetti, Rachid Deriche
article
ISBI 2014, Apr 2014, Beijing, China. pp.242–245
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BibTex
titre
Odf Maxima Computation Using Hill Climbing Algorithm
auteur
Makhlouf Laouchedi, Thinhinane Megherbi, Houssem Khabatti, Ishak Serrat, Rachid Deriche, Vincent Perlbarg, Fatima Oulebsir Boumghar
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Beijing, China. pp.722-725
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BibTex
titre
Evidence build-up facilitates on-line adaptivity in dynamic environments: example of the BCI P300-speller
auteur
Emmanuel Daucé, Eoin Thomas
article
22nd European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2014, Bruges, Belgium
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https://inria.hal.science/hal-01104024/file/es2014-188.pdf BibTex
titre
Direct native-space fiber bundle alignment for group comparisons
auteur
Eleftherios Garyfallidis, Demian Wassermann, Maxime Descoteaux
article
International Society for Magnetic Resonance Imaging (ISMRM), 2014, Milan, Italy
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BibTex
titre
Probabilistic Diffeomorphic Registration: Representing Uncertainty
auteur
Demian Wassermann, Matt Toews, Marc Niethammer, William (sandy) Wells Iii
article
Biomedical Image Registration, 2014, London, United Kingdom. pp.72 – 82, ⟨10.1007/978-3-319-08554-8_8⟩
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https://hal.science/hal-01095091/file/wbir2014.pdf BibTex

Poster de conférence

titre
Propagation of epileptic spikes revealed by diffusion-based constrained MEG source reconstruction
auteur
Anne-Charlotte Philippe, Théodore Papadopoulo, Christian G. Bénar, Jean-Michel Badier, Maureen Clerc, Rachid Deriche
article
19th International Conference on Biomagnetism, Aug 2014, Halifax, Canada. 2014
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https://hal.science/hal-01104109/file/poster_atelier.pdf BibTex
titre
Electro-Metabolic Coupling Investigated with Jitter Invariant Dictionary Learning
auteur
Sebastian Hitziger, Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Sandrine Saillet, Christian G. Bénar, Théodore Papadopoulo
article
OHBM 2014, Jun 2014, Hamburg, Germany.
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01094674/file/posterOHBM.pdf BibTex
titre
FindSources3D – Source Localization Using Rational Approximation on Plane Sections
auteur
Todor Jordanov, Jean-Paul Marmorat, Maureen Clerc, Juliette Leblond, Andre Waelkens, Théodore Papadopoulo
article
Organization Human Brain Mapping, Annual Meeting, Jun 2014, Hamburg, Germany. , Poster listings
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https://inria.hal.science/hal-01098108/file/OHBM_Poster_FS3D.pdf BibTex

Thèse

titre
Protocoles d’interaction cerveau-machine pour améliorer la performance d’attention visuo-spatiale chez l’homme
auteur
Romain Trachel
article
Autre. Université Nice Sophia Antipolis, 2014. Français. ⟨NNT : 2014NICE4038⟩
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https://theses.hal.science/tel-01077931/file/2014NICE4038.pdf BibTex

2013

Article dans une revue

titre
Continuous diffusion signal, EAP and ODF estimation via Compressive Sensing in diffusion MRI
auteur
Sylvain L. Merlet, Rachid Deriche
article
Medical Image Analysis, 2013, 17 (5), pp.556-572. ⟨10.1016/j.media.2013.02.010⟩
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BibTex
titre
Constrained diffusion kurtosis imaging using ternary quartics & MLE
auteur
Aurobrata Ghosh, Tristan Milne, Rachid Deriche
article
Magnetic Resonance in Medicine, 2013, ⟨10.1002/mrm.24781⟩
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BibTex
titre
A polynomial approach for extracting the extrema of a spherical function and its application in diffusion MRI
auteur
Aurobrata Ghosh, Elias Tsigaridas, Bernard Mourrain, Rachid Deriche
article
Medical Image Analysis, 2013, 17 (5), pp.503-514. ⟨10.1016/j.media.2013.03.004⟩
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BibTex
titre
A computational diffusion MRI and parametric dictionary learning framework for modeling the diffusion signal and its features
auteur
Sylvain L. Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
article
Medical Image Analysis, 2013, pp.MEDIMA779. ⟨10.1016/j.media.2013.04.011⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00820817/file/merlet-etal-2013.pdf BibTex
titre
Design of multishell sampling schemes with uniform coverage in diffusion MRI
auteur
Emmanuel Caruyer, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
article
Magnetic Resonance in Medicine, 2013, 69 (6), pp.1534-1540. ⟨10.1002/mrm.24736⟩
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https://inria.hal.science/hal-00821688/file/article.pdf BibTex
titre
Review of « Brain-Computer Interfaces, principles and practise », edited by Jonathan R. Wolpaw and Elizabeth Winter Wolpaw
auteur
Maureen Clerc
article
BioMedical Engineering OnLine, 2013, 12 (22), ⟨10.1186/1475-925X-12-22⟩
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BibTex
titre
A Robust Variational Approach for Simultaneous Smoothing and Estimation of DTI
auteur
Meizhu Liu, Baba Vemuri, Rachid Deriche
article
NeuroImage, 2013, 67, pp.33-41. ⟨10.1016/j.neuroimage.2012.11.012⟩
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BibTex
titre
Automatic motor task selection via a bandit algorithm for a brain-controlled button
auteur
Joan Fruitet, Alexandra Carpentier, Rémi Munos, Maureen Clerc
article
Journal of Neural Engineering, 2013, 10 (1), ⟨10.1088/1741-2560/10/1/016012⟩
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BibTex
titre
Motion Detection in Diffusion MRI via Online ODF Estimation
auteur
Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
article
International Journal of Biomedical Imaging, 2013, 2013 (Article ID 84936), pp.1-8. ⟨10.1155/2013/849363⟩
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BibTex
titre
Modulations of EEG Beta Power during Planning and Execution of Grasping Movements
auteur
Manuel Zaepffel, Romain Trachel, Bjørg Elisabeth Kilavik, Thomas Brochier
article
PLoS ONE, 2013, 27, pp.11877 – 11877. ⟨10.1371/journal.pone.0060060.g003⟩
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https://amu.hal.science/hal-01464143/file/2013-Zaepffel-Brochier-BetaGrasp.pdf BibTex
titre
An analysis of performance evaluation for motor-imagery based BCI
auteur
Eoin Thomas, Matthew Dyson, Maureen Clerc
article
Journal of Neural Engineering, 2013, 10 (3), pp.1-15. ⟨10.1088/1741-2560/10/3/031001⟩
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BibTex
titre
Combining ERD and ERS features to create a system-paced BCI
auteur
Eoin Thomas, Joan Fruitet, Maureen Clerc
article
Journal of Neuroscience Methods, 2013, 216 (2), pp.96-103. ⟨10.1016/j.jneumeth.2013.03.026⟩
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BibTex

Communication dans un congrès

titre
Adaptive and Warning Displays with Brain-Computer Interfaces : Enhanced Visuospatial Attention Performance
auteur
Romain Trachel, Thomas Brochier, Maureen Clerc
article
IEEE/EMBS 6th international conference on neural engineering, Nov 2013, San diego, United States
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https://inria.hal.science/hal-00903288/file/Trachel_2013_IEEE.pdf BibTex
titre
Optimizing P300-speller sequences by RIP-ping groups apart
auteur
Eoin M. Thomas, Maureen Clerc, Alexandra Carpentier, Emmanuel Daucé, Dieter Devlaminck, Rémi Munos
article
IEEE/EMBS 6th international conference on neural engineering (2013), IEEE/EMBS, Nov 2013, San Diego, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00907781/file/0125_MS_revised.pdf BibTex
titre
Regularized Spherical Polar Fourier Diffusion MRI with Optimal Dictionary Learning
auteur
Jian Cheng, Tianzi Jiang, Rachid Deriche, Shen Dinggang, Yap Pew-Thian
article
The 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.639-646, ⟨10.1007/978-3-642-40811-3_80⟩
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https://inria.hal.science/hal-00824507/file/DL_SPFI_MICCAI.pdf BibTex
titre
Non-Negative Spherical Deconvolution (NNSD) for Fiber Orientation Distribution Function Estimation
auteur
Jian Cheng, Rachid Deriche, Tianzi Jiang, Dinggang Shen, Pew-Thian Yap
article
MICCAI Workshop Computational Diffusion and Brain Connectivity, Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.81-93, ⟨10.1007/978-3-319-02475-2_8⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00967829/file/NNSD_CDMRI2013.pdf BibTex
titre
Verbal Communication through Brain Computer Interfaces
auteur
Maureen Clerc, Jérémie Mattout, Emmanuel Maby, Dieter Devlaminck, Théodore Papadopoulo, Violaine Guy, Claude Desnuelle
article
Interspeech – 14th Annual Conference of the International Speech Communication Association – 2013, Frédéric Bimbot, Aug 2013, Lyon, France
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https://inria.hal.science/hal-00842851/file/Interspeech_BCI.pdf BibTex
titre
Tensor Estimation and Visualization using dMRI
auteur
Dalila Cherifi, Ali Chellouche, Amazigh Ait Ouakli, Youcef Benamara, Rachid Deriche
article
8th International Workshop on Systems, Signal Processing and their Applications (WoSSPA), 2013, CDTA, May 2013, Zeralda, Algeria
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BibTex
titre
Jitter-Adaptive Dictionary Learning -Application to Multi-Trial Neuroelectric Signals
auteur
Sebastian Hitziger, Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Sandrine Saillet, Christian Bénar, Théodore Papadopoulo
article
ICLR – 1st International Conference on Learning Representations – 2013, Yoshua Bengio, Yann Lecun, May 2013, Phoenix, Arizona, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01094619/file/1301.3611%281%29.pdf BibTex
titre
Enhancing Visuospatial Attention Performance with Brain-Computer Interfaces
auteur
Romain Trachel, Thomas Brochier, Maureen Clerc
article
ACM SIGCHI Conference on Human Factors in Computing Systems, Apr 2013, Paris, France. pp.ACM 978-1-4503-1952-2
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00817799/file/trachel_paper_wip_chi2013.pdf BibTex
titre
Compressive Sensing DSI
auteur
Sylvain L. Merlet, Michael Paquette, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux
article
International Symposium on BIOMEDICAL IMAGING: From Nano to Macro – ISBI HARDI Reconstruction Challenge, Apr 2013, San Francisco, United States
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BibTex
titre
Fiber Orientation Distribution from Non-Negative Sparse Recovery
auteur
Aurobrata Ghosh, Thinhinane Megherbi, Fatima Oulebsir Boumghar, Rachid Deriche
article
International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2013, San Francisco, CA, United States
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BibTex
titre
Non-Local Non-Negative Spherical Deconvolution for Single and Multiple Shell Diffusion MRI
auteur
Jian Cheng, Rachid Deriche, Tianzi Jiang, Dinggang Shen, Pew-Thian Yap
article
HARDI Reconstruction Challenge, International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2013, San Francisco, United States. pp.1
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00967830/file/JianCheng-abstract-ISBI2013.pdf BibTex
titre
Cortex parcellation via diffusion data as prior knowledge for the MEG inverse problem
auteur
Anne-Charlotte Philippe, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche
article
Biomedical Imaging (ISBI), 2013 IEEE 10th International Symposium on, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.994-997, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556644⟩
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BibTex
titre
Débruitage Aveugle par Décompositions Parcimonieuses et Aléatoires,
auteur
Manuel Moussallam, Alexandre Gramfort, Gael Richard, Laurent Daudet
article
GRETSI, 2013, Brest, France
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BibTex

Chapitre d’ouvrage

titre
4th Order Symmetric Tensors and Positive ADC Modelling
auteur
Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
article
Anna Vilanova and Carl-Fredrik Westin and Bernhard Burgeth. Visualization and Processing of Tensors and Higher Order Descriptors for Multi-Valued Data (Dagstuhl Seminar 11501), Springer, 2013
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https://inria.hal.science/hal-00848513/file/hot4_and_positiveADC.pdf BibTex
titre
From Diffusion MRI to Brain Connectomics
auteur
Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
article
Cazals, Frédéric and Kornprobst, Pierre. Modeling in Computational Biology and Biomedicine: A Multidisciplinary Endeavor, Springer, pp.193-234, 2013, 978-3-642-31208-3. ⟨10.1007/978-3-642-31208-3⟩
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https://inria.hal.science/hal-00667912/file/author.pdf BibTex
titre
Higher-Order Tensors in Diffusion Imaging
auteur
Thomas Schultz, Andrea Fuster, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche, Luc Florack, Lim Lek-Heng
article
Burgeth, B. and Vilanova, A. and Westin, C. F. Visualization and Processing of Tensors and Higher Order Descriptors for Multi-Valued Data. Dagstuhl Seminar 2011, Springer, 2013
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https://inria.hal.science/hal-00848526/file/tensors-in-dwi-FINAL-Schultz.pdf BibTex
titre
Single-Trial Analysis of Bioelectromagnetic Signals: The Quest for Hidden Information
auteur
Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Christian G. Bénar
article
Cazals, Frederic and Kornprobst, Pierre. Modeling in Computational Biology and Biomedicine: A Multidisciplinary Endeavor, Springer, pp.237–259, 2013, 978-3-642-31208-3. ⟨10.1007/978-3-642-31208-3⟩
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BibTex

Brevet

titre
Système et Procédé de commande et de contrôle d’un appareil pilotable par un opérateur
auteur
Maureen Clerc, Romain Trachel, Thomas Brochier
article
France, N° de brevet: 1360563. 2013
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BibTex

Poster de conférence

titre
Jitter-Adaptive Dictionary Learning – Application to Multi-Trial Neuroelectric Signals
auteur
Sebastian Hitziger, Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Sandrine Saillet, Christian G. Bénar, Théodore Papadopoulo
article
International Conference on Learning Representations 2013, May 2013, Phoenix, Arizona, United States. 2013
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01094663/file/posterJADL.pdf BibTex

Document associé à des manifestations scientifiques

titre
Propagation of epileptic spikes revealed by diffusion-based constrained MEG source reconstruction
auteur
Anne-Charlotte Philippe, Christian Bénar, Jean-Michel Badier, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche, Maureen Clerc
article
Scale-free Dynamics and Networks in Neuroscience, Oct 2013, Montreal, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00908664/file/template_abstract.pdf https://inria.hal.science/hal-00908664/file/poster_atelier.pdf BibTex

Thèse

titre
Régularisation du problème inverse MEG par IRM de diffusion
auteur
Anne-Charlotte Philippe
article
Autre. Université Nice Sophia Antipolis, 2013. Français. ⟨NNT : 2013NICE4135⟩
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https://theses.hal.science/tel-00939159/file/2013NICE4135.pdf BibTex
titre
Acquisition compressée en IRM de diffusion
auteur
Sylvain Merlet
article
Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2013. English. ⟨NNT : 2013NICE4061⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://theses.hal.science/tel-00908369/file/2013NICE4061.pdf BibTex

2012

Article dans une revue

titre
Fast and Analytical EAP Approximation from a 4th-Order Tensor
auteur
Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
article
International Journal of Biomedical Imaging, 2012, 2012 (Article ID 192730), pp.1-9. ⟨10.1155/2012/192730⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
Source localization using rational approximation on plane sections
auteur
Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Théodore Papadopoulo
article
Inverse Problems, 2012, 28 (5), Article number 055018 – 24 p. ⟨10.1088/0266-5611/28/5/055018⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
L’art assisté par ordinateur
auteur
Anne-Charlotte Philippe
article
Interstices, 2012
Accès au bibtex
BibTex
titre
Fractality in the neuron axonal topography of the human brain based on 3-D diffusion MRI
auteur
Panayotis Katsaloulis, Aurobrata Ghosh, Anne-Charlotte Philippe, Astero Provata, Rachid Deriche
article
The European Physical Journal B: Condensed Matter and Complex Systems, 2012, 85 (5), pp.150-157. ⟨10.1140/epjb/e2012-30045-y⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
Context-Related Frequency Modulations of Macaque Motor Cortical LFP Beta Oscillations
auteur
Bjørg Elisabeth Kilavik, Adrian Ponce-Alvarez, Romain Trachel, Joachim Confais, Sylvain Takerkart, Alexa Riehle
article
Cerebral Cortex, 2012, 22 (9), pp.2148-2159. ⟨10.1093/cercor/bhr299⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://amu.hal.science/hal-00816339/file/Kilavik--Riehle2012.pdf BibTex
titre
Diffusion MRI Signal Reconstruction with Continuity Constraint and Optimal Regularization
auteur
Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
article
Medical Image Analysis, 2012, 16 (6), pp.1113-1120. ⟨10.1016/j.media.2012.06.011⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00711883/file/article.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
A Computational Framework for Experimental Design in Diffusion MRI
auteur
Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
article
CDMRI – MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI, Oct 2012, Nice, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00747700/file/article.pdf BibTex
titre
Nonnegative Definite EAP and ODF Estimation via a Unified Multi-Shell HARDI Reconstruction
auteur
Jian Cheng, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2012, Oct 2012, Nice, France. pp.313-321, ⟨10.1007/978-3-642-33418-4_39⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00759014/file/paper469.pdf BibTex
titre
Tractography via the Ensemble Average Propagator in diffusion MRI
auteur
Sylvain Merlet, Anne-Charlotte Philippe, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2012, Nice, France. pp.7511
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https://hal.science/hal-00727797/file/paper_789.pdf BibTex
titre
Parametric dictionary learning for modeling EAP and ODF in diffusion MRI
auteur
Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2012, Nice, France. 8 p
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https://hal.science/hal-00728067/file/paper_791.pdf BibTex
titre
Comparison of Boundary Element and Finite Element Approaches to the EEG Forward Problem
auteur
Maureen Clerc, Carsten Wolters, Johannes Vorwerk, Martin Burger
article
BMT 2012, Sep 2012, Jena, Germany. pp.795-798, ⟨10.1515/bmt-2012-4152⟩
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titre
Study of the brain connectivity in an Immersive Space
auteur
Anne-Charlotte Philippe, Jean-Christophe Lombardo
article
AFRV, Sep 2012, Strasbourg, France
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https://inria.hal.science/hal-00760084/file/isiBrainAFRV12.pdf BibTex
titre
Whole cortex parcellation combining analysis of MEG forward problem, structural connectivity and Brodmann atlas
auteur
Anne-Charlotte Philippe, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche
article
BIOMAG, Aug 2012, Paris, France
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BibTex
titre
Ensemble Average Propagator Reconstruction via Compressed Sensing: Discrete or Continuous Bases ?
auteur
Sylvain Merlet, Michael Paquette, Rachid Deriche, Maxime Descoteaux
article
ISMRM 20th Annual Meeting (2012), May 2012, Australia. pp.2277
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https://hal.science/hal-00712687/file/abstract_ISMRM_CS-basis_submitted.pdf BibTex
titre
Diffusion and multiple orientations from 1.5 MR systems with limited gradient tables
auteur
Sylvain Merlet, Rachid Deriche, Kevin Whittingstall, Maxime Descoteaux
article
ISMRM 20th Annual Meeting (2012), May 2012, Melbourne, Australia. pp.1922
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https://hal.science/hal-00712686/file/abstract_ISMRM_CS-SHORE_submitted.pdf BibTex
titre
BIOMARKERS FOR HARDI: 2nd & 4th ORDER TENSOR INVARIANTS
auteur
Aurobrata Ghosh, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro – 2012, May 2012, Barcelona, Spain
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https://inria.hal.science/hal-00667905/file/isbi12.pdf BibTex
titre
Optimal Regularization for MR Diffusion Signal Reconstruction
auteur
Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
article
ISBI – 9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, May 2012, Barcelona, Spain
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https://inria.hal.science/hal-00660635/file/article.pdf BibTex
titre
A nested cortex parcellation combining analysis of MEG forward problem and diffusion MRI tractography
auteur
Anne-Charlotte Philippe, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche
article
ISBI – IEEE International Symposium on Biomedical Imaging – 2012, May 2012, Barcelona, Spain
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https://inria.hal.science/hal-00662776/file/PHILIPPE_Ac_ISBI12.pdf BibTex
titre
UNSUPERVISED AUTOMATIC WHITE MATTER FIBER CLUSTERING USING A GAUSSIAN MIXTURE MODEL
auteur
Meizhu Liu, Baba Vemuri, Rachid Deriche
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI)., May 2012, Barcelona, Spain. pp.522-525
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BibTex
titre
Anisotropic LMMSE denoising of MRI based on statistical tissue models
auteur
Gonzalo Vegas-Sánchez-Ferrero, Antonio Tristán-Vega, Santiago Aja-Fernández, Marcos Martín-Fernández, C. Palencia, Rachid Deriche
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI)., May 2012, Barcelona, Spain. pp.1519-1522
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BibTex
titre
Parametric Dictionary Learning in Diffusion MRI
auteur
Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
article
HARDI reconstruction workshop – ISBI – International Symposium on Biomedical Imaging, Alessandro Daducci and Jean-Philippe Thiran and Yves Wiaux, May 2012, Barcelona, Spain
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https://inria.hal.science/hal-00697102/file/merlet-caruyer-etal_HARDI-Contest-ISBI-2012.pdf BibTex
titre
Elliptic fourier features of brain white matter pathways
auteur
Ali Demir, Mustafa Unel, Rachid Deriche, Gozde Unal
article
Signal Processing and Communications Applications Conference (SIU), 2012 20th, Apr 2012, Fethiye, Turkey, Turkey. pp.1-4, ⟨10.1109/SIU.2012.6204642⟩
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titre
dMRI tractography of WM fibers to recover the anatomical connectivity supporting a MEG epileptic network
auteur
Anne-Charlotte Philippe, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche
article
SFRMBM, Mar 2012, Marseille, France
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BibTex
titre
Using Radial NMR Profiles to Characterize Pore Size Distributions
auteur
Rachid Deriche, John Treilhard
article
Medical Imaging 2012: Image Processing, SPIE, Feb 2012, San Diego, CA, United States. pp.83140L-1–83140L-13, ⟨10.1117/12.910673⟩
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titre
Domain Decomposition to handle versatile conductivity models
auteur
Emmanuel Olivi, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo
article
Proceedings of Biomag, 2012, Paris, France
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BibTex
titre
Generalized Invariants of a 4th order tensor: Building blocks for new biomarkers in dMRI
auteur
Aurobrata Ghosh, Théodore Papadopoulo, Rachid Deriche
article
Computational Diffusion MRI Workshop (CDMRI), MICCAI, 2012, Nice, France. pp.165―173
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BibTex
titre
Investigating brief motor imagery for an ERD/ERS based BCI
auteur
Eoin M. Thomas, Joan Fruitet, Maureen Clerc
article
EMBC: Engineering in Medicine and Biology Conference, 2012, San Diego, CA, United States. pp.2929-2932, ⟨10.1109/EMBC.2012.6346577⟩
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BibTex
titre
Constrained Diffusion Kurtosis Imaging Using Ternary Quartics and MLE
auteur
Tristan Milne, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
article
Computational Diffusion MRI Workshop (CDMRI), 2012, MICCAI, 2012, Nice, France. pp.153―164
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BibTex
titre
Bandit Algorithms boost Brain Computer Interfaces for motor-task selection of a brain-controlled button
auteur
Joan Fruitet, Alexandra Carpentier, Rémi Munos, Maureen Clerc
article
Advances in Neural Information Processing Systems, 2012, Lake Tahoe, Nevada, United States. pp.458–466
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https://hal.science/hal-00771495/file/NIPS.pdf BibTex

Chapitre d’ouvrage

titre
EEG and MEG: forward modeling
auteur
Jan C. de Munck, Carsten Wolters, Maureen Clerc
article
Brette, Romain and Destexhe, Alain. Handbook of Neural Activity Measurement, Cambridge University Press, pp.192-256, 2012, 978-0-521-51622-8
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Autre publication scientifique

titre
L’art assisté par ordinateur
auteur
Anne-Charlotte Philippe
article
2012
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Document associé à des manifestations scientifiques

titre
The adjoint method of OpenMEEG for EEG and MEG with large source space
auteur
Emmanuel Olivi, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc
article
Proceedings of Biomag, 2012, Paris, France. 2012
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Thèse

titre
IRM de diffusion du Q-space : Acquisition et pré-traitements
auteur
Emmanuel Caruyer
article
Medical Imaging. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. English. ⟨NNT : ⟩
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https://theses.hal.science/tel-00750144/file/these.pdf BibTex
titre
Interfaces Cerveau-Machines basées sur l’imagination de mouvements brefs : vers des boutons contrôlés par la pensée
auteur
Joan Fruitet
article
Traitement du signal et de l’image [eess.SP]. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. Français. ⟨NNT : ⟩
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https://theses.hal.science/tel-00838704/file/These_Joan_Fruitet.pdf BibTex
titre
Estimation and Processing of Ensemble Average Propagator and Its Features in Diffusion MRI
auteur
Jian Cheng
article
Medical Imaging. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. English. ⟨NNT : ⟩
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https://theses.hal.science/tel-00759048/file/thesis_JianCheng.pdf BibTex

2011

Article dans une revue

titre
Multiple q-shell diffusion propagator imaging
auteur
Maxime Descoteaux, Rachid Deriche, Denis Lebihan, Jean-François Mangin, Cyril Poupon
article
Medical Image Analysis, 2011, 15 (4), pp.603-621. ⟨10.1016/j.media.2010.07.001⟩
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BibTex
titre
Improved computer-aided detection of small polyps in CT colonography using interpolation for curvature estimation
auteur
Jiamin Liu, Kabadi Suraj, Uitert Robert Van, Ronald M. Summers, Nicholas Petrick, Rachid Deriche
article
Medical Physics, 2011, 38 (7), ⟨10.1118/1.3596529⟩
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BibTex
titre
Modeling of the Neurovascular Coupling in Epileptic Discharges.
auteur
Nicole Voges, Solenna Blanchard, Fabrice Wendling, Olivier David, Habib Benali, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc, Christian G. Bénar
article
Brain Topography: a Journal of Cerebral Function and Dynamics, 2011, 25 (2), pp.136-156. ⟨10.1007/s10548-011-0190-1⟩
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BibTex
titre
Relationship between flow and metabolism in BOLD signals: insights from biophysical models.
auteur
Solenna Blanchard, Théodore Papadopoulo, Christian-George Bénar, Nicole Voges, Maureen Clerc, Habib Benali, Jan M. Warnking, Olivier David, Fabrice Wendling
article
Brain Topography: a Journal of Cerebral Function and Dynamics, 2011, 24 (1), pp.40-53. ⟨10.1007/s10548-010-0166-6⟩
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BibTex
titre
Forward Field Computation with OpenMEEG.
auteur
Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc
article
Computational Intelligence and Neuroscience, 2011, 2011, pp.923703. ⟨10.1155/2011/923703⟩
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BibTex
titre
Preliminary study for an offline hybrid BCI using sensorimotor rhythms and beta rebound
auteur
Joan Fruitet, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo
article
International Journal of bioelectromagnetism, 2011, 13 (2), pp.70-71
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https://inria.hal.science/hal-00727086/file/2011_v13_no2_70-71.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Optimal Design of Multiple Q-shells experiments for Diffusion MRI
auteur
Emmanuel Caruyer, Jian Cheng, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
article
MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI – CDMRI’11, Sep 2011, Toronto, Canada
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https://inria.hal.science/inria-00617663/file/article.pdf BibTex
titre
Compressive Sensing Ensemble Average Propagator Estimation via L1 Spherical Polar Fourier Imaging
auteur
Jian Cheng, Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
article
MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI – CDMRI’11, Sep 2011, Toronto, Canada
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https://inria.hal.science/inria-00615434/file/L1-SPFI_CDMRI2011.pdf BibTex
titre
Simultaneous Smoothing and Estimation of DTI via Robust Variational Non-local Means
auteur
Meizhu Liu, Baba Vemuri, Rachid Deriche
article
MICCAI Workshop Computational Diffusion MRI, Sep 2011, Toronto, Canada
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https://inria.hal.science/hal-00645007/file/Liu-vemuri-etal_11.pdf BibTex
titre
Diffeomorphism Invariant Riemannian Framework for Ensemble Average Propagator Computing
auteur
Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
article
MICCAI – 2011 – 14th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2011, Toronto, Canada
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https://inria.hal.science/inria-00615431/file/RiemannianFramework4EAP_MICCAI2011.pdf BibTex
titre
Impact of radial and angular sampling on multiple shells acquisition in diffusion MRI
auteur
Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
article
MICCAI 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.113-121
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https://hal.science/hal-00614387/file/MICCAI_2011_paperReady.pdf BibTex
titre
Theoretical Analysis and Practical Insights on EAP Estimation via a Unified HARDI Framework
auteur
Jian Cheng, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
article
MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI), Sep 2011, Toronto, Canada
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https://inria.hal.science/inria-00615430/file/AFTSC_compare_CDMRI2011.pdf BibTex
titre
A Polynomial Approach for Maxima Extraction and Its Application to Tractography in HARDI
auteur
Aurobrata Ghosh, Demian Wassermann, Rachid Deriche
article
Information Processing in Medical Imaging, Jul 2011, Irsee, Germany. pp.723-734, ⟨10.1007/978-3-642-22092-0_59⟩
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https://inria.hal.science/inria-00610195/file/ipmi11_cameraReady.pdf BibTex
titre
Incremental gradient table for multiple Q-shells diffusion MRI
auteur
Emmanuel Caruyer, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
article
HBM 17th Annual Meeting, Jun 2011, Québec, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00617957/file/article.pdf BibTex
titre
A Riemannian Framework for Ensemble Average Propagator Computing
auteur
Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
article
ISMRM, May 2011, Montréal, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00615436/file/RiemannianEAP_ismrm_2011_final.pdf BibTex
titre
On Line Reconstruction and Motion Detection in HARDI
auteur
Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
article
19th ISMRM annual meeting, May 2011, Montréal, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00560899/file/ISMRM11.pdf BibTex
titre
In vivo scalp-to-skull conductivity ratio calibration: an EIT study
auteur
Maureen Clerc, Laurent Koessler, Jean-Michel Badier, Martine Gavaret
article
12th International Conference in Electrical Impedance Tomography, EIT 2011, May 2011, Bath, United Kingdom
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BibTex
titre
Compressive Sensing Ensemble Average Propagator Estimation via L1 Spherical Polar Fourier Imaging
auteur
Jian Cheng, Sylvain Merlet, Aurobrata Ghosh, Emmanuel Caruyer, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
article
ISMRM, May 2011, Montréal, Canada
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https://inria.hal.science/inria-00615437/file/L1SPFI_CS_ISMRM_final.pdf BibTex
titre
EXTRACTING GEOMETRICAL FEATURES & PEAK FRACTIONAL ANISOTROPY FROM THE ODF FOR WHITE MATTER CHARACTERIZATION
auteur
Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Wright, Steve and Pan, Xiaochuan and Liebling, Michael, Mar 2011, Chicago, United States
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https://inria.hal.science/hal-00645804/file/output.pdf BibTex
titre
Online Motion Detection in High Angular Resolution Diffusion Imaging
auteur
Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
article
International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Mar 2011, Chicago, United States
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https://inria.hal.science/inria-00559904/file/article.pdf BibTex
titre
Handling white-matter anisotropy in BEM for the EEG forward problem
auteur
Emmanuel Olivi, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc
article
ISBI 2011 – 8th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Mar 2011, Chicago, United States. pp.799 – 802, ⟨10.1109/ISBI.2011.5872526⟩
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https://inria.hal.science/inria-00578876/file/OLIVI_article.pdf BibTex
titre
Spherical Polar Fourier EAP and ODF Reconstruction via Compressed Sensing in Diffusion MRI
auteur
Sylvain Merlet, Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
article
ISBI, Mar 2011, Chicago, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00585694/file/ISBI_2011_paperReady.pdf BibTex
titre
Large-scale network analysis reflects big-world characteristics in ASD
auteur
Pablo Barttfeld, Jorge Calvar, Sebastian Cukier, Rachid Deriche, Ramon Leiguarda, Silvana Navarta, Mariano Sigman, Demian Wassermann, Bruno Wicker
article
17th Annual Meeting of the Organization on Human Brain Mapping, 2011, Quebec City, Canada
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BibTex
titre
OpenMEEG for calibrating the conductivity of nested compartment models
auteur
Maureen Clerc, Jean-Michel Badier, Emmanuel Olivi, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo
article
EIT conference, 2011, Bath, United Kingdom
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BibTex

HDR

titre
Contributions and perspectives to computer vision, image processing and EEG/MEG data analysis
auteur
Théodore Papadopoulo
article
Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV]. Université Nice Sophia Antipolis, 2011
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https://theses.hal.science/tel-00847782/file/hdr.pdf BibTex

Poster de conférence

titre
Adjoint method for lead-fields computation in MEEG.
auteur
Emmanuel Olivi, Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc
article
HBM’2011, Jun 2011, Québec City, Canada
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https://inria.hal.science/inria-00603769/file/HBM2011-poster-OLIVI.pdf BibTex
titre
Tract-based statistical analyzes in dMRI in autism spectrum disorder
auteur
Demian Wassermann, Anne-Charlotte Philippe, Pablo Barttfeld, Bruno Wicker, Mariano Sigman, Rachid Deriche
article
17th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2011, Quebec, Canada
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https://inria.hal.science/hal-00649766/file/WassermannPhilippeHBM2011.pdf BibTex

Rapport

titre
Automatic motor task selection via a bandit algorithm for a brain-controlled button
auteur
Joan Fruitet, Alexandra Carpentier, Rémi Munos, Maureen Clerc
article
[Rapport de recherche] RR-7721, INRIA. 2011
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https://inria.hal.science/inria-00624686/file/RR-7721.pdf BibTex
titre
Source localization using rational approximation on plane sections
auteur
Maureen Clerc, Juliette Leblond, Jean-Paul Marmorat, Théodore Papadopoulo
article
[Research Report] RR-7704, INRIA. 2011, pp.29
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00613644/file/RR-7704.pdf BibTex

Thèse

titre
Couplage de méthodes numériques pour le problème direct en Magnéto- et Électro-Encéphalographie
auteur
Emmanuel Olivi
article
Numerical Analysis [cs.NA]. Université Nice Sophia Antipolis, 2011. English. ⟨NNT : ⟩
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https://theses.hal.science/tel-00838707/file/2011_ThA_se_OLIVI.pdf BibTex
titre
High Order Models in Diffusion MRI and Applications
auteur
Aurobrata Ghosh
article
Traitement du signal et de l’image [eess.SP]. Université Nice Sophia Antipolis, 2011. Français. ⟨NNT : ⟩
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https://theses.hal.science/tel-00645820/file/thesis.pdf BibTex

2010

Article dans une revue

titre
Phase delays within visual cortex shape the response to steady-state visual stimulation.
auteur
Benoit Cottereau, Jean Lorenceau, Alexandre Gramfort, Maureen Clerc, Bertrand Thirion, Sylvain Baillet
article
NeuroImage, 2010, 54 (3), pp.1919-1929. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.10.004⟩
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BibTex
titre
Tracking cortical activity from M/EEG using graph-cuts with spatiotemporal constraints.
auteur
Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Sylvain Baillet, Maureen Clerc
article
NeuroImage, 2010, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.09.087⟩
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BibTex
titre
OpenMEEG: opensource software for quasistatic bioelectromagnetics
auteur
Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc
article
BioMedical Engineering OnLine, 2010, 9 (1), pp.45. ⟨10.1186/1475-925X-9-45⟩
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https://inria.hal.science/inria-00467061/file/OpenMEEGjournal.pdf BibTex
titre
A Trilinear Immersed Finite Element Method for Solving the Electroencephalography Forward Problem
auteur
Sylvain Vallaghé, Théodore Papadopoulo
article
SIAM Journal on Scientific Computing, 2010, 32 (4), pp.2379-2394. ⟨10.1137/09075038X⟩
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https://inria.hal.science/inria-00536265/file/submission8.pdf BibTex
titre
Colour, texture, and motion in level set based segmentation and tracking.
auteur
Thomas Brox, Mikaël Rousson, Rachid Deriche, Joachim Weickert
article
Image and Vision Computing, 2010, 28 (3), pp.376-390. ⟨10.1016/j.imavis.2009.06.009⟩
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BibTex
titre
A comparison of regression techniques for a two-dimensional sensorimotor rhythm-based brain-computer interface.
auteur
Joan Fruitet, Dennis J Mcfarland, Jonathan R Wolpaw
article
Journal of Neural Engineering, 2010, 7 (1), pp.16003. ⟨10.1088/1741-2560/7/1/016003⟩
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BibTex
titre
Unsupervised white matter fiber clustering and tract probability map generation: Applications of a Gaussian process framework for white matter fibers
auteur
Demian Wassermann, L. Bloy, E. Kanterakis, R. Verma, Rachid Deriche
article
NeuroImage, 2010, 51 (1), pp.228-241. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.01.004⟩
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BibTex
titre
Graph-Based Variability Estimation in Single-Trial Event-Related Neural Responses
auteur
Alexandre Gramfort, Renaud Keriven, Maureen Clerc
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2010, 57 (5), pp.1051 – 1061. ⟨10.1109/TBME.2009.2037139⟩
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BibTex

Communication dans un congrès

titre
Diffusion-based population statistics using tract probability maps
auteur
Demian Wassermann, Efstathios Kanterakis, Ruben C. Gur, Rachid Deriche, Ragini Verma
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI, Sep 2010, Beijing, China. pp.631-639, ⟨10.1007/978-3-642-15705-9_77⟩
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BibTex
titre
Compressed Sensing for Accelerated EAP Recovery in Diffusion MRI
auteur
Sylvain Merlet, Rachid Deriche
article
MICCAI, Sep 2010, Pekin, China. pp.Page 14
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00536278/file/Miccai-short.pdf BibTex
titre
Model-free and Analytical EAP Reconstruction via Spherical Polar Fourier Diffusion MRI
auteur
Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI, Sep 2010, Beijing, China. pp.590-597, ⟨10.1007/978-3-642-15705-9_72⟩
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https://inria.hal.science/inria-00496932/file/PDF_MICCAI2010.pdf BibTex
titre
Model-Free, Regularized, Fast, and Robust Analytical Orientation Distribution Function Estimation
auteur
Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche, Tianzi Jiang
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2010, Sep 2010, Beijing, China
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00496929/file/ODF_MICCAI2010.pdf BibTex
titre
Reconstruction of cortical sources activities for online classification of electroencephalographic signals.
auteur
Joan Fruitet, Maureen Clerc
article
EMBC 2010, Aug 2010, Buenos Aires, Argentina
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00498768/file/Fruitet_Clerc_EMBC.pdf BibTex
titre
A bootstrap method to improve brain subcortical network segregation in resting-state fMRI data
auteur
Caroline Malherbe, E. Bardinet, Arnaud Messé, Vincent Perlbarg, Guillaume Marrelec, Mélanie Pélégrini-Issac, J. Yelnik, Stéphane Lehéricy, Habib Benali
article
COMPSTAT 2010 – 19th international symposium on computational statistics, Aug 2010, Paris, France. pp.1335-1342
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BibTex
titre
Application of a hemodynamic model to epileptic spikes
auteur
Nicole Voges, Solenna Blanchard, Fabrice Wendling, Olivier David, Habib Benali, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc, Christian G. Bénar
article
Cinquième conférence plénière française de Neurosciences Computationnelles, « Neurocomp’10 », Aug 2010, Lyon, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00553405/file/NEUROCOMP2010_0008_a0b888ca08c8853e99319c8d44217ea1.pdf BibTex
titre
Investigation of BOLD responses to epileptic spikes: a combined modeling and data analysis approach
auteur
Nicole Voges, Solenna Blanchard, Fabrice Wendling, Habib Benali, Olivier David, Théodore Papadopoulo, Maureen Clerc, Christian Bénar
article
Human Brain Mapping, Jun 2010, Barcelonna, Spain
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titre
A trilinear immersed FEM for solving the EEG forward problem
auteur
Sylvain Vallaghé, Théodore Papadopoulo
article
ECCM IV – IV European Congress on Computational Mechanics: Solids, Structures and Coupled Problems in Engineering, May 2010, Paris, France
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titre
Challenges in Reconstructing the Propagator via a Cumulant Expansion of the One-Dimensional q-space MR Signal
auteur
Aurobrata Ghosh, Evren Dr Ozarslan, Rachid Deriche
article
Proceedings ISMRM, May 2010, Stockholm, Sweden
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https://inria.hal.science/inria-00496885/file/ISMRM2010-007188.PDF BibTex
titre
Academic Software Toolboxes for the Analysis of MEG Data
auteur
Sylvain Baillet, Richard Leahy, François Tadel, John C. Mosher, Arnaud Delorme, Scott Makeig, Robert Oostenveld, Matti Hämäläinen, Sarang S. Dalal, J. Zumer, Maureen Clerc, Carsten Wolters, Stefan J. Kiebel, Ole Jensen
article
Biomag 2010, S. Supek, May 2010, Dubrovnik, Croatia. pp.101-104
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titre
The symmetric BEM: bringing in more variables for better accuracy
auteur
Maureen Clerc, Alexandre Gramfort, Emmanuel Olivi, Théodore Papadopoulo
article
Biomag 2010, S. Supek, May 2010, Dubrovnik, Croatia. pp.109-112, ⟨10.1007/978-3-642-12197-5_21⟩
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https://inria.hal.science/inria-00497081/file/ConfBiomag-122.pdf BibTex
titre
FAST AND CLOSED-FORM ENSEMBLE-AVERAGE-PROPAGATOR APPROXIMATION FROM THE 4TH-ORDER DIFFUSION TENSOR
auteur
Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
article
The IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2010, Stockholm, Sweden
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https://inria.hal.science/inria-00496877/file/isbi10.pdf BibTex
titre
Online orientation distribution function reconstruction in constant solid angle and its application to motion detection in HARDI
auteur
Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Ryan Muetzel, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
article
International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands
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https://inria.hal.science/inria-00559884/file/article.pdf BibTex
titre
Domain decomposition for coupling finite and boundary element methods in EEG
auteur
Emmanuel Olivi, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo
article
Biomag 2010, S. Supek, Apr 2010, Dubrovnik, Croatia. pp.120-123, ⟨10.1007/978-3-642-12197-5_24⟩
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https://inria.hal.science/inria-00497099/file/ConfBiomag-59.pdf BibTex
titre
The adjoint method for general EEG and MEG sensor-based lead field equations
auteur
Théodore Papadopoulo, Sylvain Vallaghé, Maureen Clerc
article
Biomag 2010 – 17th International Conference on Biomagnetism, S. Supek, Mar 2010, Dubrovnik, Croatia. pp.105-108, ⟨10.1007/978-3-642-12197-5_20⟩
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https://inria.hal.science/inria-00497088/file/ConfBiomag-341.pdf BibTex
titre
Fully Automated Straightening of the Spinal Cord using Fiber Tractography
auteur
Demian Wassermann, Julien Cohen-Adad, Stéphane Lehericy, Habib Benali, Serge Rossignol, Rachid Deriche
article
18th. International Symposium on Magnetic Resonance in Medicine, 2010, Stockholm, Sweden
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titre
Impact of outliers in DTI and Q-Ball imaging — clinical implications and correction strategies
auteur
M. Sharman, Julien Cohen-Adad, M Descoteaux, Arnaud Messé, Habib Benali, Stéphane Lehéricy
article
Proceedings of the ISMRM 18th Annual Scientific Meeting and Exhibition, 2010, Stockholm, Sweden, Sweden
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titre
Riemannian Median and Its Applications for Orientation Distribution Function Computing
auteur
Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
article
18th Scientific Meeting and Exhibition of the (ISMRM), 2010, Stockholm, Sweden
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https://inria.hal.science/inria-00497246/file/Riemannian_Median_for_ODF_ISMRM2010.pdf BibTex
titre
Fast, model-free, analytical diffusion PDF profile estimation from the DWI signals
auteur
Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
article
the Sixteenth Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), 2010, Barcelona, Spain
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https://inria.hal.science/inria-00497244/file/PDF_OHBM2010.pdf BibTex
titre
Fast, Model-Free , Analytical ODF Reconstruction from the Q-Space Signal
auteur
Jian Cheng, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
article
the Sixteenth Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), 2010, Barcelona, Spain
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https://inria.hal.science/inria-00497243/file/ODF_OHBM2010.pdf BibTex
titre
Comparing functional and anatomical segregation in the basal ganglia using fMRI and fiber tracking
auteur
Caroline Malherbe, Arnaud Messé, Mélanie Pélégrini-Issac, S Lehéricy, Habib Benali
article
Proceedings of the 16th International Conference on Functional Mapping of the Human Brain, 2010, Barcelone, Spain, Spain
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titre
Domain decomposition for coupling finite and boundary element methods with non-matching grids in Electro-Encephalography
auteur
Emmanuel Olivi, Maureen Clerc, Théodore Papadopoulo
article
Proceedings of ECCM, 2010, Paris, France
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titre
A spatial autoregressive model to link structure to function: a combined fMRI and DTI approach
auteur
Arnaud Messé, Guillaume Marrelec, Mélanie Pélégrini-Issac, Habib Benali
article
Proceedings of the 16th International Conference on Functional Mapping of the Human Brain, 2010, Barcelone, Spain, Spain
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titre
STRAIGHTENING THE SPINAL CORD USING FIBER TRACTOGRAPHY
auteur
Demian Wassermann, Julien Cohen-Adad, Stéphane Lehericy, Habib Benali, Serge Rossignol, Rachid Deriche
article
International Symposium on Biomedical Imaging, 2010, rotterdam, Netherlands
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titre
Analytical Q-Ball Imaging with Optimal Regularization
auteur
Maxime Descoteaux, Cheng Guan Koay, Peter J. Basser, Rachid Deriche
article
ISMRM 18th Scientific Meeting and Exhibition, 2010, Stockholm, Sweden
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Poster de conférence

titre
OpenMEEG for M/EEG forward modeling: a comparison study
auteur
Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc
article
Human Brain Mapping, Jun 2010, Barcelone, Spain
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https://inria.hal.science/inria-00502745/file/poster_hbm2010_gramfort.pdf BibTex
titre
An empirical evaluation of free BEM solvers for M/EEG forward modeling
auteur
Alexandre Gramfort, Théodore Papadopoulo, Emmanuel Olivi, Maureen Clerc
article
Biomag, May 2010, Dubrovnik, Croatia. 2010
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https://inria.hal.science/hal-00776674/file/poster_openmeeg_biomag_2010.pdf BibTex

Thèse

titre
Caractérisation de la relation structure-fonction dans le cerveau humain à partir de données d’IRM fonctionnelle et de diffusion : méthodes et applications cognitive et clinique
auteur
Arnaud Messé
article
Neurosciences [q-bio.NC]. Université Nice Sophia Antipolis, 2010. Français. ⟨NNT : ⟩
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https://theses.hal.science/tel-00845014/file/these.pdf BibTex
titre
Dissection Automatique In Vivo des Structures de la Matière Blanche à partir de l’imagerie par Résonance Magnétique de Diffusion
auteur
Demian Wassermann
article
Medical Imaging. Université Nice Sophia Antipolis, 2010. English. ⟨NNT : ⟩
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https://theses.hal.science/tel-00827022/file/Wassermann-Thesis.pdf BibTex