Présentation

L’équipe projet Amib (Inria Saclay/LIX) est un groupe de recherche en bioinformatique muni d’un fort intérêt pour les aspects moléculaires de l’organisation cellulaire, ainsi que d’une forte appétence pour les Acides RiboNucléiques (ARN). Partant des séquences génomique et/ou de données de séquençage haut-débit, nous concentrons nos efforts sur la structure des macromolécules, leur interactions, évolution et, plus récemment, leur conception (rational design), afin de satisfaire les besoins croissants de la biologie synthétique. Dans ce but, nous développons des approches méthodologiques basées sur des abstractions des objets biologiques, choisies tant pour leur fidélité que pour leur potentiel de traitement in silico efficace. Un ensemble d’outils communs est développé au sein d’Amib, reposant sur une expertise forte en mathématique discrète, conception et analyse d’algorithmes. Notre but ultime est la conception d’outils logiciels finalisés, aidant à la formulation et au test d’hypothèses sur la relation séquence/structure/fonction en biologie moléculaire.

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